Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1R
|
4Y4O_1A
|
7RYG_M
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1R:117 [VAL] | 1A:2891 [C] | M:116 [VAL] | A:2877 [U] | ✔ |
1R:109 [ALA] | 1A:1697 [G] | M:108 [ALA] | A:1648 [A] | ✔ |
1R:67 [LEU] | 1A:1501 [U] | M:67 [PHE] | A:1449 [U] | ✔ |
1R:94 [TYR] | 1A:2849 [G] | M:94 [TYR] | A:2835 [G] | ✔ |
1R:94 [TYR] | 1A:2850 [C] | M:94 [TYR] | A:2836 [U] | ✔ |
1R:94 [TYR] | 1A:2890 [C] | M:94 [TYR] | A:2876 [C] | ✔ |
1R:96 [ARG] | 1A:2891 [C] | M:96 [ARG] | A:2877 [U] | ✔ |
1R:96 [ARG] | 1A:2892 [A] | M:96 [ARG] | A:2878 [A] | ✔ |
1R:45 [ARG] | 1A:2828 [G] | M:45 [ARG] | A:2814 [U] | ✔ |
1R:45 [ARG] | 1A:2847 [G] | M:45 [ARG] | A:2833 [A] | ✔ |
1R:45 [ARG] | 1A:2848 [G] | M:45 [ARG] | A:2834 [G] | ✔ |
1R:45 [ARG] | 1A:2891 [C] | M:45 [ARG] | A:2877 [U] | ✔ |
1R:77 [ARG] | 1A:1500 [A] | M:77 [GLY] | A:1448 [U] | ✔ |
1R:110 [PRO] | 1A:1697 [G] | M:109 [PRO] | A:1648 [A] | ✔ |
1R:98 [LEU] | 1A:2892 [A] | M:98 [LEU] | A:2878 [A] | ✔ |
1R:49 [ASP] | 1A:2849 [G] | M:49 [GLU] | A:2835 [G] | ✔ |
1R:49 [ASP] | 1A:2850 [C] | M:49 [GLU] | A:2836 [U] | ✔ |
1R:39 [PRO] | 1A:1698 [G] | M:39 [PRO] | A:1649 [G] | ✔ |
1R:39 [PRO] | 1A:1699 [A] | M:39 [PRO] | A:1650 [A] | ✔ |
1R:19 [ALA] | 1A:1321 [A] | M:19 [ALA] | A:1270 [A] | ✔ |
1R:19 [ALA] | 1A:1341 [C] | M:19 [ALA] | A:1290 [C] | ✔ |
1R:2 [ARG] | 1A:1700 [G] | M:2 [ARG] | A:1651 [G] | ✔ |
1R:2 [ARG] | 1A:1701 [A] | M:2 [ARG] | A:1652 [A] | ✔ |
1R:2 [ARG] | 1A:2735 [G] | M:2 [ARG] | A:2718 [G] | ✔ |
1R:2 [ARG] | 1A:2829 [G] | M:2 [ARG] | A:2815 [C] | ✔ |
1R:2 [ARG] | 1A:2830 [A] | M:2 [ARG] | A:2816 [G] | ✔ |
1R:2 [ARG] | 1A:2831 [A] | M:2 [ARG] | A:2817 [A] | ✔ |
1R:2 [ARG] | 1A:2832 [G] | M:2 [ARG] | A:2818 [G] | ✔ |
1R:108 [GLY] | 1A:2031 [G] | M:107 [ALA] | A:2005 [A] | ✔ |
1R:16 [HIS] | 1A:1321 [A] | M:16 [HIS] | A:1270 [A] | ✔ |
1R:16 [HIS] | 1A:1322 [A] | M:16 [HIS] | A:1271 [A] | ✔ |
1R:71 [GLN] | 1A:2713 [C] | M:71 [ARG] | A:2697 [C] | ✔ |
1R:71 [GLN] | 1A:2719 [G] | M:71 [ARG] | A:2703 [U] | ✔ |
1R:71 [GLN] | 1A:2720 [G] | M:71 [ARG] | A:2704 [C] | ✔ |
1R:27 [SER] | 1A:1324 [A] | M:27 [SER] | A:1273 [C] | ✔ |
1R:20 [LEU] | 1A:1322 [A] | M:20 [MET] | A:1271 [A] | ✔ |
1R:20 [LEU] | 1A:1323 [G] | M:20 [MET] | A:1272 [A] | ✔ |
1R:26 [LYS] | 1A:1340 [U] | M:26 [ASN] | A:1289 [U] | ✔ |
1R:14 [SER] | 1A:2701 [U] | M:14 [SER] | A:2685 [U] | ✔ |
1R:14 [SER] | 1A:2702 [C] | M:14 [SER] | A:2686 [A] | ✔ |
1R:73 [VAL] | 1A:1500 [A] | M:73 [ALA] | A:1448 [U] | ✔ |
1R:92 [GLY] | 1A:2848 [G] | M:92 [GLY] | A:2834 [G] | ✔ |
1R:92 [GLY] | 1A:2849 [G] | M:92 [GLY] | A:2835 [G] | ✔ |
1R:92 [GLY] | 1A:2850 [C] | M:92 [GLY] | A:2836 [U] | ✔ |
1R:92 [GLY] | 1A:2890 [C] | M:92 [GLY] | A:2876 [C] | ✔ |
1R:104 [ARG] | 1A:1333 [A] | M:103 [ARG] | A:1282 [A] | ✔ |
1R:104 [ARG] | 1A:1696 [G] | M:103 [ARG] | A:1647 [G] | ✔ |
1R:104 [ARG] | 1A:1697 [G] | M:103 [ARG] | A:1648 [A] | ✔ |
1R:6 [SER] | 1A:2882 [G] | M:6 [SER] | A:2868 [G] | ✔ |
1R:6 [SER] | 1A:2883 [A] | M:6 [SER] | A:2869 [A] | ✔ |
1R:93 [GLY] | 1A:2848 [G] | M:93 [GLY] | A:2834 [G] | ✔ |
1R:93 [GLY] | 1A:2849 [G] | M:93 [GLY] | A:2835 [G] | ✔ |
1R:93 [GLY] | 1A:2890 [C] | M:93 [GLY] | A:2876 [C] | ✔ |
1R:93 [GLY] | 1A:2891 [C] | M:93 [GLY] | A:2877 [U] | ✔ |
1R:33 [ARG] | 1A:1325 [G] | M:33 [LEU] | A:1274 [G] | ✔ |
1R:46 [GLY] | 1A:2848 [G] | M:46 [ARG] | A:2834 [G] | ✔ |
1R:46 [GLY] | 1A:2849 [G] | M:46 [ARG] | A:2835 [G] | ✔ |
1R:64 [ARG] | 1A:1501 [U] | M:64 [ARG] | A:1449 [U] | ✔ |
1R:64 [ARG] | 1A:1502 [G] | M:64 [ARG] | A:1450 [G] | ✔ |
1R:64 [ARG] | 1A:2717 [A] | M:64 [ARG] | A:2701 [A] | ✔ |
1R:64 [ARG] | 1A:2718 [G] | M:64 [ARG] | A:2702 [G] | ✔ |
1R:64 [ARG] | 1A:2861 [A] | M:64 [ARG] | A:2847 [A] | ✔ |
1R:64 [ARG] | 1A:2862 [G] | M:64 [ARG] | A:2848 [G] | ✔ |
1R:9 [LYS] | 1A:1700 [G] | M:9 [LYS] | A:1651 [G] | ✔ |
1R:9 [LYS] | 1A:2023 [A] | M:9 [LYS] | A:1997 [A] | ✔ |
1R:9 [LYS] | 1A:2024 [G] | M:9 [LYS] | A:1998 [G] | ✔ |
1R:24 [GLN] | 1A:1323 [G] | M:24 [LEU] | A:1272 [A] | ✔ |
1R:24 [GLN] | 1A:1324 [A] | M:24 [LEU] | A:1273 [C] | ✔ |
1R:15 [SER] | 1A:1321 [A] | M:15 [SER] | A:1270 [A] | ✔ |
1R:15 [SER] | 1A:2722 [C] | M:15 [SER] | A:2706 [C] | ✔ |
1R:10 [LEU] | 1A:1698 [G] | M:10 [LEU] | A:1649 [G] | ✔ |
1R:10 [LEU] | 1A:1699 [A] | M:10 [LEU] | A:1650 [A] | ✔ |
1R:10 [LEU] | 1A:1700 [G] | M:10 [LEU] | A:1651 [G] | ✔ |
1R:35 [THR] | 1A:1324 [A] | M:35 [LYS] | A:1273 [C] | ✔ |
1R:35 [THR] | 1A:1325 [G] | M:35 [LYS] | A:1274 [G] | ✔ |
1R:3 [HIS] | 1A:2735 [G] | M:3 [HIS] | A:2718 [G] | ✔ |
1R:3 [HIS] | 1A:2736 [C] | M:3 [HIS] | A:2719 [C] | ✔ |
1R:3 [HIS] | 1A:2830 [A] | M:3 [HIS] | A:2816 [G] | ✔ |
1R:3 [HIS] | 1A:2831 [A] | M:3 [HIS] | A:2817 [A] | ✔ |
1R:3 [HIS] | 1A:2832 [G] | M:3 [HIS] | A:2818 [G] | ✔ |
1R:106 [GLY] | 1A:1333 [A] | M:105 [GLY] | A:1282 [A] | ✔ |
1R:106 [GLY] | 1A:1334 [U] | M:105 [GLY] | A:1283 [A] | ✔ |
1R:11 [ASN] | 1A:1700 [G] | M:11 [GLY] | A:1651 [G] | ✔ |
1R:11 [ASN] | 1A:2025 [G] | M:11 [GLY] | A:1999 [A] | ✔ |
1R:99 [LYS] | 1A:2826 [C] | M:99 [LYS] | A:2812 [G] | ✔ |
1R:99 [LYS] | 1A:2827 [G] | M:99 [LYS] | A:2813 [U] | ✔ |
1R:50 [HIS] | 1A:2849 [G] | M:50 [PRO] | A:2835 [G] | ✔ |
