Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6S0Z_O
|
6S0Z_A
|
7RYG_P
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
O:48 [ARG] | A:578 [G] | P:48 [ARG] | A:532 [G] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:602 [G] | P:48 [ARG] | A:557 [G] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:603 [C] | P:48 [ARG] | A:558 [C] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:604 [G] | P:48 [ARG] | A:559 [G] | ✔ |
O:48 [ARG] | A:1200 [A] | P:48 [ARG] | A:1154 [A] | ✔ |
O:78 [ARG] | A:1195 [A] | P:78 [ARG] | A:1149 [G] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1034 [A] | P:47 [TYR] | A:987 [A] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1036 [C] | P:47 [TYR] | A:989 [C] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1037 [A] | P:47 [TYR] | A:990 [G] | ✔ |
O:47 [PHE] | A:1200 [A] | P:47 [TYR] | A:1154 [A] | ✔ |
O:7 [GLY] | A:29 [U] | P:7 [GLY] | A:36 [U] | ✔ |
O:10 [THR] | A:626 [G] | P:10 [ALA] | A:581 [G] | ✔ |
O:10 [THR] | A:1289 [A] | P:10 [ALA] | A:1246 [C] | ✔ |
O:8 [THR] | A:29 [U] | P:8 [VAL] | A:36 [U] | ✔ |
O:8 [THR] | A:30 [G] | P:8 [VAL] | A:37 [G] | ✔ |
O:8 [THR] | A:1253 [G] | P:8 [VAL] | A:1210 [G] | ✔ |
O:8 [THR] | A:1254 [C] | P:8 [VAL] | A:1211 [G] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:560 [A] | P:31 [VAL] | A:514 [A] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:561 [C] | P:31 [VAL] | A:515 [C] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:623 [C] | P:31 [VAL] | A:578 [U] | ✔ |
O:31 [LEU] | A:624 [C] | P:31 [VAL] | A:579 [C] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:18 [C] | P:24 [TYR] | A:25 [C] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:19 [G] | P:24 [TYR] | A:26 [A] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:578 [G] | P:24 [TYR] | A:532 [G] | ✔ |
O:24 [TYR] | A:579 [U] | P:24 [TYR] | A:533 [U] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1237 [U] | P:4 [VAL] | A:1193 [U] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1238 [U] | P:4 [VAL] | A:1194 [U] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1285 [A] | P:4 [VAL] | A:1242 [A] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1286 [G] | P:4 [VAL] | A:1243 [G] | ✔ |
O:4 [VAL] | A:1287 [U] | P:4 [VAL] | A:1244 [U] | ✔ |
O:81 [ASN] | A:1195 [A] | P:81 [ASP] | A:1149 [G] | ✔ |
O:81 [ASN] | A:1196 [C] | P:81 [ASP] | A:1150 [C] | ✔ |
O:30 [THR] | A:560 [A] | P:30 [ARG] | A:514 [A] | ✔ |
O:30 [THR] | A:561 [C] | P:30 [ARG] | A:515 [C] | ✔ |
O:75 [SER] | A:1055 [A] | P:75 [SER] | A:1008 [A] | ✔ |
O:75 [SER] | A:1056 [U] | P:75 [SER] | A:1009 [U] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:579 [U] | P:49 [ASP] | A:533 [U] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:580 [C] | P:49 [ASP] | A:534 [G] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:602 [G] | P:49 [ASP] | A:557 [G] | ✔ |
O:49 [ASP] | A:603 [C] | P:49 [ASP] | A:558 [C] | ✔ |
O:36 [LYS] | A:1290 [G] | P:36 [PHE] | A:1247 [G] | ✔ |
O:85 [LYS] | A:1195 [A] | P:85 [LYS] | A:1149 [G] | ✔ |
O:27 [SER] | A:2046 [U] | P:27 [ALA] | A:2015 [A] | ✔ |
O:27 [SER] | A:2047 [A] | P:27 [ALA] | A:2016 [A] | ✔ |
O:16 [LYS] | A:1265 [G] | P:16 [LYS] | A:1222 [A] | ✔ |
O:14 [ARG] | A:625 [G] | P:14 [HIS] | A:580 [A] | ✔ |
O:14 [ARG] | A:1290 [G] | P:14 [HIS] | A:1247 [G] | ✔ |
O:91 [ASN] | A:1040 [A] | P:91 [ASP] | A:993 [A] | ✔ |
O:91 [ASN] | A:1041 [G] | P:91 [ASP] | A:994 [G] | ✔ |
O:53 [ARG] | A:580 [C] | P:53 [LYS] | A:534 [G] | ✔ |
O:53 [ARG] | A:581 [A] | P:53 [LYS] | A:535 [G] | ✔ |
O:53 [ARG] | A:1039 [C] | P:53 [LYS] | A:992 [C] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1034 [A] | P:51 [ARG] | A:987 [A] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1036 [C] | P:51 [ARG] | A:989 [C] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1037 [A] | P:51 [ARG] | A:990 [G] | ✔ |
O:51 [ARG] | A:1200 [A] | P:51 [ARG] | A:1154 [A] | ✔ |
O:29 [HIS] | A:18 [C] | P:29 [SER] | A:25 [C] | ✔ |
O:29 [HIS] | A:19 [G] | P:29 [SER] | A:26 [A] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:491 [C] | P:3 [ARG] | A:444 [C] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:492 [G] | P:3 [ARG] | A:445 [G] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:495 [A] | P:3 [ARG] | A:448 [A] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:627 [C] | P:3 [ARG] | A:582 [C] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:1238 [U] | P:3 [ARG] | A:1194 [U] | ✔ |
O:3 [ARG] | A:1286 [G] | P:3 [ARG] | A:1243 [G] | ✔ |
O:66 [ASN] | A:1054 [A] | P:66 [ASN] | A:1007 [A] | ✔ |
O:66 [ASN] | A:1055 [A] | P:66 [ASN] | A:1008 [A] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1020 [G] | P:55 [ARG] | A:973 [G] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1021 [G] | P:55 [ARG] | A:974 [G] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1199 [A] | P:55 [ARG] | A:1153 [A] | ✔ |
O:55 [ARG] | A:1200 [A] | P:55 [ARG] | A:1154 [A] | ✔ |
O:22 [LYS] | A:19 [G] | P:22 [LYS] | A:26 [A] | ✔ |
O:22 [LYS] | A:20 [C] | P:22 [LYS] | A:27 [U] | ✔ |
O:22 [LYS] | A:1257 [G] | P:22 [LYS] | A:1214 [U] | ✔ |
O:32 [TYR] | A:624 [C] | P:32 [TYR] | A:579 [C] | ✔ |
O:32 [TYR] | A:1290 [G] | P:32 [TYR] | A:1247 [G] | ✔ |
O:6 [GLY] | A:626 [G] | P:6 [ARG] | A:581 [G] | ✔ |
O:6 [GLY] | A:627 [C] | P:6 [ARG] | A:582 [C] | ✔ |
O:52 [GLN] | A:602 [G] | P:52 [GLN] | A:557 [G] | ✔ |
O:52 [GLN] | A:603 [C] | P:52 [GLN] | A:558 [C] | ✔ |
O:50 [ARG] | A:1037 [A] | P:50 [ARG] | A:990 [G] | ✔ |
O:50 [ARG] | A:1038 [C] | P:50 [ARG] | A:991 [C] | ✔ |
O:50 [ARG] | A:1039 [C] | P:50 [ARG] | A:992 [C] | ✔ |
O:80 [MET] | A:1196 [C] | P:80 [ILE] | A:1150 [C] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1054 [A] | P:77 [SER] | A:1007 [A] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1055 [A] | P:77 [SER] | A:1008 [A] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1195 [A] | P:77 [SER] | A:1149 [G] | ✔ |
O:77 [SER] | A:1196 [C] | P:77 [SER] | A:1150 [C] | ✔ |
O:13 [ARG] | A:1265 [G] | P:13 [ARG] | A:1222 [A] | ✔ |
O:13 [ARG] | A:1289 [A] | P:13 [ARG] | A:1246 [C] | ✔ |
O:15 [LYS] | A:1255 [A] | P:15 [LYS] | A:1212 [U] | ✔ |
O:15 [LYS] | A:1256 [U] | P:15 [LYS] | A:1213 [G] | ✔ |
O:93 [LYS] | A:1039 [C] | P:93 [ARG] | A:992 [C] | ✔ |
O:93 [LYS] | A:1040 [A] | P:93 [ARG] | A:993 [A] | ✔ |
O:93 [LYS] | A:1041 [G] | P:93 [ARG] | A:994 [G] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1053 [A] | P:62 [ILE] | A:1006 [A] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1054 [A] | P:62 [ILE] | A:1007 [A] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1197 [C] | P:62 [ILE] | A:1151 [C] | ✔ |
O:62 [ILE] | A:1198 [G] | P:62 [ILE] | A:1152 [G] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1054 [A] | P:76 [TYR] | A:1007 [A] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1055 [A] | P:76 [TYR] | A:1008 [A] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1196 [C] | P:76 [TYR] | A:1150 [C] | ✔ |
O:76 [TYR] | A:1197 [C] | P:76 [TYR] | A:1151 [C] | ✔ |
O:11 [ARG] | A:558 [A] | P:11 [HIS] | A:512 [A] | ✔ |
O:11 [ARG] | A:1254 [C] | P:11 [HIS] | A:1211 [G] | ✔ |
O:11 [ARG] | A:1255 [A] | P:11 [HIS] | A:1212 [U] | ✔ |
O:84 [LYS] | A:1196 [C] | P:84 [LYS] | A:1150 [C] | ✔ |
O:57 [PHE] | A:581 [A] | P:57 [PHE] | A:535 [G] | ✔ |
O:57 [PHE] | A:1039 [C] | P:57 [PHE] | A:992 [C] | ✔ |
O:46 [ALA] | A:579 [U] | P:46 [ALA] | A:533 [U] | ✔ |
O:46 [ALA] | A:580 [C] | P:46 [ALA] | A:534 [G] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:490 [C] | P:2 [ALA] | A:443 [C] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:491 [C] | P:2 [ALA] | A:444 [C] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1238 [U] | P:2 [ALA] | A:1194 [U] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1239 [C] | P:2 [ALA] | A:1195 [C] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1284 [A] | P:2 [ALA] | A:1241 [A] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1285 [A] | P:2 [ALA] | A:1242 [A] | ✔ |
O:2 [PRO] | A:1286 [G] | P:2 [ALA] | A:1243 [G] | ✔ |
O:54 [LYS] | A:1038 [C] | P:54 [LYS] | A:991 [C] | ✔ |
O:54 [LYS] | A:1039 [C] | P:54 [LYS] | A:992 [C] | ✔ |
O:9 [VAL] | A:1236 [G] | P:9 [VAL] | A:1192 [G] | ✔ |
O:9 [VAL] | A:1237 [U] | P:9 [VAL] | A:1193 [U] | ✔ |
O:38 [GLN] | A:578 [G] | P:38 [ALA] | A:532 [G] | ✔ |
O:26 [GLY] | A:17 [G] | P:26 [GLY] | A:24 [G] | ✔ |
O:26 [GLY] | A:18 [C] | P:26 [GLY] | A:25 [C] | ✔ |
O:70 [ARG] | A:1055 [A] | P:70 [ARG] | A:1008 [A] | ✔ |
O:70 [ARG] | A:1056 [U] | P:70 [ARG] | A:1009 [U] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:17 [G] | P:25 [TYR] | A:24 [G] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:18 [C] | P:25 [TYR] | A:25 [C] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:577 [A] | P:25 [TYR] | A:531 [A] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:578 [G] | P:25 [TYR] | A:532 [G] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:2047 [A] | P:25 [TYR] | A:2016 [A] | ✔ |
O:25 [PHE] | A:2048 [G] | P:25 [TYR] | A:2017 [A] | ✔ |
O:23 [GLY] | A:18 [C] | P:23 [GLY] | A:25 [C] | ✔ |
O:23 [GLY] | A:19 [G] | P:23 [GLY] | A:26 [A] | ✔ |
O:23 [GLY] | A:578 [G] | P:23 [GLY] | A:532 [G] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:577 [A] | P:45 [TYR] | A:531 [A] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:578 [G] | P:45 [TYR] | A:532 [G] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:579 [U] | P:45 [TYR] | A:533 [U] | ✔ |
O:45 [TYR] | A:604 [G] | P:45 [TYR] | A:559 [G] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:29 [U] | P:5 [LYS] | A:36 [U] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:30 [G] | P:5 [LYS] | A:37 [G] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:492 [G] | P:5 [LYS] | A:445 [G] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:493 [A] | P:5 [LYS] | A:446 [A] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:627 [C] | P:5 [LYS] | A:582 [C] | ✔ |
O:5 [LYS] | A:1237 [U] | P:5 [LYS] | A:1193 [U] | ✔ |
O:28 [LYS] | A:577 [A] | P:28 [ARG] | A:531 [A] | ✔ |
O:28 [LYS] | A:578 [G] | P:28 [ARG] | A:532 [G] | ✔ |
O:28 [LYS] | A:2046 [U] | P:28 [ARG] | A:2015 [A] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:621 [A] | P:33 [ARG] | A:576 [G] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:623 [C] | P:33 [ARG] | A:578 [U] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:624 [C] | P:33 [ARG] | A:579 [C] | ✔ |
O:33 [LYS] | A:1290 [G] | P:33 [ARG] | A:1247 [G] | ✔ |
O:56 [ASP] | A:602 [G] | P:56 [GLN] | A:557 [G] | ✔ |
O:59 [LYS] | A:1053 [A] | P:59 [ALA] | A:1006 [A] | ✔ |
O:42 [SER] | A:578 [G] | P:42 [ALA] | A:532 [G] | ✔ |
O:42 [SER] | A:579 [U] | P:42 [ALA] | A:533 [U] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1041 [G] | P:58 [ARG] | A:994 [G] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1042 [C] | P:58 [ARG] | A:995 [C] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1197 [C] | P:58 [ARG] | A:1151 [C] | ✔ |
O:58 [ARG] | A:1198 [G] | P:58 [ARG] | A:1152 [G] | ✔ |
O:61 [TRP] | A:1039 [C] | P:61 [TRP] | A:992 [C] | ✔ |
O:61 [TRP] | A:1040 [A] | P:61 [TRP] | A:993 [A] | ✔ |
O:61 [TRP] | A:1041 [G] | P:61 [TRP] | A:994 [G] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:577 [A] | P:41 [LYS] | A:531 [A] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:578 [G] | P:41 [LYS] | A:532 [G] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:606 [G] | P:41 [LYS] | A:561 [A] | ✔ |
O:41 [LYS] | A:607 [C] | P:41 [LYS] | A:562 [C] | ✔ |
O:34 [VAL] | A:2046 [U] | P:34 [VAL] | A:2015 [A] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1040 [A] | P:92 [ARG] | A:993 [A] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1041 [G] | P:92 [ARG] | A:994 [G] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1042 [C] | P:92 [ARG] | A:995 [C] | ✔ |
O:92 [ARG] | A:1197 [C] | P:92 [ARG] | A:1151 [C] | ✔ |
O:63 [THR] | A:1054 [A] | P:63 [ALA] | A:1007 [A] | ✔ |
O:37 [GLN] | A:606 [G] | P:37 [GLN] | A:561 [A] | ✔ |
O:37 [GLN] | A:607 [C] | P:37 [GLN] | A:562 [C] | ✔ |
O:37 [GLN] | A:1290 [G] | P:37 [GLN] | A:1247 [G] | ✔ |
O:7 [GLY] | A:30 [G] | P:7 [GLY] | A:37 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:10 [THR] | A:1290 [G] | P:10 [ALA] | A:1247 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:16 [LYS] | A:1266 [G] | P:16 [LYS] | A:1223 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:14 [ARG] | A:626 [G] | P:14 [HIS] | A:581 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:14 [ARG] | A:1289 [A] | P:14 [HIS] | A:1246 [C] | ❌ 7RYG_P_A |
O:53 [ARG] | A:1037 [A] | P:53 [LYS] | A:990 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:53 [ARG] | A:1038 [C] | P:53 [LYS] | A:991 [C] | ❌ 7RYG_P_A |
O:3 [ARG] | A:490 [C] | P:3 [ARG] | A:443 [C] | ❌ 7RYG_P_A |
O:32 [TYR] | A:625 [G] | P:32 [TYR] | A:580 [A] | ❌ 7RYG_P_A |
O:6 [GLY] | A:29 [U] | P:6 [ARG] | A:36 [U] | ❌ 7RYG_P_A |
O:52 [GLN] | A:1021 [G] | P:52 [GLN] | A:974 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:13 [ARG] | A:1290 [G] | P:13 [ARG] | A:1247 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:11 [ARG] | A:29 [U] | P:11 [HIS] | A:36 [U] | ❌ 7RYG_P_A |
O:11 [ARG] | A:1253 [G] | P:11 [HIS] | A:1210 [G] | ❌ 7RYG_P_A |
O:9 [VAL] | A:1289 [A] | P:9 [VAL] | A:1246 [C] | ❌ 7RYG_P_A |
O:38 [GLN] | A:577 [A] | P:38 [ALA] | A:531 [A] | ❌ 7RYG_P_A |
O:45 [TYR] | A:576 [U] | P:45 [TYR] | A:530 [C] | ❌ 7RYG_P_A |
O:92 [ARG] | A:1196 [C] | P:92 [ARG] | A:1150 [C] | ❌ 7RYG_P_A |
O:63 [THR] | A:1053 [A] | P:63 [ALA] | A:1006 [A] | ❌ 7RYG_P_A |
O:11 [ARG] | A:626 [G] | P:11 [HIS] | A:581 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:2 [PRO] | A:1287 [U] | P:2 [ALA] | A:1244 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:26 [GLY] | A:2047 [A] | P:26 [GLY] | A:2016 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:28 [LYS] | A:576 [U] | P:28 [ARG] | A:530 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:30 [THR] | A:18 [C] | P:30 [ARG] | A:25 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:37 [GLN] | A:621 [A] | P:37 [GLN] | A:576 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:4 [VAL] | A:627 [C] | P:4 [VAL] | A:582 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:48 [ARG] | A:579 [U] | P:48 [ARG] | A:533 [U] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:49 [ASP] | A:578 [G] | P:49 [ASP] | A:532 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:56 [ASP] | A:580 [C] | P:56 [GLN] | A:534 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:6 [GLY] | A:1289 [A] | P:6 [ARG] | A:1246 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:7 [GLY] | A:627 [C] | P:7 [GLY] | A:582 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:7 [GLY] | A:626 [G] | P:7 [GLY] | A:581 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:78 [ARG] | A:1055 [A] | P:78 [ARG] | A:1008 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:80 [MET] | A:1197 [C] | P:80 [ILE] | A:1151 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:84 [LYS] | A:1041 [G] | P:84 [LYS] | A:994 [G] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:84 [LYS] | A:1042 [C] | P:84 [LYS] | A:995 [C] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:9 [VAL] | A:1265 [G] | P:9 [VAL] | A:1222 [A] | ❌ 6S0Z_O_A |
O:30 [THR] | A:559 [A] | P:30 [ARG] | A:513 [A] | ❌ 7RYG_A:513 no longer at interface |
O:22 [LYS] | A:596 [G] | P:22 [LYS] | A:551 [G] | ❌ 7RYG_A:551 no longer at interface |
O:19 [LYS] | A:1258 [A] | P:19 [ALA] | A:1215 [G] | ❌ 7RYG_P:19, 7RYG_A:1215 no longer at interface |
O:11 [ARG] | A:28 [A] | P:11 [HIS] | A:35 [A] | ❌ 7RYG_A:35 no longer at interface |
O:2 [PRO] | A:489 [A] | P:2 [ALA] | A:442 [A] | ❌ 7RYG_A:442 no longer at interface |
O:23 [GLY] | A:597 [U] | P:23 [GLY] | A:552 [U] | ❌ 7RYG_A:552 no longer at interface |
O:41 [LYS] | A:605 [U] | P:41 [LYS] | A:560 [U] | ❌ 7RYG_A:560 no longer at interface |
O:13 [ARG] | A:1264 [A] | P:13 [ARG] | A:1221 [A] | ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface |
O:13 [ARG] | A:857 [C] | P:13 [ARG] | A:810 [C] | ❌ 6S0Z_A:857 no longer at interface |
O:13 [ARG] | A:1288 [G] | P:13 [ARG] | A:1245 [G] | ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface |
O:16 [LYS] | A:1264 [A] | P:16 [LYS] | A:1221 [A] | ❌ 6S0Z_A:1264 no longer at interface |
O:33 [LYS] | A:1291 [A] | P:33 [ARG] | A:1248 [A] | ❌ 6S0Z_A:1291 no longer at interface |
O:34 [VAL] | A:2045 [A] | P:34 [VAL] | A:2014 [G] | ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface |
O:37 [GLN] | A:2045 [A] | P:37 [GLN] | A:2014 [G] | ❌ 6S0Z_A:2045 no longer at interface |
O:57 [PHE] | A:582 [G] | P:57 [PHE] | A:536 [G] | ❌ 6S0Z_A:582 no longer at interface |
O:6 [GLY] | A:628 [G] | P:6 [ARG] | A:583 [G] | ❌ 6S0Z_A:628 no longer at interface |
O:6 [GLY] | A:1288 [G] | P:6 [ARG] | A:1245 [G] | ❌ 6S0Z_A:1288 no longer at interface |
O:78 [ARG] | A:1194 [U] | P:78 [ARG] | A:1148 [U] | ❌ 6S0Z_A:1194 no longer at interface |
O:78 [ARG] | A:1057 [A] | P:78 [ARG] | A:1010 [C] | ❌ 6S0Z_A:1057 no longer at interface |
O:19 [LYS] | A:1256 [U] | P:19 [ALA] | A:1213 [G] | ❌ 7RYG_P:19 no longer at interface |
O:19 [LYS] | A:1257 [G] | P:19 [ALA] | A:1214 [U] | ❌ 7RYG_P:19 no longer at interface |
O:40 [MET] | A:607 [C] | P:40 [ILE] | A:562 [C] | ❌ 7RYG_P:40 no longer at interface |
O:40 [MET] | A:1290 [G] | P:40 [ILE] | A:1247 [G] | ❌ 7RYG_P:40 no longer at interface |
O:12 [ALA] | A:1236 [G] | P:12 [ARG] | A:1192 [G] | ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface |
O:12 [ALA] | A:1265 [G] | P:12 [ARG] | A:1222 [A] | ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface |
O:12 [ALA] | A:1266 [G] | P:12 [ARG] | A:1223 [G] | ❌ 6S0Z_O:12 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.98 | 0.88 | 0.59 | 0.97 | 0.98 | 0.98 | 0.91 | 0.86 | 0.86 | 0.45 | 0.41 |
Other pairs involving 6S0Z_O_A or 7RYG_P_A
Total number of entries: 6
Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4Y4O_1U_1A | 7RYG_P_A | 0.88 | 0.96 | 1.29 | 0.55 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
4Y4O_1U_1A | 6S0Z_O_A | 0.89 | 0.97 | 1.05 | 0.48 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
7OF0_R_A | 7RYG_P_A | 0.70 | 0.93 | 2.23 | 0.29 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_O_A | 7OF0_R_A | 0.68 | 0.96 | 2.06 | 0.25 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_O_A | 7K00_p_a | 0.87 | 0.97 | 1.25 | 0.63 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_O_A | 7RYG_P_A | 0.86 | 0.98 | 0.88 | 0.59 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |