RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group82 > 6S0Z_O_A vs 7RYG_P_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0Z_O
6S0Z_A
7RYG_P
7RYG_A
Conserved?
O:48 [ARG] A:578 [G] P:48 [ARG] A:532 [G]
O:48 [ARG] A:602 [G] P:48 [ARG] A:557 [G]
O:48 [ARG] A:603 [C] P:48 [ARG] A:558 [C]
O:48 [ARG] A:604 [G] P:48 [ARG] A:559 [G]
O:48 [ARG] A:1200 [A] P:48 [ARG] A:1154 [A]
O:78 [ARG] A:1195 [A] P:78 [ARG] A:1149 [G]
O:47 [PHE] A:1034 [A] P:47 [TYR] A:987 [A]
O:47 [PHE] A:1036 [C] P:47 [TYR] A:989 [C]
O:47 [PHE] A:1037 [A] P:47 [TYR] A:990 [G]
O:47 [PHE] A:1200 [A] P:47 [TYR] A:1154 [A]
O:7 [GLY] A:29 [U] P:7 [GLY] A:36 [U]
O:10 [THR] A:626 [G] P:10 [ALA] A:581 [G]
O:10 [THR] A:1289 [A] P:10 [ALA] A:1246 [C]
O:8 [THR] A:29 [U] P:8 [VAL] A:36 [U]
O:8 [THR] A:30 [G] P:8 [VAL] A:37 [G]
O:8 [THR] A:1253 [G] P:8 [VAL] A:1210 [G]
O:8 [THR] A:1254 [C] P:8 [VAL] A:1211 [G]
O:31 [LEU] A:560 [A] P:31 [VAL] A:514 [A]
O:31 [LEU] A:561 [C] P:31 [VAL] A:515 [C]
O:31 [LEU] A:623 [C] P:31 [VAL] A:578 [U]
O:31 [LEU] A:624 [C] P:31 [VAL] A:579 [C]
O:24 [TYR] A:18 [C] P:24 [TYR] A:25 [C]
O:24 [TYR] A:19 [G] P:24 [TYR] A:26 [A]
O:24 [TYR] A:578 [G] P:24 [TYR] A:532 [G]
O:24 [TYR] A:579 [U] P:24 [TYR] A:533 [U]
O:4 [VAL] A:1237 [U] P:4 [VAL] A:1193 [U]
O:4 [VAL] A:1238 [U] P:4 [VAL] A:1194 [U]
O:4 [VAL] A:1285 [A] P:4 [VAL] A:1242 [A]
O:4 [VAL] A:1286 [G] P:4 [VAL] A:1243 [G]
O:4 [VAL] A:1287 [U] P:4 [VAL] A:1244 [U]
O:81 [ASN] A:1195 [A] P:81 [ASP] A:1149 [G]
O:81 [ASN] A:1196 [C] P:81 [ASP] A:1150 [C]
O:30 [THR] A:560 [A] P:30 [ARG] A:514 [A]
O:30 [THR] A:561 [C] P:30 [ARG] A:515 [C]
O:75 [SER] A:1055 [A] P:75 [SER] A:1008 [A]
O:75 [SER] A:1056 [U] P:75 [SER] A:1009 [U]
O:49 [ASP] A:579 [U] P:49 [ASP] A:533 [U]
O:49 [ASP] A:580 [C] P:49 [ASP] A:534 [G]
O:49 [ASP] A:602 [G] P:49 [ASP] A:557 [G]
O:49 [ASP] A:603 [C] P:49 [ASP] A:558 [C]
O:36 [LYS] A:1290 [G] P:36 [PHE] A:1247 [G]
O:85 [LYS] A:1195 [A] P:85 [LYS] A:1149 [G]
O:27 [SER] A:2046 [U] P:27 [ALA] A:2015 [A]
O:27 [SER] A:2047 [A] P:27 [ALA] A:2016 [A]
O:16 [LYS] A:1265 [G] P:16 [LYS] A:1222 [A]
O:14 [ARG] A:625 [G] P:14 [HIS] A:580 [A]
O:14 [ARG] A:1290 [G] P:14 [HIS] A:1247 [G]
O:91 [ASN] A:1040 [A] P:91 [ASP] A:993 [A]
O:91 [ASN] A:1041 [G] P:91 [ASP] A:994 [G]
O:53 [ARG] A:580 [C] P:53 [LYS] A:534 [G]
O:53 [ARG] A:581 [A] P:53 [LYS] A:535 [G]
O:53 [ARG] A:1039 [C] P:53 [LYS] A:992 [C]
O:51 [ARG] A:1034 [A] P:51 [ARG] A:987 [A]
O:51 [ARG] A:1036 [C] P:51 [ARG] A:989 [C]
O:51 [ARG] A:1037 [A] P:51 [ARG] A:990 [G]
O:51 [ARG] A:1200 [A] P:51 [ARG] A:1154 [A]
O:29 [HIS] A:18 [C] P:29 [SER] A:25 [C]
O:29 [HIS] A:19 [G] P:29 [SER] A:26 [A]
O:3 [ARG] A:491 [C] P:3 [ARG] A:444 [C]
O:3 [ARG] A:492 [G] P:3 [ARG] A:445 [G]
O:3 [ARG] A:495 [A] P:3 [ARG] A:448 [A]
O:3 [ARG] A:627 [C] P:3 [ARG] A:582 [C]
O:3 [ARG] A:1238 [U] P:3 [ARG] A:1194 [U]
O:3 [ARG] A:1286 [G] P:3 [ARG] A:1243 [G]
O:66 [ASN] A:1054 [A] P:66 [ASN] A:1007 [A]
O:66 [ASN] A:1055 [A] P:66 [ASN] A:1008 [A]
O:55 [ARG] A:1020 [G] P:55 [ARG] A:973 [G]
O:55 [ARG] A:1021 [G] P:55 [ARG] A:974 [G]
O:55 [ARG] A:1199 [A] P:55 [ARG] A:1153 [A]
O:55 [ARG] A:1200 [A] P:55 [ARG] A:1154 [A]
O:22 [LYS] A:19 [G] P:22 [LYS] A:26 [A]
O:22 [LYS] A:20 [C] P:22 [LYS] A:27 [U]
O:22 [LYS] A:1257 [G] P:22 [LYS] A:1214 [U]
O:32 [TYR] A:624 [C] P:32 [TYR] A:579 [C]
O:32 [TYR] A:1290 [G] P:32 [TYR] A:1247 [G]
O:6 [GLY] A:626 [G] P:6 [ARG] A:581 [G]
O:6 [GLY] A:627 [C] P:6 [ARG] A:582 [C]
O:52 [GLN] A:602 [G] P:52 [GLN] A:557 [G]
O:52 [GLN] A:603 [C] P:52 [GLN] A:558 [C]
O:50 [ARG] A:1037 [A] P:50 [ARG] A:990 [G]
O:50 [ARG] A:1038 [C] P:50 [ARG] A:991 [C]
O:50 [ARG] A:1039 [C] P:50 [ARG] A:992 [C]
O:80 [MET] A:1196 [C] P:80 [ILE] A:1150 [C]
O:77 [SER] A:1054 [A] P:77 [SER] A:1007 [A]
O:77 [SER] A:1055 [A] P:77 [SER] A:1008 [A]
O:77 [SER] A:1195 [A] P:77 [SER] A:1149 [G]
O:77 [SER] A:1196 [C] P:77 [SER] A:1150 [C]
O:13 [ARG] A:1265 [G] P:13 [ARG] A:1222 [A]
O:13 [ARG] A:1289 [A] P:13 [ARG] A:1246 [C]
O:15 [LYS] A:1255 [A] P:15 [LYS] A:1212 [U]
O:15 [LYS] A:1256 [U] P:15 [LYS] A:1213 [G]
O:93 [LYS] A:1039 [C] P:93 [ARG] A:992 [C]
O:93 [LYS] A:1040 [A] P:93 [ARG] A:993 [A]
O:93 [LYS] A:1041 [G] P:93 [ARG] A:994 [G]
O:62 [ILE] A:1053 [A] P:62 [ILE] A:1006 [A]
O:62 [ILE] A:1054 [A] P:62 [ILE] A:1007 [A]
O:62 [ILE] A:1197 [C] P:62 [ILE] A:1151 [C]
O:62 [ILE] A:1198 [G] P:62 [ILE] A:1152 [G]
O:76 [TYR] A:1054 [A] P:76 [TYR] A:1007 [A]
O:76 [TYR] A:1055 [A] P:76 [TYR] A:1008 [A]
O:76 [TYR] A:1196 [C] P:76 [TYR] A:1150 [C]
O:76 [TYR] A:1197 [C] P:76 [TYR] A:1151 [C]
O:11 [ARG] A:558 [A] P:11 [HIS] A:512 [A]
O:11 [ARG] A:1254 [C] P:11 [HIS] A:1211 [G]
O:11 [ARG] A:1255 [A] P:11 [HIS] A:1212 [U]
O:84 [LYS] A:1196 [C] P:84 [LYS] A:1150 [C]
O:57 [PHE] A:581 [A] P:57 [PHE] A:535 [G]
O:57 [PHE] A:1039 [C] P:57 [PHE] A:992 [C]
O:46 [ALA] A:579 [U] P:46 [ALA] A:533 [U]
O:46 [ALA] A:580 [C] P:46 [ALA] A:534 [G]
O:2 [PRO] A:490 [C] P:2 [ALA] A:443 [C]
