Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 6S0X_d
|
6S0X_a
|
7K00_D
|
7K00_A
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| d:36 [HIS] | a:519 [C] | D:40 [GLN] | A:511 [C] | ✔ |
| d:36 [HIS] | a:520 [U] | D:40 [GLN] | A:512 [U] | ✔ |
| d:36 [HIS] | a:548 [G] | D:40 [GLN] | A:540 [G] | ✔ |
| d:10 [LYS] | a:437 [U] | D:9 [LEU] | A:429 [U] | ✔ |
| d:10 [LYS] | a:438 [A] | D:9 [LEU] | A:430 [A] | ✔ |
| d:108 [ARG] | a:415 [A] | D:112 [ALA] | A:407 [U] | ✔ |
| d:108 [ARG] | a:416 [G] | D:112 [ALA] | A:408 [A] | ✔ |
| d:128 [ILE] | a:627 [U] | D:131 [ASN] | A:619 [U] | ✔ |
| d:112 [GLN] | a:414 [G] | D:116 [GLN] | A:406 [G] | ✔ |
| d:112 [GLN] | a:445 [U] | D:116 [GLN] | A:437 [U] | ✔ |
| d:112 [GLN] | a:503 [A] | D:116 [GLN] | A:495 [A] | ✔ |
| d:7 [SER] | a:438 [A] | D:6 [GLY] | A:430 [A] | ✔ |
| d:106 [THR] | a:415 [A] | D:110 [THR] | A:407 [U] | ✔ |
| d:106 [THR] | a:416 [G] | D:110 [THR] | A:408 [A] | ✔ |
| d:3 [ARG] | a:412 [G] | D:2 [ALA] | A:404 [G] | ✔ |
| d:3 [ARG] | a:413 [U] | D:2 [ALA] | A:405 [U] | ✔ |
| d:6 [GLY] | a:414 [G] | D:5 [LEU] | A:406 [G] | ✔ |
| d:6 [GLY] | a:415 [A] | D:5 [LEU] | A:407 [U] | ✔ |
| d:66 [ARG] | a:408 [C] | D:70 [ARG] | A:400 [C] | ✔ |
| d:66 [ARG] | a:409 [C] | D:70 [ARG] | A:401 [C] | ✔ |
| d:66 [ARG] | a:410 [G] | D:70 [ARG] | A:402 [G] | ✔ |
| d:66 [ARG] | a:554 [A] | D:70 [ARG] | A:546 [A] | ✔ |
| d:5 [ARG] | a:415 [A] | D:4 [TYR] | A:407 [U] | ✔ |
| d:5 [ARG] | a:554 [A] | D:4 [TYR] | A:546 [A] | ✔ |
| d:116 [HIS] | a:445 [U] | D:120 [HIS] | A:437 [U] | ✔ |
| d:116 [HIS] | a:446 [G] | D:120 [HIS] | A:438 [U] | ✔ |
| d:116 [HIS] | a:447 [U] | D:120 [HIS] | A:439 [U] | ✔ |
| d:54 [LYS] | a:553 [C] | D:58 [LYS] | A:545 [C] | ✔ |
| d:111 [ARG] | a:411 [C] | D:115 [ARG] | A:403 [C] | ✔ |
| d:111 [ARG] | a:412 [G] | D:115 [ARG] | A:404 [G] | ✔ |
| d:64 [THR] | a:554 [A] | D:68 [LEU] | A:546 [A] | ✔ |
| d:127 [ASP] | a:627 [U] | D:130 [VAL] | A:619 [U] | ✔ |
| d:35 [GLN] | a:435 [C] | D:39 [GLY] | A:427 [U] | ✔ |
| d:35 [GLN] | a:549 [G] | D:39 [GLY] | A:541 [G] | ✔ |
| d:59 [TYR] | a:551 [G] | D:63 [ARG] | A:543 [U] | ✔ |
| d:59 [TYR] | a:552 [G] | D:63 [ARG] | A:544 [G] | ✔ |
| d:77 [LYS] | a:622 [A] | D:81 [ARG] | A:614 [C] | ✔ |
| d:65 [GLU] | a:553 [C] | D:69 [GLU] | A:545 [C] | ✔ |
| d:65 [GLU] | a:554 [A] | D:69 [GLU] | A:546 [A] | ✔ |
| d:28 [LYS] | a:437 [U] | D:31 [LYS] | A:429 [U] | ✔ |
| d:51 [LEU] | a:552 [G] | D:55 [LEU] | A:544 [G] | ✔ |
| d:44 [LEU] | a:517 [A] | D:48 [LEU] | A:509 [A] | ✔ |
| d:132 [SER] | a:628 [C] | D:136 [GLN] | A:620 [C] | ✔ |
| d:130 [SER] | a:410 [G] | D:134 [SER] | A:402 [G] | ✔ |
| d:130 [SER] | a:628 [C] | D:134 [SER] | A:620 [C] | ✔ |
| d:45 [SER] | a:517 [A] | D:49 [SER] | A:509 [A] | ✔ |
| d:129 [PRO] | a:411 [C] | D:132 [ILE] | A:403 [C] | ✔ |
| d:131 [TYR] | a:627 [U] | D:135 [TYR] | A:619 [U] | ✔ |
| d:131 [TYR] | a:628 [C] | D:135 [TYR] | A:620 [C] | ✔ |
| d:9 [TRP] | a:416 [G] | D:8 [LYS] | A:408 [A] | ✔ |
| d:9 [TRP] | a:437 [U] | D:8 [LYS] | A:429 [U] | ✔ |
| d:9 [TRP] | a:438 [A] | D:8 [LYS] | A:430 [A] | ✔ |
| d:115 [ASN] | a:411 [C] | D:119 [SER] | A:403 [C] | ✔ |
| d:115 [ASN] | a:412 [G] | D:119 [SER] | A:404 [G] | ✔ |
| d:115 [ASN] | a:447 [U] | D:119 [SER] | A:439 [U] | ✔ |
| d:58 [ARG] | a:553 [C] | D:62 [ARG] | A:545 [C] | ✔ |
| d:58 [ARG] | a:554 [A] | D:62 [ARG] | A:546 [A] | ✔ |
| d:126 [VAL] | a:627 [U] | D:129 [VAL] | A:619 [U] | ✔ |
| d:34 [GLY] | a:434 [U] | D:38 [PRO] | A:426 [U] | ✔ |
| d:34 [GLY] | a:435 [C] | D:38 [PRO] | A:427 [U] | ✔ |
| d:33 [PRO] | a:435 [C] | D:37 [ALA] | A:427 [U] | ✔ |
| d:105 [ARG] | a:416 [G] | D:109 [ALA] | A:408 [A] | ✔ |
| d:109 [GLN] | a:415 [A] | D:113 [GLU] | A:407 [U] | ✔ |
| d:109 [GLN] | a:416 [G] | D:113 [GLU] | A:408 [A] | ✔ |
| d:67 [GLN] | a:410 [G] | D:71 [GLN] | A:402 [G] | ✔ |
| d:67 [GLN] | a:411 [C] | D:71 [GLN] | A:403 [C] | ✔ |
| d:55 [GLN] | a:552 [G] | D:59 [GLN] | A:544 [G] | ✔ |
| d:55 [GLN] | a:553 [C] | D:59 [GLN] | A:545 [C] | ✔ |
| d:36 [HIS] | a:518 [A] | D:40 [GLN] | A:510 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| d:10 [LYS] | a:436 [G] | D:9 [LEU] | A:428 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:108 [ARG] | a:414 [G] | D:112 [ALA] | A:406 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:128 [ILE] | a:410 [G] | D:131 [ASN] | A:402 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:128 [ILE] | a:411 [C] | D:131 [ASN] | A:403 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:128 [ILE] | a:628 [C] | D:131 [ASN] | A:620 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:112 [GLN] | a:446 [G] | D:116 [GLN] | A:438 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:7 [SER] | a:415 [A] | D:6 [GLY] | A:407 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:7 [SER] | a:416 [G] | D:6 [GLY] | A:408 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| d:14 [ARG] | a:550 [U] | D:13 [ARG] | A:542 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:14 [ARG] | a:551 [G] | D:13 [ARG] | A:543 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:14 [ARG] | a:552 [G] | D:13 [ARG] | A:544 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:5 [ARG] | a:412 [G] | D:4 [TYR] | A:404 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:5 [ARG] | a:413 [U] | D:4 [TYR] | A:405 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:5 [ARG] | a:414 [G] | D:4 [TYR] | A:406 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:5 [ARG] | a:507 [A] | D:4 [TYR] | A:499 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| d:142 [ARG] | a:499 [A] | D:146 [ARG] | A:491 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:149 [ASN] | a:444 [C] | D:152 [GLN] | A:436 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:27 [GLU] | a:437 [U] | D:30 [THR] | A:429 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:35 [GLN] | a:426 [U] | D:39 [GLY] | A:418 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:35 [GLN] | a:519 [C] | D:39 [GLY] | A:511 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:35 [GLN] | a:548 [G] | D:39 [GLY] | A:540 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:42 [LYS] | a:517 [A] | D:46 [PRO] | A:509 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| d:59 [TYR] | a:553 [C] | D:63 [ARG] | A:545 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:28 [LYS] | a:433 [A] | D:31 [LYS] | A:425 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:28 [LYS] | a:434 [U] | D:31 [LYS] | A:426 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:9 [TRP] | a:417 [U] | D:8 [LYS] | A:409 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:9 [TRP] | a:418 [G] | D:8 [LYS] | A:410 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:115 [ASN] | a:448 [U] | D:119 [SER] | A:440 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:34 [GLY] | a:549 [G] | D:38 [PRO] | A:541 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| d:33 [PRO] | a:434 [U] | D:37 [ALA] | A:426 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:109 [GLN] | a:444 [C] | D:113 [GLU] | A:436 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| d:109 [GLN] | a:445 [U] | D:113 [GLU] | A:437 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| d:112 [GLN] | a:444 [C] | D:116 [GLN] | A:436 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:112 [GLN] | a:415 [A] | D:116 [GLN] | A:407 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:112 [GLN] | a:413 [U] | D:116 [GLN] | A:405 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:116 [HIS] | a:503 [A] | D:120 [HIS] | A:495 [A] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:116 [HIS] | a:413 [U] | D:120 [HIS] | A:405 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:126 [VAL] | a:498 [U] | D:129 [VAL] | A:490 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:14 [ARG] | a:436 [G] | D:13 [ARG] | A:428 [G] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:14 [ARG] | a:435 [C] | D:13 [ARG] | A:427 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:14 [ARG] | a:434 [U] | D:13 [ARG] | A:426 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:14 [ARG] | a:437 [U] | D:13 [ARG] | A:429 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:128 [ILE] | a:447 [U] | D:131 [ASN] | A:439 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:129 [PRO] | a:410 [G] | D:132 [ILE] | A:402 [G] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:129 [PRO] | a:628 [C] | D:132 [ILE] | A:620 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:129 [PRO] | a:627 [U] | D:132 [ILE] | A:619 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:130 [SER] | a:411 [C] | D:134 [SER] | A:403 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:142 [ARG] | a:498 [U] | D:146 [ARG] | A:490 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:142 [ARG] | a:497 [C] | D:146 [ARG] | A:489 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:149 [ASN] | a:446 [G] | D:152 [GLN] | A:438 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:149 [ASN] | a:445 [U] | D:152 [GLN] | A:437 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:3 [ARG] | a:507 [A] | D:2 [ALA] | A:499 [A] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:3 [ARG] | a:411 [C] | D:2 [ALA] | A:403 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:28 [LYS] | a:418 [G] | D:31 [LYS] | A:410 [G] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:34 [GLY] | a:550 [U] | D:38 [PRO] | A:542 [G] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:34 [GLY] | a:551 [G] | D:38 [PRO] | A:543 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:35 [GLN] | a:550 [U] | D:39 [GLY] | A:542 [G] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:35 [GLN] | a:434 [U] | D:39 [GLY] | A:426 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:36 [HIS] | a:434 [U] | D:40 [GLN] | A:426 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:36 [HIS] | a:549 [G] | D:40 [GLN] | A:541 [G] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:36 [HIS] | a:426 [U] | D:40 [GLN] | A:418 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:42 [LYS] | a:518 [A] | D:46 [PRO] | A:510 [A] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:44 [LEU] | a:518 [A] | D:48 [LEU] | A:510 [A] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:6 [GLY] | a:413 [U] | D:5 [LEU] | A:405 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:51 [LEU] | a:517 [A] | D:55 [LEU] | A:509 [A] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:51 [LEU] | a:553 [C] | D:55 [LEU] | A:545 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:54 [LYS] | a:552 [G] | D:58 [LYS] | A:544 [G] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:55 [GLN] | a:551 [G] | D:59 [GLN] | A:543 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:66 [ARG] | a:553 [C] | D:70 [ARG] | A:545 [C] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:9 [TRP] | a:415 [A] | D:8 [LYS] | A:407 [U] | ❌ 6S0X_d_a |
| d:149 [ASN] | a:443 [U] | D:152 [GLN] | A:435 [A] | ❌ 7K00_A:435 no longer at interface |
| d:144 [LYS] | a:500 [A] | D:147 [GLU] | A:492 [C] | ❌ 7K00_D:147, 7K00_A:492 no longer at interface |
| d:27 [GLU] | a:420 [U] | D:30 [THR] | A:412 [A] | ❌ 7K00_A:412 no longer at interface |
| d:42 [LYS] | a:515 [C] | D:46 [PRO] | A:507 [C] | ❌ 7K00_A:507 no longer at interface |
