Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6OON_A
|
6OON_B
|
6OZS_A
|
6OZS_C,D
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:762 [SER] | B:5 [A] | A:204 [THR] | D:653 [U] | ✔ |
A:762 [SER] | B:6 [A] | A:204 [THR] | D:654 [G] | ✔ |
A:800 [SER] | B:4 [A] | A:231 [ARG] | D:652 [A] | ✔ |
A:800 [SER] | B:5 [A] | A:231 [ARG] | D:653 [U] | ✔ |
A:800 [SER] | B:6 [A] | A:231 [ARG] | D:654 [G] | ✔ |
A:799 [VAL] | B:4 [A] | A:230 [PHE] | D:652 [A] | ✔ |
A:799 [VAL] | B:5 [A] | A:230 [PHE] | D:653 [U] | ✔ |
A:757 [GLY] | B:5 [A] | A:202 [HIS] | D:653 [U] | ✔ |
A:758 [ILE] | B:5 [A] | A:203 [SER] | D:653 [U] | ✔ |
A:755 [HIS] | B:5 [A] | A:200 [HIS] | D:653 [U] | ✔ |
A:763 [ARG] | B:6 [A] | A:205 [LYS] | D:654 [G] | ✔ |
A:763 [ARG] | B:7 [A] | A:205 [LYS] | D:655 [C] | ✔ |
A:806 [TYR] | B:4 [A] | A:237 [ARG] | D:652 [A] | ✔ |
A:711 [LYS] | B:6 [A] | A:155 [LYS] | D:654 [G] | ❌ 6OZS_A_C,D |
A:758 [ILE] | B:4 [A] | A:203 [SER] | D:652 [A] | ❌ 6OZS_A_C,D |
A:755 [HIS] | B:6 [A] | A:200 [HIS] | D:654 [G] | ❌ 6OZS_A_C,D |
A:806 [TYR] | B:5 [A] | A:237 [ARG] | D:653 [U] | ❌ 6OZS_A_C,D |
A:755 [HIS] | B:4 [A] | A:200 [HIS] | D:652 [A] | ❌ 6OON_A_B |
A:758 [ILE] | B:6 [A] | A:203 [SER] | D:654 [G] | ❌ 6OON_A_B |
A:799 [VAL] | B:3 [A] | A:230 [PHE] | D:651 [C] | ❌ 6OON_A_B |
A:806 [TYR] | B:3 [A] | A:237 [ARG] | D:651 [C] | ❌ 6OON_A_B |
A:817 [TYR] | B:3 [A] | A:248 [ARG] | D:651 [C] | ❌ 6OON_A_B |
A:714 [HIS] | B:8 [A] | A:165 [ASN] | D:657 [U] | ❌ 6OZS_A:165, 6OZS_D:328 no longer at interface |
A:716 [ARG] | B:8 [A] | A:170 [LYS] | D:657 [U] | ❌ 6OZS_A:170, 6OZS_D:328 no longer at interface |
A:712 [ARG] | B:8 [A] | A:156 [LYS] | D:657 [U] | ❌ 6OZS_D:328 no longer at interface |
A:763 [ARG] | B:8 [A] | A:205 [LYS] | D:657 [U] | ❌ 6OZS_D:328 no longer at interface |
A:801 [ILE] | B:5 [A] | A:232 [ILE] | D:653 [U] | ❌ 6OZS_A:232 no longer at interface |
A:716 [ARG] | B:6 [A] | A:170 [LYS] | D:654 [G] | ❌ 6OZS_A:170 no longer at interface |
A:716 [ARG] | B:7 [A] | A:170 [LYS] | D:655 [C] | ❌ 6OZS_A:170 no longer at interface |
A:756 [ALA] | B:5 [A] | A:201 [ASP] | D:653 [U] | ❌ 6OZS_A:201 no longer at interface |
A:810 [LEU] | B:3 [A] | A:241 [ILE] | D:651 [C] | ❌ 6OON_A:810 no longer at interface |
A:810 [LEU] | B:4 [A] | A:241 [ILE] | D:652 [A] | ❌ 6OON_A:810 no longer at interface |
A:813 [PHE] | B:3 [A] | A:244 [ARG] | D:651 [C] | ❌ 6OON_A:813 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribonuclease H-like | 0.61 | 2.6 | 0.09 | 0.63 | 0.24 | 0.55 | 0.45 | 0.52 | 0.64 | 0.20 | 0.55 |
Other pairs involving 6OON_A_B or 6OZS_A_C,D
Total number of entries: 31