Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4OLA_A
|
4OLA_B
|
5AWH_A
|
5AWH_C
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:757 [GLN] | B:5 [A] | A:696 [THR] | C:5 [A] | ✔ |
A:757 [GLN] | B:6 [A] | A:696 [THR] | C:6 [A] | ✔ |
A:547 [VAL] | B:1 [A] | A:480 [VAL] | C:1 [U] | ✔ |
A:547 [VAL] | B:2 [A] | A:480 [VAL] | C:2 [U] | ✔ |
A:544 [THR] | B:1 [A] | A:477 [THR] | C:1 [U] | ✔ |
A:859 [ALA] | B:1 [A] | A:777 [LEU] | C:1 [U] | ✔ |
A:859 [ALA] | B:3 [A] | A:777 [LEU] | C:3 [A] | ✔ |
A:815 [TYR] | B:1 [A] | A:754 [ARG] | C:1 [U] | ✔ |
A:804 [TYR] | B:4 [A] | A:743 [PHE] | C:4 [C] | ✔ |
A:529 [TYR] | B:1 [A] | A:463 [TYR] | C:1 [U] | ✔ |
A:570 [LYS] | B:1 [A] | A:506 [LYS] | C:1 [U] | ✔ |
A:797 [VAL] | B:4 [A] | A:736 [ALA] | C:4 [C] | ✔ |
A:797 [VAL] | B:5 [A] | A:736 [ALA] | C:5 [A] | ✔ |
A:753 [HIS] | B:5 [A] | A:686 [ASN] | C:5 [A] | ✔ |
A:753 [HIS] | B:6 [A] | A:686 [ASN] | C:6 [A] | ✔ |
A:548 [GLN] | B:1 [A] | A:481 [ARG] | C:1 [U] | ✔ |
A:548 [GLN] | B:2 [A] | A:481 [ARG] | C:2 [U] | ✔ |
A:525 [LYS] | B:1 [A] | A:454 [ALA] | C:1 [U] | ✔ |
A:522 [LEU] | B:1 [A] | A:449 [LEU] | C:1 [U] | ✔ |
A:368 [THR] | B:7 [A] | A:271 [GLU] | C:7 [C] | ✔ |
A:760 [SER] | B:6 [A] | A:699 [PRO] | C:6 [A] | ✔ |
A:792 [ARG] | B:3 [A] | A:731 [ARG] | C:3 [A] | ✔ |
A:792 [ARG] | B:4 [A] | A:731 [ARG] | C:4 [C] | ✔ |
A:563 [LEU] | B:2 [A] | A:499 [PHE] | C:2 [U] | ✔ |
A:798 [SER] | B:4 [A] | A:737 [ALA] | C:4 [C] | ✔ |
A:798 [SER] | B:5 [A] | A:737 [ALA] | C:5 [A] | ✔ |
A:758 [GLY] | B:6 [A] | A:697 [PRO] | C:6 [A] | ✔ |
A:533 [LYS] | B:1 [A] | A:467 [LYS] | C:1 [U] | ✔ |
A:558 [GLN] | B:2 [A] | A:494 [TYR] | C:2 [U] | ✔ |
A:795 [ARG] | B:4 [A] | A:734 [LEU] | C:4 [C] | ✔ |
A:551 [ASN] | B:1 [A] | A:484 [THR] | C:1 [U] | ✔ |
A:551 [ASN] | B:2 [A] | A:484 [THR] | C:2 [U] | ✔ |
A:546 [CYS] | B:1 [A] | A:479 [GLN] | C:1 [U] | ✔ |
A:546 [CYS] | B:2 [A] | A:479 [GLN] | C:2 [U] | ✔ |
A:562 [ASN] | B:2 [A] | A:498 [ASN] | C:2 [U] | ✔ |
A:562 [ASN] | B:3 [A] | A:498 [ASN] | C:3 [A] | ✔ |
A:559 [THR] | B:2 [A] | A:495 [THR] | C:2 [U] | ✔ |
A:793 [CYS] | B:3 [A] | A:732 [SER] | C:3 [A] | ✔ |
A:793 [CYS] | B:4 [A] | A:732 [SER] | C:4 [C] | ✔ |
A:545 [GLN] | B:1 [A] | A:478 [GLN] | C:1 [U] | ✔ |
A:545 [GLN] | B:2 [A] | A:478 [GLN] | C:2 [U] | ✔ |
A:804 [TYR] | B:5 [A] | A:743 [PHE] | C:5 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
A:760 [SER] | B:5 [A] | A:699 [PRO] | C:5 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
A:798 [SER] | B:6 [A] | A:737 [ALA] | C:6 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
A:221 [ALA] | B:7 [A] | A:175 [GLY] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A_C |
A:222 [THR] | B:7 [A] | A:176 [MET] | C:7 [C] | ❌ 4OLA_A_B |
A:545 [GLN] | B:3 [A] | A:478 [GLN] | C:3 [A] | ❌ 4OLA_A_B |
A:758 [GLY] | B:7 [A] | A:697 [PRO] | C:7 [C] | ❌ 4OLA_A_B |
A:792 [ARG] | B:2 [A] | A:731 [ARG] | C:2 [U] | ❌ 4OLA_A_B |
A:369 [ALA] | B:6 [A] | A:272 [ALA] | C:6 [A] | ❌ 5AWH_A:272 no longer at interface |
A:364 [MET] | B:7 [A] | A:267 [LEU] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:267 no longer at interface |
A:756 [ILE] | B:4 [A] | A:691 [ILE] | C:4 [C] | ❌ 5AWH_A:691 no longer at interface |
A:756 [ILE] | B:5 [A] | A:691 [ILE] | C:5 [A] | ❌ 5AWH_A:691 no longer at interface |
A:709 [LYS] | B:6 [A] | A:639 [HIS] | C:6 [A] | ❌ 5AWH_A:639 no longer at interface |
A:812 [ARG] | B:1 [A] | A:751 [LEU] | C:1 [U] | ❌ 5AWH_A:751 no longer at interface |
A:799 [ILE] | B:5 [A] | A:738 [THR] | C:5 [A] | ❌ 5AWH_A:738 no longer at interface |
A:526 [THR] | B:1 [A] | A:455 [ARG] | C:1 [U] | ❌ 5AWH_A:455 no longer at interface |
A:790 [TYR] | B:3 [A] | A:729 [SER] | C:3 [A] | ❌ 5AWH_A:729 no longer at interface |
A:790 [TYR] | B:4 [A] | A:729 [SER] | C:4 [C] | ❌ 5AWH_A:729 no longer at interface |
A:566 [LYS] | B:1 [A] | A:502 [ALA] | C:1 [U] | ❌ 5AWH_A:502 no longer at interface |
A:566 [LYS] | B:2 [A] | A:502 [ALA] | C:2 [U] | ❌ 5AWH_A:502 no longer at interface |
A:566 [LYS] | B:3 [A] | A:502 [ALA] | C:3 [A] | ❌ 5AWH_A:502 no longer at interface |
A:375 [ARG] | B:7 [A] | A:280 [PHE] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:280 no longer at interface |
A:356 [LEU] | B:7 [A] | A:246 [GLU] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:246 no longer at interface |
A:220 [SER] | B:7 [A] | A:174 [ILE] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:174 no longer at interface |
A:761 [ARG] | B:6 [A] | A:700 [THR] | C:6 [A] | ❌ 5AWH_A:700 no longer at interface |
A:761 [ARG] | B:7 [A] | A:700 [THR] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:700 no longer at interface |
A:755 [GLY] | B:5 [A] | A:690 [LEU] | C:5 [A] | ❌ 5AWH_A:690 no longer at interface |
A:754 [ALA] | B:5 [A] | A:687 [SER] | C:5 [A] | ❌ 5AWH_A:687 no longer at interface |
A:365 [ILE] | B:6 [A] | A:268 [ASP] | C:6 [A] | ❌ 5AWH_A:268 no longer at interface |
A:365 [ILE] | B:7 [A] | A:268 [ASP] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:268 no longer at interface |
A:759 [THR] | B:6 [A] | A:698 [LEU] | C:6 [A] | ❌ 5AWH_A:698 no longer at interface |
A:759 [THR] | B:7 [A] | A:698 [LEU] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:698 no longer at interface |
A:714 [ARG] | B:6 [A] | A:644 [VAL] | C:6 [A] | ❌ 5AWH_A:644 no longer at interface |
A:714 [ARG] | B:7 [A] | A:644 [VAL] | C:7 [C] | ❌ 5AWH_A:644 no longer at interface |
A:524 [GLY] | B:1 [A] | A:451 [GLU] | C:1 [U] | ❌ 5AWH_A:451 no longer at interface |
A:224 [PHE] | B:7 [A] | A:178 [TYR] | C:7 [C] | ❌ 4OLA_A:224 no longer at interface |
A:355 [LYS] | B:7 [A] | A:245 [LYS] | C:7 [C] | ❌ 4OLA_A:355 no longer at interface |
A:370 [ARG] | B:7 [A] | A:275 [ARG] | C:7 [C] | ❌ 4OLA_A:370 no longer at interface |
A:527 [PRO] | B:1 [A] | A:461 [ASN] | C:1 [U] | ❌ 4OLA_A:527 no longer at interface |
A:796 [SER] | B:5 [A] | A:735 [PRO] | C:5 [A] | ❌ 4OLA_A:796 no longer at interface |
A:796 [SER] | B:4 [A] | A:735 [PRO] | C:4 [C] | ❌ 4OLA_A:796 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribonuclease H-like & Argonaute, N-terminal domain & SH3 & Middle domain in Argonaute homologs | 0.71 | 3.34 | 0.16 | 0.71 | 0.25 | 0.49 | 0.7 | 0.63 | 0.59 | 0.29 | 0.80 |
Other pairs involving 4OLA_A_B or 5AWH_A_C
Total number of entries: 30