RNAprotDB

Contacts -

6AZ3_i	6AZ3_1	Distance	Base Pair	Hbond nuc:res	Base Stacking	Residue conservation
i:7 [ARG]	1:71 [C]	3.68				24.0
i:7 [ARG]	1:72 [G]	3.9	1:67 [C]			24.0
i:16 [LYS]	1:69 [A2M]	4.84				69.8
i:16 [LYS]	1:70 [C]	3.72	1:68 [A]			69.8
i:16 [LYS]	1:71 [C]	4.59				69.8
i:17 [GLY]	1:71 [C]	3.41				95.0
i:18 [HIS]	1:71 [C]	3.31			base/AA stacks	70.1
i:20 [THR]	1:71 [C]	3.91				75.4
i:20 [THR]	1:72 [G]	3.55	1:67 [C]			75.4
i:25 [ARG]	1:350 [C]	4.97	1:341 [G]			2.5
i:25 [ARG]	1:351 [U]	3.01	1:340 [A]			2.5
i:25 [ARG]	1:352 [G]	2.86	1:339 [C]			2.5
i:27 [PRO]	1:154 [A]	3.28				0.6
i:28 [SER]	1:154 [A]	3.45				47.0
i:29 [PRO]	1:154 [A]	3.48				39.3
i:29 [PRO]	1:303 [C]	4.0				39.3
i:30 [ASN]	1:337 [G]	4.59	1:354 [C]			67.1
i:30 [ASN]	1:354 [C]	2.84	1:337 [G]		base/AA stacks	67.1
i:32 [ARG]	1:154 [A]	4.49				49.5
i:32 [ARG]	1:300 [A]	4.73				49.5
i:32 [ARG]	1:301 [A]	3.6			base/AA stacks	49.5
i:32 [ARG]	1:302 [G]	3.57		base:SC		49.5
i:32 [ARG]	1:303 [C]	4.1				49.5
i:33 [PHE]	1:303 [C]	3.57			base/AA stacks	50.9
i:33 [PHE]	1:334 [G]	4.25				50.9
i:33 [PHE]	1:337 [G]	3.57	1:354 [C]		base/AA stacks	50.9
i:33 [PHE]	1:354 [C]	3.79	1:337 [G]		base/AA stacks	50.9
i:34 [ALA]	1:337 [G]	3.98	1:354 [C]			52.3
i:35 [VAL]	1:334 [G]	4.47				1.7
i:35 [VAL]	1:335 [U]	3.93				1.7
i:36 [PRO]	1:302 [G]	4.44				0.0
i:36 [PRO]	1:335 [U]	3.14				0.0
i:37 [HIS]	1:302 [G]	3.25				65.8
i:37 [HIS]	1:303 [C]	4.9				65.8
i:37 [HIS]	1:334 [G]	3.13				65.8
i:37 [HIS]	1:335 [U]	2.38				65.8
i:38 [LYS]	1:301 [A]	3.76				75.4
i:38 [LYS]	1:302 [G]	3.47				75.4
i:38 [LYS]	1:335 [U]	3.29				75.4
i:39 [HIS]	1:117 [G]	4.41	1:151 [C]			75.7
i:39 [HIS]	1:301 [A]	3.26				75.7
i:39 [HIS]	1:302 [G]	2.97				75.7
i:40 [LEU]	1:301 [A]	4.62				39.0
i:40 [LEU]	1:302 [G]	2.82				39.0
i:40 [LEU]	1:303 [C]	4.25				39.0
i:40 [LEU]	1:334 [G]	4.31				39.0
i:40 [LEU]	1:335 [U]	4.81				39.0
i:41 [ARG]	1:334 [G]	4.54				37.4
i:41 [ARG]	1:335 [U]	3.4		sugar:SC	base/AA stacks	37.4
i:44 [LYS]	1:333 [A]	4.98	1:305 [A]			77.8
i:44 [LYS]	1:334 [G]	3.37		base:SC		77.8
i:54 [SER]	1:332 [A]	4.64	1:307 [U]			80.2
i:55 [PRO]	1:331 [C]	4.68	1:308 [A]			98.7
i:56 [LEU]	1:331 [C]	3.54	1:308 [A]			88.8
i:56 [LEU]	1:332 [A]	4.34	1:307 [U]			88.8
i:77 [LYS]	1:310 [C]	4.78	1:329 [G]			93.6
i:77 [LYS]	1:346 [U]	4.59	2:1220 [A]			93.6
i:78 [LYS]	1:310 [C]	4.98	1:329 [G]			73.8
i:78 [LYS]	1:330 [U]	4.5	1:309 [G]			73.8
i:79 [ARG]	1:309 [G]	3.73	1:330 [U]	base:BB		88.9
i:79 [ARG]	1:330 [U]	2.82	1:309 [G]	sugar:BB		88.9
i:79 [ARG]	1:331 [C]	2.99	1:308 [A]			88.9
i:80 [LEU]	1:309 [G]	2.73	1:330 [U]	base:BB		88.1
i:80 [LEU]	1:310 [C]	4.71	1:329 [G]			88.1
i:80 [LEU]	1:330 [U]	4.76	1:309 [G]			88.1
i:80 [LEU]	1:331 [C]	3.71	1:308 [A]			88.1
i:80 [LEU]	1:332 [A]	4.61	1:307 [U]			88.1
i:81 [GLY]	1:309 [G]	4.04	1:330 [U]			96.5
i:81 [GLY]	1:310 [C]	3.42	1:329 [G]			96.5
i:82 [ASP]	1:310 [C]	4.8	1:329 [G]			78.5
i:83 [PHE]	1:346 [U]	3.61	2:1220 [A]			79.7
i:83 [PHE]	1:347 [U]	3.84	2:1219 [A]			79.7
i:84 [THR]	1:338 [G]	4.62	1:353 [C]			49.2
i:84 [THR]	1:347 [U]	4.37	2:1219 [A]			49.2
i:85 [ALA]	1:332 [A]	3.96	1:307 [U]			87.7
i:87 [LYS]	1:346 [U]	4.41	2:1220 [A]			86.3
i:87 [LYS]	1:347 [U]	2.91	2:1219 [A]			86.3
i:88 [LYS]	1:333 [A]	3.21	1:305 [A]	sugar:SC		65.8
i:88 [LYS]	1:334 [G]	3.93				65.8
i:88 [LYS]	1:337 [G]	4.47	1:354 [C]			65.8
i:88 [LYS]	1:338 [G]	4.09	1:353 [C]			65.8
i:89 [LYS]	1:332 [A]	4.23	1:307 [U]			98.8
i:89 [LYS]	1:333 [A]	3.13	1:305 [A]			98.8
i:92 [LYS]	1:333 [A]	3.0	1:305 [A]			65.4
i:92 [LYS]	1:334 [G]	4.44				65.4

Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

RNAprotDB

Interface analysis

Style

Color

View

Interface

Contacts -

Properties of this interface

Interologs