Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 3FOZ_A
|
3FOZ_C
|
3FOZ_B
|
3FOZ_D
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| A:108 [THR] | C:36 [A] | B:108 [THR] | D:36 [A] | ✔ |
| A:108 [THR] | C:37 [A] | B:108 [THR] | D:37 [A] | ✔ |
| A:252 [ARG] | C:38 [A] | B:252 [ARG] | D:38 [A] | ✔ |
| A:252 [ARG] | C:39 [U] | B:252 [ARG] | D:39 [U] | ✔ |
| A:211 [HIS] | C:27 [G] | B:211 [HIS] | D:27 [G] | ✔ |
| A:211 [HIS] | C:28 [G] | B:211 [HIS] | D:28 [G] | ✔ |
| A:170 [ARG] | C:34 [G] | B:170 [ARG] | D:34 [G] | ✔ |
| A:170 [ARG] | C:35 [A] | B:170 [ARG] | D:35 [A] | ✔ |
| A:273 [CYS] | C:26 [A] | B:273 [CYS] | D:26 [A] | ✔ |
| A:273 [CYS] | C:27 [G] | B:273 [CYS] | D:27 [G] | ✔ |
| A:125 [ALA] | C:34 [G] | B:125 [ALA] | D:34 [G] | ✔ |
| A:125 [ALA] | C:35 [A] | B:125 [ALA] | D:35 [A] | ✔ |
| A:107 [GLY] | C:37 [A] | B:107 [GLY] | D:37 [A] | ✔ |
| A:82 [ALA] | C:34 [G] | B:82 [ALA] | D:34 [G] | ✔ |
| A:163 [ASN] | C:39 [U] | B:163 [ASN] | D:39 [U] | ✔ |
| A:163 [ASN] | C:40 [C] | B:163 [ASN] | D:40 [C] | ✔ |
| A:163 [ASN] | C:41 [C] | B:163 [ASN] | D:41 [C] | ✔ |
| A:284 [THR] | C:30 [G] | B:284 [THR] | D:30 [G] | ✔ |
| A:284 [THR] | C:31 [A] | B:284 [THR] | D:31 [A] | ✔ |
| A:284 [THR] | C:32 [U] | B:284 [THR] | D:32 [U] | ✔ |
| A:278 [LEU] | C:37 [A] | B:278 [LEU] | D:37 [A] | ✔ |
| A:277 [GLN] | C:26 [A] | B:277 [GLN] | D:26 [A] | ✔ |
| A:277 [GLN] | C:27 [G] | B:277 [GLN] | D:27 [G] | ✔ |
| A:242 [ASP] | C:35 [A] | B:242 [ASP] | D:35 [A] | ✔ |
| A:130 [ARG] | C:34 [G] | B:130 [ARG] | D:34 [G] | ✔ |
| A:130 [ARG] | C:35 [A] | B:130 [ARG] | D:35 [A] | ✔ |
| A:124 [SER] | C:34 [G] | B:124 [SER] | D:34 [G] | ✔ |
| A:247 [ARG] | C:35 [A] | B:247 [ARG] | D:35 [A] | ✔ |
| A:247 [ARG] | C:37 [A] | B:247 [ARG] | D:37 [A] | ✔ |
| A:247 [ARG] | C:38 [A] | B:247 [ARG] | D:38 [A] | ✔ |
| A:247 [ARG] | C:39 [U] | B:247 [ARG] | D:39 [U] | ✔ |
| A:53 [GLY] | C:37 [A] | B:53 [GLY] | D:37 [A] | ✔ |
| A:207 [ARG] | C:28 [G] | B:207 [ARG] | D:28 [G] | ✔ |
| A:207 [ARG] | C:29 [G] | B:207 [ARG] | D:29 [G] | ✔ |
| A:280 [LYS] | C:28 [G] | B:280 [LYS] | D:28 [G] | ✔ |
| A:280 [LYS] | C:29 [G] | B:280 [LYS] | D:29 [G] | ✔ |
| A:280 [LYS] | C:30 [G] | B:280 [LYS] | D:30 [G] | ✔ |
| A:111 [TYR] | C:36 [A] | B:111 [TYR] | D:36 [A] | ✔ |
| A:81 [ALA] | C:34 [G] | B:81 [ALA] | D:34 [G] | ✔ |
| A:81 [ALA] | C:36 [A] | B:81 [ALA] | D:36 [A] | ✔ |
| A:269 [TYR] | C:10 [G] | B:269 [TYR] | D:10 [G] | ✔ |
| A:269 [TYR] | C:25 [C] | B:269 [TYR] | D:25 [C] | ✔ |
| A:269 [TYR] | C:26 [A] | B:269 [TYR] | D:26 [A] | ✔ |
| A:119 [LEU] | C:33 [U] | B:119 [LEU] | D:33 [U] | ✔ |
| A:119 [LEU] | C:34 [G] | B:119 [LEU] | D:34 [G] | ✔ |
| A:276 [ARG] | C:26 [A] | B:276 [ARG] | D:26 [A] | ✔ |
| A:276 [ARG] | C:27 [G] | B:276 [ARG] | D:27 [G] | ✔ |
| A:44 [ALA] | C:37 [A] | B:44 [ALA] | D:37 [A] | ✔ |
| A:109 [MET] | C:37 [A] | B:109 [MET] | D:37 [A] | ✔ |
| A:182 [LEU] | C:33 [U] | B:182 [LEU] | D:33 [U] | ✔ |
| A:166 [GLN] | C:35 [A] | B:166 [GLN] | D:35 [A] | ✔ |
| A:166 [GLN] | C:36 [A] | B:166 [GLN] | D:36 [A] | ✔ |
| A:166 [GLN] | C:38 [A] | B:166 [GLN] | D:38 [A] | ✔ |
| A:166 [GLN] | C:39 [U] | B:166 [GLN] | D:39 [U] | ✔ |
| A:287 [ARG] | C:29 [G] | B:287 [ARG] | D:29 [G] | ✔ |
| A:287 [ARG] | C:30 [G] | B:287 [ARG] | D:30 [G] | ✔ |
| A:134 [GLU] | C:35 [A] | B:134 [GLU] | D:35 [A] | ✔ |
| A:120 [SER] | C:33 [U] | B:120 [SER] | D:33 [U] | ✔ |
| A:120 [SER] | C:34 [G] | B:120 [SER] | D:34 [G] | ✔ |
| A:42 [ASP] | C:37 [A] | B:42 [ASP] | D:37 [A] | ✔ |
| A:122 [LEU] | C:33 [U] | B:122 [LEU] | D:33 [U] | ✔ |
| A:122 [LEU] | C:34 [G] | B:122 [LEU] | D:34 [G] | ✔ |
| A:248 [CYS] | C:37 [A] | B:248 [CYS] | D:37 [A] | ✔ |
| A:186 [THR] | C:33 [U] | B:186 [THR] | D:33 [U] | ✔ |
| A:164 [ASP] | C:39 [U] | B:164 [ASP] | D:39 [U] | ✔ |
| A:164 [ASP] | C:40 [C] | B:164 [ASP] | D:40 [C] | ✔ |
| A:45 [LEU] | C:37 [A] | B:45 [LEU] | D:37 [A] | ✔ |
| A:80 [SER] | C:34 [G] | B:80 [SER] | D:34 [G] | ✔ |
| A:80 [SER] | C:35 [A] | B:80 [SER] | D:35 [A] | ✔ |
| A:80 [SER] | C:36 [A] | B:80 [SER] | D:36 [A] | ✔ |
| A:249 [VAL] | C:37 [A] | B:249 [VAL] | D:37 [A] | ✔ |
| A:249 [VAL] | C:38 [A] | B:249 [VAL] | D:38 [A] | ✔ |
| A:167 [ARG] | C:31 [A] | B:167 [ARG] | D:31 [A] | ✔ |
| A:167 [ARG] | C:32 [U] | B:167 [ARG] | D:32 [U] | ✔ |
| A:167 [ARG] | C:33 [U] | B:167 [ARG] | D:33 [U] | ✔ |
| A:167 [ARG] | C:36 [A] | B:167 [ARG] | D:36 [A] | ✔ |
| A:167 [ARG] | C:38 [A] | B:167 [ARG] | D:38 [A] | ✔ |
| A:167 [ARG] | C:39 [U] | B:167 [ARG] | D:39 [U] | ✔ |
| A:123 [PRO] | C:34 [G] | B:123 [PRO] | D:34 [G] | ✔ |
| A:244 [PRO] | C:35 [A] | B:244 [PRO] | D:35 [A] | ✔ |
| A:244 [PRO] | C:36 [A] | B:244 [PRO] | D:36 [A] | ✔ |
| A:244 [PRO] | C:37 [A] | B:244 [PRO] | D:37 [A] | ✔ |
| A:169 [SER] | C:35 [A] | B:169 [SER] | D:35 [A] | ✔ |
| A:110 [LEU] | C:32 [U] | B:110 [LEU] | D:32 [U] | ✔ |
| A:110 [LEU] | C:33 [U] | B:110 [LEU] | D:33 [U] | ✔ |
| A:110 [LEU] | C:36 [A] | B:110 [LEU] | D:36 [A] | ✔ |
| A:285 [TRP] | C:32 [U] | B:285 [TRP] | D:32 [U] | ✔ |
| A:285 [TRP] | C:36 [A] | B:285 [TRP] | D:36 [A] | ✔ |
| A:281 [ARG] | C:30 [G] | B:281 [ARG] | D:30 [G] | ✔ |
| A:281 [ARG] | C:31 [A] | B:281 [ARG] | D:31 [A] | ✔ |
| A:281 [ARG] | C:32 [U] | B:281 [ARG] | D:32 [U] | ✔ |
| A:281 [ARG] | C:37 [A] | B:281 [ARG] | D:37 [A] | ✔ |
| A:281 [ARG] | C:38 [A] | B:281 [ARG] | D:38 [A] | ✔ |
| A:281 [ARG] | C:39 [U] | B:281 [ARG] | D:39 [U] | ✔ |
| A:281 [ARG] | C:40 [C] | B:281 [ARG] | D:40 [C] | ✔ |
| A:282 [GLN] | C:37 [A] | B:282 [GLN] | D:37 [A] | ✔ |
| A:159 [ARG] | C:33 [U] | B:159 [ARG] | D:33 [U] | ✔ |
| A:54 [THR] | C:37 [A] | B:54 [THR] | D:37 [A] | ✔ |
| A:165 [PRO] | C:39 [U] | B:165 [PRO] | D:39 [U] | ✔ |
| A:165 [PRO] | C:40 [C] | B:165 [PRO] | D:40 [C] | ✔ |
| A:161 [HIS] | C:40 [C] | B:161 [HIS] | D:40 [C] | ✔ |
| A:161 [HIS] | C:41 [C] | B:161 [HIS] | D:41 [C] | ✔ |
| A:121 [PRO] | C:34 [G] | B:121 [PRO] | D:34 [G] | ✔ |
| A:47 [TYR] | C:36 [A] | B:47 [TYR] | D:36 [A] | ✔ |
| A:79 [TYR] | C:35 [A] | B:79 [TYR] | D:35 [A] | ✔ |
| A:79 [TYR] | C:36 [A] | B:79 [TYR] | D:36 [A] | ✔ |
| A:78 [ALA] | C:35 [A] | B:78 [ALA] | D:35 [A] | ✔ |
| A:43 [SER] | C:36 [A] | B:43 [SER] | D:36 [A] | ✔ |
| A:43 [SER] | C:37 [A] | B:43 [SER] | D:37 [A] | ✔ |
| A:252 [ARG] | C:37 [A] | B:252 [ARG] | D:37 [A] | ❌ 3FOZ_B_D |
| A:159 [ARG] | C:32 [U] | B:159 [ARG] | D:32 [U] | ❌ 3FOZ_B_D |
| A:113 [LYS] | C:32 [U] | B:113 [LYS] | D:32 [U] | ❌ 3FOZ_A:113 no longer at interface |
| A:270 [ARG] | C:26 [A] | B:270 [ARG] | D:26 [A] | ❌ 3FOZ_A:270 no longer at interface |
| A:270 [ARG] | C:25 [C] | B:270 [ARG] | D:25 [C] | ❌ 3FOZ_A:270 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases & tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase helical insertion domain | tRNA | 0.96 | 0.61 | 1.00 | 1.0 | 0.83 | 1.0 | 1.0 | 0.99 | 0.95 | 0.81 | 0.60 |
Other pairs involving 3FOZ_A_C or 3FOZ_B_D
Total number of entries: 1