RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group4 > 2ASB_A_B vs 2ATW_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

2ASB_A
2ASB_B
2ATW_A
2ATW_B
Conserved?
A:240 [GLY] B:1 [G] A:240 [GLY] B:1 [G] ✔
A:240 [GLY] B:2 [A] A:240 [GLY] B:2 [A] ✔
A:257 [ILE] B:2 [A] A:257 [ILE] B:2 [A] ✔
A:257 [ILE] B:3 [A] A:257 [ILE] B:3 [A] ✔
A:237 [GLY] B:1 [G] A:237 [GLY] B:1 [G] ✔
A:306 [GLU] B:7 [A] A:306 [GLU] B:7 [A] ✔
A:306 [GLU] B:8 [A] A:306 [GLU] B:8 [A] ✔
A:254 [LYS] B:3 [A] A:254 [LYS] B:3 [A] ✔
A:254 [LYS] B:4 [C] A:254 [LYS] B:4 [C] ✔
A:217 [ARG] B:3 [A] A:217 [ARG] B:3 [A] ✔
A:217 [ARG] B:4 [C] A:217 [ARG] B:4 [C] ✔
A:230 [ASN] B:1 [G] A:230 [ASN] B:1 [G] ✔
A:238 [PRO] B:1 [G] A:238 [PRO] B:1 [G] ✔
A:247 [MET] B:2 [A] A:247 [MET] B:2 [A] ✔
A:236 [ILE] B:1 [G] A:236 [ILE] B:1 [G] ✔
A:236 [ILE] B:2 [A] A:236 [ILE] B:2 [A] ✔
A:319 [TRP] B:10 [A] A:319 [TRP] B:10 [A] ✔
A:311 [ARG] B:8 [A] A:311 [ARG] B:8 [A] ✔
A:311 [ARG] B:10 [A] A:311 [ARG] B:10 [A] ✔
A:303 [ILE] B:7 [A] A:303 [ILE] B:7 [A] ✔
A:303 [ILE] B:8 [A] A:303 [ILE] B:8 [A] ✔
A:273 [SER] B:3 [A] A:273 [SER] B:3 [A] ✔
A:314 [ALA] B:10 [A] A:314 [ALA] B:10 [A] ✔
A:299 [LEU] B:5 [U] A:299 [LEU] B:5 [U] ✔
A:299 [LEU] B:7 [A] A:299 [LEU] B:7 [A] ✔
A:315 [ARG] B:10 [A] A:315 [ARG] B:10 [A] ✔
A:300 [SER] B:5 [U] A:300 [SER] B:5 [U] ✔
A:300 [SER] B:6 [C] A:300 [SER] B:6 [C] ✔
A:300 [SER] B:7 [A] A:300 [SER] B:7 [A] ✔
A:310 [ALA] B:8 [A] A:310 [ALA] B:8 [A] ✔
A:310 [ALA] B:10 [A] A:310 [ALA] B:10 [A] ✔
A:305 [LYS] B:6 [C] A:305 [LYS] B:6 [C] ✔
A:305 [LYS] B:7 [A] A:305 [LYS] B:7 [A] ✔
A:304 [GLY] B:6 [C] A:304 [GLY] B:6 [C] ✔
A:304 [GLY] B:7 [A] A:304 [GLY] B:7 [A] ✔
A:243 [VAL] B:2 [A] A:243 [VAL] B:2 [A] ✔
A:232 [LYS] B:1 [G] A:232 [LYS] B:1 [G] ✔
A:232 [LYS] B:2 [A] A:232 [LYS] B:2 [A] ✔
A:307 [GLY] B:7 [A] A:307 [GLY] B:7 [A] ✔
A:307 [GLY] B:8 [A] A:307 [GLY] B:8 [A] ✔
A:307 [GLY] B:10 [A] A:307 [GLY] B:10 [A] ✔
A:323 [ILE] B:8 [A] A:323 [ILE] B:8 [A] ✔
A:320 [ARG] B:10 [A] A:320 [ARG] B:10 [A] ✔
A:298 [GLN] B:5 [U] A:298 [GLN] B:5 [U] ✔
A:322 [ASP] B:8 [A] A:322 [ASP] B:8 [A] ✔
A:322 [ASP] B:9 [U] A:322 [ASP] B:9 [U] ✔
A:233 [GLY] B:1 [G] A:233 [GLY] B:1 [G] ✔
A:297 [PHE] B:5 [U] A:297 [PHE] B:5 [U] ✔
A:274 [PRO] B:3 [A] A:274 [PRO] B:3 [A] ✔
A:274 [PRO] B:4 [C] A:274 [PRO] B:4 [C] ✔
A:239 [MET] B:1 [G] A:239 [MET] B:1 [G] ✔
A:321 [ILE] B:8 [A] A:321 [ILE] B:8 [A] ✔
A:321 [ILE] B:9 [U] A:321 [ILE] B:9 [U] ✔
A:321 [ILE] B:10 [A] A:321 [ILE] B:10 [A] ✔
A:301 [LEU] B:4 [C] A:301 [LEU] B:4 [C] ✔
A:301 [LEU] B:5 [U] A:301 [LEU] B:5 [U] ✔
A:256 [ASP] B:2 [A] A:256 [ASP] B:2 [A] ✔
A:256 [ASP] B:3 [A] A:256 [ASP] B:3 [A] ✔
A:258 [ILE] B:3 [A] A:258 [ILE] B:3 [A] ✔
A:244 [ARG] B:2 [A] A:244 [ARG] B:2 [A] ✔
A:244 [ARG] B:3 [A] A:244 [ARG] B:3 [A] ✔
A:255 [ILE] B:2 [A] A:255 [ILE] B:2 [A] ✔
A:255 [ILE] B:3 [A] A:255 [ILE] B:3 [A] ✔
A:247 [MET] B:3 [A] A:247 [MET] B:3 [A] ❌ 2ATW_A_B
A:323 [ILE] B:9 [U] A:323 [ILE] B:9 [U] ❌ 2ATW_A_B
A:320 [ARG] B:9 [U] A:320 [ARG] B:9 [U] ❌ 2ATW_A_B
A:239 [MET] B:2 [A] A:239 [MET] B:2 [A] ❌ 2ASB_A_B
A:322 [ASP] B:10 [A] A:322 [ASP] B:10 [A] ❌ 2ASB_A_B
A:311 [ARG] B:11 [G] A:311 [ARG] B:11 [G] ❌ 2ATW_B:11 no longer at interface
A:324 [ARG] B:8 [A] A:324 [ARG] B:8 [A] ❌ 2ATW_A:324 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II) 0.98 0.29 0.91 0.99 0.63 0.97 0.91 0.98 0.99 0.69 0.29


Other pairs involving 2ASB_A_B or 2ATW_A_B

Total number of entries: 1

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
2ASB_A_B 2ATW_A_B 0.98 0.98 0.29 0.91 Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II) compare