Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6S0X_i
|
6S0X_a
|
7RYG_i
|
7RYG_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
i:120 [LEU] | a:1377 [U] | i:115 [GLY] | a:1364 [C] | ✔ |
i:132 [ARG] | a:975 [G] | i:128 [ARG] | a:963 [2MG] | ✔ |
i:108 [ARG] | a:1128 [A] | i:104 [ARG] | a:1114 [U] | ✔ |
i:108 [ARG] | a:1129 [A] | i:104 [ARG] | a:1115 [U] | ✔ |
i:108 [ARG] | a:1189 [A] | i:104 [ARG] | a:1176 [A] | ✔ |
i:118 [PRO] | a:1378 [A] | i:114 [LEU] | a:1365 [G] | ✔ |
i:113 [LYS] | a:1357 [G] | i:109 [VAL] | a:1344 [G] | ✔ |
i:113 [LYS] | a:1358 [U] | i:109 [VAL] | a:1345 [U] | ✔ |
i:113 [LYS] | a:1380 [G] | i:109 [VAL] | a:1367 [G] | ✔ |
i:113 [LYS] | a:1381 [G] | i:109 [VAL] | a:1368 [G] | ✔ |
i:73 [GLY] | a:1259 [C] | i:69 [GLY] | a:1246 [C] | ✔ |
i:73 [GLY] | a:1381 [G] | i:69 [GLY] | a:1368 [G] | ✔ |
i:19 [ALA] | a:1159 [C] | i:14 [THR] | a:1146 [U] | ✔ |
i:10 [GLY] | a:1158 [U] | i:7 [THR] | a:1145 [U] | ✔ |
i:74 [PHE] | a:1258 [A] | i:70 [ILE] | a:1245 [A] | ✔ |
i:74 [PHE] | a:1259 [C] | i:70 [ILE] | a:1246 [C] | ✔ |
i:74 [PHE] | a:1299 [A] | i:70 [ILE] | a:1286 [A] | ✔ |
i:74 [PHE] | a:1381 [G] | i:70 [ILE] | a:1368 [G] | ✔ |
i:14 [ARG] | a:1357 [G] | i:11 [LYS] | a:1344 [G] | ✔ |
i:115 [ARG] | a:1378 [A] | i:111 [ARG] | a:1365 [G] | ✔ |
i:115 [ARG] | a:1379 [C] | i:111 [ARG] | a:1366 [C] | ✔ |
i:112 [MET] | a:1127 [U] | i:108 [GLU] | a:1113 [U] | ✔ |
i:112 [MET] | a:1357 [G] | i:108 [GLU] | a:1344 [G] | ✔ |
i:72 [GLY] | a:1259 [C] | i:68 [GLY] | a:1246 [C] | ✔ |
i:72 [GLY] | a:1260 [A] | i:68 [GLY] | a:1247 [A] | ✔ |
i:72 [GLY] | a:1381 [G] | i:68 [GLY] | a:1368 [G] | ✔ |
i:17 [SER] | a:1381 [G] | i:12 [THR] | a:1368 [G] | ✔ |
i:117 [LYS] | a:1196 [G] | i:113 [LYS] | a:1183 [G] | ✔ |
i:117 [LYS] | a:1197 [G] | i:113 [LYS] | a:1184 [G] | ✔ |
i:98 [GLY] | a:1187 [G] | i:97 [ARG] | a:1174 [G] | ✔ |
i:121 [LYS] | a:1377 [U] | i:116 [LEU] | a:1364 [C] | ✔ |
i:77 [GLN] | a:1259 [C] | i:73 [GLN] | a:1246 [C] | ✔ |
i:77 [GLN] | a:1260 [A] | i:73 [GLN] | a:1247 [A] | ✔ |
i:68 [ASN] | a:1141 [A] | i:64 [THR] | a:1127 [A] | ✔ |
i:87 [ARG] | a:1129 [A] | i:83 [ARG] | a:1115 [U] | ✔ |
i:87 [ARG] | a:1130 [G] | i:83 [ARG] | a:1116 [C] | ✔ |
i:128 [GLN] | a:1242 [U] | i:124 [GLN] | a:1229 [U] | ✔ |
i:128 [GLN] | a:1243 [G] | i:124 [GLN] | a:1230 [G] | ✔ |
i:128 [GLN] | a:1352 [C] | i:124 [GLN] | a:1339 [C] | ✔ |
i:106 [LEU] | a:1189 [A] | i:102 [VAL] | a:1176 [A] | ✔ |
i:42 [PRO] | a:1301 [U] | i:39 [ARG] | a:1288 [C] | ✔ |
i:123 [ALA] | a:1358 [U] | i:119 [ALA] | a:1345 [U] | ✔ |
i:123 [ALA] | a:1359 [A] | i:119 [ALA] | a:1346 [A] | ✔ |
i:111 [ARG] | a:1356 [A] | i:107 [ARG] | a:1343 [A] | ✔ |
i:111 [ARG] | a:1357 [G] | i:107 [ARG] | a:1344 [G] | ✔ |
i:71 [GLY] | a:1260 [A] | i:67 [GLY] | a:1247 [A] | ✔ |
i:71 [GLY] | a:1261 [A] | i:67 [GLY] | a:1248 [A] | ✔ |
i:116 [LYS] | a:1377 [U] | i:112 [LYS] | a:1364 [C] | ✔ |
i:116 [LYS] | a:1378 [A] | i:112 [LYS] | a:1365 [G] | ✔ |
i:116 [LYS] | a:1379 [C] | i:112 [LYS] | a:1366 [C] | ✔ |
i:131 [LYS] | a:975 [G] | i:127 [LYS] | a:963 [2MG] | ✔ |
i:131 [LYS] | a:976 [C] | i:127 [LYS] | a:964 [5MC] | ✔ |
i:107 [THR] | a:1189 [A] | i:103 [THR] | a:1176 [A] | ✔ |
i:107 [THR] | a:1190 [A] | i:103 [THR] | a:1177 [A] | ✔ |
i:130 [SER] | a:979 [C] | i:126 [SER] | a:967 [C] | ✔ |
i:130 [SER] | a:1241 [G] | i:126 [SER] | a:1228 [G] | ✔ |
i:130 [SER] | a:1242 [U] | i:126 [SER] | a:1229 [U] | ✔ |
i:76 [GLY] | a:1382 [U] | i:72 [GLY] | a:1369 [U] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1353 [G] | i:120 [ARG] | a:1340 [G] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1354 [C] | i:120 [ARG] | a:1341 [C] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1355 [U] | i:120 [ARG] | a:1342 [U] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1358 [U] | i:120 [ARG] | a:1345 [U] | ✔ |
i:124 [ARG] | a:1359 [A] | i:120 [ARG] | a:1346 [A] | ✔ |
i:66 [LEU] | a:1141 [A] | i:62 [TYR] | a:1127 [A] | ✔ |
i:12 [GLY] | a:1129 [A] | i:9 [ARG] | a:1115 [U] | ✔ |
i:126 [SER] | a:1353 [G] | i:122 [ARG] | a:1340 [G] | ✔ |
i:126 [SER] | a:1354 [C] | i:122 [ARG] | a:1341 [C] | ✔ |
i:129 [PHE] | a:1242 [U] | i:125 [PHE] | a:1229 [U] | ✔ |
i:129 [PHE] | a:1352 [C] | i:125 [PHE] | a:1339 [C] | ✔ |
i:129 [PHE] | a:1353 [G] | i:125 [PHE] | a:1340 [G] | ✔ |
i:75 [THR] | a:1382 [U] | i:71 [GLY] | a:1369 [U] | ✔ |
i:75 [THR] | a:1383 [G] | i:71 [GLY] | a:1370 [G] | ✔ |
i:21 [VAL] | a:1158 [U] | i:16 [ARG] | a:1145 [U] | ✔ |
i:125 [ARG] | a:1353 [G] | i:121 [LYS] | a:1340 [G] | ✔ |
i:125 [ARG] | a:1354 [C] | i:121 [LYS] | a:1341 [C] | ✔ |
i:125 [ARG] | a:1359 [A] | i:121 [LYS] | a:1346 [A] | ✔ |
i:114 [GLU] | a:1357 [G] | i:110 [GLU] | a:1344 [G] | ✔ |
i:114 [GLU] | a:1358 [U] | i:110 [GLU] | a:1345 [U] | ✔ |
i:70 [HIS] | a:1139 [C] | i:66 [LYS] | a:1125 [C] | ✔ |
i:108 [ARG] | a:1190 [A] | i:104 [ARG] | a:1177 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
i:113 [LYS] | a:1383 [G] | i:109 [VAL] | a:1370 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
i:73 [GLY] | a:1260 [A] | i:69 [GLY] | a:1247 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
i:73 [GLY] | a:1380 [G] | i:69 [GLY] | a:1367 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
i:115 [ARG] | a:1358 [U] | i:111 [ARG] | a:1345 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:115 [ARG] | a:1377 [U] | i:111 [ARG] | a:1364 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
i:112 [MET] | a:1128 [A] | i:108 [GLU] | a:1114 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:72 [GLY] | a:1261 [A] | i:68 [GLY] | a:1248 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
i:72 [GLY] | a:1380 [G] | i:68 [GLY] | a:1367 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
i:13 [ARG] | a:1128 [A] | i:10 [ARG] | a:1114 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:13 [ARG] | a:1129 [A] | i:10 [ARG] | a:1115 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:13 [ARG] | a:1130 [G] | i:10 [ARG] | a:1116 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
i:68 [ASN] | a:1139 [C] | i:64 [THR] | a:1125 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
i:68 [ASN] | a:1140 [C] | i:64 [THR] | a:1126 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
i:87 [ARG] | a:1189 [A] | i:83 [ARG] | a:1176 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
i:128 [GLN] | a:1353 [G] | i:124 [GLN] | a:1340 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
i:42 [PRO] | a:1258 [A] | i:39 [ARG] | a:1245 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
i:131 [LYS] | a:979 [C] | i:127 [LYS] | a:967 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
i:107 [THR] | a:1129 [A] | i:103 [THR] | a:1115 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:76 [GLY] | a:1381 [G] | i:72 [GLY] | a:1368 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
i:69 [VAL] | a:1140 [C] | i:65 [VAL] | a:1126 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
i:34 [ASN] | a:1141 [A] | i:31 [ARG] | a:1127 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
i:75 [THR] | a:1259 [C] | i:71 [GLY] | a:1246 [C] | ❌ 7RYG_i_a |
i:75 [THR] | a:1381 [G] | i:71 [GLY] | a:1368 [G] | ❌ 7RYG_i_a |
i:109 [ASP] | a:1128 [A] | i:105 [ASP] | a:1114 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:109 [ASP] | a:1129 [A] | i:105 [ASP] | a:1115 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:122 [ALA] | a:1359 [A] | i:117 [ARG] | a:1346 [A] | ❌ 7RYG_i_a |
i:70 [HIS] | a:1159 [C] | i:66 [LYS] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i_a |
i:13 [ARG] | a:1357 [G] | i:10 [ARG] | a:1344 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:109 [ASP] | a:1357 [G] | i:105 [ASP] | a:1344 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:112 [MET] | a:1358 [U] | i:108 [GLU] | a:1345 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:14 [ARG] | a:1380 [G] | i:11 [LYS] | a:1367 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:14 [ARG] | a:1381 [G] | i:11 [LYS] | a:1368 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:14 [ARG] | a:1383 [G] | i:11 [LYS] | a:1370 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:14 [ARG] | a:1382 [U] | i:11 [LYS] | a:1369 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:114 [GLU] | a:1196 [G] | i:110 [GLU] | a:1183 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:115 [ARG] | a:1197 [G] | i:111 [ARG] | a:1184 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:115 [ARG] | a:1196 [G] | i:111 [ARG] | a:1183 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:117 [LYS] | a:1377 [U] | i:113 [LYS] | a:1364 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:117 [LYS] | a:1378 [A] | i:113 [LYS] | a:1365 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:118 [PRO] | a:1377 [U] | i:114 [LEU] | a:1364 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:122 [ALA] | a:1242 [U] | i:117 [ARG] | a:1229 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:122 [ALA] | a:1243 [G] | i:117 [ARG] | a:1230 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:17 [SER] | a:1380 [G] | i:12 [THR] | a:1367 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:17 [SER] | a:1261 [A] | i:12 [THR] | a:1248 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:17 [SER] | a:1260 [A] | i:12 [THR] | a:1247 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:124 [ARG] | a:1196 [G] | i:120 [ARG] | a:1183 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:124 [ARG] | a:1356 [A] | i:120 [ARG] | a:1343 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:125 [ARG] | a:1358 [U] | i:121 [LYS] | a:1345 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:128 [GLN] | a:1241 [G] | i:124 [GLN] | a:1228 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:129 [PHE] | a:976 [C] | i:125 [PHE] | a:964 [5MC] | ❌ 6S0X_i_a |
i:130 [SER] | a:976 [C] | i:126 [SER] | a:964 [5MC] | ❌ 6S0X_i_a |
i:132 [ARG] | a:1241 [G] | i:128 [ARG] | a:1228 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:132 [ARG] | a:979 [C] | i:128 [ARG] | a:967 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:19 [ALA] | a:1158 [U] | i:14 [THR] | a:1145 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:21 [VAL] | a:1157 [C] | i:16 [ARG] | a:1144 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:21 [VAL] | a:1140 [C] | i:16 [ARG] | a:1126 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:21 [VAL] | a:1141 [A] | i:16 [ARG] | a:1127 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:34 [ASN] | a:1258 [A] | i:31 [ARG] | a:1245 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:34 [ASN] | a:1259 [C] | i:31 [ARG] | a:1246 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:39 [GLU] | a:1301 [U] | i:38 [GLY] | a:1288 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:42 [PRO] | a:1383 [G] | i:39 [ARG] | a:1370 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:42 [PRO] | a:1382 [U] | i:39 [ARG] | a:1369 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:69 [VAL] | a:1260 [A] | i:65 [VAL] | a:1247 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:70 [HIS] | a:1140 [C] | i:66 [LYS] | a:1126 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:70 [HIS] | a:1260 [A] | i:66 [LYS] | a:1247 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:70 [HIS] | a:1158 [U] | i:66 [LYS] | a:1145 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:71 [GLY] | a:1259 [C] | i:67 [GLY] | a:1246 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:73 [GLY] | a:1382 [U] | i:69 [GLY] | a:1369 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:10 [GLY] | a:1157 [C] | i:7 [THR] | a:1144 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:74 [PHE] | a:1382 [U] | i:70 [ILE] | a:1369 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:12 [GLY] | a:1130 [G] | i:9 [ARG] | a:1116 [C] | ❌ 6S0X_i_a |
i:12 [GLY] | a:1159 [C] | i:9 [ARG] | a:1146 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:12 [GLY] | a:1158 [U] | i:9 [ARG] | a:1145 [U] | ❌ 6S0X_i_a |
i:98 [GLY] | a:1190 [A] | i:97 [ARG] | a:1177 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:98 [GLY] | a:1188 [G] | i:97 [ARG] | a:1175 [G] | ❌ 6S0X_i_a |
i:98 [GLY] | a:1189 [A] | i:97 [ARG] | a:1176 [A] | ❌ 6S0X_i_a |
i:24 [VAL] | a:1142 [U] | i:20 [SER] | a:1128 [G] | ❌ 7RYG_i:20, 7RYG_a:1128 no longer at interface |
i:39 [GLU] | a:1300 [G] | i:38 [GLY] | a:1287 [G] | ❌ 7RYG_a:1287 no longer at interface |
i:74 [PHE] | a:1298 [A] | i:70 [ILE] | a:1285 [A] | ❌ 7RYG_a:1285 no longer at interface |
i:13 [ARG] | a:1160 [U] | i:10 [ARG] | a:1147 [U] | ❌ 7RYG_a:1147 no longer at interface |
i:128 [GLN] | a:980 [G] | i:124 [GLN] | a:968 [G] | ❌ 7RYG_a:968 no longer at interface |
i:42 [PRO] | a:1300 [G] | i:39 [ARG] | a:1287 [G] | ❌ 7RYG_a:1287 no longer at interface |
i:130 [SER] | a:980 [G] | i:126 [SER] | a:968 [G] | ❌ 7RYG_a:968 no longer at interface |
i:66 [LEU] | a:1142 [U] | i:62 [TYR] | a:1128 [G] | ❌ 7RYG_a:1128 no longer at interface |
i:18 [VAL] | a:1160 [U] | i:13 [ALA] | a:1147 [U] | ❌ 7RYG_i:13, 7RYG_a:1147 no longer at interface |
i:70 [HIS] | a:1160 [U] | i:66 [LYS] | a:1147 [U] | ❌ 7RYG_a:1147 no longer at interface |
i:112 [MET] | a:1195 [G] | i:108 [GLU] | a:1182 [G] | ❌ 6S0X_a:1195 no longer at interface |
i:114 [GLU] | a:1195 [G] | i:110 [GLU] | a:1182 [G] | ❌ 6S0X_a:1195 no longer at interface |
i:122 [ALA] | a:1375 [G] | i:117 [ARG] | a:1362 [G] | ❌ 6S0X_a:1375 no longer at interface |
i:122 [ALA] | a:1376 [C] | i:117 [ARG] | a:1363 [C] | ❌ 6S0X_a:1376 no longer at interface |
i:125 [ARG] | a:1360 [A] | i:121 [LYS] | a:1347 [A] | ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface |
i:128 [GLN] | a:951 [G] | i:124 [GLN] | a:939 [G] | ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface |
i:128 [GLN] | a:952 [U] | i:124 [GLN] | a:940 [U] | ❌ 6S0X_a:952 no longer at interface |
i:129 [PHE] | a:977 [A] | i:125 [PHE] | a:965 [A] | ❌ 6S0X_a:977 no longer at interface |
i:131 [LYS] | a:1351 [U] | i:127 [LYS] | a:1338 [U] | ❌ 6S0X_a:1351 no longer at interface |
i:132 [ARG] | a:978 [A] | i:128 [ARG] | a:966 [A] | ❌ 6S0X_a:978 no longer at interface |
i:132 [ARG] | a:1240 [C] | i:128 [ARG] | a:1227 [C] | ❌ 6S0X_a:1240 no longer at interface |
i:21 [VAL] | a:1156 [A] | i:16 [ARG] | a:1143 [A] | ❌ 6S0X_a:1156 no longer at interface |
i:22 [ARG] | a:1140 [C] | i:17 [VAL] | a:1126 [C] | ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface |
i:22 [ARG] | a:1141 [A] | i:17 [VAL] | a:1127 [A] | ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface |
i:22 [ARG] | a:1157 [C] | i:17 [VAL] | a:1144 [C] | ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface |
i:22 [ARG] | a:1158 [U] | i:17 [VAL] | a:1145 [U] | ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface |
i:11 [THR] | a:1130 [G] | i:8 [GLY] | a:1116 [C] | ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface |
i:11 [THR] | a:1158 [U] | i:8 [GLY] | a:1145 [U] | ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface |
i:11 [THR] | a:1159 [C] | i:8 [GLY] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface |
i:46 [LEU] | a:1383 [G] | i:41 [THR] | a:1370 [G] | ❌ 7RYG_i:41 no longer at interface |
i:20 [ARG] | a:1139 [C] | i:15 [ALA] | a:1125 [C] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
i:20 [ARG] | a:1140 [C] | i:15 [ALA] | a:1126 [C] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
i:20 [ARG] | a:1141 [A] | i:15 [ALA] | a:1127 [A] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
i:20 [ARG] | a:1158 [U] | i:15 [ALA] | a:1145 [U] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
i:20 [ARG] | a:1159 [C] | i:15 [ALA] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface |
i:83 [HIS] | a:1129 [A] | i:79 [HIS] | a:1115 [U] | ❌ 7RYG_i:79 no longer at interface |
i:83 [HIS] | a:1130 [G] | i:79 [HIS] | a:1116 [C] | ❌ 7RYG_i:79 no longer at interface |
i:18 [VAL] | a:1159 [C] | i:13 [ALA] | a:1146 [U] | ❌ 7RYG_i:13 no longer at interface |
i:110 [PRO] | a:1127 [U] | i:106 [ALA] | a:1113 [U] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
i:110 [PRO] | a:1128 [A] | i:106 [ALA] | a:1114 [U] | ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1353 [G] | i:123 [PRO] | a:1340 [G] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1352 [C] | i:123 [PRO] | a:1339 [C] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1242 [U] | i:123 [PRO] | a:1229 [U] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:127 [PRO] | a:1243 [G] | i:123 [PRO] | a:1230 [G] | ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface |
i:37 [VAL] | a:1258 [A] | i:36 [TYR] | a:1245 [A] | ❌ 6S0X_i:37 no longer at interface |
i:37 [VAL] | a:1259 [C] | i:36 [TYR] | a:1246 [C] | ❌ 6S0X_i:37 no longer at interface |
i:8 [TYR] | a:1158 [U] | i:5 [TYR] | a:1145 [U] | ❌ 6S0X_i:8 no longer at interface |
i:8 [TYR] | a:1157 [C] | i:5 [TYR] | a:1144 [C] | ❌ 6S0X_i:8 no longer at interface |
i:94 [PRO] | a:1188 [G] | i:93 [LYS] | a:1175 [G] | ❌ 6S0X_i:94 no longer at interface |
i:94 [PRO] | a:1189 [A] | i:93 [LYS] | a:1176 [A] | ❌ 6S0X_i:94 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein S5 domain 2-like | Bacterial small subunit ribosomal RNA | 0.96 | 3.4 | 0.43 | 0.82 | 0.96 | 0.87 | 0.86 | 0.44 | 0.26 | 0.07 | 0.39 |
Other pairs involving 6S0X_i_a or 7RYG_i_a
Total number of entries: 8