RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group92 > 6S0X_i_a vs 7K00_I_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0X_i
6S0X_a
7K00_I
7K00_A
Conserved?
i:120 [LEU] a:1377 [U] I:118 [LEU] A:1367 [C]
i:24 [VAL] a:1142 [U] I:22 [LYS] A:1131 [G]
i:101 [LYS] a:1188 [G] I:99 [ARG] A:1178 [G]
i:101 [LYS] a:1190 [A] I:99 [ARG] A:1180 [A]
i:132 [ARG] a:975 [G] I:129 [LYS] A:966 [2MG]
i:108 [ARG] a:1189 [A] I:105 [THR] A:1179 [A]
i:108 [ARG] a:1190 [A] I:105 [THR] A:1180 [A]
i:118 [PRO] a:1378 [A] I:115 [LYS] A:1368 [A]
i:113 [LYS] a:1357 [G] I:110 [GLN] A:1347 [G]
i:113 [LYS] a:1358 [U] I:110 [GLN] A:1348 [U]
i:73 [GLY] a:1259 [C] I:70 [GLY] A:1249 [C]
i:73 [GLY] a:1260 [A] I:70 [GLY] A:1250 [A]
i:73 [GLY] a:1380 [G] I:70 [GLY] A:1370 [G]
i:73 [GLY] a:1381 [G] I:70 [GLY] A:1371 [G]
i:22 [ARG] a:1141 [A] I:20 [PHE] A:1130 [A]
i:22 [ARG] a:1157 [C] I:20 [PHE] A:1146 [A]
i:22 [ARG] a:1158 [U] I:20 [PHE] A:1147 [C]
i:11 [THR] a:1130 [G] I:9 [THR] A:1119 [C]
i:11 [THR] a:1158 [U] I:9 [THR] A:1147 [C]
i:11 [THR] a:1159 [C] I:9 [THR] A:1148 [U]
i:74 [PHE] a:1259 [C] I:71 [GLY] A:1249 [C]
i:74 [PHE] a:1381 [G] I:71 [GLY] A:1371 [G]
i:14 [ARG] a:1357 [G] I:12 [ARG] A:1347 [G]
i:115 [ARG] a:1358 [U] I:112 [GLU] A:1348 [U]
i:112 [MET] a:1357 [G] I:109 [ARG] A:1347 [G]
i:72 [GLY] a:1259 [C] I:69 [GLY] A:1249 [C]
i:72 [GLY] a:1260 [A] I:69 [GLY] A:1250 [A]
i:72 [GLY] a:1261 [A] I:69 [GLY] A:1251 [A]
i:17 [SER] a:1381 [G] I:15 [SER] A:1371 [G]
i:13 [ARG] a:1129 [A] I:11 [ARG] A:1118 [U]
i:13 [ARG] a:1130 [G] I:11 [ARG] A:1119 [C]
i:13 [ARG] a:1160 [U] I:11 [ARG] A:1149 [C]
i:77 [GLN] a:1259 [C] I:75 [GLN] A:1249 [C]
i:77 [GLN] a:1260 [A] I:75 [GLN] A:1250 [A]
i:15 [LYS] a:1357 [G] I:13 [LYS] A:1347 [G]
i:15 [LYS] a:1381 [G] I:13 [LYS] A:1371 [G]
i:15 [LYS] a:1382 [U] I:13 [LYS] A:1372 [U]
i:15 [LYS] a:1383 [G] I:13 [LYS] A:1373 [G]
i:87 [ARG] a:1129 [A] I:85 [ARG] A:1118 [U]
i:87 [ARG] a:1130 [G] I:85 [ARG] A:1119 [C]
i:43 [PHE] a:1300 [G] I:41 [ARG] A:1290 [G]
i:43 [PHE] a:1382 [U] I:41 [ARG] A:1372 [U]
i:43 [PHE] a:1383 [G] I:41 [ARG] A:1373 [G]
i:40 [TYR] a:1258 [A] I:38 [TYR] A:1248 [A]
i:40 [TYR] a:1259 [C] I:38 [TYR] A:1249 [C]
i:123 [ALA] a:1358 [U] I:121 [ALA] A:1348 [U]
i:123 [ALA] a:1359 [A] I:121 [ALA] A:1349 [A]
i:71 [GLY] a:1260 [A] I:68 [LYS] A:1250 [A]
i:71 [GLY] a:1261 [A] I:68 [LYS] A:1251 [A]
i:116 [LYS] a:1377 [U] I:113 [ARG] A:1367 [C]
i:116 [LYS] a:1378 [A] I:113 [ARG] A:1368 [A]
i:116 [LYS] a:1379 [C] I:113 [ARG] A:1369 [C]
i:131 [LYS] a:976 [C] I:128 [SER] A:967 [5MC]
i:131 [LYS] a:979 [C] I:128 [SER] A:970 [C]
i:107 [THR] a:1189 [A] I:104 [VAL] A:1179 [A]
i:16 [ASN] a:1261 [A] I:14 [SER] A:1251 [A]
i:16 [ASN] a:1380 [G] I:14 [SER] A:1370 [G]
i:130 [SER] a:1242 [U] I:127 [PHE] A:1232 [U]
i:76 [GLY] a:1382 [U] I:74 [GLY] A:1372 [U]
i:20 [ARG] a:1140 [C] I:18 [ARG] A:1129 [C]
i:20 [ARG] a:1141 [A] I:18 [ARG] A:1130 [A]
i:20 [ARG] a:1158 [U] I:18 [ARG] A:1147 [C]
i:20 [ARG] a:1159 [C] I:18 [ARG] A:1148 [U]
i:124 [ARG] a:1353 [G] I:122 [ARG] A:1343 [G]
i:124 [ARG] a:1354 [C] I:122 [ARG] A:1344 [C]
i:124 [ARG] a:1355 [U] I:122 [ARG] A:1345 [U]
i:124 [ARG] a:1358 [U] I:122 [ARG] A:1348 [U]
i:124 [ARG] a:1359 [A] I:122 [ARG] A:1349 [A]
i:126 [SER] a:1353 [G] I:124 [ARG] A:1343 [G]
i:126 [SER] a:1354 [C] I:124 [ARG] A:1344 [C]
i:129 [PHE] a:1242 [U] I:126 [GLN] A:1232 [U]
i:129 [PHE] a:1352 [C] I:126 [GLN] A:1342 [C]
i:18 [VAL] a:1159 [C] I:16 [ALA] A:1148 [U]
i:18 [VAL] a:1160 [U] I:16 [ALA] A:1149 [C]
i:75 [THR] a:1259 [C] I:72 [ILE] A:1249 [C]
i:75 [THR] a:1381 [G] I:72 [ILE] A:1371 [G]
i:75 [THR] a:1382 [U] I:72 [ILE] A:1372 [U]
i:125 [ARG] a:1353 [G] I:123 [ARG] A:1343 [G]
i:125 [ARG] a:1354 [C] I:123 [ARG] A:1344 [C]
i:125 [ARG] a:1359 [A] I:123 [ARG] A:1349 [A]
i:114 [GLU] a:1357 [G] I:111 [VAL] A:1347 [G]
i:114 [GLU] a:1358 [U] I:111 [VAL] A:1348 [U]
i:109 [ASP] a:1128 [A] I:106 [ARG] A:1117 [A]
i:109 [ASP] a:1129 [A] I:106 [ARG] A:1118 [U]
i:122 [ALA] a:1359 [A] I:120 [LYS] A:1349 [A]
i:108 [ARG] a:1128 [A] I:105 [THR] A:1117 [A] ❌ 7K00_I_A
i:108 [ARG] a:1129 [A] I:105 [THR] A:1118 [U] ❌ 7K00_I_A
i:113 [LYS] a:1380 [G] I:110 [GLN] A:1370 [G] ❌ 7K00_I_A
i:113 [LYS] a:1381 [G] I:110 [GLN] A:1371 [G] ❌ 7K00_I_A
i:113 [LYS] a:1383 [G] I:110 [GLN] A:1373 [G] ❌ 7K00_I_A
i:22 [ARG] a:1140 [C] I:20 [PHE] A:1129 [C] ❌ 7K00_I_A
i:74 [PHE] a:1258 [A] I:71 [GLY] A:1248 [A] ❌ 7K00_I_A
i:115 [ARG] a:1377 [U] I:112 [GLU] A:1367 [C] ❌ 7K00_I_A
i:115 [ARG] a:1378 [A] I:112 [GLU] A:1368 [A] ❌ 7K00_I_A
i:115 [ARG] a:1379 [C] I:112 [GLU] A:1369 [C] ❌ 7K00_I_A
i:112 [MET] a:1127 [U] I:109 [ARG] A:1116 [U] ❌ 7K00_I_A
i:112 [MET] a:1128 [A] I:109 [ARG] A:1117 [A] ❌ 7K00_I_A
i:72 [GLY] a:1380 [G] I:69 [GLY] A:1370 [G] ❌ 7K00_I_A
i:72 [GLY] a:1381 [G] I:69 [GLY] A:1371 [G] ❌ 7K00_I_A
i:117 [LYS] a:1196 [G] I:114 [LYS] A:1186 [G] ❌ 7K00_I_A
i:117 [LYS] a:1197 [G] I:114 [LYS] A:1187 [G] ❌ 7K00_I_A
i:121 [LYS] a:1377 [U] I:119 [ARG] A:1367 [C] ❌ 7K00_I_A
i:13 [ARG] a:1128 [A] I:11 [ARG] A:1117 [A] ❌ 7K00_I_A
i:15 [LYS] a:1380 [G] I:13 [LYS] A:1370 [G] ❌ 7K00_I_A
i:87 [ARG] a:1189 [A] I:85 [ARG] A:1179 [A] ❌ 7K00_I_A
i:111 [ARG] a:1356 [A] I:108 [ALA] A:1346 [A] ❌ 7K00_I_A
i:111 [ARG] a:1357 [G] I:108 [ALA] A:1347 [G] ❌ 7K00_I_A
i:131 [LYS] a:975 [G] I:128 [SER] A:966 [2MG] ❌ 7K00_I_A
i:107 [THR] a:1129 [A] I:104 [VAL] A:1118 [U] ❌ 7K00_I_A
i:107 [THR] a:1190 [A] I:104 [VAL] A:1180 [A] ❌ 7K00_I_A
i:16 [ASN] a:1379 [C] I:14 [SER] A:1369 [C] ❌ 7K00_I_A
i:130 [SER] a:979 [C] I:127 [PHE] A:970 [C] ❌ 7K00_I_A
i:130 [SER] a:1241 [G] I:127 [PHE] A:1231 [G] ❌ 7K00_I_A
i:76 [GLY] a:1381 [G] I:74 [GLY] A:1371 [G] ❌ 7K00_I_A
i:20 [ARG] a:1139 [C] I:18 [ARG] A:1128 [C] ❌ 7K00_I_A
i:69 [VAL] a:1140 [C] I:66 [THR] A:1129 [C] ❌ 7K00_I_A
i:129 [PHE] a:1353 [G] I:126 [GLN] A:1343 [G] ❌ 7K00_I_A
i:75 [THR] a:1383 [G] I:72 [ILE] A:1373 [G] ❌ 7K00_I_A
i:70 [HIS] a:1139 [C] I:67 [VAL] A:1128 [C] ❌ 7K00_I_A
i:70 [HIS] a:1159 [C] I:67 [VAL] A:1148 [U] ❌ 7K00_I_A
i:70 [HIS] a:1160 [U] I:67 [VAL] A:1149 [C] ❌ 7K00_I_A
i:109 [ASP] a:1189 [A] I:106 [ARG] A:1179 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:111 [ARG] a:1128 [A] I:108 [ALA] A:1117 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:111 [ARG] a:1127 [U] I:108 [ALA] A:1116 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:112 [MET] a:1356 [A] I:109 [ARG] A:1346 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:13 [ARG] a:1159 [C] I:11 [ARG] A:1148 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:113 [LYS] a:1128 [A] I:110 [GLN] A:1117 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:113 [LYS] a:1127 [U] I:110 [GLN] A:1116 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:114 [GLU] a:1383 [G] I:111 [VAL] A:1373 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:114 [GLU] a:1381 [G] I:111 [VAL] A:1371 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:114 [GLU] a:1380 [G] I:111 [VAL] A:1370 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:115 [ARG] a:1196 [G] I:112 [GLU] A:1186 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:115 [ARG] a:1357 [G] I:112 [GLU] A:1347 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:115 [ARG] a:1197 [G] I:112 [GLU] A:1187 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:116 [LYS] a:1197 [G] I:113 [ARG] A:1187 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:116 [LYS] a:1196 [G] I:113 [ARG] A:1186 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:117 [LYS] a:1379 [C] I:114 [LYS] A:1369 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:117 [LYS] a:1378 [A] I:114 [LYS] A:1368 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:117 [LYS] a:1377 [U] I:114 [LYS] A:1367 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:118 [PRO] a:1196 [G] I:115 [LYS] A:1186 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:118 [PRO] a:1197 [G] I:115 [LYS] A:1187 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:118 [PRO] a:1377 [U] I:115 [LYS] A:1367 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:121 [LYS] a:1243 [G] I:119 [ARG] A:1233 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:124 [ARG] a:1196 [G] I:122 [ARG] A:1186 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:124 [ARG] a:1356 [A] I:122 [ARG] A:1346 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:124 [ARG] a:1357 [G] I:122 [ARG] A:1347 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:125 [ARG] a:1352 [C] I:123 [ARG] A:1342 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:125 [ARG] a:1358 [U] I:123 [ARG] A:1348 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:126 [SER] a:1243 [G] I:124 [ARG] A:1233 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:129 [PHE] a:1243 [G] I:126 [GLN] A:1233 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:130 [SER] a:1353 [G] I:127 [PHE] A:1343 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:130 [SER] a:1352 [C] I:127 [PHE] A:1342 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:130 [SER] a:976 [C] I:127 [PHE] A:967 [5MC] ❌ 6S0X_i_a
i:131 [LYS] a:1242 [U] I:128 [SER] A:1232 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:131 [LYS] a:1241 [G] I:128 [SER] A:1231 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:132 [ARG] a:976 [C] I:129 [LYS] A:967 [5MC] ❌ 6S0X_i_a
i:16 [ASN] a:1260 [A] I:14 [SER] A:1250 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:16 [ASN] a:1381 [G] I:14 [SER] A:1371 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:20 [ARG] a:1157 [C] I:18 [ARG] A:1146 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:69 [VAL] a:1141 [A] I:66 [THR] A:1130 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:70 [HIS] a:1260 [A] I:67 [VAL] A:1250 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:71 [GLY] a:1139 [C] I:68 [LYS] A:1128 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:71 [GLY] a:1159 [C] I:68 [LYS] A:1148 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:71 [GLY] a:1140 [C] I:68 [LYS] A:1129 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:73 [GLY] a:1261 [A] I:70 [GLY] A:1251 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:74 [PHE] a:1382 [U] I:71 [GLY] A:1372 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:75 [THR] a:1258 [A] I:72 [ILE] A:1248 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:101 [LYS] a:1189 [A] I:99 [ARG] A:1179 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:101 [LYS] a:1187 [G] I:99 [ARG] A:1177 [G] ❌ 7K00_A:1177 no longer at interface
i:74 [PHE] a:1298 [A] I:71 [GLY] A:1288 [A] ❌ 7K00_A:1288 no longer at interface
i:74 [PHE] a:1299 [A] I:71 [GLY] A:1289 [A] ❌ 7K00_A:1289 no longer at interface
i:98 [GLY] a:1187 [G] I:96 [SER] A:1177 [G] ❌ 7K00_I:96, 7K00_A:1177 no longer at interface
i:43 [PHE] a:1299 [A] I:41 [ARG] A:1289 [A] ❌ 7K00_A:1289 no longer at interface
i:102 [ARG] a:1186 [A] I:100 [LYS] A:1176 [A] ❌ 7K00_I:100, 7K00_A:1176 no longer at interface
i:102 [ARG] a:1187 [G] I:100 [LYS] A:1177 [G] ❌ 7K00_I:100, 7K00_A:1177 no longer at interface
i:42 [PRO] a:1301 [U] I:40 [GLY] A:1291 [U] ❌ 7K00_I:40, 7K00_A:1291 no longer at interface
i:16 [ASN] a:1262 [A] I:14 [SER] A:1252 [A] ❌ 7K00_A:1252 no longer at interface
i:130 [SER] a:980 [G] I:127 [PHE] A:971 [G] ❌ 7K00_A:971 no longer at interface
i:111 [ARG] a:1194 [G] I:108 [ALA] A:1184 [G] ❌ 6S0X_a:1194 no longer at interface
i:121 [LYS] a:1244 [C] I:119 [ARG] A:1234 [C] ❌ 6S0X_a:1244 no longer at interface
i:121 [LYS] a:1376 [C] I:119 [ARG] A:1366 [C] ❌ 6S0X_a:1376 no longer at interface
i:122 [ALA] a:1360 [A] I:120 [LYS] A:1350 [A] ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface
i:122 [ALA] a:1361 [U] I:120 [LYS] A:1351 [U] ❌ 6S0X_a:1361 no longer at interface
i:125 [ARG] a:1360 [A] I:123 [ARG] A:1350 [A] ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface
i:125 [ARG] a:951 [G] I:123 [ARG] A:942 [G] ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface
i:125 [ARG] a:950 [G] I:123 [ARG] A:941 [G] ❌ 6S0X_a:950 no longer at interface
i:129 [PHE] a:952 [U] I:126 [GLN] A:943 [U] ❌ 6S0X_a:952 no longer at interface
i:129 [PHE] a:951 [G] I:126 [GLN] A:942 [G] ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface
i:130 [SER] a:1351 [U] I:127 [PHE] A:1341 [U] ❌ 6S0X_a:1351 no longer at interface
i:130 [SER] a:977 [A] I:127 [PHE] A:968 [A] ❌ 6S0X_a:977 no longer at interface
i:19 [ALA] a:1159 [C] I:17 [ALA] A:1148 [U] ❌ 7K00_I:17 no longer at interface
i:39 [GLU] a:1300 [G] I:37 [GLN] A:1290 [G] ❌ 7K00_I:37 no longer at interface
i:10 [GLY] a:1158 [U] I:8 [GLY] A:1147 [C] ❌ 7K00_I:8 no longer at interface
i:68 [ASN] a:1139 [C] I:65 [ILE] A:1128 [C] ❌ 7K00_I:65 no longer at interface
i:68 [ASN] a:1140 [C] I:65 [ILE] A:1129 [C] ❌ 7K00_I:65 no longer at interface
i:68 [ASN] a:1141 [A] I:65 [ILE] A:1130 [A] ❌ 7K00_I:65 no longer at interface
i:46 [LEU] a:1383 [G] I:44 [ALA] A:1373 [G] ❌ 7K00_I:44 no longer at interface
i:42 [PRO] a:1258 [A] I:40 [GLY] A:1248 [A] ❌ 7K00_I:40 no longer at interface
i:42 [PRO] a:1300 [G] I:40 [GLY] A:1290 [G] ❌ 7K00_I:40 no longer at interface
i:83 [HIS] a:1129 [A] I:81 [HIS] A:1118 [U] ❌ 7K00_I:81 no longer at interface
i:83 [HIS] a:1130 [G] I:81 [HIS] A:1119 [C] ❌ 7K00_I:81 no longer at interface
i:34 [ASN] a:1141 [A] I:32 [GLN] A:1130 [A] ❌ 7K00_I:32 no longer at interface
i:12 [GLY] a:1129 [A] I:10 [GLY] A:1118 [U] ❌ 7K00_I:10 no longer at interface
i:21 [VAL] a:1158 [U] I:19 [VAL] A:1147 [C] ❌ 7K00_I:19 no longer at interface
i:119 [GLY] a:1378 [A] I:116 [VAL] A:1368 [A] ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface
i:119 [GLY] a:1377 [U] I:116 [VAL] A:1367 [C] ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1352 [C] I:125 [PRO] A:1342 [C] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1243 [G] I:125 [PRO] A:1233 [G] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1353 [G] I:125 [PRO] A:1343 [G] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1242 [U] I:125 [PRO] A:1232 [U] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:35 [ARG] a:1258 [A] I:33 [ARG] A:1248 [A] ❌ 6S0X_i:35 no longer at interface
i:7 [GLU] a:1141 [A] I:5 [GLN] A:1130 [A] ❌ 6S0X_i:7 no longer at interface
i:7 [GLU] a:1142 [U] I:5 [GLN] A:1131 [G] ❌ 6S0X_i:7 no longer at interface
i:67 [VAL] a:1141 [A] I:64 [TYR] A:1130 [A] ❌ 6S0X_i:67 no longer at interface
i:9 [ARG] a:1159 [C] I:7 [TYR] A:1148 [U] ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface
i:9 [ARG] a:1158 [U] I:7 [TYR] A:1147 [C] ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface
i:97 [ARG] a:1189 [A] I:95 [ARG] A:1179 [A] ❌ 6S0X_i:97 no longer at interface
i:97 [ARG] a:1188 [G] I:95 [ARG] A:1178 [G] ❌ 6S0X_i:97 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein S5 domain 2-like Bacterial small subunit ribosomal RNA 0.96 3.04 0.31 0.83 0.95 0.82 0.86 0.49 0.39 0.11 0.38


Other pairs involving 6S0X_i_a or 7K00_I_A

Total number of entries: 9