RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group1 > 1F7U_A_B vs 2ZUE_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1F7U_A
1F7U_B
2ZUE_A
2ZUE_B
Conserved?
A:321 [ALA] B:974 [C] A:303 [ALA] B:974 [C] ✔
A:346 [LEU] B:974 [C] A:330 [THR] B:974 [C] ✔
A:465 [GLY] B:913 [C] A:483 [TYR] B:913 [U] ✔
A:465 [GLY] B:914 [A] A:483 [TYR] B:914 [A] ✔
A:607 [MET] B:936 [G] A:629 [MET] B:936 [U] ✔
A:607 [MET] B:938 [A] A:629 [MET] B:938 [A] ✔
A:469 [ASN] B:906 [C] A:487 [LYS] B:906 [G] ✔
A:469 [ASN] B:913 [C] A:487 [LYS] B:913 [U] ✔
A:469 [ASN] B:914 [A] A:487 [LYS] B:914 [A] ✔
A:453 [VAL] B:938 [A] A:471 [VAL] B:938 [A] ✔
A:433 [MET] B:938 [A] A:452 [ILE] B:938 [A] ✔
A:568 [LEU] B:935 [C] A:590 [HIS] B:935 [C] ✔
A:498 [SER] B:935 [C] A:516 [SER] B:935 [C] ✔
A:498 [SER] B:936 [G] A:516 [SER] B:936 [U] ✔
A:606 [ARG] B:936 [G] A:628 [ARG] B:936 [U] ✔
A:481 [PHE] B:938 [A] A:499 [PHE] B:938 [A] ✔
A:481 [PHE] B:939 [C] A:499 [PHE] B:939 [G] ✔
A:319 [LYS] B:974 [C] A:300 [TYR] B:974 [C] ✔
A:499 [VAL] B:935 [C] A:517 [ILE] B:935 [C] ✔
A:499 [VAL] B:936 [G] A:517 [ILE] B:936 [U] ✔
A:429 [MET] B:938 [A] A:448 [ALA] B:938 [A] ✔
A:337 [ILE] B:974 [C] A:321 [VAL] B:974 [C] ✔
A:564 [CYS] B:935 [C] A:586 [PHE] B:935 [C] ✔
A:495 [ARG] B:936 [G] A:513 [ARG] B:936 [U] ✔
A:495 [ARG] B:937 [A] A:513 [ARG] B:937 [A] ✔
A:495 [ARG] B:939 [C] A:513 [ARG] B:939 [G] ✔
A:488 [TYR] B:938 [A] A:506 [TYR] B:938 [A] ✔
A:488 [TYR] B:939 [C] A:506 [TYR] B:939 [G] ✔
A:488 [TYR] B:940 [C] A:506 [TYR] B:940 [C] ✔
A:376 [ASP] B:904 [C] A:388 [LYS] B:904 [C] ✔
A:484 [ASP] B:923 [G] A:502 [GLU] B:923 [G] ✔
A:484 [ASP] B:924 [G] A:502 [GLU] B:924 [G] ✔
A:109 [PHE] B:919 [H2U] A:85 [TYR] B:919 [G] ✔
A:569 [TRP] B:935 [C] A:591 [PRO] B:935 [C] ✔
A:502 [ASN] B:935 [C] A:520 [LYS] B:935 [C] ✔
A:552 [THR] B:914 [A] A:574 [TRP] B:914 [A] ✔
A:487 [PRO] B:938 [A] A:505 [PRO] B:938 [A] ✔
A:605 [GLU] B:936 [G] A:627 [GLU] B:936 [U] ✔
A:373 [SER] B:970 [G] A:385 [ALA] B:970 [U] ✔
A:59 [GLU] B:918 [G] A:31 [LYS] B:918 [G] ✔
A:571 [ALA] B:935 [C] A:593 [LEU] B:935 [C] ✔
A:491 [TYR] B:936 [G] A:509 [TYR] B:936 [U] ✔
A:491 [TYR] B:937 [A] A:509 [TYR] B:937 [A] ✔
A:491 [TYR] B:938 [A] A:509 [TYR] B:938 [A] ✔
A:491 [TYR] B:939 [C] A:509 [TYR] B:939 [G] ✔
A:570 [VAL] B:935 [C] A:592 [VAL] B:935 [C] ✔
A:562 [SER] B:939 [C] A:584 [ASN] B:939 [G] ✔
A:562 [SER] B:940 [C] A:584 [ASN] B:940 [C] ✔
A:549 [THR] B:915 [A] A:571 [LEU] B:915 [G] ✔
A:436 [ASN] B:936 [G] A:455 [LYS] B:936 [U] ✔
A:341 [SER] B:974 [C] A:325 [SER] B:974 [C] ✔
A:482 [GLU] B:924 [G] A:500 [GLU] B:924 [G] ✔
A:482 [GLU] B:925 [C] A:500 [GLU] B:925 [C] ✔
A:482 [GLU] B:938 [A] A:500 [GLU] B:938 [A] ✔
A:482 [GLU] B:939 [C] A:500 [GLU] B:939 [G] ✔
A:406 [GLN] B:969 [G] A:419 [GLU] B:969 [G] ✔
A:339 [GLN] B:974 [C] A:323 [ARG] B:974 [C] ✔
A:548 [THR] B:914 [A] A:570 [HIS] B:914 [A] ✔
A:548 [THR] B:915 [A] A:570 [HIS] B:915 [G] ✔
A:494 [SER] B:936 [G] A:512 [ALA] B:936 [U] ✔
A:377 [LEU] B:971 [A] A:389 [HIS] B:971 [C] ✔
A:377 [LEU] B:972 [A] A:389 [HIS] B:972 [C] ✔
A:566 [ASP] B:931 [G] A:588 [MET] B:931 [C] ✔
A:566 [ASP] B:935 [C] A:588 [MET] B:935 [C] ✔
A:566 [ASP] B:940 [C] A:588 [MET] B:940 [C] ✔
A:565 [TYR] B:935 [C] A:587 [TYR] B:935 [C] ✔
A:565 [TYR] B:936 [G] A:587 [TYR] B:936 [U] ✔
A:565 [TYR] B:937 [A] A:587 [TYR] B:937 [A] ✔
A:559 [HIS] B:940 [C] A:581 [SER] B:940 [C] ✔
A:340 [LYS] B:974 [C] A:324 [ARG] B:974 [C] ✔
A:483 [GLY] B:924 [G] A:501 [GLY] B:924 [G] ✔
A:483 [GLY] B:925 [C] A:501 [GLY] B:925 [C] ✔
A:483 [GLY] B:939 [C] A:501 [GLY] B:939 [G] ✔
A:466 [LYS] B:914 [A] A:484 [SER] B:914 [A] ✔
A:374 [GLN] B:970 [G] A:386 [GLU] B:970 [U] ✔
A:374 [GLN] B:971 [A] A:386 [GLU] B:971 [C] ✔
A:432 [VAL] B:938 [A] A:451 [LEU] B:938 [A] ✔
A:470 [ASN] B:913 [C] A:488 [LYS] B:913 [U] ✔
A:470 [ASN] B:969 [G] A:488 [LYS] B:969 [G] ✔
A:468 [ILE] B:905 [U] A:486 [ASP] B:905 [C] ✔
A:468 [ILE] B:906 [C] A:486 [ASP] B:906 [G] ✔
A:563 [SER] B:940 [C] A:585 [LYS] B:940 [C] ✔
A:563 [SER] B:941 [A] A:585 [LYS] B:941 [C] ✔
A:107 [GLY] B:919 [H2U] A:83 [ASN] B:919 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:111 [GLN] B:919 [H2U] A:87 [ASN] B:919 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:319 [LYS] B:973 [G] A:300 [TYR] B:973 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:66 [ARG] B:919 [H2U] A:38 [LEU] B:919 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:75 [ARG] B:918 [G] A:47 [PHE] B:918 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:337 [ILE] B:973 [G] A:321 [VAL] B:973 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:495 [ARG] B:940 [C] A:513 [ARG] B:940 [C] ❌ 2ZUE_A_B
A:62 [ASN] B:919 [H2U] A:34 [PRO] B:919 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:62 [ASN] B:922 [C] A:34 [PRO] B:922 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:109 [PHE] B:918 [G] A:85 [TYR] B:918 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:552 [THR] B:922 [C] A:574 [TRP] B:922 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:318 [ASP] B:973 [G] A:299 [LYS] B:973 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:72 [PRO] B:918 [G] A:44 [PRO] B:918 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:106 [ASN] B:919 [H2U] A:82 [VAL] B:919 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:70 [LEU] B:918 [G] A:42 [GLY] B:918 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:70 [LEU] B:919 [H2U] A:42 [GLY] B:919 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:559 [HIS] B:923 [G] A:581 [SER] B:923 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:559 [HIS] B:924 [G] A:581 [SER] B:924 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:63 [THR] B:922 [C] A:35 [ASP] B:922 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:466 [LYS] B:913 [C] A:484 [SER] B:913 [U] ❌ 2ZUE_A_B
A:466 [LYS] B:915 [A] A:484 [SER] B:915 [G] ❌ 2ZUE_A_B
A:318 [ASP] B:974 [C] A:299 [LYS] B:974 [C] ❌ 1F7U_A_B
A:59 [GLU] B:919 [H2U] A:31 [LYS] B:919 [G] ❌ 1F7U_A_B
A:376 [ASP] B:905 [U] A:388 [LYS] B:905 [C] ❌ 1F7U_A_B
A:377 [LEU] B:903 [C] A:389 [HIS] B:903 [A] ❌ 1F7U_A_B
A:72 [PRO] B:919 [H2U] A:44 [PRO] B:919 [G] ❌ 1F7U_A_B
A:436 [ASN] B:937 [A] A:455 [LYS] B:937 [A] ❌ 1F7U_A_B
A:436 [ASN] B:938 [A] A:455 [LYS] B:938 [A] ❌ 1F7U_A_B
A:75 [ARG] B:919 [H2U] A:47 [PHE] B:919 [G] ❌ 1F7U_A_B
A:465 [GLY] B:912 [C] A:483 [TYR] B:912 [C] ❌ 1F7U_A_B
A:484 [ASP] B:922 [C] A:502 [GLU] B:922 [G] ❌ 1F7U_A_B
A:484 [ASP] B:913 [C] A:502 [GLU] B:913 [U] ❌ 1F7U_A_B
A:484 [ASP] B:912 [C] A:502 [GLU] B:912 [C] ❌ 1F7U_A_B
A:566 [ASP] B:939 [C] A:588 [MET] B:939 [G] ❌ 1F7U_A_B
A:36 [ARG] B:916 [H2U] A:6 [ARG] B:916 [C] ❌ 2ZUE_A:6, 2ZUE_B:916 no longer at interface
A:58 [LEU] B:916 [H2U] A:30 [LEU] B:916 [C] ❌ 2ZUE_A:30, 2ZUE_B:916 no longer at interface
A:66 [ARG] B:921 [A] A:38 [LEU] B:921 [A] ❌ 2ZUE_B:921 no longer at interface
A:62 [ASN] B:916 [H2U] A:34 [PRO] B:916 [C] ❌ 2ZUE_B:916 no longer at interface
A:569 [TRP] B:934 [I] A:591 [PRO] B:934 [C] ❌ 2ZUE_B:934 no longer at interface
A:540 [ASN] B:916 [H2U] A:562 [GLN] B:916 [C] ❌ 2ZUE_B:916 no longer at interface
A:59 [GLU] B:916 [H2U] A:31 [LYS] B:916 [C] ❌ 2ZUE_B:916 no longer at interface
A:571 [ALA] B:934 [I] A:593 [LEU] B:934 [C] ❌ 2ZUE_B:934 no longer at interface
A:573 [GLN] B:934 [I] A:595 [ALA] B:934 [C] ❌ 2ZUE_A:595, 2ZUE_B:934 no longer at interface
A:470 [ASN] B:968 [G] A:488 [LYS] B:968 [G] ❌ 2ZUE_B:968 no longer at interface
A:543 [LYS] B:916 [H2U] A:565 [LYS] B:916 [C] ❌ 2ZUE_A:565, 2ZUE_B:916 no longer at interface
A:60 [TRP] B:916 [H2U] A:32 [GLU] B:916 [C] ❌ 2ZUE_B:916 no longer at interface
A:57 [ALA] B:917 [G] A:29 [GLU] B:917A [A] ❌ 1F7U_A:57, 1F7U_B:917 no longer at interface
A:62 [ASN] B:920 [C] A:34 [PRO] B:920A [C] ❌ 1F7U_B:920 no longer at interface
A:63 [THR] B:920 [C] A:35 [ASP] B:920A [C] ❌ 1F7U_B:920 no longer at interface
A:377 [LEU] B:902 [U] A:389 [HIS] B:902 [G] ❌ 1F7U_B:902 no longer at interface
A:76 [LEU] B:957 [A] A:48 [LYS] B:957 [A] ❌ 1F7U_A:76, 1F7U_B:957 no longer at interface
A:469 [ASN] B:907 [G] A:487 [LYS] B:907 [G] ❌ 1F7U_B:907 no longer at interface
A:469 [ASN] B:908 [U] A:487 [LYS] B:908 [U] ❌ 1F7U_B:908 no longer at interface
A:482 [GLU] B:926 [M2G] A:500 [GLU] B:926 [G] ❌ 1F7U_B:926 no longer at interface
A:540 [ASN] B:917 [G] A:562 [GLN] B:917A [A] ❌ 1F7U_B:917 no longer at interface
A:544 [THR] B:917 [G] A:566 [ASP] B:917A [A] ❌ 1F7U_A:544, 1F7U_B:917 no longer at interface
A:77 [ARG] B:956 [C] A:49 [LEU] B:955 [U] ❌ 2ZUE_A:49 no longer at interface
A:108 [PRO] B:919 [H2U] A:84 [GLY] B:919 [G] ❌ 2ZUE_A:84 no longer at interface
A:464 [GLN] B:913 [C] A:482 [LYS] B:913 [U] ❌ 2ZUE_A:482 no longer at interface
A:464 [GLN] B:914 [A] A:482 [LYS] B:914 [A] ❌ 2ZUE_A:482 no longer at interface
A:323 [LEU] B:973 [G] A:305 [VAL] B:973 [G] ❌ 2ZUE_A:305 no longer at interface
A:556 [LYS] B:922 [C] A:578 [GLU] B:922 [G] ❌ 2ZUE_A:578 no longer at interface
A:585 [TYR] B:935 [C] A:607 [VAL] B:935 [C] ❌ 2ZUE_A:607 no longer at interface
A:335 [LYS] B:973 [G] A:319 [ILE] B:973 [G] ❌ 2ZUE_A:319 no longer at interface
A:404 [MET] B:969 [G] A:417 [HIS] B:969 [G] ❌ 2ZUE_A:417 no longer at interface
A:404 [MET] B:970 [G] A:417 [HIS] B:970 [U] ❌ 2ZUE_A:417 no longer at interface
A:332 [LYS] B:903 [C] A:316 [LYS] B:903 [A] ❌ 2ZUE_A:316 no longer at interface
A:332 [LYS] B:904 [C] A:316 [LYS] B:904 [C] ❌ 2ZUE_A:316 no longer at interface
A:477 [ARG] B:912 [C] A:495 [ASP] B:912 [C] ❌ 2ZUE_A:495 no longer at interface
A:74 [PRO] B:918 [G] A:46 [ALA] B:918 [G] ❌ 2ZUE_A:46 no longer at interface
A:74 [PRO] B:956 [C] A:46 [ALA] B:955 [U] ❌ 2ZUE_A:46 no longer at interface
A:57 [ALA] B:918 [G] A:29 [GLU] B:918 [G] ❌ 1F7U_A:57 no longer at interface
A:320 [GLY] B:974 [C] A:301 [ARG] B:974 [C] ❌ 1F7U_A:320 no longer at interface
A:333 [LEU] B:973 [G] A:317 [ASN] B:973 [G] ❌ 1F7U_A:333 no longer at interface
A:403 [GLY] B:905 [U] A:416 [GLU] B:905 [C] ❌ 1F7U_A:403 no longer at interface
A:437 [GLU] B:936 [G] A:456 [ASN] B:936 [U] ❌ 1F7U_A:437 no longer at interface
A:76 [LEU] B:919 [H2U] A:48 [LYS] B:919 [G] ❌ 1F7U_A:76 no longer at interface
A:476 [GLU] B:925 [C] A:494 [GLU] B:925 [C] ❌ 1F7U_A:476 no longer at interface
A:480 [SER] B:925 [C] A:498 [ASN] B:925 [C] ❌ 1F7U_A:480 no longer at interface
A:79 [LYS] B:956 [C] A:51 [LYS] B:955 [U] ❌ 1F7U_A:79 no longer at interface
A:523 [ALA] B:941 [A] A:545 [ARG] B:941 [C] ❌ 1F7U_A:523 no longer at interface
A:555 [PHE] B:923 [G] A:577 [ASN] B:923 [G] ❌ 1F7U_A:555 no longer at interface
A:572 [GLY] B:935 [C] A:594 [LYS] B:935 [C] ❌ 1F7U_A:572 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
HUP domains & Arginyl-tRNA synthetase (ArgRS), N-terminal 'additional' domain tRNA 0.85 3.03 0.21 0.84 0.71 0.8 0.83 0.58 0.52 0.42 0.59


Other pairs involving 1F7U_A_B or 2ZUE_A_B

Total number of entries: 1

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1F7U_A_B 2ZUE_A_B 0.58 0.85 3.03 0.21 HUP domains & Arginyl-tRNA synthetase (ArgRS), N-terminal 'additional' domain tRNA compare