Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1U
|
4Y4O_1A
|
7OF0_R
|
7OF0_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1U:28 [ARG] | 1A:557 [A] | R:35 [LYS] | A:1828 [A] | ✔ |
1U:28 [ARG] | 1A:558 [G] | R:35 [LYS] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:28 [ARG] | 1A:2041 [A] | R:35 [LYS] | A:2682 [A] | ✔ |
1U:50 [ARG] | 1A:1038 [C] | R:57 [ARG] | A:2143 [G] | ✔ |
1U:50 [ARG] | 1A:1039 [G] | R:57 [ARG] | A:2144 [A] | ✔ |
1U:50 [ARG] | 1A:1040 [C] | R:57 [ARG] | A:2145 [G] | ✔ |
1U:50 [ARG] | 1A:1041 [C] | R:57 [ARG] | A:2146 [A] | ✔ |
1U:37 [GLU] | 1A:587 [C] | R:44 [ARG] | A:1845 [C] | ✔ |
1U:37 [GLU] | 1A:1298 [G] | R:44 [ARG] | A:2296 [U] | ✔ |
1U:37 [GLU] | 1A:2040 [G] | R:44 [ARG] | A:2681 [G] | ✔ |
1U:24 [TYR] | 1A:558 [G] | R:31 [PHE] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:24 [TYR] | 1A:559 [U] | R:31 [PHE] | A:1830 [G] | ✔ |
1U:31 [SER] | 1A:603 [C] | R:38 [CYS] | A:1861 [U] | ✔ |
1U:31 [SER] | 1A:604 [C] | R:38 [CYS] | A:1862 [U] | ✔ |
1U:49 [HIS] | 1A:559 [U] | R:56 [ALA] | A:1830 [G] | ✔ |
1U:49 [HIS] | 1A:560 [C] | R:56 [ALA] | A:1831 [G] | ✔ |
1U:10 [ARG] | 1A:606 [G] | R:17 [ARG] | A:1864 [A] | ✔ |
1U:10 [ARG] | 1A:607 [C] | R:17 [ARG] | A:1865 [C] | ✔ |
1U:10 [ARG] | 1A:1297 [C] | R:17 [ARG] | A:2295 [C] | ✔ |
1U:53 [ARG] | 1A:560 [C] | R:60 [LYS] | A:1831 [G] | ✔ |
1U:53 [ARG] | 1A:561 [A] | R:60 [LYS] | A:1832 [A] | ✔ |
1U:53 [ARG] | 1A:1040 [C] | R:60 [LYS] | A:2145 [G] | ✔ |
1U:53 [ARG] | 1A:1041 [C] | R:60 [LYS] | A:2146 [A] | ✔ |
1U:3 [ARG] | 1A:470 [C] | R:11 [ARG] | A:1770 [G] | ✔ |
1U:3 [ARG] | 1A:471 [C] | R:11 [ARG] | A:1771 [C] | ✔ |
1U:3 [ARG] | 1A:472 [G] | R:11 [ARG] | A:1772 [A] | ✔ |
1U:3 [ARG] | 1A:1244 [U] | R:11 [ARG] | A:2275 [U] | ✔ |
1U:3 [ARG] | 1A:1294 [G] | R:11 [ARG] | A:2292 [G] | ✔ |
1U:80 [ILE] | 1A:1198 [C] | R:87 [ILE] | A:2247 [C] | ✔ |
1U:80 [ILE] | 1A:1199 [C] | R:87 [ILE] | A:2248 [U] | ✔ |
1U:55 [ARG] | 1A:1201 [A] | R:62 [LYS] | A:2250 [A] | ✔ |
1U:78 [THR] | 1A:1197 [G] | R:85 [ALA] | A:2246 [A] | ✔ |
1U:33 [ARG] | 1A:601 [A] | R:40 [ARG] | A:1859 [A] | ✔ |
1U:33 [ARG] | 1A:603 [C] | R:40 [ARG] | A:1861 [U] | ✔ |
1U:33 [ARG] | 1A:604 [C] | R:40 [ARG] | A:1862 [U] | ✔ |
1U:33 [ARG] | 1A:1298 [G] | R:40 [ARG] | A:2296 [U] | ✔ |
1U:33 [ARG] | 1A:1299 [A] | R:40 [ARG] | A:2297 [A] | ✔ |
1U:77 [SER] | 1A:1197 [G] | R:84 [PRO] | A:2246 [A] | ✔ |
1U:77 [SER] | 1A:1198 [C] | R:84 [PRO] | A:2247 [C] | ✔ |
1U:6 [THR] | 1A:607 [C] | R:14 [VAL] | A:1865 [C] | ✔ |
1U:6 [THR] | 1A:1243 [U] | R:14 [VAL] | A:2274 [A] | ✔ |
1U:6 [THR] | 1A:1297 [C] | R:14 [VAL] | A:2295 [C] | ✔ |
1U:93 [LYS] | 1A:1041 [C] | R:100 [LYS] | A:2146 [A] | ✔ |
1U:93 [LYS] | 1A:1042 [A] | R:100 [LYS] | A:2147 [G] | ✔ |
1U:93 [LYS] | 1A:1043 [G] | R:100 [LYS] | A:2148 [A] | ✔ |
1U:48 [ALA] | 1A:1202 [A] | R:55 [LYS] | A:2251 [A] | ✔ |
1U:62 [ILE] | 1A:1199 [C] | R:69 [ILE] | A:2248 [U] | ✔ |
1U:62 [ILE] | 1A:1200 [G] | R:69 [ILE] | A:2249 [G] | ✔ |
1U:59 [ARG] | 1A:1200 [G] | R:66 [THR] | A:2249 [G] | ✔ |
1U:76 [TYR] | 1A:1198 [C] | R:83 [TYR] | A:2247 [C] | ✔ |
1U:76 [TYR] | 1A:1199 [C] | R:83 [TYR] | A:2248 [U] | ✔ |
1U:25 [TRP] | 1A:557 [A] | R:32 [ARG] | A:1828 [A] | ✔ |
1U:25 [TRP] | 1A:558 [G] | R:32 [ARG] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:25 [TRP] | 1A:2043 [C] | R:32 [ARG] | A:2684 [C] | ✔ |
1U:57 [PHE] | 1A:1041 [C] | R:64 [MET] | A:2146 [A] | ✔ |
1U:2 [PRO] | 1A:471 [C] | R:10 [LEU] | A:1771 [C] | ✔ |
1U:2 [PRO] | 1A:1294 [G] | R:10 [LEU] | A:2292 [G] | ✔ |
1U:46 [ALA] | 1A:559 [U] | R:53 [CYS] | A:1830 [G] | ✔ |
1U:46 [ALA] | 1A:560 [C] | R:53 [CYS] | A:1831 [G] | ✔ |
1U:54 [LYS] | 1A:1039 [G] | R:61 [LYS] | A:2144 [A] | ✔ |
1U:54 [LYS] | 1A:1040 [C] | R:61 [LYS] | A:2145 [G] | ✔ |
1U:54 [LYS] | 1A:1041 [C] | R:61 [LYS] | A:2146 [A] | ✔ |
1U:9 [VAL] | 1A:1242 [G] | R:16 [ASP] | A:2273 [A] | ✔ |
1U:9 [VAL] | 1A:1243 [U] | R:16 [ASP] | A:2274 [A] | ✔ |
1U:42 [ALA] | 1A:558 [G] | R:49 [ALA] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:42 [ALA] | 1A:559 [U] | R:49 [ALA] | A:1830 [G] | ✔ |
1U:26 [GLY] | 1A:2042 [A] | R:33 [GLY] | A:2683 [C] | ✔ |
1U:32 [PHE] | 1A:604 [C] | R:39 [TYR] | A:1862 [U] | ✔ |
1U:32 [PHE] | 1A:1298 [G] | R:39 [TYR] | A:2296 [U] | ✔ |
1U:30 [LYS] | 1A:539 [A] | R:37 [ARG] | A:1814 [A] | ✔ |
1U:30 [LYS] | 1A:540 [A] | R:37 [ARG] | A:1815 [A] | ✔ |
1U:30 [LYS] | 1A:541 [C] | R:37 [ARG] | A:1816 [G] | ✔ |
1U:45 [TYR] | 1A:557 [A] | R:52 [LYS] | A:1828 [A] | ✔ |
1U:45 [TYR] | 1A:558 [G] | R:52 [LYS] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:45 [TYR] | 1A:559 [U] | R:52 [LYS] | A:1830 [G] | ✔ |
1U:45 [TYR] | 1A:584 [G] | R:52 [LYS] | A:1842 [A] | ✔ |
1U:27 [LEU] | 1A:541 [C] | R:34 [ARG] | A:1816 [G] | ✔ |
1U:27 [LEU] | 1A:603 [C] | R:34 [ARG] | A:1861 [U] | ✔ |
1U:27 [LEU] | 1A:2041 [A] | R:34 [ARG] | A:2682 [A] | ✔ |
1U:27 [LEU] | 1A:2042 [A] | R:34 [ARG] | A:2683 [C] | ✔ |
1U:14 [HIS] | 1A:605 [G] | R:21 [ILE] | A:1863 [A] | ✔ |
1U:14 [HIS] | 1A:1298 [G] | R:21 [ILE] | A:2296 [U] | ✔ |
1U:41 [ALA] | 1A:557 [A] | R:48 [ARG] | A:1828 [A] | ✔ |
1U:41 [ALA] | 1A:558 [G] | R:48 [ARG] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:36 [ARG] | 1A:1298 [G] | R:43 [VAL] | A:2296 [U] | ✔ |
1U:23 [GLY] | 1A:558 [G] | R:30 [HIS] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:4 [ALA] | 1A:1243 [U] | R:12 [ASN] | A:2274 [A] | ✔ |
1U:4 [ALA] | 1A:1244 [U] | R:12 [ASN] | A:2275 [U] | ✔ |
1U:4 [ALA] | 1A:1293 [A] | R:12 [ASN] | A:2291 [A] | ✔ |
1U:4 [ALA] | 1A:1294 [G] | R:12 [ASN] | A:2292 [G] | ✔ |
1U:4 [ALA] | 1A:1295 [U] | R:12 [ASN] | A:2293 [A] | ✔ |
1U:38 [THR] | 1A:558 [G] | R:45 [THR] | A:1829 [A] | ✔ |
1U:5 [LYS] | 1A:472 [G] | R:13 [ARG] | A:1772 [A] | ✔ |
1U:5 [LYS] | 1A:473 [A] | R:13 [ARG] | A:1773 [A] | ✔ |
1U:5 [LYS] | 1A:607 [C] | R:13 [ARG] | A:1865 [C] | ✔ |
1U:5 [LYS] | 1A:1243 [U] | R:13 [ARG] | A:2274 [A] | ✔ |
1U:5 [LYS] | 1A:1244 [U] | R:13 [ARG] | A:2275 [U] | ✔ |
1U:91 [ASP] | 1A:1042 [A] | R:98 [ASN] | A:2147 [G] | ✔ |
1U:91 [ASP] | 1A:1043 [G] | R:98 [ASN] | A:2148 [A] | ✔ |
1U:13 [LYS] | 1A:1296 [G] | R:20 [ARG] | A:2294 [A] | ✔ |
1U:13 [LYS] | 1A:1297 [C] | R:20 [ARG] | A:2295 [C] | ✔ |
1U:56 [ASP] | 1A:582 [G] | R:63 [ASN] | A:1840 [C] | ✔ |
1U:52 [ARG] | 1A:583 [C] | R:59 [LEU] | A:1841 [U] | ✔ |
1U:58 [ARG] | 1A:1043 [G] | R:65 [ARG] | A:2148 [A] | ✔ |
1U:58 [ARG] | 1A:1044 [C] | R:65 [ARG] | A:2149 [G] | ✔ |
1U:58 [ARG] | 1A:1199 [C] | R:65 [ARG] | A:2248 [U] | ✔ |
1U:58 [ARG] | 1A:1200 [G] | R:65 [ARG] | A:2249 [G] | ✔ |
1U:51 [LYS] | 1A:1038 [C] | R:58 [TYR] | A:2143 [G] | ✔ |
1U:51 [LYS] | 1A:1039 [G] | R:58 [TYR] | A:2144 [A] | ✔ |
1U:51 [LYS] | 1A:1202 [A] | R:58 [TYR] | A:2251 [A] | ✔ |
1U:40 [PHE] | 1A:1298 [G] | R:47 [ILE] | A:2296 [U] | ✔ |
1U:61 [TRP] | 1A:1041 [C] | R:68 [TRP] | A:2146 [A] | ✔ |
1U:61 [TRP] | 1A:1042 [A] | R:68 [TRP] | A:2147 [G] | ✔ |
1U:61 [TRP] | 1A:1043 [G] | R:68 [TRP] | A:2148 [A] | ✔ |
1U:34 [LYS] | 1A:603 [C] | R:41 [LEU] | A:1861 [U] | ✔ |
1U:34 [LYS] | 1A:604 [C] | R:41 [LEU] | A:1862 [U] | ✔ |
1U:34 [LYS] | 1A:2040 [G] | R:41 [LEU] | A:2681 [G] | ✔ |
1U:34 [LYS] | 1A:2041 [A] | R:41 [LEU] | A:2682 [A] | ✔ |
1U:92 [ARG] | 1A:1042 [A] | R:99 [ARG] | A:2147 [G] | ✔ |
1U:92 [ARG] | 1A:1043 [G] | R:99 [ARG] | A:2148 [A] | ✔ |
1U:92 [ARG] | 1A:1044 [C] | R:99 [ARG] | A:2149 [G] | ✔ |
1U:92 [ARG] | 1A:1198 [C] | R:99 [ARG] | A:2247 [C] | ✔ |
1U:92 [ARG] | 1A:1199 [C] | R:99 [ARG] | A:2248 [U] | ✔ |
1U:81 [HIS] | 1A:1198 [C] | R:88 [GLY] | A:2247 [C] | ✔ |
1U:47 [TYR] | 1A:1039 [G] | R:54 [THR] | A:2144 [A] | ✔ |
1U:28 [ARG] | 1A:556 [C] | R:35 [LYS] | A:1827 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:28 [ARG] | 1A:2040 [G] | R:35 [LYS] | A:2681 [G] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:28 [ARG] | 1A:2042 [A] | R:35 [LYS] | A:2683 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:50 [ARG] | 1A:560 [C] | R:57 [ARG] | A:1831 [G] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:37 [GLU] | 1A:586 [G] | R:44 [ARG] | A:1844 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:49 [HIS] | 1A:558 [G] | R:56 [ALA] | A:1829 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:49 [HIS] | 1A:582 [G] | R:56 [ALA] | A:1840 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:49 [HIS] | 1A:583 [C] | R:56 [ALA] | A:1841 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:10 [ARG] | 1A:608 [G] | R:17 [ARG] | A:1866 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:10 [ARG] | 1A:1298 [G] | R:17 [ARG] | A:2296 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:53 [ARG] | 1A:1039 [G] | R:60 [LYS] | A:2144 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:3 [ARG] | 1A:475 [A] | R:11 [ARG] | A:1775 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:3 [ARG] | 1A:607 [C] | R:11 [ARG] | A:1865 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:55 [ARG] | 1A:1022 [C] | R:62 [LYS] | A:2127 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:55 [ARG] | 1A:1202 [A] | R:62 [LYS] | A:2251 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:6 [THR] | 1A:606 [G] | R:14 [VAL] | A:1864 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:6 [THR] | 1A:608 [G] | R:14 [VAL] | A:1866 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:25 [TRP] | 1A:2042 [A] | R:32 [ARG] | A:2683 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:57 [PHE] | 1A:561 [A] | R:64 [MET] | A:1832 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:2 [PRO] | 1A:469 [A] | R:10 [LEU] | A:1769 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:2 [PRO] | 1A:470 [C] | R:10 [LEU] | A:1770 [G] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:2 [PRO] | 1A:1244 [U] | R:10 [LEU] | A:2275 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:2 [PRO] | 1A:1245 [C] | R:10 [LEU] | A:2276 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:2 [PRO] | 1A:1292 [A] | R:10 [LEU] | A:2290 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:2 [PRO] | 1A:1293 [A] | R:10 [LEU] | A:2291 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:9 [VAL] | 1A:1296 [G] | R:16 [ASP] | A:2294 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:9 [VAL] | 1A:1297 [C] | R:16 [ASP] | A:2295 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:32 [PHE] | 1A:605 [G] | R:39 [TYR] | A:1863 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:30 [LYS] | 1A:604 [C] | R:37 [ARG] | A:1862 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:45 [TYR] | 1A:556 [C] | R:52 [LYS] | A:1827 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:14 [HIS] | 1A:604 [C] | R:21 [ILE] | A:1862 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:14 [HIS] | 1A:1297 [C] | R:21 [ILE] | A:2295 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:36 [ARG] | 1A:1297 [C] | R:43 [VAL] | A:2295 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:56 [ASP] | 1A:560 [C] | R:63 [ASN] | A:1831 [G] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:52 [ARG] | 1A:582 [G] | R:59 [LEU] | A:1840 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:52 [ARG] | 1A:1202 [A] | R:59 [LEU] | A:2251 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:40 [PHE] | 1A:587 [C] | R:47 [ILE] | A:1845 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:34 [LYS] | 1A:586 [G] | R:41 [LEU] | A:1844 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:81 [HIS] | 1A:1197 [G] | R:88 [GLY] | A:2246 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:47 [TYR] | 1A:1038 [C] | R:54 [THR] | A:2143 [G] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:47 [TYR] | 1A:1202 [A] | R:54 [THR] | A:2251 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
1U:2 [PRO] | 1A:475 [A] | R:10 [LEU] | A:1775 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:2 [PRO] | 1A:472 [G] | R:10 [LEU] | A:1772 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:2 [PRO] | 1A:607 [C] | R:10 [LEU] | A:1865 [C] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:2 [PRO] | 1A:608 [G] | R:10 [LEU] | A:1866 [U] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:3 [ARG] | 1A:1292 [A] | R:11 [ARG] | A:2290 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:3 [ARG] | 1A:1293 [A] | R:11 [ARG] | A:2291 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:3 [ARG] | 1A:1245 [C] | R:11 [ARG] | A:2276 [C] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:3 [ARG] | 1A:469 [A] | R:11 [ARG] | A:1769 [C] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:4 [ALA] | 1A:1292 [A] | R:12 [ASN] | A:2290 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:5 [LYS] | 1A:606 [G] | R:13 [ARG] | A:1864 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:6 [THR] | 1A:1242 [G] | R:14 [VAL] | A:2273 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:6 [THR] | 1A:1296 [G] | R:14 [VAL] | A:2294 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:8 [VAL] | 1A:1243 [U] | R:15 [THR] | A:2274 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:8 [VAL] | 1A:1244 [U] | R:15 [THR] | A:2275 [U] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:10 [ARG] | 1A:1296 [G] | R:17 [ARG] | A:2294 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:13 [LYS] | 1A:1242 [G] | R:20 [ARG] | A:2273 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:13 [LYS] | 1A:1243 [U] | R:20 [ARG] | A:2274 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:22 [LYS] | 1A:540 [A] | R:29 [ARG] | A:1815 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:23 [GLY] | 1A:559 [U] | R:30 [HIS] | A:1830 [G] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:27 [LEU] | 1A:2040 [G] | R:34 [ARG] | A:2681 [G] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:31 [SER] | 1A:541 [C] | R:38 [CYS] | A:1816 [G] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:31 [SER] | 1A:540 [A] | R:38 [CYS] | A:1815 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:37 [GLU] | 1A:601 [A] | R:44 [ARG] | A:1859 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:37 [GLU] | 1A:1299 [A] | R:44 [ARG] | A:2297 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:37 [GLU] | 1A:603 [C] | R:44 [ARG] | A:1861 [U] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:38 [THR] | 1A:557 [A] | R:45 [THR] | A:1828 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:41 [ALA] | 1A:587 [C] | R:48 [ARG] | A:1845 [C] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:41 [ALA] | 1A:586 [G] | R:48 [ARG] | A:1844 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:41 [ALA] | 1A:556 [C] | R:48 [ARG] | A:1827 [C] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:41 [ALA] | 1A:584 [G] | R:48 [ARG] | A:1842 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:48 [ALA] | 1A:1022 [C] | R:55 [LYS] | A:2127 [A] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:55 [ARG] | 1A:1200 [G] | R:62 [LYS] | A:2249 [G] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:58 [ARG] | 1A:1042 [A] | R:65 [ARG] | A:2147 [G] | ❌ 4Y4O_1U_1A |
1U:8 [VAL] | 1A:29 [U] | R:15 [THR] | A:1676 [A] | ❌ 7OF0_A:1676 no longer at interface |
1U:55 [ARG] | 1A:1023 [G] | R:62 [LYS] | A:2128 [G] | ❌ 7OF0_A:2128 no longer at interface |
1U:11 [ARG] | 1A:29 [U] | R:18 [TYR] | A:1676 [A] | ❌ 7OF0_R:18, 7OF0_A:1676 no longer at interface |
1U:11 [ARG] | 1A:538 [A] | R:18 [TYR] | A:1813 [C] | ❌ 7OF0_R:18, 7OF0_A:1813 no longer at interface |
1U:36 [ARG] | 1A:859 [C] | R:43 [VAL] | A:2022 [G] | ❌ 7OF0_A:2022 no longer at interface |
1U:5 [LYS] | 1A:29 [U] | R:13 [ARG] | A:1676 [A] | ❌ 7OF0_A:1676 no longer at interface |
1U:13 [LYS] | 1A:859 [C] | R:20 [ARG] | A:2022 [G] | ❌ 7OF0_A:2022 no longer at interface |
1U:52 [ARG] | 1A:1023 [G] | R:59 [LEU] | A:2128 [G] | ❌ 7OF0_A:2128 no longer at interface |
1U:51 [LYS] | 1A:1036 [A] | R:58 [TYR] | A:2141 [U] | ❌ 7OF0_A:2141 no longer at interface |
1U:47 [TYR] | 1A:1036 [A] | R:54 [THR] | A:2141 [U] | ❌ 7OF0_A:2141 no longer at interface |
1U:47 [TYR] | 1A:1037 [C] | R:54 [THR] | A:2142 [A] | ❌ 7OF0_A:2142 no longer at interface |
1U:117 [GLN] | 1A:1188 [A] | R:124 [ARG] | A:2243 [A] | ❌ 4Y4O_1U:117, 4Y4O_1A:1188 no longer at interface |
1U:117 [GLN] | 1A:1195 [G] | R:124 [ARG] | A:2244 [U] | ❌ 4Y4O_1U:117, 4Y4O_1A:1195 no longer at interface |
1U:117 [GLN] | 1A:1196 [C] | R:124 [ARG] | A:2245 [A] | ❌ 4Y4O_1U:117, 4Y4O_1A:1196 no longer at interface |
1U:27 [LEU] | 1A:602 [G] | R:34 [ARG] | A:1860 [A] | ❌ 4Y4O_1A:602 no longer at interface |
1U:51 [LYS] | 1A:1231 [G] | R:58 [TYR] | A:2262 [C] | ❌ 4Y4O_1A:1231 no longer at interface |
1U:75 [ASN] | 1A:1188 [A] | R:82 [LYS] | A:2243 [A] | ❌ 4Y4O_1A:1188 no longer at interface |
1U:75 [ASN] | 1A:1195 [G] | R:82 [LYS] | A:2244 [U] | ❌ 4Y4O_1A:1195 no longer at interface |
1U:15 [LYS] | 1A:539 [A] | R:22 [GLN] | A:1814 [A] | ❌ 7OF0_R:22 no longer at interface |
1U:11 [ARG] | 1A:606 [G] | R:18 [TYR] | A:1864 [A] | ❌ 7OF0_R:18 no longer at interface |
1U:84 [LYS] | 1A:1198 [C] | R:91 [VAL] | A:2247 [C] | ❌ 7OF0_R:91 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.97 | 1.77 | 0.27 | 0.92 | 0.97 | 0.96 | 0.92 | 0.69 | 0.67 | 0.30 | 0.22 |
Other pairs involving 4Y4O_1U_1A or 7OF0_R_A
Total number of entries: 6
Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4Y4O_1U_1A | 7RYG_P_A | 0.88 | 0.96 | 1.29 | 0.55 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
4Y4O_1U_1A | 7OF0_R_A | 0.69 | 0.97 | 1.77 | 0.27 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
4Y4O_1U_1A | 6S0Z_O_A | 0.89 | 0.97 | 1.05 | 0.48 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
4Y4O_1U_1A | 7K00_p_a | 0.91 | 0.97 | 0.81 | 0.58 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
7OF0_R_A | 7RYG_P_A | 0.70 | 0.93 | 2.23 | 0.29 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_O_A | 7OF0_R_A | 0.68 | 0.96 | 2.06 | 0.25 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |