RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group63 > 4Y4O_1d_1a vs 7K00_D_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1d
4Y4O_1a
7K00_D
7K00_A
Conserved?
1d:76 [ARG] 1a:28 [G] D:73 [ARG] A:28 [A] ✔
1d:74 [GLN] 1a:402 [G] D:71 [GLN] A:402 [G] ✔
1d:74 [GLN] 1a:403 [C] D:71 [GLN] A:403 [C] ✔
1d:66 [ARG] 1a:543 [C] D:63 [ARG] A:543 [U] ✔
1d:66 [ARG] 1a:544 [G] D:63 [ARG] A:544 [G] ✔
1d:132 [ARG] 1a:490 [G] D:129 [VAL] A:490 [C] ✔
1d:132 [ARG] 1a:619 [U] D:129 [VAL] A:619 [U] ✔
1d:77 [ASN] 1a:401 [C] D:74 [ASN] A:401 [C] ✔
1d:77 [ASN] 1a:402 [G] D:74 [ASN] A:402 [G] ✔
1d:52 [SER] 1a:509 [A] D:49 [SER] A:509 [A] ✔
1d:71 [SER] 1a:546 [G] D:68 [LEU] A:546 [A] ✔
1d:41 [GLY] 1a:426 [G] D:39 [GLY] A:426 [U] ✔
1d:41 [GLY] 1a:427 [U] D:39 [GLY] A:427 [U] ✔
1d:41 [GLY] 1a:541 [G] D:39 [GLY] A:541 [G] ✔
1d:41 [GLY] 1a:542 [G] D:39 [GLY] A:542 [G] ✔
1d:134 [ASP] 1a:619 [U] D:131 [ASN] A:619 [U] ✔
1d:205 [GLU] 1a:8 [A] D:202 [GLU] A:8 [A] ✔
1d:119 [GLN] 1a:405 [U] D:116 [GLN] A:405 [U] ✔
1d:119 [GLN] 1a:406 [G] D:116 [GLN] A:406 [G] ✔
1d:119 [GLN] 1a:407 [G] D:116 [GLN] A:407 [U] ✔
1d:119 [GLN] 1a:437 [U] D:116 [GLN] A:437 [U] ✔
1d:119 [GLN] 1a:495 [A] D:116 [GLN] A:495 [A] ✔
1d:61 [LYS] 1a:544 [G] D:58 [LYS] A:544 [G] ✔
1d:61 [LYS] 1a:545 [C] D:58 [LYS] A:545 [C] ✔
1d:5 [ILE] 1a:405 [U] D:5 [LEU] A:405 [U] ✔
1d:5 [ILE] 1a:406 [G] D:5 [LEU] A:406 [G] ✔
1d:5 [ILE] 1a:407 [G] D:5 [LEU] A:407 [U] ✔
1d:116 [GLN] 1a:407 [G] D:113 [GLU] A:407 [U] ✔
1d:116 [GLN] 1a:408 [A] D:113 [GLU] A:408 [A] ✔
1d:43 [HIS] 1a:511 [C] D:41 [HIS] A:511 [C] ✔
1d:43 [HIS] 1a:512 [U] D:41 [HIS] A:512 [U] ✔
1d:43 [HIS] 1a:540 [G] D:41 [HIS] A:540 [G] ✔
1d:43 [HIS] 1a:541 [G] D:41 [HIS] A:541 [G] ✔
1d:10 [ARG] 1a:427 [U] D:10 [LYS] A:427 [U] ✔
1d:10 [ARG] 1a:428 [G] D:10 [LYS] A:428 [G] ✔
1d:10 [ARG] 1a:429 [U] D:10 [LYS] A:429 [U] ✔
1d:10 [ARG] 1a:430 [A] D:10 [LYS] A:430 [A] ✔
1d:10 [ARG] 1a:541 [G] D:10 [LYS] A:541 [G] ✔
1d:10 [ARG] 1a:542 [G] D:10 [LYS] A:542 [G] ✔
1d:10 [ARG] 1a:543 [C] D:10 [LYS] A:543 [U] ✔
1d:8 [VAL] 1a:430 [A] D:8 [LYS] A:430 [A] ✔
1d:14 [ARG] 1a:511 [C] D:14 [ARG] A:511 [C] ✔
1d:14 [ARG] 1a:542 [G] D:14 [ARG] A:542 [G] ✔
1d:14 [ARG] 1a:543 [C] D:14 [ARG] A:543 [U] ✔
1d:21 [LEU] 1a:408 [A] D:21 [LEU] A:408 [A] ✔
1d:3 [ARG] 1a:404 [U] D:3 [ARG] A:404 [G] ✔
1d:3 [ARG] 1a:405 [U] D:3 [ARG] A:405 [U] ✔
1d:3 [ARG] 1a:406 [G] D:3 [ARG] A:406 [G] ✔
1d:3 [ARG] 1a:407 [G] D:3 [ARG] A:407 [U] ✔
1d:72 [GLU] 1a:545 [C] D:69 [GLU] A:545 [C] ✔
1d:72 [GLU] 1a:546 [G] D:69 [GLU] A:546 [A] ✔
1d:208 [SER] 1a:8 [A] D:205 [SER] A:8 [A] ✔
1d:55 [ALA] 1a:509 [A] D:52 [GLY] A:509 [A] ✔
1d:115 [ARG] 1a:407 [G] D:112 [ALA] A:407 [U] ✔
1d:115 [ARG] 1a:408 [A] D:112 [ALA] A:408 [A] ✔
1d:22 [LYS] 1a:409 [G] D:22 [LYS] A:409 [U] ✔
1d:22 [LYS] 1a:410 [G] D:22 [LYS] A:410 [G] ✔
1d:22 [LYS] 1a:429 [U] D:22 [LYS] A:429 [U] ✔
1d:22 [LYS] 1a:430 [A] D:22 [LYS] A:430 [A] ✔
1d:65 [ARG] 1a:545 [C] D:62 [ARG] A:545 [C] ✔
1d:65 [ARG] 1a:546 [G] D:62 [ARG] A:546 [A] ✔
1d:6 [GLY] 1a:430 [A] D:6 [GLY] A:430 [A] ✔
1d:157 [LEU] 1a:436 [C] D:154 [ARG] A:436 [C] ✔
1d:133 [VAL] 1a:619 [U] D:130 [VAL] A:619 [U] ✔
1d:139 [ARG] 1a:620 [C] D:136 [GLN] A:620 [C] ✔
1d:26 [CYS] 1a:409 [G] D:26 [ARG] A:409 [U] ✔
1d:38 [TYR] 1a:425 [G] D:36 [GLN] A:425 [G] ✔
1d:38 [TYR] 1a:426 [G] D:36 [GLN] A:426 [U] ✔
1d:13 [ARG] 1a:426 [G] D:13 [ARG] A:426 [U] ✔
1d:13 [ARG] 1a:427 [U] D:13 [ARG] A:427 [U] ✔
1d:13 [ARG] 1a:428 [G] D:13 [ARG] A:428 [G] ✔
1d:13 [ARG] 1a:429 [U] D:13 [ARG] A:429 [U] ✔
1d:59 [ARG] 1a:509 [A] D:56 [ARG] A:509 [A] ✔
1d:59 [ARG] 1a:543 [C] D:56 [ARG] A:543 [U] ✔
1d:59 [ARG] 1a:544 [G] D:56 [ARG] A:544 [G] ✔
1d:35 [ARG] 1a:413 [G] D:33 [LYS] A:413 [G] ✔
1d:57 [ARG] 1a:8 [A] D:54 [GLN] A:8 [A] ✔
1d:54 [TYR] 1a:508 [C] D:51 [TYR] A:508 [U] ✔
1d:54 [TYR] 1a:509 [A] D:51 [TYR] A:509 [A] ✔
1d:84 [LYS] 1a:613 [C] D:81 [ARG] A:613 [C] ✔
1d:112 [VAL] 1a:408 [A] D:109 [ALA] A:408 [A] ✔
1d:2 [GLY] 1a:404 [U] D:2 [ALA] A:404 [G] ✔
1d:2 [GLY] 1a:405 [U] D:2 [ALA] A:405 [U] ✔
1d:2 [GLY] 1a:499 [A] D:2 [ALA] A:499 [A] ✔
1d:2 [GLY] 1a:547 [A] D:2 [ALA] A:547 [A] ✔
1d:136 [PRO] 1a:403 [C] D:133 [ALA] A:403 [C] ✔
1d:136 [PRO] 1a:404 [U] D:133 [ALA] A:404 [G] ✔
1d:9 [CYS] 1a:429 [U] D:9 [LEU] A:429 [U] ✔
1d:9 [CYS] 1a:430 [A] D:9 [LEU] A:430 [A] ✔
1d:32 [ALA] 1a:429 [U] D:32 [CYS] A:429 [U] ✔
1d:137 [SER] 1a:402 [G] D:134 [SER] A:402 [G] ✔
1d:137 [SER] 1a:403 [C] D:134 [SER] A:403 [C] ✔
1d:137 [SER] 1a:620 [C] D:134 [SER] A:620 [C] ✔
1d:62 [GLN] 1a:543 [C] D:59 [GLN] A:543 [U] ✔
1d:62 [GLN] 1a:544 [G] D:59 [GLN] A:544 [G] ✔
1d:62 [GLN] 1a:545 [C] D:59 [GLN] A:545 [C] ✔
1d:7 [PRO] 1a:428 [G] D:7 [PRO] A:428 [G] ✔
1d:7 [PRO] 1a:430 [A] D:7 [PRO] A:430 [A] ✔
1d:24 [GLU] 1a:409 [G] D:24 [GLY] A:409 [U] ✔
1d:4 [TYR] 1a:546 [G] D:4 [TYR] A:546 [A] ✔
1d:25 [ARG] 1a:409 [G] D:25 [VAL] A:409 [U] ✔
1d:25 [ARG] 1a:410 [G] D:25 [VAL] A:410 [G] ✔
1d:23 [GLY] 1a:409 [G] D:23 [SER] A:409 [U] ✔
1d:155 [LEU] 1a:437 [U] D:152 [GLN] A:437 [U] ✔
1d:122 [ARG] 1a:403 [C] D:119 [SER] A:403 [C] ✔
1d:122 [ARG] 1a:404 [U] D:119 [SER] A:404 [G] ✔
1d:46 [LYS] 1a:511 [C] D:44 [ARG] A:511 [C] ✔
1d:46 [LYS] 1a:512 [U] D:44 [ARG] A:512 [U] ✔
1d:138 [TYR] 1a:619 [U] D:135 [TYR] A:619 [U] ✔
1d:138 [TYR] 1a:620 [C] D:135 [TYR] A:620 [C] ✔
1d:42 [GLN] 1a:418 [C] D:40 [GLN] A:418 [C] ✔
1d:42 [GLN] 1a:419 [C] D:40 [GLN] A:419 [C] ✔
1d:42 [GLN] 1a:426 [G] D:40 [GLN] A:426 [U] ✔
1d:42 [GLN] 1a:512 [U] D:40 [GLN] A:512 [U] ✔
1d:42 [GLN] 1a:540 [G] D:40 [GLN] A:540 [G] ✔
1d:42 [GLN] 1a:541 [G] D:40 [GLN] A:541 [G] ✔
1d:135 [LEU] 1a:402 [G] D:132 [ILE] A:402 [G] ✔
1d:135 [LEU] 1a:403 [C] D:132 [ILE] A:403 [C] ✔
1d:135 [LEU] 1a:619 [U] D:132 [ILE] A:619 [U] ✔
1d:135 [LEU] 1a:620 [C] D:132 [ILE] A:620 [C] ✔
1d:113 [SER] 1a:407 [G] D:110 [THR] A:407 [U] ✔
1d:113 [SER] 1a:408 [A] D:110 [THR] A:408 [A] ✔
1d:49 [ARG] 1a:510 [A] D:46 [PRO] A:510 [A] ✔
1d:209 [ARG] 1a:8 [A] D:206 [LYS] A:8 [A] ✔
1d:209 [ARG] 1a:26 [A] D:206 [LYS] A:26 [A] ✔
1d:209 [ARG] 1a:27 [G] D:206 [LYS] A:27 [G] ✔
1d:209 [ARG] 1a:508 [C] D:206 [LYS] A:508 [U] ✔
1d:118 [ARG] 1a:403 [C] D:115 [ARG] A:403 [C] ✔
1d:118 [ARG] 1a:404 [U] D:115 [ARG] A:404 [G] ✔
1d:206 [PHE] 1a:8 [A] D:203 [LEU] A:8 [A] ✔
1d:73 [ARG] 1a:400 [C] D:70 [ARG] A:400 [C] ✔
1d:73 [ARG] 1a:401 [C] D:70 [ARG] A:401 [C] ✔
1d:73 [ARG] 1a:545 [C] D:70 [ARG] A:545 [C] ✔
1d:73 [ARG] 1a:546 [G] D:70 [ARG] A:546 [A] ✔
1d:73 [ARG] 1a:549 [C] D:70 [ARG] A:549 [C] ✔
1d:58 [LEU] 1a:509 [A] D:55 [LEU] A:509 [A] ✔
1d:58 [LEU] 1a:544 [G] D:55 [LEU] A:544 [G] ✔
1d:40 [PRO] 1a:426 [G] D:38 [PRO] A:426 [U] ✔
1d:40 [PRO] 1a:427 [U] D:38 [PRO] A:427 [U] ✔
1d:40 [PRO] 1a:542 [G] D:38 [PRO] A:542 [G] ✔
1d:40 [PRO] 1a:543 [C] D:38 [PRO] A:543 [U] ✔
1d:123 [HIS] 1a:437 [U] D:120 [HIS] A:437 [U] ✔
1d:123 [HIS] 1a:438 [G] D:120 [HIS] A:438 [U] ✔
1d:123 [HIS] 1a:495 [A] D:120 [HIS] A:495 [A] ✔
1d:132 [ARG] 1a:489 [C] D:129 [VAL] A:489 [C] ❌ 7K00_D_A
1d:3 [ARG] 1a:547 [A] D:3 [ARG] A:547 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:55 [ALA] 1a:510 [A] D:52 [GLY] A:510 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:115 [ARG] 1a:406 [G] D:112 [ALA] A:406 [G] ❌ 7K00_D_A
1d:22 [LYS] 1a:408 [A] D:22 [LYS] A:408 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:35 [ARG] 1a:411 [A] D:33 [LYS] A:411 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:2 [GLY] 1a:546 [G] D:2 [ALA] A:546 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:30 [LYS] 1a:409 [G] D:30 [THR] A:409 [U] ❌ 7K00_D_A
1d:30 [LYS] 1a:410 [G] D:30 [THR] A:410 [G] ❌ 7K00_D_A
1d:30 [LYS] 1a:411 [A] D:30 [THR] A:411 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:24 [GLU] 1a:408 [A] D:24 [GLY] A:408 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:25 [ARG] 1a:411 [A] D:25 [VAL] A:411 [A] ❌ 7K00_D_A
1d:25 [ARG] 1a:429 [U] D:25 [VAL] A:429 [U] ❌ 7K00_D_A
1d:155 [LEU] 1a:436 [C] D:152 [GLN] A:436 [C] ❌ 7K00_D_A
1d:122 [ARG] 1a:619 [U] D:119 [SER] A:619 [U] ❌ 7K00_D_A
1d:42 [GLN] 1a:425 [G] D:40 [GLN] A:425 [G] ❌ 7K00_D_A
1d:49 [ARG] 1a:511 [C] D:46 [PRO] A:511 [C] ❌ 7K00_D_A
1d:58 [LEU] 1a:543 [C] D:55 [LEU] A:543 [U] ❌ 7K00_D_A
1d:123 [HIS] 1a:439 [A] D:120 [HIS] A:440 [C] ❌ 7K00_D_A
1d:119 [GLN] 1a:436 [C] D:116 [GLN] A:436 [C] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:123 [HIS] 1a:405 [U] D:120 [HIS] A:405 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:155 [LEU] 1a:438 [G] D:152 [GLN] A:438 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:157 [LEU] 1a:406 [G] D:154 [ARG] A:406 [G] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:157 [LEU] 1a:437 [U] D:154 [ARG] A:437 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:157 [LEU] 1a:407 [G] D:154 [ARG] A:407 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:2 [GLY] 1a:403 [C] D:2 [ALA] A:403 [C] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:23 [GLY] 1a:408 [A] D:23 [SER] A:408 [A] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:26 [CYS] 1a:410 [G] D:26 [ARG] A:410 [G] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:26 [CYS] 1a:411 [A] D:26 [ARG] A:411 [A] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:3 [ARG] 1a:546 [G] D:3 [ARG] A:546 [A] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:30 [LYS] 1a:413 [G] D:30 [THR] A:413 [G] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:32 [ALA] 1a:413 [G] D:32 [CYS] A:413 [G] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:35 [ARG] 1a:425 [G] D:33 [LYS] A:425 [G] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:35 [ARG] 1a:426 [G] D:33 [LYS] A:426 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:35 [ARG] 1a:429 [U] D:33 [LYS] A:429 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:4 [TYR] 1a:407 [G] D:4 [TYR] A:407 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:42 [GLN] 1a:511 [C] D:40 [GLN] A:511 [C] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:58 [LEU] 1a:545 [C] D:55 [LEU] A:545 [C] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:71 [SER] 1a:547 [A] D:68 [LEU] A:547 [A] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:73 [ARG] 1a:402 [G] D:70 [ARG] A:402 [G] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:76 [ARG] 1a:401 [C] D:73 [ARG] A:401 [C] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:8 [VAL] 1a:408 [A] D:8 [LYS] A:408 [A] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:8 [VAL] 1a:429 [U] D:8 [LYS] A:429 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:8 [VAL] 1a:407 [G] D:8 [LYS] A:407 [U] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:84 [LYS] 1a:614 [A] D:81 [ARG] A:614 [C] ❌ 4Y4O_1d_1a
1d:132 [ARG] 1a:488 [C] D:129 [VAL] A:488 [C] ❌ 7K00_A:488 no longer at interface
1d:141 [ARG] 1a:615 [C] D:138 [SER] A:615 [G] ❌ 7K00_D:138, 7K00_A:615 no longer at interface
1d:141 [ARG] 1a:616 [G] D:138 [SER] A:616 [G] ❌ 7K00_D:138, 7K00_A:616 no longer at interface
1d:35 [ARG] 1a:412 [A] D:33 [LYS] A:412 [A] ❌ 7K00_A:412 no longer at interface
1d:87 [GLY] 1a:5 [U] D:84 [GLY] A:5 [U] ❌ 7K00_D:84, 7K00_A:5 no longer at interface
1d:30 [LYS] 1a:412 [A] D:30 [THR] A:412 [A] ❌ 7K00_A:412 no longer at interface
1d:36 [ARG] 1a:412 [A] D:34 [ILE] A:412 [A] ❌ 7K00_D:34, 7K00_A:412 no longer at interface
1d:209 [ARG] 1a:507 [C] D:206 [LYS] A:507 [C] ❌ 7K00_A:507 no longer at interface
1d:151 [LYS] 1a:491 [G] D:148 [LYS] A:491 [G] ❌ 4Y4O_1d:151, 4Y4O_1a:491 no longer at interface
1d:85 [LYS] 1a:613 [C] D:82 [LEU] A:613 [C] ❌ 7K00_D:82 no longer at interface
1d:85 [LYS] 1a:614 [A] D:82 [LEU] A:614 [C] ❌ 7K00_D:82 no longer at interface
1d:156 [GLU] 1a:436 [C] D:153 [SER] A:436 [C] ❌ 7K00_D:153 no longer at interface
1d:156 [GLU] 1a:437 [U] D:153 [SER] A:437 [U] ❌ 7K00_D:153 no longer at interface
1d:125 [HIS] 1a:437 [U] D:122 [ALA] A:437 [U] ❌ 7K00_D:122 no longer at interface
1d:125 [HIS] 1a:438 [G] D:122 [ALA] A:438 [U] ❌ 7K00_D:122 no longer at interface
1d:152 [SER] 1a:438 [G] D:149 [ALA] A:438 [U] ❌ 7K00_D:149 no longer at interface
1d:45 [GLN] 1a:425 [G] D:43 [ALA] A:425 [G] ❌ 7K00_D:43 no longer at interface
1d:45 [GLN] 1a:426 [G] D:43 [ALA] A:426 [U] ❌ 7K00_D:43 no longer at interface
1d:36 [ARG] 1a:413 [G] D:34 [ILE] A:413 [G] ❌ 7K00_D:34 no longer at interface
1d:36 [ARG] 1a:426 [G] D:34 [ILE] A:426 [U] ❌ 7K00_D:34 no longer at interface
1d:36 [ARG] 1a:427 [U] D:34 [ILE] A:427 [U] ❌ 7K00_D:34 no longer at interface
1d:36 [ARG] 1a:428 [G] D:34 [ILE] A:428 [G] ❌ 7K00_D:34 no longer at interface
1d:36 [ARG] 1a:429 [U] D:34 [ILE] A:429 [U] ❌ 7K00_D:34 no longer at interface
1d:124 [GLY] 1a:439 [A] D:121 [LYS] A:440 [C] ❌ 4Y4O_1d:124 no longer at interface
1d:124 [GLY] 1a:489 [C] D:121 [LYS] A:489 [C] ❌ 4Y4O_1d:124 no longer at interface
1d:149 [ALA] 1a:490 [G] D:146 [ARG] A:490 [C] ❌ 4Y4O_1d:149 no longer at interface
1d:149 [ALA] 1a:489 [C] D:146 [ARG] A:489 [C] ❌ 4Y4O_1d:149 no longer at interface
1d:151 [LYS] 1a:438 [G] D:148 [LYS] A:438 [U] ❌ 4Y4O_1d:151 no longer at interface
1d:31 [CYS] 1a:410 [G] D:31 [LYS] A:410 [G] ❌ 4Y4O_1d:31 no longer at interface
1d:31 [CYS] 1a:413 [G] D:31 [LYS] A:413 [G] ❌ 4Y4O_1d:31 no longer at interface
1d:31 [CYS] 1a:429 [U] D:31 [LYS] A:429 [U] ❌ 4Y4O_1d:31 no longer at interface
1d:31 [CYS] 1a:411 [A] D:31 [LYS] A:411 [A] ❌ 4Y4O_1d:31 no longer at interface
1d:39 [PRO] 1a:427 [U] D:37 [ALA] A:427 [U] ❌ 4Y4O_1d:39 no longer at interface
1d:51 [PRO] 1a:510 [A] D:48 [LEU] A:510 [A] ❌ 4Y4O_1d:51 no longer at interface
1d:51 [PRO] 1a:509 [A] D:48 [LEU] A:509 [A] ❌ 4Y4O_1d:51 no longer at interface
1d:86 [LYS] 1a:613 [C] D:83 [LYS] A:613 [C] ❌ 4Y4O_1d:86 no longer at interface
1d:86 [LYS] 1a:614 [A] D:83 [LYS] A:614 [C] ❌ 4Y4O_1d:86 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Alpha-L RNA-binding motif Bacterial small subunit ribosomal RNA 0.98 1.52 0.45 0.94 0.98 0.9 0.94 0.73 0.68 0.51 0.45


Other pairs involving 4Y4O_1d_1a or 7K00_D_A

Total number of entries: 5

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6S0X_d_a 7K00_D_A 0.35 0.95 4.88 0.37 Alpha-L RNA-binding motif Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
7K00_D_A 7RYG_d_a 0.75 0.93 3.84 0.7 Alpha-L RNA-binding motif Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1d_1a 7K00_D_A 0.73 0.98 1.52 0.45 Alpha-L RNA-binding motif Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1d_1a 7RYG_d_a 0.61 0.91 4.08 0.44 Alpha-L RNA-binding motif Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1d_1a 6S0X_d_a 0.36 0.95 4.96 0.39 Alpha-L RNA-binding motif Bacterial small subunit ribosomal RNA compare