Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 5FQ5_B
|
5FQ5_A
|
7OX9_B
|
7OX9_A
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| B:1112 [PRO] | A:23 [U] | B:1112 [PRO] | A:23 [U] | ✔ |
| B:1112 [PRO] | A:24 [U] | B:1112 [PRO] | A:24 [U] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:51 [A] | B:69 [ARG] | A:51 [A] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:62 [G] | B:69 [ARG] | A:62 [G] | ✔ |
| B:69 [ARG] | A:63 [U] | B:69 [ARG] | A:63 [U] | ✔ |
| B:895 [ARG] | A:8 [A] | B:895 [ARG] | A:8 [C] | ✔ |
| B:447 [ARG] | A:16 [A] | B:447 [ARG] | A:16 [A] | ✔ |
| B:447 [ARG] | A:17 [A] | B:447 [ARG] | A:17 [G] | ✔ |
| B:522 [ASN] | A:4 [A] | B:522 [ASN] | A:4 [G] | ✔ |
| B:135 [ILE] | A:45 [U] | B:135 [ILE] | A:45 [U] | ✔ |
| B:135 [ILE] | A:46 [A] | B:135 [ILE] | A:46 [A] | ✔ |
| B:890 [LYS] | A:8 [A] | B:890 [LYS] | A:8 [C] | ✔ |
| B:890 [LYS] | A:9 [A] | B:890 [LYS] | A:9 [U] | ✔ |
| B:61 [ALA] | A:63 [U] | B:61 [ALA] | A:63 [U] | ✔ |
| B:340 [ARG] | A:40 [C] | B:340 [ARG] | A:40 [C] | ✔ |
| B:340 [ARG] | A:41 [A] | B:340 [ARG] | A:41 [A] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:18 [A] | B:166 [GLY] | A:18 [G] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:19 [A] | B:166 [GLY] | A:19 [A] | ✔ |
| B:694 [MET] | A:3 [A] | B:694 [MET] | A:3 [G] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:19 [A] | B:163 [LYS] | A:19 [A] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:47 [A] | B:163 [LYS] | A:47 [A] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:48 [A] | B:163 [LYS] | A:48 [A] | ✔ |
| B:163 [LYS] | A:49 [A] | B:163 [LYS] | A:49 [A] | ✔ |
| B:474 [THR] | A:59 [U] | B:474 [THR] | A:59 [U] | ✔ |
| B:742 [LYS] | A:66 [U] | B:742 [LYS] | A:66 [U] | ✔ |
| B:742 [LYS] | A:67 [C] | B:742 [LYS] | A:67 [C] | ✔ |
| B:721 [HIS] | A:65 [A] | B:721 [HIS] | A:65 [A] | ✔ |
| B:721 [HIS] | A:66 [U] | B:721 [HIS] | A:66 [U] | ✔ |
| B:364 [ASP] | A:43 [G] | B:364 [ASP] | A:43 [G] | ✔ |
| B:136 [TYR] | A:45 [U] | B:136 [TYR] | A:45 [U] | ✔ |
| B:136 [TYR] | A:46 [A] | B:136 [TYR] | A:46 [A] | ✔ |
| B:125 [GLU] | A:26 [A] | B:125 [GLU] | A:26 [A] | ✔ |
| B:753 [ARG] | A:80 [U] | B:753 [ARG] | A:80 [U] | ✔ |
| B:81 [TYR] | A:59 [U] | B:81 [TYR] | A:59 [U] | ✔ |
| B:495 [MET] | A:13 [G] | B:495 [MET] | A:13 [G] | ✔ |
| B:100 [ARG] | A:47 [A] | B:100 [ARG] | A:47 [A] | ✔ |
| B:1358 [THR] | A:68 [A] | B:1358 [THR] | A:68 [A] | ✔ |
| B:1358 [THR] | A:69 [A] | B:1358 [THR] | A:69 [A] | ✔ |
| B:1358 [THR] | A:81 [G] | B:1358 [THR] | A:81 [G] | ✔ |
| B:62 [THR] | A:63 [U] | B:62 [THR] | A:63 [U] | ✔ |
| B:62 [THR] | A:64 [U] | B:62 [THR] | A:64 [U] | ✔ |
| B:57 [GLU] | A:64 [U] | B:57 [GLU] | A:64 [U] | ✔ |
| B:57 [GLU] | A:65 [A] | B:57 [GLU] | A:65 [A] | ✔ |
| B:734 [LYS] | A:66 [U] | B:734 [LYS] | A:66 [U] | ✔ |
| B:893 [THR] | A:8 [A] | B:893 [THR] | A:8 [C] | ✔ |
| B:893 [THR] | A:9 [A] | B:893 [THR] | A:9 [U] | ✔ |
| B:894 [GLN] | A:7 [C] | B:894 [GLN] | A:7 [A] | ✔ |
| B:894 [GLN] | A:8 [A] | B:894 [GLN] | A:8 [C] | ✔ |
| B:453 [GLY] | A:15 [A] | B:453 [GLY] | A:15 [C] | ✔ |
| B:453 [GLY] | A:16 [A] | B:453 [GLY] | A:16 [A] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:16 [A] | B:74 [ARG] | A:16 [A] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:17 [A] | B:74 [ARG] | A:17 [G] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:59 [U] | B:74 [ARG] | A:59 [U] | ✔ |
| B:74 [ARG] | A:60 [C] | B:74 [ARG] | A:60 [C] | ✔ |
| B:1168 [ILE] | A:51 [A] | B:1168 [ILE] | A:51 [A] | ✔ |
| B:365 [GLY] | A:22 [U] | B:365 [GLY] | A:22 [U] | ✔ |
| B:1121 [ALA] | A:52 [A] | B:1121 [ALA] | A:52 [A] | ✔ |
| B:588 [ASN] | A:5 [C] | B:588 [ASN] | A:5 [C] | ✔ |
| B:588 [ASN] | A:6 [U] | B:588 [ASN] | A:6 [C] | ✔ |
| B:366 [GLY] | A:22 [U] | B:366 [GLY] | A:22 [U] | ✔ |
| B:464 [TRP] | A:14 [U] | B:464 [TRP] | A:14 [A] | ✔ |
| B:464 [TRP] | A:15 [A] | B:464 [TRP] | A:15 [C] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:13 [G] | B:63 [ARG] | A:13 [G] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:14 [U] | B:63 [ARG] | A:14 [A] | ✔ |
| B:63 [ARG] | A:15 [A] | B:63 [ARG] | A:15 [C] | ✔ |
| B:105 [PHE] | A:23 [U] | B:105 [PHE] | A:23 [U] | ✔ |
| B:105 [PHE] | A:24 [U] | B:105 [PHE] | A:24 [U] | ✔ |
| B:105 [PHE] | A:25 [U] | B:105 [PHE] | A:25 [U] | ✔ |
| B:105 [PHE] | A:47 [A] | B:105 [PHE] | A:47 [A] | ✔ |
| B:105 [PHE] | A:48 [A] | B:105 [PHE] | A:48 [A] | ✔ |
| B:731 [PRO] | A:12 [U] | B:731 [PRO] | A:12 [G] | ✔ |
| B:731 [PRO] | A:13 [G] | B:731 [PRO] | A:13 [G] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:14 [U] | B:66 [ARG] | A:14 [A] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:15 [A] | B:66 [ARG] | A:15 [C] | ✔ |
| B:66 [ARG] | A:62 [G] | B:66 [ARG] | A:62 [G] | ✔ |
| B:929 [LYS] | A:1 [A] | B:929 [LYS] | A:1 [G] | ✔ |
| B:929 [LYS] | A:2 [U] | B:929 [LYS] | A:2 [G] | ✔ |
| B:472 [THR] | A:58 [G] | B:472 [THR] | A:58 [G] | ✔ |
| B:472 [THR] | A:59 [U] | B:472 [THR] | A:59 [U] | ✔ |
| B:75 [ARG] | A:50 [U] | B:75 [ARG] | A:50 [U] | ✔ |
| B:473 [ILE] | A:59 [U] | B:473 [ILE] | A:59 [U] | ✔ |
| B:108 [GLU] | A:25 [U] | B:108 [GLU] | A:25 [U] | ✔ |
| B:108 [GLU] | A:26 [A] | B:108 [GLU] | A:26 [A] | ✔ |
| B:1349 [HIS] | A:68 [A] | B:1349 [HIS] | A:68 [A] | ✔ |
| B:1349 [HIS] | A:69 [A] | B:1349 [HIS] | A:69 [A] | ✔ |
| B:662 [LEU] | A:4 [A] | B:662 [LEU] | A:4 [G] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:45 [U] | B:160 [HIS] | A:45 [U] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:46 [A] | B:160 [HIS] | A:46 [A] | ✔ |
| B:160 [HIS] | A:47 [A] | B:160 [HIS] | A:47 [A] | ✔ |
| B:336 [LYS] | A:42 [A] | B:336 [LYS] | A:42 [A] | ✔ |
| B:336 [LYS] | A:43 [G] | B:336 [LYS] | A:43 [G] | ✔ |
| B:1132 [GLY] | A:23 [U] | B:1132 [GLY] | A:23 [U] | ✔ |
| B:1132 [GLY] | A:24 [U] | B:1132 [GLY] | A:24 [U] | ✔ |
| B:589 [ALA] | A:5 [C] | B:589 [ALA] | A:5 [C] | ✔ |
| B:589 [ALA] | A:6 [U] | B:589 [ALA] | A:6 [C] | ✔ |
| B:491 [PHE] | A:14 [U] | B:491 [PHE] | A:14 [A] | ✔ |
| B:115 [ARG] | A:25 [U] | B:115 [ARG] | A:25 [U] | ✔ |
| B:115 [ARG] | A:26 [A] | B:115 [ARG] | A:26 [A] | ✔ |
| B:115 [ARG] | A:27 [G] | B:115 [ARG] | A:27 [G] | ✔ |
| B:451 [TYR] | A:15 [A] | B:451 [TYR] | A:15 [C] | ✔ |
| B:129 [HIS] | A:26 [A] | B:129 [HIS] | A:26 [A] | ✔ |
| B:129 [HIS] | A:27 [G] | B:129 [HIS] | A:27 [G] | ✔ |
| B:129 [HIS] | A:45 [U] | B:129 [HIS] | A:45 [U] | ✔ |
| B:515 [TYR] | A:4 [A] | B:515 [TYR] | A:4 [G] | ✔ |
| B:515 [TYR] | A:5 [C] | B:515 [TYR] | A:5 [C] | ✔ |
| B:401 [LYS] | A:21 [G] | B:401 [LYS] | A:21 [G] | ✔ |
| B:401 [LYS] | A:44 [U] | B:401 [LYS] | A:44 [U] | ✔ |
| B:401 [LYS] | A:45 [U] | B:401 [LYS] | A:45 [U] | ✔ |
| B:1012 [ASP] | A:1 [A] | B:1012 [ASP] | A:1 [G] | ✔ |
| B:405 [PHE] | A:19 [A] | B:405 [PHE] | A:19 [A] | ✔ |
| B:405 [PHE] | A:20 [A] | B:405 [PHE] | A:20 [U] | ✔ |
| B:332 [LEU] | A:43 [G] | B:332 [LEU] | A:43 [G] | ✔ |
| B:1350 [GLN] | A:68 [A] | B:1350 [GLN] | A:68 [A] | ✔ |
| B:450 [TYR] | A:15 [A] | B:450 [TYR] | A:15 [C] | ✔ |
| B:450 [TYR] | A:16 [A] | B:450 [TYR] | A:16 [A] | ✔ |
| B:106 [LEU] | A:24 [U] | B:106 [LEU] | A:24 [U] | ✔ |
| B:106 [LEU] | A:25 [U] | B:106 [LEU] | A:25 [U] | ✔ |
| B:407 [ASN] | A:19 [A] | B:407 [ASN] | A:19 [A] | ✔ |
| B:407 [ASN] | A:20 [A] | B:407 [ASN] | A:20 [U] | ✔ |
| B:1356 [TYR] | A:68 [A] | B:1356 [TYR] | A:68 [A] | ✔ |
| B:1356 [TYR] | A:81 [G] | B:1356 [TYR] | A:81 [G] | ✔ |
| B:1098 [THR] | A:67 [C] | B:1098 [THR] | A:67 [C] | ✔ |
| B:1098 [THR] | A:68 [A] | B:1098 [THR] | A:68 [A] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:15 [A] | B:454 [PRO] | A:15 [C] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:16 [A] | B:454 [PRO] | A:16 [A] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:60 [C] | B:454 [PRO] | A:60 [C] | ✔ |
| B:454 [PRO] | A:61 [C] | B:454 [PRO] | A:61 [C] | ✔ |
| B:352 [PHE] | A:40 [C] | B:352 [PHE] | A:40 [C] | ✔ |
| B:352 [PHE] | A:41 [A] | B:352 [PHE] | A:41 [A] | ✔ |
| B:352 [PHE] | A:42 [A] | B:352 [PHE] | A:42 [A] | ✔ |
| B:83 [GLN] | A:48 [A] | B:83 [GLN] | A:48 [A] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:14 [U] | B:70 [ARG] | A:14 [A] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:15 [A] | B:70 [ARG] | A:15 [C] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:16 [A] | B:70 [ARG] | A:16 [A] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:60 [C] | B:70 [ARG] | A:60 [C] | ✔ |
| B:70 [ARG] | A:61 [C] | B:70 [ARG] | A:61 [C] | ✔ |
| B:693 [PHE] | A:3 [A] | B:693 [PHE] | A:3 [G] | ✔ |
| B:693 [PHE] | A:4 [A] | B:693 [PHE] | A:4 [G] | ✔ |
| B:329 [HIS] | A:43 [G] | B:329 [HIS] | A:43 [G] | ✔ |
| B:329 [HIS] | A:44 [U] | B:329 [HIS] | A:44 [U] | ✔ |
| B:324 [ARG] | A:44 [U] | B:324 [ARG] | A:44 [U] | ✔ |
| B:123 [VAL] | A:28 [A] | B:123 [VAL] | A:28 [A] | ✔ |
| B:1111 [LEU] | A:22 [U] | B:1111 [LEU] | A:22 [U] | ✔ |
| B:1111 [LEU] | A:23 [U] | B:1111 [LEU] | A:23 [U] | ✔ |
| B:467 [ARG] | A:58 [G] | B:467 [ARG] | A:58 [G] | ✔ |
| B:467 [ARG] | A:59 [U] | B:467 [ARG] | A:59 [U] | ✔ |
| B:76 [LYS] | A:48 [A] | B:76 [LYS] | A:48 [A] | ✔ |
| B:76 [LYS] | A:49 [A] | B:76 [LYS] | A:49 [A] | ✔ |
| B:33 [LYS] | A:81 [G] | B:33 [LYS] | A:81 [G] | ✔ |
| B:33 [LYS] | A:82 [A] | B:33 [LYS] | A:82 [A] | ✔ |
| B:404 [THR] | A:19 [A] | B:404 [THR] | A:19 [A] | ✔ |
| B:404 [THR] | A:20 [A] | B:404 [THR] | A:20 [U] | ✔ |
| B:156 [LEU] | A:47 [A] | B:156 [LEU] | A:47 [A] | ✔ |
| B:1100 [VAL] | A:67 [C] | B:1100 [VAL] | A:67 [C] | ✔ |
| B:58 [THR] | A:12 [U] | B:58 [THR] | A:12 [G] | ✔ |
| B:58 [THR] | A:13 [G] | B:58 [THR] | A:13 [G] | ✔ |
| B:58 [THR] | A:64 [U] | B:58 [THR] | A:64 [U] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:20 [A] | B:402 [GLN] | A:20 [U] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:44 [U] | B:402 [GLN] | A:44 [U] | ✔ |
| B:402 [GLN] | A:45 [U] | B:402 [GLN] | A:45 [U] | ✔ |
| B:446 [PHE] | A:17 [A] | B:446 [PHE] | A:17 [G] | ✔ |
| B:446 [PHE] | A:59 [U] | B:446 [PHE] | A:59 [U] | ✔ |
| B:455 [LEU] | A:58 [G] | B:455 [LEU] | A:58 [G] | ✔ |
| B:455 [LEU] | A:59 [U] | B:455 [LEU] | A:59 [U] | ✔ |
| B:455 [LEU] | A:60 [C] | B:455 [LEU] | A:60 [C] | ✔ |
| B:456 [ALA] | A:58 [G] | B:456 [ALA] | A:58 [G] | ✔ |
| B:456 [ALA] | A:60 [C] | B:456 [ALA] | A:60 [C] | ✔ |
| B:56 [GLY] | A:65 [A] | B:56 [GLY] | A:65 [A] | ✔ |
| B:111 [LYS] | A:25 [U] | B:111 [LYS] | A:25 [U] | ✔ |
| B:1357 [GLU] | A:68 [A] | B:1357 [GLU] | A:68 [A] | ✔ |
| B:1357 [GLU] | A:81 [G] | B:1357 [GLU] | A:81 [G] | ✔ |
| B:77 [ASN] | A:59 [U] | B:77 [ASN] | A:59 [U] | ✔ |
| B:1130 [LYS] | A:24 [U] | B:1130 [LYS] | A:24 [U] | ✔ |
| B:1126 [TRP] | A:48 [A] | B:1126 [TRP] | A:48 [A] | ✔ |
| B:1126 [TRP] | A:49 [A] | B:1126 [TRP] | A:49 [A] | ✔ |
| B:347 [TYR] | A:41 [A] | B:347 [TYR] | A:41 [A] | ✔ |
| B:347 [TYR] | A:43 [G] | B:347 [TYR] | A:43 [G] | ✔ |
| B:104 [SER] | A:24 [U] | B:104 [SER] | A:24 [U] | ✔ |
| B:104 [SER] | A:25 [U] | B:104 [SER] | A:25 [U] | ✔ |
| B:104 [SER] | A:47 [A] | B:104 [SER] | A:47 [A] | ✔ |
| B:104 [SER] | A:48 [A] | B:104 [SER] | A:48 [A] | ✔ |
| B:60 [GLU] | A:13 [G] | B:60 [GLU] | A:13 [G] | ✔ |
| B:60 [GLU] | A:14 [U] | B:60 [GLU] | A:14 [A] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:14 [U] | B:462 [PHE] | A:14 [A] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:15 [A] | B:462 [PHE] | A:15 [C] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:61 [C] | B:462 [PHE] | A:61 [C] | ✔ |
| B:462 [PHE] | A:62 [G] | B:462 [PHE] | A:62 [G] | ✔ |
| B:471 [GLU] | A:59 [U] | B:471 [GLU] | A:59 [U] | ✔ |
| B:363 [ILE] | A:43 [G] | B:363 [ILE] | A:43 [G] | ✔ |
| B:363 [ILE] | A:44 [U] | B:363 [ILE] | A:44 [U] | ✔ |
| B:1113 [LYS] | A:23 [U] | B:1113 [LYS] | A:23 [U] | ✔ |
| B:1113 [LYS] | A:24 [U] | B:1113 [LYS] | A:24 [U] | ✔ |
| B:1113 [LYS] | A:25 [U] | B:1113 [LYS] | A:25 [U] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:16 [A] | B:448 [ILE] | A:16 [A] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:17 [A] | B:448 [ILE] | A:17 [G] | ✔ |
| B:448 [ILE] | A:60 [C] | B:448 [ILE] | A:60 [C] | ✔ |
| B:155 [TYR] | A:48 [A] | B:155 [TYR] | A:48 [A] | ✔ |
| B:101 [LEU] | A:47 [A] | B:101 [LEU] | A:47 [A] | ✔ |
| B:101 [LEU] | A:48 [A] | B:101 [LEU] | A:48 [A] | ✔ |
| B:65 [LYS] | A:51 [A] | B:65 [LYS] | A:51 [A] | ✔ |
| B:65 [LYS] | A:63 [U] | B:65 [LYS] | A:63 [U] | ✔ |
| B:35 [LEU] | A:69 [A] | B:35 [LEU] | A:69 [A] | ✔ |
| B:35 [LEU] | A:81 [G] | B:35 [LEU] | A:81 [G] | ✔ |
| B:660 [GLY] | A:5 [C] | B:660 [GLY] | A:5 [C] | ✔ |
| B:400 [ARG] | A:44 [U] | B:400 [ARG] | A:44 [U] | ✔ |
| B:1131 [TYR] | A:23 [U] | B:1131 [TYR] | A:23 [U] | ✔ |
| B:1131 [TYR] | A:24 [U] | B:1131 [TYR] | A:24 [U] | ✔ |
| B:328 [HIS] | A:43 [G] | B:328 [HIS] | A:43 [G] | ✔ |
| B:328 [HIS] | A:44 [U] | B:328 [HIS] | A:44 [U] | ✔ |
| B:1122 [ARG] | A:23 [U] | B:1122 [ARG] | A:23 [U] | ✔ |
| B:1122 [ARG] | A:49 [A] | B:1122 [ARG] | A:49 [A] | ✔ |
| B:1122 [ARG] | A:50 [U] | B:1122 [ARG] | A:50 [U] | ✔ |
| B:1122 [ARG] | A:52 [A] | B:1122 [ARG] | A:52 [A] | ✔ |
| B:351 [PHE] | A:42 [A] | B:351 [PHE] | A:42 [A] | ✔ |
| B:351 [PHE] | A:43 [G] | B:351 [PHE] | A:43 [G] | ✔ |
| B:102 [GLU] | A:47 [A] | B:102 [GLU] | A:47 [A] | ✔ |
| B:102 [GLU] | A:48 [A] | B:102 [GLU] | A:48 [A] | ✔ |
| B:102 [GLU] | A:49 [A] | B:102 [GLU] | A:49 [A] | ✔ |
| B:359 [TYR] | A:43 [G] | B:359 [TYR] | A:43 [G] | ✔ |
| B:359 [TYR] | A:44 [U] | B:359 [TYR] | A:44 [U] | ✔ |
| B:459 [ASN] | A:56 [U] | B:459 [ASN] | A:56 [U] | ✔ |
| B:459 [ASN] | A:58 [G] | B:459 [ASN] | A:58 [G] | ✔ |
| B:459 [ASN] | A:60 [C] | B:459 [ASN] | A:60 [C] | ✔ |
| B:459 [ASN] | A:61 [C] | B:459 [ASN] | A:61 [C] | ✔ |
| B:661 [ARG] | A:3 [A] | B:661 [ARG] | A:3 [G] | ✔ |
| B:661 [ARG] | A:4 [A] | B:661 [ARG] | A:4 [G] | ✔ |
| B:661 [ARG] | A:5 [C] | B:661 [ARG] | A:5 [C] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:20 [A] | B:72 [TYR] | A:20 [U] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:21 [G] | B:72 [TYR] | A:21 [G] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:50 [U] | B:72 [TYR] | A:50 [U] | ✔ |
| B:72 [TYR] | A:51 [A] | B:72 [TYR] | A:51 [A] | ✔ |
| B:738 [LEU] | A:66 [U] | B:738 [LEU] | A:66 [U] | ✔ |
| B:738 [LEU] | A:67 [C] | B:738 [LEU] | A:67 [C] | ✔ |
| B:159 [ALA] | A:47 [A] | B:159 [ALA] | A:47 [A] | ✔ |
| B:55 [SER] | A:65 [A] | B:55 [SER] | A:65 [A] | ✔ |
| B:729 [GLY] | A:12 [U] | B:729 [GLY] | A:12 [G] | ✔ |
| B:518 [PHE] | A:4 [A] | B:518 [PHE] | A:4 [G] | ✔ |
| B:406 [ASP] | A:19 [A] | B:406 [ASP] | A:19 [A] | ✔ |
| B:68 [ALA] | A:51 [A] | B:68 [ALA] | A:51 [A] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:17 [A] | B:165 [ARG] | A:17 [G] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:18 [A] | B:165 [ARG] | A:18 [G] | ✔ |
| B:165 [ARG] | A:19 [A] | B:165 [ARG] | A:19 [A] | ✔ |
| B:749 [LYS] | A:80 [U] | B:749 [LYS] | A:80 [U] | ✔ |
| B:749 [LYS] | A:81 [G] | B:749 [LYS] | A:81 [G] | ✔ |
| B:79 [ILE] | A:48 [A] | B:79 [ILE] | A:48 [A] | ✔ |
| B:510 [LYS] | A:5 [C] | B:510 [LYS] | A:5 [C] | ✔ |
| B:510 [LYS] | A:6 [U] | B:510 [LYS] | A:6 [C] | ✔ |
| B:457 [ARG] | A:57 [A] | B:457 [ARG] | A:57 [A] | ✔ |
| B:457 [ARG] | A:58 [G] | B:457 [ARG] | A:58 [G] | ✔ |
| B:34 [VAL] | A:81 [G] | B:34 [VAL] | A:81 [G] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:20 [A] | B:403 [ARG] | A:20 [U] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:21 [G] | B:403 [ARG] | A:21 [G] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:45 [U] | B:403 [ARG] | A:45 [U] | ✔ |
| B:403 [ARG] | A:46 [A] | B:403 [ARG] | A:46 [A] | ✔ |
| B:1123 [LYS] | A:49 [A] | B:1123 [LYS] | A:49 [A] | ✔ |
| B:1123 [LYS] | A:50 [U] | B:1123 [LYS] | A:50 [U] | ✔ |
| B:1123 [LYS] | A:52 [A] | B:1123 [LYS] | A:52 [A] | ✔ |
| B:1123 [LYS] | A:53 [G] | B:1123 [LYS] | A:53 [G] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:21 [G] | B:1110 [ILE] | A:21 [G] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:22 [U] | B:1110 [ILE] | A:22 [U] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:23 [U] | B:1110 [ILE] | A:23 [U] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:49 [A] | B:1110 [ILE] | A:49 [A] | ✔ |
| B:1110 [ILE] | A:50 [U] | B:1110 [ILE] | A:50 [U] | ✔ |
| B:78 [ARG] | A:18 [A] | B:78 [ARG] | A:18 [G] | ✔ |
| B:73 [THR] | A:59 [U] | B:73 [THR] | A:59 [U] | ✔ |
| B:73 [THR] | A:60 [C] | B:73 [THR] | A:60 [C] | ✔ |
| B:73 [THR] | A:61 [C] | B:73 [THR] | A:61 [C] | ✔ |
| B:924 [THR] | A:1 [A] | B:924 [THR] | A:1 [G] | ✔ |
| B:494 [ARG] | A:14 [U] | B:494 [ARG] | A:14 [A] | ✔ |
| B:325 [TYR] | A:43 [G] | B:325 [TYR] | A:43 [G] | ✔ |
| B:325 [TYR] | A:44 [U] | B:325 [TYR] | A:44 [U] | ✔ |
| B:167 [HIS] | A:17 [A] | B:167 [HIS] | A:17 [G] | ✔ |
| B:167 [HIS] | A:18 [A] | B:167 [HIS] | A:18 [G] | ✔ |
| B:415 [HIS] | A:19 [A] | B:415 [HIS] | A:19 [A] | ✔ |
| B:168 [PHE] | A:17 [A] | B:168 [PHE] | A:17 [G] | ✔ |
| B:168 [PHE] | A:18 [A] | B:168 [PHE] | A:18 [G] | ✔ |
| B:1134 [PHE] | A:51 [A] | B:1134 [PHE] | A:51 [A] | ✔ |
| B:1099 [GLU] | A:67 [C] | B:1099 [GLU] | A:67 [C] | ✔ |
| B:519 [THR] | A:5 [C] | B:519 [THR] | A:5 [C] | ✔ |
| B:1124 [LYS] | A:52 [A] | B:1124 [LYS] | A:52 [A] | ✔ |
| B:1124 [LYS] | A:53 [G] | B:1124 [LYS] | A:53 [G] | ✔ |
| B:408 [GLY] | A:18 [A] | B:408 [GLY] | A:18 [G] | ✔ |
| B:408 [GLY] | A:19 [A] | B:408 [GLY] | A:19 [A] | ✔ |
| B:739 [GLN] | A:66 [U] | B:739 [GLN] | A:66 [U] | ✔ |
| B:739 [GLN] | A:67 [C] | B:739 [GLN] | A:67 [C] | ✔ |
| B:735 [LYS] | A:66 [U] | B:735 [LYS] | A:66 [U] | ✔ |
| B:134 [THR] | A:44 [U] | B:134 [THR] | A:44 [U] | ✔ |
| B:134 [THR] | A:45 [U] | B:134 [THR] | A:45 [U] | ✔ |
| B:117 [PRO] | A:26 [A] | B:117 [PRO] | A:26 [A] | ✔ |
| B:360 [ALA] | A:43 [G] | B:360 [ALA] | A:43 [G] | ✔ |
| B:460 [SER] | A:60 [C] | B:460 [SER] | A:60 [C] | ✔ |
| B:460 [SER] | A:61 [C] | B:460 [SER] | A:61 [C] | ✔ |
| B:116 [HIS] | A:26 [A] | B:116 [HIS] | A:26 [A] | ✔ |
| B:116 [HIS] | A:27 [G] | B:116 [HIS] | A:27 [G] | ✔ |
| B:1169 [MET] | A:52 [A] | B:1169 [MET] | A:52 [A] | ✔ |
| B:1104 [GLY] | A:51 [A] | B:1104 [GLY] | A:51 [A] | ✔ |
| B:1104 [GLY] | A:63 [U] | B:1104 [GLY] | A:63 [U] | ✔ |
| B:71 [ARG] | A:17 [A] | B:71 [ARG] | A:17 [G] | ✔ |
| B:71 [ARG] | A:18 [A] | B:71 [ARG] | A:18 [G] | ✔ |
| B:122 [ILE] | A:27 [G] | B:122 [ILE] | A:27 [G] | ✔ |
| B:122 [ILE] | A:28 [A] | B:122 [ILE] | A:28 [A] | ✔ |
| B:1351 [SER] | A:68 [A] | B:1351 [SER] | A:68 [A] | ✔ |
| B:926 [GLN] | A:2 [U] | B:926 [GLN] | A:2 [G] | ✔ |
| B:449 [PRO] | A:15 [A] | B:449 [PRO] | A:15 [C] | ✔ |
| B:449 [PRO] | A:16 [A] | B:449 [PRO] | A:16 [A] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:13 [G] | B:59 [ALA] | A:13 [G] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:14 [U] | B:59 [ALA] | A:14 [A] | ✔ |
| B:59 [ALA] | A:64 [U] | B:59 [ALA] | A:64 [U] | ✔ |
| B:452 [VAL] | A:15 [A] | B:452 [VAL] | A:15 [C] | ✔ |
| B:133 [PRO] | A:45 [U] | B:133 [PRO] | A:45 [U] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:51 [A] | B:1103 [GLY] | A:51 [A] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:63 [U] | B:1103 [GLY] | A:63 [U] | ✔ |
| B:1103 [GLY] | A:64 [U] | B:1103 [GLY] | A:64 [U] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:19 [A] | B:164 [PHE] | A:19 [A] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:20 [A] | B:164 [PHE] | A:20 [U] | ✔ |
| B:164 [PHE] | A:47 [A] | B:164 [PHE] | A:47 [A] | ✔ |
| B:67 [THR] | A:15 [A] | B:67 [THR] | A:15 [C] | ✔ |
| B:67 [THR] | A:16 [A] | B:67 [THR] | A:16 [A] | ✔ |
| B:126 [VAL] | A:27 [G] | B:126 [VAL] | A:27 [G] | ✔ |
| B:126 [VAL] | A:28 [A] | B:126 [VAL] | A:28 [A] | ✔ |
| B:1105 [PHE] | A:51 [A] | B:1105 [PHE] | A:51 [A] | ✔ |
| B:1105 [PHE] | A:52 [A] | B:1105 [PHE] | A:52 [A] | ✔ |
| B:725 [ALA] | A:65 [A] | B:725 [ALA] | A:65 [A] | ✔ |
| B:107 [VAL] | A:24 [U] | B:107 [VAL] | A:24 [U] | ✔ |
| B:107 [VAL] | A:25 [U] | B:107 [VAL] | A:25 [U] | ✔ |
| B:1097 [LYS] | A:67 [C] | B:1097 [LYS] | A:67 [C] | ✔ |
| B:1097 [LYS] | A:68 [A] | B:1097 [LYS] | A:68 [A] | ✔ |
| B:475 [PRO] | A:59 [U] | B:475 [PRO] | A:59 [U] | ✔ |
| B:1102 [THR] | A:63 [U] | B:1102 [THR] | A:63 [U] | ✔ |
| B:1102 [THR] | A:64 [U] | B:1102 [THR] | A:64 [U] | ✔ |
| B:1102 [THR] | A:65 [A] | B:1102 [THR] | A:65 [A] | ✔ |
| B:1102 [THR] | A:66 [U] | B:1102 [THR] | A:66 [U] | ✔ |
| B:166 [GLY] | A:17 [A] | B:166 [GLY] | A:17 [G] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:495 [MET] | A:14 [U] | B:495 [MET] | A:14 [A] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:75 [ARG] | A:49 [A] | B:75 [ARG] | A:49 [A] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:407 [ASN] | A:18 [A] | B:407 [ASN] | A:18 [G] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:56 [GLY] | A:64 [U] | B:56 [GLY] | A:64 [U] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:35 [LEU] | A:80 [U] | B:35 [LEU] | A:80 [U] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:729 [GLY] | A:11 [U] | B:729 [GLY] | A:11 [G] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:403 [ARG] | A:47 [A] | B:403 [ARG] | A:47 [A] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:133 [PRO] | A:27 [G] | B:133 [PRO] | A:27 [G] | ❌ 7OX9_B_A |
| B:1123 [LYS] | A:51 [A] | B:1123 [LYS] | A:51 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:125 [GLU] | A:27 [G] | B:125 [GLU] | A:27 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:332 [LEU] | A:44 [U] | B:332 [LEU] | A:44 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:403 [ARG] | A:19 [A] | B:403 [ARG] | A:19 [A] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:519 [THR] | A:4 [A] | B:519 [THR] | A:4 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:59 [ALA] | A:12 [U] | B:59 [ALA] | A:12 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:66 [ARG] | A:63 [U] | B:66 [ARG] | A:63 [U] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:694 [MET] | A:2 [U] | B:694 [MET] | A:2 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:753 [ARG] | A:81 [G] | B:753 [ARG] | A:81 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:926 [GLN] | A:1 [A] | B:926 [GLN] | A:1 [G] | ❌ 5FQ5_B_A |
| B:1006 [SER] | A:0 [G] | B:1006 [SER] | A:0 [G] | ❌ 5FQ5_B:1006, 5FQ5_A:0 no longer at interface |
| B:1007 [GLU] | A:0 [G] | B:1007 [GLU] | A:0 [G] | ❌ 5FQ5_B:1007, 5FQ5_A:0 no longer at interface |
| B:1012 [ASP] | A:0 [G] | B:1012 [ASP] | A:0 [G] | ❌ 5FQ5_A:0 no longer at interface |
| B:783 [ARG] | A:10 [U] | B:783 [ARG] | A:10 [A] | ❌ 5FQ5_B:783, 5FQ5_A:10 no longer at interface |
| B:918 [LYS] | A:0 [G] | B:918 [LYS] | A:0 [G] | ❌ 5FQ5_B:918, 5FQ5_A:0 no longer at interface |
| B:929 [LYS] | A:0 [G] | B:929 [LYS] | A:0 [G] | ❌ 5FQ5_A:0 no longer at interface |
| B:730 [SER] | A:11 [U] | B:730 [SER] | A:11 [G] | ❌ 7OX9_B:730 no longer at interface |
| B:730 [SER] | A:12 [U] | B:730 [SER] | A:12 [G] | ❌ 7OX9_B:730 no longer at interface |
| B:461 [ARG] | A:62 [G] | B:461 [ARG] | A:62 [G] | ❌ 7OX9_B:461 no longer at interface |
| B:461 [ARG] | A:64 [U] | B:461 [ARG] | A:64 [U] | ❌ 7OX9_B:461 no longer at interface |
| B:130 [GLU] | A:28 [A] | B:130 [GLU] | A:28 [A] | ❌ 7OX9_B:130 no longer at interface |
| B:410 [ILE] | A:18 [A] | B:410 [ILE] | A:18 [G] | ❌ 7OX9_B:410 no longer at interface |
| B:31 [LYS] | A:82 [A] | B:31 [LYS] | A:82 [A] | ❌ 7OX9_B:31 no longer at interface |
| B:1197 [LYS] | A:67 [C] | B:1197 [LYS] | A:67 [C] | ❌ 5FQ5_B:1197 no longer at interface |
| B:1352 [ILE] | A:68 [A] | B:1352 [ILE] | A:68 [A] | ❌ 5FQ5_B:1352 no longer at interface |
| B:523 [GLU] | A:5 [C] | B:523 [GLU] | A:5 [C] | ❌ 5FQ5_B:523 no longer at interface |
| B:586 [ARG] | A:6 [U] | B:586 [ARG] | A:6 [C] | ❌ 5FQ5_B:586 no longer at interface |
| B:779 [GLU] | A:11 [U] | B:779 [GLU] | A:11 [G] | ❌ 5FQ5_B:779 no longer at interface |
| B:923 [GLU] | A:1 [A] | B:923 [GLU] | A:1 [G] | ❌ 5FQ5_B:923 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribonuclease H-like & His-Me finger endonucleases & CRISPR-associated endonuclease Cas9 alpha-helical lobe & CRISPR-associated endonuclease Cas9 C-terminal domain & SSHS domain in CRISPR-associated endonuclease Cas9 | 0.99 | 0.31 | 0.74 | 0.99 | 0.97 | 0.97 | 1.0 | 0.98 | 0.97 | 0.89 | 0.50 |
Other pairs involving 5FQ5_B_A or 7OX9_B_A
Total number of entries: 15