Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1F
|
4Y4O_1A
|
7K00_e
|
7K00_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1F:134 [GLY] | 1A:345 [G] | e:129 [PRO] | a:321 [U] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:344 [A] | e:163 [ASN] | a:320 [A] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:346 [A] | e:163 [ASN] | a:322 [A] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:347 [G] | e:163 [ASN] | a:323 [C] | ✔ |
1F:73 [ALA] | 1A:1301 [U] | e:68 [ALA] | a:1255 [U] | ✔ |
1F:73 [ALA] | 1A:1302 [G] | e:68 [ALA] | a:1256 [G] | ✔ |
1F:73 [ALA] | 1A:1303 [C] | e:68 [ALA] | a:1257 [C] | ✔ |
1F:140 [LEU] | 1A:344 [A] | e:135 [ALA] | a:320 [A] | ✔ |
1F:41 [LEU] | 1A:469 [A] | e:36 [ALA] | a:443 [A] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:474 [U] | e:79 [ARG] | a:448 [U] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:475 [A] | e:79 [ARG] | a:449 [A] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:1303 [C] | e:79 [ARG] | a:1257 [C] | ✔ |
1F:84 [VAL] | 1A:1304 [C] | e:79 [ARG] | a:1258 [U] | ✔ |
1F:42 [ALA] | 1A:469 [A] | e:37 [ALA] | a:443 [A] | ✔ |
1F:59 [TYR] | 1A:495 [G] | e:54 [GLY] | a:469 [G] | ✔ |
1F:59 [TYR] | 1A:845 [G] | e:54 [GLY] | a:798 [G] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:720 [C] | e:69 [ARG] | a:673 [C] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:721 [G] | e:69 [ARG] | a:674 [G] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:854 [U] | e:69 [ARG] | a:807 [U] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:1301 [U] | e:69 [ARG] | a:1255 [U] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:2082 [A] | e:69 [ARG] | a:2060 [A] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:2456 [G] | e:69 [ARG] | a:2444 [G] | ✔ |
1F:74 [ARG] | 1A:2457 [G] | e:69 [ARG] | a:2445 [2MG] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:607 [C] | e:77 [ILE] | a:584 [C] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:608 [G] | e:77 [ILE] | a:585 [G] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:720 [C] | e:77 [ILE] | a:673 [C] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:1300 [A] | e:77 [ILE] | a:1254 [A] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:1302 [G] | e:77 [ILE] | a:1256 [G] | ✔ |
1F:82 [ILE] | 1A:1303 [C] | e:77 [ILE] | a:1257 [C] | ✔ |
1F:80 [ALA] | 1A:720 [C] | e:75 [SER] | a:673 [C] | ✔ |
1F:80 [ALA] | 1A:721 [G] | e:75 [SER] | a:674 [G] | ✔ |
1F:53 [THR] | 1A:716 [G] | e:48 [THR] | a:669 [G] | ✔ |
1F:53 [THR] | 1A:848 [G] | e:48 [THR] | a:801 [G] | ✔ |
1F:97 [TYR] | 1A:470 [C] | e:92 [HIS] | a:444 [C] | ✔ |
1F:44 [ARG] | 1A:469 [A] | e:39 [ALA] | a:443 [A] | ✔ |
1F:88 [VAL] | 1A:476 [G] | e:83 [VAL] | a:450 [G] | ✔ |
1F:88 [VAL] | 1A:1294 [G] | e:83 [VAL] | a:1248 [G] | ✔ |
1F:168 [ARG] | 1A:345 [G] | e:162 [ARG] | a:321 [U] | ✔ |
1F:168 [ARG] | 1A:346 [A] | e:162 [ARG] | a:322 [A] | ✔ |