O:2 [PRO] A:491 [C] P:2 [ALA] A:444 [C]
O:2 [PRO] A:1238 [U] P:2 [ALA] A:1194 [U]
O:2 [PRO] A:1239 [C] P:2 [ALA] A:1195 [C]
O:2 [PRO] A:1284 [A] P:2 [ALA] A:1241 [A]
O:2 [PRO] A:1285 [A] P:2 [ALA] A:1242 [A]
O:2 [PRO] A:1286 [G] P:2 [ALA] A:1243 [G]
O:54 [LYS] A:1038 [C] P:54 [LYS] A:991 [C]
O:54 [LYS] A:1039 [C] P:54 [LYS] A:992 [C]
O:9 [VAL] A:1236 [G] P:9 [VAL] A:1192 [G]
O:9 [VAL] A:1237 [U] P:9 [VAL] A:1193 [U]
O:38 [GLN] A:578 [G] P:38 [ALA] A:532 [G]
O:26 [GLY] A:17 [G] P:26 [GLY] A:24 [G]
O:26 [GLY] A:18 [C] P:26 [GLY] A:25 [C]
O:70 [ARG] A:1055 [A] P:70 [ARG] A:1008 [A]
O:70 [ARG] A:1056 [U] P:70 [ARG] A:1009 [U]
O:25 [PHE] A:17 [G] P:25 [TYR] A:24 [G]
O:25 [PHE] A:18 [C] P:25 [TYR] A:25 [C]
O:25 [PHE] A:577 [A] P:25 [TYR] A:531 [A]
O:25 [PHE] A:578 [G] P:25 [TYR] A:532 [G]
O:25 [PHE] A:2047 [A] P:25 [TYR] A:2016 [A]
O:25 [PHE] A:2048 [G] P:25 [TYR] A:2017 [A]
O:23 [GLY] A:18 [C] P:23 [GLY] A:25 [C]
O:23 [GLY] A:19 [G] P:23 [GLY] A:26 [A]
O:23 [GLY] A:578 [G] P:23 [GLY] A:532 [G]
O:45 [TYR] A:577 [A] P:45 [TYR] A:531 [A]
O:45 [TYR] A:578 [G] P:45 [TYR] A:532 [G]
O:45 [TYR] A:579 [U] P:45 [TYR] A:533 [U]
O:45 [TYR] A:604 [G] P:45 [TYR] A:559 [G]
O:5 [LYS] A:29 [U] P:5 [LYS] A:36 [U]
O:5 [LYS] A:30 [G] P:5 [LYS] A:37 [G]
O:5 [LYS] A:492 [G] P:5 [LYS] A:445 [G]
O:5 [LYS] A:493 [A] P:5 [LYS] A:446 [A]
O:5 [LYS] A:627 [C] P:5 [LYS] A:582 [C]
O:5 [LYS] A:1237 [U] P:5 [LYS] A:1193 [U]
O:28 [LYS] A:577 [A] P:28 [ARG] A:531 [A]
O:28 [LYS] A:578 [G] P:28 [ARG] A:532 [G]
O:28 [LYS] A:2046 [U] P:28 [ARG] A:2015 [A]
O:33 [LYS] A:621 [A] P:33 [ARG] A:576 [G]
O:33 [LYS] A:623 [C] P:33 [ARG] A:578 [U]
O:33 [LYS] A:624 [C] P:33 [ARG] A:579 [C]
O:33 [LYS] A:1290 [G] P:33 [ARG] A:1247 [G]
O:56 [ASP] A:602 [G] P:56 [GLN] A:557 [G]
O:59 [LYS] A:1053 [A] P:59 [ALA] A:1006 [A]
O:42 [SER] A:578 [G] P:42 [ALA] A:532 [G]
O:42 [SER] A:579 [U] P:42 [ALA] A:533 [U]
O:58 [ARG] A:1041 [G] P:58 [ARG] A:994 [G]
O:58 [ARG] A:1042 [C] P:58 [ARG] A:995 [C]
O:58 [ARG] A:1197 [C] P:58 [ARG] A:1151 [C]
O:58 [ARG] A:1198 [G] P:58 [ARG] A:1152 [G]
O:61 [TRP] A:1039 [C] P:61 [TRP] A:992 [C]
O:61 [TRP] A:1040 [A] P:61 [TRP] A:993 [A]
O:61 [TRP] A:1041 [G] P:61 [TRP] A:994 [G]
O:41 [LYS] A:577 [A] P:41 [LYS] A:531 [A]
O:41 [LYS] A:578 [G] P:41 [LYS] A:532 [G]
O:41 [LYS] A:606 [G] P:41 [LYS] A:561 [A]
O:41 [LYS] A:607 [C] P:41 [LYS] A:562 [C]
O:34 [VAL] A:2046 [U] P:34 [VAL] A:2015 [A]
O:92 [ARG] A:1040 [A] P:92 [ARG] A:993 [A]
O:92 [ARG] A:1041 [G] P:92 [ARG] A:994 [G]
O:92 [ARG] A:1042 [C] P:92 [ARG] A:995 [C]
O:92 [ARG] A:1197 [C] P:92 [ARG] A:1151 [C]
O:63 [THR] A:1054 [A] P:63 [ALA] A:1007 [A]
O:37 [GLN] A:606 [G] P:37 [GLN] A:561 [A]
O:37 [GLN] A:607 [C] P:37 [GLN] A:562 [C]
O:37 [GLN] A:1290 [G] P:37 [GLN] A:1247 [G]
O:7 [GLY] A:30 [G] P:7 [GLY] A:37 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:10 [THR] A:1290 [G] P:10 [ALA] A:1247 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:16 [LYS] A:1266 [G] P:16 [LYS] A:1223 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:14 [ARG] A:626 [G] P:14 [HIS] A:581 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:14 [ARG] A:1289 [A] P:14 [HIS] A:1246 [C] ❌ 7RYG_P_A
O:53 [ARG] A:1037 [A] P:53 [LYS] A:990 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:53 [ARG] A:1038 [C] P:53 [LYS] A:991 [C] ❌ 7RYG_P_A
O:3 [ARG] A:490 [C] P:3 [ARG] A:443 [C] ❌ 7RYG_P_A
O:32 [TYR] A:625 [G] P:32 [TYR] A:580 [A] ❌ 7RYG_P_A
O:6 [GLY] A:29 [U] P:6 [ARG] A:36 [U] ❌ 7RYG_P_A
O:52 [GLN] A:1021 [G] P:52 [GLN] A:974 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:13 [ARG] A:1290 [G] P:13 [ARG] A:1247 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:11 [ARG] A:29 [U] P:11 [HIS] A:36 [U] ❌ 7RYG_P_A
O:11 [ARG] A:1253 [G] P:11 [HIS] A:1210 [G] ❌ 7RYG_P_A
O:9 [VAL] A:1289 [A] P:9 [VAL] A:1246 [C] ❌ 7RYG_P_A
O:38 [GLN] A:577 [A] P:38 [ALA] A:531 [A] ❌ 7RYG_P_A
O:45 [TYR] A:576 [U] P:45 [TYR] A:530 [C] ❌ 7RYG_P_A
O:92 [ARG] A:1196 [C] P:92 [ARG] A:1150 [C] ❌ 7RYG_P_A
O:63 [THR] A:1053 [A] P:63 [ALA] A:1006 [A] ❌ 7RYG_P_A
O:11 [ARG] A:626 [G] P:11 [HIS] A:581 [G] ❌ 6S0Z_O_A
O:2 [PRO] A:1287 [U] P:2 [ALA] A:1244 [U] ❌ 6S0Z_O_A
O:26 [GLY] A:2047 [A] P:26 [GLY] A:2016 [A] ❌ 6S0Z_O_A
O:28 [LYS] A:576 [U] P:28 [ARG] A:530 [C] ❌ 6S0Z_O_A
O:30 [THR] A:18 [C] P:30 [ARG] A:25 [C] ❌ 6S0Z_O_A
O:37 [GLN] A:621 [A] P:37 [GLN] A:576 [G] ❌ 6S0Z_O_A
O:4 [VAL] A:627 [C] P:4 [VAL] A:582 [C] ❌ 6S0Z_O_A
O:48 [ARG] A:579 [U] P:48 [ARG] A:533 [U] ❌ 6S0Z_O_A
O:49 [ASP] A:578 [G] P:49 [ASP] A:532 [G] ❌ 6S0Z_O_A
O:56 [ASP] A:580 [C] P:56 [GLN] A:534 [G] ❌ 6S0Z_O_A
O:6 [GLY] A:1289 [A] P:6 [ARG] A:1246 [C] ❌ 6S0Z_O_A
O:7 [GLY] A:627 [C] P:7 [GLY] A:582 [C] ❌ 6S0Z_O_A
O:7 [GLY] A:626 [G] P:7 [GLY] A:581 [G] ❌ 6S0Z_O_A
O:78 [ARG] A:1055 [A] P:78 [ARG] A:1008 [A] ❌ 6S0Z_O_A
O:80 [MET] A:1197 [C] P:80 [ILE] A:1151 [C] ❌ 6S0Z_O_A
O:84 [LYS] A:1041 [G] P:84 [LYS] A:994 [G] ❌ 6S0Z_O_A
O:84 [LYS] A:1042 [C] P:84 [LYS] A:995 [C] ❌ 6S0Z_O_A
O:9 [VAL] A:1265 [G] P:9 [VAL] A:1222 [A] ❌ 6S0Z_O_A
O:30 [THR] A:559 [A] P:30 [ARG] A:513 [A] ❌ 7RYG_A:513 no longer at interface
O:22 [LYS] A:596 [G] P:22 [LYS] A:551 [G] ❌ 7RYG_A:551 no longer at interface
O:19 [LYS] A:1258 [A] P:19 [ALA] A:1215 [G] ❌ 7RYG_P:19, 7RYG_A:1215 no longer at interface
O:11 [ARG] A:28 [A] P:11 [HIS] A:35 [A] ❌ 7RYG_A:35 no longer at interface
O:2 [PRO] A:489 [A] P:2 [ALA] A:442 [A] ❌ 7RYG_A:442 no longer at interface
O:23 [GLY] A:597 [U] P:23 [GLY] A:552 [U] ❌ 7RYG_A:552 no longer at interface
O:41 [LYS] A:605 [U] P:41 [LYS] A:560 [U] ❌ 7RYG_A:560 no longer at interface
O:13 [ARG] A:1264 [A] P:13 [ARG] A:1221 [A] ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface
O:13 [ARG] A:857 [C] P:13 [ARG] A:810 [C] ❌ 6S0Z_A:857 no longer at interface
O:13 [ARG] A:1288 [G] P:13 [ARG] A:1245 [G] ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface
O:16 [LYS] A:1264 [A] P:16 [LYS] A:1221 [A] ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface
O:33 [LYS] A:1291 [A] P:33 [ARG] A:1248 [A] ❌ 6S0Z_A:1291 no longer at interface
O:34 [VAL] A:2045 [A] P:34 [VAL] A:2014 [G] ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface
O:37 [GLN] A:2045 [A] P:37 [GLN] A:2014 [G] ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface
O:57 [PHE] A:582 [G] P:57 [PHE] A:536 [G] ❌ 6S0Z_A:582 no longer at interface
O:6 [GLY] A:628 [G] P:6 [ARG] A:583 [G] ❌ 6S0Z_A:628 no longer at interface
O:6 [GLY] A:1288 [G] P:6 [ARG] A:1245 [G] ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface
O:78 [ARG] A:1194 [U] P:78 [ARG] A:1148 [U] ❌ 6S0Z_A:1194 no longer at interface
O:78 [ARG] A:1057 [A] P:78 [ARG] A:1010 [C] ❌ 6S0Z_A:1057 no longer at interface
O:19 [LYS] A:1256 [U] P:19 [ALA] A:1213 [G] ❌ 7RYG_P:19 no longer at interface
O:19 [LYS] A:1257 [G] P:19 [ALA] A:1214 [U] ❌ 7RYG_P:19 no longer at interface
O:40 [MET] A:607 [C] P:40 [ILE] A:562 [C] ❌ 7RYG_P:40 no longer at interface
O:40 [MET] A:1290 [G] P:40 [ILE] A:1247 [G] ❌ 7RYG_P:40 no longer at interface
O:12 [ALA] A:1236 [G] P:12 [ARG] A:1192 [G] ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface
O:12 [ALA] A:1265 [G] P:12 [ARG] A:1222 [A] ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface
O:12 [ALA] A:1266 [G] P:12 [ARG] A:1223 [G] ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.98 0.88 0.59 0.97 0.98 0.98 0.91 0.86 0.86 0.45 0.41


Other pairs involving 6S0Z_O_A or 7RYG_P_A

Total number of entries: 6