1R:50 [HIS] | 1A:2850 [C] | M:50 [PRO] | A:2836 [U] | ✔ |
1R:42 [LYS] | 1A:2827 [G] | M:42 [LYS] | A:2813 [U] | ✔ |
1R:42 [LYS] | 1A:2828 [G] | M:42 [LYS] | A:2814 [U] | ✔ |
1R:107 [ASP] | 1A:1333 [A] | M:106 [ASP] | A:1282 [A] | ✔ |
1R:107 [ASP] | 1A:1696 [G] | M:106 [ASP] | A:1647 [G] | ✔ |
1R:107 [ASP] | 1A:1697 [G] | M:106 [ASP] | A:1648 [A] | ✔ |
1R:107 [ASP] | 1A:2030 [C] | M:106 [ASP] | A:2004 [C] | ✔ |
1R:107 [ASP] | 1A:2031 [G] | M:106 [ASP] | A:2005 [A] | ✔ |
1R:34 [ILE] | 1A:1324 [A] | M:34 [ILE] | A:1273 [C] | ✔ |
1R:34 [ILE] | 1A:1325 [G] | M:34 [ILE] | A:1274 [G] | ✔ |
1R:1 [MET] | 1A:1701 [A] | M:1 [MET] | A:1652 [A] | ✔ |
1R:1 [MET] | 1A:2022 [G] | M:1 [MET] | A:1996 [C] | ✔ |
1R:1 [MET] | 1A:2736 [C] | M:1 [MET] | A:2719 [C] | ✔ |
1R:1 [MET] | 1A:2737 [C] | M:1 [MET] | A:2720 [U] | ✔ |
1R:97 [VAL] | 1A:2891 [C] | M:97 [VAL] | A:2877 [U] | ✔ |
1R:97 [VAL] | 1A:2892 [A] | M:97 [VAL] | A:2878 [A] | ✔ |
1R:17 [ARG] | 1A:2024 [G] | M:17 [ARG] | A:1998 [G] | ✔ |
1R:17 [ARG] | 1A:2702 [C] | M:17 [ARG] | A:2686 [A] | ✔ |
1R:90 [ARG] | 1A:2890 [C] | M:90 [ARG] | A:2876 [C] | ✔ |
1R:90 [ARG] | 1A:2891 [C] | M:90 [ARG] | A:2877 [U] | ✔ |
1R:53 [HIS] | 1A:2850 [C] | M:53 [THR] | A:2836 [U] | ✔ |
1R:53 [HIS] | 1A:2851 [C] | M:53 [THR] | A:2837 [U] | ✔ |
1R:60 [LEU] | 1A:1501 [U] | M:60 [VAL] | A:1449 [U] | ✔ |
1R:60 [LEU] | 1A:1502 [G] | M:60 [VAL] | A:1450 [G] | ✔ |
1R:60 [LEU] | 1A:2861 [A] | M:60 [VAL] | A:2847 [A] | ✔ |
1R:5 [LYS] | 1A:2734 [A] | M:5 [ASN] | A:2717 [A] | ✔ |
1R:5 [LYS] | 1A:2735 [G] | M:5 [ASN] | A:2718 [G] | ✔ |
1R:5 [LYS] | 1A:2830 [A] | M:5 [ASN] | A:2816 [G] | ✔ |
1R:5 [LYS] | 1A:2883 [A] | M:5 [ASN] | A:2869 [A] | ✔ |
1R:91 [GLN] | 1A:2849 [G] | M:91 [ASN] | A:2835 [G] | ✔ |
1R:91 [GLN] | 1A:2850 [C] | M:91 [ASN] | A:2836 [U] | ✔ |
1R:91 [GLN] | 1A:2890 [C] | M:91 [ASN] | A:2876 [C] | ✔ |
1R:95 [THR] | 1A:2891 [C] | M:95 [LEU] | A:2877 [U] | ✔ |
1R:18 [LEU] | 1A:2721 [G] | M:18 [LYS] | A:2705 [G] | ✔ |
1R:31 [HIS] | 1A:1324 [A] | M:31 [HIS] | A:1273 [C] | ✔ |
1R:31 [HIS] | 1A:1325 [G] | M:31 [HIS] | A:1274 [G] | ✔ |
1R:40 [LYS] | 1A:1323 [G] | M:40 [LYS] | A:1272 [A] | ✔ |
1R:40 [LYS] | 1A:1697 [G] | M:40 [LYS] | A:1648 [A] | ✔ |
1R:40 [LYS] | 1A:1698 [G] | M:40 [LYS] | A:1649 [G] | ✔ |
1R:61 [HIS] | 1A:2860 [A] | M:61 [ALA] | A:2846 [A] | ✔ |
1R:61 [HIS] | 1A:2861 [A] | M:61 [ALA] | A:2847 [A] | ✔ |
1R:13 [HIS] | 1A:1321 [A] | M:13 [THR] | A:1270 [A] | ✔ |
1R:13 [HIS] | 1A:2024 [G] | M:13 [THR] | A:1998 [G] | ✔ |
1R:4 [LEU] | 1A:2734 [A] | M:4 [ARG] | A:2717 [A] | ✔ |
1R:4 [LEU] | 1A:2735 [G] | M:4 [ARG] | A:2718 [G] | ✔ |
1R:4 [LEU] | 1A:2830 [A] | M:4 [ARG] | A:2816 [G] | ✔ |
1R:4 [LEU] | 1A:2883 [A] | M:4 [ARG] | A:2869 [A] | ✔ |
1R:4 [LEU] | 1A:2884 [C] | M:4 [ARG] | A:2870 [C] | ✔ |
1R:12 [ARG] | 1A:1322 [A] | M:12 [ARG] | A:1271 [A] | ✔ |
1R:12 [ARG] | 1A:1323 [G] | M:12 [ARG] | A:1272 [A] | ✔ |
1R:12 [ARG] | 1A:1697 [G] | M:12 [ARG] | A:1648 [A] | ✔ |
1R:12 [ARG] | 1A:2024 [G] | M:12 [ARG] | A:1998 [G] | ✔ |
1R:12 [ARG] | 1A:2025 [G] | M:12 [ARG] | A:1999 [A] | ✔ |
1R:68 [ARG] | 1A:2719 [G] | M:68 [ALA] | A:2703 [U] | ✔ |
1R:68 [ARG] | 1A:2720 [G] | M:68 [ALA] | A:2704 [C] | ✔ |
1R:23 [ASN] | 1A:1322 [A] | M:23 [ASN] | A:1271 [A] | ✔ |
1R:23 [ASN] | 1A:1323 [G] | M:23 [ASN] | A:1272 [A] | ✔ |
1R:23 [ASN] | 1A:1340 [U] | M:23 [ASN] | A:1289 [U] | ✔ |
1R:23 [ASN] | 1A:1341 [C] | M:23 [ASN] | A:1290 [C] | ✔ |
1R:65 [LEU] | 1A:2880 [C] | M:65 [LEU] | A:2866 [C] | ✔ |
1R:37 [THR] | 1A:1324 [A] | M:37 [THR] | A:1273 [C] | ✔ |
1R:37 [THR] | 1A:1697 [G] | M:37 [THR] | A:1648 [A] | ✔ |
1R:37 [THR] | 1A:1698 [G] | M:37 [THR] | A:1649 [G] | ✔ |
1R:63 [ARG] | 1A:1501 [U] | M:63 [ARG] | A:1449 [U] | ✔ |
1R:105 [ARG] | 1A:1331 [G] | M:104 [ALA] | A:1280 [A] | ✔ |
1R:105 [ARG] | 1A:1332 [A] | M:104 [ALA] | A:1281 [A] | ✔ |
1R:105 [ARG] | 1A:1333 [A] | M:104 [ALA] | A:1282 [A] | ✔ |
1R:36 [THR] | 1A:1323 [G] | M:36 [THR] | A:1272 [A] | ✔ |
1R:36 [THR] | 1A:1324 [A] | M:36 [THR] | A:1273 [C] | ✔ |
1R:45 [ARG] | 1A:2892 [A] | M:45 [ARG] | A:2878 [A] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:77 [ARG] | 1A:1501 [U] | M:77 [GLY] | A:1449 [U] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:27 [SER] | 1A:1323 [G] | M:27 [SER] | A:1272 [A] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:26 [LYS] | 1A:1341 [C] | M:26 [ASN] | A:1290 [C] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:73 [VAL] | 1A:1501 [U] | M:73 [ALA] | A:1449 [U] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:104 [ARG] | 1A:1324 [A] | M:103 [ARG] | A:1273 [C] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:6 [SER] | 1A:2848 [G] | M:6 [SER] | A:2834 [G] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:64 [ARG] | 1A:2719 [G] | M:64 [ARG] | A:2703 [U] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:8 [ARG] | 1A:1699 [A] | M:8 [VAL] | A:1650 [A] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:8 [ARG] | 1A:2828 [G] | M:8 [VAL] | A:2814 [U] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:106 [GLY] | 1A:2031 [G] | M:105 [GLY] | A:2005 [A] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:11 [ASN] | 1A:1698 [G] | M:11 [GLY] | A:1649 [G] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:11 [ASN] | 1A:1699 [A] | M:11 [GLY] | A:1650 [A] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:50 [HIS] | 1A:2881 [C] | M:50 [PRO] | A:2867 [U] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:42 [LYS] | 1A:2848 [G] | M:42 [LYS] | A:2834 [G] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:107 [ASP] | 1A:1334 [U] | M:106 [ASP] | A:1283 [A] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:1 [MET] | 1A:1700 [G] | M:1 [MET] | A:1651 [G] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:17 [ARG] | 1A:2701 [U] | M:17 [ARG] | A:2685 [U] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:60 [LEU] | 1A:2862 [G] | M:60 [VAL] | A:2848 [G] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:5 [LYS] | 1A:2022 [G] | M:5 [ASN] | A:1996 [C] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:61 [HIS] | 1A:2880 [C] | M:61 [ALA] | A:2866 [C] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:4 [LEU] | 1A:2829 [G] | M:4 [ARG] | A:2815 [C] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:12 [ARG] | 1A:1698 [G] | M:12 [ARG] | A:1649 [G] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:105 [ARG] | 1A:2031 [G] | M:104 [ALA] | A:2005 [A] | ❌ 7RYG_M_A |
1R:18 [LEU] | 1A:2720 [G] | M:18 [LYS] | A:2704 [C] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:46 [GLY] | 1A:2882 [G] | M:46 [ARG] | A:2868 [G] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:46 [GLY] | 1A:2883 [A] | M:46 [ARG] | A:2869 [A] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:49 [ASP] | 1A:2848 [G] | M:49 [GLU] | A:2834 [G] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:53 [HIS] | 1A:2849 [G] | M:53 [THR] | A:2835 [G] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:6 [SER] | 1A:2702 [C] | M:6 [SER] | A:2686 [A] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:63 [ARG] | 1A:1500 [A] | M:63 [ARG] | A:1448 [U] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:67 [LEU] | 1A:2719 [G] | M:67 [PHE] | A:2703 [U] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:67 [LEU] | 1A:2718 [G] | M:67 [PHE] | A:2702 [G] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:67 [LEU] | 1A:2713 [C] | M:67 [PHE] | A:2697 [C] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:71 [GLN] | 1A:2718 [G] | M:71 [ARG] | A:2702 [G] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:8 [ARG] | 1A:2702 [C] | M:8 [VAL] | A:2686 [A] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:99 [LYS] | 1A:2892 [A] | M:99 [LYS] | A:2878 [A] | ❌ 4Y4O_1R_1A |
1R:98 [LEU] | 1A:2893 [A] | M:98 [LEU] | A:2879 [A] | ❌ 7RYG_A:2879 no longer at interface |
1R:14 [SER] | 1A:2726 [A] | M:14 [SER] | A:2709 [C] | ❌ 7RYG_A:2709 no longer at interface |
1R:73 [VAL] | 1A:2714 [U] | M:73 [ALA] | A:2698 [G] | ❌ 7RYG_A:2698 no longer at interface |
1R:15 [SER] | 1A:2726 [A] | M:15 [SER] | A:2709 [C] | ❌ 7RYG_A:2709 no longer at interface |
1R:57 [ARG] | 1A:2879 [G] | M:57 [ASN] | A:2865 [G] | ❌ 7RYG_M:57, 7RYG_A:2865 no longer at interface |
1R:106 [GLY] | 1A:1695 [C] | M:105 [GLY] | A:1646 [U] | ❌ 7RYG_A:1646 no longer at interface |
1R:106 [GLY] | 1A:2032 [G] | M:105 [GLY] | A:2006 [G] | ❌ 7RYG_A:2006 no longer at interface |
1R:99 [LYS] | 1A:2893 [A] | M:99 [LYS] | A:2879 [A] | ❌ 7RYG_A:2879 no longer at interface |
1R:1 [MET] | 1A:2021 [C] | M:1 [MET] | A:1995 [G] | ❌ 7RYG_A:1995 no longer at interface |
1R:5 [LYS] | 1A:2021 [C] | M:5 [ASN] | A:1995 [G] | ❌ 7RYG_A:1995 no longer at interface |
1R:61 [HIS] | 1A:2879 [G] | M:61 [ALA] | A:2865 [G] | ❌ 7RYG_A:2865 no longer at interface |
1R:13 [HIS] | 1A:2726 [A] | M:13 [THR] | A:2709 [C] | ❌ 7RYG_A:2709 no longer at interface |
1R:105 [ARG] | 1A:1373 [C] | M:104 [ALA] | A:1322 [A] | ❌ 7RYG_A:1322 no longer at interface |
1R:105 [ARG] | 1A:1374 [G] | M:104 [ALA] | A:1323 [A] | ❌ 7RYG_A:1323 no longer at interface |
1R:4 [LEU] | 1A:2885 [C] | M:4 [ARG] | A:2871 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2885 no longer at interface |
1R:71 [GLN] | 1A:2712 [C] | M:71 [ARG] | A:2696 [A] | ❌ 4Y4O_1A:2712 no longer at interface |
1R:22 [ARG] | 1A:2720 [G] | M:22 [GLU] | A:2704 [C] | ❌ 7RYG_M:22 no longer at interface |
1R:22 [ARG] | 1A:2721 [G] | M:22 [GLU] | A:2705 [G] | ❌ 7RYG_M:22 no longer at interface |
1R:57 [ARG] | 1A:2880 [C] | M:57 [ASN] | A:2866 [C] | ❌ 7RYG_M:57 no longer at interface |
1R:103 [ARG] | 1A:2030 [C] | M:102 [PHE] | A:2004 [C] | ❌ 7RYG_M:102 no longer at interface |
1R:69 [ASP] | 1A:2880 [C] | M:69 [ARG] | A:2866 [C] | ❌ 4Y4O_1R:69 no longer at interface |
1R:69 [ASP] | 1A:2881 [C] | M:69 [ARG] | A:2867 [U] | ❌ 4Y4O_1R:69 no longer at interface |
1R:7 [GLY] | 1A:2702 [C] | M:7 [GLY] | A:2686 [A] | ❌ 4Y4O_1R:7 no longer at interface |
1R:74 [LYS] | 1A:1500 [A] | M:74 [ALA] | A:1448 [U] | ❌ 4Y4O_1R:74 no longer at interface |
1R:76 [VAL] | 1A:1501 [U] | M:76 [VAL] | A:1449 [U] | ❌ 4Y4O_1R:76 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Prokaryotic ribosomal protein L17 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.96 | 1.65 | 0.57 | 0.95 | 0.96 | 0.96 | 0.97 | 0.83 | 0.80 | 0.44 | 0.40 |
Other pairs involving 4Y4O_1R_1A or 7RYG_M_A
Total number of entries: 7