RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group53 > 6AZ3_i_1 vs 7O7Y_Bi_B5

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6AZ3_i
6AZ3_1
7O7Y_Bi
7O7Y_B5
Conserved?
i:18 [HIS] 1:71 [C] Bi:15 [HIS] B5:72 [C] ✔
i:81 [GLY] 1:309 [G] Bi:78 [GLY] B5:283 [G] ✔
i:81 [GLY] 1:310 [C] Bi:78 [GLY] B5:284 [G] ✔
i:20 [THR] 1:71 [C] Bi:17 [VAL] B5:72 [C] ✔
i:20 [THR] 1:72 [G] Bi:17 [VAL] B5:73 [A] ✔
i:32 [ARG] 1:154 [A] Bi:29 [ARG] B5:158 [A] ✔
i:32 [ARG] 1:302 [G] Bi:29 [ARG] B5:276 [C] ✔
i:32 [ARG] 1:303 [C] Bi:29 [ARG] B5:277 [G] ✔
i:92 [LYS] 1:333 [A] Bi:89 [GLU] B5:307 [A] ✔
i:92 [LYS] 1:334 [G] Bi:89 [GLU] B5:308 [G] ✔
i:44 [LYS] 1:334 [G] Bi:41 [ARG] B5:308 [G] ✔
i:39 [HIS] 1:117 [G] Bi:36 [HIS] B5:116 [G] ✔
i:39 [HIS] 1:302 [G] Bi:36 [HIS] B5:276 [C] ✔
i:16 [LYS] 1:70 [C] Bi:13 [LYS] B5:71 [C] ✔
i:79 [ARG] 1:309 [G] Bi:76 [ARG] B5:283 [G] ✔
i:79 [ARG] 1:330 [U] Bi:76 [ARG] B5:304 [C] ✔
i:79 [ARG] 1:331 [C] Bi:76 [ARG] B5:305 [A] ✔
i:88 [LYS] 1:333 [A] Bi:85 [ARG] B5:307 [A] ✔
i:88 [LYS] 1:334 [G] Bi:85 [ARG] B5:308 [G] ✔
i:88 [LYS] 1:337 [G] Bi:85 [ARG] B5:310 [G] ✔
i:88 [LYS] 1:338 [G] Bi:85 [ARG] B5:311 [G] ✔
i:40 [LEU] 1:302 [G] Bi:37 [THR] B5:276 [C] ✔
i:40 [LEU] 1:303 [C] Bi:37 [THR] B5:277 [G] ✔
i:87 [LYS] 1:347 [U] Bi:84 [LYS] B5:320 [C] ✔
i:83 [PHE] 1:346 [U] Bi:80 [HIS] B5:319 [A] ✔
i:83 [PHE] 1:347 [U] Bi:80 [HIS] B5:320 [C] ✔
i:29 [PRO] 1:154 [A] Bi:26 [HIS] B5:158 [A] ✔
i:37 [HIS] 1:302 [G] Bi:34 [THR] B5:276 [C] ✔
i:37 [HIS] 1:303 [C] Bi:34 [THR] B5:277 [G] ✔
i:80 [LEU] 1:309 [G] Bi:77 [VAL] B5:283 [G] ✔
i:80 [LEU] 1:310 [C] Bi:77 [VAL] B5:284 [G] ✔
i:80 [LEU] 1:330 [U] Bi:77 [VAL] B5:304 [C] ✔
i:80 [LEU] 1:331 [C] Bi:77 [VAL] B5:305 [A] ✔
i:80 [LEU] 1:332 [A] Bi:77 [VAL] B5:306 [A] ✔
i:36 [PRO] 1:335 [U] Bi:33 [LEU] B5:309 [C] ✔
i:34 [ALA] 1:337 [G] Bi:31 [GLY] B5:310 [G] ✔
i:78 [LYS] 1:330 [U] Bi:75 [LYS] B5:304 [C] ✔
i:56 [LEU] 1:331 [C] Bi:53 [TYR] B5:305 [A] ✔
i:56 [LEU] 1:332 [A] Bi:53 [TYR] B5:306 [A] ✔
i:38 [LYS] 1:301 [A] Bi:35 [LYS] B5:275 [C] ✔
i:82 [ASP] 1:310 [C] Bi:79 [THR] B5:284 [G] ✔
i:85 [ALA] 1:332 [A] Bi:82 [ARG] B5:306 [A] ✔
i:33 [PHE] 1:303 [C] Bi:30 [ARG] B5:277 [G] ✔
i:33 [PHE] 1:337 [G] Bi:30 [ARG] B5:310 [G] ✔
i:33 [PHE] 1:354 [C] Bi:30 [ARG] B5:327 [U] ✔
i:35 [VAL] 1:334 [G] Bi:32 [ARG] B5:308 [G] ✔
i:35 [VAL] 1:335 [U] Bi:32 [ARG] B5:309 [C] ✔
i:89 [LYS] 1:332 [A] Bi:86 [LYS] B5:306 [A] ✔
i:89 [LYS] 1:333 [A] Bi:86 [LYS] B5:307 [A] ✔
i:54 [SER] 1:332 [A] Bi:51 [ALA] B5:306 [A] ✔
i:30 [ASN] 1:354 [C] Bi:27 [SER] B5:327 [U] ✔
i:84 [THR] 1:338 [G] Bi:81 [ILE] B5:311 [G] ✔
i:17 [GLY] 1:71 [C] Bi:14 [GLY] B5:72 [C] ✔
i:32 [ARG] 1:300 [A] Bi:29 [ARG] B5:274 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:32 [ARG] 1:301 [A] Bi:29 [ARG] B5:275 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:28 [SER] 1:154 [A] Bi:25 [ARG] B5:158 [A] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:44 [LYS] 1:333 [A] Bi:41 [ARG] B5:307 [A] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:39 [HIS] 1:301 [A] Bi:36 [HIS] B5:275 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:16 [LYS] 1:71 [C] Bi:13 [LYS] B5:72 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:40 [LEU] 1:301 [A] Bi:37 [THR] B5:275 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:40 [LEU] 1:334 [G] Bi:37 [THR] B5:308 [G] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:40 [LEU] 1:335 [U] Bi:37 [THR] B5:309 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:87 [LYS] 1:346 [U] Bi:84 [LYS] B5:319 [A] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:29 [PRO] 1:303 [C] Bi:26 [HIS] B5:277 [G] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:37 [HIS] 1:334 [G] Bi:34 [THR] B5:308 [G] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:37 [HIS] 1:335 [U] Bi:34 [THR] B5:309 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:36 [PRO] 1:302 [G] Bi:33 [LEU] B5:276 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:78 [LYS] 1:310 [C] Bi:75 [LYS] B5:284 [G] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:38 [LYS] 1:302 [G] Bi:35 [LYS] B5:276 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:38 [LYS] 1:335 [U] Bi:35 [LYS] B5:309 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:77 [LYS] 1:310 [C] Bi:74 [LYS] B5:284 [G] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:77 [LYS] 1:346 [U] Bi:74 [LYS] B5:319 [A] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:33 [PHE] 1:334 [G] Bi:30 [ARG] B5:308 [G] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:30 [ASN] 1:337 [G] Bi:27 [SER] B5:310 [G] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:84 [THR] 1:347 [U] Bi:81 [ILE] B5:320 [C] ❌ 7O7Y_Bi_B5
i:29 [PRO] 1:302 [G] Bi:26 [HIS] B5:276 [C] ❌ 6AZ3_i_1
i:30 [ASN] 1:154 [A] Bi:27 [SER] B5:158 [A] ❌ 6AZ3_i_1
i:32 [ARG] 1:354 [C] Bi:29 [ARG] B5:327 [U] ❌ 6AZ3_i_1
i:34 [ALA] 1:335 [U] Bi:31 [GLY] B5:309 [C] ❌ 6AZ3_i_1
i:34 [ALA] 1:303 [C] Bi:31 [GLY] B5:277 [G] ❌ 6AZ3_i_1
i:34 [ALA] 1:334 [G] Bi:31 [GLY] B5:308 [G] ❌ 6AZ3_i_1
i:35 [VAL] 1:303 [C] Bi:32 [ARG] B5:277 [G] ❌ 6AZ3_i_1
i:36 [PRO] 1:334 [G] Bi:33 [LEU] B5:308 [G] ❌ 6AZ3_i_1
i:38 [LYS] 1:300 [A] Bi:35 [LYS] B5:274 [C] ❌ 6AZ3_i_1
i:82 [ASP] 1:309 [G] Bi:79 [THR] B5:283 [G] ❌ 6AZ3_i_1
i:85 [ALA] 1:309 [G] Bi:82 [ARG] B5:283 [G] ❌ 6AZ3_i_1
i:85 [ALA] 1:338 [G] Bi:82 [ARG] B5:311 [G] ❌ 6AZ3_i_1
i:88 [LYS] 1:335 [U] Bi:85 [ARG] B5:309 [C] ❌ 6AZ3_i_1
i:16 [LYS] 1:69 [A2M] Bi:13 [LYS] B5:70 [A] ❌ 7O7Y_B5:70 no longer at interface
i:25 [ARG] 1:350 [C] Bi:22 [SER] B5:323 [C] ❌ 7O7Y_Bi:22, 7O7Y_B5:323 no longer at interface
i:25 [ARG] 1:351 [U] Bi:22 [SER] B5:324 [A] ❌ 7O7Y_Bi:22, 7O7Y_B5:324 no longer at interface
i:26 [GLN] 1:156 [A] Bi:23 [LYS] B5:160 [G] ❌ 6AZ3_i:26, 6AZ3_1:156 no longer at interface
i:28 [SER] 1:353 [C] Bi:25 [ARG] B5:326 [C] ❌ 6AZ3_1:353 no longer at interface
i:28 [SER] 1:155 [A] Bi:25 [ARG] B5:159 [C] ❌ 6AZ3_1:155 no longer at interface
i:29 [PRO] 1:156 [A] Bi:26 [HIS] B5:160 [G] ❌ 6AZ3_1:156 no longer at interface
i:29 [PRO] 1:155 [A] Bi:26 [HIS] B5:159 [C] ❌ 6AZ3_1:155 no longer at interface
i:30 [ASN] 1:155 [A] Bi:27 [SER] B5:159 [C] ❌ 6AZ3_1:155 no longer at interface
i:31 [ASP] 1:353 [C] Bi:28 [ARG] B5:326 [C] ❌ 6AZ3_i:31, 6AZ3_1:353 no longer at interface
i:33 [PHE] 1:355 [A] Bi:30 [ARG] B5:328 [A] ❌ 6AZ3_1:355 no longer at interface
i:33 [PHE] 1:304 [G] Bi:30 [ARG] B5:278 [G] ❌ 6AZ3_1:304 no longer at interface
i:33 [PHE] 1:356 [A] Bi:30 [ARG] B5:329 [A] ❌ 6AZ3_1:356 no longer at interface
i:39 [HIS] 1:116 [U] Bi:36 [HIS] B5:115 [C] ❌ 6AZ3_1:116 no longer at interface
i:78 [LYS] 1:311 [A] Bi:75 [LYS] B5:285 [G] ❌ 6AZ3_1:311 no longer at interface
i:85 [ALA] 1:339 [C] Bi:82 [ARG] B5:312 [G] ❌ 6AZ3_1:339 no longer at interface
i:85 [ALA] 1:308 [A] Bi:82 [ARG] B5:282 [C] ❌ 6AZ3_1:308 no longer at interface
i:87 [LYS] 1:348 [G] Bi:84 [LYS] B5:321 [U] ❌ 6AZ3_1:348 no longer at interface
i:55 [PRO] 1:331 [C] Bi:52 [PRO] B5:305 [A] ❌ 7O7Y_Bi:52 no longer at interface
i:41 [ARG] 1:334 [G] Bi:38 [LYS] B5:308 [G] ❌ 7O7Y_Bi:38 no longer at interface
i:41 [ARG] 1:335 [U] Bi:38 [LYS] B5:309 [C] ❌ 7O7Y_Bi:38 no longer at interface
i:25 [ARG] 1:352 [G] Bi:22 [SER] B5:325 [U] ❌ 7O7Y_Bi:22 no longer at interface
i:27 [PRO] 1:154 [A] Bi:24 [PRO] B5:158 [A] ❌ 7O7Y_Bi:24 no longer at interface
i:19 [VAL] 1:71 [C] Bi:16 [LYS] B5:72 [C] ❌ 6AZ3_i:19 no longer at interface
i:31 [ASP] 1:354 [C] Bi:28 [ARG] B5:327 [U] ❌ 6AZ3_i:31 no longer at interface
i:31 [ASP] 1:352 [G] Bi:28 [ARG] B5:325 [U] ❌ 6AZ3_i:31 no longer at interface
i:31 [ASP] 1:337 [G] Bi:28 [ARG] B5:310 [G] ❌ 6AZ3_i:31 no longer at interface
i:48 [ALA] 1:333 [A] Bi:45 [ARG] B5:307 [A] ❌ 6AZ3_i:48 no longer at interface
i:57 [GLU] 1:333 [A] Bi:54 [GLU] B5:307 [A] ❌ 6AZ3_i:57 no longer at interface
i:57 [GLU] 1:332 [A] Bi:54 [GLU] B5:306 [A] ❌ 6AZ3_i:57 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
60S ribosomal protein rpL36 (L36e) Eukaryotic large subunit ribosomal RNA 0.92 2.12 0.32 0.81 0.91 0.86 0.88 0.55 0.50 0.17 0.46


Other pairs involving 6AZ3_i_1 or 7O7Y_Bi_B5

Total number of entries: 2

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6AZ3_i_1 7O7Y_Bi_B5 0.55 0.92 2.12 0.32 60S ribosomal protein rpL36 (L36e) Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_i_2 7O7Y_Bi_B5 0.91 0.91 0.65 0.6 60S ribosomal protein rpL36 (L36e) Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare