RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group30 > 7D3J_A_B vs 7EU9_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

7D3J_A
7D3J_B
7EU9_A
7EU9_B
Conserved?
A:859 [LYS] B:10 [C] A:859 [LYS] B:10 [C] ✔
A:859 [LYS] B:11 [C] A:859 [LYS] B:11 [C] ✔
A:509 [TYR] B:3 [U] A:509 [TYR] B:3 [U] ✔
A:509 [TYR] B:4 [U] A:509 [TYR] B:4 [U] ✔
A:509 [TYR] B:5 [U] A:509 [TYR] B:5 [U] ✔
A:509 [TYR] B:6 [U] A:509 [TYR] B:6 [U] ✔
A:594 [ARG] B:18 [U] A:594 [ARG] B:18 [U] ✔
A:594 [ARG] B:19 [G] A:594 [ARG] B:19 [G] ✔
A:594 [ARG] B:20 [G] A:594 [ARG] B:20 [G] ✔
A:866 [SER] B:9 [G] A:866 [SER] B:9 [G] ✔
A:866 [SER] B:10 [C] A:866 [SER] B:10 [C] ✔
A:570 [LEU] B:18 [U] A:570 [LEU] B:18 [U] ✔
A:464 [GLN] B:31 [G] A:464 [GLN] B:31 [G] ✔
A:464 [GLN] B:32 [A] A:464 [GLN] B:32 [A] ✔
A:22 [ARG] B:1 [A] A:22 [ARG] B:1 [A] ✔
A:22 [ARG] B:2 [U] A:22 [ARG] B:2 [U] ✔
A:863 [LYS] B:10 [C] A:863 [LYS] B:10 [C] ✔
A:863 [LYS] B:11 [C] A:863 [LYS] B:11 [C] ✔
A:578 [ILE] B:18 [U] A:578 [ILE] B:18 [U] ✔
A:578 [ILE] B:19 [G] A:578 [ILE] B:19 [G] ✔
A:700 [TYR] B:12 [C] A:700 [TYR] B:12 [C] ✔
A:700 [TYR] B:13 [A] A:700 [TYR] B:13 [A] ✔
A:489 [ILE] B:1 [A] A:489 [ILE] B:1 [A] ✔
A:507 [ASP] B:2 [U] A:507 [ASP] B:2 [U] ✔
A:507 [ASP] B:3 [U] A:507 [ASP] B:3 [U] ✔
A:507 [ASP] B:4 [U] A:507 [ASP] B:4 [U] ✔
A:497 [HIS] B:1 [A] A:497 [HIS] B:1 [A] ✔
A:497 [HIS] B:2 [U] A:497 [HIS] B:2 [U] ✔
A:470 [ILE] B:28 [A] A:470 [ILE] B:28 [A] ✔
A:470 [ILE] B:29 [A] A:470 [ILE] B:29 [A] ✔
A:588 [VAL] B:6 [U] A:588 [VAL] B:6 [U] ✔
A:588 [VAL] B:7 [G] A:588 [VAL] B:7 [G] ✔
A:901 [LYS] B:32 [A] A:901 [LYS] B:32 [A] ✔
A:901 [LYS] B:33 [A] A:901 [LYS] B:33 [A] ✔
A:689 [GLN] B:19 [G] A:689 [GLN] B:19 [G] ✔
A:689 [GLN] B:20 [G] A:689 [GLN] B:20 [G] ✔
A:467 [ASN] B:29 [A] A:467 [ASN] B:29 [A] ✔
A:467 [ASN] B:30 [G] A:467 [ASN] B:30 [G] ✔
A:691 [ARG] B:14 [U] A:691 [ARG] B:14 [U] ✔
A:691 [ARG] B:17 [U] A:691 [ARG] B:17 [U] ✔
A:530 [ALA] B:3 [U] A:530 [ALA] B:3 [U] ✔
A:498 [ASN] B:2 [U] A:498 [ASN] B:2 [U] ✔
A:585 [LEU] B:5 [U] A:585 [LEU] B:5 [U] ✔
A:585 [LEU] B:6 [U] A:585 [LEU] B:6 [U] ✔
A:873 [ASN] B:22 [A] A:873 [ASN] B:22 [A] ✔
A:873 [ASN] B:23 [C] A:873 [ASN] B:23 [C] ✔
A:909 [ASN] B:33 [A] A:909 [ASN] B:33 [A] ✔
A:909 [ASN] B:34 [U] A:909 [ASN] B:34 [U] ✔
A:819 [GLY] B:36 [G] A:819 [GLY] B:36 [G] ✔
A:819 [GLY] B:37 [A] A:819 [GLY] B:37 [A] ✔
A:494 [LYS] B:2 [U] A:494 [LYS] B:2 [U] ✔
A:494 [LYS] B:3 [U] A:494 [LYS] B:3 [U] ✔
A:583 [VAL] B:16 [G] A:583 [VAL] B:16 [G] ✔
A:869 [GLU] B:22 [A] A:869 [GLU] B:22 [A] ✔
A:869 [GLU] B:23 [C] A:869 [GLU] B:23 [C] ✔
A:869 [GLU] B:25 [A] A:869 [GLU] B:25 [A] ✔
A:905 [LYS] B:34 [U] A:905 [LYS] B:34 [U] ✔
A:460 [LYS] B:32 [A] A:460 [LYS] B:32 [A] ✔
A:493 [ASP] B:1 [A] A:493 [ASP] B:1 [A] ✔
A:765 [GLN] B:35 [G] A:765 [GLN] B:35 [G] ✔
A:765 [GLN] B:36 [G] A:765 [GLN] B:36 [G] ✔
A:707 [TYR] B:13 [A] A:707 [TYR] B:13 [A] ✔
A:811 [LYS] B:35 [G] A:811 [LYS] B:35 [G] ✔
A:865 [LYS] B:8 [U] A:865 [LYS] B:8 [U] ✔
A:865 [LYS] B:23 [C] A:865 [LYS] B:23 [C] ✔
A:865 [LYS] B:25 [A] A:865 [LYS] B:25 [A] ✔
A:579 [ARG] B:18 [U] A:579 [ARG] B:18 [U] ✔
A:11 [THR] B:24 [U] A:11 [THR] B:24 [U] ✔
A:697 [GLN] B:10 [C] A:697 [GLN] B:10 [C] ✔
A:697 [GLN] B:11 [C] A:697 [GLN] B:11 [C] ✔
A:697 [GLN] B:20 [G] A:697 [GLN] B:20 [G] ✔
A:17 [THR] B:7 [G] A:17 [THR] B:7 [G] ✔
A:569 [ALA] B:18 [U] A:569 [ALA] B:18 [U] ✔
A:539 [GLU] B:23 [C] A:539 [GLU] B:23 [C] ✔
A:798 [SER] B:11 [C] A:798 [SER] B:11 [C] ✔
A:798 [SER] B:12 [C] A:798 [SER] B:12 [C] ✔
A:688 [SER] B:11 [C] A:688 [SER] B:11 [C] ✔
A:688 [SER] B:20 [G] A:688 [SER] B:20 [G] ✔
A:688 [SER] B:21 [C] A:688 [SER] B:21 [C] ✔
A:315 [MET] B:29 [A] A:315 [MSE] B:29 [A] ✔
A:900 [THR] B:32 [A] A:900 [THR] B:32 [A] ✔
A:900 [THR] B:33 [A] A:900 [THR] B:33 [A] ✔
A:695 [TYR] B:11 [C] A:695 [TYR] B:11 [C] ✔
A:695 [TYR] B:12 [C] A:695 [TYR] B:12 [C] ✔
A:695 [TYR] B:13 [A] A:695 [TYR] B:13 [A] ✔
A:533 [SER] B:7 [G] A:533 [SER] B:7 [G] ✔
A:797 [SER] B:11 [C] A:797 [SER] B:11 [C] ✔
A:797 [SER] B:12 [C] A:797 [SER] B:12 [C] ✔
A:16 [THR] B:7 [G] A:16 [THR] B:7 [G] ✔
A:16 [THR] B:8 [U] A:16 [THR] B:8 [U] ✔
A:16 [THR] B:25 [A] A:16 [THR] B:25 [A] ✔
A:769 [ARG] B:36 [G] A:769 [ARG] B:36 [G] ✔
A:769 [ARG] B:37 [A] A:769 [ARG] B:37 [A] ✔
A:126 [HIS] B:30 [G] A:126 [HIS] B:30 [G] ✔
A:799 [LEU] B:10 [C] A:799 [LEU] B:10 [C] ✔
A:799 [LEU] B:11 [C] A:799 [LEU] B:11 [C] ✔
A:586 [ARG] B:16 [G] A:586 [ARG] B:16 [G] ✔
A:586 [ARG] B:19 [G] A:586 [ARG] B:19 [G] ✔
A:795 [LYS] B:12 [C] A:795 [LYS] B:12 [C] ✔
A:795 [LYS] B:15 [C] A:795 [LYS] B:15 [C] ✔
A:465 [LYS] B:30 [G] A:465 [LYS] B:30 [G] ✔
A:465 [LYS] B:31 [G] A:465 [LYS] B:31 [G] ✔
A:589 [LYS] B:5 [U] A:589 [LYS] B:5 [U] ✔
A:687 [GLU] B:20 [G] A:687 [GLU] B:20 [G] ✔
A:791 [LEU] B:13 [A] A:791 [LEU] B:13 [A] ✔
A:796 [LEU] B:12 [C] A:796 [LEU] B:12 [C] ✔
A:796 [LEU] B:13 [A] A:796 [LEU] B:13 [A] ✔
A:796 [LEU] B:15 [C] A:796 [LEU] B:15 [C] ✔
A:511 [TRP] B:1 [A] A:511 [TRP] B:1 [A] ✔
A:511 [TRP] B:2 [U] A:511 [TRP] B:2 [U] ✔
A:511 [TRP] B:3 [U] A:511 [TRP] B:3 [U] ✔
A:431 [GLN] B:42 [A] A:431 [GLN] B:42 [A] ✔
A:590 [LYS] B:18 [U] A:590 [LYS] B:18 [U] ✔
A:590 [LYS] B:19 [G] A:590 [LYS] B:19 [G] ✔
A:590 [LYS] B:20 [G] A:590 [LYS] B:20 [G] ✔
A:926 [GLU] B:24 [U] A:926 [GLU] B:24 [U] ✔
A:354 [GLU] B:41 [U] A:354 [GLU] B:41 [U] ✔
A:812 [SER] B:35 [G] A:812 [SER] B:35 [G] ✔
A:812 [SER] B:36 [G] A:812 [SER] B:36 [G] ✔
A:627 [THR] B:25 [A] A:627 [THR] B:25 [A] ✔
A:14 [ALA] B:24 [U] A:14 [ALA] B:24 [U] ✔
A:14 [ALA] B:25 [A] A:14 [ALA] B:25 [A] ✔
A:568 [PRO] B:18 [U] A:568 [PRO] B:18 [U] ✔
A:472 [LYS] B:27 [U] A:472 [LYS] B:27 [U] ✔
A:625 [GLU] B:26 [U] A:625 [GLU] B:26 [U] ✔
A:471 [GLN] B:27 [U] A:471 [GLN] B:27 [U] ✔
A:471 [GLN] B:28 [A] A:471 [GLN] B:28 [A] ✔
A:591 [ARG] B:7 [G] A:591 [ARG] B:7 [G] ✔
A:591 [ARG] B:8 [U] A:591 [ARG] B:8 [U] ✔
A:591 [ARG] B:9 [G] A:591 [ARG] B:9 [G] ✔
A:591 [ARG] B:22 [A] A:591 [ARG] B:22 [A] ✔
A:591 [ARG] B:23 [C] A:591 [ARG] B:23 [C] ✔
A:904 [LYS] B:34 [U] A:904 [LYS] B:34 [U] ✔
A:356 [ASP] B:40 [A] A:356 [ASP] B:40 [A] ✔
A:870 [VAL] B:22 [A] A:870 [VAL] B:22 [A] ✔
A:575 [ILE] B:18 [U] A:575 [ILE] B:18 [U] ✔
A:686 [VAL] B:21 [C] A:686 [VAL] B:21 [C] ✔
A:532 [SER] B:6 [U] A:532 [SER] B:6 [U] ✔
A:532 [SER] B:7 [G] A:532 [SER] B:7 [G] ✔
A:862 [ASN] B:9 [G] A:862 [ASN] B:9 [G] ✔
A:862 [ASN] B:10 [C] A:862 [ASN] B:10 [C] ✔
A:13 [LYS] B:24 [U] A:13 [LYS] B:24 [U] ✔
A:754 [TYR] B:11 [C] A:754 [TYR] B:11 [C] ✔
A:754 [TYR] B:12 [C] A:754 [TYR] B:12 [C] ✔
A:754 [TYR] B:13 [A] A:754 [TYR] B:13 [A] ✔
A:528 [HIS] B:1 [A] A:528 [HIS] B:1 [A] ✔
A:12 [ARG] B:24 [U] A:12 [ARG] B:24 [U] ✔
A:466 [ILE] B:30 [G] A:466 [ILE] B:30 [G] ✔
A:910 [SER] B:34 [U] A:910 [SER] B:34 [U] ✔
A:910 [SER] B:35 [G] A:910 [SER] B:35 [G] ✔
A:20 [ILE] B:3 [U] A:20 [ILE] B:3 [U] ✔
A:20 [ILE] B:6 [U] A:20 [ILE] B:6 [U] ✔
A:816 [THR] B:36 [G] A:816 [THR] B:36 [G] ✔
A:816 [THR] B:37 [A] A:816 [THR] B:37 [A] ✔
A:823 [LYS] B:37 [A] A:823 [LYS] B:37 [A] ✔
A:823 [LYS] B:38 [A] A:823 [LYS] B:38 [A] ✔
A:508 [ASN] B:4 [U] A:508 [ASN] B:4 [U] ✔
A:318 [LYS] B:29 [A] A:318 [LYS] B:29 [A] ✔
A:318 [LYS] B:30 [G] A:318 [LYS] B:30 [G] ✔
A:503 [ARG] B:1 [A] A:503 [ARG] B:1 [A] ✔
A:503 [ARG] B:2 [U] A:503 [ARG] B:2 [U] ✔
A:503 [ARG] B:4 [U] A:503 [ARG] B:4 [U] ✔
A:703 [VAL] B:13 [A] A:703 [VAL] B:13 [A] ✔
A:690 [VAL] B:11 [C] A:690 [VAL] B:11 [C] ✔
A:690 [VAL] B:12 [C] A:690 [VAL] B:12 [C] ✔
A:690 [VAL] B:16 [G] A:690 [VAL] B:16 [G] ✔
A:690 [VAL] B:17 [U] A:690 [VAL] B:17 [U] ✔
A:690 [VAL] B:19 [G] A:690 [VAL] B:19 [G] ✔
A:927 [MET] B:23 [C] A:927 [MSE] B:23 [C] ✔
A:927 [MET] B:24 [U] A:927 [MSE] B:24 [U] ✔
A:560 [LYS] B:21 [C] A:560 [LYS] B:21 [C] ✔
A:560 [LYS] B:22 [A] A:560 [LYS] B:22 [A] ✔
A:820 [HIS] B:37 [A] A:820 [HIS] B:37 [A] ✔
A:820 [HIS] B:38 [A] A:820 [HIS] B:38 [A] ✔
A:693 [LYS] B:13 [A] A:693 [LYS] B:13 [A] ✔
A:693 [LYS] B:14 [U] A:693 [LYS] B:14 [U] ✔
A:18 [LYS] B:6 [U] A:18 [LYS] B:6 [U] ✔
A:18 [LYS] B:7 [G] A:18 [LYS] B:7 [G] ✔
A:906 [SER] B:34 [U] A:906 [SER] B:34 [U] ✔
A:906 [SER] B:35 [G] A:906 [SER] B:35 [G] ✔
A:475 [SER] B:26 [U] A:475 [SER] B:26 [U] ✔
A:534 [THR] B:6 [U] A:534 [THR] B:6 [U] ✔
A:534 [THR] B:7 [G] A:534 [THR] B:7 [G] ✔
A:561 [THR] B:23 [C] A:561 [THR] B:23 [C] ✔
A:473 [TYR] B:27 [U] A:473 [TYR] B:27 [U] ✔
A:473 [TYR] B:28 [A] A:473 [TYR] B:28 [A] ✔
A:790 [LYS] B:13 [A] A:790 [LYS] B:13 [A] ✔
A:902 [LYS] B:32 [A] A:902 [LYS] B:32 [A] ✔
A:902 [LYS] B:33 [A] A:902 [LYS] B:33 [A] ✔
A:620 [ARG] B:26 [U] A:620 [ARG] B:26 [U] ✔
A:620 [ARG] B:27 [U] A:620 [ARG] B:27 [U] ✔
A:620 [ARG] B:28 [A] A:620 [ARG] B:28 [A] ✔
A:913 [MET] B:33 [A] A:913 [MSE] B:33 [A] ✔
A:913 [MET] B:34 [U] A:913 [MSE] B:34 [U] ✔
A:815 [GLY] B:36 [G] A:815 [GLY] B:36 [G] ✔
A:468 [PRO] B:29 [A] A:468 [PRO] B:29 [A] ✔
A:468 [PRO] B:30 [G] A:468 [PRO] B:30 [G] ✔
A:567 [LYS] B:21 [C] A:567 [LYS] B:21 [C] ✔
A:355 [SER] B:40 [A] A:355 [SER] B:40 [A] ✔
A:535 [ARG] B:7 [G] A:535 [ARG] B:7 [G] ✔
A:535 [ARG] B:23 [C] A:535 [ARG] B:23 [C] ✔
A:535 [ARG] B:24 [U] A:535 [ARG] B:24 [U] ✔
A:535 [ARG] B:25 [A] A:535 [ARG] B:25 [A] ✔
A:582 [PRO] B:5 [U] A:582 [PRO] B:5 [U] ✔
A:463 [LYS] B:31 [G] A:463 [LYS] B:31 [G] ✔
A:463 [LYS] B:32 [A] A:463 [LYS] B:32 [A] ✔
A:584 [GLY] B:6 [U] A:584 [GLY] B:6 [U] ✔
A:587 [LYS] B:9 [G] A:587 [LYS] B:9 [G] ✔
A:587 [LYS] B:10 [C] A:587 [LYS] B:10 [C] ✔
A:587 [LYS] B:11 [C] A:587 [LYS] B:11 [C] ✔
A:587 [LYS] B:19 [G] A:587 [LYS] B:19 [G] ✔
A:587 [LYS] B:20 [G] A:587 [LYS] B:20 [G] ✔
A:587 [LYS] B:21 [C] A:587 [LYS] B:21 [C] ✔
A:923 [LYS] B:23 [C] A:923 [LYS] B:23 [C] ✔
A:923 [LYS] B:24 [U] A:923 [LYS] B:24 [U] ✔
A:901 [LYS] B:34 [U] A:901 [LYS] B:34 [U] ❌ 7EU9_A_B
A:691 [ARG] B:16 [G] A:691 [ARG] B:16 [G] ❌ 7EU9_A_B
A:460 [LYS] B:31 [G] A:460 [LYS] B:31 [G] ❌ 7EU9_A_B
A:811 [LYS] B:34 [U] A:811 [LYS] B:34 [U] ❌ 7EU9_A_B
A:688 [SER] B:19 [G] A:688 [SER] B:19 [G] ❌ 7EU9_A_B
A:687 [GLU] B:21 [C] A:687 [GLU] B:21 [C] ❌ 7EU9_A_B
A:431 [GLN] B:43 [G] A:431 [GLN] B:43 [G] ❌ 7EU9_A_B
A:354 [GLU] B:40 [A] A:354 [GLU] B:40 [A] ❌ 7EU9_A_B
A:354 [GLU] B:42 [A] A:354 [GLU] B:42 [A] ❌ 7EU9_A_B
A:592 [GLN] B:5 [U] A:592 [GLN] B:5 [U] ❌ 7EU9_A_B
A:472 [LYS] B:28 [A] A:472 [LYS] B:28 [A] ❌ 7EU9_A_B
A:820 [HIS] B:36 [G] A:820 [HIS] B:36 [G] ❌ 7EU9_A_B
A:923 [LYS] B:25 [A] A:923 [LYS] B:25 [A] ❌ 7EU9_A_B
A:18 [LYS] B:5 [U] A:18 [LYS] B:5 [U] ❌ 7D3J_A_B
A:355 [SER] B:41 [U] A:355 [SER] B:41 [U] ❌ 7D3J_A_B
A:561 [THR] B:22 [A] A:561 [THR] B:22 [A] ❌ 7D3J_A_B
A:567 [LYS] B:20 [G] A:567 [LYS] B:20 [G] ❌ 7D3J_A_B
A:592 [GLN] B:7 [G] A:592 [GLN] B:7 [G] ❌ 7D3J_A_B
A:690 [VAL] B:14 [U] A:690 [VAL] B:14 [U] ❌ 7D3J_A_B
A:697 [GLN] B:21 [C] A:697 [GLN] B:21 [C] ❌ 7D3J_A_B
A:790 [LYS] B:14 [U] A:790 [LYS] B:14 [U] ❌ 7D3J_A_B
A:790 [LYS] B:12 [C] A:790 [LYS] B:12 [C] ❌ 7D3J_A_B
A:790 [LYS] B:15 [C] A:790 [LYS] B:15 [C] ❌ 7D3J_A_B
A:859 [LYS] B:9 [G] A:859 [LYS] B:9 [G] ❌ 7D3J_A_B
A:870 [VAL] B:21 [C] A:870 [VAL] B:21 [C] ❌ 7D3J_A_B
A:808 [LYS] B:34 [U] A:808 [LYS] B:34 [U] ❌ 7EU9_A:808 no longer at interface
A:629 [ALA] B:24 [U] A:629 [ALA] B:24 [U] ❌ 7EU9_A:629 no longer at interface
A:702 [GLY] B:13 [A] A:702 [GLY] B:13 [A] ❌ 7EU9_A:702 no longer at interface
A:415 [ASN] B:43 [G] A:415 [ASN] B:43 [G] ❌ 7EU9_A:415 no longer at interface
A:125 [LYS] B:30 [G] A:125 [LYS] B:30 [G] ❌ 7D3J_A:125 no longer at interface
A:426 [LYS] B:34 [U] A:426 [LYS] B:34 [U] ❌ 7D3J_A:426 no longer at interface
A:430 [VAL] B:42 [A] A:430 [VAL] B:42 [A] ❌ 7D3J_A:430 no longer at interface
A:501 [CYS] B:1 [A] A:501 [CYS] B:1 [A] ❌ 7D3J_A:501 no longer at interface
A:729 [ASP] B:43 [G] A:729 [ASP] B:43 [G] ❌ 7D3J_A:729 no longer at interface
A:730 [ASN] B:43 [G] A:730 [ASN] B:43 [G] ❌ 7D3J_A:730 no longer at interface
A:907 [SER] B:35 [G] A:907 [SER] B:35 [G] ❌ 7D3J_A:907 no longer at interface
A:930 [MET] B:24 [U] A:930 [MSE] B:24 [U] ❌ 7D3J_A:930 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
1.0 0.3 0.94 1.0 0.95 0.97 1.0 0.98 0.96 0.71 0.32


Other pairs involving 7D3J_A_B or 7EU9_A_B

Total number of entries: 1

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
7D3J_A_B 7EU9_A_B 0.98 1.0 0.3 0.94 compare