Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
5XTM_A
|
5XTM_B
|
7OZQ_A
|
7OZQ_H
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:39 [GLU] | B:18 [G] | A:38 [GLU] | H:28 [A] | ✔ |
A:39 [GLU] | B:20 [G] | A:38 [GLU] | H:30 [G] | ✔ |
A:35 [LYS] | B:18 [G] | A:34 [LYS] | H:28 [A] | ✔ |
A:35 [LYS] | B:20 [G] | A:34 [LYS] | H:30 [G] | ✔ |
A:99 [SER] | B:19 [U] | A:98 [SER] | H:29 [U] | ✔ |
A:60 [PRO] | B:19 [U] | A:59 [PRO] | H:29 [U] | ✔ |
A:94 [GLU] | B:17 [G] | A:93 [GLU] | H:27 [G] | ✔ |
A:59 [ASP] | B:19 [U] | A:58 [ASP] | H:29 [U] | ✔ |
A:58 [VAL] | B:19 [U] | A:57 [VAL] | H:29 [U] | ✔ |
A:40 [THR] | B:20 [G] | A:39 [THR] | H:30 [G] | ✔ |
A:97 [ALA] | B:18 [G] | A:96 [ALA] | H:28 [A] | ✔ |
A:97 [ALA] | B:19 [U] | A:96 [ALA] | H:29 [U] | ✔ |
A:98 [ALA] | B:18 [G] | A:97 [ALA] | H:28 [A] | ✔ |
A:98 [ALA] | B:19 [U] | A:97 [ALA] | H:29 [U] | ✔ |
A:96 [ALA] | B:18 [G] | A:95 [ALA] | H:28 [A] | ✔ |
A:96 [ALA] | B:19 [U] | A:95 [ALA] | H:29 [U] | ✔ |
A:84 [LYS] | B:19 [U] | A:83 [LYS] | H:29 [U] | ✔ |
A:36 [GLY] | B:18 [G] | A:35 [GLY] | H:28 [A] | ✔ |
A:36 [GLY] | B:19 [U] | A:35 [GLY] | H:29 [U] | ✔ |
A:36 [GLY] | B:20 [G] | A:35 [GLY] | H:30 [G] | ✔ |
A:95 [VAL] | B:17 [G] | A:94 [VAL] | H:27 [G] | ✔ |
A:95 [VAL] | B:18 [G] | A:94 [VAL] | H:28 [A] | ✔ |
A:38 [ASN] | B:20 [G] | A:37 [ASN] | H:30 [G] | ✔ |
A:93 [ILE] | B:18 [G] | A:92 [ILE] | H:28 [A] | ✔ |
A:57 [ASP] | B:19 [U] | A:56 [ASP] | H:29 [U] | ✔ |
A:37 [THR] | B:18 [G] | A:36 [THR] | H:28 [A] | ✔ |
A:37 [THR] | B:19 [U] | A:36 [THR] | H:29 [U] | ✔ |
A:37 [THR] | B:20 [G] | A:36 [THR] | H:30 [G] | ✔ |
A:63 [ILE] | B:19 [U] | A:62 [ILE] | H:29 [U] | ✔ |
A:38 [ASN] | B:19 [U] | A:37 [ASN] | H:29 [U] | ❌ 5XTM_A_B |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
L30e-like | 0.85 | 0.21 | 0.38 | 1.0 | 0.24 | 1.0 | 0.5 | 1.00 | 1.00 | 0.70 | 0.00 |
Other pairs involving 5XTM_A_B or 7OZQ_A_H
Total number of entries: 25