RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group82 > 4Y4O_1U_1A vs 6S0Z_O_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1U
4Y4O_1A
6S0Z_O
6S0Z_A
Conserved?
1U:28 [ARG] 1A:557 [A] O:28 [LYS] A:577 [A] ✔
1U:28 [ARG] 1A:558 [G] O:28 [LYS] A:578 [G] ✔
1U:28 [ARG] 1A:2041 [A] O:28 [LYS] A:2046 [U] ✔
1U:50 [ARG] 1A:1039 [G] O:50 [ARG] A:1037 [A] ✔
1U:50 [ARG] 1A:1040 [C] O:50 [ARG] A:1038 [C] ✔
1U:50 [ARG] 1A:1041 [C] O:50 [ARG] A:1039 [C] ✔
1U:7 [GLY] 1A:29 [U] O:7 [GLY] A:29 [U] ✔
1U:7 [GLY] 1A:30 [G] O:7 [GLY] A:30 [G] ✔
1U:37 [GLU] 1A:586 [G] O:37 [GLN] A:606 [G] ✔
1U:37 [GLU] 1A:587 [C] O:37 [GLN] A:607 [C] ✔
1U:37 [GLU] 1A:1298 [G] O:37 [GLN] A:1290 [G] ✔
1U:24 [TYR] 1A:18 [C] O:24 [TYR] A:18 [C] ✔
1U:24 [TYR] 1A:19 [C] O:24 [TYR] A:19 [G] ✔
1U:24 [TYR] 1A:558 [G] O:24 [TYR] A:578 [G] ✔
1U:24 [TYR] 1A:559 [U] O:24 [TYR] A:579 [U] ✔
1U:31 [SER] 1A:603 [C] O:31 [LEU] A:623 [C] ✔
1U:31 [SER] 1A:604 [C] O:31 [LEU] A:624 [C] ✔
1U:49 [HIS] 1A:559 [U] O:49 [ASP] A:579 [U] ✔
1U:49 [HIS] 1A:560 [C] O:49 [ASP] A:580 [C] ✔
1U:49 [HIS] 1A:582 [G] O:49 [ASP] A:602 [G] ✔
1U:49 [HIS] 1A:583 [C] O:49 [ASP] A:603 [C] ✔
1U:16 [LYS] 1A:1273 [G] O:16 [LYS] A:1265 [G] ✔
1U:10 [ARG] 1A:606 [G] O:10 [THR] A:626 [G] ✔
1U:10 [ARG] 1A:1297 [C] O:10 [THR] A:1289 [A] ✔
1U:10 [ARG] 1A:1298 [G] O:10 [THR] A:1290 [G] ✔
1U:8 [VAL] 1A:29 [U] O:8 [THR] A:29 [U] ✔
1U:8 [VAL] 1A:30 [G] O:8 [THR] A:30 [G] ✔
1U:8 [VAL] 1A:1260 [G] O:8 [THR] A:1253 [G] ✔
1U:8 [VAL] 1A:1261 [G] O:8 [THR] A:1254 [C] ✔
1U:75 [ASN] 1A:1057 [G] O:75 [SER] A:1055 [A] ✔
1U:75 [ASN] 1A:1058 [U] O:75 [SER] A:1056 [U] ✔
1U:53 [ARG] 1A:560 [C] O:53 [ARG] A:580 [C] ✔
1U:53 [ARG] 1A:561 [A] O:53 [ARG] A:581 [A] ✔
1U:53 [ARG] 1A:1039 [G] O:53 [ARG] A:1037 [A] ✔
1U:53 [ARG] 1A:1040 [C] O:53 [ARG] A:1038 [C] ✔
1U:53 [ARG] 1A:1041 [C] O:53 [ARG] A:1039 [C] ✔
1U:3 [ARG] 1A:470 [C] O:3 [ARG] A:490 [C] ✔
1U:3 [ARG] 1A:471 [C] O:3 [ARG] A:491 [C] ✔
1U:3 [ARG] 1A:472 [G] O:3 [ARG] A:492 [G] ✔
1U:3 [ARG] 1A:475 [A] O:3 [ARG] A:495 [A] ✔
1U:3 [ARG] 1A:607 [C] O:3 [ARG] A:627 [C] ✔
1U:3 [ARG] 1A:1244 [U] O:3 [ARG] A:1238 [U] ✔
1U:3 [ARG] 1A:1294 [G] O:3 [ARG] A:1286 [G] ✔
1U:80 [ILE] 1A:1198 [C] O:80 [MET] A:1196 [C] ✔
1U:66 [ASN] 1A:1056 [A] O:66 [ASN] A:1054 [A] ✔
1U:66 [ASN] 1A:1057 [G] O:66 [ASN] A:1055 [A] ✔
1U:55 [ARG] 1A:1022 [C] O:55 [ARG] A:1020 [G] ✔
1U:55 [ARG] 1A:1023 [G] O:55 [ARG] A:1021 [G] ✔
1U:55 [ARG] 1A:1201 [A] O:55 [ARG] A:1199 [A] ✔
1U:55 [ARG] 1A:1202 [A] O:55 [ARG] A:1200 [A] ✔
1U:22 [LYS] 1A:19 [C] O:22 [LYS] A:19 [G] ✔
1U:22 [LYS] 1A:20 [C] O:22 [LYS] A:20 [C] ✔
1U:22 [LYS] 1A:1264 [G] O:22 [LYS] A:1257 [G] ✔
1U:78 [THR] 1A:1197 [G] O:78 [ARG] A:1195 [A] ✔
1U:33 [ARG] 1A:601 [A] O:33 [LYS] A:621 [A] ✔
1U:33 [ARG] 1A:603 [C] O:33 [LYS] A:623 [C] ✔
1U:33 [ARG] 1A:604 [C] O:33 [LYS] A:624 [C] ✔
1U:33 [ARG] 1A:1298 [G] O:33 [LYS] A:1290 [G] ✔
1U:29 [SER] 1A:18 [C] O:29 [HIS] A:18 [C] ✔
1U:29 [SER] 1A:19 [C] O:29 [HIS] A:19 [G] ✔
1U:77 [SER] 1A:1056 [A] O:77 [SER] A:1054 [A] ✔
1U:77 [SER] 1A:1057 [G] O:77 [SER] A:1055 [A] ✔
1U:77 [SER] 1A:1197 [G] O:77 [SER] A:1195 [A] ✔
1U:77 [SER] 1A:1198 [C] O:77 [SER] A:1196 [C] ✔
1U:19 [LYS] 1A:1264 [G] O:19 [LYS] A:1257 [G] ✔
1U:19 [LYS] 1A:1265 [A] O:19 [LYS] A:1258 [A] ✔
1U:15 [LYS] 1A:1262 [C] O:15 [LYS] A:1255 [A] ✔
1U:15 [LYS] 1A:1263 [C] O:15 [LYS] A:1256 [U] ✔
1U:6 [THR] 1A:606 [G] O:6 [GLY] A:626 [G] ✔
1U:6 [THR] 1A:607 [C] O:6 [GLY] A:627 [C] ✔
1U:93 [LYS] 1A:1041 [C] O:93 [LYS] A:1039 [C] ✔
1U:93 [LYS] 1A:1042 [A] O:93 [LYS] A:1040 [A] ✔
1U:93 [LYS] 1A:1043 [G] O:93 [LYS] A:1041 [G] ✔
1U:48 [ALA] 1A:1202 [A] O:48 [ARG] A:1200 [A] ✔
1U:62 [ILE] 1A:1055 [A] O:62 [ILE] A:1053 [A] ✔
1U:62 [ILE] 1A:1056 [A] O:62 [ILE] A:1054 [A] ✔
1U:62 [ILE] 1A:1199 [C] O:62 [ILE] A:1197 [C] ✔
1U:62 [ILE] 1A:1200 [G] O:62 [ILE] A:1198 [G] ✔
1U:59 [ARG] 1A:1055 [A] O:59 [LYS] A:1053 [A] ✔
1U:76 [TYR] 1A:1056 [A] O:76 [TYR] A:1054 [A] ✔
1U:76 [TYR] 1A:1057 [G] O:76 [TYR] A:1055 [A] ✔
1U:76 [TYR] 1A:1198 [C] O:76 [TYR] A:1196 [C] ✔
1U:76 [TYR] 1A:1199 [C] O:76 [TYR] A:1197 [C] ✔
1U:11 [ARG] 1A:28 [A] O:11 [ARG] A:28 [A] ✔
1U:11 [ARG] 1A:29 [U] O:11 [ARG] A:29 [U] ✔
1U:11 [ARG] 1A:538 [A] O:11 [ARG] A:558 [A] ✔
1U:11 [ARG] 1A:1260 [G] O:11 [ARG] A:1253 [G] ✔
1U:11 [ARG] 1A:1261 [G] O:11 [ARG] A:1254 [C] ✔
1U:11 [ARG] 1A:1262 [C] O:11 [ARG] A:1255 [A] ✔
1U:25 [TRP] 1A:17 [G] O:25 [PHE] A:17 [G] ✔
1U:25 [TRP] 1A:18 [C] O:25 [PHE] A:18 [C] ✔
1U:25 [TRP] 1A:557 [A] O:25 [PHE] A:577 [A] ✔
1U:25 [TRP] 1A:558 [G] O:25 [PHE] A:578 [G] ✔
1U:25 [TRP] 1A:2042 [A] O:25 [PHE] A:2047 [A] ✔
1U:25 [TRP] 1A:2043 [C] O:25 [PHE] A:2048 [G] ✔
1U:84 [LYS] 1A:1198 [C] O:84 [LYS] A:1196 [C] ✔
1U:57 [PHE] 1A:561 [A] O:57 [PHE] A:581 [A] ✔
1U:57 [PHE] 1A:1041 [C] O:57 [PHE] A:1039 [C] ✔
1U:2 [PRO] 1A:469 [A] O:2 [PRO] A:489 [A] ✔
1U:2 [PRO] 1A:470 [C] O:2 [PRO] A:490 [C] ✔
1U:2 [PRO] 1A:471 [C] O:2 [PRO] A:491 [C] ✔
1U:2 [PRO] 1A:1244 [U] O:2 [PRO] A:1238 [U] ✔
1U:2 [PRO] 1A:1245 [C] O:2 [PRO] A:1239 [C] ✔
1U:2 [PRO] 1A:1292 [A] O:2 [PRO] A:1284 [A] ✔
1U:2 [PRO] 1A:1293 [A] O:2 [PRO] A:1285 [A] ✔
1U:2 [PRO] 1A:1294 [G] O:2 [PRO] A:1286 [G] ✔
1U:46 [ALA] 1A:559 [U] O:46 [ALA] A:579 [U] ✔
1U:46 [ALA] 1A:560 [C] O:46 [ALA] A:580 [C] ✔
1U:54 [LYS] 1A:1040 [C] O:54 [LYS] A:1038 [C] ✔
1U:54 [LYS] 1A:1041 [C] O:54 [LYS] A:1039 [C] ✔
1U:9 [VAL] 1A:1242 [G] O:9 [VAL] A:1236 [G] ✔
1U:9 [VAL] 1A:1243 [U] O:9 [VAL] A:1237 [U] ✔
1U:9 [VAL] 1A:1297 [C] O:9 [VAL] A:1289 [A] ✔
1U:42 [ALA] 1A:558 [G] O:42 [SER] A:578 [G] ✔
1U:42 [ALA] 1A:559 [U] O:42 [SER] A:579 [U] ✔
1U:26 [GLY] 1A:17 [G] O:26 [GLY] A:17 [G] ✔
1U:26 [GLY] 1A:18 [C] O:26 [GLY] A:18 [C] ✔
1U:70 [ARG] 1A:1057 [G] O:70 [ARG] A:1055 [A] ✔
1U:70 [ARG] 1A:1058 [U] O:70 [ARG] A:1056 [U] ✔
1U:32 [PHE] 1A:604 [C] O:32 [TYR] A:624 [C] ✔
1U:32 [PHE] 1A:605 [G] O:32 [TYR] A:625 [G] ✔
1U:32 [PHE] 1A:1298 [G] O:32 [TYR] A:1290 [G] ✔
1U:30 [LYS] 1A:539 [A] O:30 [THR] A:559 [A] ✔
1U:30 [LYS] 1A:540 [A] O:30 [THR] A:560 [A] ✔
1U:30 [LYS] 1A:541 [C] O:30 [THR] A:561 [C] ✔
1U:45 [TYR] 1A:556 [C] O:45 [TYR] A:576 [U] ✔
1U:45 [TYR] 1A:557 [A] O:45 [TYR] A:577 [A] ✔
1U:45 [TYR] 1A:558 [G] O:45 [TYR] A:578 [G] ✔
1U:45 [TYR] 1A:559 [U] O:45 [TYR] A:579 [U] ✔
1U:45 [TYR] 1A:584 [G] O:45 [TYR] A:604 [G] ✔
1U:27 [LEU] 1A:2041 [A] O:27 [SER] A:2046 [U] ✔
1U:27 [LEU] 1A:2042 [A] O:27 [SER] A:2047 [A] ✔
1U:14 [HIS] 1A:605 [G] O:14 [ARG] A:625 [G] ✔
1U:14 [HIS] 1A:1297 [C] O:14 [ARG] A:1289 [A] ✔
1U:14 [HIS] 1A:1298 [G] O:14 [ARG] A:1290 [G] ✔
1U:41 [ALA] 1A:557 [A] O:41 [LYS] A:577 [A] ✔
1U:41 [ALA] 1A:558 [G] O:41 [LYS] A:578 [G] ✔
1U:36 [ARG] 1A:1298 [G] O:36 [LYS] A:1290 [G] ✔
1U:23 [GLY] 1A:18 [C] O:23 [GLY] A:18 [C] ✔
1U:23 [GLY] 1A:19 [C] O:23 [GLY] A:19 [G] ✔
1U:23 [GLY] 1A:558 [G] O:23 [GLY] A:578 [G] ✔
1U:23 [GLY] 1A:577 [U] O:23 [GLY] A:597 [U] ✔
1U:4 [ALA] 1A:1243 [U] O:4 [VAL] A:1237 [U] ✔
1U:4 [ALA] 1A:1244 [U] O:4 [VAL] A:1238 [U] ✔
1U:4 [ALA] 1A:1293 [A] O:4 [VAL] A:1285 [A] ✔
1U:4 [ALA] 1A:1294 [G] O:4 [VAL] A:1286 [G] ✔
1U:4 [ALA] 1A:1295 [U] O:4 [VAL] A:1287 [U] ✔
1U:38 [THR] 1A:558 [G] O:38 [GLN] A:578 [G] ✔
1U:5 [LYS] 1A:29 [U] O:5 [LYS] A:29 [U] ✔
1U:5 [LYS] 1A:30 [G] O:5 [LYS] A:30 [G] ✔
1U:5 [LYS] 1A:472 [G] O:5 [LYS] A:492 [G] ✔
1U:5 [LYS] 1A:473 [A] O:5 [LYS] A:493 [A] ✔
1U:5 [LYS] 1A:607 [C] O:5 [LYS] A:627 [C] ✔
1U:5 [LYS] 1A:1243 [U] O:5 [LYS] A:1237 [U] ✔
1U:91 [ASP] 1A:1042 [A] O:91 [ASN] A:1040 [A] ✔
1U:91 [ASP] 1A:1043 [G] O:91 [ASN] A:1041 [G] ✔
1U:13 [LYS] 1A:1273 [G] O:13 [ARG] A:1265 [G] ✔
1U:13 [LYS] 1A:1297 [C] O:13 [ARG] A:1289 [A] ✔
1U:56 [ASP] 1A:582 [G] O:56 [ASP] A:602 [G] ✔
1U:52 [ARG] 1A:582 [G] O:52 [GLN] A:602 [G] ✔
1U:52 [ARG] 1A:583 [C] O:52 [GLN] A:603 [C] ✔
1U:52 [ARG] 1A:1023 [G] O:52 [GLN] A:1021 [G] ✔
1U:58 [ARG] 1A:1043 [G] O:58 [ARG] A:1041 [G] ✔
1U:58 [ARG] 1A:1044 [C] O:58 [ARG] A:1042 [C] ✔
1U:58 [ARG] 1A:1199 [C] O:58 [ARG] A:1197 [C] ✔
1U:58 [ARG] 1A:1200 [G] O:58 [ARG] A:1198 [G] ✔
1U:51 [LYS] 1A:1036 [A] O:51 [ARG] A:1034 [A] ✔
1U:51 [LYS] 1A:1038 [C] O:51 [ARG] A:1036 [C] ✔
1U:51 [LYS] 1A:1039 [G] O:51 [ARG] A:1037 [A] ✔
1U:51 [LYS] 1A:1202 [A] O:51 [ARG] A:1200 [A] ✔
1U:40 [PHE] 1A:587 [C] O:40 [MET] A:607 [C] ✔
1U:40 [PHE] 1A:1298 [G] O:40 [MET] A:1290 [G] ✔
1U:63 [VAL] 1A:1055 [A] O:63 [THR] A:1053 [A] ✔
1U:63 [VAL] 1A:1056 [A] O:63 [THR] A:1054 [A] ✔
1U:61 [TRP] 1A:1041 [C] O:61 [TRP] A:1039 [C] ✔
1U:61 [TRP] 1A:1042 [A] O:61 [TRP] A:1040 [A] ✔
1U:61 [TRP] 1A:1043 [G] O:61 [TRP] A:1041 [G] ✔
1U:34 [LYS] 1A:2041 [A] O:34 [VAL] A:2046 [U] ✔
1U:92 [ARG] 1A:1042 [A] O:92 [ARG] A:1040 [A] ✔
1U:92 [ARG] 1A:1043 [G] O:92 [ARG] A:1041 [G] ✔
1U:92 [ARG] 1A:1044 [C] O:92 [ARG] A:1042 [C] ✔
1U:92 [ARG] 1A:1198 [C] O:92 [ARG] A:1196 [C] ✔
1U:92 [ARG] 1A:1199 [C] O:92 [ARG] A:1197 [C] ✔
1U:81 [HIS] 1A:1197 [G] O:81 [ASN] A:1195 [A] ✔
1U:81 [HIS] 1A:1198 [C] O:81 [ASN] A:1196 [C] ✔
1U:47 [TYR] 1A:1036 [A] O:47 [PHE] A:1034 [A] ✔
1U:47 [TYR] 1A:1038 [C] O:47 [PHE] A:1036 [C] ✔
1U:47 [TYR] 1A:1039 [G] O:47 [PHE] A:1037 [A] ✔
1U:47 [TYR] 1A:1202 [A] O:47 [PHE] A:1200 [A] ✔
1U:28 [ARG] 1A:556 [C] O:28 [LYS] A:576 [U] ❌ 6S0Z_O_A
1U:28 [ARG] 1A:2042 [A] O:28 [LYS] A:2047 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:50 [ARG] 1A:560 [C] O:50 [ARG] A:580 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:50 [ARG] 1A:1038 [C] O:50 [ARG] A:1036 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:7 [GLY] 1A:606 [G] O:7 [GLY] A:626 [G] ❌ 6S0Z_O_A
1U:7 [GLY] 1A:607 [C] O:7 [GLY] A:627 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:49 [HIS] 1A:558 [G] O:49 [ASP] A:578 [G] ❌ 6S0Z_O_A
1U:10 [ARG] 1A:607 [C] O:10 [THR] A:627 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:80 [ILE] 1A:1199 [C] O:80 [MET] A:1197 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:22 [LYS] 1A:18 [C] O:22 [LYS] A:18 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:22 [LYS] 1A:577 [U] O:22 [LYS] A:597 [U] ❌ 6S0Z_O_A
1U:78 [THR] 1A:1057 [G] O:78 [ARG] A:1055 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:15 [LYS] 1A:539 [A] O:15 [LYS] A:559 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:6 [THR] 1A:1243 [U] O:6 [GLY] A:1237 [U] ❌ 6S0Z_O_A
1U:6 [THR] 1A:1297 [C] O:6 [GLY] A:1289 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:59 [ARG] 1A:1200 [G] O:59 [LYS] A:1198 [G] ❌ 6S0Z_O_A
1U:11 [ARG] 1A:606 [G] O:11 [ARG] A:626 [G] ❌ 6S0Z_O_A
1U:54 [LYS] 1A:1039 [G] O:54 [LYS] A:1037 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:26 [GLY] 1A:2042 [A] O:26 [GLY] A:2047 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:30 [LYS] 1A:18 [C] O:30 [THR] A:18 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:30 [LYS] 1A:19 [C] O:30 [THR] A:19 [G] ❌ 6S0Z_O_A
1U:30 [LYS] 1A:604 [C] O:30 [THR] A:624 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:27 [LEU] 1A:541 [C] O:27 [SER] A:561 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:27 [LEU] 1A:603 [C] O:27 [SER] A:623 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:14 [HIS] 1A:604 [C] O:14 [ARG] A:624 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:36 [ARG] 1A:1297 [C] O:36 [LYS] A:1289 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:5 [LYS] 1A:1244 [U] O:5 [LYS] A:1238 [U] ❌ 6S0Z_O_A
1U:56 [ASP] 1A:560 [C] O:56 [ASP] A:580 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:52 [ARG] 1A:1202 [A] O:52 [GLN] A:1200 [A] ❌ 6S0Z_O_A
1U:34 [LYS] 1A:586 [G] O:34 [VAL] A:606 [G] ❌ 6S0Z_O_A
1U:34 [LYS] 1A:603 [C] O:34 [VAL] A:623 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:34 [LYS] 1A:604 [C] O:34 [VAL] A:624 [C] ❌ 6S0Z_O_A
1U:13 [LYS] 1A:1298 [G] O:13 [ARG] A:1290 [G] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:14 [HIS] 1A:606 [G] O:14 [ARG] A:626 [G] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:19 [LYS] 1A:1263 [C] O:19 [LYS] A:1256 [U] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:31 [SER] 1A:540 [A] O:31 [LEU] A:560 [A] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:31 [SER] 1A:541 [C] O:31 [LEU] A:561 [C] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:38 [THR] 1A:557 [A] O:38 [GLN] A:577 [A] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:41 [ALA] 1A:586 [G] O:41 [LYS] A:606 [G] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:41 [ALA] 1A:587 [C] O:41 [LYS] A:607 [C] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:48 [ALA] 1A:582 [G] O:48 [ARG] A:602 [G] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:48 [ALA] 1A:583 [C] O:48 [ARG] A:603 [C] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:48 [ALA] 1A:558 [G] O:48 [ARG] A:578 [G] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:48 [ALA] 1A:584 [G] O:48 [ARG] A:604 [G] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:6 [THR] 1A:29 [U] O:6 [GLY] A:29 [U] ❌ 4Y4O_1U_1A
1U:28 [ARG] 1A:2040 [G] O:28 [LYS] A:2045 [A] ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface
1U:37 [GLU] 1A:2040 [G] O:37 [GLN] A:2045 [A] ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface
1U:16 [LYS] 1A:1272 [A] O:16 [LYS] A:1264 [A] ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface
1U:10 [ARG] 1A:608 [G] O:10 [THR] A:628 [G] ❌ 6S0Z_A:628 no longer at interface
1U:33 [ARG] 1A:1299 [A] O:33 [LYS] A:1291 [A] ❌ 6S0Z_A:1291 no longer at interface
1U:6 [THR] 1A:608 [G] O:6 [GLY] A:628 [G] ❌ 6S0Z_A:628 no longer at interface
1U:59 [ARG] 1A:1054 [C] O:59 [LYS] A:1052 [A] ❌ 6S0Z_A:1052 no longer at interface
1U:9 [VAL] 1A:1296 [G] O:9 [VAL] A:1288 [G] ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface
1U:36 [ARG] 1A:859 [C] O:36 [LYS] A:857 [C] ❌ 6S0Z_A:857 no longer at interface
1U:13 [LYS] 1A:859 [C] O:13 [ARG] A:857 [C] ❌ 6S0Z_A:857 no longer at interface
1U:13 [LYS] 1A:1272 [A] O:13 [ARG] A:1264 [A] ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface
1U:13 [LYS] 1A:1296 [G] O:13 [ARG] A:1288 [G] ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface
1U:34 [LYS] 1A:2040 [G] O:34 [VAL] A:2045 [A] ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface
1U:47 [TYR] 1A:1037 [C] O:47 [PHE] A:1035 [C] ❌ 6S0Z_A:1035 no longer at interface
1U:16 [LYS] 1A:1274 [G] O:16 [LYS] A:1266 [G] ❌ 4Y4O_1A:1274 no longer at interface
1U:22 [LYS] 1A:576 [G] O:22 [LYS] A:596 [G] ❌ 4Y4O_1A:576 no longer at interface
1U:41 [ALA] 1A:585 [U] O:41 [LYS] A:605 [U] ❌ 4Y4O_1A:585 no longer at interface
1U:21 [ALA] 1A:19 [C] O:21 [ALA] A:19 [G] ❌ 6S0Z_O:21 no longer at interface
1U:12 [ARG] 1A:1260 [G] O:12 [ALA] A:1253 [G] ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface
1U:12 [ARG] 1A:1261 [G] O:12 [ALA] A:1254 [C] ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface
1U:85 [LYS] 1A:1197 [G] O:85 [LYS] A:1195 [A] ❌ 4Y4O_1U:85 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.97 1.05 0.48 0.98 0.97 0.98 0.96 0.89 0.87 0.48 0.32


Other pairs involving 4Y4O_1U_1A or 6S0Z_O_A

Total number of entries: 7

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4Y4O_1U_1A 7RYG_P_A 0.88 0.96 1.29 0.55 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1U_1A 7OF0_R_A 0.69 0.97 1.77 0.27 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1U_1A 6S0Z_O_A 0.89 0.97 1.05 0.48 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1U_1A 7K00_p_a 0.91 0.97 0.81 0.58 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_O_A 7OF0_R_A 0.68 0.96 2.06 0.25 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_O_A 7K00_p_a 0.87 0.97 1.25 0.63 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_O_A 7RYG_P_A 0.86 0.98 0.88 0.59 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare