RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group82 > 7OF0_R_A vs 7RYG_P_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

7OF0_R
7OF0_A
7RYG_P
7RYG_A
Conserved?
R:48 [ARG] A:1828 [A] P:41 [LYS] A:531 [A] ✔
R:48 [ARG] A:1829 [A] P:41 [LYS] A:532 [G] ✔
R:48 [ARG] A:1844 [A] P:41 [LYS] A:561 [A] ✔
R:48 [ARG] A:1845 [C] P:41 [LYS] A:562 [C] ✔
R:63 [ASN] A:1840 [C] P:56 [GLN] A:557 [G] ✔
R:32 [ARG] A:1828 [A] P:25 [TYR] A:531 [A] ✔
R:32 [ARG] A:1829 [A] P:25 [TYR] A:532 [G] ✔
R:32 [ARG] A:2684 [C] P:25 [TYR] A:2017 [A] ✔
R:56 [ALA] A:1830 [G] P:49 [ASP] A:533 [U] ✔
R:56 [ALA] A:1831 [G] P:49 [ASP] A:534 [G] ✔
R:60 [LYS] A:1831 [G] P:53 [LYS] A:534 [G] ✔
R:60 [LYS] A:1832 [A] P:53 [LYS] A:535 [G] ✔
R:60 [LYS] A:2146 [A] P:53 [LYS] A:992 [C] ✔
R:61 [LYS] A:2145 [G] P:54 [LYS] A:991 [C] ✔
R:61 [LYS] A:2146 [A] P:54 [LYS] A:992 [C] ✔
R:40 [ARG] A:1859 [A] P:33 [ARG] A:576 [G] ✔
R:40 [ARG] A:1861 [U] P:33 [ARG] A:578 [U] ✔
R:40 [ARG] A:1862 [U] P:33 [ARG] A:579 [C] ✔
R:40 [ARG] A:2296 [U] P:33 [ARG] A:1247 [G] ✔
R:40 [ARG] A:2297 [A] P:33 [ARG] A:1248 [A] ✔
R:88 [GLY] A:2247 [C] P:81 [ASP] A:1150 [C] ✔
R:98 [ASN] A:2147 [G] P:91 [ASP] A:993 [A] ✔
R:98 [ASN] A:2148 [A] P:91 [ASP] A:994 [G] ✔
R:84 [PRO] A:2246 [A] P:77 [SER] A:1149 [G] ✔
R:84 [PRO] A:2247 [C] P:77 [SER] A:1150 [C] ✔
R:64 [MET] A:2146 [A] P:57 [PHE] A:992 [C] ✔
R:35 [LYS] A:1828 [A] P:28 [ARG] A:531 [A] ✔
R:35 [LYS] A:1829 [A] P:28 [ARG] A:532 [G] ✔
R:35 [LYS] A:2682 [A] P:28 [ARG] A:2015 [A] ✔
R:21 [ILE] A:1863 [A] P:14 [HIS] A:580 [A] ✔
R:21 [ILE] A:2296 [U] P:14 [HIS] A:1247 [G] ✔
R:49 [ALA] A:1829 [A] P:42 [ALA] A:532 [G] ✔
R:49 [ALA] A:1830 [G] P:42 [ALA] A:533 [U] ✔
R:38 [CYS] A:1815 [A] P:31 [VAL] A:514 [A] ✔
R:38 [CYS] A:1816 [G] P:31 [VAL] A:515 [C] ✔
R:38 [CYS] A:1861 [U] P:31 [VAL] A:578 [U] ✔
R:38 [CYS] A:1862 [U] P:31 [VAL] A:579 [C] ✔
R:99 [ARG] A:2147 [G] P:92 [ARG] A:993 [A] ✔
R:99 [ARG] A:2148 [A] P:92 [ARG] A:994 [G] ✔
R:99 [ARG] A:2149 [G] P:92 [ARG] A:995 [C] ✔
R:99 [ARG] A:2248 [U] P:92 [ARG] A:1151 [C] ✔
R:41 [LEU] A:2681 [G] P:34 [VAL] A:2014 [G] ✔
R:41 [LEU] A:2682 [A] P:34 [VAL] A:2015 [A] ✔
R:65 [ARG] A:2148 [A] P:58 [ARG] A:994 [G] ✔
R:65 [ARG] A:2149 [G] P:58 [ARG] A:995 [C] ✔
R:65 [ARG] A:2248 [U] P:58 [ARG] A:1151 [C] ✔
R:65 [ARG] A:2249 [G] P:58 [ARG] A:1152 [G] ✔
R:83 [TYR] A:2247 [C] P:76 [TYR] A:1150 [C] ✔
R:83 [TYR] A:2248 [U] P:76 [TYR] A:1151 [C] ✔
R:33 [GLY] A:2683 [C] P:26 [GLY] A:2016 [A] ✔
R:34 [ARG] A:2682 [A] P:27 [ALA] A:2015 [A] ✔
R:34 [ARG] A:2683 [C] P:27 [ALA] A:2016 [A] ✔
R:13 [ARG] A:1772 [A] P:5 [LYS] A:445 [G] ✔
R:13 [ARG] A:1773 [A] P:5 [LYS] A:446 [A] ✔
R:13 [ARG] A:1865 [C] P:5 [LYS] A:582 [C] ✔
R:13 [ARG] A:2274 [A] P:5 [LYS] A:1193 [U] ✔
R:69 [ILE] A:2248 [U] P:62 [ILE] A:1151 [C] ✔
R:69 [ILE] A:2249 [G] P:62 [ILE] A:1152 [G] ✔
R:68 [TRP] A:2146 [A] P:61 [TRP] A:992 [C] ✔
R:68 [TRP] A:2147 [G] P:61 [TRP] A:993 [A] ✔
R:68 [TRP] A:2148 [A] P:61 [TRP] A:994 [G] ✔
R:59 [LEU] A:1841 [U] P:52 [GLN] A:558 [C] ✔
R:57 [ARG] A:2144 [A] P:50 [ARG] A:990 [G] ✔
R:57 [ARG] A:2145 [G] P:50 [ARG] A:991 [C] ✔
R:57 [ARG] A:2146 [A] P:50 [ARG] A:992 [C] ✔
R:10 [LEU] A:1771 [C] P:2 [ALA] A:444 [C] ✔
R:10 [LEU] A:2292 [G] P:2 [ALA] A:1243 [G] ✔
R:53 [CYS] A:1830 [G] P:46 [ALA] A:533 [U] ✔
R:53 [CYS] A:1831 [G] P:46 [ALA] A:534 [G] ✔
R:43 [VAL] A:2296 [U] P:36 [PHE] A:1247 [G] ✔
R:11 [ARG] A:1771 [C] P:3 [ARG] A:444 [C] ✔
R:11 [ARG] A:1772 [A] P:3 [ARG] A:445 [G] ✔
R:11 [ARG] A:2275 [U] P:3 [ARG] A:1194 [U] ✔
R:11 [ARG] A:2292 [G] P:3 [ARG] A:1243 [G] ✔
R:31 [PHE] A:1829 [A] P:24 [TYR] A:532 [G] ✔
R:31 [PHE] A:1830 [G] P:24 [TYR] A:533 [U] ✔
R:37 [ARG] A:1815 [A] P:30 [ARG] A:514 [A] ✔
R:37 [ARG] A:1816 [G] P:30 [ARG] A:515 [C] ✔
R:55 [LYS] A:2251 [A] P:48 [ARG] A:1154 [A] ✔
R:12 [ASN] A:2274 [A] P:4 [VAL] A:1193 [U] ✔
R:12 [ASN] A:2275 [U] P:4 [VAL] A:1194 [U] ✔
R:12 [ASN] A:2291 [A] P:4 [VAL] A:1242 [A] ✔
R:12 [ASN] A:2292 [G] P:4 [VAL] A:1243 [G] ✔
R:12 [ASN] A:2293 [A] P:4 [VAL] A:1244 [U] ✔
R:39 [TYR] A:1862 [U] P:32 [TYR] A:579 [C] ✔
R:39 [TYR] A:2296 [U] P:32 [TYR] A:1247 [G] ✔
R:87 [ILE] A:2247 [C] P:80 [ILE] A:1150 [C] ✔
R:87 [ILE] A:2248 [U] P:80 [ILE] A:1151 [C] ✔
R:100 [LYS] A:2146 [A] P:93 [ARG] A:992 [C] ✔
R:100 [LYS] A:2147 [G] P:93 [ARG] A:993 [A] ✔
R:100 [LYS] A:2148 [A] P:93 [ARG] A:994 [G] ✔
R:62 [LYS] A:2250 [A] P:55 [ARG] A:1153 [A] ✔
R:30 [HIS] A:1829 [A] P:23 [GLY] A:532 [G] ✔
R:17 [ARG] A:1864 [A] P:10 [ALA] A:581 [G] ✔
R:17 [ARG] A:2295 [C] P:10 [ALA] A:1246 [C] ✔
R:85 [ALA] A:2246 [A] P:78 [ARG] A:1149 [G] ✔
R:20 [ARG] A:2294 [A] P:13 [ARG] A:1245 [G] ✔
R:20 [ARG] A:2295 [C] P:13 [ARG] A:1246 [C] ✔
R:45 [THR] A:1829 [A] P:38 [ALA] A:532 [G] ✔
R:16 [ASP] A:2273 [A] P:9 [VAL] A:1192 [G] ✔
R:16 [ASP] A:2274 [A] P:9 [VAL] A:1193 [U] ✔
R:58 [TYR] A:2143 [G] P:51 [ARG] A:989 [C] ✔
R:58 [TYR] A:2144 [A] P:51 [ARG] A:990 [G] ✔
R:58 [TYR] A:2251 [A] P:51 [ARG] A:1154 [A] ✔
R:14 [VAL] A:1865 [C] P:6 [ARG] A:582 [C] ✔
R:14 [VAL] A:2294 [A] P:6 [ARG] A:1245 [G] ✔
R:14 [VAL] A:2295 [C] P:6 [ARG] A:1246 [C] ✔
R:52 [LYS] A:1828 [A] P:45 [TYR] A:531 [A] ✔
R:52 [LYS] A:1829 [A] P:45 [TYR] A:532 [G] ✔
R:52 [LYS] A:1830 [G] P:45 [TYR] A:533 [U] ✔
R:52 [LYS] A:1842 [A] P:45 [TYR] A:559 [G] ✔
R:54 [THR] A:2144 [A] P:47 [TYR] A:990 [G] ✔
R:44 [ARG] A:1845 [C] P:37 [GLN] A:562 [C] ✔
R:44 [ARG] A:1859 [A] P:37 [GLN] A:576 [G] ✔
R:44 [ARG] A:2296 [U] P:37 [GLN] A:1247 [G] ✔
R:44 [ARG] A:2681 [G] P:37 [GLN] A:2014 [G] ✔
R:48 [ARG] A:1827 [C] P:41 [LYS] A:530 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:48 [ARG] A:1842 [A] P:41 [LYS] A:559 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:66 [THR] A:2249 [G] P:59 [ALA] A:1152 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:60 [LYS] A:2145 [G] P:53 [LYS] A:991 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:61 [LYS] A:2144 [A] P:54 [LYS] A:990 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:99 [ARG] A:2247 [C] P:92 [ARG] A:1150 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:41 [LEU] A:1861 [U] P:34 [VAL] A:578 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:41 [LEU] A:1862 [U] P:34 [VAL] A:579 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:65 [ARG] A:2147 [G] P:58 [ARG] A:993 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:34 [ARG] A:1816 [G] P:27 [ALA] A:515 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:34 [ARG] A:1861 [U] P:27 [ALA] A:578 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:34 [ARG] A:2681 [G] P:27 [ALA] A:2014 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:13 [ARG] A:1864 [A] P:5 [LYS] A:581 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:13 [ARG] A:2275 [U] P:5 [LYS] A:1194 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:57 [ARG] A:2143 [G] P:50 [ARG] A:989 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:10 [LEU] A:1772 [A] P:2 [ALA] A:445 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:10 [LEU] A:1775 [A] P:2 [ALA] A:448 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:10 [LEU] A:1865 [C] P:2 [ALA] A:582 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:10 [LEU] A:1866 [U] P:2 [ALA] A:583 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:29 [ARG] A:1815 [A] P:22 [LYS] A:514 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:11 [ARG] A:1770 [G] P:3 [ARG] A:443 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:11 [ARG] A:2276 [C] P:3 [ARG] A:1195 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:11 [ARG] A:2290 [A] P:3 [ARG] A:1241 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:11 [ARG] A:2291 [A] P:3 [ARG] A:1242 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:55 [LYS] A:2127 [A] P:48 [ARG] A:973 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:12 [ASN] A:2290 [A] P:4 [VAL] A:1241 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:62 [LYS] A:2249 [G] P:55 [ARG] A:1152 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:30 [HIS] A:1830 [G] P:23 [GLY] A:533 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:17 [ARG] A:1865 [C] P:10 [ALA] A:582 [C] ❌ 7RYG_P_A
R:17 [ARG] A:2294 [A] P:10 [ALA] A:1245 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:20 [ARG] A:2273 [A] P:13 [ARG] A:1192 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:20 [ARG] A:2274 [A] P:13 [ARG] A:1193 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:45 [THR] A:1828 [A] P:38 [ALA] A:531 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:14 [VAL] A:2273 [A] P:6 [ARG] A:1192 [G] ❌ 7RYG_P_A
R:14 [VAL] A:2274 [A] P:6 [ARG] A:1193 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:44 [ARG] A:1861 [U] P:37 [GLN] A:578 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:44 [ARG] A:2297 [A] P:37 [GLN] A:1248 [A] ❌ 7RYG_P_A
R:15 [THR] A:2274 [A] P:8 [VAL] A:1193 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:15 [THR] A:2275 [U] P:8 [VAL] A:1194 [U] ❌ 7RYG_P_A
R:10 [LEU] A:2293 [A] P:2 [ALA] A:1244 [U] ❌ 7OF0_R_A
R:10 [LEU] A:2276 [C] P:2 [ALA] A:1195 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:10 [LEU] A:2290 [A] P:2 [ALA] A:1241 [A] ❌ 7OF0_R_A
R:10 [LEU] A:2275 [U] P:2 [ALA] A:1194 [U] ❌ 7OF0_R_A
R:10 [LEU] A:1770 [G] P:2 [ALA] A:443 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:10 [LEU] A:2291 [A] P:2 [ALA] A:1242 [A] ❌ 7OF0_R_A
R:32 [ARG] A:2683 [C] P:25 [TYR] A:2016 [A] ❌ 7OF0_R_A
R:35 [LYS] A:1827 [C] P:28 [ARG] A:530 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:11 [ARG] A:1775 [A] P:3 [ARG] A:448 [A] ❌ 7OF0_R_A
R:11 [ARG] A:1865 [C] P:3 [ARG] A:582 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:44 [ARG] A:1844 [A] P:37 [GLN] A:561 [A] ❌ 7OF0_R_A
R:12 [ASN] A:1865 [C] P:4 [VAL] A:582 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:54 [THR] A:2251 [A] P:47 [TYR] A:1154 [A] ❌ 7OF0_R_A
R:54 [THR] A:2143 [G] P:47 [TYR] A:989 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:55 [LYS] A:1842 [A] P:48 [ARG] A:559 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:55 [LYS] A:1829 [A] P:48 [ARG] A:532 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:55 [LYS] A:1830 [G] P:48 [ARG] A:533 [U] ❌ 7OF0_R_A
R:55 [LYS] A:1841 [U] P:48 [ARG] A:558 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:55 [LYS] A:1840 [C] P:48 [ARG] A:557 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:56 [ALA] A:1829 [A] P:49 [ASP] A:532 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:56 [ALA] A:1841 [U] P:49 [ASP] A:558 [C] ❌ 7OF0_R_A
R:56 [ALA] A:1840 [C] P:49 [ASP] A:557 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:59 [LEU] A:1840 [C] P:52 [GLN] A:557 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:62 [LYS] A:2251 [A] P:55 [ARG] A:1154 [A] ❌ 7OF0_R_A
R:62 [LYS] A:2127 [A] P:55 [ARG] A:973 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:63 [ASN] A:1831 [G] P:56 [GLN] A:534 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:64 [MET] A:1832 [A] P:57 [PHE] A:535 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:14 [VAL] A:1866 [U] P:6 [ARG] A:583 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:14 [VAL] A:1864 [A] P:6 [ARG] A:581 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:85 [ALA] A:2245 [A] P:78 [ARG] A:1148 [U] ❌ 7OF0_R_A
R:88 [GLY] A:2246 [A] P:81 [ASP] A:1149 [G] ❌ 7OF0_R_A
R:82 [LYS] A:2243 [A] P:75 [SER] A:1140 [A] ❌ 7RYG_A:1140 no longer at interface
R:82 [LYS] A:2244 [U] P:75 [SER] A:1147 [G] ❌ 7RYG_A:1147 no longer at interface
R:34 [ARG] A:1860 [A] P:27 [ALA] A:577 [G] ❌ 7RYG_A:577 no longer at interface
R:11 [ARG] A:1769 [C] P:3 [ARG] A:442 [A] ❌ 7RYG_A:442 no longer at interface
R:37 [ARG] A:1814 [A] P:30 [ARG] A:513 [A] ❌ 7RYG_A:513 no longer at interface
R:125 [HIS] A:2244 [U] P:118 [ALA] A:1147 [G] ❌ 7RYG_P:118, 7RYG_A:1147 no longer at interface
R:124 [ARG] A:2243 [A] P:117 [LEU] A:1140 [A] ❌ 7RYG_P:117, 7RYG_A:1140 no longer at interface
R:124 [ARG] A:2244 [U] P:117 [LEU] A:1147 [G] ❌ 7RYG_P:117, 7RYG_A:1147 no longer at interface
R:58 [TYR] A:2262 [C] P:51 [ARG] A:1181 [G] ❌ 7RYG_A:1181 no longer at interface
R:18 [TYR] A:1813 [C] P:11 [HIS] A:512 [A] ❌ 7OF0_R:18, 7OF0_A:1813 no longer at interface
R:20 [ARG] A:2022 [G] P:13 [ARG] A:810 [C] ❌ 7OF0_A:2022 no longer at interface
R:54 [THR] A:2141 [U] P:47 [TYR] A:987 [A] ❌ 7OF0_A:2141 no longer at interface
R:13 [ARG] A:1677 [C] P:5 [LYS] A:37 [G] ❌ 7OF0_A:1677 no longer at interface
R:13 [ARG] A:1676 [A] P:5 [LYS] A:36 [U] ❌ 7OF0_A:1676 no longer at interface
R:58 [TYR] A:2141 [U] P:51 [ARG] A:987 [A] ❌ 7OF0_A:2141 no longer at interface
R:62 [LYS] A:2128 [G] P:55 [ARG] A:974 [G] ❌ 7OF0_A:2128 no longer at interface
R:64 [MET] A:1833 [C] P:57 [PHE] A:536 [G] ❌ 7OF0_A:1833 no longer at interface
R:15 [THR] A:1676 [A] P:8 [VAL] A:36 [U] ❌ 7OF0_A:1676 no longer at interface
R:15 [THR] A:1677 [C] P:8 [VAL] A:37 [G] ❌ 7OF0_A:1677 no longer at interface
R:47 [ILE] A:2296 [U] P:40 [ILE] A:1247 [G] ❌ 7RYG_P:40 no longer at interface
R:124 [ARG] A:2245 [A] P:117 [LEU] A:1148 [U] ❌ 7RYG_P:117 no longer at interface
R:18 [TYR] A:1864 [A] P:11 [HIS] A:581 [G] ❌ 7OF0_R:18 no longer at interface
R:19 [PHE] A:2273 [A] P:12 [ARG] A:1192 [G] ❌ 7OF0_R:19 no longer at interface
R:91 [VAL] A:2148 [A] P:84 [LYS] A:994 [G] ❌ 7OF0_R:91 no longer at interface
R:91 [VAL] A:2149 [G] P:84 [LYS] A:995 [C] ❌ 7OF0_R:91 no longer at interface
R:91 [VAL] A:2247 [C] P:84 [LYS] A:1150 [C] ❌ 7OF0_R:91 no longer at interface
R:92 [LYS] A:2246 [A] P:85 [LYS] A:1149 [G] ❌ 7OF0_R:92 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.93 2.23 0.29 0.93 0.93 0.95 0.9 0.70 0.71 0.27 0.28


Other pairs involving 7OF0_R_A or 7RYG_P_A

Total number of entries: 5

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4Y4O_1U_1A 7RYG_P_A 0.88 0.96 1.29 0.55 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1U_1A 7OF0_R_A 0.69 0.97 1.77 0.27 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7OF0_R_A 7RYG_P_A 0.70 0.93 2.23 0.29 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_O_A 7OF0_R_A 0.68 0.96 2.06 0.25 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_O_A 7RYG_P_A 0.86 0.98 0.88 0.59 Ribosomal protein L20 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare