RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group125 > 4OO8_A_B vs 7EL1_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4OO8_A
4OO8_B
7EL1_A
7EL1_B
Conserved?
A:1112 [PRO] B:23 [U] A:790 [SER] B:23 [U] ✔
A:1112 [PRO] B:24 [U] A:790 [SER] B:24 [U] ✔
A:69 [ARG] B:51 [A] A:54 [ARG] B:55 [A] ✔
A:69 [ARG] B:62 [G] A:54 [ARG] B:68 [G] ✔
A:69 [ARG] B:63 [U] A:54 [ARG] B:69 [U] ✔
A:447 [ARG] B:16 [U] A:208 [ARG] B:16 [U] ✔
A:447 [ARG] B:17 [U] A:208 [ARG] B:17 [U] ✔
A:522 [ASN] B:4 [A] A:260 [ASN] B:4 [A] ✔
A:135 [ILE] B:45 [U] A:88 [PRO] B:49 [U] ✔
A:135 [ILE] B:46 [A] A:88 [PRO] B:50 [A] ✔
A:61 [ALA] B:63 [U] A:46 [GLY] B:69 [U] ✔
A:166 [GLY] B:17 [U] A:117 [GLY] B:17 [U] ✔
A:166 [GLY] B:18 [G] A:117 [GLY] B:18 [G] ✔
A:166 [GLY] B:19 [G] A:117 [GLY] B:19 [G] ✔
A:694 [MET] B:2 [G] A:415 [ILE] B:2 [G] ✔
A:694 [MET] B:3 [A] A:415 [ILE] B:3 [A] ✔
A:163 [LYS] B:19 [G] A:114 [LYS] B:19 [G] ✔
A:163 [LYS] B:47 [A] A:114 [LYS] B:51 [A] ✔
A:163 [LYS] B:48 [A] A:114 [LYS] B:52 [A] ✔
A:1172 [SER] B:52 [A] A:934 [ILE] B:56 [A] ✔
A:742 [LYS] B:66 [U] A:459 [LYS] B:72 [U] ✔
A:742 [LYS] B:67 [C] A:459 [LYS] B:73 [U] ✔
A:136 [TYR] B:45 [U] A:89 [TYR] B:49 [U] ✔
A:136 [TYR] B:46 [A] A:89 [TYR] B:50 [A] ✔
A:62 [THR] B:63 [U] A:47 [ARG] B:69 [U] ✔
A:62 [THR] B:64 [U] A:47 [ARG] B:70 [G] ✔
A:453 [GLY] B:15 [C] A:214 [GLY] B:15 [C] ✔
A:453 [GLY] B:16 [U] A:214 [GLY] B:16 [U] ✔
A:74 [ARG] B:16 [U] A:59 [ARG] B:16 [U] ✔
A:74 [ARG] B:17 [U] A:59 [ARG] B:17 [U] ✔
A:74 [ARG] B:59 [U] A:59 [ARG] B:65 [G] ✔
A:74 [ARG] B:60 [C] A:59 [ARG] B:66 [C] ✔
A:588 [ASN] B:6 [U] A:322 [GLU] B:6 [U] ✔
A:464 [TRP] B:14 [G] A:223 [TRP] B:14 [G] ✔
A:464 [TRP] B:15 [C] A:223 [TRP] B:15 [C] ✔
A:63 [ARG] B:13 [C] A:48 [ARG] B:13 [C] ✔
A:63 [ARG] B:14 [G] A:48 [ARG] B:14 [G] ✔
A:63 [ARG] B:15 [C] A:48 [ARG] B:15 [C] ✔
A:66 [ARG] B:14 [G] A:51 [ARG] B:14 [G] ✔
A:66 [ARG] B:15 [C] A:51 [ARG] B:15 [C] ✔
A:66 [ARG] B:62 [G] A:51 [ARG] B:68 [G] ✔
A:929 [LYS] B:1 [G] A:654 [ARG] B:1 [G] ✔
A:929 [LYS] B:2 [G] A:654 [ARG] B:2 [G] ✔
A:75 [ARG] B:50 [U] A:60 [ARG] B:54 [C] ✔
A:662 [LEU] B:4 [A] A:395 [LEU] B:4 [A] ✔
A:160 [HIS] B:45 [U] A:111 [HIS] B:49 [U] ✔
A:160 [HIS] B:46 [A] A:111 [HIS] B:50 [A] ✔
A:160 [HIS] B:47 [A] A:111 [HIS] B:51 [A] ✔
A:1132 [GLY] B:23 [U] A:904 [VAL] B:23 [U] ✔
A:1132 [GLY] B:24 [U] A:904 [VAL] B:24 [U] ✔
A:451 [TYR] B:15 [C] A:212 [TYR] B:15 [C] ✔
A:401 [LYS] B:44 [U] A:163 [GLU] B:48 [C] ✔
A:401 [LYS] B:45 [U] A:163 [GLU] B:49 [U] ✔
A:405 [PHE] B:19 [G] A:167 [SER] B:19 [G] ✔
A:405 [PHE] B:20 [C] A:167 [SER] B:20 [C] ✔
A:523 [GLU] B:5 [A] A:261 [ASP] B:5 [A] ✔
A:450 [TYR] B:14 [G] A:211 [TYR] B:14 [G] ✔
A:450 [TYR] B:15 [C] A:211 [TYR] B:15 [C] ✔
A:450 [TYR] B:16 [U] A:211 [TYR] B:16 [U] ✔
A:407 [ASN] B:19 [G] A:169 [ASN] B:19 [G] ✔
A:407 [ASN] B:20 [C] A:169 [ASN] B:20 [C] ✔
A:454 [PRO] B:15 [C] A:215 [PRO] B:15 [C] ✔
A:454 [PRO] B:16 [U] A:215 [PRO] B:16 [U] ✔
A:454 [PRO] B:60 [C] A:215 [PRO] B:66 [C] ✔
A:454 [PRO] B:61 [C] A:215 [PRO] B:67 [C] ✔
A:70 [ARG] B:15 [C] A:55 [ARG] B:15 [C] ✔
A:70 [ARG] B:16 [U] A:55 [ARG] B:16 [U] ✔
A:70 [ARG] B:60 [C] A:55 [ARG] B:66 [C] ✔
A:70 [ARG] B:61 [C] A:55 [ARG] B:67 [C] ✔
A:693 [PHE] B:3 [A] A:414 [GLN] B:3 [A] ✔
A:693 [PHE] B:4 [A] A:414 [GLN] B:4 [A] ✔
A:1111 [LEU] B:22 [U] A:789 [TYR] B:22 [U] ✔
A:1111 [LEU] B:23 [U] A:789 [TYR] B:23 [U] ✔
A:76 [LYS] B:49 [A] A:61 [ARG] B:53 [A] ✔
A:76 [LYS] B:50 [U] A:61 [ARG] B:54 [C] ✔
A:404 [THR] B:19 [G] A:166 [GLY] B:19 [G] ✔
A:404 [THR] B:20 [C] A:166 [GLY] B:20 [C] ✔
A:156 [LEU] B:47 [A] A:107 [ALA] B:51 [A] ✔
A:1109 [SER] B:22 [U] A:787 [THR] B:22 [U] ✔
A:58 [THR] B:12 [G] A:41 [VAL] B:12 [G] ✔
A:58 [THR] B:13 [C] A:41 [VAL] B:13 [C] ✔
A:402 [GLN] B:20 [C] A:164 [VAL] B:20 [C] ✔
A:402 [GLN] B:44 [U] A:164 [VAL] B:48 [C] ✔
A:402 [GLN] B:45 [U] A:164 [VAL] B:49 [U] ✔
A:455 [LEU] B:59 [U] A:216 [GLY] B:65 [G] ✔
A:455 [LEU] B:60 [C] A:216 [GLY] B:66 [C] ✔
A:456 [ALA] B:60 [C] A:217 [GLU] B:66 [C] ✔
A:77 [ASN] B:59 [U] A:62 [HIS] B:65 [G] ✔
A:1126 [TRP] B:48 [A] A:897 [TYR] B:52 [A] ✔
A:1126 [TRP] B:49 [A] A:897 [TYR] B:53 [A] ✔
A:60 [GLU] B:12 [G] A:45 [GLU] B:12 [G] ✔
A:60 [GLU] B:13 [C] A:45 [GLU] B:13 [C] ✔
A:462 [PHE] B:14 [G] A:221 [PHE] B:14 [G] ✔
A:462 [PHE] B:15 [C] A:221 [PHE] B:15 [C] ✔
A:462 [PHE] B:61 [C] A:221 [PHE] B:67 [C] ✔
A:462 [PHE] B:62 [G] A:221 [PHE] B:68 [G] ✔
A:448 [ILE] B:16 [U] A:209 [ARG] B:16 [U] ✔
A:448 [ILE] B:17 [U] A:209 [ARG] B:17 [U] ✔
A:448 [ILE] B:60 [C] A:209 [ARG] B:66 [C] ✔
A:65 [LYS] B:63 [U] A:50 [LYS] B:69 [U] ✔
A:660 [GLY] B:5 [A] A:393 [HIS] B:5 [A] ✔
A:400 [ARG] B:44 [U] A:162 [GLY] B:48 [C] ✔
A:1122 [ARG] B:52 [A] A:893 [ILE] B:56 [A] ✔
A:459 [ASN] B:60 [C] A:218 [GLY] B:66 [C] ✔
A:661 [ARG] B:4 [A] A:394 [ASN] B:4 [A] ✔
A:661 [ARG] B:5 [A] A:394 [ASN] B:5 [A] ✔
A:72 [TYR] B:50 [U] A:57 [LYS] B:54 [C] ✔
A:72 [TYR] B:51 [A] A:57 [LYS] B:55 [A] ✔
A:738 [LEU] B:66 [U] A:455 [ILE] B:72 [U] ✔
A:738 [LEU] B:67 [C] A:455 [ILE] B:73 [U] ✔
A:159 [ALA] B:47 [A] A:110 [LEU] B:51 [A] ✔
A:518 [PHE] B:4 [A] A:256 [TYR] B:4 [A] ✔
A:165 [ARG] B:17 [U] A:116 [ARG] B:17 [U] ✔
A:165 [ARG] B:18 [G] A:116 [ARG] B:18 [G] ✔
A:165 [ARG] B:19 [G] A:116 [ARG] B:19 [G] ✔
A:79 [ILE] B:48 [A] A:64 [ILE] B:52 [A] ✔
A:510 [LYS] B:5 [A] A:248 [LYS] B:5 [A] ✔
A:510 [LYS] B:6 [U] A:248 [LYS] B:6 [U] ✔
A:403 [ARG] B:19 [G] A:165 [ARG] B:19 [G] ✔
A:403 [ARG] B:20 [C] A:165 [ARG] B:20 [C] ✔
A:403 [ARG] B:45 [U] A:165 [ARG] B:49 [U] ✔
A:403 [ARG] B:46 [A] A:165 [ARG] B:50 [A] ✔
A:1110 [ILE] B:22 [U] A:788 [LEU] B:22 [U] ✔
A:1110 [ILE] B:23 [U] A:788 [LEU] B:23 [U] ✔
A:1110 [ILE] B:49 [A] A:788 [LEU] B:53 [A] ✔
A:78 [ARG] B:18 [G] A:63 [ARG] B:18 [G] ✔
A:73 [THR] B:60 [C] A:58 [ARG] B:66 [C] ✔
A:73 [THR] B:61 [C] A:58 [ARG] B:67 [C] ✔
A:325 [TYR] B:44 [U] A:158 [LEU] B:48 [C] ✔
A:167 [HIS] B:17 [U] A:118 [VAL] B:17 [U] ✔
A:167 [HIS] B:18 [G] A:118 [VAL] B:18 [G] ✔
A:415 [HIS] B:19 [G] A:176 [TYR] B:19 [G] ✔
A:168 [PHE] B:17 [U] A:119 [HIS] B:17 [U] ✔
A:1134 [PHE] B:51 [A] A:906 [LYS] B:55 [A] ✔
A:1108 [GLU] B:63 [U] A:786 [ASP] B:69 [U] ✔
A:519 [THR] B:4 [A] A:257 [ASN] B:4 [A] ✔
A:519 [THR] B:5 [A] A:257 [ASN] B:5 [A] ✔
A:408 [GLY] B:18 [G] A:170 [ARG] B:18 [G] ✔
A:408 [GLY] B:19 [G] A:170 [ARG] B:19 [G] ✔
A:739 [GLN] B:67 [C] A:456 [GLN] B:73 [U] ✔
A:735 [LYS] B:66 [U] A:452 [ARG] B:72 [U] ✔
A:134 [THR] B:45 [U] A:87 [ASN] B:49 [U] ✔
A:460 [SER] B:60 [C] A:219 [SER] B:66 [C] ✔
A:460 [SER] B:61 [C] A:219 [SER] B:67 [C] ✔
A:1169 [MET] B:52 [A] A:931 [LEU] B:56 [A] ✔
A:1104 [GLY] B:51 [A] A:782 [GLU] B:55 [A] ✔
A:1104 [GLY] B:63 [U] A:782 [GLU] B:69 [U] ✔
A:71 [ARG] B:17 [U] A:56 [LEU] B:17 [U] ✔
A:71 [ARG] B:18 [G] A:56 [LEU] B:18 [G] ✔
A:500 [LYS] B:3 [A] A:238 [THR] B:3 [A] ✔
A:449 [PRO] B:15 [C] A:210 [THR] B:15 [C] ✔
A:449 [PRO] B:16 [U] A:210 [THR] B:16 [U] ✔
A:59 [ALA] B:13 [C] A:44 [ASN] B:13 [C] ✔
A:59 [ALA] B:14 [G] A:44 [ASN] B:14 [G] ✔
A:59 [ALA] B:64 [U] A:44 [ASN] B:70 [G] ✔
A:452 [VAL] B:15 [C] A:213 [GLU] B:15 [C] ✔
A:1103 [GLY] B:51 [A] A:781 [ARG] B:55 [A] ✔
A:1103 [GLY] B:63 [U] A:781 [ARG] B:69 [U] ✔
A:1103 [GLY] B:64 [U] A:781 [ARG] B:70 [G] ✔
A:164 [PHE] B:19 [G] A:115 [ARG] B:19 [G] ✔
A:164 [PHE] B:47 [A] A:115 [ARG] B:51 [A] ✔
A:1105 [PHE] B:51 [A] A:783 [LEU] B:55 [A] ✔
A:1105 [PHE] B:52 [A] A:783 [LEU] B:56 [A] ✔
A:1097 [LYS] B:67 [C] A:774 [ARG] B:73 [U] ✔
A:1102 [THR] B:63 [U] A:780 [ASN] B:69 [U] ✔
A:1102 [THR] B:64 [U] A:780 [ASN] B:70 [G] ✔
A:163 [LYS] B:49 [A] A:114 [LYS] B:53 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:81 [TYR] B:59 [U] A:66 [ARG] B:65 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:734 [LYS] B:66 [U] A:451 [LYS] B:72 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:461 [ARG] B:14 [G] A:220 [PRO] B:14 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:461 [ARG] B:62 [G] A:220 [PRO] B:68 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:461 [ARG] B:64 [U] A:220 [PRO] B:70 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:588 [ASN] B:5 [A] A:322 [GLU] B:5 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:731 [PRO] B:65 [A] A:448 [PRO] B:71 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:75 [ARG] B:49 [A] A:60 [ARG] B:53 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:70 [ARG] B:62 [G] A:55 [ARG] B:68 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:58 [THR] B:64 [U] A:41 [VAL] B:70 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:446 [PHE] B:59 [U] A:207 [THR] B:65 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:455 [LEU] B:58 [G] A:216 [GLY] B:63 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:456 [ALA] B:58 [G] A:217 [GLU] B:63 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:1130 [LYS] B:24 [U] A:902 [ASN] B:24 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:60 [GLU] B:14 [G] A:45 [GLU] B:14 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:65 [LYS] B:51 [A] A:50 [LYS] B:55 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:1122 [ARG] B:23 [U] A:893 [ILE] B:23 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:1122 [ARG] B:49 [A] A:893 [ILE] B:53 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:1122 [ARG] B:50 [U] A:893 [ILE] B:54 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:1122 [ARG] B:53 [G] A:893 [ILE] B:57 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:459 [ASN] B:61 [C] A:218 [GLY] B:67 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:72 [TYR] B:20 [C] A:57 [LYS] B:20 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:73 [THR] B:59 [U] A:58 [ARG] B:65 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:73 [THR] B:62 [G] A:58 [ARG] B:68 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:325 [TYR] B:43 [G] A:158 [LEU] B:47 [A] ❌ 7EL1_A_B
A:168 [PHE] B:18 [G] A:119 [HIS] B:18 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:739 [GLN] B:66 [U] A:456 [GLN] B:72 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:134 [THR] B:44 [U] A:87 [ASN] B:48 [C] ❌ 7EL1_A_B
A:59 [ALA] B:12 [G] A:44 [ASN] B:12 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:164 [PHE] B:18 [G] A:115 [ARG] B:18 [G] ❌ 7EL1_A_B
A:1102 [THR] B:65 [A] A:780 [ASN] B:71 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:1102 [THR] B:66 [U] A:780 [ASN] B:72 [U] ❌ 7EL1_A_B
A:164 [PHE] B:20 [C] A:115 [ARG] B:20 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:164 [PHE] B:46 [A] A:115 [ARG] B:50 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:325 [TYR] B:45 [U] A:158 [LEU] B:49 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:447 [ARG] B:18 [G] A:208 [ARG] B:18 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:448 [ILE] B:59 [U] A:209 [ARG] B:65 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:456 [ALA] B:59 [U] A:217 [GLU] B:65 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:461 [ARG] B:60 [C] A:220 [PRO] B:66 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:461 [ARG] B:61 [C] A:220 [PRO] B:67 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:500 [LYS] B:4 [A] A:238 [THR] B:4 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:510 [LYS] B:7 [U] A:248 [LYS] B:7 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:519 [THR] B:6 [U] A:257 [ASN] B:6 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:660 [GLY] B:4 [A] A:393 [HIS] B:4 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:662 [LEU] B:5 [A] A:395 [LEU] B:5 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:731 [PRO] B:12 [G] A:448 [PRO] B:12 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:731 [PRO] B:13 [C] A:448 [PRO] B:13 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:734 [LYS] B:65 [A] A:451 [LYS] B:71 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:735 [LYS] B:65 [A] A:452 [ARG] B:71 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:62 [THR] B:14 [G] A:47 [ARG] B:14 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:62 [THR] B:62 [G] A:47 [ARG] B:68 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:63 [ARG] B:12 [G] A:48 [ARG] B:12 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:72 [TYR] B:49 [A] A:57 [LYS] B:53 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:77 [ASN] B:58 [G] A:62 [HIS] B:63 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:81 [TYR] B:58 [G] A:66 [ARG] B:63 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1097 [LYS] B:66 [U] A:774 [ARG] B:72 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1102 [THR] B:51 [A] A:780 [ASN] B:55 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1102 [THR] B:52 [A] A:780 [ASN] B:56 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1102 [THR] B:62 [G] A:780 [ASN] B:68 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:1103 [GLY] B:65 [A] A:781 [ARG] B:71 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1104 [GLY] B:64 [U] A:782 [GLU] B:70 [G] ❌ 4OO8_A_B
A:1108 [GLU] B:51 [A] A:786 [ASP] B:55 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:1108 [GLU] B:50 [U] A:786 [ASP] B:54 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:1110 [ILE] B:50 [U] A:788 [LEU] B:54 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:1126 [TRP] B:50 [U] A:897 [TYR] B:54 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:1126 [TRP] B:24 [U] A:897 [TYR] B:24 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1126 [TRP] B:23 [U] A:897 [TYR] B:23 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1130 [LYS] B:25 [U] A:902 [ASN] B:25 [U] ❌ 4OO8_A_B
A:1134 [PHE] B:50 [U] A:906 [LYS] B:54 [C] ❌ 4OO8_A_B
A:1134 [PHE] B:52 [A] A:906 [LYS] B:56 [A] ❌ 4OO8_A_B
A:893 [THR] B:8 [A] A:616 [GLY] B:8 [A] ❌ 7EL1_A:616, 7EL1_B:8 no longer at interface
A:779 [GLU] B:10 [G] A:493 [GLU] B:10 [G] ❌ 7EL1_A:493, 7EL1_B:10 no longer at interface
A:72 [TYR] B:21 [G] A:57 [LYS] B:21 [G] ❌ 7EL1_B:21 no longer at interface
A:403 [ARG] B:21 [G] A:165 [ARG] B:21 [G] ❌ 7EL1_B:21 no longer at interface
A:783 [ARG] B:8 [A] A:497 [ARG] B:8 [A] ❌ 7EL1_A:497, 7EL1_B:8 no longer at interface
A:783 [ARG] B:9 [G] A:497 [ARG] B:9 [G] ❌ 7EL1_A:497, 7EL1_B:9 no longer at interface
A:729 [GLY] B:11 [U] A:446 [LEU] B:11 [U] ❌ 4OO8_A:729, 4OO8_B:11 no longer at interface
A:775 [LYS] B:11 [U] A:489 [LYS] B:11 [U] ❌ 4OO8_A:775, 4OO8_B:11 no longer at interface
A:721 [HIS] B:65 [A] A:438 [THR] B:71 [U] ❌ 7EL1_A:438 no longer at interface
A:721 [HIS] B:66 [U] A:438 [THR] B:72 [U] ❌ 7EL1_A:438 no longer at interface
A:57 [GLU] B:64 [U] A:40 [ASN] B:70 [G] ❌ 7EL1_A:40 no longer at interface
A:57 [GLU] B:65 [A] A:40 [ASN] B:71 [U] ❌ 7EL1_A:40 no longer at interface
A:1168 [ILE] B:51 [A] A:930 [ASN] B:55 [A] ❌ 7EL1_A:930 no longer at interface
A:1121 [ALA] B:52 [A] A:892 [ASP] B:56 [A] ❌ 7EL1_A:892 no longer at interface
A:923 [GLU] B:1 [G] A:648 [ASP] B:1 [G] ❌ 7EL1_A:648 no longer at interface
A:589 [ALA] B:5 [A] A:323 [PHE] B:5 [A] ❌ 7EL1_A:323 no longer at interface
A:589 [ALA] B:6 [U] A:323 [PHE] B:6 [U] ❌ 7EL1_A:323 no longer at interface
A:491 [PHE] B:14 [G] A:229 [TRP] B:14 [G] ❌ 7EL1_A:229 no longer at interface
A:515 [TYR] B:4 [A] A:253 [ALA] B:4 [A] ❌ 7EL1_A:253 no longer at interface
A:515 [TYR] B:5 [A] A:253 [ALA] B:5 [A] ❌ 7EL1_A:253 no longer at interface
A:1098 [THR] B:67 [C] A:775 [VAL] B:73 [U] ❌ 7EL1_A:775 no longer at interface
A:83 [GLN] B:48 [A] A:68 [LYS] B:52 [A] ❌ 7EL1_A:68 no longer at interface
A:324 [ARG] B:44 [U] A:157 [ARG] B:48 [C] ❌ 7EL1_A:157 no longer at interface
A:1100 [VAL] B:67 [C] A:777 [LYS] B:73 [U] ❌ 7EL1_A:777 no longer at interface
A:56 [GLY] B:65 [A] A:39 [ALA] B:71 [U] ❌ 7EL1_A:39 no longer at interface
A:410 [ILE] B:18 [G] A:171 [PHE] B:18 [G] ❌ 7EL1_A:171 no longer at interface
A:1113 [LYS] B:23 [U] A:791 [THR] B:23 [U] ❌ 7EL1_A:791 no longer at interface
A:1113 [LYS] B:24 [U] A:791 [THR] B:24 [U] ❌ 7EL1_A:791 no longer at interface
A:1113 [LYS] B:25 [U] A:791 [THR] B:25 [U] ❌ 7EL1_A:791 no longer at interface
A:155 [TYR] B:48 [A] A:106 [SER] B:52 [A] ❌ 7EL1_A:106 no longer at interface
A:1131 [TYR] B:23 [U] A:903 [LYS] B:23 [U] ❌ 7EL1_A:903 no longer at interface
A:1131 [TYR] B:24 [U] A:903 [LYS] B:24 [U] ❌ 7EL1_A:903 no longer at interface
A:328 [HIS] B:44 [U] A:161 [ASP] B:48 [C] ❌ 7EL1_A:161 no longer at interface
A:1197 [LYS] B:67 [C] A:965 [SER] B:73 [U] ❌ 7EL1_A:965 no longer at interface
A:55 [SER] B:65 [A] A:38 [GLU] B:71 [U] ❌ 7EL1_A:38 no longer at interface
A:406 [ASP] B:19 [G] A:168 [ILE] B:19 [G] ❌ 7EL1_A:168 no longer at interface
A:68 [ALA] B:51 [A] A:53 [ALA] B:55 [A] ❌ 7EL1_A:53 no longer at interface
A:1123 [LYS] B:49 [A] A:894 [THR] B:53 [A] ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface
A:1123 [LYS] B:50 [U] A:894 [THR] B:54 [C] ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface
A:1123 [LYS] B:52 [A] A:894 [THR] B:56 [A] ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface
A:1123 [LYS] B:53 [G] A:894 [THR] B:57 [G] ❌ 7EL1_A:894 no longer at interface
A:1099 [GLU] B:67 [C] A:776 [ASP] B:73 [U] ❌ 7EL1_A:776 no longer at interface
A:1124 [LYS] B:52 [A] A:895 [ASP] B:56 [A] ❌ 7EL1_A:895 no longer at interface
A:1124 [LYS] B:53 [G] A:895 [ASP] B:57 [G] ❌ 7EL1_A:895 no longer at interface
A:117 [PRO] B:26 [A] A:82 [GLU] B:26 [A] ❌ 7EL1_A:82 no longer at interface
A:926 [GLN] B:2 [G] A:651 [TYR] B:2 [G] ❌ 7EL1_A:651 no longer at interface
A:67 [THR] B:15 [C] A:52 [GLY] B:15 [C] ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface
A:67 [THR] B:16 [U] A:52 [GLY] B:16 [U] ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface
A:67 [THR] B:17 [U] A:52 [GLY] B:17 [U] ❌ 7EL1_A:52 no longer at interface
A:725 [ALA] B:65 [A] A:442 [ASP] B:71 [U] ❌ 7EL1_A:442 no longer at interface
A:246 [LEU] B:18 [G] A:134 [THR] B:18 [G] ❌ 4OO8_A:246 no longer at interface
A:501 [ASN] B:3 [A] A:239 [TYR] B:3 [A] ❌ 4OO8_A:501 no longer at interface
A:511 [HIS] B:6 [U] A:249 [TYR] B:6 [U] ❌ 4OO8_A:511 no longer at interface
A:511 [HIS] B:7 [U] A:249 [TYR] B:7 [U] ❌ 4OO8_A:511 no longer at interface
A:516 [GLU] B:6 [U] A:254 [ASP] B:6 [U] ❌ 4OO8_A:516 no longer at interface
A:583 [VAL] B:6 [U] A:314 [ARG] B:6 [U] ❌ 4OO8_A:583 no longer at interface
A:583 [VAL] B:5 [A] A:314 [ARG] B:5 [A] ❌ 4OO8_A:583 no longer at interface
A:590 [SER] B:5 [A] A:324 [THR] B:5 [A] ❌ 4OO8_A:590 no longer at interface
A:706 [GLU] B:3 [A] A:425 [PRO] B:3 [A] ❌ 4OO8_A:706 no longer at interface
A:706 [GLU] B:2 [G] A:425 [PRO] B:2 [G] ❌ 4OO8_A:706 no longer at interface
A:729 [GLY] B:12 [G] A:446 [LEU] B:12 [G] ❌ 4OO8_A:729 no longer at interface
A:775 [LYS] B:12 [G] A:489 [LYS] B:12 [G] ❌ 4OO8_A:775 no longer at interface
A:924 [THR] B:1 [G] A:649 [THR] B:1 [G] ❌ 4OO8_A:924 no longer at interface
A:80 [LEU] B:48 [A] A:65 [GLN] B:52 [A] ❌ 4OO8_A:80 no longer at interface
A:1101 [GLN] B:63 [U] A:778 [LYS] B:69 [U] ❌ 4OO8_A:1101 no longer at interface
A:1101 [GLN] B:65 [A] A:778 [LYS] B:71 [U] ❌ 4OO8_A:1101 no longer at interface
A:1101 [GLN] B:64 [U] A:778 [LYS] B:70 [G] ❌ 4OO8_A:1101 no longer at interface
A:1101 [GLN] B:66 [U] A:778 [LYS] B:72 [U] ❌ 4OO8_A:1101 no longer at interface
A:1106 [SER] B:51 [A] A:784 [ILE] B:55 [A] ❌ 4OO8_A:1106 no longer at interface
A:1107 [LYS] B:51 [A] A:785 [ASN] B:55 [A] ❌ 4OO8_A:1107 no longer at interface
A:1114 [ARG] B:24 [U] A:792 [ARG] B:24 [U] ❌ 4OO8_A:1114 no longer at interface
A:119 [PHE] B:26 [A] A:84 [SER] B:26 [A] ❌ 4OO8_A:119 no longer at interface
A:1120 [ILE] B:52 [A] A:891 [LEU] B:56 [A] ❌ 4OO8_A:1120 no longer at interface
A:1125 [ASP] B:53 [G] A:896 [ASP] B:57 [G] ❌ 4OO8_A:1125 no longer at interface
A:1125 [ASP] B:48 [A] A:896 [ASP] B:52 [A] ❌ 4OO8_A:1125 no longer at interface
A:1125 [ASP] B:49 [A] A:896 [ASP] B:53 [A] ❌ 4OO8_A:1125 no longer at interface
A:1125 [ASP] B:52 [A] A:896 [ASP] B:56 [A] ❌ 4OO8_A:1125 no longer at interface
A:1127 [ASP] B:24 [U] A:898 [PRO] B:24 [U] ❌ 4OO8_A:1127 no longer at interface
A:1127 [ASP] B:25 [U] A:898 [PRO] B:25 [U] ❌ 4OO8_A:1127 no longer at interface
A:1128 [PRO] B:24 [U] A:900 [SER] B:24 [U] ❌ 4OO8_A:1128 no longer at interface
A:1128 [PRO] B:25 [U] A:900 [SER] B:25 [U] ❌ 4OO8_A:1128 no longer at interface
A:1129 [LYS] B:24 [U] A:901 [ARG] B:24 [U] ❌ 4OO8_A:1129 no longer at interface
A:1129 [LYS] B:26 [A] A:901 [ARG] B:26 [A] ❌ 4OO8_A:1129 no longer at interface
A:1129 [LYS] B:25 [U] A:901 [ARG] B:25 [U] ❌ 4OO8_A:1129 no longer at interface
A:1171 [ARG] B:52 [A] A:933 [VAL] B:56 [A] ❌ 4OO8_A:1171 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 0.71 2.09 0.23 0.71 0.55 0.67 0.79 0.65 0.53 0.32 0.54


Other pairs involving 4OO8_A_B or 7EL1_A_B

Total number of entries: 15

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
4OO8_A_B 5X2H_A_B 0.54 0.74 3.37 0.16 Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2R_B_A 0.96 0.92 1.49 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2S_B_A 0.96 0.92 1.52 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5FQ5_B_A 0.95 0.92 1.5 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5B2T_B_A 0.97 0.93 1.46 0.97 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 5FW1_B_A 0.94 0.93 1.42 0.73 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7OX9_B_A 0.96 0.93 1.58 0.72 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
4OO8_A_B 7EL1_A_B 0.65 0.71 2.09 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2S_B_A 7EL1_A_B 0.63 0.73 1.98 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FQ5_B_A 7EL1_A_B 0.63 0.73 1.97 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5X2H_A_B 7EL1_A_B 0.68 0.81 2.06 0.19 CRISPR-associated endonuclease Cas9 wedge domain & Ribonuclease H-like & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2T_B_A 7EL1_A_B 0.64 0.73 1.93 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
7EL1_A_B 7OX9_B_A 0.63 0.73 1.92 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5FW1_B_A 7EL1_A_B 0.65 0.73 2.0 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare
5B2R_B_A 7EL1_A_B 0.63 0.73 1.96 0.23 Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 compare