RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group80 > 4Y4O_18_1A vs 7OF0_3_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_18
4Y4O_1A
7OF0_3
7OF0_A
Conserved?
18:9 [GLY] 1A:236 [G] 3:109 [ALA] A:1747 [G]
18:9 [GLY] 1A:239 [G] 3:109 [ALA] A:1750 [G]
18:40 [GLU] 1A:2374 [G] 3:140 [ARG] A:2870 [G]
18:40 [GLU] 1A:2375 [C] 3:140 [ARG] A:2871 [U]
18:54 [GLU] 1A:2371 [C] 3:154 [GLN] A:2867 [C]
18:36 [LYS] 1A:2404 [A] 3:136 [LYS] A:2897 [A]
18:3 [LYS] 1A:229 [G] 3:103 [LYS] A:1740 [A]
18:3 [LYS] 1A:230 [A] 3:103 [LYS] A:1741 [A]
18:3 [LYS] 1A:231 [G] 3:103 [LYS] A:1742 [G]
18:44 [LYS] 1A:2373 [A] 3:144 [LEU] A:2869 [A]
18:44 [LYS] 1A:2374 [G] 3:144 [LEU] A:2870 [G]
18:26 [LYS] 1A:2373 [A] 3:126 [LYS] A:2869 [A]
18:26 [LYS] 1A:2405 [A] 3:126 [LYS] A:2898 [U]
18:25 [MET] 1A:2373 [A] 3:125 [ARG] A:2869 [A]
18:8 [LYS] 1A:232 [U] 3:108 [LYS] A:1743 [U]
18:8 [LYS] 1A:233 [A] 3:108 [LYS] A:1744 [A]
18:8 [LYS] 1A:234 [G] 3:108 [LYS] A:1745 [U]
18:8 [LYS] 1A:235 [C] 3:108 [LYS] A:1746 [A]
18:8 [LYS] 1A:236 [G] 3:108 [LYS] A:1747 [G]
18:8 [LYS] 1A:241 [G] 3:108 [LYS] A:1752 [U]
18:8 [LYS] 1A:242 [C] 3:108 [LYS] A:1753 [A]
18:8 [LYS] 1A:243 [G] 3:108 [LYS] A:1754 [G]
18:56 [GLU] 1A:984 [G] 3:156 [LYS] A:2091 [A]
18:13 [ARG] 1A:238 [C] 3:113 [ARG] A:1749 [C]
18:13 [ARG] 1A:239 [G] 3:113 [ARG] A:1750 [G]
18:13 [ARG] 1A:2405 [A] 3:113 [ARG] A:2898 [U]
18:13 [ARG] 1A:2406 [C] 3:113 [ARG] A:2899 [C]
18:6 [THR] 1A:231 [G] 3:106 [THR] A:1742 [G]
18:6 [THR] 1A:232 [U] 3:106 [THR] A:1743 [U]
18:6 [THR] 1A:243 [G] 3:106 [THR] A:1754 [G]
18:28 [GLY] 1A:2404 [A] 3:128 [GLY] A:2897 [A]
18:28 [GLY] 1A:2405 [A] 3:128 [GLY] A:2898 [U]
18:34 [TRP] 1A:2431 [U] 3:134 [TRP] A:2908 [U]
18:34 [TRP] 1A:2432 [C] 3:134 [TRP] A:2909 [G]
18:32 [LEU] 1A:2403 [G] 3:132 [LYS] A:2896 [G]
18:32 [LEU] 1A:2404 [A] 3:132 [LYS] A:2897 [A]
18:32 [LEU] 1A:2432 [C] 3:132 [LYS] A:2909 [G]
18:51 [ALA] 1A:2371 [C] 3:151 [ASN] A:2867 [C]
18:51 [ALA] 1A:2372 [A] 3:151 [ASN] A:2868 [C]
18:53 [PRO] 1A:881 [C] 3:153 [THR] A:2043 [C]
18:53 [PRO] 1A:882 [A] 3:153 [THR] A:2044 [A]
18:35 [GLN] 1A:2402 [U] 3:135 [LYS] A:2895 [U]
18:4 [MET] 1A:231 [G] 3:104 [ARG] A:1742 [G]
18:4 [MET] 1A:615 [G] 3:104 [ARG] A:1871 [A]
18:4 [MET] 1A:616 [G] 3:104 [ARG] A:1872 [U]
18:39 [LYS] 1A:2376 [C] 3:139 [ALA] A:2872 [C]
18:30 [ARG] 1A:2431 [U] 3:130 [LYS] A:2908 [U]
18:12 [LYS] 1A:236 [G] 3:112 [ASP] A:1747 [G]
18:12 [LYS] 1A:238 [C] 3:112 [ASP] A:1749 [C]
18:60 [LEU] 1A:616 [G] 3:160 [LYS] A:1872 [U]
18:5 [LYS] 1A:231 [G] 3:105 [LYS] A:1742 [G]
18:5 [LYS] 1A:241 [G] 3:105 [LYS] A:1752 [U]
18:5 [LYS] 1A:242 [C] 3:105 [LYS] A:1753 [A]
18:5 [LYS] 1A:243 [G] 3:105 [LYS] A:1754 [G]
18:27 [THR] 1A:2372 [A] 3:127 [ALA] A:2868 [C]
18:27 [THR] 1A:2373 [A] 3:127 [ALA] A:2869 [A]
18:27 [THR] 1A:2404 [A] 3:127 [ALA] A:2897 [A]
