RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group70 > 1YHQ_3_0 vs 7O7Y_Bo_B5

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1YHQ_3
1YHQ_0
7O7Y_Bo
7O7Y_B5
Conserved?
3:4 [PRO] 0:2320 [U] Bo:5 [PRO] B5:3978 [U] ✔
3:66 [ASP] 0:2457 [U] Bo:67 [VAL] B5:4114 [G] ✔
3:66 [ASP] 0:2458 [U] Bo:67 [VAL] B5:4115 [A] ✔
3:78 [HIS] 0:2382 [A] Bo:81 [ARG] B5:4040 [C] ✔
3:78 [HIS] 0:2436 [U] Bo:81 [ARG] B5:4092 [U] ✔
3:43 [ASN] 0:170 [U] Bo:44 [LYS] B5:43 [U] ✔
3:43 [ASN] 0:218 [C] Bo:44 [LYS] B5:90 [G] ✔
3:43 [ASN] 0:219 [G] Bo:44 [LYS] B5:91 [G] ✔
3:60 [LYS] 0:2316 [G] Bo:61 [LYS] B5:3974 [OMG] ✔
3:60 [LYS] 0:2427 [C] Bo:61 [LYS] B5:4083 [C] ✔
3:60 [LYS] 0:2428 [G] Bo:61 [LYS] B5:4084 [G] ✔
3:60 [LYS] 0:2460 [A] Bo:61 [LYS] B5:4117 [G] ✔
3:60 [LYS] 0:2461 [U] Bo:61 [LYS] B5:4118 [U] ✔
3:60 [LYS] 0:2462 [G] Bo:61 [LYS] B5:4119 [G] ✔
3:45 [GLY] 0:389 [G] Bo:47 [GLY] B5:288 [G] ✔
3:45 [GLY] 0:390 [G] Bo:47 [GLY] B5:289 [C] ✔
3:55 [VAL] 0:2120 [U] Bo:55 [ILE] B5:3657 [OMU] ✔
3:15 [ASN] 0:2408 [A] Bo:16 [GLY] B5:4064 [C] ✔
3:49 [ASP] 0:170 [U] Bo:51 [GLN] B5:43 [U] ✔
3:49 [ASP] 0:2121 [G] Bo:51 [GLN] B5:3658 [C] ✔
3:81 [GLU] 0:2457 [U] Bo:84 [ALA] B5:4114 [G] ✔
3:81 [GLU] 0:2458 [U] Bo:84 [ALA] B5:4115 [A] ✔
3:27 [SER] 0:2434 [A] Bo:28 [LYS] B5:4090 [U] ✔
3:8 [ASN] 0:2378 [U] Bo:9 [ARG] B5:4036 [U] ✔
3:8 [ASN] 0:2379 [G] Bo:9 [ARG] B5:4037 [G] ✔
3:79 [LEU] 0:2435 [U] Bo:82 [MET] B5:4091 [C] ✔
3:79 [LEU] 0:2436 [U] Bo:82 [MET] B5:4092 [U] ✔
3:79 [LEU] 0:2456 [A] Bo:82 [MET] B5:4113 [G] ✔
3:79 [LEU] 0:2457 [U] Bo:82 [MET] B5:4114 [G] ✔
3:63 [LYS] 0:2459 [G] Bo:64 [LYS] B5:4116 [OMG] ✔
3:63 [LYS] 0:2460 [A] Bo:64 [LYS] B5:4117 [G] ✔
3:25 [VAL] 0:2434 [A] Bo:26 [TYR] B5:4090 [U] ✔
3:25 [VAL] 0:2435 [U] Bo:26 [TYR] B5:4091 [C] ✔
3:83 [TRP] 0:2319 [C] Bo:86 [LYS] B5:3977 [C] ✔
3:83 [TRP] 0:2420 [G] Bo:86 [LYS] B5:4076 [G] ✔
3:59 [ASP] 0:2460 [A] Bo:60 [ALA] B5:4117 [G] ✔
3:59 [ASP] 0:2461 [U] Bo:60 [ALA] B5:4118 [U] ✔
3:31 [THR] 0:2434 [A] Bo:32 [SER] B5:4090 [U] ✔
3:31 [THR] 0:2451 [G] Bo:32 [SER] B5:4108 [A] ✔
3:64 [LYS] 0:2428 [G] Bo:65 [LYS] B5:4084 [G] ✔
3:64 [LYS] 0:2458 [U] Bo:65 [LYS] B5:4115 [A] ✔
3:64 [LYS] 0:2459 [G] Bo:65 [LYS] B5:4116 [OMG] ✔
3:26 [ARG] 0:2434 [A] Bo:27 [LYS] B5:4090 [U] ✔
3:87 [ARG] 0:2318 [C] Bo:90 [HIS] B5:3976 [C] ✔
3:29 [ARG] 0:1925 [G] Bo:30 [LYS] B5:3463 [C] ✔
3:29 [ARG] 0:2434 [A] Bo:30 [LYS] B5:4090 [U] ✔
3:80 [ARG] 0:2380 [A] Bo:83 [LEU] B5:4038 [A] ✔
3:80 [ARG] 0:2381 [C] Bo:83 [LEU] B5:4039 [PSU] ✔
3:80 [ARG] 0:2382 [A] Bo:83 [LEU] B5:4040 [C] ✔
3:80 [ARG] 0:2457 [U] Bo:83 [LEU] B5:4114 [G] ✔
3:61 [PRO] 0:2316 [G] Bo:62 [THR] B5:3974 [OMG] ✔
3:61 [PRO] 0:2317 [C] Bo:62 [THR] B5:3975 [U] ✔
3:61 [PRO] 0:2462 [G] Bo:62 [THR] B5:4119 [G] ✔
3:48 [ASN] 0:2120 [U] Bo:50 [GLY] B5:3657 [OMU] ✔
3:48 [ASN] 0:2121 [G] Bo:50 [GLY] B5:3658 [C] ✔
3:28 [GLY] 0:2434 [A] Bo:29 [GLY] B5:4090 [U] ✔
3:28 [GLY] 0:2435 [U] Bo:29 [GLY] B5:4091 [C] ✔
3:7 [PHE] 0:2378 [U] Bo:8 [ARG] B5:4036 [U] ✔
3:77 [ALA] 0:2436 [U] Bo:80 [LYS] B5:4092 [U] ✔
3:77 [ALA] 0:2437 [A] Bo:80 [LYS] B5:4093 [G] ✔
3:75 [GLY] 0:2437 [A] Bo:78 [ARG] B5:4093 [G] ✔
3:30 [GLN] 0:2433 [A] Bo:31 [ASP] B5:4089 [U] ✔
3:30 [GLN] 0:2434 [A] Bo:31 [ASP] B5:4090 [U] ✔
3:54 [LYS] 0:219 [G] Bo:54 [PRO] B5:91 [G] ✔
3:54 [LYS] 0:2468 [A] Bo:54 [PRO] B5:4125 [A] ✔
3:62 [THR] 0:2316 [G] Bo:63 [THR] B5:3974 [OMG] ✔
3:62 [THR] 0:2317 [C] Bo:63 [THR] B5:3975 [U] ✔
3:32 [GLY] 0:1924 [A] Bo:33 [LEU] B5:3462 [PSU] ✔
3:39 [GLN] 0:217 [C] Bo:40 [ARG] B5:89 [C] ✔
3:39 [GLN] 0:218 [C] Bo:40 [ARG] B5:90 [G] ✔
3:39 [GLN] 0:219 [G] Bo:40 [ARG] B5:91 [G] ✔
3:39 [GLN] 0:220 [C] Bo:40 [ARG] B5:92 [C] ✔
3:50 [GLY] 0:170 [U] Bo:52 [THR] B5:43 [U] ✔
3:50 [GLY] 0:2468 [A] Bo:52 [THR] B5:4125 [A] ✔
3:1 [MET] 0:2319 [C] Bo:2 [VAL] B5:3977 [C] ✔
3:1 [MET] 0:2320 [U] Bo:2 [VAL] B5:3978 [U] ✔
3:58 [GLY] 0:2460 [A] Bo:59 [LYS] B5:4117 [G] ✔
3:58 [GLY] 0:2461 [U] Bo:59 [LYS] B5:4118 [U] ✔
3:44 [SER] 0:389 [G] Bo:46 [SER] B5:288 [G] ✔
3:44 [SER] 0:390 [G] Bo:46 [SER] B5:289 [C] ✔
3:16 [GLU] 0:2408 [A] Bo:17 [LYS] B5:4064 [C] ✔
3:16 [GLU] 0:2409 [C] Bo:17 [LYS] B5:4065 [C] ✔
3:35 [TRP] 0:395 [A] Bo:36 [GLN] B5:294 [G] ✔
3:35 [TRP] 0:396 [U] Bo:36 [GLN] B5:295 [A] ✔
3:35 [TRP] 0:2451 [G] Bo:36 [GLN] B5:4108 [A] ✔
3:35 [TRP] 0:2452 [G] Bo:36 [GLN] B5:4109 [A] ✔
3:12 [PRO] 0:2382 [A] Bo:13 [LYS] B5:4040 [C] ✔
3:38 [ARG] 0:395 [A] Bo:39 [ARG] B5:294 [G] ✔
3:38 [ARG] 0:396 [U] Bo:39 [ARG] B5:295 [A] ✔
3:38 [ARG] 0:2451 [G] Bo:39 [ARG] B5:4108 [A] ✔
3:38 [ARG] 0:2452 [G] Bo:39 [ARG] B5:4109 [A] ✔
3:85 [ALA] 0:2318 [C] Bo:88 [CYS] B5:3976 [C] ✔
3:76 [LYS] 0:2437 [A] Bo:79 [SER] B5:4093 [G] ✔
3:2 [GLN] 0:2320 [U] Bo:3 [ASN] B5:3978 [U] ✔
3:2 [GLN] 0:2321 [A] Bo:3 [ASN] B5:3979 [A] ✔
3:84 [ARG] 0:2317 [C] Bo:87 [ARG] B5:3975 [U] ✔
3:84 [ARG] 0:2318 [C] Bo:87 [ARG] B5:3976 [C] ✔
3:84 [ARG] 0:2427 [C] Bo:87 [ARG] B5:4083 [C] ✔
3:84 [ARG] 0:2428 [G] Bo:87 [ARG] B5:4084 [G] ✔
3:33 [MET] 0:1923 [G] Bo:34 [TYR] B5:3461 [U] ✔
3:33 [MET] 0:2451 [G] Bo:34 [TYR] B5:4108 [A] ✔
3:3 [MET] 0:2320 [U] Bo:4 [VAL] B5:3978 [U] ✔
3:36 [ILE] 0:2432 [C] Bo:37 [GLY] B5:4088 [C] ✔
3:36 [ILE] 0:2433 [A] Bo:37 [GLY] B5:4089 [U] ✔
3:36 [ILE] 0:2452 [G] Bo:37 [GLY] B5:4109 [A] ✔
3:51 [LYS] 0:219 [G] Bo:53 [MLZ] B5:91 [G] ✔
3:51 [LYS] 0:220 [C] Bo:53 [MLZ] B5:92 [C] ✔
3:51 [LYS] 0:2431 [C] Bo:53 [MLZ] B5:4087 [C] ✔
3:51 [LYS] 0:2432 [C] Bo:53 [MLZ] B5:4088 [C] ✔
3:51 [LYS] 0:2468 [A] Bo:53 [MLZ] B5:4125 [A] ✔
3:17 [HIS] 0:2379 [G] Bo:18 [HIS] B5:4037 [G] ✔
3:17 [HIS] 0:2381 [C] Bo:18 [HIS] B5:4039 [PSU] ✔
3:17 [HIS] 0:2408 [A] Bo:18 [HIS] B5:4064 [C] ✔
3:17 [HIS] 0:2409 [C] Bo:18 [HIS] B5:4065 [C] ✔
3:34 [LYS] 0:2433 [A] Bo:35 [ALA] B5:4089 [U] ✔
3:34 [LYS] 0:2434 [A] Bo:35 [ALA] B5:4090 [U] ✔
3:34 [LYS] 0:2451 [G] Bo:35 [ALA] B5:4108 [A] ✔
3:34 [LYS] 0:2452 [G] Bo:35 [ALA] B5:4109 [A] ✔
3:46 [ILE] 0:389 [G] Bo:48 [TYR] B5:288 [G] ✔
3:46 [ILE] 0:390 [G] Bo:48 [TYR] B5:289 [C] ✔
3:46 [ILE] 0:2121 [G] Bo:48 [TYR] B5:3658 [C] ✔
3:46 [ILE] 0:2122 [C] Bo:48 [TYR] B5:3659 [U] ✔
3:86 [GLY] 0:2317 [C] Bo:89 [LYS] B5:3975 [U] ✔
3:86 [GLY] 0:2318 [C] Bo:89 [LYS] B5:3976 [C] ✔
3:10 [TYR] 0:2379 [G] Bo:11 [PHE] B5:4037 [G] ✔
3:10 [TYR] 0:2381 [C] Bo:11 [PHE] B5:4039 [PSU] ✔
3:10 [TYR] 0:2382 [A] Bo:11 [PHE] B5:4040 [C] ✔
3:10 [TYR] 0:2407 [G] Bo:11 [PHE] B5:4063 [A] ✔
3:10 [TYR] 0:2408 [A] Bo:11 [PHE] B5:4064 [C] ✔
3:9 [THR] 0:2379 [G] Bo:10 [THR] B5:4037 [G] ✔
3:9 [THR] 0:2381 [C] Bo:10 [THR] B5:4039 [PSU] ✔
3:42 [ARG] 0:395 [A] Bo:43 [ARG] B5:294 [G] ✔
3:82 [GLY] 0:2457 [U] Bo:85 [ILE] B5:4114 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:82 [GLY] 0:2458 [U] Bo:85 [ILE] B5:4115 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:45 [GLY] 0:2122 [C] Bo:47 [GLY] B5:3659 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:15 [ASN] 0:2407 [G] Bo:16 [GLY] B5:4063 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:81 [GLU] 0:2382 [A] Bo:84 [ALA] B5:4040 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:27 [SER] 0:2435 [U] Bo:28 [LYS] B5:4091 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:47 [GLY] 0:2121 [G] Bo:49 [GLY] B5:3658 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:47 [GLY] 0:2122 [C] Bo:49 [GLY] B5:3659 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:79 [LEU] 0:2382 [A] Bo:82 [MET] B5:4040 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:83 [TRP] 0:2380 [A] Bo:86 [LYS] B5:4038 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:31 [THR] 0:1923 [G] Bo:32 [SER] B5:3461 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:31 [THR] 0:1924 [A] Bo:32 [SER] B5:3462 [PSU] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:26 [ARG] 0:2435 [U] Bo:27 [LYS] B5:4091 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:29 [ARG] 0:1924 [A] Bo:30 [LYS] B5:3462 [PSU] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:29 [ARG] 0:2435 [U] Bo:30 [LYS] B5:4091 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:80 [ARG] 0:2379 [G] Bo:83 [LEU] B5:4037 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:80 [ARG] 0:2458 [U] Bo:83 [LEU] B5:4115 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:61 [PRO] 0:2427 [C] Bo:62 [THR] B5:4083 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:48 [ASN] 0:169 [A] Bo:50 [GLY] B5:42 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:48 [ASN] 0:170 [U] Bo:50 [GLY] B5:43 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:48 [ASN] 0:2468 [A] Bo:50 [GLY] B5:4125 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:7 [PHE] 0:2379 [G] Bo:8 [ARG] B5:4037 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:30 [GLN] 0:1923 [G] Bo:31 [ASP] B5:3461 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:30 [GLN] 0:1924 [A] Bo:31 [ASP] B5:3462 [PSU] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:57 [GLY] 0:2460 [A] Bo:57 [ARG] B5:4117 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:62 [THR] 0:2318 [C] Bo:63 [THR] B5:3976 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:62 [THR] 0:2459 [G] Bo:63 [THR] B5:4116 [OMG] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:32 [GLY] 0:1923 [G] Bo:33 [LEU] B5:3461 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:50 [GLY] 0:169 [A] Bo:52 [THR] B5:42 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:1 [MET] 0:2380 [A] Bo:2 [VAL] B5:4038 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:35 [TRP] 0:217 [C] Bo:36 [GLN] B5:89 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:35 [TRP] 0:218 [C] Bo:36 [GLN] B5:90 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:35 [TRP] 0:219 [G] Bo:36 [GLN] B5:91 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:35 [TRP] 0:220 [C] Bo:36 [GLN] B5:92 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:35 [TRP] 0:2432 [C] Bo:36 [GLN] B5:4088 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:76 [LYS] 0:2438 [G] Bo:79 [SER] B5:4094 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:2 [GLN] 0:2319 [C] Bo:3 [ASN] B5:3977 [C] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:13 [HIS] 0:2436 [U] Bo:14 [LYS] B5:4092 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:13 [HIS] 0:2437 [A] Bo:14 [LYS] B5:4093 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:9 [THR] 0:2378 [U] Bo:10 [THR] B5:4036 [U] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:42 [ARG] 0:218 [C] Bo:43 [ARG] B5:90 [G] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:42 [ARG] 0:396 [U] Bo:43 [ARG] B5:295 [A] ❌ 7O7Y_Bo_B5
3:13 [HIS] 0:2438 [G] Bo:14 [LYS] B5:4094 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:17 [HIS] 0:2378 [U] Bo:18 [HIS] B5:4036 [U] ❌ 1YHQ_3_0
3:25 [VAL] 0:2457 [U] Bo:26 [TYR] B5:4114 [G] ❌ 1YHQ_3_0
3:25 [VAL] 0:2458 [U] Bo:26 [TYR] B5:4115 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:27 [SER] 0:2433 [A] Bo:28 [LYS] B5:4089 [U] ❌ 1YHQ_3_0
3:31 [THR] 0:2433 [A] Bo:32 [SER] B5:4089 [U] ❌ 1YHQ_3_0
3:33 [MET] 0:1924 [A] Bo:34 [TYR] B5:3462 [PSU] ❌ 1YHQ_3_0
3:33 [MET] 0:2452 [G] Bo:34 [TYR] B5:4109 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:33 [MET] 0:396 [U] Bo:34 [TYR] B5:295 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:35 [TRP] 0:2433 [A] Bo:36 [GLN] B5:4089 [U] ❌ 1YHQ_3_0
3:39 [GLN] 0:395 [A] Bo:40 [ARG] B5:294 [G] ❌ 1YHQ_3_0
3:39 [GLN] 0:2432 [C] Bo:40 [ARG] B5:4088 [C] ❌ 1YHQ_3_0
3:47 [GLY] 0:169 [A] Bo:49 [GLY] B5:42 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:47 [GLY] 0:170 [U] Bo:49 [GLY] B5:43 [U] ❌ 1YHQ_3_0
3:47 [GLY] 0:2120 [U] Bo:49 [GLY] B5:3657 [OMU] ❌ 1YHQ_3_0
3:49 [ASP] 0:169 [A] Bo:51 [GLN] B5:42 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:49 [ASP] 0:2468 [A] Bo:51 [GLN] B5:4125 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:49 [ASP] 0:2120 [U] Bo:51 [GLN] B5:3657 [OMU] ❌ 1YHQ_3_0
3:50 [GLY] 0:219 [G] Bo:52 [THR] B5:91 [G] ❌ 1YHQ_3_0
3:55 [VAL] 0:2468 [A] Bo:55 [ILE] B5:4125 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:57 [GLY] 0:2468 [A] Bo:57 [ARG] B5:4125 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:57 [GLY] 0:2120 [U] Bo:57 [ARG] B5:3657 [OMU] ❌ 1YHQ_3_0
3:59 [ASP] 0:2462 [G] Bo:60 [ALA] B5:4119 [G] ❌ 1YHQ_3_0
3:62 [THR] 0:2460 [A] Bo:63 [THR] B5:4117 [G] ❌ 1YHQ_3_0
3:64 [LYS] 0:2427 [C] Bo:65 [LYS] B5:4083 [C] ❌ 1YHQ_3_0
3:7 [PHE] 0:2320 [U] Bo:8 [ARG] B5:3978 [U] ❌ 1YHQ_3_0
3:7 [PHE] 0:2380 [A] Bo:8 [ARG] B5:4038 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:78 [HIS] 0:2381 [C] Bo:81 [ARG] B5:4039 [PSU] ❌ 1YHQ_3_0
3:82 [GLY] 0:2380 [A] Bo:85 [ILE] B5:4038 [A] ❌ 1YHQ_3_0
3:83 [TRP] 0:2427 [C] Bo:86 [LYS] B5:4083 [C] ❌ 1YHQ_3_0
3:83 [TRP] 0:2318 [C] Bo:86 [LYS] B5:3976 [C] ❌ 1YHQ_3_0
3:84 [ARG] 0:2459 [G] Bo:87 [ARG] B5:4116 [OMG] ❌ 1YHQ_3_0
3:84 [ARG] 0:2460 [A] Bo:87 [ARG] B5:4117 [G] ❌ 1YHQ_3_0
3:86 [GLY] 0:2316 [G] Bo:89 [LYS] B5:3974 [OMG] ❌ 1YHQ_3_0
3:8 [ASN] 0:2409 [C] Bo:9 [ARG] B5:4065 [C] ❌ 1YHQ_3_0
3:87 [ARG] 0:2319 [C] Bo:90 [HIS] B5:3977 [C] ❌ 1YHQ_3_0
3:15 [ASN] 0:735 [C] Bo:16 [GLY] B5:1428 [U] ❌ 7O7Y_B5:1428 no longer at interface
3:31 [THR] 0:2450 [C] Bo:32 [SER] B5:4107 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:4107 no longer at interface
3:54 [LYS] 0:2467 [A] Bo:54 [PRO] B5:4124 [A] ❌ 7O7Y_B5:4124 no longer at interface
3:84 [ARG] 0:2426 [G] Bo:87 [ARG] B5:4082 [A] ❌ 7O7Y_B5:4082 no longer at interface
3:33 [MET] 0:2450 [C] Bo:34 [TYR] B5:4107 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:4107 no longer at interface
3:10 [TYR] 0:735 [C] Bo:11 [PHE] B5:1428 [U] ❌ 7O7Y_B5:1428 no longer at interface
3:12 [PRO] 0:2383 [G] Bo:13 [LYS] B5:4041 [U] ❌ 1YHQ_0:2383 no longer at interface
3:42 [ARG] 0:397 [A] Bo:43 [ARG] B5:296 [A] ❌ 1YHQ_0:397 no longer at interface
3:42 [ARG] 0:391 [U] Bo:43 [ARG] B5:290 [U] ❌ 1YHQ_0:391 no longer at interface
3:42 [ARG] 0:392 [U] Bo:43 [ARG] B5:291 [U] ❌ 1YHQ_0:392 no longer at interface
3:42 [ARG] 0:398 [U] Bo:43 [ARG] B5:297 [U] ❌ 1YHQ_0:398 no longer at interface
3:46 [ILE] 0:2123 [A] Bo:48 [TYR] B5:3660 [A] ❌ 1YHQ_0:2123 no longer at interface
3:57 [GLY] 0:2469 [A] Bo:57 [ARG] B5:4126 [A] ❌ 1YHQ_0:2469 no longer at interface
3:57 [GLY] 0:2119 [C] Bo:57 [ARG] B5:3656 [C] ❌ 1YHQ_0:2119 no longer at interface
3:83 [TRP] 0:2421 [G] Bo:86 [LYS] B5:4077 [G] ❌ 1YHQ_0:2421 no longer at interface
3:8 [ASN] 0:2410 [G] Bo:9 [ARG] B5:4066 [G] ❌ 1YHQ_0:2410 no longer at interface
3:68 [LYS] 0:2435 [U] Bo:69 [ARG] B5:4091 [C] ❌ 7O7Y_Bo:69 no longer at interface
3:68 [LYS] 0:2436 [U] Bo:69 [ARG] B5:4092 [U] ❌ 7O7Y_Bo:69 no longer at interface
3:41 [GLU] 0:1923 [G] Bo:42 [ASP] B5:3461 [U] ❌ 7O7Y_Bo:42 no longer at interface
3:70 [ARG] 0:2436 [U] Bo:71 [GLU] B5:4092 [U] ❌ 7O7Y_Bo:71 no longer at interface
3:70 [ARG] 0:2437 [A] Bo:71 [GLU] B5:4093 [G] ❌ 7O7Y_Bo:71 no longer at interface
3:91 [GLN] 0:2320 [U] Bo:94 [GLY] B5:3978 [U] ❌ 7O7Y_Bo:94 no longer at interface
3:91 [GLN] 0:2321 [A] Bo:94 [GLY] B5:3979 [A] ❌ 7O7Y_Bo:94 no longer at interface
3:65 [THR] 0:2457 [U] Bo:66 [ILE] B5:4114 [G] ❌ 7O7Y_Bo:66 no longer at interface
3:65 [THR] 0:2458 [U] Bo:66 [ILE] B5:4115 [A] ❌ 7O7Y_Bo:66 no longer at interface
3:37 [ASP] 0:2432 [C] Bo:38 [LYS] B5:4088 [C] ❌ 1YHQ_3:37 no longer at interface
3:37 [ASP] 0:2433 [A] Bo:38 [LYS] B5:4089 [U] ❌ 1YHQ_3:37 no longer at interface
3:56 [PRO] 0:2468 [A] Bo:56 [PHE] B5:4125 [A] ❌ 1YHQ_3:56 no longer at interface
3:56 [PRO] 0:2461 [U] Bo:56 [PHE] B5:4118 [U] ❌ 1YHQ_3:56 no longer at interface
3:56 [PRO] 0:2460 [A] Bo:56 [PHE] B5:4117 [G] ❌ 1YHQ_3:56 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Rubredoxin-related 0.94 2.39 0.21 0.8 0.94 0.9 0.91 0.67 0.54 0.27 0.28


Other pairs involving 1YHQ_3_0 or 7O7Y_Bo_B5

Total number of entries: 7

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_3_0 1YHQ_3_0 0.99 1.0 0.24 1.0 Rubredoxin-related Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_3_0 6AZ3_p_1 0.71 0.77 2.21 0.43 Rubredoxin-related compare
1YHQ_3_0 6AZ3_p_2 0.68 0.82 2.38 0.21 Rubredoxin-related compare
6AZ3_p_2 7O7Y_Bo_B5 0.92 0.91 1.03 0.58 Rubredoxin-related Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_3_0 7O7Y_Bo_B5 0.67 0.94 2.37 0.21 Rubredoxin-related compare
1YHQ_3_0 7O7Y_Bo_B5 0.67 0.94 2.39 0.21 Rubredoxin-related compare
6AZ3_p_1 7O7Y_Bo_B5 0.86 0.92 0.53 0.79 Rubredoxin-related Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare