Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 6S0X_i
|
6S0X_a
|
7O7Y_Ap
|
7O7Y_A2
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| i:120 [LEU] | a:1377 [U] | Ap:134 [GLY] | A2:1669 [U] | ✔ |
| i:24 [VAL] | a:1142 [U] | Ap:26 [LYS] | A2:1410 [A] | ✔ |
| i:108 [ARG] | a:1189 [A] | Ap:122 [ALA] | A2:1475 [A] | ✔ |
| i:118 [PRO] | a:1378 [A] | Ap:131 [LYS] | A2:1670 [G] | ✔ |
| i:113 [LYS] | a:1357 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1649 [G] | ✔ |
| i:113 [LYS] | a:1358 [U] | Ap:127 [CYS] | A2:1650 [U] | ✔ |
| i:113 [LYS] | a:1380 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1672 [G] | ✔ |
| i:113 [LYS] | a:1381 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1673 [U] | ✔ |
| i:113 [LYS] | a:1383 [G] | Ap:127 [CYS] | A2:1675 [G] | ✔ |
| i:73 [GLY] | a:1259 [C] | Ap:75 [GLY] | A2:1545 [C] | ✔ |
| i:73 [GLY] | a:1260 [A] | Ap:75 [GLY] | A2:1546 [A] | ✔ |
| i:73 [GLY] | a:1381 [G] | Ap:75 [GLY] | A2:1673 [U] | ✔ |
| i:22 [ARG] | a:1141 [A] | Ap:24 [HIS] | A2:1409 [U] | ✔ |
| i:11 [THR] | a:1130 [G] | Ap:13 [PHE] | A2:1397 [A] | ✔ |
| i:11 [THR] | a:1158 [U] | Ap:13 [PHE] | A2:1443 [OMU] | ✔ |
| i:11 [THR] | a:1159 [C] | Ap:13 [PHE] | A2:1444 [C] | ✔ |
| i:10 [GLY] | a:1158 [U] | Ap:12 [VAL] | A2:1443 [OMU] | ✔ |
| i:74 [PHE] | a:1258 [A] | Ap:77 [HIS] | A2:1544 [U] | ✔ |
| i:74 [PHE] | a:1259 [C] | Ap:77 [HIS] | A2:1545 [C] | ✔ |
| i:74 [PHE] | a:1299 [A] | Ap:77 [HIS] | A2:1591 [C] | ✔ |
| i:74 [PHE] | a:1381 [G] | Ap:77 [HIS] | A2:1673 [U] | ✔ |
| i:14 [ARG] | a:1357 [G] | Ap:16 [LYS] | A2:1649 [G] | ✔ |
| i:115 [ARG] | a:1378 [A] | Ap:129 [SER] | A2:1670 [G] | ✔ |
| i:115 [ARG] | a:1379 [C] | Ap:129 [SER] | A2:1671 [C] | ✔ |
| i:112 [MET] | a:1127 [U] | Ap:126 [ARG] | A2:1394 [G] | ✔ |
| i:112 [MET] | a:1128 [A] | Ap:126 [ARG] | A2:1395 [G] | ✔ |
| i:112 [MET] | a:1357 [G] | Ap:126 [ARG] | A2:1649 [G] | ✔ |
| i:72 [GLY] | a:1259 [C] | Ap:74 [GLY] | A2:1545 [C] | ✔ |
| i:72 [GLY] | a:1260 [A] | Ap:74 [GLY] | A2:1546 [A] | ✔ |
| i:72 [GLY] | a:1261 [A] | Ap:74 [GLY] | A2:1547 [G] | ✔ |
| i:17 [SER] | a:1381 [G] | Ap:19 [ALA] | A2:1673 [U] | ✔ |
| i:13 [ARG] | a:1129 [A] | Ap:15 [ARG] | A2:1396 [C] | ✔ |
| i:13 [ARG] | a:1160 [U] | Ap:15 [ARG] | A2:1445 [U] | ✔ |
| i:77 [GLN] | a:1259 [C] | Ap:80 [GLN] | A2:1545 [C] | ✔ |
| i:77 [GLN] | a:1260 [A] | Ap:80 [GLN] | A2:1546 [A] | ✔ |
| i:15 [LYS] | a:1357 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1649 [G] | ✔ |
| i:15 [LYS] | a:1381 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1673 [U] | ✔ |
| i:15 [LYS] | a:1382 [U] | Ap:17 [LYS] | A2:1674 [U] | ✔ |
| i:15 [LYS] | a:1383 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1675 [G] | ✔ |
| i:128 [GLN] | a:1242 [U] | Ap:142 [GLN] | A2:1528 [C] | ✔ |
| i:128 [GLN] | a:1243 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1529 [G] | ✔ |
| i:128 [GLN] | a:1352 [C] | Ap:142 [GLN] | A2:1644 [PSU] | ✔ |
| i:42 [PRO] | a:1301 [U] | Ap:45 [ARG] | A2:1593 [C] | ✔ |
| i:123 [ALA] | a:1358 [U] | Ap:137 [ALA] | A2:1650 [U] | ✔ |
| i:123 [ALA] | a:1359 [A] | Ap:137 [ALA] | A2:1651 [A] | ✔ |
| i:111 [ARG] | a:1356 [A] | Ap:125 [ARG] | A2:1648 [A] | ✔ |
| i:111 [ARG] | a:1357 [G] | Ap:125 [ARG] | A2:1649 [G] | ✔ |
| i:71 [GLY] | a:1260 [A] | Ap:73 [LYS] | A2:1546 [A] | ✔ |
| i:131 [LYS] | a:976 [C] | Ap:144 [SER] | A2:1250 [C] | ✔ |
| i:131 [LYS] | a:979 [C] | Ap:144 [SER] | A2:1253 [C] | ✔ |
| i:107 [THR] | a:1189 [A] | Ap:121 [VAL] | A2:1475 [A] | ✔ |
| i:107 [THR] | a:1190 [A] | Ap:121 [VAL] | A2:1476 [G] | ✔ |
| i:16 [ASN] | a:1261 [A] | Ap:18 [THR] | A2:1547 [G] | ✔ |
| i:16 [ASN] | a:1380 [G] | Ap:18 [THR] | A2:1672 [G] | ✔ |
| i:76 [GLY] | a:1381 [G] | Ap:79 [ALA] | A2:1673 [U] | ✔ |
| i:76 [GLY] | a:1382 [U] | Ap:79 [ALA] | A2:1674 [U] | ✔ |
| i:20 [ARG] | a:1158 [U] | Ap:22 [VAL] | A2:1443 [OMU] | ✔ |
| i:20 [ARG] | a:1159 [C] | Ap:22 [VAL] | A2:1444 [C] | ✔ |
| i:69 [VAL] | a:1140 [C] | Ap:71 [ARG] | A2:1408 [U] | ✔ |
| i:124 [ARG] | a:1353 [G] | Ap:138 [ARG] | A2:1645 [C] | ✔ |
| i:124 [ARG] | a:1354 [C] | Ap:138 [ARG] | A2:1646 [C] | ✔ |
| i:124 [ARG] | a:1355 [U] | Ap:138 [ARG] | A2:1647 [C] | ✔ |
| i:124 [ARG] | a:1358 [U] | Ap:138 [ARG] | A2:1650 [U] | ✔ |
| i:124 [ARG] | a:1359 [A] | Ap:138 [ARG] | A2:1651 [A] | ✔ |
| i:126 [SER] | a:1353 [G] | Ap:140 [ARG] | A2:1645 [C] | ✔ |
| i:126 [SER] | a:1354 [C] | Ap:140 [ARG] | A2:1646 [C] | ✔ |
| i:129 [PHE] | a:1242 [U] | Ap:143 [LYS] | A2:1528 [C] | ✔ |
| i:129 [PHE] | a:1352 [C] | Ap:143 [LYS] | A2:1644 [PSU] | ✔ |
| i:129 [PHE] | a:1353 [G] | Ap:143 [LYS] | A2:1645 [C] | ✔ |
| i:18 [VAL] | a:1159 [C] | Ap:20 [THR] | A2:1444 [C] | ✔ |
| i:18 [VAL] | a:1160 [U] | Ap:20 [THR] | A2:1445 [U] | ✔ |
| i:75 [THR] | a:1382 [U] | Ap:78 [VAL] | A2:1674 [U] | ✔ |
| i:75 [THR] | a:1383 [G] | Ap:78 [VAL] | A2:1675 [G] | ✔ |
| i:125 [ARG] | a:1353 [G] | Ap:139 [ALA] | A2:1645 [C] | ✔ |
| i:125 [ARG] | a:1354 [C] | Ap:139 [ALA] | A2:1646 [C] | ✔ |
| i:125 [ARG] | a:1359 [A] | Ap:139 [ALA] | A2:1651 [A] | ✔ |
| i:114 [GLU] | a:1357 [G] | Ap:128 [GLU] | A2:1649 [G] | ✔ |
| i:114 [GLU] | a:1358 [U] | Ap:128 [GLU] | A2:1650 [U] | ✔ |
| i:122 [ALA] | a:1359 [A] | Ap:136 [GLY] | A2:1651 [A] | ✔ |
| i:108 [ARG] | a:1128 [A] | Ap:122 [ALA] | A2:1395 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:108 [ARG] | a:1129 [A] | Ap:122 [ALA] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:108 [ARG] | a:1190 [A] | Ap:122 [ALA] | A2:1476 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:73 [GLY] | a:1380 [G] | Ap:75 [GLY] | A2:1672 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:22 [ARG] | a:1140 [C] | Ap:24 [HIS] | A2:1408 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:22 [ARG] | a:1158 [U] | Ap:24 [HIS] | A2:1443 [OMU] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:115 [ARG] | a:1358 [U] | Ap:129 [SER] | A2:1650 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:115 [ARG] | a:1377 [U] | Ap:129 [SER] | A2:1669 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:72 [GLY] | a:1380 [G] | Ap:74 [GLY] | A2:1672 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:72 [GLY] | a:1381 [G] | Ap:74 [GLY] | A2:1673 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:117 [LYS] | a:1196 [G] | Ap:130 [LYS] | A2:1480 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:117 [LYS] | a:1197 [G] | Ap:130 [LYS] | A2:1481 [A] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:121 [LYS] | a:1377 [U] | Ap:135 [PRO] | A2:1669 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:13 [ARG] | a:1128 [A] | Ap:15 [ARG] | A2:1395 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:13 [ARG] | a:1130 [G] | Ap:15 [ARG] | A2:1397 [A] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:15 [LYS] | a:1380 [G] | Ap:17 [LYS] | A2:1672 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:128 [GLN] | a:1353 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1645 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:42 [PRO] | a:1258 [A] | Ap:45 [ARG] | A2:1544 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:42 [PRO] | a:1300 [G] | Ap:45 [ARG] | A2:1592 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:71 [GLY] | a:1261 [A] | Ap:73 [LYS] | A2:1547 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:107 [THR] | a:1129 [A] | Ap:121 [VAL] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:16 [ASN] | a:1379 [C] | Ap:18 [THR] | A2:1671 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:20 [ARG] | a:1140 [C] | Ap:22 [VAL] | A2:1408 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:20 [ARG] | a:1141 [A] | Ap:22 [VAL] | A2:1409 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:34 [ASN] | a:1141 [A] | Ap:36 [GLY] | A2:1409 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:75 [THR] | a:1259 [C] | Ap:78 [VAL] | A2:1545 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:75 [THR] | a:1381 [G] | Ap:78 [VAL] | A2:1673 [U] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:109 [ASP] | a:1128 [A] | Ap:123 [ASP] | A2:1395 [G] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:109 [ASP] | a:1129 [A] | Ap:123 [ASP] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap_A2 |
| i:109 [ASP] | a:1357 [G] | Ap:123 [ASP] | A2:1649 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:112 [MET] | a:1358 [U] | Ap:126 [ARG] | A2:1650 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:112 [MET] | a:1129 [A] | Ap:126 [ARG] | A2:1396 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:114 [GLU] | a:1379 [C] | Ap:128 [GLU] | A2:1671 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:114 [GLU] | a:1197 [G] | Ap:128 [GLU] | A2:1481 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:114 [GLU] | a:1196 [G] | Ap:128 [GLU] | A2:1480 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:115 [ARG] | a:1196 [G] | Ap:129 [SER] | A2:1480 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:117 [LYS] | a:1379 [C] | Ap:130 [LYS] | A2:1671 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:117 [LYS] | a:1378 [A] | Ap:130 [LYS] | A2:1670 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:117 [LYS] | a:1377 [U] | Ap:130 [LYS] | A2:1669 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:118 [PRO] | a:1196 [G] | Ap:131 [LYS] | A2:1480 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:118 [PRO] | a:1197 [G] | Ap:131 [LYS] | A2:1481 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:124 [ARG] | a:1356 [A] | Ap:138 [ARG] | A2:1648 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:124 [ARG] | a:1196 [G] | Ap:138 [ARG] | A2:1480 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:125 [ARG] | a:1358 [U] | Ap:139 [ALA] | A2:1650 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:129 [PHE] | a:976 [C] | Ap:143 [LYS] | A2:1250 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:131 [LYS] | a:1242 [U] | Ap:144 [SER] | A2:1528 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:131 [LYS] | a:1241 [G] | Ap:144 [SER] | A2:1527 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:132 [ARG] | a:979 [C] | Ap:145 [TYR] | A2:1253 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:132 [ARG] | a:976 [C] | Ap:145 [TYR] | A2:1250 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:132 [ARG] | a:1352 [C] | Ap:145 [TYR] | A2:1644 [PSU] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:132 [ARG] | a:1353 [G] | Ap:145 [TYR] | A2:1645 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:13 [ARG] | a:1159 [C] | Ap:15 [ARG] | A2:1444 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:16 [ASN] | a:1381 [G] | Ap:18 [THR] | A2:1673 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:16 [ASN] | a:1260 [A] | Ap:18 [THR] | A2:1546 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:22 [ARG] | a:1142 [U] | Ap:24 [HIS] | A2:1410 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:69 [VAL] | a:1159 [C] | Ap:71 [ARG] | A2:1444 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:69 [VAL] | a:1158 [U] | Ap:71 [ARG] | A2:1443 [OMU] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:69 [VAL] | a:1141 [A] | Ap:71 [ARG] | A2:1409 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:71 [GLY] | a:1259 [C] | Ap:73 [LYS] | A2:1545 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:73 [GLY] | a:1382 [U] | Ap:75 [GLY] | A2:1674 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:74 [PHE] | a:1382 [U] | Ap:77 [HIS] | A2:1674 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:74 [PHE] | a:1300 [G] | Ap:77 [HIS] | A2:1592 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
| i:132 [ARG] | a:975 [G] | Ap:145 [TYR] | A2:1248 [C] | ❌ 7O7Y_A2:1248 no longer at interface |
| i:22 [ARG] | a:1157 [C] | Ap:24 [HIS] | A2:1442 [U] | ❌ 7O7Y_A2:1442 no longer at interface |
| i:74 [PHE] | a:1298 [A] | Ap:77 [HIS] | A2:1590 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1590 no longer at interface |
| i:68 [ASN] | a:1139 [C] | Ap:70 [VAL] | A2:1407 [G] | ❌ 7O7Y_Ap:70, 7O7Y_A2:1407 no longer at interface |
| i:128 [GLN] | a:980 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1254 [A] | ❌ 7O7Y_A2:1254 no longer at interface |
| i:131 [LYS] | a:975 [G] | Ap:144 [SER] | A2:1248 [C] | ❌ 7O7Y_A2:1248 no longer at interface |
| i:16 [ASN] | a:1262 [A] | Ap:18 [THR] | A2:1548 [C] | ❌ 7O7Y_A2:1548 no longer at interface |
| i:20 [ARG] | a:1139 [C] | Ap:22 [VAL] | A2:1407 [G] | ❌ 7O7Y_A2:1407 no longer at interface |
| i:70 [HIS] | a:1139 [C] | Ap:72 [VAL] | A2:1407 [G] | ❌ 7O7Y_Ap:72, 7O7Y_A2:1407 no longer at interface |
| i:119 [GLY] | a:1198 [A] | Ap:132 [PHE] | A2:1482 [G] | ❌ 6S0X_i:119, 6S0X_a:1198 no longer at interface |
| i:121 [LYS] | a:1360 [A] | Ap:135 [PRO] | A2:1652 [A] | ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface |
| i:125 [ARG] | a:1360 [A] | Ap:139 [ALA] | A2:1652 [A] | ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface |
| i:127 [PRO] | a:1376 [C] | Ap:141 [TYR] | A2:1668 [U] | ❌ 6S0X_i:127, 6S0X_a:1376 no longer at interface |
| i:128 [GLN] | a:1351 [U] | Ap:142 [GLN] | A2:1643 [U] | ❌ 6S0X_a:1351 no longer at interface |
| i:128 [GLN] | a:951 [G] | Ap:142 [GLN] | A2:1225 [G] | ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface |
| i:128 [GLN] | a:952 [U] | Ap:142 [GLN] | A2:1226 [U] | ❌ 6S0X_a:952 no longer at interface |
| i:129 [PHE] | a:977 [A] | Ap:143 [LYS] | A2:1251 [A] | ❌ 6S0X_a:977 no longer at interface |
| i:132 [ARG] | a:978 [A] | Ap:145 [TYR] | A2:1252 [A] | ❌ 6S0X_a:978 no longer at interface |
| i:132 [ARG] | a:944 [A] | Ap:145 [TYR] | A2:1218 [A] | ❌ 6S0X_a:944 no longer at interface |
| i:29 [ASN] | a:1146 [U] | Ap:31 [LEU] | A2:1427 [U] | ❌ 6S0X_i:29, 6S0X_a:1146 no longer at interface |
| i:31 [THR] | a:1146 [U] | Ap:33 [LYS] | A2:1427 [U] | ❌ 6S0X_i:31, 6S0X_a:1146 no longer at interface |
| i:33 [ASN] | a:1146 [U] | Ap:35 [ASN] | A2:1427 [U] | ❌ 6S0X_i:33, 6S0X_a:1146 no longer at interface |
| i:33 [ASN] | a:1147 [A] | Ap:35 [ASN] | A2:1428 [C] | ❌ 6S0X_i:33, 6S0X_a:1147 no longer at interface |
| i:34 [ASN] | a:1146 [U] | Ap:36 [GLY] | A2:1427 [U] | ❌ 6S0X_a:1146 no longer at interface |
| i:34 [ASN] | a:1147 [A] | Ap:36 [GLY] | A2:1428 [C] | ❌ 6S0X_a:1147 no longer at interface |
| i:35 [ARG] | a:1257 [U] | Ap:37 [ARG] | A2:1543 [C] | ❌ 6S0X_i:35, 6S0X_a:1257 no longer at interface |
| i:41 [LEU] | a:1257 [U] | Ap:43 [GLU] | A2:1543 [C] | ❌ 6S0X_i:41, 6S0X_a:1257 no longer at interface |
| i:67 [VAL] | a:1146 [U] | Ap:69 [ARG] | A2:1427 [U] | ❌ 6S0X_i:67, 6S0X_a:1146 no longer at interface |
| i:71 [GLY] | a:1148 [A] | Ap:73 [LYS] | A2:1429 [G] | ❌ 6S0X_a:1148 no longer at interface |
| i:19 [ALA] | a:1159 [C] | Ap:21 [ALA] | A2:1444 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:21 no longer at interface |
| i:39 [GLU] | a:1300 [G] | Ap:41 [MET] | A2:1592 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:41 no longer at interface |
| i:68 [ASN] | a:1140 [C] | Ap:70 [VAL] | A2:1408 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:70 no longer at interface |
| i:68 [ASN] | a:1141 [A] | Ap:70 [VAL] | A2:1409 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:70 no longer at interface |
| i:87 [ARG] | a:1129 [A] | Ap:93 [VAL] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:93 no longer at interface |
| i:87 [ARG] | a:1130 [G] | Ap:93 [VAL] | A2:1397 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:93 no longer at interface |
| i:87 [ARG] | a:1189 [A] | Ap:93 [VAL] | A2:1475 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:93 no longer at interface |
| i:43 [PHE] | a:1299 [A] | Ap:47 [LEU] | A2:1591 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:47 no longer at interface |
| i:43 [PHE] | a:1300 [G] | Ap:47 [LEU] | A2:1592 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:47 no longer at interface |
| i:43 [PHE] | a:1382 [U] | Ap:47 [LEU] | A2:1674 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:47 no longer at interface |
| i:43 [PHE] | a:1383 [G] | Ap:47 [LEU] | A2:1675 [G] | ❌ 7O7Y_Ap:47 no longer at interface |
| i:106 [LEU] | a:1189 [A] | Ap:120 [LEU] | A2:1475 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:120 no longer at interface |
| i:40 [TYR] | a:1258 [A] | Ap:42 [ILE] | A2:1544 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:42 no longer at interface |
| i:40 [TYR] | a:1259 [C] | Ap:42 [ILE] | A2:1545 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:42 no longer at interface |
| i:46 [LEU] | a:1383 [G] | Ap:50 [LYS] | A2:1675 [G] | ❌ 7O7Y_Ap:50 no longer at interface |
| i:83 [HIS] | a:1129 [A] | Ap:89 [SER] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:89 no longer at interface |
| i:83 [HIS] | a:1130 [G] | Ap:89 [SER] | A2:1397 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:89 no longer at interface |
| i:66 [LEU] | a:1141 [A] | Ap:68 [ILE] | A2:1409 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:68 no longer at interface |
| i:66 [LEU] | a:1142 [U] | Ap:68 [ILE] | A2:1410 [A] | ❌ 7O7Y_Ap:68 no longer at interface |
| i:12 [GLY] | a:1129 [A] | Ap:14 [GLY] | A2:1396 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:14 no longer at interface |
| i:21 [VAL] | a:1158 [U] | Ap:23 [ALA] | A2:1443 [OMU] | ❌ 7O7Y_Ap:23 no longer at interface |
| i:70 [HIS] | a:1159 [C] | Ap:72 [VAL] | A2:1444 [C] | ❌ 7O7Y_Ap:72 no longer at interface |
| i:70 [HIS] | a:1160 [U] | Ap:72 [VAL] | A2:1445 [U] | ❌ 7O7Y_Ap:72 no longer at interface |
| i:9 [ARG] | a:1140 [C] | Ap:11 [GLN] | A2:1408 [U] | ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface |
| i:9 [ARG] | a:1158 [U] | Ap:11 [GLN] | A2:1443 [OMU] | ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface |
| i:9 [ARG] | a:1141 [A] | Ap:11 [GLN] | A2:1409 [U] | ❌ 6S0X_i:9 no longer at interface |
| i:104 [GLY] | a:1189 [A] | Ap:117 [ARG] | A2:1475 [A] | ❌ 6S0X_i:104 no longer at interface |
| i:104 [GLY] | a:1188 [G] | Ap:117 [ARG] | A2:1474 [G] | ❌ 6S0X_i:104 no longer at interface |
| i:104 [GLY] | a:1190 [A] | Ap:117 [ARG] | A2:1476 [G] | ❌ 6S0X_i:104 no longer at interface |
| i:110 [PRO] | a:1189 [A] | Ap:124 [PRO] | A2:1475 [A] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
| i:110 [PRO] | a:1128 [A] | Ap:124 [PRO] | A2:1395 [G] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
| i:110 [PRO] | a:1190 [A] | Ap:124 [PRO] | A2:1476 [G] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
| i:110 [PRO] | a:1127 [U] | Ap:124 [PRO] | A2:1394 [G] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
| i:119 [GLY] | a:1378 [A] | Ap:132 [PHE] | A2:1670 [G] | ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface |
| i:119 [GLY] | a:1377 [U] | Ap:132 [PHE] | A2:1669 [U] | ❌ 6S0X_i:119 no longer at interface |
| i:127 [PRO] | a:1377 [U] | Ap:141 [TYR] | A2:1669 [U] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| i:127 [PRO] | a:1242 [U] | Ap:141 [TYR] | A2:1528 [C] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| i:127 [PRO] | a:1352 [C] | Ap:141 [TYR] | A2:1644 [PSU] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| i:127 [PRO] | a:1353 [G] | Ap:141 [TYR] | A2:1645 [C] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| i:127 [PRO] | a:1243 [G] | Ap:141 [TYR] | A2:1529 [G] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
| i:33 [ASN] | a:1259 [C] | Ap:35 [ASN] | A2:1545 [C] | ❌ 6S0X_i:33 no longer at interface |
| i:35 [ARG] | a:1258 [A] | Ap:37 [ARG] | A2:1544 [U] | ❌ 6S0X_i:35 no longer at interface |
| i:41 [LEU] | a:1258 [A] | Ap:43 [GLU] | A2:1544 [U] | ❌ 6S0X_i:41 no longer at interface |
| i:41 [LEU] | a:1301 [U] | Ap:43 [GLU] | A2:1593 [C] | ❌ 6S0X_i:41 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein S5 domain 2-like | 0.89 | 3.49 | 0.20 | 0.74 | 0.89 | 0.7 | 0.84 | 0.47 | 0.41 | 0.02 | 0.54 |
Other pairs involving 6S0X_i_a or 7O7Y_Ap_A2
Total number of entries: 8
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2VQE_I_A | 6S0X_i_a | 0.50 | 0.96 | 3.04 | 0.4 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 2VQE_I_A | 7O7Y_Ap_A2 | 0.67 | 0.92 | 2.64 | 0.3 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare | |
| 4Y4O_1i_1a | 7O7Y_Ap_A2 | 0.70 | 0.93 | 2.23 | 0.3 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare | |
| 4Y4O_1i_1a | 6S0X_i_a | 0.49 | 0.95 | 3.36 | 0.33 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0X_i_a | 7K00_I_A | 0.49 | 0.96 | 3.04 | 0.31 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0X_i_a | 7RYG_i_a | 0.44 | 0.96 | 3.4 | 0.43 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0X_i_a | 7O7Y_Ap_A2 | 0.47 | 0.89 | 3.49 | 0.2 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare | |
| 7K00_I_A | 7O7Y_Ap_A2 | 0.70 | 0.92 | 2.24 | 0.38 | Ribosomal protein S5 domain 2-like | compare |