18:27 [THR] 1A:2405 [A] 3:127 [ALA] A:2898 [U]
18:33 [ASN] 1A:2431 [U] 3:133 [LEU] A:2908 [U]
18:46 [ARG] 1A:2363 [G] 3:146 [GLU] A:2858 [A]
18:31 [HIS] 1A:2404 [A] 3:131 [LYS] A:2897 [A]
18:31 [HIS] 1A:2432 [C] 3:131 [LYS] A:2909 [G]
18:52 [LYS] 1A:983 [G] 3:152 [LYS] A:2090 [A]
18:38 [GLY] 1A:2359 [C] 3:138 [PRO] A:2855 [G]
18:38 [GLY] 1A:2361 [G] 3:138 [PRO] A:2856 [C]
18:64 [TYR] 1A:231 [G] 3:165 [PHE] A:1742 [G]
18:64 [TYR] 1A:232 [U] 3:165 [PHE] A:1743 [U]
18:29 [LYS] 1A:2405 [A] 3:129 [TYR] A:2898 [U]
18:7 [HIS] 1A:240 [A] 3:107 [VAL] A:1751 [A]
18:42 [ARG] 1A:2362 [C] 3:142 [LYS] A:2857 [U]
18:42 [ARG] 1A:2363 [G] 3:142 [LYS] A:2858 [A]
18:54 [GLU] 1A:881 [C] 3:154 [GLN] A:2043 [C] ❌ 7OF0_3_A
18:36 [LYS] 1A:2403 [G] 3:136 [LYS] A:2896 [G] ❌ 7OF0_3_A
18:3 [LYS] 1A:615 [G] 3:103 [LYS] A:1871 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:8 [LYS] 1A:231 [G] 3:108 [LYS] A:1742 [G] ❌ 7OF0_3_A
18:56 [GLU] 1A:983 [G] 3:156 [LYS] A:2090 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:63 [PRO] 1A:616 [G] 3:163 [THR] A:1872 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:63 [PRO] 1A:617 [U] 3:163 [THR] A:1873 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:34 [TRP] 1A:2402 [U] 3:134 [TRP] A:2895 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:35 [GLN] 1A:2403 [G] 3:135 [LYS] A:2896 [G] ❌ 7OF0_3_A
18:39 [LYS] 1A:2363 [G] 3:139 [ALA] A:2858 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:30 [ARG] 1A:2405 [A] 3:130 [LYS] A:2898 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:30 [ARG] 1A:2406 [C] 3:130 [LYS] A:2899 [C] ❌ 7OF0_3_A
18:30 [ARG] 1A:2432 [C] 3:130 [LYS] A:2909 [G] ❌ 7OF0_3_A
18:12 [LYS] 1A:235 [C] 3:112 [ASP] A:1746 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:60 [LEU] 1A:617 [U] 3:160 [LYS] A:1873 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:65 [GLU] 1A:650 [G] 3:166 [TRP] A:1891 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:33 [ASN] 1A:2432 [C] 3:133 [LEU] A:2909 [G] ❌ 7OF0_3_A
18:46 [ARG] 1A:2362 [C] 3:146 [GLU] A:2857 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:31 [HIS] 1A:2403 [G] 3:131 [LYS] A:2896 [G] ❌ 7OF0_3_A
18:43 [GLN] 1A:2363 [G] 3:143 [ARG] A:2858 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:52 [LYS] 1A:982 [U] 3:152 [LYS] A:2089 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:64 [TYR] 1A:615 [G] 3:165 [PHE] A:1871 [A] ❌ 7OF0_3_A
18:64 [TYR] 1A:616 [G] 3:165 [PHE] A:1872 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:29 [LYS] 1A:2430 [A] 3:129 [TYR] A:2907 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:7 [HIS] 1A:239 [G] 3:107 [VAL] A:1750 [G] ❌ 7OF0_3_A
18:42 [ARG] 1A:2361 [G] 3:142 [LYS] A:2856 [C] ❌ 7OF0_3_A
18:41 [ILE] 1A:2430 [A] 3:141 [LYS] A:2907 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:41 [ILE] 1A:2431 [U] 3:141 [LYS] A:2908 [U] ❌ 7OF0_3_A
18:6 [THR] 1A:241 [G] 3:106 [THR] A:1752 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:7 [HIS] 1A:241 [G] 3:107 [VAL] A:1752 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:9 [GLY] 1A:240 [A] 3:109 [ALA] A:1751 [A] ❌ 4Y4O_18_1A
18:18 [ALA] 1A:650 [G] 3:118 [HIS] A:1891 [A] ❌ 4Y4O_18_1A
18:26 [LYS] 1A:2374 [G] 3:126 [LYS] A:2870 [G] ❌ 4Y4O_18_1A
18:30 [ARG] 1A:2430 [A] 3:130 [LYS] A:2907 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:31 [HIS] 1A:2405 [A] 3:131 [LYS] A:2898 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:31 [HIS] 1A:2431 [U] 3:131 [LYS] A:2908 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:32 [LEU] 1A:2431 [U] 3:132 [LYS] A:2908 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:33 [ASN] 1A:2430 [A] 3:133 [LEU] A:2907 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:36 [LYS] 1A:2374 [G] 3:136 [LYS] A:2870 [G] ❌ 4Y4O_18_1A
18:37 [SER] 1A:2375 [C] 3:137 [THR] A:2871 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:40 [GLU] 1A:2402 [U] 3:140 [ARG] A:2895 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:40 [GLU] 1A:2403 [G] 3:140 [ARG] A:2896 [G] ❌ 4Y4O_18_1A
18:40 [GLU] 1A:2373 [A] 3:140 [ARG] A:2869 [A] ❌ 4Y4O_18_1A
18:41 [ILE] 1A:2361 [G] 3:141 [LYS] A:2856 [C] ❌ 4Y4O_18_1A
18:43 [GLN] 1A:2375 [C] 3:143 [ARG] A:2871 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:43 [GLN] 1A:2376 [C] 3:143 [ARG] A:2872 [C] ❌ 4Y4O_18_1A
18:52 [LYS] 1A:984 [G] 3:152 [LYS] A:2091 [A] ❌ 4Y4O_18_1A
18:54 [GLU] 1A:2372 [A] 3:154 [GLN] A:2868 [C] ❌ 4Y4O_18_1A
18:56 [GLU] 1A:616 [G] 3:156 [LYS] A:1872 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:56 [GLU] 1A:617 [U] 3:156 [LYS] A:1873 [A] ❌ 4Y4O_18_1A
18:63 [PRO] 1A:232 [U] 3:163 [THR] A:1743 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:63 [PRO] 1A:231 [G] 3:163 [THR] A:1742 [G] ❌ 4Y4O_18_1A
18:64 [TYR] 1A:230 [A] 3:165 [PHE] A:1741 [A] ❌ 4Y4O_18_1A
18:65 [GLU] 1A:232 [U] 3:166 [TRP] A:1743 [U] ❌ 4Y4O_18_1A
18:65 [GLU] 1A:233 [A] 3:166 [TRP] A:1744 [A] ❌ 4Y4O_18_1A
18:54 [GLU] 1A:880 [U] 3:154 [GLN] A:2042 [U] ❌ 7OF0_A:2042 no longer at interface
18:54 [GLU] 1A:2370 [G] 3:154 [GLN] A:2866 [A] ❌ 7OF0_A:2866 no longer at interface
18:25 [MET] 1A:2429 [C] 3:125 [ARG] A:2906 [C] ❌ 7OF0_A:2906 no longer at interface
18:57 [ARG] 1A:880 [U] 3:157 [LEU] A:2042 [U] ❌ 7OF0_3:157, 7OF0_A:2042 no longer at interface
18:32 [LEU] 1A:2433 [G] 3:132 [LYS] A:2910 [A] ❌ 7OF0_A:2910 no longer at interface
18:32 [LEU] 1A:2434 [A] 3:132 [LYS] A:2911 [C] ❌ 7OF0_A:2911 no longer at interface
18:35 [GLN] 1A:2401 [G] 3:135 [LYS] A:2894 [U] ❌ 7OF0_A:2894 no longer at interface
18:39 [LYS] 1A:2377 [G] 3:139 [ALA] A:2873 [A] ❌ 7OF0_A:2873 no longer at interface
18:31 [HIS] 1A:2433 [G] 3:131 [LYS] A:2910 [A] ❌ 7OF0_A:2910 no longer at interface
18:31 [HIS] 1A:2434 [A] 3:131 [LYS] A:2911 [C] ❌ 7OF0_A:2911 no longer at interface
18:43 [GLN] 1A:2377 [G] 3:143 [ARG] A:2873 [A] ❌ 7OF0_A:2873 no longer at interface
18:38 [GLY] 1A:2395 [G] 3:138 [PRO] A:2889 [C] ❌ 7OF0_A:2889 no longer at interface
18:29 [LYS] 1A:2429 [C] 3:129 [TYR] A:2906 [C] ❌ 7OF0_A:2906 no longer at interface
18:37 [SER] 1A:2395 [G] 3:137 [THR] A:2889 [C] ❌ 7OF0_A:2889 no longer at interface
18:3 [LYS] 1A:228 [U] 3:103 [LYS] A:1739 [A] ❌ 4Y4O_1A:228 no longer at interface
18:18 [ALA] 1A:651 [U] 3:118 [HIS] A:1892 [A] ❌ 4Y4O_1A:651 no longer at interface
18:18 [ALA] 1A:649 [C] 3:118 [HIS] A:1890 [C] ❌ 4Y4O_1A:649 no longer at interface
18:31 [HIS] 1A:2407 [C] 3:131 [LYS] A:2900 [C] ❌ 4Y4O_1A:2407 no longer at interface
18:35 [GLN] 1A:2294 [G] 3:135 [LYS] A:2846 [G] ❌ 4Y4O_1A:2294 no longer at interface
18:35 [GLN] 1A:2295 [C] 3:135 [LYS] A:2847 [C] ❌ 4Y4O_1A:2295 no longer at interface
18:38 [GLY] 1A:2358 [A] 3:138 [PRO] A:2854 [U] ❌ 4Y4O_1A:2358 no longer at interface
18:56 [GLU] 1A:985 [G] 3:156 [LYS] A:2092 [C] ❌ 4Y4O_1A:985 no longer at interface
18:60 [LEU] 1A:985 [G] 3:160 [LYS] A:2092 [C] ❌ 4Y4O_1A:985 no longer at interface
18:60 [LEU] 1A:986 [A] 3:160 [LYS] A:2093 [U] ❌ 4Y4O_1A:986 no longer at interface
18:64 [TYR] 1A:649 [C] 3:165 [PHE] A:1890 [C] ❌ 4Y4O_1A:649 no longer at interface
18:11 [LYS] 1A:232 [U] 3:111 [ILE] A:1743 [U] ❌ 7OF0_3:111 no longer at interface
18:11 [LYS] 1A:233 [A] 3:111 [ILE] A:1744 [A] ❌ 7OF0_3:111 no longer at interface
18:50 [LEU] 1A:2371 [C] 3:150 [CYS] A:2867 [C] ❌ 7OF0_3:150 no longer at interface
18:50 [LEU] 1A:2372 [A] 3:150 [CYS] A:2868 [C] ❌ 7OF0_3:150 no longer at interface
18:57 [ARG] 1A:881 [C] 3:157 [LEU] A:2043 [C] ❌ 7OF0_3:157 no longer at interface
18:2 [PRO] 1A:615 [G] 3:102 [GLY] A:1871 [A] ❌ 7OF0_3:102 no longer at interface
18:48 [PHE] 1A:2372 [A] 3:148 [VAL] A:2868 [C] ❌ 7OF0_3:148 no longer at interface
18:48 [PHE] 1A:2373 [A] 3:148 [VAL] A:2869 [A] ❌ 7OF0_3:148 no longer at interface
18:49 [VAL] 1A:2372 [A] 3:149 [PHE] A:2868 [C] ❌ 7OF0_3:149 no longer at interface
18:24 [ALA] 1A:2373 [A] 3:124 [ARG] A:2869 [A] ❌ 4Y4O_18:24 no longer at interface
18:24 [ALA] 1A:2372 [A] 3:124 [ARG] A:2868 [C] ❌ 4Y4O_18:24 no longer at interface
18:45 [GLY] 1A:2362 [C] 3:145 [ARG] A:2857 [U] ❌ 4Y4O_18:45 no longer at interface
18:45 [GLY] 1A:2361 [G] 3:145 [ARG] A:2856 [C] ❌ 4Y4O_18:45 no longer at interface
18:59 [LYS] 1A:616 [G] 3:159 [ASP] A:1872 [U] ❌ 4Y4O_18:59 no longer at interface
18:62 [LEU] 1A:616 [G] 3:162 [THR] A:1872 [U] ❌ 4Y4O_18:62 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein L35p Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.95 1.85 0.19 0.86 0.97 0.75 0.71 0.52 0.34 0.25 0.42


Other pairs involving 4Y4O_18_1A or 7OF0_3_A

Total number of entries: 7