RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 6S0Z_C_A

Interface analysis

mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Chain
Chain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity
Electrostatics (surface only)
Conservation*

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show as licorice
show Accessibility
Rim - Core

Contacts -

6S0Z_C
6S0Z_A
Distance
Base Pair
Hbond nuc:res
Base Stacking
Residue conservation
C:4 [LYS] A:1612 [C] 3.58 A:1615 [G] 57.8
C:6 [TYR] A:1612 [C] 4.34 A:1615 [G] 15.23
C:7 [LYS] A:750 [A] 3.38 A:771 [G] 71.05
C:7 [LYS] A:751 [A] 3.96 A:770 [G] 71.05
C:7 [LYS] A:1739 [G] 4.1 A:1736 [U] 71.05
C:8 [PRO] A:1737 [U] 4.73 A:1856 [A] 62.21
C:8 [PRO] A:1738 [C] 3.62 62.21
C:8 [PRO] A:1739 [G] 3.22 A:1736 [U] 62.21
C:9 [ILE] A:750 [A] 3.92 A:771 [G] 49.06
C:9 [ILE] A:772 [A] 3.7 A:749 [G] 49.06
C:9 [ILE] A:773 [G] 3.98 A:748 [U] 49.06
C:9 [ILE] A:1739 [G] 3.74 A:1736 [U] 49.06
C:10 [THR] A:773 [G] 3.71 A:748 [U] 80.81
C:10 [THR] A:774 [G] 3.3 A:1801 [C] 80.81
C:10 [THR] A:775 [A] 4.09 A:747 [U] 80.81
C:11 [ASN] A:774 [G] 4.61 A:1801 [C] 56.67
C:11 [ASN] A:1800 [A] 2.77 A:2004 [A] base:BB base/AA stacks 56.67
C:11 [ASN] A:1801 [C] 3.37 A:774 [G] sugar:SC 56.67
C:11 [ASN] A:2004 [A] 4.29 A:1800 [A] 56.67
C:11 [ASN] A:2005 [A] 3.05 base:SC 56.67
C:12 [GLY] A:774 [G] 3.72 A:1801 [C] 72.82
C:12 [GLY] A:1800 [A] 4.82 A:2004 [A] 72.82
C:12 [GLY] A:1801 [C] 4.03 A:774 [G] 72.82
C:13 [ARG] A:772 [A] 4.03 A:749 [G] 31.68
C:13 [ARG] A:773 [G] 3.99 A:748 [U] 31.68
C:13 [ARG] A:774 [G] 3.02 A:1801 [C] 31.68
C:14 [ARG] A:1737 [U] 2.22 A:1856 [A] sugar:SC 91.33
C:14 [ARG] A:1739 [G] 2.99 A:1736 [U] base:SC 91.33
C:14 [ARG] A:1800 [A] 4.04 A:2004 [A] 91.33
C:14 [ARG] A:1856 [A] 4.32 A:1737 [U] 91.33
C:14 [ARG] A:2004 [A] 3.76 A:1800 [A] 91.33
C:15 [ASN] A:1856 [A] 4.4 A:1737 [U] 48.55
C:15 [ASN] A:1857 [C] 3.76 A:2002 [G] 48.55
C:18 [SER] A:1612 [C] 4.6 A:1615 [G] 21.65
C:18 [SER] A:1613 [G] 4.79 21.65
C:19 [LEU] A:1612 [C] 4.15 A:1615 [G] 5.18
C:21 [PHE] A:1612 [C] 4.02 A:1615 [G] 5.2
C:21 [PHE] A:1613 [G] 4.72 5.2
C:21 [PHE] A:1614 [A] 3.84 5.2
C:27 [THR] A:1612 [C] 4.13 A:1615 [G] 7.91
C:27 [THR] A:1614 [A] 3.27 7.91
C:29 [PRO] A:1615 [G] 4.49 A:1612 [C] 51.54
C:31 [LYS] A:1469 [G] 3.54 A:1620 [G] 76.58
C:31 [LYS] A:1470 [G] 2.6 A:1619 [A] base:SC 76.58
C:31 [LYS] A:1471 [A] 3.2 A:1618 [A] sugar:SC 76.58
C:34 [LEU] A:1617 [A] 4.97 A:1472 [C] 56.18
C:35 [LYS] A:1843 [U] 3.37 3.06
C:36 [PRO] A:1616 [A] 3.7 1.58
C:36 [PRO] A:1617 [A] 4.42 A:1472 [C] 1.58
C:36 [PRO] A:1843 [U] 4.96 1.58
C:37 [LEU] A:1843 [U] 3.51 0.62
C:38 [PRO] A:737 [C] 4.83 A:815 [G] 39.13
C:38 [PRO] A:738 [U] 3.83 A:814 [A] 39.13
C:38 [PRO] A:1391 [A] 4.74 A:1414 [G] 39.13
C:39 [LYS] A:737 [C] 3.44 A:815 [G] 56.51
C:39 [LYS] A:738 [U] 3.34 A:814 [A] 56.51
C:40 [LYS] A:736 [C] 4.37 A:816 [G] 45.34
C:40 [LYS] A:737 [C] 4.84 A:815 [G] 45.34
C:40 [LYS] A:1392 [G] 4.19 A:1413 [C] 45.34
C:40 [LYS] A:1840 [U] 3.65 A:1831 [A] 45.34
C:40 [LYS] A:1841 [G] 3.79 A:1830 [A] 45.34
C:40 [LYS] A:1843 [U] 4.67 45.34
C:41 [ALA] A:736 [C] 3.15 A:816 [G] 61.42
C:41 [ALA] A:737 [C] 3.97 A:815 [G] 61.42
C:41 [ALA] A:1841 [G] 4.96 A:1830 [A] 61.42
C:42 [GLY] A:1840 [U] 3.29 A:1831 [A] 98.46
C:42 [GLY] A:1841 [G] 4.65 A:1830 [A] 98.46
C:43 [ARG] A:735 [C] 2.96 A:817 [G] base:SC, sugar:SC 95.78
C:43 [ARG] A:736 [C] 3.51 A:816 [G] 95.78
C:43 [ARG] A:817 [G] 4.13 A:735 [C] 95.78
C:43 [ARG] A:824 [A] 4.13 A:830 [U] 95.78
C:43 [ARG] A:825 [G] 4.31 A:828 [A] 95.78
C:43 [ARG] A:1840 [U] 3.66 A:1831 [A] 95.78
C:44 [ASN] A:1833 [C] 3.25 A:1838 [G] base:SC 93.69
C:44 [ASN] A:1838 [G] 4.3 A:1833 [C] 93.69
C:44 [ASN] A:1839 [G] 3.62 A:1832 [C] 93.69
C:44 [ASN] A:1840 [U] 3.81 A:1831 [A] 93.69
C:45 [ASN] A:1407 [C] 4.09 A:1398 [G] 75.5
C:45 [ASN] A:1408 [G] 3.93 75.5
C:45 [ASN] A:1833 [C] 4.91 A:1838 [G] 75.5
C:45 [ASN] A:1838 [G] 3.53 A:1833 [C] base:SC, sugar:SC 75.5
C:45 [ASN] A:1839 [G] 3.06 A:1832 [C] sugar:BB 75.5
C:46 [GLN] A:817 [G] 4.88 A:735 [C] 47.89
C:46 [GLN] A:818 [U] 3.27 A:734 [A] 47.89
C:46 [GLN] A:819 [A] 4.91 47.89
C:46 [GLN] A:1833 [C] 2.62 A:1838 [G] sugar:SC 47.89
C:46 [GLN] A:1834 [G] 3.26 A:1837 [A] sugar:SC 47.89
C:46 [GLN] A:1837 [A] 4.5 A:1834 [G] 47.89
C:46 [GLN] A:1838 [G] 4.03 A:1833 [C] 47.89
C:47 [GLY] A:817 [G] 3.86 A:735 [C] 96.24
C:47 [GLY] A:818 [U] 3.4 A:734 [A] 96.24
C:47 [GLY] A:824 [A] 4.44 A:830 [U] 96.24
C:48 [LYS] A:818 [U] 3.44 A:734 [A] 73.04
C:48 [LYS] A:819 [A] 4.58 73.04
C:48 [LYS] A:822 [G] 3.94 A:832 [C] 73.04
C:48 [LYS] A:823 [G] 2.61 A:831 [C] 73.04
C:48 [LYS] A:824 [A] 3.96 A:830 [U] 73.04
C:48 [LYS] A:1833 [C] 3.44 A:1838 [G] sugar:SC 73.04
C:48 [LYS] A:1834 [G] 4.25 A:1837 [A] 73.04
C:49 [LEU] A:824 [A] 3.19 A:830 [U] 91.33
C:49 [LEU] A:825 [G] 3.79 A:828 [A] 91.33
C:49 [LEU] A:1832 [C] 4.69 A:1839 [G] 91.33
C:50 [THR] A:1832 [C] 2.99 A:1839 [G] sugar:BB 86.39
