Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 5AWH_A
|
5AWH_C
|
6OON_A
|
6OON_B
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| A:494 [TYR] | C:2 [U] | A:550 [GLN] | B:2 [A] | ✔ |
| A:731 [ARG] | C:3 [A] | A:794 [ARG] | B:3 [A] | ✔ |
| A:731 [ARG] | C:4 [C] | A:794 [ARG] | B:4 [A] | ✔ |
| A:499 [PHE] | C:2 [U] | A:555 [LEU] | B:2 [A] | ✔ |
| A:777 [LEU] | C:1 [U] | A:861 [ALA] | B:1 [A] | ✔ |
| A:777 [LEU] | C:3 [A] | A:861 [ALA] | B:3 [A] | ✔ |
| A:463 [TYR] | C:1 [U] | A:521 [TYR] | B:1 [A] | ✔ |
| A:449 [LEU] | C:1 [U] | A:514 [LEU] | B:1 [A] | ✔ |
| A:484 [THR] | C:2 [U] | A:543 [ASN] | B:2 [A] | ✔ |
| A:480 [VAL] | C:1 [U] | A:539 [VAL] | B:1 [A] | ✔ |
| A:480 [VAL] | C:2 [U] | A:539 [VAL] | B:2 [A] | ✔ |
| A:686 [ASN] | C:5 [A] | A:755 [HIS] | B:5 [A] | ✔ |
| A:686 [ASN] | C:6 [A] | A:755 [HIS] | B:6 [A] | ✔ |
| A:737 [ALA] | C:4 [C] | A:800 [SER] | B:4 [A] | ✔ |
| A:737 [ALA] | C:5 [A] | A:800 [SER] | B:5 [A] | ✔ |
| A:736 [ALA] | C:4 [C] | A:799 [VAL] | B:4 [A] | ✔ |
| A:736 [ALA] | C:5 [A] | A:799 [VAL] | B:5 [A] | ✔ |
| A:479 [GLN] | C:1 [U] | A:538 [CYS] | B:1 [A] | ✔ |
| A:479 [GLN] | C:2 [U] | A:538 [CYS] | B:2 [A] | ✔ |
| A:478 [GLN] | C:1 [U] | A:537 [GLN] | B:1 [A] | ✔ |
| A:478 [GLN] | C:2 [U] | A:537 [GLN] | B:2 [A] | ✔ |
| A:467 [LYS] | C:1 [U] | A:525 [LYS] | B:1 [A] | ✔ |
| A:697 [PRO] | C:6 [A] | A:760 [GLY] | B:6 [A] | ✔ |
| A:696 [THR] | C:5 [A] | A:759 [GLN] | B:5 [A] | ✔ |
| A:696 [THR] | C:6 [A] | A:759 [GLN] | B:6 [A] | ✔ |
| A:754 [ARG] | C:1 [U] | A:817 [TYR] | B:1 [A] | ✔ |
| A:481 [ARG] | C:1 [U] | A:540 [GLN] | B:1 [A] | ✔ |
| A:481 [ARG] | C:2 [U] | A:540 [GLN] | B:2 [A] | ✔ |
| A:699 [PRO] | C:6 [A] | A:762 [SER] | B:6 [A] | ✔ |
| A:506 [LYS] | C:1 [U] | A:562 [LYS] | B:1 [A] | ✔ |
| A:498 [ASN] | C:2 [U] | A:554 [ASN] | B:2 [A] | ✔ |
| A:498 [ASN] | C:3 [A] | A:554 [ASN] | B:3 [A] | ✔ |
| A:495 [THR] | C:2 [U] | A:551 [THR] | B:2 [A] | ✔ |
| A:734 [LEU] | C:4 [C] | A:797 [ARG] | B:4 [A] | ✔ |
| A:271 [GLU] | C:7 [C] | A:358 [THR] | B:7 [A] | ✔ |
| A:477 [THR] | C:1 [U] | A:536 [THR] | B:1 [A] | ✔ |
| A:176 [MET] | C:7 [C] | A:211 [ALA] | B:7 [A] | ✔ |
| A:732 [SER] | C:3 [A] | A:795 [CYS] | B:3 [A] | ✔ |
| A:732 [SER] | C:4 [C] | A:795 [CYS] | B:4 [A] | ✔ |
| A:454 [ALA] | C:1 [U] | A:517 [LYS] | B:1 [A] | ✔ |
| A:743 [PHE] | C:4 [C] | A:806 [TYR] | B:4 [A] | ✔ |
| A:731 [ARG] | C:2 [U] | A:794 [ARG] | B:2 [A] | ❌ 6OON_A_B |
| A:484 [THR] | C:1 [U] | A:543 [ASN] | B:1 [A] | ❌ 6OON_A_B |
| A:478 [GLN] | C:3 [A] | A:537 [GLN] | B:3 [A] | ❌ 6OON_A_B |
| A:697 [PRO] | C:7 [C] | A:760 [GLY] | B:7 [A] | ❌ 6OON_A_B |
| A:175 [GLY] | C:7 [C] | A:210 [SER] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
| A:699 [PRO] | C:5 [A] | A:762 [SER] | B:5 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
| A:734 [LEU] | C:3 [A] | A:797 [ARG] | B:3 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
| A:737 [ALA] | C:6 [A] | A:800 [SER] | B:6 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
| A:743 [PHE] | C:5 [A] | A:806 [TYR] | B:5 [A] | ❌ 5AWH_A_C |
| A:461 [ASN] | C:1 [U] | A:519 [PRO] | B:1 [A] | ❌ 6OON_A:519 no longer at interface |
| A:245 [LYS] | C:7 [C] | A:345 [LYS] | B:7 [A] | ❌ 6OON_A:345 no longer at interface |
| A:178 [TYR] | C:7 [C] | A:213 [ALA] | B:7 [A] | ❌ 6OON_A:213 no longer at interface |
| A:735 [PRO] | C:4 [C] | A:798 [SER] | B:4 [A] | ❌ 6OON_A:798 no longer at interface |
| A:735 [PRO] | C:5 [A] | A:798 [SER] | B:5 [A] | ❌ 6OON_A:798 no longer at interface |
| A:487 [LEU] | C:2 [U] | A:546 [LYS] | B:2 [A] | ❌ 6OON_A:546 no longer at interface |
| A:275 [ARG] | C:7 [C] | A:360 [ARG] | B:7 [A] | ❌ 6OON_A:360 no longer at interface |
| A:246 [GLU] | C:7 [C] | A:346 [LEU] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A:246 no longer at interface |
| A:267 [LEU] | C:7 [C] | A:354 [MET] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A:267 no longer at interface |
| A:268 [ASP] | C:7 [C] | A:355 [ILE] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A:268 no longer at interface |
| A:268 [ASP] | C:6 [A] | A:355 [ILE] | B:6 [A] | ❌ 5AWH_A:268 no longer at interface |
| A:272 [ALA] | C:6 [A] | A:359 [ALA] | B:6 [A] | ❌ 5AWH_A:272 no longer at interface |
| A:280 [PHE] | C:7 [C] | A:365 [ARG] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A:280 no longer at interface |
| A:451 [GLU] | C:1 [U] | A:516 [GLY] | B:1 [A] | ❌ 5AWH_A:451 no longer at interface |
| A:455 [ARG] | C:1 [U] | A:518 [THR] | B:1 [A] | ❌ 5AWH_A:455 no longer at interface |
| A:502 [ALA] | C:1 [U] | A:558 [LYS] | B:1 [A] | ❌ 5AWH_A:502 no longer at interface |
| A:502 [ALA] | C:2 [U] | A:558 [LYS] | B:2 [A] | ❌ 5AWH_A:502 no longer at interface |
| A:502 [ALA] | C:3 [A] | A:558 [LYS] | B:3 [A] | ❌ 5AWH_A:502 no longer at interface |
| A:639 [HIS] | C:6 [A] | A:711 [LYS] | B:6 [A] | ❌ 5AWH_A:639 no longer at interface |
| A:644 [VAL] | C:7 [C] | A:716 [ARG] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A:644 no longer at interface |
| A:644 [VAL] | C:6 [A] | A:716 [ARG] | B:6 [A] | ❌ 5AWH_A:644 no longer at interface |
| A:687 [SER] | C:5 [A] | A:756 [ALA] | B:5 [A] | ❌ 5AWH_A:687 no longer at interface |
| A:690 [LEU] | C:5 [A] | A:757 [GLY] | B:5 [A] | ❌ 5AWH_A:690 no longer at interface |
| A:691 [ILE] | C:4 [C] | A:758 [ILE] | B:4 [A] | ❌ 5AWH_A:691 no longer at interface |
| A:691 [ILE] | C:5 [A] | A:758 [ILE] | B:5 [A] | ❌ 5AWH_A:691 no longer at interface |
| A:698 [LEU] | C:7 [C] | A:761 [THR] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A:698 no longer at interface |
| A:698 [LEU] | C:6 [A] | A:761 [THR] | B:6 [A] | ❌ 5AWH_A:698 no longer at interface |
| A:700 [THR] | C:7 [C] | A:763 [ARG] | B:7 [A] | ❌ 5AWH_A:700 no longer at interface |
| A:700 [THR] | C:6 [A] | A:763 [ARG] | B:6 [A] | ❌ 5AWH_A:700 no longer at interface |
| A:729 [SER] | C:3 [A] | A:792 [TYR] | B:3 [A] | ❌ 5AWH_A:729 no longer at interface |
| A:729 [SER] | C:4 [C] | A:792 [TYR] | B:4 [A] | ❌ 5AWH_A:729 no longer at interface |
| A:738 [THR] | C:5 [A] | A:801 [ILE] | B:5 [A] | ❌ 5AWH_A:738 no longer at interface |
| A:751 [LEU] | C:1 [U] | A:814 [ARG] | B:1 [A] | ❌ 5AWH_A:751 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribonuclease H-like & Argonaute, N-terminal domain & SH3 & Middle domain in Argonaute homologs | 0.7 | 3.84 | 0.16 | 0.71 | 0.28 | 0.52 | 0.58 | 0.65 | 0.59 | 0.32 | 0.79 |
Other pairs involving 5AWH_A_C or 6OON_A_B
Total number of entries: 30