RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group13 > 4RMO_A_B vs 7D8O_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4RMO_A
4RMO_B
7D8O_A
7D8O_B
Conserved?
A:74 [ILE] B:4 [U] A:68 [PHE] B:0 [U] ✔
A:131 [GLY] B:7 [A] A:137 [ASN] B:16 [U] ✔
A:128 [LYS] B:7 [A] A:134 [LEU] B:16 [U] ✔
A:56 [LYS] B:4 [U] A:57 [TRP] B:0 [U] ✔
A:70 [ASN] B:6 [U] A:64 [SER] B:2 [G] ✔
A:139 [PHE] B:4 [U] A:145 [GLN] B:0 [U] ✔
A:139 [PHE] B:5 [U] A:145 [GLN] B:1 [A] ✔
A:138 [LYS] B:5 [U] A:144 [MET] B:1 [A] ✔
A:137 [ILE] B:5 [U] A:143 [ARG] B:1 [A] ✔
A:137 [ILE] B:7 [A] A:143 [ARG] B:16 [U] ✔
A:135 [ARG] B:8 [C] A:141 [GLN] B:17 [U] ✔
A:132 [MSE] B:7 [A] A:138 [LEU] B:16 [U] ✔
A:69 [ARG] B:6 [U] A:63 [GLU] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:69 [ARG] B:7 [A] A:63 [GLU] B:16 [U] ❌ 7D8O_A_B
A:128 [LYS] B:6 [U] A:134 [LEU] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:73 [ILE] B:4 [U] A:67 [ALA] B:0 [U] ❌ 7D8O_A_B
A:73 [ILE] B:6 [U] A:67 [ALA] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:140 [THR] B:4 [U] A:146 [GLY] B:0 [U] ❌ 7D8O_A_B
A:140 [THR] B:5 [U] A:146 [GLY] B:1 [A] ❌ 7D8O_A_B
A:90 [GLN] B:4 [U] A:87 [LYS] B:0 [U] ❌ 7D8O_A_B
A:139 [PHE] B:6 [U] A:145 [GLN] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:72 [ASP] B:6 [U] A:66 [PRO] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:137 [ILE] B:6 [U] A:143 [ARG] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:135 [ARG] B:7 [A] A:141 [GLN] B:16 [U] ❌ 7D8O_A_B
A:132 [MSE] B:6 [U] A:138 [LEU] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:71 [CYS] B:6 [U] A:65 [SER] B:2 [G] ❌ 7D8O_A_B
A:128 [LYS] B:5 [U] A:134 [LEU] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:131 [GLY] B:8 [C] A:137 [ASN] B:17 [U] ❌ 4RMO_A_B
A:132 [MSE] B:5 [U] A:138 [LEU] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:137 [ILE] B:8 [C] A:143 [ARG] B:17 [U] ❌ 4RMO_A_B
A:24 [GLY] B:2 [A] A:23 [ASN] B:-2 [U] ❌ 4RMO_A_B
A:70 [ASN] B:7 [A] A:64 [SER] B:16 [U] ❌ 4RMO_A_B
A:70 [ASN] B:5 [U] A:64 [SER] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:71 [CYS] B:5 [U] A:65 [SER] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:71 [CYS] B:4 [U] A:65 [SER] B:0 [U] ❌ 4RMO_A_B
A:72 [ASP] B:5 [U] A:66 [PRO] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:73 [ILE] B:5 [U] A:67 [ALA] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:74 [ILE] B:5 [U] A:68 [PHE] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:88 [LEU] B:2 [A] A:85 [ASN] B:-2 [U] ❌ 4RMO_A_B
A:90 [GLN] B:5 [U] A:87 [LYS] B:1 [A] ❌ 4RMO_A_B
A:57 [TYR] B:4 [U] A:58 [HIS] B:0 [U] ❌ 7D8O_A:58 no longer at interface
A:49 [PRO] B:2 [A] A:50 [PRO] B:-2 [U] ❌ 4RMO_A:49 no longer at interface
A:51 [SER] B:1 [A] A:52 [THR] B:-3 [A] ❌ 4RMO_A:51 no longer at interface
A:51 [SER] B:2 [A] A:52 [THR] B:-2 [U] ❌ 4RMO_A:51 no longer at interface
A:54 [ILE] B:1 [A] A:55 [LYS] B:-3 [A] ❌ 4RMO_A:54 no longer at interface
A:54 [ILE] B:2 [A] A:55 [LYS] B:-2 [U] ❌ 4RMO_A:54 no longer at interface
A:59 [LYS] B:4 [U] A:60 [ASN] B:0 [U] ❌ 4RMO_A:59 no longer at interface
A:61 [VAL] B:4 [U] A:61 [VAL] B:0 [U] ❌ 4RMO_A:61 no longer at interface
A:65 [THR] B:4 [U] A:62 [LYS] B:0 [U] ❌ 4RMO_A:65 no longer at interface
A:65 [THR] B:6 [U] A:62 [LYS] B:2 [G] ❌ 4RMO_A:65 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
SH3 0.63 2.16 0.00 0.74 0.29 0.75 0.42 0.30 0.26 0.00 0.26


Other pairs involving 4RMO_A_B or 7D8O_A_B

Total number of entries: 1

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4RMO_A_B 7D8O_A_B 0.30 0.63 2.16 0.0 SH3 compare