Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6S0Z_O
|
6S0Z_A
|
7K00_p
|
7K00_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
O:48 [ARG] | A:578 [G] | p:48 [ARG] | a:533 [G] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:602 [G] | p:48 [ARG] | a:559 [G] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:603 [C] | p:48 [ARG] | a:560 [C] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:604 [G] | p:48 [ARG] | a:561 [G] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:1200 [A] | p:48 [ARG] | a:1156 [A] | ✔ |
O:78 [ARG] | A:1195 [A] | p:78 [LYS] | a:1151 [A] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1034 [A] | p:47 [TYR] | a:990 [A] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1036 [C] | p:47 [TYR] | a:992 [C] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1037 [A] | p:47 [TYR] | a:993 [G] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1200 [A] | p:47 [TYR] | a:1156 [A] | ✔ |
O:7 [GLY] | A:29 [U] | p:7 [GLY] | a:29 [U] | ✔ |
O:10 [THR] | A:626 [G] | p:10 [ALA] | a:583 [G] | ✔ |
O:10 [THR] | A:1289 [A] | p:10 [ALA] | a:1251 [C] | ✔ |
O:8 [THR] | A:29 [U] | p:8 [VAL] | a:29 [U] | ✔ |
O:8 [THR] | A:30 [G] | p:8 [VAL] | a:30 [G] | ✔ |
O:8 [THR] | A:1253 [G] | p:8 [VAL] | a:1215 [G] | ✔ |
O:8 [THR] | A:1254 [C] | p:8 [VAL] | a:1216 [G] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:560 [A] | p:31 [VAL] | a:515 [A] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:561 [C] | p:31 [VAL] | a:516 [C] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:623 [C] | p:31 [VAL] | a:580 [U] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:624 [C] | p:31 [VAL] | a:581 [C] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:18 [C] | p:24 [TYR] | a:18 [U] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:19 [G] | p:24 [TYR] | a:19 [A] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:578 [G] | p:24 [TYR] | a:533 [G] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:579 [U] | p:24 [TYR] | a:534 [U] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1237 [U] | p:4 [VAL] | a:1198 [U] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1238 [U] | p:4 [VAL] | a:1199 [U] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1285 [A] | p:4 [VAL] | a:1247 [A] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1286 [G] | p:4 [VAL] | a:1248 [G] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1287 [U] | p:4 [VAL] | a:1249 [U] | ✔ |
O:81 [ASN] | A:1195 [A] | p:81 [ASN] | a:1151 [A] | ✔ |
O:81 [ASN] | A:1196 [C] | p:81 [ASN] | a:1152 [C] | ✔ |
O:30 [THR] | A:559 [A] | p:30 [ARG] | a:514 [A] | ✔ |
O:30 [THR] | A:560 [A] | p:30 [ARG] | a:515 [A] | ✔ |
O:30 [THR] | A:561 [C] | p:30 [ARG] | a:516 [C] | ✔ |
O:75 [SER] | A:1055 [A] | p:75 [SER] | a:1011 [G] | ✔ |
O:75 [SER] | A:1056 [U] | p:75 [SER] | a:1012 [U] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:579 [U] | p:49 [ASP] | a:534 [U] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:580 [C] | p:49 [ASP] | a:535 [G] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:602 [G] | p:49 [ASP] | a:559 [G] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:603 [C] | p:49 [ASP] | a:560 [C] | ✔ |
O:36 [LYS] | A:1290 [G] | p:36 [PHE] | a:1252 [G] | ✔ |
O:85 [LYS] | A:1195 [A] | p:85 [LYS] | a:1151 [A] | ✔ |
O:27 [SER] | A:2046 [U] | p:27 [ALA] | a:2019 [A] | ✔ |
O:27 [SER] | A:2047 [A] | p:27 [ALA] | a:2020 [A] | ✔ |
O:16 [LYS] | A:1265 [G] | p:16 [LYS] | a:1227 [G] | ✔ |
O:14 [ARG] | A:625 [G] | p:14 [HIS] | a:582 [A] | ✔ |
O:14 [ARG] | A:1290 [G] | p:14 [HIS] | a:1252 [G] | ✔ |
O:91 [ASN] | A:1040 [A] | p:91 [ASP] | a:996 [A] | ✔ |
O:91 [ASN] | A:1041 [G] | p:91 [ASP] | a:997 [G] | ✔ |
O:53 [ARG] | A:580 [C] | p:53 [ARG] | a:535 [G] | ✔ |
O:53 [ARG] | A:581 [A] | p:53 [ARG] | a:536 [G] | ✔ |
O:53 [ARG] | A:1038 [C] | p:53 [ARG] | a:994 [C] | ✔ |
O:53 [ARG] | A:1039 [C] | p:53 [ARG] | a:995 [C] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1034 [A] | p:51 [ARG] | a:990 [A] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1036 [C] | p:51 [ARG] | a:992 [C] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1037 [A] | p:51 [ARG] | a:993 [G] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1200 [A] | p:51 [ARG] | a:1156 [A] | ✔ |
O:29 [HIS] | A:18 [C] | p:29 [SER] | a:18 [U] | ✔ |
O:29 [HIS] | A:19 [G] | p:29 [SER] | a:19 [A] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:490 [C] | p:3 [ARG] | a:444 [C] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:491 [C] | p:3 [ARG] | a:445 [C] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:492 [G] | p:3 [ARG] | a:446 [G] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:495 [A] | p:3 [ARG] | a:449 [A] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:627 [C] | p:3 [ARG] | a:584 [C] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:1238 [U] | p:3 [ARG] | a:1199 [U] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:1286 [G] | p:3 [ARG] | a:1248 [G] | ✔ |
O:66 [ASN] | A:1054 [A] | p:66 [ASN] | a:1010 [A] | ✔ |
O:66 [ASN] | A:1055 [A] | p:66 [ASN] | a:1011 [G] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1020 [G] | p:55 [ARG] | a:976 [G] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1021 [G] | p:55 [ARG] | a:977 [G] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1199 [A] | p:55 [ARG] | a:1155 [A] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1200 [A] | p:55 [ARG] | a:1156 [A] | ✔ |
O:22 [LYS] | A:19 [G] | p:22 [LYS] | a:19 [A] | ✔ |
O:22 [LYS] | A:20 [C] | p:22 [LYS] | a:20 [C] | ✔ |
O:22 [LYS] | A:1257 [G] | p:22 [LYS] | a:1219 [U] | ✔ |
O:32 [TYR] | A:624 [C] | p:32 [TYR] | a:581 [C] | ✔ |
O:32 [TYR] | A:625 [G] | p:32 [TYR] | a:582 [A] | ✔ |
O:32 [TYR] | A:1290 [G] | p:32 [TYR] | a:1252 [G] | ✔ |
O:6 [GLY] | A:626 [G] | p:6 [ARG] | a:583 [G] | ✔ |
O:6 [GLY] | A:627 [C] | p:6 [ARG] | a:584 [C] | ✔ |
O:52 [GLN] | A:602 [G] | p:52 [GLN] | a:559 [G] | ✔ |
O:52 [GLN] | A:603 [C] | p:52 [GLN] | a:560 [C] | ✔ |
O:52 [GLN] | A:1021 [G] | p:52 [GLN] | a:977 [G] | ✔ |
O:50 [ARG] | A:1037 [A] | p:50 [ARG] | a:993 [G] | ✔ |
O:50 [ARG] | A:1038 [C] | p:50 [ARG] | a:994 [C] | ✔ |
O:50 [ARG] | A:1039 [C] | p:50 [ARG] | a:995 [C] | ✔ |
O:80 [MET] | A:1196 [C] | p:80 [ILE] | a:1152 [C] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1054 [A] | p:77 [SER] | a:1010 [A] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1055 [A] | p:77 [SER] | a:1011 [G] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1195 [A] | p:77 [SER] | a:1151 [A] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1196 [C] | p:77 [SER] | a:1152 [C] | ✔ |
O:19 [LYS] | A:1257 [G] | p:19 [LYS] | a:1219 [U] | ✔ |
O:13 [ARG] | A:1265 [G] | p:13 [ARG] | a:1227 [G] | ✔ |
O:13 [ARG] | A:1289 [A] | p:13 [ARG] | a:1251 [C] | ✔ |
O:15 [LYS] | A:1255 [A] | p:15 [LYS] | a:1217 [U] | ✔ |
O:15 [LYS] | A:1256 [U] | p:15 [LYS] | a:1218 [G] | ✔ |
O:93 [LYS] | A:1039 [C] | p:93 [LYS] | a:995 [C] | ✔ |
O:93 [LYS] | A:1040 [A] | p:93 [LYS] | a:996 [A] | ✔ |
O:93 [LYS] | A:1041 [G] | p:93 [LYS] | a:997 [G] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1053 [A] | p:62 [ILE] | a:1009 [A] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1054 [A] | p:62 [ILE] | a:1010 [A] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1197 [C] | p:62 [ILE] | a:1153 [C] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1198 [G] | p:62 [ILE] | a:1154 [G] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1054 [A] | p:76 [TYR] | a:1010 [A] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1055 [A] | p:76 [TYR] | a:1011 [G] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1196 [C] | p:76 [TYR] | a:1152 [C] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1197 [C] | p:76 [TYR] | a:1153 [C] | ✔ |
O:11 [ARG] | A:558 [A] | p:11 [ARG] | a:513 [A] | ✔ |
O:11 [ARG] | A:1254 [C] | p:11 [ARG] | a:1216 [G] | ✔ |
O:11 [ARG] | A:1255 [A] | p:11 [ARG] | a:1217 [U] | ✔ |
O:84 [LYS] | A:1196 [C] | p:84 [LYS] | a:1152 [C] | ✔ |
O:57 [PHE] | A:581 [A] | p:57 [PHE] | a:536 [G] | ✔ |
O:57 [PHE] | A:1039 [C] | p:57 [PHE] | a:995 [C] | ✔ |
O:46 [ALA] | A:579 [U] | p:46 [ALA] | a:534 [U] | ✔ |
O:46 [ALA] | A:580 [C] | p:46 [ALA] | a:535 [G] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:489 [A] | p:2 [ALA] | a:443 [A] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:490 [C] | p:2 [ALA] | a:444 [C] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:491 [C] | p:2 [ALA] | a:445 [C] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1238 [U] | p:2 [ALA] | a:1199 [U] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1239 [C] | p:2 [ALA] | a:1200 [C] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1284 [A] | p:2 [ALA] | a:1246 [A] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1285 [A] | p:2 [ALA] | a:1247 [A] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1286 [G] | p:2 [ALA] | a:1248 [G] | ✔ |
O:54 [LYS] | A:1038 [C] | p:54 [LYS] | a:994 [C] | ✔ |
O:54 [LYS] | A:1039 [C] | p:54 [LYS] | a:995 [C] | ✔ |
O:9 [VAL] | A:1236 [G] | p:9 [ILE] | a:1197 [G] | ✔ |
O:9 [VAL] | A:1237 [U] | p:9 [ILE] | a:1198 [U] | ✔ |
O:9 [VAL] | A:1289 [A] | p:9 [ILE] | a:1251 [C] | ✔ |
O:38 [GLN] | A:578 [G] | p:38 [ALA] | a:533 [G] | ✔ |
O:26 [GLY] | A:17 [G] | p:26 [GLY] | a:17 [G] | ✔ |
O:26 [GLY] | A:18 [C] | p:26 [GLY] | a:18 [U] | ✔ |
O:70 [ARG] | A:1055 [A] | p:70 [ARG] | a:1011 [G] | ✔ |
O:70 [ARG] | A:1056 [U] | p:70 [ARG] | a:1012 [U] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:17 [G] | p:25 [TYR] | a:17 [G] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:18 [C] | p:25 [TYR] | a:18 [U] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:577 [A] | p:25 [TYR] | a:532 [A] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:578 [G] | p:25 [TYR] | a:533 [G] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:2047 [A] | p:25 [TYR] | a:2020 [A] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:2048 [G] | p:25 [TYR] | a:2021 [C] | ✔ |
O:23 [GLY] | A:18 [C] | p:23 [GLY] | a:18 [U] | ✔ |
O:23 [GLY] | A:19 [G] | p:23 [GLY] | a:19 [A] | ✔ |
O:23 [GLY] | A:578 [G] | p:23 [GLY] | a:533 [G] | ✔ |
O:23 [GLY] | A:597 [U] | p:23 [GLY] | a:554 [U] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:576 [U] | p:45 [TYR] | a:531 [C] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:577 [A] | p:45 [TYR] | a:532 [A] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:578 [G] | p:45 [TYR] | a:533 [G] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:579 [U] | p:45 [TYR] | a:534 [U] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:604 [G] | p:45 [TYR] | a:561 [G] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:29 [U] | p:5 [LYS] | a:29 [U] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:30 [G] | p:5 [LYS] | a:30 [G] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:492 [G] | p:5 [LYS] | a:446 [G] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:493 [A] | p:5 [LYS] | a:447 [A] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:627 [C] | p:5 [LYS] | a:584 [C] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:1237 [U] | p:5 [LYS] | a:1198 [U] | ✔ |
O:28 [LYS] | A:577 [A] | p:28 [ARG] | a:532 [A] | ✔ |
O:28 [LYS] | A:578 [G] | p:28 [ARG] | a:533 [G] | ✔ |
O:28 [LYS] | A:2046 [U] | p:28 [ARG] | a:2019 [A] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:621 [A] | p:33 [ARG] | a:578 [G] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:623 [C] | p:33 [ARG] | a:580 [U] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:624 [C] | p:33 [ARG] | a:581 [C] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:1290 [G] | p:33 [ARG] | a:1252 [G] | ✔ |
O:56 [ASP] | A:602 [G] | p:56 [GLN] | a:559 [G] | ✔ |
O:59 [LYS] | A:1053 [A] | p:59 [GLN] | a:1009 [A] | ✔ |
O:42 [SER] | A:578 [G] | p:42 [ALA] | a:533 [G] | ✔ |
O:42 [SER] | A:579 [U] | p:42 [ALA] | a:534 [U] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1041 [G] | p:58 [ARG] | a:997 [G] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1042 [C] | p:58 [ARG] | a:998 [C] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1197 [C] | p:58 [ARG] | a:1153 [C] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1198 [G] | p:58 [ARG] | a:1154 [G] | ✔ |
O:61 [TRP] | A:1039 [C] | p:61 [TRP] | a:995 [C] | ✔ |
O:61 [TRP] | A:1040 [A] | p:61 [TRP] | a:996 [A] | ✔ |
O:61 [TRP] | A:1041 [G] | p:61 [TRP] | a:997 [G] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:577 [A] | p:41 [LYS] | a:532 [A] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:578 [G] | p:41 [LYS] | a:533 [G] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:605 [U] | p:41 [LYS] | a:562 [U] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:606 [G] | p:41 [LYS] | a:563 [A] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:607 [C] | p:41 [LYS] | a:564 [C] | ✔ |
O:34 [VAL] | A:2046 [U] | p:34 [VAL] | a:2019 [A] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1040 [A] | p:92 [ARG] | a:996 [A] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1041 [G] | p:92 [ARG] | a:997 [G] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1042 [C] | p:92 [ARG] | a:998 [C] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1196 [C] | p:92 [ARG] | a:1152 [C] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1197 [C] | p:92 [ARG] | a:1153 [C] | ✔ |
O:63 [THR] | A:1053 [A] | p:63 [ALA] | a:1009 [A] | ✔ |
O:63 [THR] | A:1054 [A] | p:63 [ALA] | a:1010 [A] | ✔ |
O:37 [GLN] | A:606 [G] | p:37 [GLN] | a:563 [A] | ✔ |
O:37 [GLN] | A:607 [C] | p:37 [GLN] | a:564 [C] | ✔ |
O:37 [GLN] | A:1290 [G] | p:37 [GLN] | a:1252 [G] | ✔ |
O:7 [GLY] | A:30 [G] | p:7 [GLY] | a:30 [G] | ❌ 7K00_p_a |
O:10 [THR] | A:1290 [G] | p:10 [ALA] | a:1252 [G] | ❌ 7K00_p_a |
O:14 [ARG] | A:626 [G] | p:14 [HIS] | a:583 [G] | ❌ 7K00_p_a |
O:14 [ARG] | A:1289 [A] | p:14 [HIS] | a:1251 [C] | ❌ 7K00_p_a |
O:53 [ARG] | A:1037 [A] | p:53 [ARG] | a:993 [G] | ❌ 7K00_p_a |
O:6 [GLY] | A:29 [U] | p:6 [ARG] | a:29 [U] | ❌ 7K00_p_a |
O:19 [LYS] | A:1256 [U] | p:19 [LYS] | a:1218 [G] | ❌ 7K00_p_a |
O:13 [ARG] | A:1290 [G] | p:13 [ARG] | a:1252 [G] | ❌ 7K00_p_a |
O:11 [ARG] | A:29 [U] | p:11 [ARG] | a:29 [U] | ❌ 7K00_p_a |
O:11 [ARG] | A:1253 [G] | p:11 [ARG] | a:1215 [G] | ❌ 7K00_p_a |
O:38 [GLN] | A:577 [A] | p:38 [ALA] | a:532 [A] | ❌ 7K00_p_a |
O:11 [ARG] | A:559 [A] | p:11 [ARG] | a:514 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:11 [ARG] | A:625 [G] | p:11 [ARG] | a:582 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:11 [ARG] | A:626 [G] | p:11 [ARG] | a:583 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:14 [ARG] | A:624 [C] | p:14 [HIS] | a:581 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:22 [LYS] | A:1256 [U] | p:22 [LYS] | a:1218 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:22 [LYS] | A:18 [C] | p:22 [LYS] | a:18 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:26 [GLY] | A:2047 [A] | p:26 [GLY] | a:2020 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:28 [LYS] | A:2047 [A] | p:28 [ARG] | a:2020 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:3 [ARG] | A:493 [A] | p:3 [ARG] | a:447 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:30 [THR] | A:19 [G] | p:30 [ARG] | a:19 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:30 [THR] | A:18 [C] | p:30 [ARG] | a:18 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:30 [THR] | A:17 [G] | p:30 [ARG] | a:17 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:32 [TYR] | A:623 [C] | p:32 [TYR] | a:580 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:37 [GLN] | A:621 [A] | p:37 [GLN] | a:578 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:4 [VAL] | A:627 [C] | p:4 [VAL] | a:584 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:41 [LYS] | A:604 [G] | p:41 [LYS] | a:561 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:41 [LYS] | A:576 [U] | p:41 [LYS] | a:531 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:48 [ARG] | A:579 [U] | p:48 [ARG] | a:534 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:49 [ASP] | A:578 [G] | p:49 [ASP] | a:533 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:50 [ARG] | A:1036 [C] | p:50 [ARG] | a:992 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:54 [LYS] | A:1037 [A] | p:54 [LYS] | a:993 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:56 [ASP] | A:603 [C] | p:56 [GLN] | a:560 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:56 [ASP] | A:580 [C] | p:56 [GLN] | a:535 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:58 [ARG] | A:1040 [A] | p:58 [ARG] | a:996 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:59 [LYS] | A:1198 [G] | p:59 [GLN] | a:1154 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:6 [GLY] | A:1289 [A] | p:6 [ARG] | a:1251 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:66 [ASN] | A:1053 [A] | p:66 [ASN] | a:1009 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:7 [GLY] | A:626 [G] | p:7 [GLY] | a:583 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:7 [GLY] | A:627 [C] | p:7 [GLY] | a:584 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:70 [ARG] | A:1054 [A] | p:70 [ARG] | a:1010 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:78 [ARG] | A:1055 [A] | p:78 [LYS] | a:1011 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:80 [MET] | A:1197 [C] | p:80 [ILE] | a:1153 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:80 [MET] | A:1042 [C] | p:80 [ILE] | a:998 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:84 [LYS] | A:1042 [C] | p:84 [LYS] | a:998 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:84 [LYS] | A:1041 [G] | p:84 [LYS] | a:997 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:16 [LYS] | A:1266 [G] | p:16 [LYS] | a:1228 [G] | ❌ 7K00_a:1228 no longer at interface |
O:22 [LYS] | A:596 [G] | p:22 [LYS] | a:553 [G] | ❌ 7K00_a:553 no longer at interface |
O:19 [LYS] | A:1258 [A] | p:19 [LYS] | a:1220 [G] | ❌ 7K00_a:1220 no longer at interface |
O:11 [ARG] | A:28 [A] | p:11 [ARG] | a:28 [A] | ❌ 7K00_a:28 no longer at interface |
O:13 [ARG] | A:857 [C] | p:13 [ARG] | a:812 [C] | ❌ 6S0Z_A:857 no longer at interface |
O:13 [ARG] | A:858 [U] | p:13 [ARG] | a:813 [U] | ❌ 6S0Z_A:858 no longer at interface |
O:13 [ARG] | A:1264 [A] | p:13 [ARG] | a:1226 [A] | ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface |
O:16 [LYS] | A:1264 [A] | p:16 [LYS] | a:1226 [A] | ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface |
O:33 [LYS] | A:1291 [A] | p:33 [ARG] | a:1253 [A] | ❌ 6S0Z_A:1291 no longer at interface |
O:34 [VAL] | A:2045 [A] | p:34 [VAL] | a:2018 [G] | ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface |
O:37 [GLN] | A:2045 [A] | p:37 [GLN] | a:2018 [G] | ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface |
O:47 [PHE] | A:1035 [C] | p:47 [TYR] | a:991 [C] | ❌ 6S0Z_A:1035 no longer at interface |
O:57 [PHE] | A:582 [G] | p:57 [PHE] | a:537 [G] | ❌ 6S0Z_A:582 no longer at interface |
O:59 [LYS] | A:1052 [A] | p:59 [GLN] | a:1008 [A] | ❌ 6S0Z_A:1052 no longer at interface |
O:6 [GLY] | A:628 [G] | p:6 [ARG] | a:585 [G] | ❌ 6S0Z_A:628 no longer at interface |
O:6 [GLY] | A:1288 [G] | p:6 [ARG] | a:1250 [G] | ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface |
O:40 [MET] | A:607 [C] | p:40 [ILE] | a:564 [C] | ❌ 7K00_p:40 no longer at interface |
O:40 [MET] | A:1290 [G] | p:40 [ILE] | a:1252 [G] | ❌ 7K00_p:40 no longer at interface |
O:21 [ALA] | A:19 [G] | p:21 [ALA] | a:19 [A] | ❌ 6S0Z_O:21 no longer at interface |
O:44 [GLN] | A:607 [C] | p:44 [GLN] | a:564 [C] | ❌ 6S0Z_O:44 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.97 | 1.25 | 0.63 | 0.96 | 0.97 | 0.98 | 0.95 | 0.87 | 0.85 | 0.52 | 0.30 |
Other pairs involving 6S0Z_O_A or 7K00_p_a
Total number of entries: 5
Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4Y4O_1U_1A | 6S0Z_O_A | 0.89 | 0.97 | 1.05 | 0.48 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
4Y4O_1U_1A | 7K00_p_a | 0.91 | 0.97 | 0.81 | 0.58 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_O_A | 7OF0_R_A | 0.68 | 0.96 | 2.06 | 0.25 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_O_A | 7K00_p_a | 0.87 | 0.97 | 1.25 | 0.63 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_O_A | 7RYG_P_A | 0.86 | 0.98 | 0.88 | 0.59 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |