Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 6S0Z_O
|
6S0Z_A
|
7OF0_R
|
7OF0_A
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| O:48 [ARG] | A:1200 [A] | R:55 [LYS] | A:2251 [A] | ✔ |
| O:78 [ARG] | A:1195 [A] | R:85 [ALA] | A:2246 [A] | ✔ |
| O:47 [PHE] | A:1037 [A] | R:54 [THR] | A:2144 [A] | ✔ |
| O:10 [THR] | A:626 [G] | R:17 [ARG] | A:1864 [A] | ✔ |
| O:10 [THR] | A:1289 [A] | R:17 [ARG] | A:2295 [C] | ✔ |
| O:31 [LEU] | A:560 [A] | R:38 [CYS] | A:1815 [A] | ✔ |
| O:31 [LEU] | A:561 [C] | R:38 [CYS] | A:1816 [G] | ✔ |
| O:31 [LEU] | A:623 [C] | R:38 [CYS] | A:1861 [U] | ✔ |
| O:31 [LEU] | A:624 [C] | R:38 [CYS] | A:1862 [U] | ✔ |
| O:24 [TYR] | A:578 [G] | R:31 [PHE] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:24 [TYR] | A:579 [U] | R:31 [PHE] | A:1830 [G] | ✔ |
| O:4 [VAL] | A:1237 [U] | R:12 [ASN] | A:2274 [A] | ✔ |
| O:4 [VAL] | A:1238 [U] | R:12 [ASN] | A:2275 [U] | ✔ |
| O:4 [VAL] | A:1285 [A] | R:12 [ASN] | A:2291 [A] | ✔ |
| O:4 [VAL] | A:1286 [G] | R:12 [ASN] | A:2292 [G] | ✔ |
| O:4 [VAL] | A:1287 [U] | R:12 [ASN] | A:2293 [A] | ✔ |
| O:81 [ASN] | A:1196 [C] | R:88 [GLY] | A:2247 [C] | ✔ |
| O:30 [THR] | A:559 [A] | R:37 [ARG] | A:1814 [A] | ✔ |
| O:30 [THR] | A:560 [A] | R:37 [ARG] | A:1815 [A] | ✔ |
| O:30 [THR] | A:561 [C] | R:37 [ARG] | A:1816 [G] | ✔ |
| O:49 [ASP] | A:579 [U] | R:56 [ALA] | A:1830 [G] | ✔ |
| O:49 [ASP] | A:580 [C] | R:56 [ALA] | A:1831 [G] | ✔ |
| O:36 [LYS] | A:1290 [G] | R:43 [VAL] | A:2296 [U] | ✔ |
| O:27 [SER] | A:2046 [U] | R:34 [ARG] | A:2682 [A] | ✔ |
| O:27 [SER] | A:2047 [A] | R:34 [ARG] | A:2683 [C] | ✔ |
| O:14 [ARG] | A:625 [G] | R:21 [ILE] | A:1863 [A] | ✔ |
| O:14 [ARG] | A:1290 [G] | R:21 [ILE] | A:2296 [U] | ✔ |
| O:91 [ASN] | A:1040 [A] | R:98 [ASN] | A:2147 [G] | ✔ |
| O:91 [ASN] | A:1041 [G] | R:98 [ASN] | A:2148 [A] | ✔ |
| O:53 [ARG] | A:580 [C] | R:60 [LYS] | A:1831 [G] | ✔ |
| O:53 [ARG] | A:581 [A] | R:60 [LYS] | A:1832 [A] | ✔ |
| O:53 [ARG] | A:1038 [C] | R:60 [LYS] | A:2145 [G] | ✔ |
| O:53 [ARG] | A:1039 [C] | R:60 [LYS] | A:2146 [A] | ✔ |
| O:51 [ARG] | A:1036 [C] | R:58 [TYR] | A:2143 [G] | ✔ |
| O:51 [ARG] | A:1037 [A] | R:58 [TYR] | A:2144 [A] | ✔ |
| O:51 [ARG] | A:1200 [A] | R:58 [TYR] | A:2251 [A] | ✔ |
| O:3 [ARG] | A:490 [C] | R:11 [ARG] | A:1770 [G] | ✔ |
| O:3 [ARG] | A:491 [C] | R:11 [ARG] | A:1771 [C] | ✔ |
| O:3 [ARG] | A:492 [G] | R:11 [ARG] | A:1772 [A] | ✔ |
| O:3 [ARG] | A:1238 [U] | R:11 [ARG] | A:2275 [U] | ✔ |
| O:3 [ARG] | A:1286 [G] | R:11 [ARG] | A:2292 [G] | ✔ |
| O:55 [ARG] | A:1199 [A] | R:62 [LYS] | A:2250 [A] | ✔ |
| O:32 [TYR] | A:624 [C] | R:39 [TYR] | A:1862 [U] | ✔ |
| O:32 [TYR] | A:1290 [G] | R:39 [TYR] | A:2296 [U] | ✔ |
| O:6 [GLY] | A:627 [C] | R:14 [VAL] | A:1865 [C] | ✔ |
| O:52 [GLN] | A:603 [C] | R:59 [LEU] | A:1841 [U] | ✔ |
| O:50 [ARG] | A:1037 [A] | R:57 [ARG] | A:2144 [A] | ✔ |
| O:50 [ARG] | A:1038 [C] | R:57 [ARG] | A:2145 [G] | ✔ |
| O:50 [ARG] | A:1039 [C] | R:57 [ARG] | A:2146 [A] | ✔ |
| O:80 [MET] | A:1196 [C] | R:87 [ILE] | A:2247 [C] | ✔ |
| O:77 [SER] | A:1195 [A] | R:84 [PRO] | A:2246 [A] | ✔ |
| O:77 [SER] | A:1196 [C] | R:84 [PRO] | A:2247 [C] | ✔ |
| O:13 [ARG] | A:1289 [A] | R:20 [ARG] | A:2295 [C] | ✔ |
| O:93 [LYS] | A:1039 [C] | R:100 [LYS] | A:2146 [A] | ✔ |
| O:93 [LYS] | A:1040 [A] | R:100 [LYS] | A:2147 [G] | ✔ |
| O:93 [LYS] | A:1041 [G] | R:100 [LYS] | A:2148 [A] | ✔ |
| O:62 [ILE] | A:1197 [C] | R:69 [ILE] | A:2248 [U] | ✔ |
| O:62 [ILE] | A:1198 [G] | R:69 [ILE] | A:2249 [G] | ✔ |
| O:76 [TYR] | A:1196 [C] | R:83 [TYR] | A:2247 [C] | ✔ |
| O:76 [TYR] | A:1197 [C] | R:83 [TYR] | A:2248 [U] | ✔ |
| O:57 [PHE] | A:1039 [C] | R:64 [MET] | A:2146 [A] | ✔ |
| O:46 [ALA] | A:579 [U] | R:53 [CYS] | A:1830 [G] | ✔ |
| O:46 [ALA] | A:580 [C] | R:53 [CYS] | A:1831 [G] | ✔ |
| O:2 [PRO] | A:491 [C] | R:10 [LEU] | A:1771 [C] | ✔ |
| O:2 [PRO] | A:1286 [G] | R:10 [LEU] | A:2292 [G] | ✔ |
| O:40 [MET] | A:1290 [G] | R:47 [ILE] | A:2296 [U] | ✔ |
| O:54 [LYS] | A:1038 [C] | R:61 [LYS] | A:2145 [G] | ✔ |
| O:54 [LYS] | A:1039 [C] | R:61 [LYS] | A:2146 [A] | ✔ |
| O:9 [VAL] | A:1236 [G] | R:16 [ASP] | A:2273 [A] | ✔ |
| O:9 [VAL] | A:1237 [U] | R:16 [ASP] | A:2274 [A] | ✔ |
| O:38 [GLN] | A:577 [A] | R:45 [THR] | A:1828 [A] | ✔ |
| O:38 [GLN] | A:578 [G] | R:45 [THR] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:25 [PHE] | A:577 [A] | R:32 [ARG] | A:1828 [A] | ✔ |
| O:25 [PHE] | A:578 [G] | R:32 [ARG] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:25 [PHE] | A:2048 [G] | R:32 [ARG] | A:2684 [C] | ✔ |
| O:23 [GLY] | A:578 [G] | R:30 [HIS] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:45 [TYR] | A:577 [A] | R:52 [LYS] | A:1828 [A] | ✔ |
| O:45 [TYR] | A:578 [G] | R:52 [LYS] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:45 [TYR] | A:579 [U] | R:52 [LYS] | A:1830 [G] | ✔ |
| O:45 [TYR] | A:604 [G] | R:52 [LYS] | A:1842 [A] | ✔ |
| O:5 [LYS] | A:492 [G] | R:13 [ARG] | A:1772 [A] | ✔ |
| O:5 [LYS] | A:493 [A] | R:13 [ARG] | A:1773 [A] | ✔ |
| O:5 [LYS] | A:627 [C] | R:13 [ARG] | A:1865 [C] | ✔ |
| O:5 [LYS] | A:1237 [U] | R:13 [ARG] | A:2274 [A] | ✔ |
| O:28 [LYS] | A:577 [A] | R:35 [LYS] | A:1828 [A] | ✔ |
| O:28 [LYS] | A:578 [G] | R:35 [LYS] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:28 [LYS] | A:2046 [U] | R:35 [LYS] | A:2682 [A] | ✔ |
| O:33 [LYS] | A:621 [A] | R:40 [ARG] | A:1859 [A] | ✔ |
| O:33 [LYS] | A:623 [C] | R:40 [ARG] | A:1861 [U] | ✔ |
| O:33 [LYS] | A:624 [C] | R:40 [ARG] | A:1862 [U] | ✔ |
| O:33 [LYS] | A:1290 [G] | R:40 [ARG] | A:2296 [U] | ✔ |
| O:56 [ASP] | A:602 [G] | R:63 [ASN] | A:1840 [C] | ✔ |
| O:42 [SER] | A:578 [G] | R:49 [ALA] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:42 [SER] | A:579 [U] | R:49 [ALA] | A:1830 [G] | ✔ |
| O:58 [ARG] | A:1041 [G] | R:65 [ARG] | A:2148 [A] | ✔ |
| O:58 [ARG] | A:1042 [C] | R:65 [ARG] | A:2149 [G] | ✔ |
| O:58 [ARG] | A:1197 [C] | R:65 [ARG] | A:2248 [U] | ✔ |
| O:58 [ARG] | A:1198 [G] | R:65 [ARG] | A:2249 [G] | ✔ |
| O:61 [TRP] | A:1039 [C] | R:68 [TRP] | A:2146 [A] | ✔ |
| O:61 [TRP] | A:1040 [A] | R:68 [TRP] | A:2147 [G] | ✔ |
| O:61 [TRP] | A:1041 [G] | R:68 [TRP] | A:2148 [A] | ✔ |
| O:41 [LYS] | A:577 [A] | R:48 [ARG] | A:1828 [A] | ✔ |
| O:41 [LYS] | A:578 [G] | R:48 [ARG] | A:1829 [A] | ✔ |
| O:41 [LYS] | A:606 [G] | R:48 [ARG] | A:1844 [A] | ✔ |
| O:41 [LYS] | A:607 [C] | R:48 [ARG] | A:1845 [C] | ✔ |
| O:34 [VAL] | A:2046 [U] | R:41 [LEU] | A:2682 [A] | ✔ |
| O:92 [ARG] | A:1040 [A] | R:99 [ARG] | A:2147 [G] | ✔ |
| O:92 [ARG] | A:1041 [G] | R:99 [ARG] | A:2148 [A] | ✔ |
| O:92 [ARG] | A:1042 [C] | R:99 [ARG] | A:2149 [G] | ✔ |
| O:92 [ARG] | A:1196 [C] | R:99 [ARG] | A:2247 [C] | ✔ |
| O:92 [ARG] | A:1197 [C] | R:99 [ARG] | A:2248 [U] | ✔ |
| O:37 [GLN] | A:607 [C] | R:44 [ARG] | A:1845 [C] | ✔ |
| O:37 [GLN] | A:1290 [G] | R:44 [ARG] | A:2296 [U] | ✔ |
| O:48 [ARG] | A:578 [G] | R:55 [LYS] | A:1829 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:48 [ARG] | A:602 [G] | R:55 [LYS] | A:1840 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:48 [ARG] | A:603 [C] | R:55 [LYS] | A:1841 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:48 [ARG] | A:604 [G] | R:55 [LYS] | A:1842 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:47 [PHE] | A:1036 [C] | R:54 [THR] | A:2143 [G] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:47 [PHE] | A:1200 [A] | R:54 [THR] | A:2251 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:10 [THR] | A:1290 [G] | R:17 [ARG] | A:2296 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:81 [ASN] | A:1195 [A] | R:88 [GLY] | A:2246 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:49 [ASP] | A:602 [G] | R:56 [ALA] | A:1840 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:49 [ASP] | A:603 [C] | R:56 [ALA] | A:1841 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:14 [ARG] | A:626 [G] | R:21 [ILE] | A:1864 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:14 [ARG] | A:1289 [A] | R:21 [ILE] | A:2295 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:53 [ARG] | A:1037 [A] | R:60 [LYS] | A:2144 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:3 [ARG] | A:495 [A] | R:11 [ARG] | A:1775 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:3 [ARG] | A:627 [C] | R:11 [ARG] | A:1865 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:55 [ARG] | A:1020 [G] | R:62 [LYS] | A:2127 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:55 [ARG] | A:1200 [A] | R:62 [LYS] | A:2251 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:32 [TYR] | A:625 [G] | R:39 [TYR] | A:1863 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:6 [GLY] | A:626 [G] | R:14 [VAL] | A:1864 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:52 [GLN] | A:602 [G] | R:59 [LEU] | A:1840 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:13 [ARG] | A:1290 [G] | R:20 [ARG] | A:2296 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:57 [PHE] | A:581 [A] | R:64 [MET] | A:1832 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:2 [PRO] | A:489 [A] | R:10 [LEU] | A:1769 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:2 [PRO] | A:490 [C] | R:10 [LEU] | A:1770 [G] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:2 [PRO] | A:1238 [U] | R:10 [LEU] | A:2275 [U] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:2 [PRO] | A:1239 [C] | R:10 [LEU] | A:2276 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:2 [PRO] | A:1284 [A] | R:10 [LEU] | A:2290 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:2 [PRO] | A:1285 [A] | R:10 [LEU] | A:2291 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:40 [MET] | A:607 [C] | R:47 [ILE] | A:1845 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:9 [VAL] | A:1289 [A] | R:16 [ASP] | A:2295 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:25 [PHE] | A:2047 [A] | R:32 [ARG] | A:2683 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:45 [TYR] | A:576 [U] | R:52 [LYS] | A:1827 [C] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:37 [GLN] | A:606 [G] | R:44 [ARG] | A:1844 [A] | ❌ 7OF0_R_A |
| O:2 [PRO] | A:495 [A] | R:10 [LEU] | A:1775 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:2 [PRO] | A:492 [G] | R:10 [LEU] | A:1772 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:2 [PRO] | A:627 [C] | R:10 [LEU] | A:1865 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:3 [ARG] | A:1284 [A] | R:11 [ARG] | A:2290 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:3 [ARG] | A:1285 [A] | R:11 [ARG] | A:2291 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:3 [ARG] | A:1239 [C] | R:11 [ARG] | A:2276 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:3 [ARG] | A:489 [A] | R:11 [ARG] | A:1769 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:4 [VAL] | A:1284 [A] | R:12 [ASN] | A:2290 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:5 [LYS] | A:1238 [U] | R:13 [ARG] | A:2275 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:5 [LYS] | A:626 [G] | R:13 [ARG] | A:1864 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:6 [GLY] | A:1236 [G] | R:14 [VAL] | A:2273 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:6 [GLY] | A:1289 [A] | R:14 [VAL] | A:2295 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:6 [GLY] | A:1237 [U] | R:14 [VAL] | A:2274 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:7 [GLY] | A:1237 [U] | R:15 [THR] | A:2274 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:7 [GLY] | A:1238 [U] | R:15 [THR] | A:2275 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:10 [THR] | A:627 [C] | R:17 [ARG] | A:1865 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:13 [ARG] | A:1236 [G] | R:20 [ARG] | A:2273 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:13 [ARG] | A:1237 [U] | R:20 [ARG] | A:2274 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:22 [LYS] | A:560 [A] | R:29 [ARG] | A:1815 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:23 [GLY] | A:579 [U] | R:30 [HIS] | A:1830 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:26 [GLY] | A:2047 [A] | R:33 [GLY] | A:2683 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:27 [SER] | A:561 [C] | R:34 [ARG] | A:1816 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:27 [SER] | A:623 [C] | R:34 [ARG] | A:1861 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:34 [VAL] | A:624 [C] | R:41 [LEU] | A:1862 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:34 [VAL] | A:623 [C] | R:41 [LEU] | A:1861 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:37 [GLN] | A:621 [A] | R:44 [ARG] | A:1859 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:37 [GLN] | A:623 [C] | R:44 [ARG] | A:1861 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:41 [LYS] | A:576 [U] | R:48 [ARG] | A:1827 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:41 [LYS] | A:604 [G] | R:48 [ARG] | A:1842 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:48 [ARG] | A:1020 [G] | R:55 [LYS] | A:2127 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:50 [ARG] | A:1036 [C] | R:57 [ARG] | A:2143 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:54 [LYS] | A:1037 [A] | R:61 [LYS] | A:2144 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:55 [ARG] | A:1198 [G] | R:62 [LYS] | A:2249 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:58 [ARG] | A:1040 [A] | R:65 [ARG] | A:2147 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:59 [LYS] | A:1198 [G] | R:66 [THR] | A:2249 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:80 [MET] | A:1197 [C] | R:87 [ILE] | A:2248 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
| O:47 [PHE] | A:1034 [A] | R:54 [THR] | A:2141 [U] | ❌ 7OF0_A:2141 no longer at interface |
| O:7 [GLY] | A:29 [U] | R:15 [THR] | A:1676 [A] | ❌ 7OF0_A:1676 no longer at interface |
| O:51 [ARG] | A:1034 [A] | R:58 [TYR] | A:2141 [U] | ❌ 7OF0_A:2141 no longer at interface |
| O:55 [ARG] | A:1021 [G] | R:62 [LYS] | A:2128 [G] | ❌ 7OF0_A:2128 no longer at interface |
| O:6 [GLY] | A:29 [U] | R:14 [VAL] | A:1676 [A] | ❌ 7OF0_A:1676 no longer at interface |
| O:52 [GLN] | A:1021 [G] | R:59 [LEU] | A:2128 [G] | ❌ 7OF0_A:2128 no longer at interface |
| O:11 [ARG] | A:29 [U] | R:18 [TYR] | A:1676 [A] | ❌ 7OF0_R:18, 7OF0_A:1676 no longer at interface |
| O:11 [ARG] | A:558 [A] | R:18 [TYR] | A:1813 [C] | ❌ 7OF0_R:18, 7OF0_A:1813 no longer at interface |
| O:23 [GLY] | A:597 [U] | R:30 [HIS] | A:1835 [A] | ❌ 7OF0_A:1835 no longer at interface |
| O:5 [LYS] | A:29 [U] | R:13 [ARG] | A:1676 [A] | ❌ 7OF0_A:1676 no longer at interface |
| O:41 [LYS] | A:605 [U] | R:48 [ARG] | A:1843 [U] | ❌ 7OF0_A:1843 no longer at interface |
| O:2 [PRO] | A:628 [G] | R:10 [LEU] | A:1866 [U] | ❌ 6S0Z_A:628 no longer at interface |
| O:116 [ALA] | A:1187 [A] | R:124 [ARG] | A:2243 [A] | ❌ 6S0Z_O:116, 6S0Z_A:1187 no longer at interface |
| O:116 [ALA] | A:1193 [U] | R:124 [ARG] | A:2244 [U] | ❌ 6S0Z_O:116, 6S0Z_A:1193 no longer at interface |
| O:116 [ALA] | A:1194 [U] | R:124 [ARG] | A:2245 [A] | ❌ 6S0Z_O:116, 6S0Z_A:1194 no longer at interface |
| O:117 [LEU] | A:1193 [U] | R:125 [HIS] | A:2244 [U] | ❌ 6S0Z_O:117, 6S0Z_A:1193 no longer at interface |
| O:6 [GLY] | A:1288 [G] | R:14 [VAL] | A:2294 [A] | ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface |
| O:10 [THR] | A:1288 [G] | R:17 [ARG] | A:2294 [A] | ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface |
| O:13 [ARG] | A:1288 [G] | R:20 [ARG] | A:2294 [A] | ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface |
| O:27 [SER] | A:2045 [A] | R:34 [ARG] | A:2681 [G] | ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface |
| O:27 [SER] | A:622 [A] | R:34 [ARG] | A:1860 [A] | ❌ 6S0Z_A:622 no longer at interface |
| O:33 [LYS] | A:1291 [A] | R:40 [ARG] | A:2297 [A] | ❌ 6S0Z_A:1291 no longer at interface |
| O:34 [VAL] | A:2045 [A] | R:41 [LEU] | A:2681 [G] | ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface |
| O:37 [GLN] | A:2045 [A] | R:44 [ARG] | A:2681 [G] | ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface |
| O:37 [GLN] | A:1291 [A] | R:44 [ARG] | A:2297 [A] | ❌ 6S0Z_A:1291 no longer at interface |
| O:51 [ARG] | A:1225 [G] | R:58 [TYR] | A:2262 [C] | ❌ 6S0Z_A:1225 no longer at interface |
| O:75 [SER] | A:1187 [A] | R:82 [LYS] | A:2243 [A] | ❌ 6S0Z_A:1187 no longer at interface |
| O:75 [SER] | A:1193 [U] | R:82 [LYS] | A:2244 [U] | ❌ 6S0Z_A:1193 no longer at interface |
| O:85 [LYS] | A:1195 [A] | R:92 [LYS] | A:2246 [A] | ❌ 7OF0_R:92 no longer at interface |
| O:84 [LYS] | A:1196 [C] | R:91 [VAL] | A:2247 [C] | ❌ 7OF0_R:91 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.96 | 2.06 | 0.25 | 0.92 | 0.96 | 0.96 | 0.85 | 0.68 | 0.69 | 0.30 | 0.30 |
Other pairs involving 6S0Z_O_A or 7OF0_R_A
Total number of entries: 6
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4Y4O_1U_1A | 7OF0_R_A | 0.69 | 0.97 | 1.77 | 0.27 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 4Y4O_1U_1A | 6S0Z_O_A | 0.89 | 0.97 | 1.05 | 0.48 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 7OF0_R_A | 7RYG_P_A | 0.70 | 0.93 | 2.23 | 0.29 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_O_A | 7OF0_R_A | 0.68 | 0.96 | 2.06 | 0.25 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_O_A | 7K00_p_a | 0.87 | 0.97 | 1.25 | 0.63 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_O_A | 7RYG_P_A | 0.86 | 0.98 | 0.88 | 0.59 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |