RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group87 > 6S0X_j_a vs 7RYG_j_a

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0X_j
6S0X_a
7RYG_j
7RYG_a
Conserved?
j:54 [ALA] a:1070 [U] j:54 [SER] a:1056 [C] ✔
j:54 [ALA] a:1071 [U] j:54 [SER] a:1057 [U] ✔
j:55 [VAL] a:1069 [G] j:55 [PRO] a:1055 [G] ✔
j:55 [VAL] a:1070 [U] j:55 [PRO] a:1056 [C] ✔
j:55 [VAL] a:1071 [U] j:55 [PRO] a:1057 [U] ✔
j:55 [VAL] a:1208 [A] j:55 [PRO] a:1195 [G] ✔
j:55 [VAL] a:1209 [U] j:55 [PRO] a:1196 [U] ✔
j:55 [VAL] a:1212 [U] j:55 [PRO] a:1199 [U] ✔
j:39 [PRO] a:1134 [A] j:39 [PRO] a:1120 [A] ✔
j:57 [LYS] a:973 [A] j:57 [VAL] a:961 [A] ✔
j:57 [LYS] a:981 [C] j:57 [VAL] a:969 [C] ✔
j:57 [LYS] a:982 [G] j:57 [VAL] a:970 [G] ✔
j:57 [LYS] a:1208 [A] j:57 [VAL] a:1195 [G] ✔
j:50 [THR] a:984 [A] j:50 [ASN] a:972 [A] ✔
j:50 [THR] a:1377 [U] j:50 [ASN] a:1364 [C] ✔
j:53 [ARG] a:1070 [U] j:53 [THR] a:1056 [C] ✔
j:53 [ARG] a:1071 [U] j:53 [THR] a:1057 [U] ✔
j:44 [THR] a:1162 [A] j:44 [THR] a:1149 [A] ✔
j:61 [SER] a:1071 [U] j:61 [ALA] a:1057 [U] ✔
j:61 [SER] a:1072 [G] j:61 [ALA] a:1058 [G] ✔
j:15 [HIS] a:1162 [A] j:15 [HIS] a:1149 [A] ✔
j:15 [HIS] a:1163 [G] j:15 [HIS] a:1150 [G] ✔
j:9 [ARG] a:1137 [U] j:9 [ARG] a:1123 [U] ✔
j:40 [ILE] a:1134 [A] j:40 [ILE] a:1120 [A] ✔
j:40 [ILE] a:1135 [G] j:40 [ILE] a:1121 [C] ✔
j:40 [ILE] a:1136 [U] j:40 [ILE] a:1122 [U] ✔
j:71 [LYS] a:1289 [A] j:71 [LYS] a:1276 [A] ✔
j:71 [LYS] a:1290 [A] j:71 [LYS] a:1277 [A] ✔
j:41 [PRO] a:1161 [A] j:41 [PRO] a:1148 [A] ✔
j:52 [ILE] a:982 [G] j:52 [LEU] a:970 [G] ✔
j:52 [ILE] a:983 [A] j:52 [LEU] a:971 [A] ✔
j:59 [LYS] a:981 [C] j:59 [LYS] a:969 [C] ✔
j:59 [LYS] a:982 [G] j:59 [LYS] a:970 [G] ✔
j:73 [LEU] a:1136 [U] j:73 [LEU] a:1122 [U] ✔
j:73 [LEU] a:1137 [U] j:73 [LEU] a:1123 [U] ✔
j:7 [ARG] a:1136 [U] j:7 [ARG] a:1122 [U] ✔
j:7 [ARG] a:1137 [U] j:7 [ARG] a:1123 [U] ✔
j:56 [HIS] a:972 [G] j:56 [HIS] a:960 [G] ✔
j:56 [HIS] a:982 [G] j:56 [HIS] a:970 [G] ✔
j:56 [HIS] a:1208 [A] j:56 [HIS] a:1195 [G] ✔
j:56 [HIS] a:1209 [U] j:56 [HIS] a:1196 [U] ✔
j:58 [TYR] a:978 [A] j:58 [ASN] a:966 [A] ✔
j:58 [TYR] a:1071 [U] j:58 [ASN] a:1057 [U] ✔
j:58 [TYR] a:1072 [G] j:58 [ASN] a:1058 [G] ✔
j:43 [PRO] a:1161 [A] j:43 [PRO] a:1148 [A] ✔
j:43 [PRO] a:1290 [A] j:43 [PRO] a:1277 [A] ✔
j:38 [GLY] a:1134 [A] j:38 [GLY] a:1120 [A] ✔
j:38 [GLY] a:1135 [G] j:38 [GLY] a:1121 [C] ✔
j:62 [ARG] a:1376 [C] j:62 [ARG] a:1363 [C] ✔
j:62 [ARG] a:1377 [U] j:62 [ARG] a:1364 [C] ✔
j:45 [GLU] a:1264 [G] j:45 [ARG] a:1251 [G] ✔
j:42 [LEU] a:1161 [A] j:42 [MET] a:1148 [A] ✔
j:42 [LEU] a:1290 [A] j:42 [MET] a:1277 [A] ✔
j:37 [SER] a:1134 [A] j:37 [CYS] a:1120 [A] ✔
j:37 [SER] a:1135 [G] j:37 [CYS] a:1121 [C] ✔
j:37 [SER] a:1136 [U] j:37 [CYS] a:1122 [U] ✔
j:72 [ARG] a:1162 [A] j:72 [ARG] a:1149 [A] ✔
j:39 [PRO] a:1162 [A] j:39 [PRO] a:1149 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:57 [LYS] a:978 [A] j:57 [VAL] a:966 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:53 [ARG] a:1072 [G] j:53 [THR] a:1058 [G] ❌ 7RYG_j_a
j:9 [ARG] a:1289 [A] j:9 [ARG] a:1276 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:9 [ARG] a:1290 [A] j:9 [ARG] a:1277 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:40 [ILE] a:1161 [A] j:40 [ILE] a:1148 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:19 [ASP] a:1163 [G] j:19 [ASP] a:1150 [G] ❌ 7RYG_j_a
j:41 [PRO] a:1162 [A] j:41 [PRO] a:1149 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:59 [LYS] a:978 [A] j:59 [LYS] a:966 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:73 [LEU] a:1290 [A] j:73 [LEU] a:1277 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:56 [HIS] a:1212 [U] j:56 [HIS] a:1199 [U] ❌ 7RYG_j_a
j:58 [TYR] a:1208 [A] j:58 [ASN] a:1195 [G] ❌ 7RYG_j_a
j:43 [PRO] a:1162 [A] j:43 [PRO] a:1149 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:42 [LEU] a:1162 [A] j:42 [MET] a:1149 [A] ❌ 7RYG_j_a
j:19 [ASP] a:1162 [A] j:19 [ASP] a:1149 [A] ❌ 6S0X_j_a
j:41 [PRO] a:1134 [A] j:41 [PRO] a:1120 [A] ❌ 6S0X_j_a
j:42 [LEU] a:1136 [U] j:42 [MET] a:1122 [U] ❌ 6S0X_j_a
j:42 [LEU] a:1137 [U] j:42 [MET] a:1123 [U] ❌ 6S0X_j_a
j:44 [THR] a:1161 [A] j:44 [THR] a:1148 [A] ❌ 6S0X_j_a
j:54 [ALA] a:1208 [A] j:54 [SER] a:1195 [G] ❌ 6S0X_j_a
j:55 [VAL] a:982 [G] j:55 [PRO] a:970 [G] ❌ 6S0X_j_a
j:56 [HIS] a:973 [A] j:56 [HIS] a:961 [A] ❌ 6S0X_j_a
j:57 [LYS] a:972 [G] j:57 [VAL] a:960 [G] ❌ 6S0X_j_a
j:58 [TYR] a:981 [C] j:58 [ASN] a:969 [C] ❌ 6S0X_j_a
j:59 [LYS] a:1376 [C] j:59 [LYS] a:1363 [C] ❌ 6S0X_j_a
j:59 [LYS] a:984 [A] j:59 [LYS] a:972 [A] ❌ 6S0X_j_a
j:62 [ARG] a:984 [A] j:62 [ARG] a:972 [A] ❌ 6S0X_j_a
j:71 [LYS] a:1137 [U] j:71 [LYS] a:1123 [U] ❌ 6S0X_j_a
j:72 [ARG] a:1161 [A] j:72 [ARG] a:1148 [A] ❌ 6S0X_j_a
j:60 [ASP] a:977 [A] j:60 [ASP] a:965 [A] ❌ 7RYG_j:60, 7RYG_a:965 no longer at interface
j:60 [ASP] a:979 [C] j:60 [ASP] a:967 [C] ❌ 7RYG_j:60, 7RYG_a:967 no longer at interface
j:39 [PRO] a:1133 [U] j:39 [PRO] a:1119 [U] ❌ 7RYG_a:1119 no longer at interface
j:57 [LYS] a:974 [A] j:57 [VAL] a:962 [U] ❌ 7RYG_a:962 no longer at interface
j:57 [LYS] a:1207 [A] j:57 [VAL] a:1194 [A] ❌ 7RYG_a:1194 no longer at interface
j:56 [HIS] a:1211 [A] j:56 [HIS] a:1198 [A] ❌ 7RYG_a:1198 no longer at interface
j:58 [TYR] a:977 [A] j:58 [ASN] a:965 [A] ❌ 7RYG_a:965 no longer at interface
j:58 [TYR] a:1207 [A] j:58 [ASN] a:1194 [A] ❌ 7RYG_a:1194 no longer at interface
j:68 [ARG] a:1125 [C] j:68 [ARG] a:1111 [C] ❌ 7RYG_a:1111 no longer at interface
j:41 [PRO] a:1160 [U] j:41 [PRO] a:1147 [U] ❌ 6S0X_a:1160 no longer at interface
j:42 [LEU] a:1160 [U] j:42 [MET] a:1147 [U] ❌ 6S0X_a:1160 no longer at interface
j:43 [PRO] a:1160 [U] j:43 [PRO] a:1147 [U] ❌ 6S0X_a:1160 no longer at interface
j:44 [THR] a:1160 [U] j:44 [THR] a:1147 [U] ❌ 6S0X_a:1160 no longer at interface
j:45 [GLU] a:1265 [G] j:45 [ARG] a:1252 [G] ❌ 6S0X_a:1265 no longer at interface
j:46 [LYS] a:1263 [G] j:46 [ILE] a:1250 [G] ❌ 6S0X_j:46, 6S0X_a:1263 no longer at interface
j:59 [LYS] a:980 [G] j:59 [LYS] a:968 [G] ❌ 6S0X_a:980 no longer at interface
j:63 [GLU] a:1199 [U] j:63 [ASP] a:1186 [C] ❌ 6S0X_j:63, 6S0X_a:1199 no longer at interface
j:68 [ARG] a:1126 [U] j:68 [ARG] a:1112 [U] ❌ 6S0X_a:1126 no longer at interface
j:9 [ARG] a:1291 [U] j:9 [ARG] a:1278 [U] ❌ 6S0X_a:1291 no longer at interface
j:48 [VAL] a:1377 [U] j:48 [ARG] a:1364 [C] ❌ 7RYG_j:48 no longer at interface
j:48 [VAL] a:1378 [A] j:48 [ARG] a:1365 [G] ❌ 7RYG_j:48 no longer at interface
j:60 [ASP] a:1072 [G] j:60 [ASP] a:1058 [G] ❌ 7RYG_j:60 no longer at interface
j:11 [LYS] a:1289 [A] j:11 [LYS] a:1276 [A] ❌ 6S0X_j:11 no longer at interface
j:16 [ARG] a:1163 [G] j:16 [ARG] a:1150 [G] ❌ 6S0X_j:16 no longer at interface
j:36 [VAL] a:1135 [G] j:36 [VAL] a:1121 [C] ❌ 6S0X_j:36 no longer at interface
j:46 [LYS] a:1264 [G] j:46 [ILE] a:1251 [G] ❌ 6S0X_j:46 no longer at interface
j:47 [SER] a:1264 [G] j:47 [GLU] a:1251 [G] ❌ 6S0X_j:47 no longer at interface
j:64 [GLN] a:1377 [U] j:64 [GLN] a:1364 [C] ❌ 6S0X_j:64 no longer at interface
j:64 [GLN] a:1378 [A] j:64 [GLN] a:1365 [G] ❌ 6S0X_j:64 no longer at interface
j:70 [HIS] a:1162 [A] j:70 [TYR] a:1149 [A] ❌ 6S0X_j:70 no longer at interface
j:75 [ASP] a:1136 [U] j:75 [ASP] a:1122 [U] ❌ 6S0X_j:75 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal protein S10 Bacterial small subunit ribosomal RNA 0.96 3.17 0.57 0.85 0.96 0.93 0.79 0.60 0.48 0.14 0.52


Other pairs involving 6S0X_j_a or 7RYG_j_a

Total number of entries: 6

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4Y4O_1j_1a 6S0X_j_a 0.67 0.95 2.77 0.53 Ribosomal protein S10 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1j_1a 7RYG_j_a 0.34 0.91 4.08 0.11 Ribosomal protein S10 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
6S0X_j_a 7RYG_j_a 0.60 0.96 3.17 0.57 Ribosomal protein S10 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
6S0X_j_a 7O7Y_At_A2 0.54 0.9 2.76 0.33 Ribosomal protein S10 compare
6S0X_j_a 7K00_J_A 0.73 0.96 2.98 0.62 Ribosomal protein S10 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
7K00_J_A 7RYG_j_a 0.32 0.93 4.14 0.18 Ribosomal protein S10 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare