RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group71 > 1YHQ_O_0 vs 6AZ3_P_1

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1YHQ_O
1YHQ_0
6AZ3_P
6AZ3_1
Conserved?
O:3 [THR] 0:655 [U] P:22 [THR] 1:704 [G]
O:3 [THR] 0:656 [G] P:22 [THR] 1:705 [C]
O:19 [ARG] 0:1276 [U] P:38 [LYS] 1:1419 [C]
O:19 [ARG] 0:1277 [C] P:38 [LYS] 1:1441 [A]
O:19 [ARG] 0:1278 [A] P:38 [LYS] 1:1442 [G]
O:50 [ARG] 0:700 [A] P:69 [VAL] 1:770 [G]
O:50 [ARG] 0:701 [U] P:69 [VAL] 1:771 [U]
O:114 [ILE] 0:721 [A] P:146 [LEU] 1:804 [C]
O:44 [ASN] 0:745 [G] P:63 [SER] 1:836 [G]
O:110 [HIS] 0:710 [G] P:142 [ASN] 1:780 [C]
O:110 [HIS] 0:711 [G] P:142 [ASN] 1:781 [A]
O:42 [GLU] 0:659 [A] P:61 [PRO] 1:708 [A]
O:12 [ALA] 0:1277 [C] P:31 [LYS] 1:1441 [A]
O:28 [ASP] 0:708 [A] P:47 [VAL] 1:778 [C]
O:28 [ASP] 0:709 [G] P:47 [VAL] 1:779 [A]
O:108 [GLY] 0:710 [G] P:140 [GLY] 1:780 [C]
O:35 [LYS] 0:655 [U] P:54 [LYS] 1:704 [G]
O:35 [LYS] 0:936 [C] P:54 [LYS] 1:1026 [C]
O:51 [TYR] 0:701 [U] P:70 [VAL] 1:771 [U]
O:51 [TYR] 0:721 [A] P:70 [VAL] 1:804 [C]
O:63 [LYS] 0:659 [A] P:92 [ASP] 1:708 [A]
O:81 [PHE] 0:659 [A] P:112 [PHE] 1:708 [A]
O:25 [VAL] 0:709 [G] P:44 [PHE] 1:779 [A]
O:25 [VAL] 0:710 [G] P:44 [PHE] 1:780 [C]
O:115 [ARG] 0:721 [A] P:148 [GLY] 1:804 [C]
O:115 [ARG] 0:722 [G] P:148 [GLY] 1:805 [A]
O:46 [GLY] 0:745 [G] P:65 [SER] 1:836 [G]
O:2 [LYS] 0:655 [U] P:21 [SER] 1:704 [G]
O:2 [LYS] 0:656 [G] P:21 [SER] 1:705 [C]
O:24 [ALA] 0:709 [G] P:43 [GLY] 1:779 [A]
O:24 [ALA] 0:710 [G] P:43 [GLY] 1:780 [C]
O:66 [GLY] 0:660 [A] P:95 [ASP] 1:709 [A]
O:66 [GLY] 0:746 [A] P:95 [ASP] 1:837 [A]
O:15 [LYS] 0:1277 [C] P:34 [LYS] 1:1441 [A]
O:15 [LYS] 0:1278 [A] P:34 [LYS] 1:1442 [G]
O:15 [LYS] 0:1279 [U] P:34 [LYS] 1:1443 [U]
O:109 [SER] 0:710 [G] P:141 [LYS] 1:780 [C]
O:109 [SER] 0:711 [G] P:141 [LYS] 1:781 [A]
O:80 [ASP] 0:658 [C] P:111 [ARG] 1:707 [C]
O:68 [GLY] 0:745 [G] P:97 [VAL] 1:836 [G]
O:37 [ARG] 0:655 [U] P:56 [ARG] 1:704 [G]
O:37 [ARG] 0:656 [G] P:56 [ARG] 1:705 [C]
O:37 [ARG] 0:657 [G] P:56 [ARG] 1:706 [G]
O:37 [ARG] 0:658 [C] P:56 [ARG] 1:707 [C]
O:36 [PRO] 0:654 [A] P:55 [SER] 1:703 [C]
O:36 [PRO] 0:655 [U] P:55 [SER] 1:704 [G]
O:83 [GLY] 0:659 [A] P:114 [LYS] 1:708 [A]
O:4 [ASN] 0:655 [U] P:23 [ASN] 1:704 [G]
O:4 [ASN] 0:656 [G] P:23 [ASN] 1:705 [C]
O:4 [ASN] 0:657 [G] P:23 [ASN] 1:706 [G]
O:39 [THR] 0:935 [G] P:58 [ASN] 1:1025 [G]
O:39 [THR] 0:936 [C] P:58 [ASN] 1:1026 [C]
O:67 [SER] 0:745 [G] P:96 [ASP] 1:836 [G]
O:23 [GLY] 0:710 [G] P:42 [SER] 1:780 [C]
O:113 [VAL] 0:708 [A] P:145 [LEU] 1:778 [C]
O:113 [VAL] 0:709 [G] P:145 [LEU] 1:779 [A]
O:113 [VAL] 0:721 [A] P:145 [LEU] 1:804 [C]
O:38 [ARG] 0:653 [U] P:57 [SER] 1:702 [A]
O:38 [ARG] 0:654 [A] P:57 [SER] 1:703 [C]
O:38 [ARG] 0:655 [U] P:57 [SER] 1:704 [G]
O:85 [ALA] 0:660 [A] P:116 [ALA] 1:709 [A]
O:69 [VAL] 0:700 [A] P:99 [MET] 1:770 [G]
O:7 [LEU] 0:656 [G] P:26 [ILE] 1:705 [C]
O:16 [SER] 0:1277 [C] P:35 [PHE] 1:1441 [A]
O:112 [ARG] 0:709 [G] P:144 [TYR] 1:779 [A]
O:112 [ARG] 0:719 [C] P:144 [TYR] 1:802 [C]
O:112 [ARG] 0:720 [G] P:144 [TYR] 1:803 [C]
O:111 [VAL] 0:709 [G] P:143 [THR] 1:779 [A]
O:111 [VAL] 0:710 [G] P:143 [THR] 1:780 [C]
O:47 [ARG] 0:721 [A] P:66 [ARG] 1:804 [C]
O:47 [ARG] 0:722 [G] P:66 [ARG] 1:805 [A]
O:47 [ARG] 0:745 [G] P:66 [ARG] 1:836 [G]
O:84 [THR] 0:659 [A] P:115 [SER] 1:708 [A]
O:84 [THR] 0:660 [A] P:115 [SER] 1:709 [A]
O:82 [SER] 0:659 [A] P:113 [SER] 1:708 [A]
O:82 [SER] 0:660 [A] P:113 [SER] 1:709 [A]
O:65 [LEU] 0:659 [A] P:94 [LEU] 1:708 [A]
O:65 [LEU] 0:660 [A] P:94 [LEU] 1:709 [A]
O:65 [LEU] 0:746 [A] P:94 [LEU] 1:837 [A]
O:1 [SER] 0:654 [A] P:20 [TYR] 1:703 [C]
O:1 [SER] 0:655 [U] P:20 [TYR] 1:704 [G]
O:50 [ARG] 0:744 [G] P:69 [VAL] 1:834 [U] ❌ 6AZ3_P_1
O:50 [ARG] 0:745 [G] P:69 [VAL] 1:836 [G] ❌ 6AZ3_P_1
O:32 [ARG] 0:936 [C] P:51 [ARG] 1:1026 [C] ❌ 6AZ3_P_1
O:44 [ASN] 0:660 [A] P:63 [SER] 1:709 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:44 [ASN] 0:746 [A] P:63 [SER] 1:837 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:110 [HIS] 0:712 [C] P:142 [ASN] 1:782 [C] ❌ 6AZ3_P_1
O:42 [GLU] 0:746 [A] P:61 [PRO] 1:837 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:42 [GLU] 0:747 [G] P:61 [PRO] 1:838 [G] ❌ 6AZ3_P_1
O:108 [GLY] 0:711 [G] P:140 [GLY] 1:781 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:35 [LYS] 0:935 [G] P:54 [LYS] 1:1025 [G] ❌ 6AZ3_P_1
O:51 [TYR] 0:722 [G] P:70 [VAL] 1:805 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:63 [LYS] 0:658 [C] P:92 [ASP] 1:707 [C] ❌ 6AZ3_P_1
O:46 [GLY] 0:700 [A] P:65 [SER] 1:770 [G] ❌ 6AZ3_P_1
O:36 [PRO] 0:935 [G] P:55 [SER] 1:1025 [G] ❌ 6AZ3_P_1
O:67 [SER] 0:660 [A] P:96 [ASP] 1:709 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:67 [SER] 0:746 [A] P:96 [ASP] 1:837 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:38 [ARG] 0:934 [C] P:57 [SER] 1:1024 [U] ❌ 6AZ3_P_1
O:38 [ARG] 0:935 [G] P:57 [SER] 1:1025 [G] ❌ 6AZ3_P_1
O:69 [VAL] 0:745 [G] P:99 [MET] 1:836 [G] ❌ 6AZ3_P_1
O:47 [ARG] 0:746 [A] P:66 [ARG] 1:837 [A] ❌ 6AZ3_P_1
O:80 [ASP] 0:659 [A] P:111 [ARG] 1:708 [A] ❌ 1YHQ_O_0
O:83 [GLY] 0:658 [C] P:114 [LYS] 1:707 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:112 [ARG] 0:721 [A] P:144 [TYR] 1:804 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:112 [ARG] 0:708 [A] P:144 [TYR] 1:778 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:114 [ILE] 0:708 [A] P:146 [LEU] 1:778 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:1 [SER] 0:934 [C] P:20 [TYR] 1:1024 [U] ❌ 1YHQ_O_0
O:1 [SER] 0:935 [G] P:20 [TYR] 1:1025 [G] ❌ 1YHQ_O_0
O:12 [ALA] 0:1278 [A] P:31 [LYS] 1:1442 [G] ❌ 1YHQ_O_0
O:32 [ARG] 0:708 [A] P:51 [ARG] 1:778 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:32 [ARG] 0:721 [A] P:51 [ARG] 1:804 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:37 [ARG] 0:747 [G] P:56 [ARG] 1:838 [G] ❌ 1YHQ_O_0
O:37 [ARG] 0:659 [A] P:56 [ARG] 1:708 [A] ❌ 1YHQ_O_0
O:39 [THR] 0:654 [A] P:58 [ASN] 1:703 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:47 [ARG] 0:701 [U] P:66 [ARG] 1:771 [U] ❌ 1YHQ_O_0
O:51 [TYR] 0:719 [C] P:70 [VAL] 1:802 [C] ❌ 1YHQ_O_0
O:65 [LEU] 0:745 [G] P:94 [LEU] 1:836 [G] ❌ 1YHQ_O_0
O:66 [GLY] 0:745 [G] P:95 [ASP] 1:836 [G] ❌ 1YHQ_O_0
O:68 [GLY] 0:660 [A] P:97 [VAL] 1:709 [A] ❌ 1YHQ_O_0
O:83 [GLY] 0:662 [U] P:114 [LYS] 1:711 [G] ❌ 1YHQ_0:662 no longer at interface
O:32 [ARG] 0:938 [G] P:51 [ARG] 1:1028 [A] ❌ 1YHQ_0:938 no longer at interface
O:35 [LYS] 0:937 [C] P:54 [LYS] 1:1027 [U] ❌ 1YHQ_0:937 no longer at interface
O:37 [ARG] 0:748 [C] P:56 [ARG] 1:839 [U] ❌ 1YHQ_0:748 no longer at interface
O:37 [ARG] 0:749 [C] P:56 [ARG] 1:840 [G] ❌ 1YHQ_0:749 no longer at interface
O:68 [GLY] 0:661 [G] P:97 [VAL] 1:710 [G] ❌ 1YHQ_0:661 no longer at interface
O:53 [GLN] 0:719 [C] P:75 [ALA] 1:802 [C] ❌ 6AZ3_P:75 no longer at interface
O:34 [GLU] 0:655 [U] P:53 [ILE] 1:704 [G] ❌ 6AZ3_P:53 no longer at interface
O:56 [GLU] 0:710 [G] P:85 [PRO] 1:780 [C] ❌ 6AZ3_P:85 no longer at interface
O:45 [LEU] 0:745 [G] P:64 [LEU] 1:836 [G] ❌ 6AZ3_P:64 no longer at interface
O:22 [GLY] 0:710 [G] P:41 [SER] 1:780 [C] ❌ 6AZ3_P:41 no longer at interface
O:70 [LEU] 0:700 [A] P:101 [ARG] 1:770 [G] ❌ 1YHQ_O:70 no longer at interface
O:71 [GLN] 0:700 [A] P:102 [ILE] 1:770 [G] ❌ 1YHQ_O:71 no longer at interface
O:72 [LYS] 0:700 [A] P:103 [PRO] 1:770 [G] ❌ 1YHQ_O:72 no longer at interface
O:107 [GLU] 0:710 [G] P:139 [THR] 1:780 [C] ❌ 1YHQ_O:107 no longer at interface
O:11 [ILE] 0:1278 [A] P:30 [ILE] 1:1442 [G] ❌ 1YHQ_O:11 no longer at interface
O:20 [SER] 0:1277 [C] P:39 [ARG] 1:1441 [A] ❌ 1YHQ_O:20 no longer at interface
O:40 [HIS] 0:656 [G] P:59 [ARG] 1:705 [C] ❌ 1YHQ_O:40 no longer at interface
O:43 [VAL] 0:721 [A] P:62 [ILE] 1:804 [C] ❌ 1YHQ_O:43 no longer at interface
O:49 [GLU] 0:700 [A] P:68 [ALA] 1:770 [G] ❌ 1YHQ_O:49 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e 0.74 1.97 0.24 0.89 0.76 0.9 1.0 0.76 0.63 0.28 0.34


Other pairs involving 1YHQ_O_0 or 6AZ3_P_1

Total number of entries: 5