Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6S0X_i
|
6S0X_a
|
7K00_I
|
7K00_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
i:120 [LEU] | a:1377 [U] | I:118 [LEU] | A:1367 [C] | ✔ |
i:24 [VAL] | a:1142 [U] | I:22 [LYS] | A:1131 [G] | ✔ |
i:101 [LYS] | a:1188 [G] | I:99 [ARG] | A:1178 [G] | ✔ |
i:101 [LYS] | a:1190 [A] | I:99 [ARG] | A:1180 [A] | ✔ |
i:132 [ARG] | a:975 [G] | I:129 [LYS] | A:966 [2MG] | ✔ |
i:108 [ARG] | a:1189 [A] | I:105 [THR] | A:1179 [A] | ✔ |
i:108 [ARG] | a:1190 [A] | I:105 [THR] | A:1180 [A] | ✔ |
i:118 [PRO] | a:1378 [A] | I:115 [LYS] | A:1368 [A] | ✔ |
i:113 [LYS] | a:1357 [G] | I:110 [GLN] | A:1347 [G] | ✔ |
i:113 [LYS] | a:1358 [U] | I:110 [GLN] | A:1348 [U] | ✔ |
i:73 [GLY] | a:1259 [C] | I:70 [GLY] | A:1249 [C] | ✔ |
i:73 [GLY] | a:1260 [A] | I:70 [GLY] | A:1250 [A] | ✔ |
i:73 [GLY] | a:1380 [G] | I:70 [GLY] | A:1370 [G] | ✔ |
i:73 [GLY] | a:1381 [G] | I:70 [GLY] | A:1371 [G] | ✔ |
i:22 [ARG] | a:1141 [A] | I:20 [PHE] | A:1130 [A] | ✔ |
i:22 [ARG] | a:1157 [C] | I:20 [PHE] | A:1146 [A] | ✔ |
i:22 [ARG] | a:1158 [U] | I:20 [PHE] | A:1147 [C] | ✔ |
i:11 [THR] | a:1130 [G] | I:9 [THR] | A:1119 [C] | ✔ |
i:11 [THR] | a:1158 [U] | I:9 [THR] | A:1147 [C] | ✔ |
i:11 [THR] | a:1159 [C] | I:9 [THR] | A:1148 [U] | ✔ |
i:74 [PHE] | a:1259 [C] | I:71 [GLY] | A:1249 [C] | ✔ |
i:74 [PHE] | a:1381 [G] | I:71 [GLY] | A:1371 [G] | ✔ |
i:14 [ARG] | a:1357 [G] | I:12 [ARG] | A:1347 [G] | ✔ |
i:115 [ARG] | a:1358 [U] | I:112 [GLU] | A:1348 [U] | ✔ |
i:112 [MET] | a:1357 [G] | I:109 [ARG] | A:1347 [G] | ✔ |
i:72 [GLY] | a:1259 [C] | I:69 [GLY] | A:1249 [C] | ✔ |
i:72 [GLY] | a:1260 [A] | I:69 [GLY] | A:1250 [A] | ✔ |
i:72 [GLY] | a:1261 [A] | I:69 [GLY] | A:1251 [A] | ✔ |
i:17 [SER] | a:1381 [G] | I:15 [SER] | A:1371 [G] | ✔ |
i:13 [ARG] | a:1129 [A] | I:11 [ARG] | A:1118 [U] | ✔ |
i:13 [ARG] | a:1130 [G] | I:11 [ARG] | A:1119 [C] | ✔ |
i:13 [ARG] | a:1160 [U] | I:11 [ARG] | A:1149 [C] | ✔ |
i:77 [GLN] | a:1259 [C] | I:75 [GLN] | A:1249 [C] | ✔ |
i:77 [GLN] | a:1260 [A] | I:75 [GLN] | A:1250 [A] | ✔ |
i:15 [LYS] | a:1357 [G] | I:13 [LYS] | A:1347 [G] | ✔ |
i:15 [LYS] | a:1381 [G] | I:13 [LYS] | A:1371 [G] | ✔ |
i:15 [LYS] | a:1382 [U] | I:13 [LYS] | A:1372 [U] | ✔ |
i:15 [LYS] | a:1383 [G] | I:13 [LYS] | A:1373 [G] | ✔ |
i:87 [ARG] | a:1129 [A] | I:85 [ARG] | A:1118 [U] | ✔ |
i:87 [ARG] | a:1130 [G] | I:85 [ARG] | A:1119 [C] | ✔ |
i:43 [PHE] | a:1300 [G] | I:41 [ARG] | A:1290 [G] | ✔ |
i:43 [PHE] | a:1382 [U] | I:41 [ARG] | A:1372 [U] | ✔ |
i:43 [PHE] | a:1383 [G] | I:41 [ARG] | A:1373 [G] | ✔ |
i:40 [TYR] | a:1258 [A] | I:38 [TYR] | A:1248 [A] | ✔ |
i:40 [TYR] | a:1259 [C] | I:38 [TYR] | A:1249 [C] | ✔ |
i:123 [ALA] | a:1358 [U] | I:121 [ALA] | A:1348 [U] | ✔ |
i:123 [ALA] | a:1359 [A] | I:121 [ALA] | A:1349 [A] | ✔ |
i:71 [GLY] | a:1260 [A] | I:68 [LYS] | A:1250 [A] | ✔ |
i:71 [GLY] | a:1261 [A] | I:68 [LYS] | A:1251 [A] | ✔ |
i:116 [LYS] | a:1377 [U] | I:113 [ARG] | A:1367 [C] | ✔ |
i:116 [LYS] | a:1378 [A] | I:113 [ARG] | A:1368 [A] | ✔ |
i:116 [LYS] | a:1379 [C] | I:113 [ARG] | A:1369 [C] | ✔ |
i:131 [LYS] | a:976 [C] | I:128 [SER] | A:967 [5MC] | ✔ |
i:131 [LYS] | a:979 [C] | I:128 [SER] | A:970 [C] | ✔ |
i:107 [THR] | a:1189 [A] | I:104 [VAL] | A:1179 [A] | ✔ |
i:16 [ASN] | a:1261 [A] | I:14 [SER] | A:1251 [A] | ✔ |
i:16 [ASN] | a:1380 [G] | I:14 [SER] | A:1370 [G] | ✔ |
i:130 [SER] | a:1242 [U] | I:127 [PHE] | A:1232 [U] | ✔ |
i:76 [GLY] | a:1382 [U] | I:74 [GLY] | A:1372 [U] | ✔ |
i:20 [ARG] | a:1140 [C] | I:18 [ARG] | A:1129 [C] | ✔ |
i:20 [ARG] | a:1141 [A] | I:18 [ARG] | A:1130 [A] | ✔ |
i:20 [ARG] | a:1158 [U] | I:18 [ARG] | A:1147 [C] | ✔ |
i:20 [ARG] | a:1159 [C] | I:18 [ARG] | A:1148 [U] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1353 [G] | I:122 [ARG] | A:1343 [G] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1354 [C] | I:122 [ARG] | A:1344 [C] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1355 [U] | I:122 [ARG] | A:1345 [U] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1358 [U] | I:122 [ARG] | A:1348 [U] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1359 [A] | I:122 [ARG] | A:1349 [A] | ✔ |
i:126 [SER] | a:1353 [G] | I:124 [ARG] | A:1343 [G] | ✔ |
i:126 [SER] | a:1354 [C] | I:124 [ARG] | A:1344 [C] | ✔ |
i:129 [PHE] | a:1242 [U] | I:126 [GLN] | A:1232 [U] | ✔ |
i:129 [PHE] | a:1352 [C] | I:126 [GLN] | A:1342 [C] | ✔ |
i:18 [VAL] | a:1159 [C] | I:16 [ALA] | A:1148 [U] | ✔ |
i:18 [VAL] | a:1160 [U] | I:16 [ALA] | A:1149 [C] | ✔ |
i:75 [THR] | a:1259 [C] | I:72 [ILE] | A:1249 [C] | ✔ |
i:75 [THR] | a:1381 [G] | I:72 [ILE] | A:1371 [G] | ✔ |
i:75 [THR] | a:1382 [U] | I:72 [ILE] | A:1372 [U] | ✔ |
i:125 [ARG] | a:1353 [G] | I:123 [ARG] | A:1343 [G] | ✔ |
i:125 [ARG] | a:1354 [C] | I:123 [ARG] | A:1344 [C] | ✔ |
i:125 [ARG] | a:1359 [A] | I:123 [ARG] | A:1349 [A] | ✔ |
i:114 [GLU] | a:1357 [G] | I:111 [VAL] | A:1347 [G] | ✔ |
i:114 [GLU] | a:1358 [U] | I:111 [VAL] | A:1348 [U] | ✔ |
i:109 [ASP] | a:1128 [A] | I:106 [ARG] | A:1117 [A] | ✔ |
i:109 [ASP] | a:1129 [A] | I:106 [ARG] | A:1118 [U] | ✔ |
i:122 [ALA] | a:1359 [A] | I:120 [LYS] | A:1349 [A] | ✔ |
i:108 [ARG] | a:1128 [A] | I:105 [THR] | A:1117 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:108 [ARG] | a:1129 [A] | I:105 [THR] | A:1118 [U] | ❌ 7K00_I_A |
i:113 [LYS] | a:1380 [G] | I:110 [GLN] | A:1370 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:113 [LYS] | a:1381 [G] | I:110 [GLN] | A:1371 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:113 [LYS] | a:1383 [G] | I:110 [GLN] | A:1373 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:22 [ARG] | a:1140 [C] | I:20 [PHE] | A:1129 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:74 [PHE] | a:1258 [A] | I:71 [GLY] | A:1248 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:115 [ARG] | a:1377 [U] | I:112 [GLU] | A:1367 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:115 [ARG] | a:1378 [A] | I:112 [GLU] | A:1368 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:115 [ARG] | a:1379 [C] | I:112 [GLU] | A:1369 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:112 [MET] | a:1127 [U] | I:109 [ARG] | A:1116 [U] | ❌ 7K00_I_A |
i:112 [MET] | a:1128 [A] | I:109 [ARG] | A:1117 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:72 [GLY] | a:1380 [G] | I:69 [GLY] | A:1370 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:72 [GLY] | a:1381 [G] | I:69 [GLY] | A:1371 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:117 [LYS] | a:1196 [G] | I:114 [LYS] | A:1186 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:117 [LYS] | a:1197 [G] | I:114 [LYS] | A:1187 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:121 [LYS] | a:1377 [U] | I:119 [ARG] | A:1367 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:13 [ARG] | a:1128 [A] | I:11 [ARG] | A:1117 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:15 [LYS] | a:1380 [G] | I:13 [LYS] | A:1370 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:87 [ARG] | a:1189 [A] | I:85 [ARG] | A:1179 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:111 [ARG] | a:1356 [A] | I:108 [ALA] | A:1346 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:111 [ARG] | a:1357 [G] | I:108 [ALA] | A:1347 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:131 [LYS] | a:975 [G] | I:128 [SER] | A:966 [2MG] | ❌ 7K00_I_A |
i:107 [THR] | a:1129 [A] | I:104 [VAL] | A:1118 [U] | ❌ 7K00_I_A |
i:107 [THR] | a:1190 [A] | I:104 [VAL] | A:1180 [A] | ❌ 7K00_I_A |
i:16 [ASN] | a:1379 [C] | I:14 [SER] | A:1369 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:130 [SER] | a:979 [C] | I:127 [PHE] | A:970 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:130 [SER] | a:1241 [G] | I:127 [PHE] | A:1231 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:76 [GLY] | a:1381 [G] | I:74 [GLY] | A:1371 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:20 [ARG] | a:1139 [C] | I:18 [ARG] | A:1128 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:69 [VAL] | a:1140 [C] | I:66 [THR] | A:1129 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:129 [PHE] | a:1353 [G] | I:126 [GLN] | A:1343 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:75 [THR] | a:1383 [G] | I:72 [ILE] | A:1373 [G] | ❌ 7K00_I_A |
i:70 [HIS] | a:1139 [C] | I:67 [VAL] | A:1128 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:70 [HIS] | a:1159 [C] | I:67 [VAL] | A:1148 [U] | ❌ 7K00_I_A |
i:70 [HIS] | a:1160 [U] | I:67 [VAL] | A:1149 [C] | ❌ 7K00_I_A |
i:109 [ASP] | a:1189 [A] | I:106 [ARG] | A:1179 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:111 [ARG] | a:1128 [A] | I:108 [ALA] | A:1117 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:111 [ARG] | a:1127 [U] | I:108 [ALA] | A:1116 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:112 [MET] | a:1356 [A] | I:109 [ARG] | A:1346 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:13 [ARG] | a:1159 [C] | I:11 [ARG] | A:1148 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:113 [LYS] | a:1128 [A] | I:110 [GLN] | A:1117 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:113 [LYS] | a:1127 [U] | I:110 [GLN] | A:1116 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:114 [GLU] | a:1383 [G] | I:111 [VAL] | A:1373 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:114 [GLU] | a:1381 [G] | I:111 [VAL] | A:1371 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:114 [GLU] | a:1380 [G] | I:111 [VAL] | A:1370 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:115 [ARG] | a:1196 [G] | I:112 [GLU] | A:1186 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:115 [ARG] | a:1357 [G] | I:112 [GLU] | A:1347 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:115 [ARG] | a:1197 [G] | I:112 [GLU] | A:1187 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:116 [LYS] | a:1197 [G] | I:113 [ARG] | A:1187 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:116 [LYS] | a:1196 [G] | I:113 [ARG] | A:1186 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:117 [LYS] | a:1379 [C] | I:114 [LYS] | A:1369 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:117 [LYS] | a:1378 [A] | I:114 [LYS] | A:1368 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:117 [LYS] | a:1377 [U] | I:114 [LYS] | A:1367 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:118 [PRO] | a:1196 [G] | I:115 [LYS] | A:1186 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:118 [PRO] | a:1197 [G] | I:115 [LYS] | A:1187 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:118 [PRO] | a:1377 [U] | I:115 [LYS] | A:1367 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:121 [LYS] | a:1243 [G] | I:119 [ARG] | A:1233 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:124 [ARG] | a:1196 [G] | I:122 [ARG] | A:1186 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:124 [ARG] | a:1356 [A] | I:122 [ARG] | A:1346 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:124 [ARG] | a:1357 [G] | I:122 [ARG] | A:1347 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:125 [ARG] | a:1352 [C] | I:123 [ARG] | A:1342 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:125 [ARG] | a:1358 [U] | I:123 [ARG] | A:1348 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:126 [SER] | a:1243 [G] | I:124 [ARG] | A:1233 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:129 [PHE] | a:1243 [G] | I:126 [GLN] | A:1233 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:130 [SER] | a:1353 [G] | I:127 [PHE] | A:1343 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:130 [SER] | a:1352 [C] | I:127 [PHE] | A:1342 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:130 [SER] | a:976 [C] | I:127 [PHE] | A:967 [5MC] | ❌ 6S0X_i_a |
i:131 [LYS] | a:1242 [U] | I:128 [SER] | A:1232 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:131 [LYS] | a:1241 [G] | I:128 [SER] | A:1231 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:132 [ARG] | a:976 [C] | I:129 [LYS] | A:967 [5MC] | ❌ 6S0X_i_a |
i:16 [ASN] | a:1260 [A] | I:14 [SER] | A:1250 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:16 [ASN] | a:1381 [G] | I:14 [SER] | A:1371 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:20 [ARG] | a:1157 [C] | I:18 [ARG] | A:1146 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:69 [VAL] | a:1141 [A] | I:66 [THR] | A:1130 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:70 [HIS] | a:1260 [A] | I:67 [VAL] | A:1250 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:71 [GLY] | a:1139 [C] | I:68 [LYS] | A:1128 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:71 [GLY] | a:1159 [C] | I:68 [LYS] | A:1148 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:71 [GLY] | a:1140 [C] | I:68 [LYS] | A:1129 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:73 [GLY] | a:1261 [A] | I:70 [GLY] | A:1251 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:74 [PHE] | a:1382 [U] | I:71 [GLY] | A:1372 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:75 [THR] | a:1258 [A] | I:72 [ILE] | A:1248 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:101 [LYS] | a:1189 [A] | I:99 [ARG] | A:1179 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:101 [LYS] | a:1187 [G] | I:99 [ARG] | A:1177 [G] | ❌ 7K00_A:1177 no longer at interface |
i:74 [PHE] | a:1298 [A] | I:71 [GLY] | A:1288 [A] | ❌ 7K00_A:1288 no longer at interface |
i:74 [PHE] | a:1299 [A] | I:71 [GLY] | A:1289 [A] | ❌ 7K00_A:1289 no longer at interface |
i:98 [GLY] | a:1187 [G] | I:96 [SER] | A:1177 [G] | ❌ 7K00_I:96, 7K00_A:1177 no longer at interface |
i:43 [PHE] | a:1299 [A] | I:41 [ARG] | A:1289 [A] | ❌ 7K00_A:1289 no longer at interface |
i:102 [ARG] | a:1186 [A] | I:100 [LYS] | A:1176 [A] | ❌ 7K00_I:100, 7K00_A:1176 no longer at interface |
i:102 [ARG] | a:1187 [G] | I:100 [LYS] | A:1177 [G] | ❌ 7K00_I:100, 7K00_A:1177 no longer at interface |
i:42 [PRO] | a:1301 [U] | I:40 [GLY] | A:1291 [U] | ❌ 7K00_I:40, 7K00_A:1291 no longer at interface |
i:16 [ASN] | a:1262 [A] | I:14 [SER] | A:1252 [A] | ❌ 7K00_A:1252 no longer at interface |
i:130 [SER] | a:980 [G] | I:127 [PHE] | A:971 [G] | ❌ 7K00_A:971 no longer at interface |
i:111 [ARG] | a:1194 [G] | I:108 [ALA] | A:1184 [G] | ❌ 6S0X_a:1194 no longer at interface |
i:121 [LYS] | a:1244 [C] | I:119 [ARG] | A:1234 [C] | ❌ 6S0X_a:1244 no longer at interface |
i:121 [LYS] | a:1376 [C] | I:119 [ARG] | A:1366 [C] | ❌ 6S0X_a:1376 no longer at interface |
i:122 [ALA] | a:1360 [A] | I:120 [LYS] | A:1350 [A] | ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface |
i:122 [ALA] | a:1361 [U] | I:120 [LYS] | A:1351 [U] | ❌ 6S0X_a:1361 no longer at interface |
i:125 [ARG] | a:1360 [A] | I:123 [ARG] | A:1350 [A] | ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface |
i:125 [ARG] | a:951 [G] | I:123 [ARG] | A:942 [G] | ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface |
i:125 [ARG] | a:950 [G] | I:123 [ARG] | A:941 [G] | ❌ 6S0X_a:950 no longer at interface |
i:129 [PHE] | a:952 [U] | I:126 [GLN] | A:943 [U] | ❌ 6S0X_a:952 no longer at interface |
i:129 [PHE] | a:951 [G] | I:126 [GLN] | A:942 [G] | ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface |
i:130 [SER] | a:1351 [U] | I:127 [PHE] | A:1341 [U] | ❌ 6S0X_a:1351 no longer at interface |
i:130 [SER] | a:977 [A] | I:127 [PHE] | A:968 [A] | ❌ 6S0X_a:977 no longer at interface |
i:19 [ALA] | a:1159 [C] | I:17 [ALA] | A:1148 [U] | ❌ 7K00_I:17 no longer at interface |
i:39 [GLU] | a:1300 [G] | I:37 [GLN] | A:1290 [G] | ❌ 7K00_I:37 no longer at interface |
i:10 [GLY] | a:1158 [U] | I:8 [GLY] | A:1147 [C] | ❌ 7K00_I:8 no longer at interface |
i:68 [ASN] | a:1139 [C] | I:65 [ILE] | A:1128 [C] | ❌ 7K00_I:65 no longer at interface |
i:68 [ASN] | a:1140 [C] | I:65 [ILE] | A:1129 [C] | ❌ 7K00_I:65 no longer at interface |
i:68 [ASN] | a:1141 [A] | I:65 [ILE] | A:1130 [A] | ❌ 7K00_I:65 no longer at interface |
i:46 [LEU] | a:1383 [G] | I:44 [ALA] | A:1373 [G] | ❌ 7K00_I:44 no longer at interface |
i:42 [PRO] | a:1258 [A] | I:40 [GLY] | A:1248 [A] | ❌ 7K00_I:40 no longer at interface |
i:42 [PRO] | a:1300 [G] | I:40 [GLY] | A:1290 [G] | ❌ 7K00_I:40 no longer at interface |
i:83 [HIS] | a:1129 [A] | I:81 [HIS] | A:1118 [U] | ❌ 7K00_I:81 no longer at interface |
i:83 [HIS] | a:1130 [G] | I:81 [HIS] | A:1119 [C] | ❌ 7K00_I:81 no longer at interface |
i:34 [ASN] | a:1141 [A] | I:32 [GLN] | A:1130 [A] | ❌ 7K00_I:32 no longer at interface |
i:12 [GLY] | a:1129 [A] | I:10 [GLY] | A:1118 [U] | ❌ 7K00_I:10 no longer at interface |
i:21 [VAL] | a:1158 [U] | I:19 [VAL] | A:1147 [C] | ❌ 7K00_I:19 no longer at interface |
i:119 [GLY] | a:1378 [A] | I:116 [VAL] | A:1368 [A] | ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface |
i:119 [GLY] | a:1377 [U] | I:116 [VAL] | A:1367 [C] | ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1352 [C] | I:125 [PRO] | A:1342 [C] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1243 [G] | I:125 [PRO] | A:1233 [G] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1353 [G] | I:125 [PRO] | A:1343 [G] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1242 [U] | I:125 [PRO] | A:1232 [U] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:35 [ARG] | a:1258 [A] | I:33 [ARG] | A:1248 [A] | ❌ 6S0X_i:35 no longer at interface |
i:7 [GLU] | a:1141 [A] | I:5 [GLN] | A:1130 [A] | ❌ 6S0X_i:7 no longer at interface |
i:7 [GLU] | a:1142 [U] | I:5 [GLN] | A:1131 [G] | ❌ 6S0X_i:7 no longer at interface |
i:67 [VAL] | a:1141 [A] | I:64 [TYR] | A:1130 [A] | ❌ 6S0X_i:67 no longer at interface |
i:9 [ARG] | a:1159 [C] | I:7 [TYR] | A:1148 [U] | ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface |
i:9 [ARG] | a:1158 [U] | I:7 [TYR] | A:1147 [C] | ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface |
i:97 [ARG] | a:1189 [A] | I:95 [ARG] | A:1179 [A] | ❌ 6S0X_i:97 no longer at interface |
i:97 [ARG] | a:1188 [G] | I:95 [ARG] | A:1178 [G] | ❌ 6S0X_i:97 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.96 | 3.04 | 0.31 | 0.83 | 0.95 | 0.82 | 0.86 | 0.49 | 0.39 | 0.11 | 0.38 |
Other pairs involving 6S0X_i_a or 7K00_I_A
Total number of entries: 9