1F:168 [ARG] | 1A:364 [A] | e:162 [ARG] | a:340 [A] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:623 [G] | e:99 [LYS] | a:600 [G] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:624 [C] | e:99 [LYS] | a:601 [C] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:628 [C] | e:99 [LYS] | a:605 [G] | ✔ |
1F:104 [LYS] | 1A:629 [U] | e:99 [LYS] | a:606 [U] | ✔ |
1F:60 [SER] | 1A:494 [G] | e:55 [SER] | a:468 [G] | ✔ |
1F:60 [SER] | 1A:495 [G] | e:55 [SER] | a:469 [G] | ✔ |
1F:60 [SER] | 1A:844 [C] | e:55 [SER] | a:797 [G] | ✔ |
1F:60 [SER] | 1A:845 [G] | e:55 [SER] | a:798 [G] | ✔ |
1F:85 [GLY] | 1A:474 [U] | e:80 [SER] | a:448 [U] | ✔ |
1F:85 [GLY] | 1A:475 [A] | e:80 [SER] | a:449 [A] | ✔ |
1F:136 [THR] | 1A:344 [A] | e:131 [THR] | a:320 [A] | ✔ |
1F:136 [THR] | 1A:345 [G] | e:131 [THR] | a:321 [U] | ✔ |
1F:136 [THR] | 1A:346 [A] | e:131 [THR] | a:322 [A] | ✔ |
1F:69 [HIS] | 1A:2081 [A] | e:64 [GLY] | a:2059 [A] | ✔ |
1F:69 [HIS] | 1A:2082 [A] | e:64 [GLY] | a:2060 [A] | ✔ |
1F:83 [PHE] | 1A:1303 [C] | e:78 [TRP] | a:1257 [C] | ✔ |
1F:170 [LEU] | 1A:344 [A] | e:164 [LEU] | a:320 [A] | ✔ |
1F:170 [LEU] | 1A:347 [G] | e:164 [LEU] | a:323 [C] | ✔ |
1F:71 [GLY] | 1A:1301 [U] | e:66 [GLY] | a:1255 [U] | ✔ |
1F:71 [GLY] | 1A:2081 [A] | e:66 [GLY] | a:2059 [A] | ✔ |
1F:71 [GLY] | 1A:2082 [A] | e:66 [GLY] | a:2060 [A] | ✔ |
1F:75 [HIS] | 1A:721 [G] | e:70 [SER] | a:674 [G] | ✔ |
1F:75 [HIS] | 1A:722 [A] | e:70 [SER] | a:675 [A] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:38 [A] | e:43 [THR] | a:38 [A] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:39 [C] | e:43 [THR] | a:39 [G] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:468 [G] | e:43 [THR] | a:442 [G] | ✔ |
1F:48 [THR] | 1A:470 [C] | e:43 [THR] | a:444 [C] | ✔ |
1F:166 [ALA] | 1A:345 [G] | e:160 [ALA] | a:321 [U] | ✔ |
1F:99 [TYR] | 1A:707 [G] | e:94 [GLN] | a:660 [C] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:721 [G] | e:62 [GLN] | a:674 [G] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:722 [A] | e:62 [GLN] | a:675 [A] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:723 [A] | e:62 [GLN] | a:676 [A] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:1301 [U] | e:62 [GLN] | a:1255 [U] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:2082 [A] | e:62 [GLN] | a:2060 [A] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:2455 [C] | e:62 [GLN] | a:2443 [C] | ✔ |
1F:67 [GLN] | 1A:2456 [G] | e:62 [GLN] | a:2444 [G] | ✔ |
1F:55 [GLY] | 1A:848 [G] | e:50 [ALA] | a:801 [G] | ✔ |
1F:45 [ARG] | 1A:469 [A] | e:40 [ARG] | a:443 [A] | ✔ |
1F:45 [ARG] | 1A:470 [C] | e:40 [ARG] | a:444 [C] | ✔ |
1F:45 [ARG] | 1A:1292 [A] | e:40 [ARG] | a:1246 [A] | ✔ |
1F:54 [ARG] | 1A:720 [C] | e:49 [ARG] | a:673 [C] | ✔ |
1F:54 [ARG] | 1A:721 [G] | e:49 [ARG] | a:674 [G] | ✔ |
1F:54 [ARG] | 1A:848 [G] | e:49 [ARG] | a:801 [G] | ✔ |
1F:58 [ALA] | 1A:477 [C] | e:53 [THR] | a:451 [U] | ✔ |
1F:58 [ALA] | 1A:478 [G] | e:53 [THR] | a:452 [G] | ✔ |
1F:58 [ALA] | 1A:484 [G] | e:53 [THR] | a:458 [G] | ✔ |
1F:58 [ALA] | 1A:495 [G] | e:53 [THR] | a:469 [G] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2081 [A] | e:63 [LYS] | a:2059 [A] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2082 [A] | e:63 [LYS] | a:2060 [A] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2083 [G] | e:63 [LYS] | a:2061 [G] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2084 [A] | e:63 [LYS] | a:2062 [A] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2455 [C] | e:63 [LYS] | a:2443 [C] | ✔ |
1F:68 [LYS] | 1A:2456 [G] | e:63 [LYS] | a:2444 [G] | ✔ |
1F:101 [LEU] | 1A:630 [U] | e:96 [VAL] | a:607 [U] | ✔ |
1F:101 [LEU] | 1A:706 [C] | e:96 [VAL] | a:659 [G] | ✔ |
1F:89 [VAL] | 1A:609 [A] | e:84 [THR] | a:586 [A] | ✔ |
1F:89 [VAL] | 1A:719 [C] | e:84 [THR] | a:672 [C] | ✔ |
1F:70 [THR] | 1A:2081 [A] | e:65 [THR] | a:2059 [A] | ✔ |
1F:70 [THR] | 1A:2082 [A] | e:65 [THR] | a:2060 [A] | ✔ |
1F:29 [ASN] | 1A:622 [G] | e:24 [ASN] | a:599 [A] | ✔ |
1F:29 [ASN] | 1A:623 [G] | e:24 [ASN] | a:600 [G] | ✔ |
1F:81 [PRO] | 1A:608 [G] | e:76 [PRO] | a:585 [G] | ✔ |
1F:81 [PRO] | 1A:719 [C] | e:76 [PRO] | a:672 [C] | ✔ |
1F:81 [PRO] | 1A:720 [C] | e:76 [PRO] | a:673 [C] | ✔ |
1F:56 [GLU] | 1A:478 [G] | e:51 [GLU] | a:452 [G] | ✔ |
1F:77 [ASP] | 1A:721 [G] | e:72 [SER] | a:674 [G] | ✔ |
1F:50 [SER] | 1A:37 [C] | e:45 [ALA] | a:37 [C] | ✔ |
1F:50 [SER] | 1A:38 [A] | e:45 [ALA] | a:38 [A] | ✔ |
1F:50 [SER] | 1A:476 [G] | e:45 [ALA] | a:450 [G] | ✔ |
1F:50 [SER] | 1A:477 [C] | e:45 [ALA] | a:451 [U] | ✔ |
1F:34 [TRP] | 1A:1290 [G] | e:29 [HIS] | a:1244 [A] | ✔ |
1F:34 [TRP] | 1A:1291 [G] | e:29 [HIS] | a:1245 [G] | ✔ |
1F:40 [GLN] | 1A:640 [A] | e:35 [TYR] | a:615 [U] | ✔ |
1F:61 [GLY] | 1A:845 [G] | e:56 [GLY] | a:798 [G] | ✔ |
1F:32 [LEU] | 1A:622 [G] | e:27 [LEU] | a:599 [A] | ✔ |
1F:32 [LEU] | 1A:623 [G] | e:27 [LEU] | a:600 [G] | ✔ |
1F:100 [THR] | 1A:630 [U] | e:95 [LYS] | a:607 [U] | ✔ |
1F:100 [THR] | 1A:705 [C] | e:95 [LYS] | a:658 [U] | ✔ |
1F:100 [THR] | 1A:706 [C] | e:95 [LYS] | a:659 [G] | ✔ |
1F:65 [TRP] | 1A:1303 [C] | e:60 [TRP] | a:1257 [C] | ✔ |
1F:105 [VAL] | 1A:622 [G] | e:100 [MET] | a:599 [A] | ✔ |
1F:105 [VAL] | 1A:623 [G] | e:100 [MET] | a:600 [G] | ✔ |
1F:38 [ARG] | 1A:1291 [G] | e:33 [VAL] | a:1245 [G] | ✔ |
1F:165 [ARG] | 1A:345 [G] | e:159 [LEU] | a:321 [U] | ✔ |
1F:165 [ARG] | 1A:346 [A] | e:159 [LEU] | a:322 [A] | ✔ |
1F:57 [VAL] | 1A:478 [G] | e:52 [VAL] | a:452 [G] | ✔ |
1F:62 [ARG] | 1A:843 [C] | e:57 [LYS] | a:796 [C] | ✔ |
1F:62 [ARG] | 1A:844 [C] | e:57 [LYS] | a:797 [G] | ✔ |
1F:62 [ARG] | 1A:845 [G] | e:57 [LYS] | a:798 [G] | ✔ |
1F:95 [ARG] | 1A:612 [C] | e:90 [GLN] | a:589 [U] | ✔ |
1F:95 [ARG] | 1A:613 [A] | e:90 [GLN] | a:590 [A] | ✔ |
1F:135 [LYS] | 1A:344 [A] | e:130 [LYS] | a:320 [A] | ✔ |
1F:135 [LYS] | 1A:345 [G] | e:130 [LYS] | a:321 [U] | ✔ |
1F:106 [ARG] | 1A:642 [G] | e:101 [TYR] | a:617 [G] | ✔ |
1F:171 [PRO] | 1A:347 [G] | e:165 [HIS] | a:323 [C] | ✔ |
1F:171 [PRO] | 1A:1250 [U] | e:165 [HIS] | a:1205 [A] | ✔ |
1F:205 [ARG] | 1A:641 [G] | e:199 [MET] | a:616 [A] | ✔ |
1F:205 [ARG] | 1A:642 [G] | e:199 [MET] | a:617 [G] | ✔ |
1F:47 [GLY] | 1A:469 [A] | e:42 [GLY] | a:443 [A] | ✔ |
1F:47 [GLY] | 1A:470 [C] | e:42 [GLY] | a:444 [C] | ✔ |
1F:49 [ALA] | 1A:38 [A] | e:44 [ARG] | a:38 [A] | ✔ |
1F:49 [ALA] | 1A:468 [G] | e:44 [ARG] | a:442 [G] | ✔ |
1F:49 [ALA] | 1A:470 [C] | e:44 [ARG] | a:444 [C] | ✔ |
1F:63 [LYS] | 1A:721 [G] | e:58 [LYS] | a:674 [G] | ✔ |
1F:63 [LYS] | 1A:722 [A] | e:58 [LYS] | a:675 [A] | ✔ |
1F:63 [LYS] | 1A:723 [A] | e:58 [LYS] | a:676 [A] | ✔ |
1F:94 [PRO] | 1A:38 [A] | e:89 [PRO] | a:38 [A] | ✔ |
1F:94 [PRO] | 1A:39 [C] | e:89 [PRO] | a:39 [G] | ✔ |
1F:137 [LYS] | 1A:344 [A] | e:132 [LYS] | a:320 [A] | ✔ |
1F:137 [LYS] | 1A:345 [G] | e:132 [LYS] | a:321 [U] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:610 [C] | e:85 [PHE] | a:587 [C] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:611 [U] | e:85 [PHE] | a:588 [U] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:716 [G] | e:85 [PHE] | a:669 [G] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:718 [C] | e:85 [PHE] | a:671 [C] | ✔ |
1F:90 [PHE] | 1A:719 [C] | e:85 [PHE] | a:672 [C] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:630 [U] | e:98 [LYS] | a:607 [U] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:643 [C] | e:98 [LYS] | a:618 [G] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:644 [G] | e:98 [LYS] | a:619 [G] | ✔ |
1F:103 [LYS] | 1A:645 [G] | e:98 [LYS] | a:620 [G] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:629 [U] | e:97 [ASN] | a:606 [U] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:630 [U] | e:97 [ASN] | a:607 [U] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:705 [C] | e:97 [ASN] | a:658 [U] | ✔ |
1F:102 [PRO] | 1A:706 [C] | e:97 [ASN] | a:659 [G] | ✔ |
1F:35 [GLU] | 1A:622 [G] | e:30 [GLN] | a:599 [A] | ✔ |
1F:35 [GLU] | 1A:706 [C] | e:30 [GLN] | a:659 [G] | ✔ |
1F:35 [GLU] | 1A:707 [G] | e:30 [GLN] | a:660 [C] | ✔ |
1F:78 [ILE] | 1A:495 [G] | e:73 [ILE] | a:469 [G] | ✔ |
1F:51 [THR] | 1A:37 [C] | e:46 [GLN] | a:37 [C] | ✔ |
1F:51 [THR] | 1A:476 [G] | e:46 [GLN] | a:450 [G] | ✔ |
1F:51 [THR] | 1A:477 [C] | e:46 [GLN] | a:451 [U] | ✔ |
1F:51 [THR] | 1A:1294 [G] | e:46 [GLN] | a:1248 [G] | ✔ |
1F:179 [GLU] | 1A:641 [G] | e:173 [THR] | a:616 [A] | ✔ |
1F:76 [GLY] | 1A:721 [G] | e:71 [GLY] | a:674 [G] | ✔ |
1F:76 [GLY] | 1A:722 [A] | e:71 [GLY] | a:675 [A] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:38 [A] | e:41 [GLN] | a:38 [A] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:39 [C] | e:41 [GLN] | a:39 [G] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:467 [U] | e:41 [GLN] | a:441 [U] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:468 [G] | e:41 [GLN] | a:442 [G] | ✔ |
1F:46 [ARG] | 1A:469 [A] | e:41 [GLN] | a:443 [A] | ✔ |
1F:31 [HIS] | 1A:622 [G] | e:26 [ALA] | a:599 [A] | ✔ |
1F:107 [LYS] | 1A:642 [G] | e:102 [ARG] | a:617 [G] | ✔ |
1F:52 [LYS] | 1A:37 [C] | e:47 [LYS] | a:37 [C] | ✔ |
1F:52 [LYS] | 1A:477 [C] | e:47 [LYS] | a:451 [U] | ✔ |
1F:52 [LYS] | 1A:478 [G] | e:47 [LYS] | a:452 [G] | ✔ |
1F:86 [GLY] | 1A:475 [A] | e:81 [GLY] | a:449 [A] | ✔ |
1F:86 [GLY] | 1A:476 [G] | e:81 [GLY] | a:450 [G] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1301 [U] | e:67 [ARG] | a:1255 [U] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1302 [G] | e:67 [ARG] | a:1256 [G] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1303 [C] | e:67 [ARG] | a:1257 [C] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:1304 [C] | e:67 [ARG] | a:1258 [U] | ✔ |
1F:72 [ARG] | 1A:2082 [A] | e:67 [ARG] | a:2060 [A] | ✔ |
1F:169 [ASN] | 1A:348 [A] | e:163 [ASN] | a:324 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:39 [TRP] | 1A:641 [G] | e:34 [ALA] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:39 [TRP] | 1A:642 [G] | e:34 [ALA] | a:617 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:84 [VAL] | 1A:607 [C] | e:79 [ARG] | a:584 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:59 [TYR] | 1A:478 [G] | e:54 [GLY] | a:452 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:59 [TYR] | 1A:496 [A] | e:54 [GLY] | a:470 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:97 [TYR] | 1A:1292 [A] | e:92 [HIS] | a:1246 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:97 [TYR] | 1A:1293 [A] | e:92 [HIS] | a:1247 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:43 [LYS] | 1A:641 [G] | e:38 [GLY] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:168 [ARG] | 1A:1250 [U] | e:162 [ARG] | a:1205 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:60 [SER] | 1A:843 [C] | e:55 [SER] | a:796 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:85 [GLY] | 1A:478 [G] | e:80 [SER] | a:452 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:69 [HIS] | 1A:2084 [A] | e:64 [GLY] | a:2062 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:69 [HIS] | 1A:2455 [C] | e:64 [GLY] | a:2443 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:83 [PHE] | 1A:607 [C] | e:78 [TRP] | a:584 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:83 [PHE] | 1A:1304 [C] | e:78 [TRP] | a:1258 [U] | ❌ 7K00_e_a |
1F:170 [LEU] | 1A:1250 [U] | e:164 [LEU] | a:1205 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:75 [HIS] | 1A:720 [C] | e:70 [SER] | a:673 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:75 [HIS] | 1A:1302 [G] | e:70 [SER] | a:1256 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:75 [HIS] | 1A:1303 [C] | e:70 [SER] | a:1257 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:48 [THR] | 1A:37 [C] | e:43 [THR] | a:37 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:99 [TYR] | 1A:706 [C] | e:94 [GLN] | a:659 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:89 [VAL] | 1A:718 [C] | e:84 [THR] | a:671 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:81 [PRO] | 1A:607 [C] | e:76 [PRO] | a:584 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:177 [ALA] | 1A:640 [A] | e:171 [ASP] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e_a |
1F:50 [SER] | 1A:470 [C] | e:45 [ALA] | a:444 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:50 [SER] | 1A:1294 [G] | e:45 [ALA] | a:1248 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:34 [TRP] | 1A:707 [G] | e:29 [HIS] | a:660 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:40 [GLN] | 1A:641 [G] | e:35 [TYR] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:61 [GLY] | 1A:844 [C] | e:56 [GLY] | a:797 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:38 [ARG] | 1A:469 [A] | e:33 [VAL] | a:443 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:38 [ARG] | 1A:707 [G] | e:33 [VAL] | a:660 [C] | ❌ 7K00_e_a |
1F:38 [ARG] | 1A:708 [C] | e:33 [VAL] | a:661 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:38 [ARG] | 1A:1292 [A] | e:33 [VAL] | a:1246 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:62 [ARG] | 1A:494 [G] | e:57 [LYS] | a:468 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:95 [ARG] | 1A:1292 [A] | e:90 [GLN] | a:1246 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:95 [ARG] | 1A:1293 [A] | e:90 [GLN] | a:1247 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:135 [LYS] | 1A:343 [C] | e:130 [LYS] | a:319 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:106 [ARG] | 1A:630 [U] | e:101 [TYR] | a:607 [U] | ❌ 7K00_e_a |
1F:171 [PRO] | 1A:344 [A] | e:165 [HIS] | a:320 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:47 [GLY] | 1A:38 [A] | e:42 [GLY] | a:38 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:90 [PHE] | 1A:1294 [G] | e:85 [PHE] | a:1248 [G] | ❌ 7K00_e_a |
1F:102 [PRO] | 1A:622 [G] | e:97 [ASN] | a:599 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:179 [GLU] | 1A:640 [A] | e:173 [THR] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e_a |
1F:52 [LYS] | 1A:38 [A] | e:47 [LYS] | a:38 [A] | ❌ 7K00_e_a |
1F:105 [VAL] | 1A:706 [C] | e:100 [MET] | a:659 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:105 [VAL] | 1A:705 [C] | e:100 [MET] | a:658 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:106 [ARG] | 1A:640 [A] | e:101 [TYR] | a:615 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:106 [ARG] | 1A:641 [G] | e:101 [TYR] | a:616 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:107 [LYS] | 1A:643 [C] | e:102 [ARG] | a:618 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:137 [LYS] | 1A:343 [C] | e:132 [LYS] | a:319 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:168 [ARG] | 1A:348 [A] | e:162 [ARG] | a:324 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:169 [ASN] | 1A:343 [C] | e:163 [ASN] | a:319 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:179 [GLU] | 1A:637 [U] | e:173 [THR] | a:614 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:38 [ARG] | 1A:1290 [G] | e:33 [VAL] | a:1244 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:39 [TRP] | 1A:640 [A] | e:34 [ALA] | a:615 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:41 [LEU] | 1A:640 [A] | e:36 [ALA] | a:615 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:43 [LYS] | 1A:640 [A] | e:38 [GLY] | a:615 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:44 [ARG] | 1A:640 [A] | e:39 [ALA] | a:615 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:47 [GLY] | 1A:468 [G] | e:42 [GLY] | a:442 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:48 [THR] | 1A:467 [U] | e:43 [THR] | a:441 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:49 [ALA] | 1A:37 [C] | e:44 [ARG] | a:37 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:49 [ALA] | 1A:1293 [A] | e:44 [ARG] | a:1247 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:49 [ALA] | 1A:1294 [G] | e:44 [ARG] | a:1248 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:51 [THR] | 1A:470 [C] | e:46 [GLN] | a:444 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:54 [ARG] | 1A:719 [C] | e:49 [ARG] | a:672 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:71 [GLY] | 1A:1302 [G] | e:66 [GLY] | a:1256 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:76 [GLY] | 1A:720 [C] | e:71 [GLY] | a:673 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:82 [ILE] | 1A:719 [C] | e:77 [ILE] | a:672 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:83 [PHE] | 1A:1302 [G] | e:78 [TRP] | a:1256 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:84 [VAL] | 1A:496 [A] | e:79 [ARG] | a:470 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:88 [VAL] | 1A:475 [A] | e:83 [VAL] | a:449 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:89 [VAL] | 1A:608 [G] | e:84 [THR] | a:585 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:89 [VAL] | 1A:848 [G] | e:84 [THR] | a:801 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:89 [VAL] | 1A:716 [G] | e:84 [THR] | a:669 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:90 [PHE] | 1A:609 [A] | e:85 [PHE] | a:586 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:99 [TYR] | 1A:708 [C] | e:94 [GLN] | a:661 [A] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:100 [THR] | 1A:707 [G] | e:95 [LYS] | a:660 [C] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:100 [THR] | 1A:629 [U] | e:95 [LYS] | a:606 [U] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:102 [PRO] | 1A:623 [G] | e:97 [ASN] | a:600 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:103 [LYS] | 1A:642 [G] | e:98 [LYS] | a:617 [G] | ❌ 4Y4O_1F_1A |
1F:66 [PRO] | 1A:837 [C] | e:61 [ARG] | a:790 [U] | ❌ 7K00_e:61, 7K00_a:790 no longer at interface |
1F:41 [LEU] | 1A:1247 [C] | e:36 [ALA] | a:1202 [G] | ❌ 7K00_a:1202 no longer at interface |
1F:84 [VAL] | 1A:606 [G] | e:79 [ARG] | a:583 [G] | ❌ 7K00_a:583 no longer at interface |
1F:44 [ARG] | 1A:1247 [C] | e:39 [ALA] | a:1202 [G] | ❌ 7K00_a:1202 no longer at interface |
1F:188 [ARG] | 1A:1248 [G] | e:182 [ALA] | a:1203 [U] | ❌ 7K00_e:182, 7K00_a:1203 no longer at interface |
1F:184 [TYR] | 1A:1247 [C] | e:178 [VAL] | a:1202 [G] | ❌ 7K00_e:178, 7K00_a:1202 no longer at interface |
1F:184 [TYR] | 1A:1248 [G] | e:178 [VAL] | a:1203 [U] | ❌ 7K00_e:178, 7K00_a:1203 no longer at interface |
1F:100 [THR] | 1A:631 [A] | e:95 [LYS] | a:608 [A] | ❌ 7K00_a:608 no longer at interface |
1F:90 [PHE] | 1A:717 [A] | e:85 [PHE] | a:670 [A] | ❌ 7K00_a:670 no longer at interface |
1F:35 [GLU] | 1A:621 [G] | e:30 [GLN] | a:598 [U] | ❌ 7K00_a:598 no longer at interface |
1F:46 [ARG] | 1A:466 [G] | e:41 [GLN] | a:440 [C] | ❌ 7K00_a:440 no longer at interface |
1F:31 [HIS] | 1A:621 [G] | e:26 [ALA] | a:598 [U] | ❌ 7K00_a:598 no longer at interface |
1F:177 [ALA] | 1A:636 [G] | e:171 [ASP] | a:613 [A] | ❌ 4Y4O_1A:636 no longer at interface |
1F:179 [GLU] | 1A:636 [G] | e:173 [THR] | a:613 [A] | ❌ 4Y4O_1A:636 no longer at interface |
1F:62 [ARG] | 1A:842 [C] | e:57 [LYS] | a:795 [C] | ❌ 4Y4O_1A:842 no longer at interface |
1F:84 [VAL] | 1A:497 [A] | e:79 [ARG] | a:471 [A] | ❌ 4Y4O_1A:497 no longer at interface |
1F:84 [VAL] | 1A:498 [A] | e:79 [ARG] | a:472 [A] | ❌ 4Y4O_1A:498 no longer at interface |
1F:85 [GLY] | 1A:497 [A] | e:80 [SER] | a:471 [A] | ❌ 4Y4O_1A:497 no longer at interface |
1F:176 [LEU] | 1A:640 [A] | e:170 [ARG] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e:170 no longer at interface |
1F:185 [ASP] | 1A:640 [A] | e:179 [SER] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e:179 no longer at interface |
1F:91 [GLY] | 1A:1294 [G] | e:86 [ALA] | a:1248 [G] | ❌ 7K00_e:86 no longer at interface |
1F:182 [ASN] | 1A:640 [A] | e:176 [ASP] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e:176 no longer at interface |
1F:182 [ASN] | 1A:641 [G] | e:176 [ASP] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e:176 no longer at interface |
1F:181 [LEU] | 1A:641 [G] | e:175 [ILE] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e:175 no longer at interface |
1F:92 [PRO] | 1A:1294 [G] | e:87 [ALA] | a:1248 [G] | ❌ 7K00_e:87 no longer at interface |
1F:180 [GLY] | 1A:640 [A] | e:174 [GLY] | a:615 [U] | ❌ 7K00_e:174 no longer at interface |
1F:180 [GLY] | 1A:641 [G] | e:174 [GLY] | a:616 [A] | ❌ 7K00_e:174 no longer at interface |
1F:108 [LYS] | 1A:623 [G] | e:103 [GLY] | a:600 [G] | ❌ 7K00_e:103 no longer at interface |
1F:108 [LYS] | 1A:624 [C] | e:103 [GLY] | a:601 [C] | ❌ 7K00_e:103 no longer at interface |
1F:172 [TRP] | 1A:1250 [U] | e:166 [LYS] | a:1205 [A] | ❌ 4Y4O_1F:172 no longer at interface |
1F:26 [ALA] | 1A:624 [C] | e:21 [ARG] | a:601 [C] | ❌ 4Y4O_1F:26 no longer at interface |
1F:79 [GLY] | 1A:848 [G] | e:74 [LYS] | a:801 [G] | ❌ 4Y4O_1F:79 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L4 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.96 | 1.16 | 0.47 | 0.91 | 0.96 | 0.96 | 0.95 | 0.77 | 0.68 | 0.53 | 0.28 |
Other pairs involving 4Y4O_1F_1A or 7K00_e_a
Total number of entries: 17