Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 2VQE_I
|
2VQE_A
|
7O7Y_Ap
|
7O7Y_A2
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| I:112 [LYS] | A:1367 [C] | Ap:130 [LYS] | A2:1669 [U] | ✔ |
| I:112 [LYS] | A:1368 [G] | Ap:130 [LYS] | A2:1670 [G] | ✔ |
| I:112 [LYS] | A:1369 [C] | Ap:130 [LYS] | A2:1671 [C] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1249 [C] | Ap:76 [GLY] | A2:1545 [C] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1371 [G] | Ap:76 [GLY] | A2:1673 [U] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1372 [U] | Ap:76 [GLY] | A2:1674 [U] | ✔ |
| I:71 [SER] | A:1372 [U] | Ap:78 [VAL] | A2:1674 [U] | ✔ |
| I:71 [SER] | A:1373 [G] | Ap:78 [VAL] | A2:1675 [G] | ✔ |
| I:18 [PHE] | A:1130 [A] | Ap:24 [HIS] | A2:1409 [U] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:942 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1225 [G] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:943 [U] | Ap:142 [GLN] | A2:1226 [U] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1232 [U] | Ap:142 [GLN] | A2:1528 [C] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1233 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1529 [G] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1342 [C] | Ap:142 [GLN] | A2:1644 [PSU] | ✔ |
| I:128 [ARG] | A:970 [C] | Ap:146 [ARG] | A2:1253 [C] | ✔ |
| I:128 [ARG] | A:1231 [G] | Ap:146 [ARG] | A2:1527 [G] | ✔ |
| I:7 [THR] | A:1119 [C] | Ap:13 [PHE] | A2:1397 [A] | ✔ |
| I:7 [THR] | A:1147 [C] | Ap:13 [PHE] | A2:1443 [OMU] | ✔ |
| I:7 [THR] | A:1148 [U] | Ap:13 [PHE] | A2:1444 [C] | ✔ |
| I:113 [LYS] | A:1186 [G] | Ap:131 [LYS] | A2:1480 [G] | ✔ |
| I:113 [LYS] | A:1187 [G] | Ap:131 [LYS] | A2:1481 [A] | ✔ |
| I:113 [LYS] | A:1368 [G] | Ap:131 [LYS] | A2:1670 [G] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1343 [G] | Ap:139 [ALA] | A2:1645 [C] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1344 [C] | Ap:139 [ALA] | A2:1646 [C] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1348 [U] | Ap:139 [ALA] | A2:1650 [U] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1349 [A] | Ap:139 [ALA] | A2:1651 [A] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1350 [A] | Ap:139 [ALA] | A2:1652 [A] | ✔ |
| I:5 [TYR] | A:1147 [C] | Ap:11 [GLN] | A2:1443 [OMU] | ✔ |
| I:16 [ARG] | A:1147 [C] | Ap:22 [VAL] | A2:1443 [OMU] | ✔ |
| I:16 [ARG] | A:1148 [U] | Ap:22 [VAL] | A2:1444 [C] | ✔ |
| I:107 [ARG] | A:1347 [G] | Ap:125 [ARG] | A2:1649 [G] | ✔ |
| I:10 [ARG] | A:1347 [G] | Ap:16 [LYS] | A2:1649 [G] | ✔ |
| I:103 [THR] | A:1179 [A] | Ap:121 [VAL] | A2:1475 [A] | ✔ |
| I:103 [THR] | A:1180 [A] | Ap:121 [VAL] | A2:1476 [G] | ✔ |
| I:125 [TYR] | A:1232 [U] | Ap:143 [LYS] | A2:1528 [C] | ✔ |
| I:125 [TYR] | A:1342 [C] | Ap:143 [LYS] | A2:1644 [PSU] | ✔ |
| I:125 [TYR] | A:1343 [G] | Ap:143 [LYS] | A2:1645 [C] | ✔ |
| I:108 [VAL] | A:1116 [C] | Ap:126 [ARG] | A2:1394 [G] | ✔ |
| I:108 [VAL] | A:1347 [G] | Ap:126 [ARG] | A2:1649 [G] | ✔ |
| I:108 [VAL] | A:1348 [U] | Ap:126 [ARG] | A2:1650 [U] | ✔ |
| I:104 [ARG] | A:1179 [A] | Ap:122 [ALA] | A2:1475 [A] | ✔ |
| I:72 [GLY] | A:1372 [U] | Ap:79 [ALA] | A2:1674 [U] | ✔ |
| I:12 [GLU] | A:1250 [A] | Ap:18 [THR] | A2:1546 [A] | ✔ |
| I:12 [GLU] | A:1251 [A] | Ap:18 [THR] | A2:1547 [G] | ✔ |
| I:12 [GLU] | A:1370 [G] | Ap:18 [THR] | A2:1672 [G] | ✔ |
| I:12 [GLU] | A:1371 [G] | Ap:18 [THR] | A2:1673 [U] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1347 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1649 [G] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1371 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1673 [U] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1372 [U] | Ap:17 [LYS] | A2:1674 [U] | ✔ |
| I:11 [LYS] | A:1373 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1675 [G] | ✔ |
| I:66 [ARG] | A:1249 [C] | Ap:73 [LYS] | A2:1545 [C] | ✔ |
| I:66 [ARG] | A:1250 [A] | Ap:73 [LYS] | A2:1546 [A] | ✔ |
| I:119 [ALA] | A:1349 [A] | Ap:137 [ALA] | A2:1651 [A] | ✔ |
| I:73 [GLN] | A:1249 [C] | Ap:80 [GLN] | A2:1545 [C] | ✔ |
| I:73 [GLN] | A:1250 [A] | Ap:80 [GLN] | A2:1546 [A] | ✔ |
| I:9 [ARG] | A:1118 [C] | Ap:15 [ARG] | A2:1396 [C] | ✔ |
| I:9 [ARG] | A:1148 [U] | Ap:15 [ARG] | A2:1444 [C] | ✔ |
| I:9 [ARG] | A:1149 [C] | Ap:15 [ARG] | A2:1445 [U] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1249 [C] | Ap:75 [GLY] | A2:1545 [C] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1250 [A] | Ap:75 [GLY] | A2:1546 [A] | ✔ |
| I:68 [GLY] | A:1371 [G] | Ap:75 [GLY] | A2:1673 [U] | ✔ |
| I:38 [GLN] | A:1291 [G] | Ap:45 [ARG] | A2:1593 [C] | ✔ |
| I:118 [LYS] | A:1349 [A] | Ap:136 [GLY] | A2:1651 [A] | ✔ |
| I:111 [ARG] | A:1186 [G] | Ap:129 [SER] | A2:1480 [G] | ✔ |
| I:111 [ARG] | A:1368 [G] | Ap:129 [SER] | A2:1670 [G] | ✔ |
| I:111 [ARG] | A:1369 [C] | Ap:129 [SER] | A2:1671 [C] | ✔ |
| I:67 [GLY] | A:1249 [C] | Ap:74 [GLY] | A2:1545 [C] | ✔ |
| I:67 [GLY] | A:1250 [A] | Ap:74 [GLY] | A2:1546 [A] | ✔ |
| I:67 [GLY] | A:1251 [A] | Ap:74 [GLY] | A2:1547 [G] | ✔ |
| I:39 [GLY] | A:1291 [G] | Ap:46 [THR] | A2:1593 [C] | ✔ |
| I:39 [GLY] | A:1292 [U] | Ap:46 [THR] | A2:1594 [C] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1186 [G] | Ap:138 [ARG] | A2:1480 [G] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1343 [G] | Ap:138 [ARG] | A2:1645 [C] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1344 [C] | Ap:138 [ARG] | A2:1646 [C] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1345 [U] | Ap:138 [ARG] | A2:1647 [C] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1346 [A] | Ap:138 [ARG] | A2:1648 [A] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1348 [U] | Ap:138 [ARG] | A2:1650 [U] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1349 [A] | Ap:138 [ARG] | A2:1651 [A] | ✔ |
| I:116 [LYS] | A:1367 [C] | Ap:134 [GLY] | A2:1669 [U] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1347 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1649 [G] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1348 [U] | Ap:127 [CYS] | A2:1650 [U] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1370 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1672 [G] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1371 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1673 [U] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1373 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1675 [G] | ✔ |
| I:127 [LYS] | A:967 [C] | Ap:145 [TYR] | A2:1250 [C] | ✔ |
| I:127 [LYS] | A:970 [C] | Ap:145 [TYR] | A2:1253 [C] | ✔ |
| I:106 [ALA] | A:1116 [C] | Ap:124 [PRO] | A2:1394 [G] | ✔ |
| I:106 [ALA] | A:1117 [G] | Ap:124 [PRO] | A2:1395 [G] | ✔ |
| I:115 [GLY] | A:1367 [C] | Ap:133 [GLY] | A2:1669 [U] | ✔ |
| I:123 [PRO] | A:1232 [U] | Ap:141 [TYR] | A2:1528 [C] | ✔ |
| I:123 [PRO] | A:1233 [G] | Ap:141 [TYR] | A2:1529 [G] | ✔ |
| I:123 [PRO] | A:1342 [C] | Ap:141 [TYR] | A2:1644 [PSU] | ✔ |
| I:123 [PRO] | A:1343 [G] | Ap:141 [TYR] | A2:1645 [C] | ✔ |
| I:20 [ARG] | A:1131 [G] | Ap:26 [LYS] | A2:1410 [A] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1248 [A] | Ap:77 [HIS] | A2:1544 [U] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1249 [C] | Ap:77 [HIS] | A2:1545 [C] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1290 [G] | Ap:77 [HIS] | A2:1592 [C] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1371 [G] | Ap:77 [HIS] | A2:1673 [U] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1372 [U] | Ap:77 [HIS] | A2:1674 [U] | ✔ |
| I:14 [VAL] | A:1148 [U] | Ap:20 [THR] | A2:1444 [C] | ✔ |
| I:14 [VAL] | A:1149 [C] | Ap:20 [THR] | A2:1445 [U] | ✔ |
| I:126 [SER] | A:970 [C] | Ap:144 [SER] | A2:1253 [C] | ✔ |
| I:126 [SER] | A:1231 [G] | Ap:144 [SER] | A2:1527 [G] | ✔ |
| I:126 [SER] | A:1232 [U] | Ap:144 [SER] | A2:1528 [C] | ✔ |
| I:105 [ASP] | A:1347 [G] | Ap:123 [ASP] | A2:1649 [G] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1186 [G] | Ap:128 [GLU] | A2:1480 [G] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1187 [G] | Ap:128 [GLU] | A2:1481 [A] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1347 [G] | Ap:128 [GLU] | A2:1649 [G] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1348 [U] | Ap:128 [GLU] | A2:1650 [U] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1369 [C] | Ap:128 [GLU] | A2:1671 [C] | ✔ |
| I:122 [ALA] | A:1343 [G] | Ap:140 [ARG] | A2:1645 [C] | ✔ |
| I:122 [ALA] | A:1344 [C] | Ap:140 [ARG] | A2:1646 [C] | ✔ |
| I:114 [TYR] | A:1188 [A] | Ap:132 [PHE] | A2:1482 [G] | ✔ |
| I:114 [TYR] | A:1367 [C] | Ap:132 [PHE] | A2:1669 [U] | ✔ |
| I:114 [TYR] | A:1368 [G] | Ap:132 [PHE] | A2:1670 [G] | ✔ |
| I:112 [LYS] | A:1366 [C] | Ap:130 [LYS] | A2:1668 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:69 [GLY] | A:1250 [A] | Ap:76 [GLY] | A2:1546 [A] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:124 [GLN] | A:1231 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1527 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:124 [GLN] | A:1343 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1645 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:113 [LYS] | A:1367 [C] | Ap:131 [LYS] | A2:1669 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:121 [ARG] | A:1342 [C] | Ap:139 [ALA] | A2:1644 [PSU] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:5 [TYR] | A:1148 [U] | Ap:11 [GLN] | A2:1444 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:117 [HIS] | A:1232 [U] | Ap:135 [PRO] | A2:1528 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:117 [HIS] | A:1233 [G] | Ap:135 [PRO] | A2:1529 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:117 [HIS] | A:1366 [C] | Ap:135 [PRO] | A2:1668 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:125 [TYR] | A:1231 [G] | Ap:143 [LYS] | A2:1527 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:125 [TYR] | A:1341 [U] | Ap:143 [LYS] | A2:1643 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:104 [ARG] | A:1117 [G] | Ap:122 [ALA] | A2:1395 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:104 [ARG] | A:1118 [C] | Ap:122 [ALA] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:104 [ARG] | A:1180 [A] | Ap:122 [ALA] | A2:1476 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:11 [LYS] | A:1370 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1672 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:66 [ARG] | A:1148 [U] | Ap:73 [LYS] | A2:1444 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:62 [TYR] | A:1129 [C] | Ap:69 [ARG] | A2:1408 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:62 [TYR] | A:1130 [A] | Ap:69 [ARG] | A2:1409 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:9 [ARG] | A:1119 [C] | Ap:15 [ARG] | A2:1397 [A] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:68 [GLY] | A:1251 [A] | Ap:75 [GLY] | A2:1547 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:68 [GLY] | A:1370 [G] | Ap:75 [GLY] | A2:1672 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:118 [LYS] | A:1348 [U] | Ap:136 [GLY] | A2:1650 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:118 [LYS] | A:1350 [A] | Ap:136 [GLY] | A2:1652 [A] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:111 [ARG] | A:1187 [G] | Ap:129 [SER] | A2:1481 [A] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:111 [ARG] | A:1188 [A] | Ap:129 [SER] | A2:1482 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:116 [LYS] | A:1344 [C] | Ap:134 [GLY] | A2:1646 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:20 [ARG] | A:1130 [A] | Ap:26 [LYS] | A2:1409 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| I:5 [TYR] | A:1129 [C] | Ap:11 [GLN] | A2:1408 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:5 [TYR] | A:1130 [A] | Ap:11 [GLN] | A2:1409 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:106 [ALA] | A:1179 [A] | Ap:124 [PRO] | A2:1475 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:106 [ALA] | A:1180 [A] | Ap:124 [PRO] | A2:1476 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:107 [ARG] | A:1346 [A] | Ap:125 [ARG] | A2:1648 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:108 [VAL] | A:1118 [C] | Ap:126 [ARG] | A2:1396 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:108 [VAL] | A:1117 [G] | Ap:126 [ARG] | A2:1395 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:117 [HIS] | A:1350 [A] | Ap:135 [PRO] | A2:1652 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:119 [ALA] | A:1348 [U] | Ap:137 [ALA] | A2:1650 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:123 [PRO] | A:1366 [C] | Ap:141 [TYR] | A2:1668 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:123 [PRO] | A:1367 [C] | Ap:141 [TYR] | A2:1669 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:124 [GLN] | A:1341 [U] | Ap:142 [GLN] | A2:1643 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:125 [TYR] | A:967 [C] | Ap:143 [LYS] | A2:1250 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:126 [SER] | A:967 [C] | Ap:144 [SER] | A2:1250 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:127 [LYS] | A:1342 [C] | Ap:145 [TYR] | A2:1644 [PSU] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:127 [LYS] | A:1343 [G] | Ap:145 [TYR] | A2:1645 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:18 [PHE] | A:1131 [G] | Ap:24 [HIS] | A2:1410 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1129 [C] | Ap:71 [ARG] | A2:1408 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1148 [U] | Ap:71 [ARG] | A2:1444 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1147 [C] | Ap:71 [ARG] | A2:1443 [OMU] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1130 [A] | Ap:71 [ARG] | A2:1409 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:68 [GLY] | A:1372 [U] | Ap:75 [GLY] | A2:1674 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:72 [GLY] | A:1371 [G] | Ap:79 [ALA] | A2:1673 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1128 [C] | Ap:71 [ARG] | A2:1407 [G] | ❌ 7O7Y_A2:1407 no longer at interface |
| I:121 [ARG] | A:941 [G] | Ap:139 [ALA] | A2:1224 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1224 no longer at interface |
| I:16 [ARG] | A:1127 [G] | Ap:22 [VAL] | A2:1406 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1406 no longer at interface |
| I:16 [ARG] | A:1128 [C] | Ap:22 [VAL] | A2:1407 [G] | ❌ 7O7Y_A2:1407 no longer at interface |
| I:12 [GLU] | A:1252 [A] | Ap:18 [THR] | A2:1548 [C] | ❌ 7O7Y_A2:1548 no longer at interface |
| I:66 [ARG] | A:1127 [G] | Ap:73 [LYS] | A2:1406 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1406 no longer at interface |
| I:66 [ARG] | A:1128 [C] | Ap:73 [LYS] | A2:1407 [G] | ❌ 7O7Y_A2:1407 no longer at interface |
| I:62 [TYR] | A:1128 [C] | Ap:69 [ARG] | A2:1407 [G] | ❌ 7O7Y_A2:1407 no longer at interface |
| I:68 [GLY] | A:1287 [A] | Ap:75 [GLY] | A2:1589 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1589 no longer at interface |
| I:118 [LYS] | A:1351 [U] | Ap:136 [GLY] | A2:1653 [G] | ❌ 7O7Y_A2:1653 no longer at interface |
| I:97 [LYS] | A:1176 [A] | Ap:114 [GLN] | A2:1472 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:114, 7O7Y_A2:1472 no longer at interface |
| I:97 [LYS] | A:1177 [G] | Ap:114 [GLN] | A2:1473 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:114, 7O7Y_A2:1473 no longer at interface |
| I:106 [ALA] | A:1184 [G] | Ap:124 [PRO] | A2:1478 [U] | ❌ 7O7Y_A2:1478 no longer at interface |
| I:114 [TYR] | A:1189 [C] | Ap:132 [PHE] | A2:1483 [C] | ❌ 7O7Y_A2:1483 no longer at interface |
| I:125 [TYR] | A:968 [A] | Ap:143 [LYS] | A2:1251 [A] | ❌ 2VQE_A:968 no longer at interface |
| I:127 [LYS] | A:969 [A] | Ap:145 [TYR] | A2:1252 [A] | ❌ 2VQE_A:969 no longer at interface |
| I:127 [LYS] | A:935 [A] | Ap:145 [TYR] | A2:1218 [A] | ❌ 2VQE_A:935 no longer at interface |
| I:128 [ARG] | A:969 [A] | Ap:146 [ARG] | A2:1252 [A] | ❌ 2VQE_A:969 no longer at interface |
| I:128 [ARG] | A:1230 [C] | Ap:146 [ARG] | A2:1526 [C] | ❌ 2VQE_A:1230 no longer at interface |
| I:29 [ASN] | A:1137 [C] | Ap:35 [ASN] | A2:1428 [C] | ❌ 2VQE_I:29, 2VQE_A:1137 no longer at interface |
| I:30 [GLY] | A:1137 [C] | Ap:36 [GLY] | A2:1428 [C] | ❌ 2VQE_I:30, 2VQE_A:1137 no longer at interface |
| I:31 [GLN] | A:1247 [U] | Ap:37 [ARG] | A2:1543 [C] | ❌ 2VQE_I:31, 2VQE_A:1247 no longer at interface |
| I:37 [PHE] | A:1247 [U] | Ap:43 [GLU] | A2:1543 [C] | ❌ 2VQE_I:37, 2VQE_A:1247 no longer at interface |
| I:66 [ARG] | A:1138 [G] | Ap:73 [LYS] | A2:1429 [G] | ❌ 2VQE_A:1138 no longer at interface |
| I:70 [LYS] | A:1289 [A] | Ap:77 [HIS] | A2:1591 [C] | ❌ 2VQE_A:1289 no longer at interface |
| I:102 [LEU] | A:1179 [A] | Ap:120 [LEU] | A2:1475 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:120 no longer at interface |
| I:102 [LEU] | A:1180 [A] | Ap:120 [LEU] | A2:1476 [G] | ❌ 7O7Y_Ap:120 no longer at interface |
| I:40 [LEU] | A:1290 [G] | Ap:47 [LEU] | A2:1592 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:47 no longer at interface |
| I:40 [LEU] | A:1291 [G] | Ap:47 [LEU] | A2:1593 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:47 no longer at interface |
| I:36 [TYR] | A:1248 [A] | Ap:42 [ILE] | A2:1544 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:42 no longer at interface |
| I:36 [TYR] | A:1249 [C] | Ap:42 [ILE] | A2:1545 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:42 no longer at interface |
| I:2 [GLU] | A:1131 [G] | Ap:8 [GLN] | A2:1410 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:8 no longer at interface |
| I:83 [ARG] | A:1118 [C] | Ap:91 [ALA] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:91 no longer at interface |
| I:83 [ARG] | A:1119 [C] | Ap:91 [ALA] | A2:1397 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:91 no longer at interface |
| I:83 [ARG] | A:1179 [A] | Ap:91 [ALA] | A2:1475 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:91 no longer at interface |
| I:3 [GLN] | A:1130 [A] | Ap:9 [SER] | A2:1409 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:9 no longer at interface |
| I:3 [GLN] | A:1131 [G] | Ap:9 [SER] | A2:1410 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:9 no longer at interface |
| I:97 [LYS] | A:1178 [G] | Ap:114 [GLN] | A2:1474 [G] | ❌ 7O7Y_Ap:114 no longer at interface |
| I:42 [ARG] | A:1373 [G] | Ap:49 [TYR] | A2:1675 [G] | ❌ 7O7Y_Ap:49 no longer at interface |
| I:100 [GLY] | A:1179 [A] | Ap:117 [ARG] | A2:1475 [A] | ❌ 2VQE_I:100 no longer at interface |
| I:100 [GLY] | A:1178 [G] | Ap:117 [ARG] | A2:1474 [G] | ❌ 2VQE_I:100 no longer at interface |
| I:100 [GLY] | A:1180 [A] | Ap:117 [ARG] | A2:1476 [G] | ❌ 2VQE_I:100 no longer at interface |
| I:6 [GLY] | A:1147 [C] | Ap:12 [VAL] | A2:1443 [OMU] | ❌ 2VQE_I:6 no longer at interface |
| I:13 [ALA] | A:1371 [G] | Ap:19 [ALA] | A2:1673 [U] | ❌ 2VQE_I:13 no longer at interface |
| I:29 [ASN] | A:1249 [C] | Ap:35 [ASN] | A2:1545 [C] | ❌ 2VQE_I:29 no longer at interface |
| I:31 [GLN] | A:1248 [A] | Ap:37 [ARG] | A2:1544 [U] | ❌ 2VQE_I:31 no longer at interface |
| I:37 [PHE] | A:1248 [A] | Ap:43 [GLU] | A2:1544 [U] | ❌ 2VQE_I:37 no longer at interface |
| I:37 [PHE] | A:1291 [G] | Ap:43 [GLU] | A2:1593 [C] | ❌ 2VQE_I:37 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein S5 domain 2-like | 0.92 | 2.64 | 0.30 | 0.81 | 0.92 | 0.84 | 0.81 | 0.67 | 0.63 | 0.27 | 0.48 |
Other pairs involving 2VQE_I_A or 7O7Y_Ap_A2
Total number of entries: 8
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2VQE_I_A | 7K00_I_A | 0.84 | 0.97 | 1.43 | 0.69 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 2VQE_I_A | 4Y4O_1i_1a | 0.90 | 0.99 | 1.78 | 0.91 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 2VQE_I_A | 7RYG_i_a | 0.28 | 0.92 | 4.33 | 0.19 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 2VQE_I_A | 6S0X_i_a | 0.50 | 0.96 | 3.04 | 0.4 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 2VQE_I_A | 7O7Y_Ap_A2 | 0.67 | 0.92 | 2.64 | 0.3 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare | |
| 4Y4O_1i_1a | 7O7Y_Ap_A2 | 0.70 | 0.93 | 2.23 | 0.3 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare | |
| 6S0X_i_a | 7O7Y_Ap_A2 | 0.47 | 0.89 | 3.49 | 0.2 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare | |
| 7K00_I_A | 7O7Y_Ap_A2 | 0.70 | 0.92 | 2.24 | 0.38 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare |