RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group8 > 3IEV_A_D vs 3R9W_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

3IEV_A
3IEV_D
3R9W_A
3R9W_B
Conserved?
A:245 [LYS] D:1533 [C] A:245 [LYS] B:1533 [C] ✔
A:245 [LYS] D:1534 [A] A:245 [LYS] B:1534 [A] ✔
A:210 [VAL] D:1531 [A] A:210 [VAL] B:1531 [A] ✔
A:255 [ARG] D:1531 [A] A:255 [ARG] B:1531 [A] ✔
A:255 [ARG] D:1532 [U] A:255 [ARG] B:1532 [U] ✔
A:222 [LYS] D:1538 [C] A:222 [LYS] B:1538 [C] ✔
A:280 [TRP] D:1534 [A] A:280 [TRP] B:1534 [A] ✔
A:280 [TRP] D:1535 [C] A:280 [TRP] B:1535 [C] ✔
A:279 [LEU] D:1534 [A] A:279 [LEU] B:1534 [A] ✔
A:279 [LEU] D:1535 [C] A:279 [LEU] B:1535 [C] ✔
A:227 [ASN] D:1538 [C] A:227 [ASN] B:1538 [C] ✔
A:256 [LEU] D:1534 [A] A:256 [LEU] B:1534 [A] ✔
A:256 [LEU] D:1535 [C] A:256 [LEU] B:1535 [C] ✔
A:253 [GLY] D:1534 [A] A:253 [GLY] B:1534 [A] ✔
A:253 [GLY] D:1535 [C] A:253 [GLY] B:1535 [C] ✔
A:249 [ILE] D:1533 [C] A:249 [ILE] B:1533 [C] ✔
A:249 [ILE] D:1534 [A] A:249 [ILE] B:1534 [A] ✔
A:207 [ARG] D:1531 [A] A:207 [ARG] B:1531 [A] ✔
A:268 [GLU] D:1537 [U] A:268 [GLU] B:1537 [U] ✔
A:250 [GLY] D:1532 [U] A:250 [GLY] B:1532 [U] ✔
A:250 [GLY] D:1533 [C] A:250 [GLY] B:1533 [C] ✔
A:226 [ALA] D:1538 [C] A:226 [ALA] B:1538 [C] ✔
A:226 [ALA] D:1539 [C] A:226 [ALA] B:1539 [C] ✔
A:264 [ARG] D:1536 [C] A:264 [ARG] B:1536 [C] ✔
A:264 [ARG] D:1537 [U] A:264 [ARG] B:1537 [U] ✔
A:206 [THR] D:1531 [A] A:206 [THR] B:1531 [A] ✔
A:281 [VAL] D:1534 [A] A:281 [VAL] B:1534 [A] ✔
A:278 [GLU] D:1537 [U] A:278 [GLU] B:1537 [U] ✔
A:224 [GLY] D:1538 [C] A:224 [GLY] B:1538 [C] ✔
A:275 [VAL] D:1537 [U] A:275 [VAL] B:1537 [U] ✔
A:246 [PRO] D:1531 [A] A:246 [PRO] B:1531 [A] ✔
A:246 [PRO] D:1532 [U] A:246 [PRO] B:1532 [U] ✔
A:246 [PRO] D:1533 [C] A:246 [PRO] B:1533 [C] ✔
A:232 [VAL] D:1538 [C] A:232 [VAL] B:1538 [C] ✔
A:205 [LEU] D:1531 [A] A:205 [LEU] B:1531 [A] ✔
A:247 [ILE] D:1531 [A] A:247 [ILE] B:1531 [A] ✔
A:276 [TYR] D:1537 [U] A:276 [TYR] B:1537 [U] ✔
A:276 [TYR] D:1538 [C] A:276 [TYR] B:1538 [C] ✔
A:225 [ASP] D:1538 [C] A:225 [ASP] B:1538 [C] ✔
A:225 [ASP] D:1539 [C] A:225 [ASP] B:1539 [C] ✔
A:242 [GLU] D:1533 [C] A:242 [GLU] B:1533 [C] ✔
A:277 [LEU] D:1536 [C] A:277 [LEU] B:1536 [C] ✔
A:277 [LEU] D:1537 [U] A:277 [LEU] B:1537 [U] ✔
A:252 [LYS] D:1534 [A] A:252 [LYS] B:1534 [A] ✔
A:252 [LYS] D:1535 [C] A:252 [LYS] B:1535 [C] ✔
A:260 [GLY] D:1536 [C] A:260 [GLY] B:1536 [C] ✔
A:257 [LYS] D:1535 [C] A:257 [LYS] B:1535 [C] ✔
A:257 [LYS] D:1536 [C] A:257 [LYS] B:1536 [C] ✔
A:251 [LYS] D:1532 [U] A:251 [LYS] B:1532 [U] ✔
A:251 [LYS] D:1533 [C] A:251 [LYS] B:1533 [C] ✔
A:208 [GLU] D:1531 [A] A:208 [GLU] B:1531 [A] ✔
A:230 [MET] D:1537 [U] A:230 [MET] B:1537 [U] ✔
A:230 [MET] D:1538 [C] A:230 [MET] B:1538 [C] ✔
A:261 [LYS] D:1536 [C] A:261 [LYS] B:1536 [C] ✔
A:254 [GLN] D:1531 [A] A:254 [GLN] B:1531 [A] ❌ 3R9W_A_B
A:254 [GLN] D:1532 [U] A:254 [GLN] B:1532 [U] ❌ 3R9W_A_B
A:278 [GLU] D:1538 [C] A:278 [GLU] B:1538 [C] ❌ 3R9W_A_B
A:278 [GLU] D:1539 [C] A:278 [GLU] B:1539 [C] ❌ 3R9W_A_B
A:276 [TYR] D:1539 [C] A:276 [TYR] B:1539 [C] ❌ 3R9W_A_B
A:251 [LYS] D:1531 [A] A:251 [LYS] B:1531 [A] ❌ 3IEV_A_D
A:252 [LYS] D:1533 [C] A:252 [LYS] B:1533 [C] ❌ 3IEV_A_D
A:254 [GLN] D:1535 [C] A:254 [GLN] B:1535 [C] ❌ 3IEV_A_D
A:254 [GLN] D:1536 [C] A:254 [GLN] B:1536 [C] ❌ 3IEV_A_D
A:234 [LYS] D:1538 [C] A:234 [LYS] B:1538 [C] ❌ 3R9W_A:234 no longer at interface
A:223 [PRO] D:1538 [C] A:223 [PRO] B:1538 [C] ❌ 3R9W_A:223 no longer at interface
A:209 [GLU] D:1531 [A] A:209 [GLU] B:1531 [A] ❌ 3IEV_A:209 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II) 0.99 0.63 0.95 0.99 0.32 0.95 1.0 0.97 0.95 0.58 0.25


Other pairs involving 3IEV_A_D or 3R9W_A_B

Total number of entries: 1

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
3IEV_A_D 3R9W_A_B 0.97 0.99 0.63 0.95 Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II) compare