Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
| 7K00_p
|
7K00_a
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
|---|---|---|---|---|---|---|
| p:2 [ALA] | a:443 [A] | 4.78 | 59.83 | |||
| p:2 [ALA] | a:444 [C] | 3.37 | a:36 [G] | 59.83 | ||
| p:2 [ALA] | a:445 [C] | 3.03 | a:35 [G] | 59.83 | ||
| p:2 [ALA] | a:1199 [U] | 3.85 | a:1246 [A] | 59.83 | ||
| p:2 [ALA] | a:1200 [C] | 4.78 | a:1245 [G] | 59.83 | ||
| p:2 [ALA] | a:1246 [A] | 4.3 | a:1199 [U] | 59.83 | ||
| p:2 [ALA] | a:1247 [A] | 4.17 | a:1198 [U] | 59.83 | ||
| p:2 [ALA] | a:1248 [G] | 3.21 | sugar:BB | 59.83 | ||
| p:3 [ARG] | a:444 [C] | 4.81 | a:36 [G] | 98.21 | ||
| p:3 [ARG] | a:445 [C] | 2.8 | a:35 [G] | 98.21 | ||
| p:3 [ARG] | a:446 [G] | 3.02 | 98.21 | |||
| p:3 [ARG] | a:447 [A] | 5.0 | a:33 [C] | 98.21 | ||
| p:3 [ARG] | a:449 [A] | 3.43 | a:454 [A] | 98.21 | ||
| p:3 [ARG] | a:584 [C] | 4.11 | a:1256 [G] | 98.21 | ||
| p:3 [ARG] | a:1199 [U] | 3.39 | a:1246 [A] | sugar:BB | 98.21 | |
| p:3 [ARG] | a:1248 [G] | 3.43 | 98.21 | |||
| p:4 [VAL] | a:584 [C] | 4.71 | a:1256 [G] | 78.74 | ||
| p:4 [VAL] | a:1198 [U] | 3.19 | a:1247 [A] | 78.74 | ||
| p:4 [VAL] | a:1199 [U] | 3.67 | a:1246 [A] | 78.74 | ||
| p:4 [VAL] | a:1247 [A] | 4.33 | a:1198 [U] | 78.74 | ||
| p:4 [VAL] | a:1248 [G] | 3.24 | sugar:BB | 78.74 | ||
| p:4 [VAL] | a:1249 [U] | 3.79 | a:1197 [G] | 78.74 | ||
| p:5 [LYS] | a:29 [U] | 3.84 | a:511 [U] | 75.55 | ||
| p:5 [LYS] | a:30 [G] | 2.93 | a:510 [C] | 75.55 | ||
| p:5 [LYS] | a:446 [G] | 3.86 | 75.55 | |||
| p:5 [LYS] | a:447 [A] | 3.0 | a:33 [C] | 75.55 | ||
| p:5 [LYS] | a:584 [C] | 3.78 | a:1256 [G] | 75.55 | ||
| p:5 [LYS] | a:1198 [U] | 3.98 | a:1247 [A] | sugar:BB | 75.55 | |
| p:6 [ARG] | a:583 [G] | 4.68 | a:1257 [C] | 57.77 | ||
| p:6 [ARG] | a:584 [C] | 2.93 | a:1256 [G] | 57.77 | ||
| p:6 [ARG] | a:585 [G] | 2.83 | a:1254 [A] | base:SC, base:SC | 57.77 | |
| p:6 [ARG] | a:1250 [G] | 3.72 | a:1196 [C] | 57.77 | ||
| p:6 [ARG] | a:1251 [C] | 2.79 | a:586 [A] | base/AA stacks | 57.77 | |
| p:7 [GLY] | a:29 [U] | 3.97 | a:511 [U] | 66.97 | ||
| p:7 [GLY] | a:583 [G] | 3.35 | a:1257 [C] | 66.97 | ||
| p:7 [GLY] | a:584 [C] | 4.28 | a:1256 [G] | 66.97 | ||
| p:8 [VAL] | a:29 [U] | 3.52 | a:511 [U] | 25.91 | ||
| p:8 [VAL] | a:30 [G] | 3.92 | a:510 [C] | 25.91 | ||
| p:8 [VAL] | a:1215 [G] | 4.16 | a:1234 [U] | 25.91 | ||
| p:8 [VAL] | a:1216 [G] | 3.92 | a:1233 [C] | 25.91 | ||
| p:9 [ILE] | a:1197 [G] | 3.35 | a:1249 [U] | 31.24 | ||
| p:9 [ILE] | a:1198 [U] | 3.76 | a:1247 [A] | 31.24 | ||
| p:9 [ILE] | a:1251 [C] | 4.79 | a:586 [A] | 31.24 | ||
| p:10 [ALA] | a:583 [G] | 3.94 | a:1257 [C] | 51.6 | ||
| p:10 [ALA] | a:1251 [C] | 3.76 | a:586 [A] | 51.6 | ||
| p:11 [ARG] | a:513 [A] | 3.03 | a:27 [G] | sugar:SC | 53.26 | |
| p:11 [ARG] | a:514 [A] | 3.03 | a:26 [G] | sugar:SC | 53.26 | |
| p:11 [ARG] | a:582 [A] | 3.65 | a:1258 [U] | 53.26 | ||
| p:11 [ARG] | a:583 [G] | 4.53 | a:1257 [C] | 53.26 | ||
| p:11 [ARG] | a:1216 [G] | 4.17 | a:1233 [C] | 53.26 | ||
| p:11 [ARG] | a:1217 [U] | 3.72 | a:1232 [G] | 53.26 | ||
| p:13 [ARG] | a:812 [C] | 3.01 | a:1195 [G] | sugar:SC | 69.2 | |
| p:13 [ARG] | a:813 [U] | 4.58 | a:1194 [A] | 69.2 | ||
| p:13 [ARG] | a:1226 [A] | 3.13 | a:1223 [G] | 69.2 | ||
| p:13 [ARG] | a:1227 [G] | 2.83 | a:1222 [U] | 69.2 | ||
| p:13 [ARG] | a:1251 [C] | 4.17 | a:586 [A] | 69.2 | ||
| p:14 [HIS] | a:581 [C] | 4.89 | a:1259 [G] | 81.86 | ||
| p:14 [HIS] | a:582 [A] | 2.89 | a:1258 [U] | 81.86 | ||
| p:14 [HIS] | a:1252 [G] | 2.79 | 81.86 | |||
| p:15 [LYS] | a:1217 [U] | 3.4 | a:1232 [G] | 73.03 | ||
| p:15 [LYS] | a:1218 [G] | 3.56 | a:1231 [U] | 73.03 | ||
| p:16 [LYS] | a:1226 [A] | 3.5 | a:1223 [G] | 65.79 | ||
| p:16 [LYS] | a:1227 [G] | 3.36 | a:1222 [U] | 65.79 | ||
| p:19 [LYS] | a:1219 [U] | 4.32 | a:1230 [A] | 48.8 | ||
| p:21 [ALA] | a:19 [A] | 4.8 | a:521 [U] | 72.55 | ||
| p:22 [LYS] | a:18 [U] | 4.65 | a:522 [A] | 80.16 | ||
| p:22 [LYS] | a:19 [A] | 3.68 | a:521 [U] | 80.16 | ||
| p:22 [LYS] | a:20 [C] | 2.88 | a:520 [G] | 80.16 | ||
| p:22 [LYS] | a:1218 [G] | 4.81 | a:1231 [U] | 80.16 | ||
| p:22 [LYS] | a:1219 [U] | 3.62 | a:1230 [A] | 80.16 | ||
| p:23 [GLY] | a:18 [U] | 3.17 | a:522 [A] | 89.93 | ||
| p:23 [GLY] | a:19 [A] | 2.84 | a:521 [U] | 89.93 | ||
| p:23 [GLY] | a:533 [G] | 4.28 | a:560 [C] | 89.93 | ||
| p:23 [GLY] | a:554 [U] | 4.44 | a:539 [G] | 89.93 | ||
| p:24 [TYR] | a:18 [U] | 3.53 | a:522 [A] | 54.8 | ||
| p:24 [TYR] | a:19 [A] | 4.63 | a:521 [U] | 54.8 | ||
| p:24 [TYR] | a:533 [G] | 3.34 | a:560 [C] | 54.8 | ||
| p:24 [TYR] | a:534 [U] | 2.81 | a:559 [G] | 54.8 | ||
| p:25 [TYR] | a:17 [G] | 3.31 | a:523 [C] | 40.44 | ||
| p:25 [TYR] | a:18 [U] | 3.68 | a:522 [A] | 40.44 | ||
| p:25 [TYR] | a:532 [A] | 3.55 | 40.44 | |||
| p:25 [TYR] | a:533 [G] | 2.78 | a:560 [C] | 40.44 | ||
| p:25 [TYR] | a:2020 [A] | 3.44 | a:2034 [U] | 40.44 | ||
| p:25 [TYR] | a:2021 [C] | 2.6 | 40.44 | |||
| p:26 [GLY] | a:17 [G] | 4.43 | a:523 [C] | 69.33 | ||
| p:26 [GLY] | a:18 [U] | 2.73 | a:522 [A] | 69.33 | ||
| p:26 [GLY] | a:2020 [A] | 3.65 | a:2034 [U] | 69.33 | ||
| p:27 [ALA] | a:2019 [A] | 3.05 | a:2035 [G] | 76.6 | ||
| p:27 [ALA] | a:2020 [A] | 2.85 | a:2034 [U] | 76.6 | ||
| p:28 [ARG] | a:532 [A] | 3.47 | 61.12 | |||
| p:28 [ARG] | a:533 [G] | 2.93 | a:560 [C] | sugar:SC | 61.12 | |
| p:28 [ARG] | a:2019 [A] | 4.04 | a:2035 [G] | 61.12 | ||
| p:28 [ARG] | a:2020 [A] | 4.99 | a:2034 [U] | 61.12 | ||
| p:29 [SER] | a:18 [U] | 4.35 | a:522 [A] | 72.54 | ||
| p:29 [SER] | a:19 [A] | 4.0 | a:521 [U] | 72.54 | ||
| p:30 [ARG] | a:17 [G] | 4.9 | a:523 [C] | 66.53 | ||
| p:30 [ARG] | a:18 [U] | 2.6 | a:522 [A] | 66.53 | ||
| p:30 [ARG] | a:19 [A] | 4.94 | a:521 [U] | 66.53 | ||
| p:30 [ARG] | a:514 [A] | 4.77 | a:26 [G] | 66.53 | ||
| p:30 [ARG] | a:515 [A] | 3.49 | a:25 [U] | 66.53 | ||
| p:30 [ARG] | a:516 [C] | 3.83 | a:24 [G] | 66.53 | ||
| p:31 [VAL] | a:515 [A] | 4.14 | a:25 [U] | 33.52 | ||
| p:31 [VAL] | a:516 [C] | 4.08 | a:24 [G] | 33.52 | ||
| p:31 [VAL] | a:580 [U] | 3.11 | a:1260 [A] | 33.52 | ||
| p:31 [VAL] | a:581 [C] | 3.53 | a:1259 [G] | 33.52 | ||
| p:32 [TYR] | a:580 [U] | 4.86 | a:1260 [A] | 45.76 | ||
| p:32 [TYR] | a:581 [C] | 3.49 | a:1259 [G] | 45.76 | ||
| p:32 [TYR] | a:582 [A] | 4.87 | a:1258 [U] | 45.76 | ||
| p:32 [TYR] | a:1252 [G] | 3.51 | 45.76 | |||
| p:33 [ARG] | a:578 [G] | 4.01 | a:563 [A] | 73.96 | ||
| p:33 [ARG] | a:580 [U] | 3.94 | a:1260 [A] | 73.96 | ||
| p:33 [ARG] | a:581 [C] | 2.96 | a:1259 [G] | 73.96 | ||
| p:33 [ARG] | a:1252 [G] | 3.08 | 73.96 | |||
| p:33 [ARG] | a:1253 [A] | 2.84 | 73.96 | |||
| p:34 [VAL] | a:2018 [G] | 3.97 | a:531 [C] | 44.29 | ||
| p:34 [VAL] | a:2019 [A] | 3.56 | a:2035 [G] | 44.29 | ||
| p:36 [PHE] | a:1252 [G] | 3.26 | 51.21 | |||
| p:37 [GLN] | a:563 [A] | 3.01 | a:578 [G] | base:SC, sugar:SC | 74.89 | |
| p:37 [GLN] | a:564 [C] | 3.25 | a:577 [G] | 74.89 | ||
| p:37 [GLN] | a:578 [G] | 3.9 | a:563 [A] | 74.89 | ||
| p:37 [GLN] | a:1252 [G] | 2.75 | base:SC | 74.89 | ||
| p:37 [GLN] | a:2018 [G] | 4.6 | a:531 [C] | 74.89 | ||
| p:38 [ALA] | a:533 [G] | 4.71 | a:560 [C] | 67.45 | ||
| p:41 [LYS] | a:531 [C] | 4.47 | a:2018 [G] | 76.42 | ||
| p:41 [LYS] | a:532 [A] | 3.43 | 76.42 | |||
| p:41 [LYS] | a:533 [G] | 4.37 | a:560 [C] | 76.42 | ||
| p:41 [LYS] | a:561 [G] | 4.82 | 76.42 | |||
| p:41 [LYS] | a:562 [U] | 4.47 | a:2033 [A] | 76.42 | ||
| p:41 [LYS] | a:563 [A] | 3.02 | a:578 [G] | 76.42 | ||
| p:41 [LYS] | a:564 [C] | 4.3 | a:577 [G] | 76.42 | ||
| p:42 [ALA] | a:533 [G] | 3.45 | a:560 [C] | 90.77 | ||
| p:42 [ALA] | a:534 [U] | 3.65 | a:559 [G] | 90.77 | ||
| p:44 [GLN] | a:564 [C] | 4.61 | a:577 [G] | 33.15 | ||
| p:45 [TYR] | a:531 [C] | 4.69 | a:2018 [G] | 54.03 | ||
| p:45 [TYR] | a:532 [A] | 2.53 | 54.03 | |||
| p:45 [TYR] | a:533 [G] | 3.29 | a:560 [C] | 54.03 | ||
| p:45 [TYR] | a:534 [U] | 3.14 | a:559 [G] | 54.03 | ||
| p:45 [TYR] | a:561 [G] | 2.71 | sugar:SC | 54.03 | ||
| p:46 [ALA] | a:534 [U] | 3.68 | a:559 [G] | 79.98 | ||
| p:46 [ALA] | a:535 [G] | 3.95 | a:558 [U] | 79.98 | ||
| p:47 [TYR] | a:990 [A] | 3.1 | a:974 [G] | sugar:SC | 55.18 | |
| p:47 [TYR] | a:991 [C] | 4.8 | a:1163 [G] | 55.18 | ||
| p:47 [TYR] | a:992 [C] | 2.44 | a:1162 [G] | 55.18 | ||
| p:47 [TYR] | a:993 [G] | 4.0 | a:1161 [C] | 55.18 | ||
| p:47 [TYR] | a:1156 [A] | 3.96 | 55.18 | |||
| p:48 [ARG] | a:533 [G] | 3.53 | a:560 [C] | 28.52 | ||
| p:48 [ARG] | a:534 [U] | 4.35 | a:559 [G] | 28.52 | ||
| p:48 [ARG] | a:559 [G] | 3.97 | a:534 [U] | 28.52 | ||
| p:48 [ARG] | a:560 [C] | 2.72 | a:533 [G] | base:SC | 28.52 | |
| p:48 [ARG] | a:561 [G] | 2.93 | sugar:SC | 28.52 | ||
| p:48 [ARG] | a:1156 [A] | 3.94 | 28.52 | |||
| p:49 [ASP] | a:533 [G] | 4.9 | a:560 [C] | 60.46 | ||
| p:49 [ASP] | a:534 [U] | 2.27 | a:559 [G] | sugar:SC | 60.46 | |
| p:49 [ASP] | a:535 [G] | 3.24 | a:558 [U] | 60.46 | ||
| p:49 [ASP] | a:559 [G] | 3.13 | a:534 [U] | base:SC | 60.46 | |
| p:49 [ASP] | a:560 [C] | 4.66 | a:533 [G] | 60.46 | ||
| p:50 [ARG] | a:992 [C] | 4.6 | a:1162 [G] | 99.0 | ||
| p:50 [ARG] | a:993 [G] | 2.71 | a:1161 [C] | 99.0 | ||
| p:50 [ARG] | a:994 [C] | 3.51 | a:1160 [G] | 99.0 | ||
| p:50 [ARG] | a:995 [C] | 4.2 | 99.0 | |||
| p:51 [ARG] | a:990 [A] | 4.79 | a:974 [G] | 61.52 | ||
| p:51 [ARG] | a:992 [C] | 3.95 | a:1162 [G] | 61.52 | ||
| p:51 [ARG] | a:993 [G] | 2.6 | a:1161 [C] | 61.52 | ||
| p:51 [ARG] | a:1156 [A] | 3.5 | 61.52 | |||
| p:52 [GLN] | a:559 [G] | 3.32 | a:534 [U] | 0.28 | ||
| p:52 [GLN] | a:560 [C] | 2.94 | a:533 [G] | sugar:SC, sugar:SC | 0.28 | |
| p:52 [GLN] | a:977 [G] | 4.98 | a:986 [C] | 0.28 | ||
| p:53 [ARG] | a:535 [G] | 3.27 | a:558 [U] | 75.72 | ||
| p:53 [ARG] | a:536 [G] | 3.44 | a:557 [C] | 75.72 | ||
| p:53 [ARG] | a:994 [C] | 2.73 | a:1160 [G] | 75.72 | ||
| p:53 [ARG] | a:995 [C] | 3.01 | 75.72 | |||
| p:54 [LYS] | a:993 [G] | 4.93 | a:1161 [C] | 88.84 | ||
| p:54 [LYS] | a:994 [C] | 2.75 | a:1160 [G] | 88.84 | ||
| p:54 [LYS] | a:995 [C] | 2.82 | 88.84 | |||
| p:55 [ARG] | a:976 [G] | 3.15 | a:987 [C] | sugar:SC | 72.69 | |
| p:55 [ARG] | a:977 [G] | 2.95 | a:986 [C] | 72.69 | ||
| p:55 [ARG] | a:1155 [A] | 3.23 | a:999 [U] | 72.69 | ||
| p:55 [ARG] | a:1156 [A] | 3.21 | base:SC | 72.69 | ||
| p:56 [GLN] | a:535 [G] | 3.11 | a:558 [U] | base:SC | 25.35 | |
| p:56 [GLN] | a:559 [G] | 3.07 | a:534 [U] | base:SC | 25.35 | |
| p:56 [GLN] | a:560 [C] | 4.8 | a:533 [G] | 25.35 | ||
| p:57 [PHE] | a:536 [G] | 3.67 | a:557 [C] | 35.24 | ||
| p:57 [PHE] | a:537 [G] | 4.64 | a:556 [A] | 35.24 | ||
| p:57 [PHE] | a:995 [C] | 3.29 | base/AA stacks | 35.24 | ||
| p:58 [ARG] | a:996 [A] | 4.97 | a:1159 [U] | 90.77 | ||
| p:58 [ARG] | a:997 [G] | 2.9 | a:1158 [C] | 90.77 | ||
| p:58 [ARG] | a:998 [C] | 2.96 | a:1157 [G] | 90.77 | ||
| p:58 [ARG] | a:1153 [C] | 3.44 | a:1002 [G] | 90.77 | ||
| p:58 [ARG] | a:1154 [G] | 2.83 | a:1001 [A] | 90.77 | ||
| p:59 [GLN] | a:1008 [A] | 4.28 | a:1009 [A] | 7.52 | ||
| p:59 [GLN] | a:1009 [A] | 3.3 | a:1008 [A] | 7.52 | ||
| p:59 [GLN] | a:1154 [G] | 4.74 | a:1001 [A] | 7.52 | ||
| p:61 [TRP] | a:995 [C] | 3.47 | 66.66 | |||
| p:61 [TRP] | a:996 [A] | 3.83 | a:1159 [U] | 66.66 | ||
| p:61 [TRP] | a:997 [G] | 4.43 | a:1158 [C] | 66.66 | ||
| p:62 [ILE] | a:1009 [A] | 3.42 | a:1008 [A] | 87.98 | ||
| p:62 [ILE] | a:1010 [A] | 3.5 | 87.98 | |||
| p:62 [ILE] | a:1153 [C] | 3.49 | a:1002 [G] | 87.98 | ||
| p:62 [ILE] | a:1154 [G] | 3.67 | a:1001 [A] | 87.98 | ||
| p:63 [ALA] | a:1009 [A] | 4.4 | a:1008 [A] | 52.21 | ||
| p:63 [ALA] | a:1010 [A] | 3.6 | 52.21 | |||
| p:66 [ASN] | a:1009 [A] | 4.84 | a:1008 [A] | 87.52 | ||
| p:66 [ASN] | a:1010 [A] | 2.92 | 87.52 | |||
| p:66 [ASN] | a:1011 [G] | 2.66 | a:1150 [C] | 87.52 | ||
| p:70 [ARG] | a:1010 [A] | 4.94 | 76.39 | |||
| p:70 [ARG] | a:1011 [G] | 2.74 | a:1150 [C] | 76.39 | ||
| p:70 [ARG] | a:1012 [U] | 2.77 | a:1143 [A] | 76.39 | ||
| p:75 [SER] | a:1011 [G] | 3.2 | a:1150 [C] | 62.71 | ||
| p:75 [SER] | a:1012 [U] | 3.8 | a:1143 [A] | 62.71 | ||
| p:76 [TYR] | a:1010 [A] | 3.88 | 93.56 | |||
| p:76 [TYR] | a:1011 [G] | 3.6 | a:1150 [C] | 93.56 | ||
| p:76 [TYR] | a:1152 [C] | 3.5 | a:1003 [G] | 93.56 | ||
| p:76 [TYR] | a:1153 [C] | 2.71 | a:1002 [G] | 93.56 | ||
| p:77 [SER] | a:1010 [A] | 3.85 | 85.01 | |||
| p:77 [SER] | a:1011 [G] | 2.69 | a:1150 [C] | 85.01 | ||
| p:77 [SER] | a:1151 [A] | 3.2 | a:1004 [U] | 85.01 | ||
| p:77 [SER] | a:1152 [C] | 3.4 | a:1003 [G] | 85.01 | ||
| p:78 [LYS] | a:1011 [G] | 4.91 | a:1150 [C] | 7.8 | ||
| p:78 [LYS] | a:1151 [A] | 4.13 | a:1004 [U] | 7.8 | ||
| p:80 [ILE] | a:998 [C] | 4.95 | a:1157 [G] | 77.37 | ||
| p:80 [ILE] | a:1152 [C] | 3.74 | a:1003 [G] | 77.37 | ||
| p:80 [ILE] | a:1153 [C] | 4.6 | a:1002 [G] | 77.37 | ||
| p:81 [ASN] | a:1151 [A] | 3.24 | a:1004 [U] | 28.6 | ||
| p:81 [ASN] | a:1152 [C] | 3.77 | a:1003 [G] | 28.6 | ||
| p:84 [LYS] | a:997 [G] | 4.41 | a:1158 [C] | 45.32 | ||
| p:84 [LYS] | a:998 [C] | 2.86 | a:1157 [G] | 45.32 | ||
| p:84 [LYS] | a:1152 [C] | 4.49 | a:1003 [G] | 45.32 | ||
| p:85 [LYS] | a:1151 [A] | 3.98 | a:1004 [U] | 49.42 | ||
| p:91 [ASP] | a:996 [A] | 2.9 | a:1159 [U] | sugar:SC | 82.98 | |
| p:91 [ASP] | a:997 [G] | 3.44 | a:1158 [C] | 82.98 | ||
| p:92 [ARG] | a:996 [A] | 4.22 | a:1159 [U] | 97.81 | ||
| p:92 [ARG] | a:997 [G] | 2.87 | a:1158 [C] | 97.81 | ||
| p:92 [ARG] | a:998 [C] | 2.8 | a:1157 [G] | 97.81 | ||
| p:92 [ARG] | a:1152 [C] | 4.77 | a:1003 [G] | 97.81 | ||
| p:92 [ARG] | a:1153 [C] | 2.98 | a:1002 [G] | 97.81 | ||
| p:93 [LYS] | a:995 [C] | 2.74 | sugar:SC | 92.37 | ||
| p:93 [LYS] | a:996 [A] | 3.29 | a:1159 [U] | 92.37 | ||
| p:93 [LYS] | a:997 [G] | 4.52 | a:1158 [C] | 92.37 |
Export the table of contacts
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
| Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| group82 | 7K00_p_a | p: 50s ribosomal protein l20, Escherichia coli (natural) a: 23s rRNA, Escherichia coli (natural) | P0A7L3 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | ✔ |
|
Interologs
Total number of interologs for this interface: 2
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4Y4O_1U_1A | 7K00_p_a | 0.91 | 0.97 | 0.81 | 0.58 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_O_A | 7K00_p_a | 0.87 | 0.97 | 1.25 | 0.63 | Ribosomal protein L20 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |