RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group88 > 6S0X_s_a vs 7O7Y_Ao_A2

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0X_s
6S0X_a
7O7Y_Ao
7O7Y_A2
Conserved?
s:82 [GLY] a:964 [U] Ao:126 [VAL] A2:1238 [C] ✔
s:82 [GLY] a:965 [U] Ao:126 [VAL] A2:1239 [PSU] ✔
s:78 [ARG] a:967 [A] Ao:122 [THR] A2:1241 [A] ✔
s:78 [ARG] a:968 [A] Ao:122 [THR] A2:1242 [A] ✔
s:32 [LYS] a:1023 [A] Ao:77 [LYS] A2:1299 [G] ✔
s:54 [GLY] a:967 [A] Ao:98 [ASN] A2:1241 [A] ✔
s:54 [GLY] a:1230 [G] Ao:98 [ASN] A2:1516 [G] ✔
s:54 [GLY] a:1231 [G] Ao:98 [ASN] A2:1517 [G] ✔
s:80 [PHE] a:965 [U] Ao:124 [LYS] A2:1239 [PSU] ✔
s:80 [PHE] a:1235 [A] Ao:124 [LYS] A2:1521 [G] ✔
s:53 [ASP] a:1230 [G] Ao:97 [TYR] A2:1516 [G] ✔
s:81 [LYS] a:965 [U] Ao:125 [PRO] A2:1239 [PSU] ✔
s:55 [ARG] a:967 [A] Ao:99 [GLY] A2:1241 [A] ✔
s:55 [ARG] a:995 [A] Ao:99 [GLY] A2:1269 [C] ✔
s:55 [ARG] a:1230 [G] Ao:99 [GLY] A2:1516 [G] ✔
s:72 [GLY] a:1330 [C] Ao:115 [TYR] A2:1622 [U] ✔
s:36 [ARG] a:1330 [C] Ao:82 [ASP] A2:1622 [U] ✔
s:83 [HIS] a:964 [U] Ao:127 [LYS] A2:1238 [C] ✔
s:83 [HIS] a:965 [U] Ao:127 [LYS] A2:1239 [PSU] ✔
s:33 [THR] a:1023 [A] Ao:78 [THR] A2:1299 [G] ✔
s:78 [ARG] a:965 [U] Ao:122 [THR] A2:1239 [PSU] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:78 [ARG] a:966 [U] Ao:122 [THR] A2:1240 [U] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:32 [LYS] a:996 [A] Ao:77 [LYS] A2:1270 [G] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:32 [LYS] a:1022 [G] Ao:77 [LYS] A2:1298 [U] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:79 [THR] a:965 [U] Ao:123 [TYR] A2:1239 [PSU] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:79 [THR] a:966 [U] Ao:123 [TYR] A2:1240 [U] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:54 [GLY] a:994 [C] Ao:98 [ASN] A2:1268 [C] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:54 [GLY] a:995 [A] Ao:98 [ASN] A2:1269 [C] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:80 [PHE] a:1236 [C] Ao:124 [LYS] A2:1522 [C] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:53 [ASP] a:967 [A] Ao:97 [TYR] A2:1241 [A] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:53 [ASP] a:968 [A] Ao:97 [TYR] A2:1242 [A] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:53 [ASP] a:1231 [G] Ao:97 [TYR] A2:1517 [G] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:55 [ARG] a:966 [U] Ao:99 [GLY] A2:1240 [U] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:72 [GLY] a:1331 [U] Ao:115 [TYR] A2:1623 [U] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:36 [ARG] a:1230 [G] Ao:82 [ASP] A2:1516 [G] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:36 [ARG] a:1231 [G] Ao:82 [ASP] A2:1517 [G] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:36 [ARG] a:1331 [U] Ao:82 [ASP] A2:1623 [U] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:77 [THR] a:967 [A] Ao:121 [ILE] A2:1241 [A] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:77 [THR] a:968 [A] Ao:121 [ILE] A2:1242 [A] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:77 [THR] a:1231 [G] Ao:121 [ILE] A2:1517 [G] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:77 [THR] a:1232 [G] Ao:121 [ILE] A2:1518 [G] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:83 [HIS] a:1236 [C] Ao:127 [LYS] A2:1522 [C] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:83 [HIS] a:1237 [A] Ao:127 [LYS] A2:1523 [A] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:10 [PHE] a:1328 [A] Ao:42 [ARG] A2:1620 [A] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:10 [PHE] a:1329 [A] Ao:42 [ARG] A2:1621 [A] ❌ 7O7Y_Ao_A2
s:72 [GLY] a:1329 [A] Ao:115 [TYR] A2:1621 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:72 [GLY] a:1328 [A] Ao:115 [TYR] A2:1620 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:77 [THR] a:1331 [U] Ao:121 [ILE] A2:1623 [U] ❌ 6S0X_s_a
s:78 [ARG] a:1231 [G] Ao:122 [THR] A2:1517 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:78 [ARG] a:1232 [G] Ao:122 [THR] A2:1518 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:78 [ARG] a:1331 [U] Ao:122 [THR] A2:1623 [U] ❌ 6S0X_s_a
s:79 [THR] a:1235 [A] Ao:123 [TYR] A2:1521 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:79 [THR] a:1331 [U] Ao:123 [TYR] A2:1623 [U] ❌ 6S0X_s_a
s:79 [THR] a:968 [A] Ao:123 [TYR] A2:1242 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:80 [PHE] a:967 [A] Ao:124 [LYS] A2:1241 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:80 [PHE] a:966 [U] Ao:124 [LYS] A2:1240 [U] ❌ 6S0X_s_a
s:82 [GLY] a:1235 [A] Ao:126 [VAL] A2:1521 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:82 [GLY] a:1236 [C] Ao:126 [VAL] A2:1522 [C] ❌ 6S0X_s_a
s:82 [GLY] a:1237 [A] Ao:126 [VAL] A2:1523 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:10 [PHE] a:1322 [G] Ao:42 [ARG] A2:1614 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:10 [PHE] a:1323 [U] Ao:42 [ARG] A2:1615 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:32 [LYS] a:1024 [G] Ao:77 [LYS] A2:1300 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:36 [ARG] a:1329 [A] Ao:82 [ASP] A2:1621 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:36 [ARG] a:1328 [A] Ao:82 [ASP] A2:1620 [A] ❌ 6S0X_s_a
s:53 [ASP] a:996 [A] Ao:97 [TYR] A2:1270 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:53 [ASP] a:1229 [U] Ao:97 [TYR] A2:1515 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:53 [ASP] a:995 [A] Ao:97 [TYR] A2:1269 [C] ❌ 6S0X_s_a
s:55 [ARG] a:1231 [G] Ao:99 [GLY] A2:1517 [G] ❌ 6S0X_s_a
s:55 [ARG] a:994 [C] Ao:99 [GLY] A2:1268 [C] ❌ 6S0X_s_a
s:79 [THR] a:970 [U] Ao:123 [TYR] A2:1243 [U] ❌ 6S0X_a:970 no longer at interface
s:80 [PHE] a:970 [U] Ao:124 [LYS] A2:1243 [U] ❌ 6S0X_a:970 no longer at interface
s:82 [GLY] a:970 [U] Ao:126 [VAL] A2:1243 [U] ❌ 6S0X_a:970 no longer at interface
s:19 [VAL] a:1025 [A] Ao:58 [LYS] A2:1301 [U] ❌ 6S0X_s:19, 6S0X_a:1025 no longer at interface
s:21 [ALA] a:1021 [A] Ao:60 [LEU] A2:1296 [A] ❌ 7O7Y_Ao:60 no longer at interface
s:21 [ALA] a:1022 [G] Ao:60 [LEU] A2:1298 [U] ❌ 7O7Y_Ao:60 no longer at interface
s:22 [GLN] a:1022 [G] Ao:61 [ARG] A2:1298 [U] ❌ 7O7Y_Ao:61 no longer at interface
s:69 [HIS] a:1330 [C] Ao:112 [ILE] A2:1622 [U] ❌ 7O7Y_Ao:112 no longer at interface
s:56 [LYS] a:995 [A] Ao:103 [ASN] A2:1269 [C] ❌ 7O7Y_Ao:103 no longer at interface
s:56 [LYS] a:996 [A] Ao:103 [ASN] A2:1270 [G] ❌ 7O7Y_Ao:103 no longer at interface
s:18 [LYS] a:1022 [G] Ao:57 [LEU] A2:1298 [U] ❌ 7O7Y_Ao:57 no longer at interface
s:18 [LYS] a:1023 [A] Ao:57 [LEU] A2:1299 [G] ❌ 7O7Y_Ao:57 no longer at interface
s:34 [TRP] a:1023 [A] Ao:80 [LEU] A2:1299 [G] ❌ 7O7Y_Ao:80 no longer at interface
s:34 [TRP] a:1024 [G] Ao:80 [LEU] A2:1300 [A] ❌ 7O7Y_Ao:80 no longer at interface
s:34 [TRP] a:1229 [U] Ao:80 [LEU] A2:1515 [G] ❌ 7O7Y_Ao:80 no longer at interface
s:34 [TRP] a:1230 [G] Ao:80 [LEU] A2:1516 [G] ❌ 7O7Y_Ao:80 no longer at interface
s:37 [ARG] a:1230 [G] Ao:83 [MET] A2:1516 [G] ❌ 7O7Y_Ao:83 no longer at interface
s:37 [ARG] a:1327 [C] Ao:83 [MET] A2:1619 [C] ❌ 7O7Y_Ao:83 no longer at interface
s:37 [ARG] a:1328 [A] Ao:83 [MET] A2:1620 [A] ❌ 7O7Y_Ao:83 no longer at interface
s:37 [ARG] a:1330 [C] Ao:83 [MET] A2:1622 [U] ❌ 7O7Y_Ao:83 no longer at interface
s:73 [GLU] a:1330 [C] Ao:116 [LEU] A2:1622 [U] ❌ 7O7Y_Ao:116 no longer at interface
s:14 [HIS] a:1022 [G] Ao:49 [LEU] A2:1298 [U] ❌ 7O7Y_Ao:49 no longer at interface
s:14 [HIS] a:1024 [G] Ao:49 [LEU] A2:1300 [A] ❌ 7O7Y_Ao:49 no longer at interface
s:12 [ASP] a:1328 [A] Ao:45 [LEU] A2:1620 [A] ❌ 7O7Y_Ao:45 no longer at interface
s:52 [TYR] a:995 [A] Ao:96 [VAL] A2:1269 [C] ❌ 7O7Y_Ao:96 no longer at interface
s:52 [TYR] a:996 [A] Ao:96 [VAL] A2:1270 [G] ❌ 7O7Y_Ao:96 no longer at interface
s:52 [TYR] a:1023 [A] Ao:96 [VAL] A2:1299 [G] ❌ 7O7Y_Ao:96 no longer at interface
s:52 [TYR] a:1230 [G] Ao:96 [VAL] A2:1516 [G] ❌ 7O7Y_Ao:96 no longer at interface
s:52 [TYR] a:1231 [G] Ao:96 [VAL] A2:1517 [G] ❌ 7O7Y_Ao:96 no longer at interface
s:70 [LYS] a:1329 [A] Ao:113 [GLY] A2:1621 [A] ❌ 7O7Y_Ao:113 no longer at interface
s:70 [LYS] a:1330 [C] Ao:113 [GLY] A2:1622 [U] ❌ 7O7Y_Ao:113 no longer at interface
s:31 [ILE] a:1023 [A] Ao:76 [VAL] A2:1299 [G] ❌ 7O7Y_Ao:76 no longer at interface
s:74 [PHE] a:1330 [C] Ao:118 [GLU] A2:1622 [U] ❌ 6S0X_s:74 no longer at interface
s:76 [PRO] a:1331 [U] Ao:120 [SER] A2:1623 [U] ❌ 6S0X_s:76 no longer at interface
s:9 [PRO] a:1322 [G] Ao:35 [GLN] A2:1614 [G] ❌ 6S0X_s:9 no longer at interface
s:11 [VAL] a:1329 [A] Ao:44 [ARG] A2:1621 [A] ❌ 6S0X_s:11 no longer at interface
s:11 [VAL] a:1328 [A] Ao:44 [ARG] A2:1620 [A] ❌ 6S0X_s:11 no longer at interface
s:35 [SER] a:1331 [U] Ao:81 [ARG] A2:1623 [U] ❌ 6S0X_s:35 no longer at interface
s:35 [SER] a:1231 [G] Ao:81 [ARG] A2:1517 [G] ❌ 6S0X_s:35 no longer at interface
s:35 [SER] a:1230 [G] Ao:81 [ARG] A2:1516 [G] ❌ 6S0X_s:35 no longer at interface
s:35 [SER] a:1330 [C] Ao:81 [ARG] A2:1622 [U] ❌ 6S0X_s:35 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal protein S19 0.89 4.66 0.06 0.72 0.89 0.45 0.94 0.21 0.18 0.00 0.46


Other pairs involving 6S0X_s_a or 7O7Y_Ao_A2

Total number of entries: 6

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4Y4O_1s_1a 6S0X_s_a 0.33 0.94 6.37 0.11 Ribosomal protein S19 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1s_1a 7O7Y_Ao_A2 0.62 0.93 2.94 0.43 Ribosomal protein S19 compare
6S0X_s_a 7O7Y_Ao_A2 0.21 0.89 4.66 0.06 Ribosomal protein S19 compare
6S0X_s_a 7RYG_s_a 0.50 0.96 5.57 0.35 Ribosomal protein S19 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
6S0X_s_a 7K00_S_A 0.32 0.94 5.84 0.17 Ribosomal protein S19 Bacterial small subunit ribosomal RNA compare
7K00_S_A 7O7Y_Ao_A2 0.55 0.92 2.87 0.27 Ribosomal protein S19 compare