Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 7K00_D
|
7K00_A
|
7RYG_d
|
7RYG_a
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| D:109 [ALA] | A:408 [A] | d:112 [THR] | a:404 [G] | ✔ |
| D:10 [LYS] | A:427 [U] | d:10 [LYS] | a:423 [U] | ✔ |
| D:10 [LYS] | A:428 [G] | d:10 [LYS] | a:424 [G] | ✔ |
| D:10 [LYS] | A:429 [U] | d:10 [LYS] | a:425 [U] | ✔ |
| D:10 [LYS] | A:542 [G] | d:10 [LYS] | a:539 [G] | ✔ |
| D:32 [CYS] | A:413 [G] | d:33 [LYS] | a:409 [G] | ✔ |
| D:32 [CYS] | A:429 [U] | d:33 [LYS] | a:425 [U] | ✔ |
| D:55 [LEU] | A:509 [A] | d:57 [LEU] | a:506 [A] | ✔ |
| D:55 [LEU] | A:544 [G] | d:57 [LEU] | a:541 [G] | ✔ |
| D:68 [LEU] | A:546 [A] | d:70 [LEU] | a:543 [G] | ✔ |
| D:68 [LEU] | A:547 [A] | d:70 [LEU] | a:544 [A] | ✔ |
| D:112 [ALA] | A:407 [U] | d:114 [ALA] | a:403 [U] | ✔ |
| D:112 [ALA] | A:408 [A] | d:114 [ALA] | a:404 [G] | ✔ |
| D:30 [THR] | A:413 [G] | d:31 [LYS] | a:409 [G] | ✔ |
| D:116 [GLN] | A:406 [G] | d:118 [GLN] | a:402 [G] | ✔ |
| D:116 [GLN] | A:407 [U] | d:118 [GLN] | a:403 [U] | ✔ |
| D:116 [GLN] | A:437 [U] | d:118 [GLN] | a:433 [U] | ✔ |
| D:116 [GLN] | A:495 [A] | d:118 [GLN] | a:492 [A] | ✔ |
| D:56 [ARG] | A:544 [G] | d:58 [ARG] | a:541 [G] | ✔ |
| D:134 [SER] | A:402 [G] | d:136 [SER] | a:398 [G] | ✔ |
| D:134 [SER] | A:403 [C] | d:136 [SER] | a:399 [C] | ✔ |
| D:134 [SER] | A:620 [C] | d:136 [SER] | a:617 [U] | ✔ |
| D:71 [GLN] | A:402 [G] | d:73 [GLN] | a:398 [G] | ✔ |
| D:71 [GLN] | A:403 [C] | d:73 [GLN] | a:399 [C] | ✔ |
| D:14 [ARG] | A:542 [G] | d:14 [ARG] | a:539 [G] | ✔ |
| D:14 [ARG] | A:543 [U] | d:14 [ARG] | a:540 [U] | ✔ |
| D:51 [TYR] | A:509 [A] | d:53 [TYR] | a:506 [A] | ✔ |
| D:21 [LEU] | A:408 [A] | d:21 [LEU] | a:404 [G] | ✔ |
| D:3 [ARG] | A:404 [G] | d:3 [ARG] | a:400 [G] | ✔ |
| D:3 [ARG] | A:405 [U] | d:3 [ARG] | a:401 [U] | ✔ |
| D:3 [ARG] | A:406 [G] | d:3 [ARG] | a:402 [G] | ✔ |
| D:3 [ARG] | A:407 [U] | d:3 [ARG] | a:403 [U] | ✔ |
| D:3 [ARG] | A:546 [A] | d:3 [ARG] | a:543 [G] | ✔ |
| D:31 [LYS] | A:429 [U] | d:32 [THR] | a:425 [U] | ✔ |
| D:25 [VAL] | A:409 [U] | d:26 [LYS] | a:405 [U] | ✔ |
| D:25 [VAL] | A:410 [G] | d:26 [LYS] | a:406 [G] | ✔ |
| D:205 [SER] | A:8 [A] | d:207 [SER] | a:10 [A] | ✔ |
| D:115 [ARG] | A:404 [G] | d:117 [ARG] | a:400 [G] | ✔ |
| D:22 [LYS] | A:409 [U] | d:22 [LYS] | a:405 [U] | ✔ |
| D:22 [LYS] | A:429 [U] | d:22 [LYS] | a:425 [U] | ✔ |
| D:22 [LYS] | A:430 [A] | d:22 [LYS] | a:426 [A] | ✔ |
| D:206 [LYS] | A:8 [A] | d:208 [LYS] | a:10 [A] | ✔ |
| D:203 [LEU] | A:8 [A] | d:205 [LEU] | a:10 [A] | ✔ |
| D:8 [LYS] | A:407 [U] | d:8 [LYS] | a:403 [U] | ✔ |
| D:8 [LYS] | A:408 [A] | d:8 [LYS] | a:404 [G] | ✔ |
| D:8 [LYS] | A:430 [A] | d:8 [LYS] | a:426 [A] | ✔ |
| D:81 [ARG] | A:613 [C] | d:83 [ARG] | a:610 [C] | ✔ |
| D:81 [ARG] | A:614 [C] | d:83 [ARG] | a:611 [C] | ✔ |
| D:13 [ARG] | A:427 [U] | d:13 [ARG] | a:423 [U] | ✔ |
| D:13 [ARG] | A:428 [G] | d:13 [ARG] | a:424 [G] | ✔ |
| D:13 [ARG] | A:429 [U] | d:13 [ARG] | a:425 [U] | ✔ |
| D:121 [LYS] | A:439 [U] | d:123 [ARG] | a:435 [U] | ✔ |
| D:121 [LYS] | A:440 [C] | d:123 [ARG] | a:436 [A] | ✔ |
| D:121 [LYS] | A:489 [C] | d:123 [ARG] | a:486 [U] | ✔ |
| D:52 [GLY] | A:509 [A] | d:54 [SER] | a:506 [A] | ✔ |
| D:41 [HIS] | A:511 [C] | d:42 [HIS] | a:508 [C] | ✔ |
| D:41 [HIS] | A:512 [U] | d:42 [HIS] | a:509 [U] | ✔ |
| D:41 [HIS] | A:540 [G] | d:42 [HIS] | a:537 [G] | ✔ |
| D:23 [SER] | A:408 [A] | d:23 [SER] | a:404 [G] | ✔ |
| D:23 [SER] | A:409 [U] | d:23 [SER] | a:405 [U] | ✔ |
| D:5 [LEU] | A:405 [U] | d:5 [ILE] | a:401 [U] | ✔ |
| D:5 [LEU] | A:406 [G] | d:5 [ILE] | a:402 [G] | ✔ |
| D:5 [LEU] | A:407 [U] | d:5 [ILE] | a:403 [U] | ✔ |
| D:74 [ASN] | A:401 [C] | d:76 [ASN] | a:397 [C] | ✔ |
| D:74 [ASN] | A:402 [G] | d:76 [ASN] | a:398 [G] | ✔ |
| D:38 [PRO] | A:426 [U] | d:39 [PRO] | a:422 [U] | ✔ |
| D:38 [PRO] | A:427 [U] | d:39 [PRO] | a:423 [U] | ✔ |
| D:38 [PRO] | A:542 [G] | d:39 [PRO] | a:539 [G] | ✔ |
| D:131 [ASN] | A:619 [U] | d:134 [ILE] | a:616 [U] | ✔ |
| D:40 [GLN] | A:419 [C] | d:41 [GLN] | a:415 [C] | ✔ |
| D:40 [GLN] | A:426 [U] | d:41 [GLN] | a:422 [U] | ✔ |
| D:40 [GLN] | A:511 [C] | d:41 [GLN] | a:508 [C] | ✔ |
| D:40 [GLN] | A:512 [U] | d:41 [GLN] | a:509 [U] | ✔ |
| D:40 [GLN] | A:540 [G] | d:41 [GLN] | a:537 [G] | ✔ |
| D:40 [GLN] | A:541 [G] | d:41 [GLN] | a:538 [G] | ✔ |
| D:54 [GLN] | A:8 [A] | d:56 [GLN] | a:10 [A] | ✔ |
| D:49 [SER] | A:509 [A] | d:51 [SER] | a:506 [A] | ✔ |
| D:135 [TYR] | A:619 [U] | d:137 [ILE] | a:616 [U] | ✔ |
| D:135 [TYR] | A:620 [C] | d:137 [ILE] | a:617 [U] | ✔ |
| D:9 [LEU] | A:429 [U] | d:9 [CYS] | a:425 [U] | ✔ |
| D:9 [LEU] | A:430 [A] | d:9 [CYS] | a:426 [A] | ✔ |
| D:70 [ARG] | A:400 [C] | d:72 [ARG] | a:396 [C] | ✔ |
| D:70 [ARG] | A:401 [C] | d:72 [ARG] | a:397 [C] | ✔ |
| D:70 [ARG] | A:402 [G] | d:72 [ARG] | a:398 [G] | ✔ |
| D:70 [ARG] | A:546 [A] | d:72 [ARG] | a:543 [G] | ✔ |
| D:7 [PRO] | A:428 [G] | d:7 [PRO] | a:424 [G] | ✔ |
| D:7 [PRO] | A:430 [A] | d:7 [PRO] | a:426 [A] | ✔ |
| D:39 [GLY] | A:426 [U] | d:40 [GLY] | a:422 [U] | ✔ |
| D:39 [GLY] | A:427 [U] | d:40 [GLY] | a:423 [U] | ✔ |
| D:39 [GLY] | A:541 [G] | d:40 [GLY] | a:538 [G] | ✔ |
| D:39 [GLY] | A:542 [G] | d:40 [GLY] | a:539 [G] | ✔ |
| D:132 [ILE] | A:403 [C] | d:135 [ALA] | a:399 [C] | ✔ |
| D:119 [SER] | A:403 [C] | d:121 [SER] | a:399 [C] | ✔ |
| D:119 [SER] | A:404 [G] | d:121 [SER] | a:400 [G] | ✔ |
| D:119 [SER] | A:439 [U] | d:121 [SER] | a:435 [U] | ✔ |
| D:4 [TYR] | A:546 [A] | d:4 [TYR] | a:543 [G] | ✔ |
| D:202 [GLU] | A:8 [A] | d:204 [GLU] | a:10 [A] | ✔ |
| D:58 [LYS] | A:544 [G] | d:60 [LYS] | a:541 [G] | ✔ |
| D:58 [LYS] | A:545 [C] | d:60 [LYS] | a:542 [C] | ✔ |
| D:33 [LYS] | A:425 [G] | d:34 [LYS] | a:421 [G] | ✔ |
| D:33 [LYS] | A:426 [U] | d:34 [LYS] | a:422 [U] | ✔ |
| D:130 [VAL] | A:619 [U] | d:133 [ASN] | a:616 [U] | ✔ |
| D:59 [GLN] | A:544 [G] | d:61 [GLN] | a:541 [G] | ✔ |
| D:59 [GLN] | A:545 [C] | d:61 [GLN] | a:542 [C] | ✔ |
| D:69 [GLU] | A:545 [C] | d:71 [GLU] | a:542 [C] | ✔ |
| D:69 [GLU] | A:546 [A] | d:71 [GLU] | a:543 [G] | ✔ |
| D:62 [ARG] | A:545 [C] | d:64 [ARG] | a:542 [C] | ✔ |
| D:62 [ARG] | A:546 [A] | d:64 [ARG] | a:543 [G] | ✔ |
| D:63 [ARG] | A:544 [G] | d:65 [ARG] | a:541 [G] | ✔ |
| D:120 [HIS] | A:437 [U] | d:122 [HIS] | a:433 [U] | ✔ |
| D:120 [HIS] | A:438 [U] | d:122 [HIS] | a:434 [U] | ✔ |
| D:120 [HIS] | A:439 [U] | d:122 [HIS] | a:435 [U] | ✔ |
| D:120 [HIS] | A:495 [A] | d:122 [HIS] | a:492 [A] | ✔ |
| D:129 [VAL] | A:619 [U] | d:132 [VAL] | a:616 [U] | ✔ |
| D:113 [GLU] | A:407 [U] | d:115 [GLU] | a:403 [U] | ✔ |
| D:113 [GLU] | A:408 [A] | d:115 [GLU] | a:404 [G] | ✔ |
| D:2 [ALA] | A:403 [C] | d:2 [ALA] | a:399 [C] | ✔ |
| D:2 [ALA] | A:404 [G] | d:2 [ALA] | a:400 [G] | ✔ |
| D:2 [ALA] | A:405 [U] | d:2 [ALA] | a:401 [U] | ✔ |
| D:2 [ALA] | A:499 [A] | d:2 [ALA] | a:496 [A] | ✔ |
| D:2 [ALA] | A:547 [A] | d:2 [ALA] | a:544 [A] | ✔ |
| D:10 [LYS] | A:430 [A] | d:10 [LYS] | a:426 [A] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:10 [LYS] | A:541 [G] | d:10 [LYS] | a:538 [G] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:10 [LYS] | A:543 [U] | d:10 [LYS] | a:540 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:55 [LEU] | A:545 [C] | d:57 [LEU] | a:542 [C] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:116 [GLN] | A:405 [U] | d:118 [GLN] | a:401 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:116 [GLN] | A:436 [C] | d:118 [GLN] | a:432 [C] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:56 [ARG] | A:509 [A] | d:58 [ARG] | a:506 [A] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:56 [ARG] | A:543 [U] | d:58 [ARG] | a:540 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:14 [ARG] | A:511 [C] | d:14 [ARG] | a:508 [C] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:31 [LYS] | A:410 [G] | d:32 [THR] | a:406 [G] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:31 [LYS] | A:411 [A] | d:32 [THR] | a:407 [A] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:31 [LYS] | A:413 [G] | d:32 [THR] | a:409 [G] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:115 [ARG] | A:403 [C] | d:117 [ARG] | a:399 [C] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:22 [LYS] | A:410 [G] | d:22 [LYS] | a:406 [G] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:8 [LYS] | A:429 [U] | d:8 [LYS] | a:425 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:13 [ARG] | A:426 [U] | d:13 [ARG] | a:422 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:41 [HIS] | A:541 [G] | d:42 [HIS] | a:538 [G] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:38 [PRO] | A:543 [U] | d:39 [PRO] | a:540 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:131 [ASN] | A:439 [U] | d:134 [ILE] | a:435 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:70 [ARG] | A:545 [C] | d:72 [ARG] | a:542 [C] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:132 [ILE] | A:402 [G] | d:135 [ALA] | a:398 [G] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:132 [ILE] | A:619 [U] | d:135 [ALA] | a:616 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:132 [ILE] | A:620 [C] | d:135 [ALA] | a:617 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:4 [TYR] | A:407 [U] | d:4 [TYR] | a:403 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:33 [LYS] | A:413 [G] | d:34 [LYS] | a:409 [G] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:33 [LYS] | A:429 [U] | d:34 [LYS] | a:425 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:59 [GLN] | A:543 [U] | d:61 [GLN] | a:540 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:63 [ARG] | A:543 [U] | d:65 [ARG] | a:540 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:120 [HIS] | A:405 [U] | d:122 [HIS] | a:401 [U] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:129 [VAL] | A:490 [C] | d:132 [VAL] | a:487 [C] | ❌ 7RYG_d_a |
| D:109 [ALA] | A:407 [U] | d:112 [THR] | a:403 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| D:121 [LYS] | A:490 [C] | d:123 [ARG] | a:487 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| D:130 [VAL] | A:439 [U] | d:133 [ASN] | a:435 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| D:130 [VAL] | A:403 [C] | d:133 [ASN] | a:399 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| D:131 [ASN] | A:402 [G] | d:134 [ILE] | a:398 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| D:131 [ASN] | A:403 [C] | d:134 [ILE] | a:399 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| D:131 [ASN] | A:620 [C] | d:134 [ILE] | a:617 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| D:14 [ARG] | A:510 [A] | d:14 [ARG] | a:507 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| D:2 [ALA] | A:546 [A] | d:2 [ALA] | a:543 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| D:3 [ARG] | A:547 [A] | d:3 [ARG] | a:544 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| D:30 [THR] | A:410 [G] | d:31 [LYS] | a:406 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| D:30 [THR] | A:411 [A] | d:31 [LYS] | a:407 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| D:30 [THR] | A:429 [U] | d:31 [LYS] | a:425 [U] | ❌ 7K00_D_A |
| D:62 [ARG] | A:544 [G] | d:64 [ARG] | a:541 [G] | ❌ 7K00_D_A |
| D:63 [ARG] | A:545 [C] | d:65 [ARG] | a:542 [C] | ❌ 7K00_D_A |
| D:70 [ARG] | A:547 [A] | d:72 [ARG] | a:544 [A] | ❌ 7K00_D_A |
| D:51 [TYR] | A:508 [U] | d:53 [TYR] | a:505 [U] | ❌ 7RYG_a:505 no longer at interface |
| D:206 [LYS] | A:26 [A] | d:208 [LYS] | a:28 [A] | ❌ 7RYG_a:28 no longer at interface |
| D:206 [LYS] | A:27 [G] | d:208 [LYS] | a:29 [G] | ❌ 7RYG_a:29 no longer at interface |
| D:206 [LYS] | A:508 [U] | d:208 [LYS] | a:505 [U] | ❌ 7RYG_a:505 no longer at interface |
| D:148 [LYS] | A:491 [G] | d:150 [GLY] | a:488 [G] | ❌ 7RYG_d:150, 7RYG_a:488 no longer at interface |
| D:40 [GLN] | A:418 [C] | d:41 [GLN] | a:414 [C] | ❌ 7RYG_a:414 no longer at interface |
| D:70 [ARG] | A:549 [C] | d:72 [ARG] | a:546 [C] | ❌ 7RYG_a:546 no longer at interface |
| D:83 [LYS] | A:2 [A] | d:85 [LYS] | a:4 [A] | ❌ 7RYG_d:85, 7RYG_a:4 no longer at interface |
| D:73 [ARG] | A:28 [A] | d:75 [SER] | a:30 [A] | ❌ 7RYG_d:75, 7RYG_a:30 no longer at interface |
| D:81 [ARG] | A:4 [U] | d:83 [ARG] | a:6 [C] | ❌ 7K00_A:4 no longer at interface |
| D:81 [ARG] | A:612 [C] | d:83 [ARG] | a:609 [C] | ❌ 7K00_A:612 no longer at interface |
| D:146 [ARG] | A:489 [C] | d:148 [HIS] | a:486 [U] | ❌ 7RYG_d:148 no longer at interface |
| D:146 [ARG] | A:490 [C] | d:148 [HIS] | a:487 [C] | ❌ 7RYG_d:148 no longer at interface |
| D:24 [GLY] | A:409 [U] | d:24 [GLY] | a:405 [U] | ❌ 7RYG_d:24 no longer at interface |
| D:37 [ALA] | A:427 [U] | d:38 [ALA] | a:423 [U] | ❌ 7RYG_d:38 no longer at interface |
| D:36 [GLN] | A:425 [G] | d:37 [LYS] | a:421 [G] | ❌ 7RYG_d:37 no longer at interface |
| D:36 [GLN] | A:426 [U] | d:37 [LYS] | a:422 [U] | ❌ 7RYG_d:37 no longer at interface |
| D:6 [GLY] | A:430 [A] | d:6 [GLY] | a:426 [A] | ❌ 7RYG_d:6 no longer at interface |
| D:148 [LYS] | A:438 [U] | d:150 [GLY] | a:434 [U] | ❌ 7RYG_d:150 no longer at interface |
| D:26 [ARG] | A:409 [U] | d:27 [PRO] | a:405 [U] | ❌ 7RYG_d:27 no longer at interface |
| D:26 [ARG] | A:410 [G] | d:27 [PRO] | a:406 [G] | ❌ 7RYG_d:27 no longer at interface |
| D:26 [ARG] | A:411 [A] | d:27 [PRO] | a:407 [A] | ❌ 7RYG_d:27 no longer at interface |
| D:152 [GLN] | A:437 [U] | d:155 [LEU] | a:433 [U] | ❌ 7RYG_d:155 no longer at interface |
| D:152 [GLN] | A:438 [U] | d:155 [LEU] | a:434 [U] | ❌ 7RYG_d:155 no longer at interface |
| D:136 [GLN] | A:620 [C] | d:138 [GLN] | a:617 [U] | ❌ 7RYG_d:138 no longer at interface |
| D:46 [PRO] | A:510 [A] | d:48 [GLY] | a:507 [A] | ❌ 7RYG_d:48 no longer at interface |
| D:48 [LEU] | A:509 [A] | d:50 [GLN] | a:506 [A] | ❌ 7RYG_d:50 no longer at interface |
| D:48 [LEU] | A:510 [A] | d:50 [GLN] | a:507 [A] | ❌ 7RYG_d:50 no longer at interface |
| D:83 [LYS] | A:613 [C] | d:85 [LYS] | a:610 [C] | ❌ 7RYG_d:85 no longer at interface |
| D:83 [LYS] | A:614 [C] | d:85 [LYS] | a:611 [C] | ❌ 7RYG_d:85 no longer at interface |
| D:73 [ARG] | A:401 [C] | d:75 [SER] | a:397 [C] | ❌ 7RYG_d:75 no longer at interface |
| D:44 [ARG] | A:511 [C] | d:45 [ALA] | a:508 [C] | ❌ 7RYG_d:45 no longer at interface |
| D:44 [ARG] | A:512 [U] | d:45 [ALA] | a:509 [U] | ❌ 7RYG_d:45 no longer at interface |
| D:108 [GLY] | A:408 [A] | d:111 [SER] | a:404 [G] | ❌ 7K00_D:108 no longer at interface |
| D:128 [ARG] | A:490 [C] | d:131 [ARG] | a:487 [C] | ❌ 7K00_D:128 no longer at interface |
| D:128 [ARG] | A:619 [U] | d:131 [ARG] | a:616 [U] | ❌ 7K00_D:128 no longer at interface |
| D:151 [LYS] | A:437 [U] | d:154 [GLN] | a:433 [U] | ❌ 7K00_D:151 no longer at interface |
| D:153 [SER] | A:437 [U] | d:156 [ARG] | a:433 [U] | ❌ 7K00_D:153 no longer at interface |
| D:153 [SER] | A:436 [C] | d:156 [ARG] | a:432 [C] | ❌ 7K00_D:153 no longer at interface |
| D:153 [SER] | A:406 [G] | d:156 [ARG] | a:402 [G] | ❌ 7K00_D:153 no longer at interface |
| D:153 [SER] | A:407 [U] | d:156 [ARG] | a:403 [U] | ❌ 7K00_D:153 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.93 | 3.84 | 0.70 | 0.96 | 0.93 | 0.92 | 0.96 | 0.75 | 0.63 | 0.38 | 0.47 |
Other pairs involving 7K00_D_A or 7RYG_d_a
Total number of entries: 5
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6S0X_d_a | 7K00_D_A | 0.35 | 0.95 | 4.88 | 0.37 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 4Y4O_1d_1a | 7K00_D_A | 0.73 | 0.98 | 1.52 | 0.45 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0X_d_a | 7RYG_d_a | 0.58 | 0.96 | 2.24 | 0.49 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 7K00_D_A | 7RYG_d_a | 0.75 | 0.93 | 3.84 | 0.7 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 4Y4O_1d_1a | 7RYG_d_a | 0.61 | 0.91 | 4.08 | 0.44 | Alpha-L RNA-binding motif | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |