RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group41 > 4RWN_A_B,C vs 4S3N_A_B,C

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4RWN_A
4RWN_B,C
4S3N_A
4S3N_B,C
Conserved?
A:37 [CYS] C:24 [U] A:37 [ALA] C:24 [U] ✔
A:205 [LYS] B:7 [U] A:200 [LYS] B:7 [U] ✔
A:205 [LYS] B:8 [G] A:200 [LYS] B:8 [G] ✔
A:42 [GLU] B:16 [U] A:42 [GLU] B:16 [U] ✔
A:42 [GLU] B:17 [G] A:42 [GLU] B:17 [G] ✔
A:20 [LEU] B:6 [U] A:20 [GLN] B:6 [U] ✔
A:53 [ARG] B:18 [A] A:53 [ARG] B:18 [A] ✔
A:53 [ARG] B:19 [A] A:53 [ARG] B:19 [A] ✔
A:199 [ASN] B:8 [G] A:194 [ILE] B:8 [G] ✔
A:199 [ASN] B:9 [A] A:194 [ILE] B:9 [A] ✔
A:58 [VAL] C:23 [A] A:58 [VAL] C:23 [A] ✔
A:58 [VAL] C:24 [U] A:58 [VAL] C:24 [U] ✔
A:200 [ARG] B:7 [U] A:195 [ARG] B:7 [U] ✔
A:56 [LYS] B:17 [G] A:56 [LYS] B:17 [G] ✔
A:56 [LYS] C:22 [C] A:56 [LYS] C:22 [C] ✔
A:56 [LYS] C:23 [A] A:56 [LYS] C:23 [A] ✔
A:203 [LYS] C:34 [A] A:198 [LYS] C:34 [A] ✔
A:203 [LYS] C:35 [A] A:198 [LYS] C:35 [A] ✔
A:247 [THR] C:33 [A] A:244 [ASP] C:33 [A] ✔
A:247 [THR] C:34 [A] A:244 [ASP] C:34 [A] ✔
A:23 [THR] B:5 [U] A:23 [LYS] B:5 [U] ✔
A:23 [THR] B:6 [U] A:23 [LYS] B:6 [U] ✔
A:157 [GLN] B:18 [A] A:155 [GLN] B:18 [A] ✔
A:157 [GLN] B:19 [A] A:155 [GLN] B:19 [A] ✔
A:157 [GLN] C:21 [U] A:155 [GLN] C:21 [U] ✔
A:157 [GLN] C:22 [C] A:155 [GLN] C:22 [C] ✔
A:30 [LYS] C:25 [A] A:30 [ARG] C:25 [A] ✔
A:30 [LYS] C:26 [A] A:30 [ARG] C:26 [A] ✔
A:55 [SER] B:17 [G] A:55 [LEU] B:17 [G] ✔
A:55 [SER] B:18 [A] A:55 [LEU] B:18 [A] ✔
A:55 [SER] C:22 [C] A:55 [LEU] C:22 [C] ✔
A:16 [GLU] C:35 [A] A:16 [ALA] C:35 [A] ✔
A:16 [GLU] C:36 [G] A:16 [ALA] C:36 [G] ✔
A:248 [ASP] C:34 [A] A:245 [ALA] C:34 [A] ✔
A:206 [SER] C:34 [A] A:201 [ASN] C:34 [A] ✔
A:13 [LYS] C:35 [A] A:13 [ARG] C:35 [A] ✔
A:13 [LYS] C:36 [G] A:13 [ARG] C:36 [G] ✔
A:13 [LYS] C:37 [C] A:13 [ARG] C:37 [C] ✔
A:194 [ARG] C:24 [U] A:189 [ARG] C:24 [U] ✔
A:59 [LYS] C:24 [U] A:59 [LYS] C:24 [U] ✔
A:59 [LYS] C:25 [A] A:59 [LYS] C:25 [A] ✔
A:57 [VAL] C:23 [A] A:57 [THR] C:23 [A] ✔
A:57 [VAL] C:24 [U] A:57 [THR] C:24 [U] ✔
A:12 [ASP] C:35 [A] A:12 [ASP] C:35 [A] ✔
A:12 [ASP] C:36 [G] A:12 [ASP] C:36 [G] ✔
A:54 [VAL] B:17 [G] A:54 [VAL] B:17 [G] ✔
A:54 [VAL] B:18 [A] A:54 [VAL] B:18 [A] ✔
A:34 [ASP] C:24 [U] A:34 [GLY] C:24 [U] ✔
A:34 [ASP] C:25 [A] A:34 [GLY] C:25 [A] ✔
A:82 [THR] B:19 [A] A:82 [ASP] B:19 [A] ✔
A:202 [THR] B:6 [U] A:197 [ALA] B:6 [U] ✔
A:202 [THR] B:7 [U] A:197 [ALA] B:7 [U] ✔
A:202 [THR] C:33 [A] A:197 [ALA] C:33 [A] ✔
A:202 [THR] C:34 [A] A:197 [ALA] C:34 [A] ✔
A:41 [LYS] B:16 [U] A:41 [ARG] B:16 [U] ✔
A:41 [LYS] B:17 [G] A:41 [ARG] B:17 [G] ✔
A:41 [LYS] C:24 [U] A:41 [ARG] C:24 [U] ✔
A:191 [GLU] C:22 [C] A:186 [GLU] C:22 [C] ✔
A:191 [GLU] C:23 [A] A:186 [GLU] C:23 [A] ✔
A:198 [ARG] B:7 [U] A:193 [ASN] B:7 [U] ✔
A:198 [ARG] B:8 [G] A:193 [ASN] B:8 [G] ✔
A:201 [PRO] C:33 [A] A:196 [PRO] C:33 [A] ✔
A:20 [LEU] C:35 [A] A:20 [GLN] C:35 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:55 [SER] C:23 [A] A:55 [LEU] C:23 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:16 [GLU] B:5 [U] A:16 [ALA] B:5 [U] ❌ 4S3N_A_B,C
A:248 [ASP] C:35 [A] A:245 [ALA] C:35 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:194 [ARG] C:23 [A] A:189 [ARG] C:23 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:59 [LYS] C:23 [A] A:59 [LYS] C:23 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:82 [THR] B:18 [A] A:82 [ASP] B:18 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:41 [LYS] C:23 [A] A:41 [ARG] C:23 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:198 [ARG] B:9 [A] A:193 [ASN] B:9 [A] ❌ 4S3N_A_B,C
A:198 [ARG] C:24 [U] A:193 [ASN] C:24 [U] ❌ 4S3N_A_B,C
A:194 [ARG] B:8 [G] A:189 [ARG] B:8 [G] ❌ 4RWN_A_B,C
A:206 [SER] C:35 [A] A:201 [ASN] C:35 [A] ❌ 4RWN_A_B,C
A:55 [SER] B:19 [A] A:55 [LEU] B:19 [A] ❌ 4RWN_A_B,C
A:41 [LYS] B:15 [A] A:41 [ARG] B:15 [A] ❌ 4RWN_B:15 no longer at interface
A:65 [LYS] B:7 [U] A:65 [ARG] B:7 [U] ❌ 4S3N_A:65 no longer at interface
A:65 [LYS] B:8 [G] A:65 [ARG] B:8 [G] ❌ 4S3N_A:65 no longer at interface
A:68 [THR] B:7 [U] A:68 [ALA] B:7 [U] ❌ 4S3N_A:68 no longer at interface
A:66 [GLY] B:7 [U] A:66 [GLY] B:7 [U] ❌ 4S3N_A:66 no longer at interface
A:66 [GLY] B:8 [G] A:66 [GLY] B:8 [G] ❌ 4S3N_A:66 no longer at interface
A:26 [ARG] B:6 [U] A:26 [VAL] B:6 [U] ❌ 4S3N_A:26 no longer at interface
A:26 [ARG] B:7 [U] A:26 [VAL] B:7 [U] ❌ 4S3N_A:26 no longer at interface
A:31 [GLU] C:25 [A] A:31 [ARG] C:25 [A] ❌ 4S3N_A:31 no longer at interface
A:22 [ASN] B:6 [U] A:22 [ARG] B:6 [U] ❌ 4S3N_A:22 no longer at interface
A:21 [PRO] B:5 [U] A:21 [PRO] B:5 [U] ❌ 4S3N_A:21 no longer at interface
A:21 [PRO] B:6 [U] A:21 [PRO] B:6 [U] ❌ 4S3N_A:21 no longer at interface
A:21 [PRO] B:7 [U] A:21 [PRO] B:7 [U] ❌ 4S3N_A:21 no longer at interface
A:64 [GLY] B:8 [G] A:64 [GLY] B:8 [G] ❌ 4S3N_A:64 no longer at interface
A:17 [ASP] C:36 [G] A:17 [ARG] C:36 [G] ❌ 4S3N_A:17 no longer at interface
A:63 [SER] B:8 [G] A:63 [SER] B:8 [G] ❌ 4S3N_A:63 no longer at interface
A:27 [THR] C:26 [A] A:27 [GLU] C:26 [A] ❌ 4S3N_A:27 no longer at interface
A:209 [ARG] B:6 [U] A:204 [LEU] B:6 [U] ❌ 4S3N_A:204 no longer at interface
A:209 [ARG] B:7 [U] A:204 [LEU] B:7 [U] ❌ 4S3N_A:204 no longer at interface
A:33 [ILE] C:24 [U] A:33 [LEU] C:24 [U] ❌ 4S3N_A:33 no longer at interface
A:33 [ILE] C:25 [A] A:33 [LEU] C:25 [A] ❌ 4S3N_A:33 no longer at interface
A:156 [GLY] C:22 [C] A:154 [GLY] C:22 [C] ❌ 4RWN_A:156 no longer at interface
A:249 [PHE] C:35 [A] A:246 [PHE] C:35 [A] ❌ 4RWN_A:249 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
PAP/OAS1 substrate-binding domain & Nucleotidyltransferase 0.9 0.98 0.42 0.89 0.69 0.94 1.0 0.80 0.75 0.32 0.64


Other pairs involving 4RWN_A_B,C or 4S3N_A_B,C

Total number of entries: 3

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4RWO_A_B,C 4S3N_A_B,C 0.81 0.89 1.07 0.42 PAP/OAS1 substrate-binding domain & Nucleotidyltransferase compare
4RWN_A_B,C 4RWO_A_B,C 0.98 1.0 0.24 0.95 PAP/OAS1 substrate-binding domain & Nucleotidyltransferase compare
4RWN_A_B,C 4S3N_A_B,C 0.80 0.9 0.98 0.42 PAP/OAS1 substrate-binding domain & Nucleotidyltransferase compare