C:50 [THR] A:1833 [C] 3.73 A:1838 [G] 86.39
C:50 [THR] A:1839 [G] 3.62 A:1832 [C] 86.39
C:50 [THR] A:1840 [U] 3.12 A:1831 [A] base:SC 86.39
C:51 [VAL] A:1831 [A] 3.95 A:1840 [U] 81.33
C:51 [VAL] A:1832 [C] 4.98 A:1839 [G] 81.33
C:51 [VAL] A:1840 [U] 3.37 A:1831 [A] 81.33
C:51 [VAL] A:1841 [G] 3.77 A:1830 [A] 81.33
C:52 [ARG] A:1850 [G] 4.19 A:1823 [U] 77.45
C:52 [ARG] A:1851 [G] 2.94 A:1822 [C] 77.45
C:52 [ARG] A:1852 [G] 3.14 A:1821 [U] 77.45
C:53 [HIS] A:1851 [G] 3.12 A:1822 [C] 78.97
C:54 [HIS] A:1841 [G] 3.7 A:1830 [A] 80.65
C:54 [HIS] A:1842 [A] 3.65 A:1829 [A] 80.65
C:54 [HIS] A:1849 [G] 4.1 A:1824 [C] 80.65
C:54 [HIS] A:1850 [G] 2.91 A:1823 [U] 80.65
C:55 [GLY] A:736 [C] 4.4 A:816 [G] 87.14
C:55 [GLY] A:737 [C] 3.49 A:815 [G] 87.14
C:56 [GLY] A:736 [C] 4.36 A:816 [G] 77.36
C:56 [GLY] A:737 [C] 3.03 A:815 [G] 77.36
C:57 [GLY] A:737 [C] 4.9 A:815 [G] 84.04
C:58 [HIS] A:1473 [G] 4.57 A:1611 [C] 59.29
C:58 [HIS] A:1613 [G] 3.5 59.29
C:58 [HIS] A:1614 [A] 3.44 59.29
C:58 [HIS] A:1615 [G] 3.39 A:1612 [C] 59.29
C:59 [LYS] A:739 [U] 3.05 A:813 [G] 79.7
C:59 [LYS] A:1614 [A] 3.72 79.7
C:59 [LYS] A:1615 [G] 3.33 A:1612 [C] 79.7
C:59 [LYS] A:1616 [A] 2.94 sugar:SC 79.7
C:60 [ARG] A:1614 [A] 3.22 65.11
C:60 [ARG] A:1615 [G] 3.49 A:1612 [C] 65.11
C:61 [GLN] A:1615 [G] 2.87 A:1612 [C] 35.76
C:61 [GLN] A:1616 [A] 3.34 35.76
C:61 [GLN] A:1617 [A] 3.3 A:1472 [C] 35.76
C:62 [TYR] A:1843 [U] 3.37 base/AA stacks 47.01
C:62 [TYR] A:1844 [G] 2.73 A:1827 [C] 47.01
C:63 [ARG] A:1614 [A] 3.19 sugar:SC 89.0
C:63 [ARG] A:1615 [G] 2.93 A:1612 [C] 89.0
C:67 [PHE] A:1844 [G] 3.95 A:1827 [C] 59.0
C:67 [PHE] A:1845 [U] 4.75 A:1826 [G] 59.0
C:68 [LYS] A:2232 [A] 4.46 A:2246 [U] 26.37
C:68 [LYS] A:2233 [C] 3.96 A:2245 [G] 26.37
C:71 [LYS] A:1533 [A] 2.91 base:SC 42.59
C:74 [ILE] A:1533 [A] 3.31 46.33
C:77 [LYS] A:1544 [G] 4.34 A:1531 [U] 45.86
C:77 [LYS] A:1545 [U] 2.9 A:1530 [A] 45.86
C:83 [TYR] A:1612 [C] 4.42 A:1615 [G] 78.7
C:83 [TYR] A:1613 [G] 4.7 78.7
C:83 [TYR] A:1614 [A] 3.12 base/AA stacks 78.7
C:85 [PRO] A:1614 [A] 3.63 78.33
C:85 [PRO] A:1615 [G] 3.9 A:1612 [C] 78.33
C:86 [ASN] A:1844 [G] 3.98 A:1827 [C] 73.82
C:87 [ARG] A:1844 [G] 2.86 A:1827 [C] 86.9
C:87 [ARG] A:1845 [U] 3.87 A:1826 [G] 86.9
C:88 [SER] A:1845 [U] 4.5 A:1826 [G] 77.5
C:88 [SER] A:1847 [U] 4.22 77.5
C:88 [SER] A:1848 [A] 4.91 A:1825 [U] 77.5
C:95 [VAL] A:1543 [G] 4.41 A:1532 [U] 30.15
C:95 [VAL] A:1544 [G] 4.03 A:1531 [U] 30.15
C:96 [TYR] A:1533 [A] 3.45 53.15
C:96 [TYR] A:1544 [G] 4.4 A:1531 [U] 53.15
C:97 [ALA] A:1533 [A] 4.55 32.74
C:97 [ALA] A:1543 [G] 3.95 A:1532 [U] base:BB 32.74
C:97 [ALA] A:1544 [G] 3.69 A:1531 [U] 32.74
C:98 [ASP] A:1533 [A] 2.48 base/AA stacks 75.25
C:98 [ASP] A:1534 [G] 3.41 A:1542 [C] 75.25
C:98 [ASP] A:1543 [G] 2.69 A:1532 [U] base:BB 75.25
C:98 [ASP] A:1544 [G] 4.95 A:1531 [U] 75.25
C:99 [GLY] A:1543 [G] 3.14 A:1532 [U] sugar:BB 61.99
C:99 [GLY] A:1544 [G] 3.88 A:1531 [U] 61.99
C:100 [GLU] A:1533 [A] 3.58 28.81
C:101 [LYS] A:1543 [G] 4.73 A:1532 [U] 0.32
C:147 [LYS] A:1828 [U] 4.41 11.59
C:147 [LYS] A:2229 [C] 3.85 A:2248 [G] 11.59
C:147 [LYS] A:2230 [G] 4.83 11.59
C:147 [LYS] A:2231 [C] 2.81 A:2247 [G] 11.59
C:148 [PRO] A:2232 [A] 3.68 A:2246 [U] 76.77
C:148 [PRO] A:2248 [G] 4.53 A:2229 [C] 76.77
C:149 [GLY] A:2232 [A] 3.3 A:2246 [U] 60.64
C:150 [LYS] A:1828 [U] 2.8 54.41
C:150 [LYS] A:2230 [G] 3.98 54.41
C:150 [LYS] A:2231 [C] 2.84 A:2247 [G] 54.41
C:150 [LYS] A:2232 [A] 3.27 A:2246 [U] 54.41
C:153 [GLN] A:1826 [G] 4.36 A:1845 [U] 68.8
C:153 [GLN] A:1827 [C] 2.57 A:1844 [G] sugar:SC 68.8
C:153 [GLN] A:1828 [U] 3.33 68.8
C:153 [GLN] A:1845 [U] 2.5 A:1826 [G] base:SC, sugar:BB 68.8
C:154 [ILE] A:1826 [G] 3.41 A:1845 [U] 48.8
C:154 [ILE] A:1845 [U] 3.37 A:1826 [G] 48.8
C:154 [ILE] A:1846 [A] 4.16 48.8
C:155 [ALA] A:1826 [G] 4.63 A:1845 [U] 68.44
C:155 [ALA] A:1845 [U] 3.42 A:1826 [G] 68.44
C:155 [ALA] A:1846 [A] 3.36 68.44
C:156 [ARG] A:1843 [U] 4.82 92.8
C:156 [ARG] A:1844 [G] 2.74 A:1827 [C] 92.8
C:156 [ARG] A:1845 [U] 2.66 A:1826 [G] 92.8
C:156 [ARG] A:1846 [A] 3.35 92.8
C:157 [SER] A:1845 [U] 3.66 A:1826 [G] 85.25
C:157 [SER] A:1846 [A] 3.37 85.25
C:157 [SER] A:1847 [U] 2.98 sugar:SC 85.25
C:157 [SER] A:1848 [A] 4.13 A:1825 [U] 85.25
C:158 [ALA] A:1847 [U] 2.96 sugar:BB 88.0
C:159 [GLY] A:1847 [U] 3.72 95.92
C:160 [ALA] A:1846 [A] 3.81 77.41
C:170 [LYS] A:2249 [G] 3.13 A:2228 [C] 37.19
C:170 [LYS] A:2250 [A] 2.84 A:2227 [C] 37.19
C:171 [TYR] A:2249 [G] 3.8 A:2228 [C] 10.0
C:171 [TYR] A:2250 [A] 2.99 A:2227 [C] 10.0
C:176 [LEU] A:1826 [G] 3.63 A:1845 [U] 80.55
C:177 [ARG] A:1826 [G] 4.05 A:1845 [U] 75.08
C:177 [ARG] A:1846 [A] 3.74 75.08
C:177 [ARG] A:1847 [U] 3.17 75.08
C:178 [SER] A:1826 [G] 2.67 A:1845 [U] base:SC, base:BB, base:SC 99.0
C:178 [SER] A:1846 [A] 3.5 99.0
C:180 [GLU] A:1826 [G] 2.37 A:1845 [U] sugar:SC 79.15
C:182 [ARG] A:1826 [G] 3.11 A:1845 [U] sugar:SC 64.25
C:182 [ARG] A:1827 [C] 2.42 A:1844 [G] 64.25
