Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 2VQE_I
|
2VQE_A
|
6S0X_i
|
6S0X_a
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| I:64 [THR] | A:1128 [C] | i:68 [ASN] | a:1139 [C] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1249 [C] | i:73 [GLY] | a:1259 [C] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1250 [A] | i:73 [GLY] | a:1260 [A] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1371 [G] | i:73 [GLY] | a:1381 [G] | ✔ |
| I:71 [SER] | A:1372 [U] | i:75 [THR] | a:1382 [U] | ✔ |
| I:71 [SER] | A:1373 [G] | i:75 [THR] | a:1383 [G] | ✔ |
| I:18 [PHE] | A:1130 [A] | i:22 [ARG] | a:1141 [A] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1232 [U] | i:129 [PHE] | a:1242 [U] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1342 [C] | i:129 [PHE] | a:1352 [C] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1343 [G] | i:129 [PHE] | a:1353 [G] | ✔ |
| I:7 [THR] | A:1119 [C] | i:11 [THR] | a:1130 [G] | ✔ |
| I:7 [THR] | A:1147 [C] | i:11 [THR] | a:1158 [U] | ✔ |
| I:7 [THR] | A:1148 [U] | i:11 [THR] | a:1159 [C] | ✔ |
| I:113 [LYS] | A:1368 [G] | i:118 [PRO] | a:1378 [A] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1343 [G] | i:125 [ARG] | a:1353 [G] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1344 [C] | i:125 [ARG] | a:1354 [C] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1349 [A] | i:125 [ARG] | a:1359 [A] | ✔ |
| I:16 [ARG] | A:1128 [C] | i:20 [ARG] | a:1139 [C] | ✔ |
| I:16 [ARG] | A:1147 [C] | i:20 [ARG] | a:1158 [U] | ✔ |
| I:16 [ARG] | A:1148 [U] | i:20 [ARG] | a:1159 [C] | ✔ |
| I:107 [ARG] | A:1347 [G] | i:111 [ARG] | a:1357 [G] | ✔ |
| I:10 [ARG] | A:1347 [G] | i:14 [ARG] | a:1357 [G] | ✔ |
| I:102 [LEU] | A:1179 [A] | i:106 [LEU] | a:1189 [A] | ✔ |
| I:103 [THR] | A:1179 [A] | i:107 [THR] | a:1189 [A] | ✔ |
| I:103 [THR] | A:1180 [A] | i:107 [THR] | a:1190 [A] | ✔ |
| I:125 [TYR] | A:1231 [G] | i:130 [SER] | a:1241 [G] | ✔ |
| I:125 [TYR] | A:1232 [U] | i:130 [SER] | a:1242 [U] | ✔ |
| I:108 [VAL] | A:1116 [C] | i:112 [MET] | a:1127 [U] | ✔ |
| I:108 [VAL] | A:1347 [G] | i:112 [MET] | a:1357 [G] | ✔ |
| I:104 [ARG] | A:1117 [G] | i:108 [ARG] | a:1128 [A] | ✔ |
| I:104 [ARG] | A:1118 [C] | i:108 [ARG] | a:1129 [A] | ✔ |
| I:104 [ARG] | A:1179 [A] | i:108 [ARG] | a:1189 [A] | ✔ |
| I:104 [ARG] | A:1180 [A] | i:108 [ARG] | a:1190 [A] | ✔ |
| I:72 [GLY] | A:1372 [U] | i:76 [GLY] | a:1382 [U] | ✔ |
| I:12 [GLU] | A:1251 [A] | i:16 [ASN] | a:1261 [A] | ✔ |
| I:12 [GLU] | A:1252 [A] | i:16 [ASN] | a:1262 [A] | ✔ |
| I:12 [GLU] | A:1370 [G] | i:16 [ASN] | a:1380 [G] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1347 [G] | i:15 [LYS] | a:1357 [G] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1370 [G] | i:15 [LYS] | a:1380 [G] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1371 [G] | i:15 [LYS] | a:1381 [G] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1372 [U] | i:15 [LYS] | a:1382 [U] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1373 [G] | i:15 [LYS] | a:1383 [G] | ✔ |
| I:66 [ARG] | A:1128 [C] | i:70 [HIS] | a:1139 [C] | ✔ |
| I:66 [ARG] | A:1148 [U] | i:70 [HIS] | a:1159 [C] | ✔ |
| I:62 [TYR] | A:1130 [A] | i:66 [LEU] | a:1141 [A] | ✔ |
| I:119 [ALA] | A:1349 [A] | i:123 [ALA] | a:1359 [A] | ✔ |
| I:36 [TYR] | A:1248 [A] | i:40 [TYR] | a:1258 [A] | ✔ |
| I:36 [TYR] | A:1249 [C] | i:40 [TYR] | a:1259 [C] | ✔ |
| I:73 [GLN] | A:1249 [C] | i:77 [GLN] | a:1259 [C] | ✔ |
| I:73 [GLN] | A:1250 [A] | i:77 [GLN] | a:1260 [A] | ✔ |
| I:9 [ARG] | A:1118 [C] | i:13 [ARG] | a:1129 [A] | ✔ |
| I:9 [ARG] | A:1119 [C] | i:13 [ARG] | a:1130 [G] | ✔ |
| I:9 [ARG] | A:1149 [C] | i:13 [ARG] | a:1160 [U] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1249 [C] | i:72 [GLY] | a:1259 [C] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1250 [A] | i:72 [GLY] | a:1260 [A] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1251 [A] | i:72 [GLY] | a:1261 [A] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1370 [G] | i:72 [GLY] | a:1380 [G] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1371 [G] | i:72 [GLY] | a:1381 [G] | ✔ |
| I:83 [ARG] | A:1118 [C] | i:87 [ARG] | a:1129 [A] | ✔ |
| I:83 [ARG] | A:1119 [C] | i:87 [ARG] | a:1130 [G] | ✔ |
| I:83 [ARG] | A:1179 [A] | i:87 [ARG] | a:1189 [A] | ✔ |
| I:38 [GLN] | A:1291 [G] | i:42 [PRO] | a:1301 [U] | ✔ |
| I:118 [LYS] | A:1349 [A] | i:122 [ALA] | a:1359 [A] | ✔ |
| I:111 [ARG] | A:1368 [G] | i:116 [LYS] | a:1378 [A] | ✔ |
| I:111 [ARG] | A:1369 [C] | i:116 [LYS] | a:1379 [C] | ✔ |
| I:67 [GLY] | A:1250 [A] | i:71 [GLY] | a:1260 [A] | ✔ |
| I:67 [GLY] | A:1251 [A] | i:71 [GLY] | a:1261 [A] | ✔ |
| I:97 [LYS] | A:1177 [G] | i:101 [LYS] | a:1187 [G] | ✔ |
| I:97 [LYS] | A:1178 [G] | i:101 [LYS] | a:1188 [G] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1343 [G] | i:124 [ARG] | a:1353 [G] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1344 [C] | i:124 [ARG] | a:1354 [C] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1345 [U] | i:124 [ARG] | a:1355 [U] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1348 [U] | i:124 [ARG] | a:1358 [U] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1349 [A] | i:124 [ARG] | a:1359 [A] | ✔ |
| I:116 [LYS] | A:1367 [C] | i:120 [LEU] | a:1377 [U] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1347 [G] | i:114 [GLU] | a:1357 [G] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1348 [U] | i:114 [GLU] | a:1358 [U] | ✔ |
| I:127 [LYS] | A:966 [G] | i:132 [ARG] | a:975 [G] | ✔ |
| I:20 [ARG] | A:1131 [G] | i:24 [VAL] | a:1142 [U] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1248 [A] | i:74 [PHE] | a:1258 [A] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1249 [C] | i:74 [PHE] | a:1259 [C] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1371 [G] | i:74 [PHE] | a:1381 [G] | ✔ |
| I:14 [VAL] | A:1148 [U] | i:18 [VAL] | a:1159 [C] | ✔ |
| I:14 [VAL] | A:1149 [C] | i:18 [VAL] | a:1160 [U] | ✔ |
| I:126 [SER] | A:970 [C] | i:131 [LYS] | a:979 [C] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1348 [U] | i:115 [ARG] | a:1358 [U] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1369 [C] | i:115 [ARG] | a:1379 [C] | ✔ |
| I:122 [ALA] | A:1343 [G] | i:126 [SER] | a:1353 [G] | ✔ |
| I:122 [ALA] | A:1344 [C] | i:126 [SER] | a:1354 [C] | ✔ |
| I:42 [ARG] | A:1373 [G] | i:46 [LEU] | a:1383 [G] | ✔ |
| I:112 [LYS] | A:1367 [C] | i:117 [LYS] | a:1377 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:112 [LYS] | A:1368 [G] | i:117 [LYS] | a:1378 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:112 [LYS] | A:1369 [C] | i:117 [LYS] | a:1379 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:69 [GLY] | A:1372 [U] | i:73 [GLY] | a:1382 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:124 [GLN] | A:1231 [G] | i:129 [PHE] | a:1241 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:124 [GLN] | A:1233 [G] | i:129 [PHE] | a:1243 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:113 [LYS] | A:1186 [G] | i:118 [PRO] | a:1196 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:113 [LYS] | A:1187 [G] | i:118 [PRO] | a:1197 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:113 [LYS] | A:1367 [C] | i:118 [PRO] | a:1377 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:121 [ARG] | A:1342 [C] | i:125 [ARG] | a:1352 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:121 [ARG] | A:1348 [U] | i:125 [ARG] | a:1358 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:117 [HIS] | A:1232 [U] | i:121 [LYS] | a:1242 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:117 [HIS] | A:1233 [G] | i:121 [LYS] | a:1243 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:102 [LEU] | A:1180 [A] | i:106 [LEU] | a:1190 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:125 [TYR] | A:1342 [C] | i:130 [SER] | a:1352 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:125 [TYR] | A:1343 [G] | i:130 [SER] | a:1353 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:108 [VAL] | A:1348 [U] | i:112 [MET] | a:1358 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:12 [GLU] | A:1250 [A] | i:16 [ASN] | a:1260 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:12 [GLU] | A:1371 [G] | i:16 [ASN] | a:1381 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:66 [ARG] | A:1249 [C] | i:70 [HIS] | a:1259 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:66 [ARG] | A:1250 [A] | i:70 [HIS] | a:1260 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:62 [TYR] | A:1128 [C] | i:66 [LEU] | a:1139 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:62 [TYR] | A:1129 [C] | i:66 [LEU] | a:1140 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:9 [ARG] | A:1148 [U] | i:13 [ARG] | a:1159 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:118 [LYS] | A:1348 [U] | i:122 [ALA] | a:1358 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:111 [ARG] | A:1186 [G] | i:116 [LYS] | a:1196 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:111 [ARG] | A:1187 [G] | i:116 [LYS] | a:1197 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:67 [GLY] | A:1249 [C] | i:71 [GLY] | a:1259 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:97 [LYS] | A:1176 [A] | i:101 [LYS] | a:1186 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:39 [GLY] | A:1291 [G] | i:43 [PHE] | a:1301 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:120 [ARG] | A:1186 [G] | i:124 [ARG] | a:1196 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:120 [ARG] | A:1346 [A] | i:124 [ARG] | a:1356 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:116 [LYS] | A:1344 [C] | i:120 [LEU] | a:1354 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:109 [VAL] | A:1370 [G] | i:114 [GLU] | a:1380 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:109 [VAL] | A:1371 [G] | i:114 [GLU] | a:1381 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:109 [VAL] | A:1373 [G] | i:114 [GLU] | a:1383 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:127 [LYS] | A:967 [C] | i:132 [ARG] | a:976 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:127 [LYS] | A:970 [C] | i:132 [ARG] | a:979 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:20 [ARG] | A:1130 [A] | i:24 [VAL] | a:1141 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:70 [LYS] | A:1290 [G] | i:74 [PHE] | a:1300 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:70 [LYS] | A:1372 [U] | i:74 [PHE] | a:1382 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:126 [SER] | A:1231 [G] | i:131 [LYS] | a:1241 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:126 [SER] | A:1232 [U] | i:131 [LYS] | a:1242 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:105 [ASP] | A:1347 [G] | i:109 [ASP] | a:1357 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:110 [GLU] | A:1186 [G] | i:115 [ARG] | a:1196 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:110 [GLU] | A:1187 [G] | i:115 [ARG] | a:1197 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:110 [GLU] | A:1347 [G] | i:115 [ARG] | a:1357 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| I:97 [LYS] | A:1180 [A] | i:101 [LYS] | a:1190 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:103 [THR] | A:1118 [C] | i:107 [THR] | a:1129 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:105 [ASP] | A:1117 [G] | i:109 [ASP] | a:1128 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:105 [ASP] | A:1118 [C] | i:109 [ASP] | a:1129 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:107 [ARG] | A:1346 [A] | i:111 [ARG] | a:1356 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:108 [VAL] | A:1117 [G] | i:112 [MET] | a:1128 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:110 [GLU] | A:1368 [G] | i:115 [ARG] | a:1378 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:110 [GLU] | A:1367 [C] | i:115 [ARG] | a:1377 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:111 [ARG] | A:1367 [C] | i:116 [LYS] | a:1377 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:112 [LYS] | A:1186 [G] | i:117 [LYS] | a:1196 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:112 [LYS] | A:1187 [G] | i:117 [LYS] | a:1197 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:117 [HIS] | A:1367 [C] | i:121 [LYS] | a:1377 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:119 [ALA] | A:1348 [U] | i:123 [ALA] | a:1358 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:9 [ARG] | A:1117 [G] | i:13 [ARG] | a:1128 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:125 [TYR] | A:970 [C] | i:130 [SER] | a:979 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:126 [SER] | A:966 [G] | i:131 [LYS] | a:975 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:126 [SER] | A:967 [C] | i:131 [LYS] | a:976 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:12 [GLU] | A:1369 [C] | i:16 [ASN] | a:1379 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:16 [ARG] | A:1130 [A] | i:20 [ARG] | a:1141 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:16 [ARG] | A:1129 [C] | i:20 [ARG] | a:1140 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:18 [PHE] | A:1129 [C] | i:22 [ARG] | a:1140 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:18 [PHE] | A:1147 [C] | i:22 [ARG] | a:1158 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:38 [GLN] | A:1248 [A] | i:42 [PRO] | a:1258 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:38 [GLN] | A:1290 [G] | i:42 [PRO] | a:1300 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:39 [GLY] | A:1290 [G] | i:43 [PHE] | a:1300 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:39 [GLY] | A:1373 [G] | i:43 [PHE] | a:1383 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:39 [GLY] | A:1372 [U] | i:43 [PHE] | a:1382 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:62 [TYR] | A:1131 [G] | i:66 [LEU] | a:1142 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1129 [C] | i:68 [ASN] | a:1140 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1130 [A] | i:68 [ASN] | a:1141 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:66 [ARG] | A:1149 [C] | i:70 [HIS] | a:1160 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:69 [GLY] | A:1370 [G] | i:73 [GLY] | a:1380 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:71 [SER] | A:1249 [C] | i:75 [THR] | a:1259 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:71 [SER] | A:1371 [G] | i:75 [THR] | a:1381 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:72 [GLY] | A:1371 [G] | i:76 [GLY] | a:1381 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:112 [LYS] | A:1366 [C] | i:117 [LYS] | a:1376 [C] | ❌ 6S0X_a:1376 no longer at interface |
| I:124 [GLN] | A:942 [G] | i:129 [PHE] | a:951 [G] | ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface |
| I:124 [GLN] | A:943 [U] | i:129 [PHE] | a:952 [U] | ❌ 6S0X_a:952 no longer at interface |
| I:121 [ARG] | A:941 [G] | i:125 [ARG] | a:950 [G] | ❌ 6S0X_a:950 no longer at interface |
| I:121 [ARG] | A:1350 [A] | i:125 [ARG] | a:1360 [A] | ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface |
| I:16 [ARG] | A:1127 [G] | i:20 [ARG] | a:1138 [G] | ❌ 6S0X_a:1138 no longer at interface |
| I:117 [HIS] | A:1366 [C] | i:121 [LYS] | a:1376 [C] | ❌ 6S0X_a:1376 no longer at interface |
| I:125 [TYR] | A:1341 [U] | i:130 [SER] | a:1351 [U] | ❌ 6S0X_a:1351 no longer at interface |
| I:66 [ARG] | A:1127 [G] | i:70 [HIS] | a:1138 [G] | ❌ 6S0X_a:1138 no longer at interface |
| I:68 [GLY] | A:1287 [A] | i:72 [GLY] | a:1297 [A] | ❌ 6S0X_a:1297 no longer at interface |
| I:118 [LYS] | A:1350 [A] | i:122 [ALA] | a:1360 [A] | ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface |
| I:118 [LYS] | A:1351 [U] | i:122 [ALA] | a:1361 [U] | ❌ 6S0X_a:1361 no longer at interface |
| I:111 [ARG] | A:1188 [A] | i:116 [LYS] | a:1198 [A] | ❌ 6S0X_a:1198 no longer at interface |
| I:39 [GLY] | A:1292 [U] | i:43 [PHE] | a:1302 [U] | ❌ 6S0X_a:1302 no longer at interface |
| I:106 [ALA] | A:1184 [G] | i:110 [PRO] | a:1194 [G] | ❌ 6S0X_i:110, 6S0X_a:1194 no longer at interface |
| I:114 [TYR] | A:1188 [A] | i:119 [GLY] | a:1198 [A] | ❌ 6S0X_i:119, 6S0X_a:1198 no longer at interface |
| I:114 [TYR] | A:1189 [C] | i:119 [GLY] | a:1199 [U] | ❌ 6S0X_i:119, 6S0X_a:1199 no longer at interface |
| I:125 [TYR] | A:971 [G] | i:130 [SER] | a:980 [G] | ❌ 2VQE_A:971 no longer at interface |
| I:18 [PHE] | A:1146 [A] | i:22 [ARG] | a:1157 [C] | ❌ 2VQE_A:1146 no longer at interface |
| I:39 [GLY] | A:1289 [A] | i:43 [PHE] | a:1299 [A] | ❌ 2VQE_A:1289 no longer at interface |
| I:70 [LYS] | A:1288 [A] | i:74 [PHE] | a:1298 [A] | ❌ 2VQE_A:1288 no longer at interface |
| I:70 [LYS] | A:1289 [A] | i:74 [PHE] | a:1299 [A] | ❌ 2VQE_A:1289 no longer at interface |
| I:5 [TYR] | A:1147 [C] | i:9 [ARG] | a:1158 [U] | ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface |
| I:5 [TYR] | A:1148 [U] | i:9 [ARG] | a:1159 [C] | ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface |
| I:40 [LEU] | A:1290 [G] | i:44 [GLU] | a:1300 [G] | ❌ 6S0X_i:44 no longer at interface |
| I:40 [LEU] | A:1291 [G] | i:44 [GLU] | a:1301 [U] | ❌ 6S0X_i:44 no longer at interface |
| I:93 [ARG] | A:1178 [G] | i:97 [ARG] | a:1188 [G] | ❌ 6S0X_i:97 no longer at interface |
| I:93 [ARG] | A:1179 [A] | i:97 [ARG] | a:1189 [A] | ❌ 6S0X_i:97 no longer at interface |
| I:2 [GLU] | A:1131 [G] | i:6 [VAL] | a:1142 [U] | ❌ 6S0X_i:6 no longer at interface |
| I:3 [GLN] | A:1130 [A] | i:7 [GLU] | a:1141 [A] | ❌ 6S0X_i:7 no longer at interface |
| I:3 [GLN] | A:1131 [G] | i:7 [GLU] | a:1142 [U] | ❌ 6S0X_i:7 no longer at interface |
| I:106 [ALA] | A:1116 [C] | i:110 [PRO] | a:1127 [U] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
| I:106 [ALA] | A:1117 [G] | i:110 [PRO] | a:1128 [A] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
| I:123 [PRO] | A:1232 [U] | i:127 [PRO] | a:1242 [U] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| I:123 [PRO] | A:1233 [G] | i:127 [PRO] | a:1243 [G] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| I:123 [PRO] | A:1342 [C] | i:127 [PRO] | a:1352 [C] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| I:123 [PRO] | A:1343 [G] | i:127 [PRO] | a:1353 [G] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| I:114 [TYR] | A:1367 [C] | i:119 [GLY] | a:1377 [U] | ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface |
| I:114 [TYR] | A:1368 [G] | i:119 [GLY] | a:1378 [A] | ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface |
| I:6 [GLY] | A:1147 [C] | i:10 [GLY] | a:1158 [U] | ❌ 2VQE_I:6 no longer at interface |
| I:98 [PRO] | A:1177 [G] | i:102 [ARG] | a:1187 [G] | ❌ 2VQE_I:98 no longer at interface |
| I:98 [PRO] | A:1176 [A] | i:102 [ARG] | a:1186 [A] | ❌ 2VQE_I:98 no longer at interface |
| I:8 [GLY] | A:1118 [C] | i:12 [GLY] | a:1129 [A] | ❌ 2VQE_I:8 no longer at interface |
| I:13 [ALA] | A:1371 [G] | i:17 [SER] | a:1381 [G] | ❌ 2VQE_I:13 no longer at interface |
| I:15 [ALA] | A:1148 [U] | i:19 [ALA] | a:1159 [C] | ❌ 2VQE_I:15 no longer at interface |
| I:17 [VAL] | A:1147 [C] | i:21 [VAL] | a:1158 [U] | ❌ 2VQE_I:17 no longer at interface |
| I:30 [GLY] | A:1130 [A] | i:34 [ASN] | a:1141 [A] | ❌ 2VQE_I:30 no longer at interface |
| I:35 [GLU] | A:1290 [G] | i:39 [GLU] | a:1300 [G] | ❌ 2VQE_I:35 no longer at interface |
| I:65 [VAL] | A:1129 [C] | i:69 [VAL] | a:1140 [C] | ❌ 2VQE_I:65 no longer at interface |
| I:79 [LEU] | A:1119 [C] | i:83 [HIS] | a:1130 [G] | ❌ 2VQE_I:79 no longer at interface |
| I:79 [LEU] | A:1118 [C] | i:83 [HIS] | a:1129 [A] | ❌ 2VQE_I:79 no longer at interface |
| I:94 [ALA] | A:1177 [G] | i:98 [GLY] | a:1187 [G] | ❌ 2VQE_I:94 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.96 | 3.04 | 0.40 | 0.83 | 0.96 | 0.82 | 0.92 | 0.50 | 0.36 | 0.10 | 0.39 |
Other pairs involving 2VQE_I_A or 6S0X_i_a
Total number of entries: 9