Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 2VQE_I
|
2VQE_A
|
7RYG_i
|
7RYG_a
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| I:112 [LYS] | A:1367 [C] | i:113 [LYS] | a:1364 [C] | ✔ |
| I:112 [LYS] | A:1368 [G] | i:113 [LYS] | a:1365 [G] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1249 [C] | i:69 [GLY] | a:1246 [C] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1371 [G] | i:69 [GLY] | a:1368 [G] | ✔ |
| I:69 [GLY] | A:1372 [U] | i:69 [GLY] | a:1369 [U] | ✔ |
| I:71 [SER] | A:1372 [U] | i:71 [GLY] | a:1369 [U] | ✔ |
| I:71 [SER] | A:1373 [G] | i:71 [GLY] | a:1370 [G] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1233 [G] | i:125 [PHE] | a:1229 [U] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1342 [C] | i:125 [PHE] | a:1339 [C] | ✔ |
| I:124 [GLN] | A:1343 [G] | i:125 [PHE] | a:1340 [G] | ✔ |
| I:128 [ARG] | A:970 [C] | i:128 [ARG] | a:967 [C] | ✔ |
| I:128 [ARG] | A:1231 [G] | i:128 [ARG] | a:1227 [C] | ✔ |
| I:113 [LYS] | A:1367 [C] | i:114 [LEU] | a:1364 [C] | ✔ |
| I:113 [LYS] | A:1368 [G] | i:114 [LEU] | a:1365 [G] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1343 [G] | i:122 [ARG] | a:1340 [G] | ✔ |
| I:121 [ARG] | A:1344 [C] | i:122 [ARG] | a:1341 [C] | ✔ |
| I:107 [ARG] | A:1347 [G] | i:108 [GLU] | a:1344 [G] | ✔ |
| I:10 [ARG] | A:1347 [G] | i:11 [LYS] | a:1344 [G] | ✔ |
| I:102 [LEU] | A:1179 [A] | i:103 [THR] | a:1176 [A] | ✔ |
| I:102 [LEU] | A:1180 [A] | i:103 [THR] | a:1177 [A] | ✔ |
| I:103 [THR] | A:1179 [A] | i:104 [ARG] | a:1176 [A] | ✔ |
| I:125 [TYR] | A:1232 [U] | i:126 [SER] | a:1228 [G] | ✔ |
| I:108 [VAL] | A:1347 [G] | i:109 [VAL] | a:1344 [G] | ✔ |
| I:108 [VAL] | A:1348 [U] | i:109 [VAL] | a:1345 [U] | ✔ |
| I:66 [ARG] | A:1249 [C] | i:67 [GLY] | a:1246 [C] | ✔ |
| I:66 [ARG] | A:1250 [A] | i:67 [GLY] | a:1247 [A] | ✔ |
| I:119 [ALA] | A:1349 [A] | i:119 [ALA] | a:1346 [A] | ✔ |
| I:36 [TYR] | A:1248 [A] | i:36 [TYR] | a:1245 [A] | ✔ |
| I:36 [TYR] | A:1249 [C] | i:36 [TYR] | a:1246 [C] | ✔ |
| I:38 [GLN] | A:1291 [G] | i:38 [GLY] | a:1288 [C] | ✔ |
| I:111 [ARG] | A:1368 [G] | i:112 [LYS] | a:1365 [G] | ✔ |
| I:111 [ARG] | A:1369 [C] | i:112 [LYS] | a:1366 [C] | ✔ |
| I:67 [GLY] | A:1249 [C] | i:68 [GLY] | a:1246 [C] | ✔ |
| I:67 [GLY] | A:1250 [A] | i:68 [GLY] | a:1247 [A] | ✔ |
| I:39 [GLY] | A:1291 [G] | i:39 [ARG] | a:1288 [C] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1186 [G] | i:120 [ARG] | a:1183 [G] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1343 [G] | i:120 [ARG] | a:1340 [G] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1344 [C] | i:120 [ARG] | a:1341 [C] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1345 [U] | i:120 [ARG] | a:1342 [U] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1346 [A] | i:120 [ARG] | a:1343 [A] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1348 [U] | i:120 [ARG] | a:1345 [U] | ✔ |
| I:120 [ARG] | A:1349 [A] | i:120 [ARG] | a:1346 [A] | ✔ |
| I:116 [LYS] | A:1367 [C] | i:115 [GLY] | a:1364 [C] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1347 [G] | i:110 [GLU] | a:1344 [G] | ✔ |
| I:109 [VAL] | A:1348 [U] | i:110 [GLU] | a:1345 [U] | ✔ |
| I:123 [PRO] | A:1232 [U] | i:124 [GLN] | a:1228 [G] | ✔ |
| I:123 [PRO] | A:1233 [G] | i:124 [GLN] | a:1229 [U] | ✔ |
| I:123 [PRO] | A:1342 [C] | i:124 [GLN] | a:1339 [C] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1248 [A] | i:70 [ILE] | a:1245 [A] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1249 [C] | i:70 [ILE] | a:1246 [C] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1371 [G] | i:70 [ILE] | a:1368 [G] | ✔ |
| I:70 [LYS] | A:1372 [U] | i:70 [ILE] | a:1369 [U] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1186 [G] | i:111 [ARG] | a:1183 [G] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1187 [G] | i:111 [ARG] | a:1184 [G] | ✔ |
| I:110 [GLU] | A:1369 [C] | i:111 [ARG] | a:1366 [C] | ✔ |
| I:122 [ALA] | A:1343 [G] | i:123 [PRO] | a:1340 [G] | ✔ |
| I:112 [LYS] | A:1366 [C] | i:113 [LYS] | a:1363 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:112 [LYS] | A:1369 [C] | i:113 [LYS] | a:1366 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:64 [THR] | A:1128 [C] | i:65 [VAL] | a:1125 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:69 [GLY] | A:1250 [A] | i:69 [GLY] | a:1247 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:124 [GLN] | A:942 [G] | i:125 [PHE] | a:940 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:124 [GLN] | A:1231 [G] | i:125 [PHE] | a:1227 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:124 [GLN] | A:1232 [U] | i:125 [PHE] | a:1228 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:113 [LYS] | A:1186 [G] | i:114 [LEU] | a:1183 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:113 [LYS] | A:1187 [G] | i:114 [LEU] | a:1184 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:121 [ARG] | A:941 [G] | i:122 [ARG] | a:939 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:121 [ARG] | A:1342 [C] | i:122 [ARG] | a:1339 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:121 [ARG] | A:1348 [U] | i:122 [ARG] | a:1345 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:121 [ARG] | A:1349 [A] | i:122 [ARG] | a:1346 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:121 [ARG] | A:1350 [A] | i:122 [ARG] | a:1347 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:117 [HIS] | A:1232 [U] | i:116 [LEU] | a:1228 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:117 [HIS] | A:1233 [G] | i:116 [LEU] | a:1229 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:117 [HIS] | A:1366 [C] | i:116 [LEU] | a:1363 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:103 [THR] | A:1180 [A] | i:104 [ARG] | a:1177 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:125 [TYR] | A:1231 [G] | i:126 [SER] | a:1227 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:125 [TYR] | A:1341 [U] | i:126 [SER] | a:1338 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:125 [TYR] | A:1342 [C] | i:126 [SER] | a:1339 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:125 [TYR] | A:1343 [G] | i:126 [SER] | a:1340 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:108 [VAL] | A:1116 [C] | i:109 [VAL] | a:1113 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:104 [ARG] | A:1117 [G] | i:105 [ASP] | a:1114 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:104 [ARG] | A:1118 [C] | i:105 [ASP] | a:1115 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:104 [ARG] | A:1179 [A] | i:105 [ASP] | a:1176 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:104 [ARG] | A:1180 [A] | i:105 [ASP] | a:1177 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:66 [ARG] | A:1128 [C] | i:67 [GLY] | a:1125 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:66 [ARG] | A:1148 [U] | i:67 [GLY] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:73 [GLN] | A:1249 [C] | i:72 [GLY] | a:1246 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:73 [GLN] | A:1250 [A] | i:72 [GLY] | a:1247 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:9 [ARG] | A:1118 [C] | i:10 [ARG] | a:1115 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:9 [ARG] | A:1119 [C] | i:10 [ARG] | a:1116 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:9 [ARG] | A:1148 [U] | i:10 [ARG] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:118 [LYS] | A:1348 [U] | i:117 [ARG] | a:1345 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:118 [LYS] | A:1349 [A] | i:117 [ARG] | a:1346 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:118 [LYS] | A:1350 [A] | i:117 [ARG] | a:1347 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:118 [LYS] | A:1351 [U] | i:117 [ARG] | a:1348 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:111 [ARG] | A:1186 [G] | i:112 [LYS] | a:1183 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:111 [ARG] | A:1187 [G] | i:112 [LYS] | a:1184 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:67 [GLY] | A:1251 [A] | i:68 [GLY] | a:1248 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:116 [LYS] | A:1344 [C] | i:115 [GLY] | a:1341 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:109 [VAL] | A:1370 [G] | i:110 [GLU] | a:1367 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:109 [VAL] | A:1371 [G] | i:110 [GLU] | a:1368 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:109 [VAL] | A:1373 [G] | i:110 [GLU] | a:1370 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:106 [ALA] | A:1116 [C] | i:107 [ARG] | a:1113 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:106 [ALA] | A:1117 [G] | i:107 [ARG] | a:1114 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:123 [PRO] | A:1343 [G] | i:124 [GLN] | a:1340 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:126 [SER] | A:970 [C] | i:127 [LYS] | a:967 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:126 [SER] | A:1231 [G] | i:127 [LYS] | a:1227 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:126 [SER] | A:1232 [U] | i:127 [LYS] | a:1228 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:105 [ASP] | A:1347 [G] | i:106 [ALA] | a:1344 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:110 [GLU] | A:1347 [G] | i:111 [ARG] | a:1344 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:110 [GLU] | A:1348 [U] | i:111 [ARG] | a:1345 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:122 [ALA] | A:1344 [C] | i:123 [PRO] | a:1341 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
| I:9 [ARG] | A:1347 [G] | i:10 [ARG] | a:1344 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:103 [THR] | A:1118 [C] | i:104 [ARG] | a:1115 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:103 [THR] | A:1117 [G] | i:104 [ARG] | a:1114 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:104 [ARG] | A:1347 [G] | i:105 [ASP] | a:1344 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:105 [ASP] | A:1116 [C] | i:106 [ALA] | a:1113 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:105 [ASP] | A:1117 [G] | i:106 [ALA] | a:1114 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:106 [ALA] | A:1347 [G] | i:107 [ARG] | a:1344 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:106 [ALA] | A:1346 [A] | i:107 [ARG] | a:1343 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:107 [ARG] | A:1116 [C] | i:108 [GLU] | a:1113 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:107 [ARG] | A:1348 [U] | i:108 [GLU] | a:1345 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:108 [VAL] | A:1371 [G] | i:109 [VAL] | a:1368 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:108 [VAL] | A:1370 [G] | i:109 [VAL] | a:1367 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:10 [ARG] | A:1370 [G] | i:11 [LYS] | a:1367 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:10 [ARG] | A:1371 [G] | i:11 [LYS] | a:1368 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:10 [ARG] | A:1373 [G] | i:11 [LYS] | a:1370 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:10 [ARG] | A:1372 [U] | i:11 [LYS] | a:1369 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:109 [VAL] | A:1186 [G] | i:110 [GLU] | a:1183 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:110 [GLU] | A:1368 [G] | i:111 [ARG] | a:1365 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:111 [ARG] | A:1367 [C] | i:112 [LYS] | a:1364 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:112 [LYS] | A:1187 [G] | i:113 [LYS] | a:1184 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:112 [LYS] | A:1186 [G] | i:113 [LYS] | a:1183 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:117 [HIS] | A:1367 [C] | i:116 [LEU] | a:1364 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:118 [LYS] | A:1233 [G] | i:117 [ARG] | a:1229 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:118 [LYS] | A:1366 [C] | i:117 [ARG] | a:1363 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:119 [ALA] | A:1348 [U] | i:119 [ALA] | a:1345 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:122 [ALA] | A:1342 [C] | i:123 [PRO] | a:1339 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:122 [ALA] | A:1233 [G] | i:123 [PRO] | a:1229 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:123 [PRO] | A:941 [G] | i:124 [GLN] | a:939 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:123 [PRO] | A:942 [G] | i:124 [GLN] | a:940 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:124 [GLN] | A:967 [C] | i:125 [PHE] | a:964 [5MC] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:125 [TYR] | A:1233 [G] | i:126 [SER] | a:1229 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:125 [TYR] | A:967 [C] | i:126 [SER] | a:964 [5MC] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:125 [TYR] | A:970 [C] | i:126 [SER] | a:967 [C] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:126 [SER] | A:966 [G] | i:127 [LYS] | a:963 [2MG] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:126 [SER] | A:1341 [U] | i:127 [LYS] | a:1338 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:126 [SER] | A:967 [C] | i:127 [LYS] | a:964 [5MC] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:128 [ARG] | A:966 [G] | i:128 [ARG] | a:963 [2MG] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:128 [ARG] | A:1232 [U] | i:128 [ARG] | a:1228 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:39 [GLY] | A:1373 [G] | i:39 [ARG] | a:1370 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:39 [GLY] | A:1372 [U] | i:39 [ARG] | a:1369 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:64 [THR] | A:1250 [A] | i:65 [VAL] | a:1247 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:66 [ARG] | A:1251 [A] | i:67 [GLY] | a:1248 [A] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:67 [GLY] | A:1371 [G] | i:68 [GLY] | a:1368 [G] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:73 [GLN] | A:1372 [U] | i:72 [GLY] | a:1369 [U] | ❌ 2VQE_I_A |
| I:124 [GLN] | A:943 [U] | i:125 [PHE] | a:941 [G] | ❌ 7RYG_a:941 no longer at interface |
| I:16 [ARG] | A:1127 [G] | i:15 [ALA] | a:1124 [G] | ❌ 7RYG_i:15, 7RYG_a:1124 no longer at interface |
| I:66 [ARG] | A:1127 [G] | i:67 [GLY] | a:1124 [G] | ❌ 7RYG_a:1124 no longer at interface |
| I:2 [GLU] | A:1131 [G] | i:3 [THR] | a:1128 [G] | ❌ 7RYG_i:3, 7RYG_a:1128 no longer at interface |
| I:9 [ARG] | A:1149 [C] | i:10 [ARG] | a:1147 [U] | ❌ 7RYG_a:1147 no longer at interface |
| I:111 [ARG] | A:1188 [A] | i:112 [LYS] | a:1185 [A] | ❌ 7RYG_a:1185 no longer at interface |
| I:3 [GLN] | A:1131 [G] | i:4 [ASN] | a:1128 [G] | ❌ 7RYG_i:4, 7RYG_a:1128 no longer at interface |
| I:97 [LYS] | A:1176 [A] | i:100 [GLY] | a:1173 [A] | ❌ 7RYG_i:100, 7RYG_a:1173 no longer at interface |
| I:39 [GLY] | A:1292 [U] | i:39 [ARG] | a:1289 [C] | ❌ 7RYG_a:1289 no longer at interface |
| I:106 [ALA] | A:1184 [G] | i:107 [ARG] | a:1181 [G] | ❌ 7RYG_a:1181 no longer at interface |
| I:20 [ARG] | A:1131 [G] | i:19 [LEU] | a:1128 [G] | ❌ 7RYG_i:19, 7RYG_a:1128 no longer at interface |
| I:70 [LYS] | A:1290 [G] | i:70 [ILE] | a:1287 [G] | ❌ 7RYG_a:1287 no longer at interface |
| I:14 [VAL] | A:1149 [C] | i:13 [ALA] | a:1147 [U] | ❌ 7RYG_i:13, 7RYG_a:1147 no longer at interface |
| I:107 [ARG] | A:1185 [G] | i:108 [GLU] | a:1182 [G] | ❌ 2VQE_A:1185 no longer at interface |
| I:109 [VAL] | A:1185 [G] | i:110 [GLU] | a:1182 [G] | ❌ 2VQE_A:1185 no longer at interface |
| I:118 [LYS] | A:1365 [G] | i:117 [ARG] | a:1362 [G] | ❌ 2VQE_A:1365 no longer at interface |
| I:118 [LYS] | A:1234 [C] | i:117 [ARG] | a:1230 [G] | ❌ 2VQE_A:1234 no longer at interface |
| I:122 [ALA] | A:1234 [C] | i:123 [PRO] | a:1230 [G] | ❌ 2VQE_A:1234 no longer at interface |
| I:123 [PRO] | A:1234 [C] | i:124 [GLN] | a:1230 [G] | ❌ 2VQE_A:1234 no longer at interface |
| I:124 [GLN] | A:968 [A] | i:125 [PHE] | a:965 [A] | ❌ 2VQE_A:968 no longer at interface |
| I:128 [ARG] | A:969 [A] | i:128 [ARG] | a:966 [A] | ❌ 2VQE_A:969 no longer at interface |
| I:17 [VAL] | A:1145 [C] | i:16 [ARG] | a:1143 [A] | ❌ 2VQE_I:17, 2VQE_A:1145 no longer at interface |
| I:17 [VAL] | A:1146 [A] | i:16 [ARG] | a:1144 [C] | ❌ 2VQE_I:17, 2VQE_A:1146 no longer at interface |
| I:4 [TYR] | A:1146 [A] | i:5 [TYR] | a:1144 [C] | ❌ 2VQE_I:4, 2VQE_A:1146 no longer at interface |
| I:6 [GLY] | A:1146 [A] | i:7 [THR] | a:1144 [C] | ❌ 2VQE_I:6, 2VQE_A:1146 no longer at interface |
| I:70 [LYS] | A:1289 [A] | i:70 [ILE] | a:1286 [A] | ❌ 2VQE_A:1289 no longer at interface |
| I:18 [PHE] | A:1130 [A] | i:17 [VAL] | a:1127 [A] | ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface |
| I:7 [THR] | A:1119 [C] | i:8 [GLY] | a:1116 [C] | ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface |
| I:7 [THR] | A:1147 [C] | i:8 [GLY] | a:1145 [U] | ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface |
| I:7 [THR] | A:1148 [U] | i:8 [GLY] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface |
| I:5 [TYR] | A:1147 [C] | i:6 [GLY] | a:1145 [U] | ❌ 7RYG_i:6 no longer at interface |
| I:5 [TYR] | A:1148 [U] | i:6 [GLY] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i:6 no longer at interface |
| I:16 [ARG] | A:1128 [C] | i:15 [ALA] | a:1125 [C] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
| I:16 [ARG] | A:1147 [C] | i:15 [ALA] | a:1145 [U] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
| I:16 [ARG] | A:1148 [U] | i:15 [ALA] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
| I:62 [TYR] | A:1128 [C] | i:63 [ILE] | a:1125 [C] | ❌ 7RYG_i:63 no longer at interface |
| I:62 [TYR] | A:1129 [C] | i:63 [ILE] | a:1126 [C] | ❌ 7RYG_i:63 no longer at interface |
| I:62 [TYR] | A:1130 [A] | i:63 [ILE] | a:1127 [A] | ❌ 7RYG_i:63 no longer at interface |
| I:93 [ARG] | A:1178 [G] | i:96 [LEU] | a:1175 [G] | ❌ 7RYG_i:96 no longer at interface |
| I:93 [ARG] | A:1179 [A] | i:96 [LEU] | a:1176 [A] | ❌ 7RYG_i:96 no longer at interface |
| I:83 [ARG] | A:1118 [C] | i:82 [THR] | a:1115 [U] | ❌ 7RYG_i:82 no longer at interface |
| I:83 [ARG] | A:1119 [C] | i:82 [THR] | a:1116 [C] | ❌ 7RYG_i:82 no longer at interface |
| I:83 [ARG] | A:1179 [A] | i:82 [THR] | a:1176 [A] | ❌ 7RYG_i:82 no longer at interface |
| I:3 [GLN] | A:1130 [A] | i:4 [ASN] | a:1127 [A] | ❌ 7RYG_i:4 no longer at interface |
| I:97 [LYS] | A:1177 [G] | i:100 [GLY] | a:1174 [G] | ❌ 7RYG_i:100 no longer at interface |
| I:97 [LYS] | A:1178 [G] | i:100 [GLY] | a:1175 [G] | ❌ 7RYG_i:100 no longer at interface |
| I:20 [ARG] | A:1130 [A] | i:19 [LEU] | a:1127 [A] | ❌ 7RYG_i:19 no longer at interface |
| I:14 [VAL] | A:1148 [U] | i:13 [ALA] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i:13 no longer at interface |
| I:101 [PHE] | A:1179 [A] | i:102 [VAL] | a:1176 [A] | ❌ 2VQE_I:101 no longer at interface |
| I:13 [ALA] | A:1371 [G] | i:12 [THR] | a:1368 [G] | ❌ 2VQE_I:13 no longer at interface |
| I:13 [ALA] | A:1370 [G] | i:12 [THR] | a:1367 [G] | ❌ 2VQE_I:13 no longer at interface |
| I:13 [ALA] | A:1251 [A] | i:12 [THR] | a:1248 [A] | ❌ 2VQE_I:13 no longer at interface |
| I:13 [ALA] | A:1250 [A] | i:12 [THR] | a:1247 [A] | ❌ 2VQE_I:13 no longer at interface |
| I:15 [ALA] | A:1148 [U] | i:14 [THR] | a:1146 [U] | ❌ 2VQE_I:15 no longer at interface |
| I:15 [ALA] | A:1147 [C] | i:14 [THR] | a:1145 [U] | ❌ 2VQE_I:15 no longer at interface |
| I:17 [VAL] | A:1147 [C] | i:16 [ARG] | a:1145 [U] | ❌ 2VQE_I:17 no longer at interface |
| I:17 [VAL] | A:1129 [C] | i:16 [ARG] | a:1126 [C] | ❌ 2VQE_I:17 no longer at interface |
| I:17 [VAL] | A:1130 [A] | i:16 [ARG] | a:1127 [A] | ❌ 2VQE_I:17 no longer at interface |
| I:19 [LEU] | A:1130 [A] | i:18 [PHE] | a:1127 [A] | ❌ 2VQE_I:19 no longer at interface |
| I:31 [GLN] | A:1248 [A] | i:31 [ARG] | a:1245 [A] | ❌ 2VQE_I:31 no longer at interface |
| I:31 [GLN] | A:1249 [C] | i:31 [ARG] | a:1246 [C] | ❌ 2VQE_I:31 no longer at interface |
| I:4 [TYR] | A:1147 [C] | i:5 [TYR] | a:1145 [U] | ❌ 2VQE_I:4 no longer at interface |
| I:63 [ILE] | A:1130 [A] | i:64 [THR] | a:1127 [A] | ❌ 2VQE_I:63 no longer at interface |
| I:65 [VAL] | A:1128 [C] | i:66 [LYS] | a:1125 [C] | ❌ 2VQE_I:65 no longer at interface |
| I:65 [VAL] | A:1129 [C] | i:66 [LYS] | a:1126 [C] | ❌ 2VQE_I:65 no longer at interface |
| I:65 [VAL] | A:1250 [A] | i:66 [LYS] | a:1247 [A] | ❌ 2VQE_I:65 no longer at interface |
| I:65 [VAL] | A:1147 [C] | i:66 [LYS] | a:1145 [U] | ❌ 2VQE_I:65 no longer at interface |
| I:6 [GLY] | A:1147 [C] | i:7 [THR] | a:1145 [U] | ❌ 2VQE_I:6 no longer at interface |
| I:74 [ILE] | A:1249 [C] | i:73 [GLN] | a:1246 [C] | ❌ 2VQE_I:74 no longer at interface |
| I:74 [ILE] | A:1250 [A] | i:73 [GLN] | a:1247 [A] | ❌ 2VQE_I:74 no longer at interface |
| I:84 [ALA] | A:1118 [C] | i:83 [ARG] | a:1115 [U] | ❌ 2VQE_I:84 no longer at interface |
| I:84 [ALA] | A:1119 [C] | i:83 [ARG] | a:1116 [C] | ❌ 2VQE_I:84 no longer at interface |
| I:8 [GLY] | A:1118 [C] | i:9 [ARG] | a:1115 [U] | ❌ 2VQE_I:8 no longer at interface |
| I:8 [GLY] | A:1119 [C] | i:9 [ARG] | a:1116 [C] | ❌ 2VQE_I:8 no longer at interface |
| I:8 [GLY] | A:1148 [U] | i:9 [ARG] | a:1146 [U] | ❌ 2VQE_I:8 no longer at interface |
| I:8 [GLY] | A:1147 [C] | i:9 [ARG] | a:1145 [U] | ❌ 2VQE_I:8 no longer at interface |
| I:90 [PRO] | A:1178 [G] | i:93 [LYS] | a:1175 [G] | ❌ 2VQE_I:90 no longer at interface |
| I:90 [PRO] | A:1179 [A] | i:93 [LYS] | a:1176 [A] | ❌ 2VQE_I:90 no longer at interface |
| I:94 [ALA] | A:1177 [G] | i:97 [ARG] | a:1174 [G] | ❌ 2VQE_I:94 no longer at interface |
| I:94 [ALA] | A:1180 [A] | i:97 [ARG] | a:1177 [A] | ❌ 2VQE_I:94 no longer at interface |
| I:94 [ALA] | A:1178 [G] | i:97 [ARG] | a:1175 [G] | ❌ 2VQE_I:94 no longer at interface |
| I:94 [ALA] | A:1179 [A] | i:97 [ARG] | a:1176 [A] | ❌ 2VQE_I:94 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.92 | 4.33 | 0.19 | 0.94 | 0.93 | 0.67 | 0.85 | 0.28 | 0.22 | 0.08 | 0.45 |
Other pairs involving 2VQE_I_A or 7RYG_i_a
Total number of entries: 8