C:185 [LEU] A:2249 [G] 4.42 A:2228 [C] 63.51
C:194 [GLN] A:1847 [U] 4.56 36.14
C:197 [ASN] A:1847 [U] 4.0 86.26
C:198 [LEU] A:1847 [U] 2.69 base:BB 27.55
C:199 [GLN] A:1847 [U] 4.39 62.1
C:200 [HIS] A:1847 [U] 3.68 57.58
C:200 [HIS] A:1848 [A] 3.71 A:1825 [U] 57.58
C:201 [GLU] A:1847 [U] 2.89 base:BB 2.82
C:203 [VAL] A:1819 [G] 4.0 A:1854 [U] 45.21
C:204 [ASN] A:1818 [A] 3.0 A:1855 [G] sugar:SC 52.57
C:204 [ASN] A:1819 [G] 3.09 A:1854 [U] 52.57
C:205 [VAL] A:1818 [A] 3.36 A:1855 [G] 51.9
C:205 [VAL] A:1819 [G] 3.11 A:1854 [U] 51.9
C:206 [GLY] A:1818 [A] 2.99 A:1855 [G] sugar:BB 52.52
C:206 [GLY] A:1819 [G] 4.69 A:1854 [U] 52.52
C:207 [LYS] A:774 [G] 2.98 A:1801 [C] sugar:SC 90.77
C:207 [LYS] A:809 [A] 3.21 A:1802 [U] 90.77
C:207 [LYS] A:1817 [C] 4.4 90.77
C:207 [LYS] A:1818 [A] 3.81 A:1855 [G] 90.77
C:208 [ALA] A:774 [G] 3.29 A:1801 [C] base:BB 98.92
C:208 [ALA] A:809 [A] 3.61 A:1802 [U] 98.92
C:208 [ALA] A:1817 [C] 3.37 98.92
C:208 [ALA] A:1818 [A] 4.13 A:1855 [G] 98.92
C:209 [GLY] A:774 [G] 3.14 A:1801 [C] base:BB 93.93
C:209 [GLY] A:809 [A] 3.5 A:1802 [U] 93.93
C:210 [ARG] A:1612 [C] 4.87 A:1615 [G] 53.72
C:210 [ARG] A:1613 [G] 2.58 53.72
C:211 [SER] A:1818 [A] 3.34 A:1855 [G] 65.94
C:212 [ARG] A:736 [C] 4.22 A:816 [G] 79.81
C:212 [ARG] A:809 [A] 2.99 A:1802 [U] base:SC 79.81
C:212 [ARG] A:826 [A] 3.89 79.81
C:213 [TRP] A:809 [A] 3.16 A:1802 [U] 26.55
C:213 [TRP] A:1613 [G] 3.39 base/AA stacks 26.55
C:214 [LYS] A:1613 [G] 4.66 33.64
C:217 [ARG] A:735 [C] 3.54 A:817 [G] 83.87
C:217 [ARG] A:736 [C] 2.88 A:816 [G] 83.87
C:217 [ARG] A:825 [G] 3.53 A:828 [A] 83.87
C:217 [ARG] A:826 [A] 2.62 83.87
C:218 [PRO] A:809 [A] 4.12 A:1802 [U] 92.46
C:218 [PRO] A:826 [A] 3.58 92.46
C:218 [PRO] A:1816 [A] 3.32 92.46
C:218 [PRO] A:1817 [C] 4.07 92.46
C:219 [THR] A:1816 [A] 3.2 58.8
C:219 [THR] A:1817 [C] 3.29 58.8
C:220 [VAL] A:826 [A] 4.62 91.6
C:220 [VAL] A:827 [A] 3.36 91.6
C:220 [VAL] A:1815 [C] 4.22 A:1803 [G] 91.6
C:220 [VAL] A:1816 [A] 3.49 91.6
C:221 [ARG] A:1815 [C] 3.16 A:1803 [G] 94.76
C:221 [ARG] A:1816 [A] 2.58 94.76
C:221 [ARG] A:1853 [C] 3.33 A:1820 [G] 94.76
C:221 [ARG] A:1854 [U] 2.83 A:1819 [G] 94.76
C:221 [ARG] A:1855 [G] 3.2 A:1818 [A] base:SC 94.76
C:222 [GLY] A:1852 [G] 4.75 A:1821 [U] 93.61
C:222 [GLY] A:1853 [C] 3.35 A:1820 [G] 93.61
C:223 [SER] A:1853 [C] 3.09 A:1820 [G] 75.6
C:223 [SER] A:1854 [U] 3.88 A:1819 [G] 75.6
C:224 [VAL] A:827 [A] 3.26 91.89
C:224 [VAL] A:828 [A] 3.69 A:825 [G] 91.89
C:224 [VAL] A:1815 [C] 3.68 A:1803 [G] 91.89
C:224 [VAL] A:1816 [A] 4.64 91.89
C:225 [MET] A:827 [A] 3.37 90.36
C:226 [ASN] A:828 [A] 4.26 A:825 [G] 95.46
C:226 [ASN] A:829 [U] 3.09 sugar:SC 95.46
C:227 [PRO] A:2100 [C] 3.65 A:2463 [G] 88.54
C:227 [PRO] A:2101 [U] 3.9 A:2462 [A] 88.54
C:227 [PRO] A:2625 [A] 3.77 A:2622 [G] 88.54
C:227 [PRO] A:2626 [G] 4.4 A:2621 [C] 88.54
C:228 [ASN] A:829 [U] 3.36 base/AA stacks 76.97
C:228 [ASN] A:830 [U] 4.87 A:824 [A] 76.97
C:228 [ASN] A:838 [A] 3.88 76.97
C:228 [ASN] A:2100 [C] 4.68 A:2463 [G] 76.97
C:229 [ASP] A:824 [A] 4.64 A:830 [U] 89.53
C:229 [ASP] A:825 [G] 3.33 A:828 [A] base:SC 89.53
C:229 [ASP] A:827 [A] 4.14 89.53
C:229 [ASP] A:830 [U] 4.93 A:824 [A] 89.53
C:230 [HIS] A:1852 [G] 3.02 A:1821 [U] 98.65
C:231 [PRO] A:2266 [G] 4.54 A:2108 [U] 97.2
C:232 [HIS] A:1852 [G] 3.48 A:1821 [U] 88.41
C:232 [HIS] A:1853 [C] 3.43 A:1820 [G] 88.41
C:233 [GLY] A:2625 [A] 4.26 A:2622 [G] 96.32
C:234 [GLY] A:2625 [A] 3.71 A:2622 [G] 94.52
C:234 [GLY] A:2626 [G] 3.05 A:2621 [C] 94.52
C:235 [GLY] A:2625 [A] 3.49 A:2622 [G] 84.98
C:235 [GLY] A:2626 [G] 2.86 A:2621 [C] 84.98
C:236 [GLU] A:2617 [A] 4.02 A:2631 [U] 77.44
C:236 [GLU] A:2619 [G] 4.51 A:2628 [C] 77.44
C:236 [GLU] A:2620 [U] 3.6 A:2627 [A] 77.44
C:236 [GLU] A:2621 [C] 4.25 A:2626 [G] 77.44
C:236 [GLU] A:2626 [G] 2.79 A:2621 [C] base:BB 77.44
C:236 [GLU] A:2627 [A] 2.35 A:2620 [U] base:SC 77.44
C:236 [GLU] A:2628 [C] 4.6 A:2619 [G] 77.44
C:237 [GLY] A:2617 [A] 3.36 A:2631 [U] 84.2
C:237 [GLY] A:2618 [C] 4.14 A:2630 [G] 84.2
C:238 [ARG] A:1814 [A] 4.33 A:1804 [U] 72.95
C:238 [ARG] A:1815 [C] 4.16 A:1803 [G] 72.95
C:238 [ARG] A:1998 [A] 3.13 72.95
C:238 [ARG] A:1999 [G] 3.83 A:1860 [C] 72.95
C:238 [ARG] A:2617 [A] 3.56 A:2631 [U] 72.95
C:238 [ARG] A:2618 [C] 3.15 A:2630 [G] 72.95
C:239 [ALA] A:1998 [A] 3.75 74.78
C:239 [ALA] A:2625 [A] 4.55 A:2622 [G] 74.78
C:240 [PRO] A:1930 [G] 3.43 A:1864 [C] 69.54
C:240 [PRO] A:1998 [A] 3.84 69.54
C:240 [PRO] A:2624 [G] 4.98 69.54
C:241 [ILE] A:1852 [G] 4.32 A:1821 [U] 51.51
C:241 [ILE] A:1853 [C] 4.28 A:1820 [G] 51.51
C:241 [ILE] A:1929 [C] 2.6 A:1867 [G] 51.51
C:241 [ILE] A:1930 [G] 2.68 A:1864 [C] 51.51
C:242 [GLY] A:1929 [C] 4.8 A:1867 [G] 83.55
C:242 [GLY] A:1930 [G] 4.0 A:1864 [C] 83.55
C:242 [GLY] A:2623 [U] 3.09 sugar:BB 83.55
C:242 [GLY] A:2624 [G] 3.72 83.55
C:243 [ARG] A:1929 [C] 2.58 A:1867 [G] sugar:BB 72.59
C:243 [ARG] A:2102 [U] 3.46 72.59
C:243 [ARG] A:2265 [G] 4.7 72.59
C:243 [ARG] A:2266 [G] 2.75 A:2108 [U] 72.59
C:244 [PRO] A:1868 [U] 4.15 A:1928 [A] 67.46
C:244 [PRO] A:1869 [G] 4.02 A:1925 [U] 67.46
C:244 [PRO] A:1928 [A] 4.37 A:1868 [U] 67.46
C:244 [PRO] A:1929 [C] 3.01 A:1867 [G] 67.46
C:245 [SER] A:1869 [G] 3.56 A:1925 [U] 59.51
C:245 [SER] A:1929 [C] 4.75 A:1867 [G] 59.51
C:246 [PRO] A:1852 [G] 3.74 A:1821 [U] 75.67
C:246 [PRO] A:1928 [A] 3.49 A:1868 [U] 75.67
C:246 [PRO] A:1929 [C] 4.68 A:1867 [G] 75.67
C:247 [MET] A:1851 [G] 4.85 A:1822 [C] 71.27
C:247 [MET] A:1852 [G] 3.66 A:1821 [U] 71.27
C:247 [MET] A:2266 [G] 4.61 A:2108 [U] 71.27
C:248 [SER] A:1851 [G] 4.13 A:1822 [C] 80.69
C:248 [SER] A:1852 [G] 4.69 A:1821 [U] 80.69
C:249 [PRO] A:1851 [G] 3.38 A:1822 [C] 72.08
C:249 [PRO] A:1852 [G] 3.43 A:1821 [U] 72.08
C:250 [TRP] A:1831 [A] 3.87 A:1840 [U] 48.99
C:250 [TRP] A:1832 [C] 3.53 A:1839 [G] 48.99
C:250 [TRP] A:1833 [C] 4.03 A:1838 [G] 48.99
C:250 [TRP] A:1851 [G] 4.11 A:1822 [C] 48.99
C:250 [TRP] A:2266 [G] 4.46 A:2108 [U] 48.99
C:251 [GLY] A:2266 [G] 3.7 A:2108 [U] 90.9
C:252 [LYS] A:1831 [A] 4.93 A:1840 [U] 62.11
C:252 [LYS] A:1832 [C] 3.34 A:1839 [G] 62.11
C:254 [THR] A:1823 [U] 3.67 A:1850 [G] 71.79
C:254 [THR] A:1850 [G] 4.3 A:1823 [U] 71.79
C:254 [THR] A:1851 [G] 2.78 A:1822 [C] sugar:SC 71.79
C:254 [THR] A:1852 [G] 3.68 A:1821 [U] 71.79
C:255 [LEU] A:1822 [C] 3.59 A:1851 [G] 62.43
C:255 [LEU] A:1823 [U] 3.6 A:1850 [G] 62.43
C:255 [LEU] A:1851 [G] 3.96 A:1822 [C] 62.43
C:255 [LEU] A:1852 [G] 4.77 A:1821 [U] 62.43
C:255 [LEU] A:1870 [C] 4.4 A:1924 [G] 62.43
C:255 [LEU] A:1928 [A] 3.53 A:1868 [U] 62.43
C:256 [GLY] A:1823 [U] 2.61 A:1850 [G] sugar:BB 86.61
C:256 [GLY] A:1824 [C] 4.11 A:1849 [G] 86.61
C:256 [GLY] A:1870 [C] 2.87 A:1924 [G] 86.61
C:256 [GLY] A:1871 [U] 3.56 A:1923 [A] 86.61
C:257 [LYS] A:1823 [U] 4.41 A:1850 [G] 0.13
C:257 [LYS] A:1824 [C] 3.42 A:1849 [G] 0.13
C:257 [LYS] A:1870 [C] 3.62 A:1924 [G] 0.13
C:257 [LYS] A:1871 [U] 3.98 A:1923 [A] 0.13
C:258 [LYS] A:1824 [C] 3.81 A:1849 [G] 64.01
C:258 [LYS] A:1825 [U] 3.78 A:1848 [A] 64.01
C:258 [LYS] A:1870 [C] 4.67 A:1924 [G] 64.01
C:258 [LYS] A:1871 [U] 3.59 A:1923 [A] 64.01
C:258 [LYS] A:1872 [G] 3.85 A:1922 [C] 64.01
C:259 [THR] A:1824 [C] 2.16 A:1849 [G] sugar:SC 88.91
C:259 [THR] A:1825 [U] 3.4 A:1848 [A] 88.91
C:259 [THR] A:1830 [A] 3.17 A:1841 [G] sugar:SC 88.91
C:259 [THR] A:1831 [A] 3.65 A:1840 [U] 88.91
C:260 [ARG] A:1824 [C] 4.77 A:1849 [G] 72.71
C:260 [ARG] A:1825 [U] 3.69 A:1848 [A] 72.71
C:260 [ARG] A:1826 [G] 2.57 A:1845 [U] 72.71
C:260 [ARG] A:1827 [C] 3.19 A:1844 [G] 72.71
C:261 [ARG] A:1830 [A] 3.4 A:1841 [G] 45.46
C:261 [ARG] A:1831 [A] 2.88 A:1840 [U] 45.46
C:261 [ARG] A:2112 [C] 4.82 A:2261 [G] 45.46
C:263 [LYS] A:2113 [U] 3.06 A:2260 [A] 52.9
C:263 [LYS] A:2114 [G] 4.2 A:2259 [C] 52.9
C:263 [LYS] A:2254 [A] 4.3 A:2119 [U] 52.9
C:263 [LYS] A:2255 [G] 4.59 A:2118 [U] 52.9
C:264 [LYS] A:1827 [C] 3.35 A:1844 [G] 74.16
C:264 [LYS] A:1829 [A] 4.81 A:1842 [A] 74.16
C:265 [SER] A:2250 [A] 4.35 A:2227 [C] 10.7
C:266 [SER] A:1826 [G] 4.52 A:1845 [U] 66.4
C:266 [SER] A:1827 [C] 3.4 A:1844 [G] 66.4
C:268 [LYS] A:2250 [A] 4.81 A:2227 [C] 46.65
C:268 [LYS] A:2251 [G] 3.26 A:2226 [A] 46.65
C:270 [ILE] A:1826 [G] 3.86 A:1845 [U] 78.38
C:270 [ILE] A:1827 [C] 4.8 A:1844 [G] 78.38
C:274 [ARG] A:1846 [A] 4.68 62.42
C:275 [LYS] A:1824 [C] 4.89 A:1849 [G] 63.31
C:275 [LYS] A:1825 [U] 2.7 A:1848 [A] 63.31
C:275 [LYS] A:1826 [G] 4.25 A:1845 [U] 63.31
C:275 [LYS] A:1846 [A] 3.87 63.31

logo_download Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

Properties of this interface

Interolog group ID Structure ID Structure description
 UniProt ID
 		ECOD label(s)
 		RFAM label(s)
 		Is ribosome? RCSB PDB link
group131 6S0Z_C_A C: 50s ribosomal protein l2, Staphylococcus aureus (natural) A: 23s ribosomal RNA, Staphylococcus aureus (natural) B3VKN3 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA ✔

Interologs

Total number of interologs for this interface: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6S0Z_C_A 7K00_c_a 0.85 0.98 1.04 0.61 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7RYG_C_A 0.86 0.98 1.12 0.6 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 6YSI_A_1 0.86 0.98 0.99 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7OF0_D_A 0.68 0.95 2.97 0.33 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1D_1A 6S0Z_C_A 0.86 0.97 1.58 0.66 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7O7Y_BA_B5 0.58 0.88 3.94 0.25 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6S0Z_C_A 0.59 0.93 3.61 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6S0Z_C_A 0.58 0.93 3.7 0.25 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 6S0Z_C_A 0.60 0.77 3.89 0.24 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_3 6S0Z_C_A 0.39 0.72 3.6 0.09 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6S0Z_C_A 0.59 0.93 3.59 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare