Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 2EZ6_A
|
2EZ6_C
|
2NUF_A
|
2NUF_C
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| A:180 [HIS] | C:7 [C] | A:180 [HIS] | C:7 [C] | ✔ |
| A:180 [HIS] | C:8 [A] | A:180 [HIS] | C:8 [A] | ✔ |
| A:180 [HIS] | C:20 [G] | A:180 [HIS] | C:20 [G] | ✔ |
| A:180 [HIS] | C:21 [G] | A:180 [HIS] | C:21 [G] | ✔ |
| A:103 [THR] | C:20 [G] | A:103 [THR] | C:20 [G] | ✔ |
| A:179 [HIS] | C:6 [U] | A:179 [HIS] | C:6 [U] | ✔ |
| A:179 [HIS] | C:7 [C] | A:179 [HIS] | C:7 [C] | ✔ |
| A:179 [HIS] | C:21 [G] | A:179 [HIS] | C:21 [G] | ✔ |
| A:179 [HIS] | C:22 [C] | A:179 [HIS] | C:22 [C] | ✔ |
| A:201 [SER] | C:22 [C] | A:201 [SER] | C:22 [C] | ✔ |
| A:201 [SER] | C:23 [C] | A:201 [SER] | C:23 [C] | ✔ |
| A:97 [ARG] | C:10 [U] | A:97 [ARG] | C:10 [U] | ✔ |
| A:97 [ARG] | C:11 [C] | A:97 [ARG] | C:11 [C] | ✔ |
| A:44 [ASN] | C:1 [A] | A:44 [ASP] | C:1 [C] | ✔ |
| A:202 [LYS] | C:22 [C] | A:202 [LYS] | C:22 [C] | ✔ |
| A:202 [LYS] | C:23 [C] | A:202 [LYS] | C:23 [C] | ✔ |
| A:202 [LYS] | C:24 [U] | A:202 [LYS] | C:24 [U] | ✔ |
| A:29 [SER] | C:18 [G] | A:29 [SER] | C:18 [G] | ✔ |
| A:181 [LYS] | C:21 [G] | A:181 [LYS] | C:21 [G] | ✔ |
| A:104 [ILE] | C:19 [U] | A:104 [ILE] | C:19 [U] | ✔ |
| A:27 [HIS] | C:18 [G] | A:27 [HIS] | C:18 [G] | ✔ |
| A:27 [HIS] | C:19 [U] | A:27 [HIS] | C:19 [U] | ✔ |
| A:28 [VAL] | C:18 [G] | A:28 [VAL] | C:18 [G] | ✔ |
| A:184 [PHE] | C:22 [C] | A:184 [PHE] | C:22 [C] | ✔ |
| A:184 [PHE] | C:23 [C] | A:184 [PHE] | C:23 [C] | ✔ |
| A:101 [ASN] | C:19 [U] | A:101 [ASN] | C:19 [U] | ✔ |
| A:101 [ASN] | C:20 [G] | A:101 [ASN] | C:20 [G] | ✔ |
| A:203 [LYS] | C:23 [C] | A:203 [LYS] | C:23 [C] | ✔ |
| A:200 [LYS] | C:21 [G] | A:200 [LYS] | C:21 [G] | ✔ |
| A:200 [LYS] | C:22 [C] | A:200 [LYS] | C:22 [C] | ✔ |
| A:182 [LYS] | C:21 [G] | A:182 [LYS] | C:21 [G] | ✔ |
| A:182 [LYS] | C:22 [C] | A:182 [LYS] | C:22 [C] | ✔ |
| A:97 [ARG] | C:18 [G] | A:97 [ARG] | C:18 [G] | ❌ 2NUF_A_C |
| A:97 [ARG] | C:19 [U] | A:97 [ARG] | C:19 [U] | ❌ 2NUF_A_C |
| A:28 [VAL] | C:19 [U] | A:28 [VAL] | C:19 [U] | ❌ 2EZ6_A_C |
| A:28 [VAL] | C:17 [A] | A:28 [VAL] | C:17 [A] | ❌ 2EZ6_C:17 no longer at interface |
| A:40 [GLU] | C:2 [A] | A:40 [GLU] | C:2 [A] | ❌ 2EZ6_A:40, 2EZ6_C:2 no longer at interface |
| A:41 [PHE] | C:2 [A] | A:41 [PHE] | C:2 [A] | ❌ 2EZ6_A:41, 2EZ6_C:2 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RNase III catalytic domain-like & dsRNA-binding domain-like | 1.0 | 0.85 | 0.92 | 1.0 | 0.83 | 1.0 | 1.0 | 0.90 | 0.86 | 0.50 | 0.50 |
Other pairs involving 2EZ6_A_C or 2NUF_A_C
Total number of entries: 2
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2NUF_A_C | 2NUG_A_C,E | 0.45 | 0.79 | 2.81 | 0.08 | RNase III catalytic domain-like & dsRNA-binding domain-like | compare | |
| 2EZ6_A_C | 2NUF_A_C | 0.90 | 1.0 | 0.85 | 0.92 | RNase III catalytic domain-like & dsRNA-binding domain-like | compare |