Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4BW0_B
|
4BW0_A
|
7OZQ_A
|
7OZQ_H
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
B:88 [ILE] | A:18 [A] | A:92 [ILE] | H:28 [A] | ✔ |
B:55 [PRO] | A:19 [A] | A:59 [PRO] | H:29 [U] | ✔ |
B:41 [ARG] | A:3 [G] | A:45 [ARG] | H:3 [A] | ✔ |
B:41 [ARG] | A:4 [G] | A:45 [ARG] | H:4 [C] | ✔ |
B:37 [LYS] | A:3 [G] | A:41 [LYS] | H:3 [A] | ✔ |
B:37 [LYS] | A:4 [G] | A:41 [LYS] | H:4 [C] | ✔ |
B:91 [PRO] | A:18 [A] | A:95 [ALA] | H:28 [A] | ✔ |
B:91 [PRO] | A:19 [A] | A:95 [ALA] | H:29 [U] | ✔ |
B:89 [GLU] | A:7 [G] | A:93 [GLU] | H:7 [G] | ✔ |
B:89 [GLU] | A:17 [G] | A:93 [GLU] | H:27 [G] | ✔ |
B:79 [LYS] | A:19 [A] | A:83 [LYS] | H:29 [U] | ✔ |
B:34 [GLU] | A:5 [G] | A:38 [GLU] | H:5 [U] | ✔ |
B:34 [GLU] | A:18 [A] | A:38 [GLU] | H:28 [A] | ✔ |
B:34 [GLU] | A:20 [G] | A:38 [GLU] | H:30 [G] | ✔ |
B:94 [SER] | A:19 [A] | A:98 [SER] | H:29 [U] | ✔ |
B:32 [THR] | A:18 [A] | A:36 [THR] | H:28 [A] | ✔ |
B:32 [THR] | A:19 [A] | A:36 [THR] | H:29 [U] | ✔ |
B:32 [THR] | A:20 [G] | A:36 [THR] | H:30 [G] | ✔ |
B:58 [ILE] | A:19 [A] | A:62 [ILE] | H:29 [U] | ✔ |
B:35 [THR] | A:20 [G] | A:39 [THR] | H:30 [G] | ✔ |
B:31 [GLY] | A:18 [A] | A:35 [GLY] | H:28 [A] | ✔ |
B:31 [GLY] | A:19 [A] | A:35 [GLY] | H:29 [U] | ✔ |
B:31 [GLY] | A:20 [G] | A:35 [GLY] | H:30 [G] | ✔ |
B:30 [LYS] | A:18 [A] | A:34 [LYS] | H:28 [A] | ✔ |
B:30 [LYS] | A:20 [G] | A:34 [LYS] | H:30 [G] | ✔ |
B:92 [CYS] | A:18 [A] | A:96 [ALA] | H:28 [A] | ✔ |
B:92 [CYS] | A:19 [A] | A:96 [ALA] | H:29 [U] | ✔ |
B:33 [ASN] | A:19 [A] | A:37 [ASN] | H:29 [U] | ✔ |
B:33 [ASN] | A:20 [G] | A:37 [ASN] | H:30 [G] | ✔ |
B:93 [ALA] | A:18 [A] | A:97 [ALA] | H:28 [A] | ✔ |
B:93 [ALA] | A:19 [A] | A:97 [ALA] | H:29 [U] | ✔ |
B:90 [VAL] | A:17 [G] | A:94 [VAL] | H:27 [G] | ✔ |
B:90 [VAL] | A:18 [A] | A:94 [VAL] | H:28 [A] | ✔ |
B:29 [LYS] | A:5 [G] | A:33 [ARG] | H:5 [U] | ✔ |
B:54 [ASP] | A:19 [A] | A:58 [ASP] | H:29 [U] | ✔ |
B:33 [ASN] | A:4 [G] | A:37 [ASN] | H:4 [C] | ❌ 7OZQ_A_H |
B:33 [ASN] | A:5 [G] | A:37 [ASN] | H:5 [U] | ❌ 7OZQ_A_H |
B:29 [LYS] | A:4 [G] | A:33 [ARG] | H:4 [C] | ❌ 4BW0_B_A |
B:34 [GLU] | A:6 [A] | A:38 [GLU] | H:6 [A] | ❌ 7OZQ_H:6 no longer at interface |
B:30 [LYS] | A:6 [A] | A:34 [LYS] | H:6 [A] | ❌ 7OZQ_H:6 no longer at interface |
B:52 [ASP] | A:19 [A] | A:56 [ASP] | H:29 [U] | ❌ 4BW0_B:52 no longer at interface |
B:53 [VAL] | A:19 [A] | A:57 [VAL] | H:29 [U] | ❌ 4BW0_B:53 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
L30e-like | 0.9 | 0.62 | 0.50 | 0.96 | 0.31 | 1.0 | 1.0 | 0.91 | 0.79 | 0.57 | 0.57 |
Other pairs involving 4BW0_B_A or 7OZQ_A_H
Total number of entries: 26