Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6OZP_A
|
6OZP_C,D
|
6OZS_A
|
6OZS_C,D
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:204 [THR] | D:41 [U] | A:204 [THR] | D:653 [U] | ✔ |
A:204 [THR] | D:42 [G] | A:204 [THR] | D:654 [G] | ✔ |
A:200 [HIS] | D:40 [A] | A:200 [HIS] | D:652 [A] | ✔ |
A:200 [HIS] | D:41 [U] | A:200 [HIS] | D:653 [U] | ✔ |
A:155 [LYS] | C:12 [U] | A:155 [LYS] | C:318 [U] | ✔ |
A:230 [PHE] | D:40 [A] | A:230 [PHE] | D:652 [A] | ✔ |
A:230 [PHE] | D:41 [U] | A:230 [PHE] | D:653 [U] | ✔ |
A:205 [LYS] | D:42 [G] | A:205 [LYS] | D:654 [G] | ✔ |
A:205 [LYS] | D:43 [C] | A:205 [LYS] | D:655 [C] | ✔ |
A:57 [LYS] | C:13 [A] | A:57 [LYS] | C:319 [A] | ✔ |
A:57 [LYS] | C:14 [U] | A:57 [LYS] | C:320 [U] | ✔ |
A:248 [ARG] | D:37 [U] | A:248 [ARG] | D:649 [U] | ✔ |
A:248 [ARG] | D:38 [G] | A:248 [ARG] | D:650 [G] | ✔ |
A:248 [ARG] | D:39 [C] | A:248 [ARG] | D:651 [C] | ✔ |
A:237 [ARG] | D:39 [C] | A:237 [ARG] | D:651 [C] | ✔ |
A:237 [ARG] | D:40 [A] | A:237 [ARG] | D:652 [A] | ✔ |
A:156 [LYS] | C:12 [U] | A:156 [LYS] | C:318 [U] | ✔ |
A:156 [LYS] | D:46 [U] | A:156 [LYS] | D:658 [U] | ✔ |
A:203 [SER] | D:41 [U] | A:203 [SER] | D:653 [U] | ✔ |
A:203 [SER] | D:42 [G] | A:203 [SER] | D:654 [G] | ✔ |
A:126 [ASP] | C:12 [U] | A:126 [ASP] | C:318 [U] | ✔ |
A:241 [ILE] | D:39 [C] | A:241 [ILE] | D:651 [C] | ✔ |
A:241 [ILE] | D:40 [A] | A:241 [ILE] | D:652 [A] | ✔ |
A:52 [ASP] | C:12 [U] | A:52 [ASP] | C:318 [U] | ✔ |
A:54 [SER] | C:12 [U] | A:54 [SER] | C:318 [U] | ✔ |
A:54 [SER] | C:13 [A] | A:54 [SER] | C:319 [A] | ✔ |
A:240 [ASP] | C:12 [U] | A:240 [ASP] | C:318 [U] | ✔ |
A:240 [ASP] | C:13 [A] | A:240 [ASP] | C:319 [A] | ✔ |
A:202 [HIS] | D:41 [U] | A:202 [HIS] | D:653 [U] | ✔ |
A:53 [VAL] | C:12 [U] | A:53 [VAL] | C:318 [U] | ✔ |
A:55 [PHE] | C:12 [U] | A:55 [PHE] | C:318 [U] | ✔ |
A:55 [PHE] | C:13 [A] | A:55 [PHE] | C:319 [A] | ✔ |
A:231 [ARG] | D:40 [A] | A:231 [ARG] | D:652 [A] | ✔ |
A:231 [ARG] | D:41 [U] | A:231 [ARG] | D:653 [U] | ✔ |
A:231 [ARG] | D:42 [G] | A:231 [ARG] | D:654 [G] | ✔ |
A:244 [ARG] | C:13 [A] | A:244 [ARG] | C:319 [A] | ✔ |
A:244 [ARG] | D:38 [G] | A:244 [ARG] | D:650 [G] | ✔ |
A:244 [ARG] | D:39 [C] | A:244 [ARG] | D:651 [C] | ✔ |
A:53 [VAL] | C:13 [A] | A:53 [VAL] | C:319 [A] | ❌ 6OZS_A_C,D |
A:230 [PHE] | D:39 [C] | A:230 [PHE] | D:651 [C] | ❌ 6OZP_A_C,D |
A:156 [LYS] | D:45 [U] | A:156 [LYS] | D:657 [U] | ❌ 6OZS_D:657 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribonuclease H-like | 0.99 | 0.16 | 1.00 | 0.99 | 0.85 | 1.0 | 1.0 | 0.99 | 0.97 | 1.00 | 0.33 |
Other pairs involving 6OZP_A_C,D or 6OZS_A_C,D
Total number of entries: 27