RNAprotDB

5HO4_A	5HO4_B	6DCL_A	6DCL_C	Conserved?
A:102 [SER]	B:2 [A]	A:95 [SER]	C:4 [A]	✔
A:102 [SER]	B:3 [G]	A:95 [SER]	C:5 [G]	✔
A:92 [GLU]	B:1 [A]	A:85 [GLU]	C:3 [U]	✔
A:99 [ARG]	B:3 [G]	A:92 [ARG]	C:5 [G]	✔
A:22 [LYS]	B:3 [G]	A:15 [LYS]	C:5 [G]	✔
A:98 [ALA]	B:3 [G]	A:91 [SER]	C:5 [G]	✔
A:96 [ALA]	B:2 [A]	A:89 [ALA]	C:4 [A]	✔
A:96 [ALA]	B:3 [G]	A:89 [ALA]	C:5 [G]	✔
A:53 [MET]	B:3 [G]	A:46 [MET]	C:5 [G]	✔
A:19 [GLN]	B:3 [G]	A:12 [GLN]	C:5 [G]	✔
A:24 [PHE]	B:1 [A]	A:17 [PHE]	C:3 [U]	✔
A:24 [PHE]	B:2 [A]	A:17 [PHE]	C:4 [A]	✔
A:26 [GLY]	B:1 [A]	A:19 [GLY]	C:3 [U]	✔
A:66 [PHE]	B:2 [A]	A:59 [PHE]	C:4 [A]	✔
A:66 [PHE]	B:3 [G]	A:59 [PHE]	C:5 [G]	✔
A:64 [PHE]	B:1 [A]	A:57 [PHE]	C:3 [U]	✔
A:64 [PHE]	B:2 [A]	A:57 [PHE]	C:4 [A]	✔
A:64 [PHE]	B:3 [G]	A:57 [PHE]	C:5 [G]	✔
A:97 [VAL]	B:2 [A]	A:90 [VAL]	C:4 [A]	✔
A:97 [VAL]	B:3 [G]	A:90 [VAL]	C:5 [G]	✔
A:63 [GLY]	B:1 [A]	A:56 [GLY]	C:3 [U]	✔
A:94 [LYS]	B:2 [A]	A:87 [LYS]	C:4 [A]	✔
A:108 [HIS]	B:2 [A]	A:101 [HIS]	C:4 [A]	✔
A:27 [GLY]	B:1 [A]	A:20 [GLY]	C:3 [U]	✔
A:62 [ARG]	B:1 [A]	A:55 [ARG]	C:3 [U]	✔
A:62 [ARG]	B:2 [A]	A:55 [ARG]	C:4 [A]	✔
A:62 [ARG]	B:3 [G]	A:55 [ARG]	C:5 [G]	✔
A:95 [ARG]	B:2 [A]	A:88 [ARG]	C:4 [A]	✔
A:108 [HIS]	B:3 [G]	A:101 [HIS]	C:5 [G]	❌ 6DCL_A_C
A:94 [LYS]	B:1 [A]	A:87 [LYS]	C:3 [U]	❌ 5HO4_A_B
A:90 [VAL]	B:1 [A]	A:83 [VAL]	C:3 [U]	❌ 6DCL_A:83 no longer at interface
A:30 [PHE]	B:1 [A]	A:23 [PHE]	C:3 [U]	❌ 5HO4_A:30 no longer at interface
A:89 [ARG]	B:1 [A]	A:82 [ARG]	C:3 [U]	❌ 5HO4_A:89 no longer at interface

Export the table of contacts

Interface 1	Interface 2	Percentage conservation	Interface TM-score	Interface RMSD	Percentage identity	Common ECOD label(s)	Explore both interfaces
1URN_A_P	5HO4_A_B	0.68	0.59	2.13	0.0	RNA-binding domain, RBD	compare
5HO4_A_B	5WWF_A_B	0.87	0.94	0.85	0.4	RNA-binding domain, RBD	compare
5HO4_A_B	5WWE_A_B	0.93	0.93	0.72	0.6	RNA-binding domain, RBD	compare
5HO4_A_B	6DCL_A_C	0.98	0.92	0.75	0.4	RNA-binding domain, RBD	compare

Interface analysis