| d:28 [LYS] | a:420 [U] | D:31 [LYS] | A:412 [A] | ❌ 7K00_A:412 no longer at interface |
| d:3 [ARG] | a:555 [A] | D:2 [ALA] | A:547 [A] | ❌ 6S0X_a:555 no longer at interface |
| d:196 [GLU] | a:9 [A] | D:202 [GLU] | A:8 [A] | ❌ 6S0X_d:196, 6S0X_a:9 no longer at interface |
| d:197 [TYR] | a:9 [A] | D:203 [LEU] | A:8 [A] | ❌ 6S0X_d:197, 6S0X_a:9 no longer at interface |
| d:199 [SER] | a:9 [A] | D:205 [SER] | A:8 [A] | ❌ 6S0X_d:199, 6S0X_a:9 no longer at interface |
| d:200 [ARG] | a:28 [G] | D:206 [LYS] | A:27 [G] | ❌ 6S0X_d:200, 6S0X_a:28 no longer at interface |
| d:200 [ARG] | a:516 [U] | D:206 [LYS] | A:508 [U] | ❌ 6S0X_d:200, 6S0X_a:516 no longer at interface |
| d:200 [ARG] | a:27 [A] | D:206 [LYS] | A:26 [A] | ❌ 6S0X_d:200, 6S0X_a:27 no longer at interface |
| d:200 [ARG] | a:9 [A] | D:206 [LYS] | A:8 [A] | ❌ 6S0X_d:200, 6S0X_a:9 no longer at interface |
| d:23 [GLY] | a:419 [A] | D:26 [ARG] | A:411 [A] | ❌ 6S0X_d:23, 6S0X_a:419 no longer at interface |
| d:27 [GLU] | a:421 [G] | D:30 [THR] | A:413 [G] | ❌ 6S0X_a:421 no longer at interface |
| d:28 [LYS] | a:421 [G] | D:31 [LYS] | A:413 [G] | ❌ 6S0X_a:421 no longer at interface |
| d:28 [LYS] | a:419 [A] | D:31 [LYS] | A:411 [A] | ❌ 6S0X_a:419 no longer at interface |
| d:29 [ARG] | a:421 [G] | D:33 [LYS] | A:413 [G] | ❌ 6S0X_d:29, 6S0X_a:421 no longer at interface |
| d:36 [HIS] | a:427 [C] | D:40 [GLN] | A:419 [C] | ❌ 6S0X_a:427 no longer at interface |
| d:47 [TYR] | a:516 [U] | D:51 [TYR] | A:508 [U] | ❌ 6S0X_d:47, 6S0X_a:516 no longer at interface |
| d:50 [GLN] | a:9 [A] | D:54 [GLN] | A:8 [A] | ❌ 6S0X_d:50, 6S0X_a:9 no longer at interface |
| d:64 [THR] | a:555 [A] | D:68 [LEU] | A:547 [A] | ❌ 6S0X_a:555 no longer at interface |
| d:66 [ARG] | a:557 [C] | D:70 [ARG] | A:549 [C] | ❌ 6S0X_a:557 no longer at interface |
| d:69 [ARG] | a:29 [G] | D:73 [ARG] | A:28 [A] | ❌ 6S0X_d:69, 6S0X_a:29 no longer at interface |
| d:77 [LYS] | a:621 [C] | D:81 [ARG] | A:613 [C] | ❌ 6S0X_a:621 no longer at interface |
| d:79 [PHE] | a:621 [C] | D:83 [LYS] | A:613 [C] | ❌ 6S0X_d:79, 6S0X_a:621 no longer at interface |
| d:113 [LEU] | a:445 [U] | D:117 [LEU] | A:437 [U] | ❌ 7K00_D:117 no longer at interface |
| d:113 [LEU] | a:446 [G] | D:117 [LEU] | A:438 [U] | ❌ 7K00_D:117 no longer at interface |
| d:150 [ILE] | a:444 [C] | D:153 [SER] | A:436 [C] | ❌ 7K00_D:153 no longer at interface |
| d:150 [ILE] | a:445 [U] | D:153 [SER] | A:437 [U] | ❌ 7K00_D:153 no longer at interface |
| d:148 [LEU] | a:444 [C] | D:151 [LYS] | A:436 [C] | ❌ 7K00_D:151 no longer at interface |
| d:148 [LEU] | a:445 [U] | D:151 [LYS] | A:437 [U] | ❌ 7K00_D:151 no longer at interface |
| d:13 [ARG] | a:437 [U] | D:12 [SER] | A:429 [U] | ❌ 7K00_D:12 no longer at interface |
| d:144 [LYS] | a:499 [A] | D:147 [GLU] | A:491 [G] | ❌ 7K00_D:147 no longer at interface |
| d:118 [HIS] | a:446 [G] | D:122 [ALA] | A:438 [U] | ❌ 7K00_D:122 no longer at interface |
| d:125 [ARG] | a:497 [C] | D:128 [ARG] | A:489 [C] | ❌ 7K00_D:128 no longer at interface |
| d:125 [ARG] | a:498 [U] | D:128 [ARG] | A:490 [C] | ❌ 7K00_D:128 no longer at interface |
| d:11 [LYS] | a:550 [U] | D:10 [LYS] | A:542 [G] | ❌ 6S0X_d:11 no longer at interface |
| d:11 [LYS] | a:437 [U] | D:10 [LYS] | A:429 [U] | ❌ 6S0X_d:11 no longer at interface |
| d:11 [LYS] | a:551 [G] | D:10 [LYS] | A:543 [U] | ❌ 6S0X_d:11 no longer at interface |
| d:11 [LYS] | a:436 [G] | D:10 [LYS] | A:428 [G] | ❌ 6S0X_d:11 no longer at interface |
| d:11 [LYS] | a:438 [A] | D:10 [LYS] | A:430 [A] | ❌ 6S0X_d:11 no longer at interface |
| d:11 [LYS] | a:549 [G] | D:10 [LYS] | A:541 [G] | ❌ 6S0X_d:11 no longer at interface |
| d:11 [LYS] | a:435 [C] | D:10 [LYS] | A:427 [U] | ❌ 6S0X_d:11 no longer at interface |
| d:117 [GLY] | a:448 [U] | D:121 [LYS] | A:440 [C] | ❌ 6S0X_d:117 no longer at interface |
| d:117 [GLY] | a:447 [U] | D:121 [LYS] | A:439 [U] | ❌ 6S0X_d:117 no longer at interface |
| d:117 [GLY] | a:497 [C] | D:121 [LYS] | A:489 [C] | ❌ 6S0X_d:117 no longer at interface |
| d:145 [SER] | a:446 [G] | D:148 [LYS] | A:438 [U] | ❌ 6S0X_d:145 no longer at interface |
| d:145 [SER] | a:499 [A] | D:148 [LYS] | A:491 [G] | ❌ 6S0X_d:145 no longer at interface |
| d:151 [ILE] | a:414 [G] | D:154 [ARG] | A:406 [G] | ❌ 6S0X_d:151 no longer at interface |
| d:151 [ILE] | a:445 [U] | D:154 [ARG] | A:437 [U] | ❌ 6S0X_d:151 no longer at interface |
| d:151 [ILE] | a:444 [C] | D:154 [ARG] | A:436 [C] | ❌ 6S0X_d:151 no longer at interface |
| d:151 [ILE] | a:415 [A] | D:154 [ARG] | A:407 [U] | ❌ 6S0X_d:151 no longer at interface |
| d:20 [SER] | a:418 [G] | D:22 [LYS] | A:410 [G] | ❌ 6S0X_d:20 no longer at interface |
| d:20 [SER] | a:438 [A] | D:22 [LYS] | A:430 [A] | ❌ 6S0X_d:20 no longer at interface |
| d:20 [SER] | a:437 [U] | D:22 [LYS] | A:429 [U] | ❌ 6S0X_d:20 no longer at interface |
| d:20 [SER] | a:417 [U] | D:22 [LYS] | A:409 [U] | ❌ 6S0X_d:20 no longer at interface |
| d:21 [GLY] | a:416 [G] | D:23 [SER] | A:408 [A] | ❌ 6S0X_d:21 no longer at interface |
| d:21 [GLY] | a:417 [U] | D:23 [SER] | A:409 [U] | ❌ 6S0X_d:21 no longer at interface |
| d:22 [THR] | a:417 [U] | D:24 [GLY] | A:409 [U] | ❌ 6S0X_d:22 no longer at interface |
| d:23 [GLY] | a:418 [G] | D:26 [ARG] | A:410 [G] | ❌ 6S0X_d:23 no longer at interface |
| d:23 [GLY] | a:417 [U] | D:26 [ARG] | A:409 [U] | ❌ 6S0X_d:23 no longer at interface |
| d:4 [PHE] | a:414 [G] | D:3 [ARG] | A:406 [G] | ❌ 6S0X_d:4 no longer at interface |
| d:4 [PHE] | a:415 [A] | D:3 [ARG] | A:407 [U] | ❌ 6S0X_d:4 no longer at interface |
| d:4 [PHE] | a:412 [G] | D:3 [ARG] | A:404 [G] | ❌ 6S0X_d:4 no longer at interface |
| d:4 [PHE] | a:554 [A] | D:3 [ARG] | A:546 [A] | ❌ 6S0X_d:4 no longer at interface |
| d:4 [PHE] | a:413 [U] | D:3 [ARG] | A:405 [U] | ❌ 6S0X_d:4 no longer at interface |
| d:29 [ARG] | a:433 [A] | D:33 [LYS] | A:425 [G] | ❌ 6S0X_d:29 no longer at interface |
| d:29 [ARG] | a:434 [U] | D:33 [LYS] | A:426 [U] | ❌ 6S0X_d:29 no longer at interface |
| d:29 [ARG] | a:437 [U] | D:33 [LYS] | A:429 [U] | ❌ 6S0X_d:29 no longer at interface |
| d:32 [ALA] | a:433 [A] | D:36 [GLN] | A:425 [G] | ❌ 6S0X_d:32 no longer at interface |
| d:32 [ALA] | a:434 [U] | D:36 [GLN] | A:426 [U] | ❌ 6S0X_d:32 no longer at interface |
| d:37 [GLY] | a:520 [U] | D:41 [HIS] | A:512 [U] | ❌ 6S0X_d:37 no longer at interface |
| d:37 [GLY] | a:549 [G] | D:41 [HIS] | A:541 [G] | ❌ 6S0X_d:37 no longer at interface |
| d:37 [GLY] | a:519 [C] | D:41 [HIS] | A:511 [C] | ❌ 6S0X_d:37 no longer at interface |
| d:37 [GLY] | a:548 [G] | D:41 [HIS] | A:540 [G] | ❌ 6S0X_d:37 no longer at interface |
| d:40 [GLN] | a:520 [U] | D:44 [ARG] | A:512 [U] | ❌ 6S0X_d:40 no longer at interface |
| d:40 [GLN] | a:519 [C] | D:44 [ARG] | A:511 [C] | ❌ 6S0X_d:40 no longer at interface |
| d:47 [TYR] | a:517 [A] | D:51 [TYR] | A:509 [A] | ❌ 6S0X_d:47 no longer at interface |
| d:48 [GLY] | a:517 [A] | D:52 [GLY] | A:509 [A] | ❌ 6S0X_d:48 no longer at interface |
| d:52 [ARG] | a:551 [G] | D:56 [ARG] | A:543 [U] | ❌ 6S0X_d:52 no longer at interface |
| d:52 [ARG] | a:552 [G] | D:56 [ARG] | A:544 [G] | ❌ 6S0X_d:52 no longer at interface |
| d:52 [ARG] | a:517 [A] | D:56 [ARG] | A:509 [A] | ❌ 6S0X_d:52 no longer at interface |
| d:8 [ASN] | a:436 [G] | D:7 [PRO] | A:428 [G] | ❌ 6S0X_d:8 no longer at interface |
| d:8 [ASN] | a:438 [A] | D:7 [PRO] | A:430 [A] | ❌ 6S0X_d:8 no longer at interface |
| d:69 [ARG] | a:409 [C] | D:73 [ARG] | A:401 [C] | ❌ 6S0X_d:69 no longer at interface |
| d:70 [ASN] | a:410 [G] | D:74 [ASN] | A:402 [G] | ❌ 6S0X_d:70 no longer at interface |
| d:70 [ASN] | a:409 [C] | D:74 [ASN] | A:401 [C] | ❌ 6S0X_d:70 no longer at interface |
| d:79 [PHE] | a:622 [A] | D:83 [LYS] | A:614 [C] | ❌ 6S0X_d:79 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.95 | 4.88 | 0.37 | 0.88 | 0.95 | 0.84 | 0.91 | 0.35 | 0.22 | 0.09 | 0.56 |
Other pairs involving 6S0X_d_a or 7K00_D_A
Total number of entries: 5
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4Y4O_1d_1a | 6S0X_d_a | 0.36 | 0.95 | 4.96 | 0.39 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0X_d_a | 7K00_D_A | 0.35 | 0.95 | 4.88 | 0.37 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 4Y4O_1d_1a | 7K00_D_A | 0.73 | 0.98 | 1.52 | 0.45 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0X_d_a | 7RYG_d_a | 0.58 | 0.96 | 2.24 | 0.49 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 7K00_D_A | 7RYG_d_a | 0.75 | 0.93 | 3.84 | 0.7 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |