RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group92 > 6S0X_i_a vs 7RYG_i_a

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0X_i
6S0X_a
7RYG_i
7RYG_a
Conserved?
i:120 [LEU] a:1377 [U] i:115 [GLY] a:1364 [C]
i:132 [ARG] a:975 [G] i:128 [ARG] a:963 [2MG]
i:108 [ARG] a:1128 [A] i:104 [ARG] a:1114 [U]
i:108 [ARG] a:1129 [A] i:104 [ARG] a:1115 [U]
i:108 [ARG] a:1189 [A] i:104 [ARG] a:1176 [A]
i:118 [PRO] a:1378 [A] i:114 [LEU] a:1365 [G]
i:113 [LYS] a:1357 [G] i:109 [VAL] a:1344 [G]
i:113 [LYS] a:1358 [U] i:109 [VAL] a:1345 [U]
i:113 [LYS] a:1380 [G] i:109 [VAL] a:1367 [G]
i:113 [LYS] a:1381 [G] i:109 [VAL] a:1368 [G]
i:73 [GLY] a:1259 [C] i:69 [GLY] a:1246 [C]
i:73 [GLY] a:1381 [G] i:69 [GLY] a:1368 [G]
i:19 [ALA] a:1159 [C] i:14 [THR] a:1146 [U]
i:10 [GLY] a:1158 [U] i:7 [THR] a:1145 [U]
i:74 [PHE] a:1258 [A] i:70 [ILE] a:1245 [A]
i:74 [PHE] a:1259 [C] i:70 [ILE] a:1246 [C]
i:74 [PHE] a:1299 [A] i:70 [ILE] a:1286 [A]
i:74 [PHE] a:1381 [G] i:70 [ILE] a:1368 [G]
i:14 [ARG] a:1357 [G] i:11 [LYS] a:1344 [G]
i:115 [ARG] a:1378 [A] i:111 [ARG] a:1365 [G]
i:115 [ARG] a:1379 [C] i:111 [ARG] a:1366 [C]
i:112 [MET] a:1127 [U] i:108 [GLU] a:1113 [U]
i:112 [MET] a:1357 [G] i:108 [GLU] a:1344 [G]
i:72 [GLY] a:1259 [C] i:68 [GLY] a:1246 [C]
i:72 [GLY] a:1260 [A] i:68 [GLY] a:1247 [A]
i:72 [GLY] a:1381 [G] i:68 [GLY] a:1368 [G]
i:17 [SER] a:1381 [G] i:12 [THR] a:1368 [G]
i:117 [LYS] a:1196 [G] i:113 [LYS] a:1183 [G]
i:117 [LYS] a:1197 [G] i:113 [LYS] a:1184 [G]
i:98 [GLY] a:1187 [G] i:97 [ARG] a:1174 [G]
i:121 [LYS] a:1377 [U] i:116 [LEU] a:1364 [C]
i:77 [GLN] a:1259 [C] i:73 [GLN] a:1246 [C]
i:77 [GLN] a:1260 [A] i:73 [GLN] a:1247 [A]
i:68 [ASN] a:1141 [A] i:64 [THR] a:1127 [A]
i:87 [ARG] a:1129 [A] i:83 [ARG] a:1115 [U]
i:87 [ARG] a:1130 [G] i:83 [ARG] a:1116 [C]
i:128 [GLN] a:1242 [U] i:124 [GLN] a:1229 [U]
i:128 [GLN] a:1243 [G] i:124 [GLN] a:1230 [G]
i:128 [GLN] a:1352 [C] i:124 [GLN] a:1339 [C]
i:106 [LEU] a:1189 [A] i:102 [VAL] a:1176 [A]
i:42 [PRO] a:1301 [U] i:39 [ARG] a:1288 [C]
i:123 [ALA] a:1358 [U] i:119 [ALA] a:1345 [U]
i:123 [ALA] a:1359 [A] i:119 [ALA] a:1346 [A]
i:111 [ARG] a:1356 [A] i:107 [ARG] a:1343 [A]
i:111 [ARG] a:1357 [G] i:107 [ARG] a:1344 [G]
i:71 [GLY] a:1260 [A] i:67 [GLY] a:1247 [A]
i:71 [GLY] a:1261 [A] i:67 [GLY] a:1248 [A]
i:116 [LYS] a:1377 [U] i:112 [LYS] a:1364 [C]
i:116 [LYS] a:1378 [A] i:112 [LYS] a:1365 [G]
i:116 [LYS] a:1379 [C] i:112 [LYS] a:1366 [C]
i:131 [LYS] a:975 [G] i:127 [LYS] a:963 [2MG]
i:131 [LYS] a:976 [C] i:127 [LYS] a:964 [5MC]
i:107 [THR] a:1189 [A] i:103 [THR] a:1176 [A]
i:107 [THR] a:1190 [A] i:103 [THR] a:1177 [A]
i:130 [SER] a:979 [C] i:126 [SER] a:967 [C]
i:130 [SER] a:1241 [G] i:126 [SER] a:1228 [G]
i:130 [SER] a:1242 [U] i:126 [SER] a:1229 [U]
i:76 [GLY] a:1382 [U] i:72 [GLY] a:1369 [U]
i:124 [ARG] a:1353 [G] i:120 [ARG] a:1340 [G]
i:124 [ARG] a:1354 [C] i:120 [ARG] a:1341 [C]
i:124 [ARG] a:1355 [U] i:120 [ARG] a:1342 [U]
i:124 [ARG] a:1358 [U] i:120 [ARG] a:1345 [U]
i:124 [ARG] a:1359 [A] i:120 [ARG] a:1346 [A]
i:66 [LEU] a:1141 [A] i:62 [TYR] a:1127 [A]
i:12 [GLY] a:1129 [A] i:9 [ARG] a:1115 [U]
i:126 [SER] a:1353 [G] i:122 [ARG] a:1340 [G]
i:126 [SER] a:1354 [C] i:122 [ARG] a:1341 [C]
i:129 [PHE] a:1242 [U] i:125 [PHE] a:1229 [U]
i:129 [PHE] a:1352 [C] i:125 [PHE] a:1339 [C]
i:129 [PHE] a:1353 [G] i:125 [PHE] a:1340 [G]
i:75 [THR] a:1382 [U] i:71 [GLY] a:1369 [U]
i:75 [THR] a:1383 [G] i:71 [GLY] a:1370 [G]
i:21 [VAL] a:1158 [U] i:16 [ARG] a:1145 [U]
i:125 [ARG] a:1353 [G] i:121 [LYS] a:1340 [G]
i:125 [ARG] a:1354 [C] i:121 [LYS] a:1341 [C]
i:125 [ARG] a:1359 [A] i:121 [LYS] a:1346 [A]
i:114 [GLU] a:1357 [G] i:110 [GLU] a:1344 [G]
i:114 [GLU] a:1358 [U] i:110 [GLU] a:1345 [U]
i:70 [HIS] a:1139 [C] i:66 [LYS] a:1125 [C]
i:108 [ARG] a:1190 [A] i:104 [ARG] a:1177 [A] ❌ 7RYG_i_a
i:113 [LYS] a:1383 [G] i:109 [VAL] a:1370 [G] ❌ 7RYG_i_a
i:73 [GLY] a:1260 [A] i:69 [GLY] a:1247 [A] ❌ 7RYG_i_a
i:73 [GLY] a:1380 [G] i:69 [GLY] a:1367 [G] ❌ 7RYG_i_a
i:115 [ARG] a:1358 [U] i:111 [ARG] a:1345 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:115 [ARG] a:1377 [U] i:111 [ARG] a:1364 [C] ❌ 7RYG_i_a
i:112 [MET] a:1128 [A] i:108 [GLU] a:1114 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:72 [GLY] a:1261 [A] i:68 [GLY] a:1248 [A] ❌ 7RYG_i_a
i:72 [GLY] a:1380 [G] i:68 [GLY] a:1367 [G] ❌ 7RYG_i_a
i:13 [ARG] a:1128 [A] i:10 [ARG] a:1114 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:13 [ARG] a:1129 [A] i:10 [ARG] a:1115 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:13 [ARG] a:1130 [G] i:10 [ARG] a:1116 [C] ❌ 7RYG_i_a
i:68 [ASN] a:1139 [C] i:64 [THR] a:1125 [C] ❌ 7RYG_i_a
i:68 [ASN] a:1140 [C] i:64 [THR] a:1126 [C] ❌ 7RYG_i_a
i:87 [ARG] a:1189 [A] i:83 [ARG] a:1176 [A] ❌ 7RYG_i_a
i:128 [GLN] a:1353 [G] i:124 [GLN] a:1340 [G] ❌ 7RYG_i_a
i:42 [PRO] a:1258 [A] i:39 [ARG] a:1245 [A] ❌ 7RYG_i_a
i:131 [LYS] a:979 [C] i:127 [LYS] a:967 [C] ❌ 7RYG_i_a
i:107 [THR] a:1129 [A] i:103 [THR] a:1115 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:76 [GLY] a:1381 [G] i:72 [GLY] a:1368 [G] ❌ 7RYG_i_a
i:69 [VAL] a:1140 [C] i:65 [VAL] a:1126 [C] ❌ 7RYG_i_a
i:34 [ASN] a:1141 [A] i:31 [ARG] a:1127 [A] ❌ 7RYG_i_a
i:75 [THR] a:1259 [C] i:71 [GLY] a:1246 [C] ❌ 7RYG_i_a
i:75 [THR] a:1381 [G] i:71 [GLY] a:1368 [G] ❌ 7RYG_i_a
i:109 [ASP] a:1128 [A] i:105 [ASP] a:1114 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:109 [ASP] a:1129 [A] i:105 [ASP] a:1115 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:122 [ALA] a:1359 [A] i:117 [ARG] a:1346 [A] ❌ 7RYG_i_a
i:70 [HIS] a:1159 [C] i:66 [LYS] a:1146 [U] ❌ 7RYG_i_a
i:13 [ARG] a:1357 [G] i:10 [ARG] a:1344 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:109 [ASP] a:1357 [G] i:105 [ASP] a:1344 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:112 [MET] a:1358 [U] i:108 [GLU] a:1345 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:14 [ARG] a:1380 [G] i:11 [LYS] a:1367 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:14 [ARG] a:1381 [G] i:11 [LYS] a:1368 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:14 [ARG] a:1383 [G] i:11 [LYS] a:1370 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:14 [ARG] a:1382 [U] i:11 [LYS] a:1369 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:114 [GLU] a:1196 [G] i:110 [GLU] a:1183 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:115 [ARG] a:1197 [G] i:111 [ARG] a:1184 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:115 [ARG] a:1196 [G] i:111 [ARG] a:1183 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:117 [LYS] a:1377 [U] i:113 [LYS] a:1364 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:117 [LYS] a:1378 [A] i:113 [LYS] a:1365 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:118 [PRO] a:1377 [U] i:114 [LEU] a:1364 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:122 [ALA] a:1242 [U] i:117 [ARG] a:1229 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:122 [ALA] a:1243 [G] i:117 [ARG] a:1230 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:17 [SER] a:1380 [G] i:12 [THR] a:1367 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:17 [SER] a:1261 [A] i:12 [THR] a:1248 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:17 [SER] a:1260 [A] i:12 [THR] a:1247 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:124 [ARG] a:1196 [G] i:120 [ARG] a:1183 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:124 [ARG] a:1356 [A] i:120 [ARG] a:1343 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:125 [ARG] a:1358 [U] i:121 [LYS] a:1345 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:128 [GLN] a:1241 [G] i:124 [GLN] a:1228 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:129 [PHE] a:976 [C] i:125 [PHE] a:964 [5MC] ❌ 6S0X_i_a
i:130 [SER] a:976 [C] i:126 [SER] a:964 [5MC] ❌ 6S0X_i_a
i:132 [ARG] a:1241 [G] i:128 [ARG] a:1228 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:132 [ARG] a:979 [C] i:128 [ARG] a:967 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:19 [ALA] a:1158 [U] i:14 [THR] a:1145 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:21 [VAL] a:1157 [C] i:16 [ARG] a:1144 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:21 [VAL] a:1140 [C] i:16 [ARG] a:1126 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:21 [VAL] a:1141 [A] i:16 [ARG] a:1127 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:34 [ASN] a:1258 [A] i:31 [ARG] a:1245 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:34 [ASN] a:1259 [C] i:31 [ARG] a:1246 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:39 [GLU] a:1301 [U] i:38 [GLY] a:1288 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:42 [PRO] a:1383 [G] i:39 [ARG] a:1370 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:42 [PRO] a:1382 [U] i:39 [ARG] a:1369 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:69 [VAL] a:1260 [A] i:65 [VAL] a:1247 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:70 [HIS] a:1140 [C] i:66 [LYS] a:1126 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:70 [HIS] a:1260 [A] i:66 [LYS] a:1247 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:70 [HIS] a:1158 [U] i:66 [LYS] a:1145 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:71 [GLY] a:1259 [C] i:67 [GLY] a:1246 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:73 [GLY] a:1382 [U] i:69 [GLY] a:1369 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:10 [GLY] a:1157 [C] i:7 [THR] a:1144 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:74 [PHE] a:1382 [U] i:70 [ILE] a:1369 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:12 [GLY] a:1130 [G] i:9 [ARG] a:1116 [C] ❌ 6S0X_i_a
i:12 [GLY] a:1159 [C] i:9 [ARG] a:1146 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:12 [GLY] a:1158 [U] i:9 [ARG] a:1145 [U] ❌ 6S0X_i_a
i:98 [GLY] a:1190 [A] i:97 [ARG] a:1177 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:98 [GLY] a:1188 [G] i:97 [ARG] a:1175 [G] ❌ 6S0X_i_a
i:98 [GLY] a:1189 [A] i:97 [ARG] a:1176 [A] ❌ 6S0X_i_a
i:24 [VAL] a:1142 [U] i:20 [SER] a:1128 [G] ❌ 7RYG_i:20, 7RYG_a:1128 no longer at interface
i:39 [GLU] a:1300 [G] i:38 [GLY] a:1287 [G] ❌ 7RYG_a:1287 no longer at interface
i:74 [PHE] a:1298 [A] i:70 [ILE] a:1285 [A] ❌ 7RYG_a:1285 no longer at interface
i:13 [ARG] a:1160 [U] i:10 [ARG] a:1147 [U] ❌ 7RYG_a:1147 no longer at interface
i:128 [GLN] a:980 [G] i:124 [GLN] a:968 [G] ❌ 7RYG_a:968 no longer at interface
i:42 [PRO] a:1300 [G] i:39 [ARG] a:1287 [G] ❌ 7RYG_a:1287 no longer at interface
i:130 [SER] a:980 [G] i:126 [SER] a:968 [G] ❌ 7RYG_a:968 no longer at interface
i:66 [LEU] a:1142 [U] i:62 [TYR] a:1128 [G] ❌ 7RYG_a:1128 no longer at interface
i:18 [VAL] a:1160 [U] i:13 [ALA] a:1147 [U] ❌ 7RYG_i:13, 7RYG_a:1147 no longer at interface
i:70 [HIS] a:1160 [U] i:66 [LYS] a:1147 [U] ❌ 7RYG_a:1147 no longer at interface
i:112 [MET] a:1195 [G] i:108 [GLU] a:1182 [G] ❌ 6S0X_a:1195 no longer at interface
i:114 [GLU] a:1195 [G] i:110 [GLU] a:1182 [G] ❌ 6S0X_a:1195 no longer at interface
i:122 [ALA] a:1375 [G] i:117 [ARG] a:1362 [G] ❌ 6S0X_a:1375 no longer at interface
i:122 [ALA] a:1376 [C] i:117 [ARG] a:1363 [C] ❌ 6S0X_a:1376 no longer at interface
i:125 [ARG] a:1360 [A] i:121 [LYS] a:1347 [A] ❌ 6S0X_a:1360 no longer at interface
i:128 [GLN] a:951 [G] i:124 [GLN] a:939 [G] ❌ 6S0X_a:951 no longer at interface
i:128 [GLN] a:952 [U] i:124 [GLN] a:940 [U] ❌ 6S0X_a:952 no longer at interface
i:129 [PHE] a:977 [A] i:125 [PHE] a:965 [A] ❌ 6S0X_a:977 no longer at interface
i:131 [LYS] a:1351 [U] i:127 [LYS] a:1338 [U] ❌ 6S0X_a:1351 no longer at interface
i:132 [ARG] a:978 [A] i:128 [ARG] a:966 [A] ❌ 6S0X_a:978 no longer at interface
i:132 [ARG] a:1240 [C] i:128 [ARG] a:1227 [C] ❌ 6S0X_a:1240 no longer at interface
i:21 [VAL] a:1156 [A] i:16 [ARG] a:1143 [A] ❌ 6S0X_a:1156 no longer at interface
i:22 [ARG] a:1140 [C] i:17 [VAL] a:1126 [C] ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface
i:22 [ARG] a:1141 [A] i:17 [VAL] a:1127 [A] ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface
i:22 [ARG] a:1157 [C] i:17 [VAL] a:1144 [C] ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface
i:22 [ARG] a:1158 [U] i:17 [VAL] a:1145 [U] ❌ 7RYG_i:17 no longer at interface
i:11 [THR] a:1130 [G] i:8 [GLY] a:1116 [C] ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface
i:11 [THR] a:1158 [U] i:8 [GLY] a:1145 [U] ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface
i:11 [THR] a:1159 [C] i:8 [GLY] a:1146 [U] ❌ 7RYG_i:8 no longer at interface
i:46 [LEU] a:1383 [G] i:41 [THR] a:1370 [G] ❌ 7RYG_i:41 no longer at interface
i:20 [ARG] a:1139 [C] i:15 [ALA] a:1125 [C] ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface
i:20 [ARG] a:1140 [C] i:15 [ALA] a:1126 [C] ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface
i:20 [ARG] a:1141 [A] i:15 [ALA] a:1127 [A] ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface
i:20 [ARG] a:1158 [U] i:15 [ALA] a:1145 [U] ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface
i:20 [ARG] a:1159 [C] i:15 [ALA] a:1146 [U] ❌ 7RYG_i:15 no longer at interface
i:83 [HIS] a:1129 [A] i:79 [HIS] a:1115 [U] ❌ 7RYG_i:79 no longer at interface
i:83 [HIS] a:1130 [G] i:79 [HIS] a:1116 [C] ❌ 7RYG_i:79 no longer at interface
i:18 [VAL] a:1159 [C] i:13 [ALA] a:1146 [U] ❌ 7RYG_i:13 no longer at interface
i:110 [PRO] a:1127 [U] i:106 [ALA] a:1113 [U] ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface
i:110 [PRO] a:1128 [A] i:106 [ALA] a:1114 [U] ❌ 6S0X_i:110 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1353 [G] i:123 [PRO] a:1340 [G] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1352 [C] i:123 [PRO] a:1339 [C] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1242 [U] i:123 [PRO] a:1229 [U] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:127 [PRO] a:1243 [G] i:123 [PRO] a:1230 [G] ❌ 6S0X_i:127 no longer at interface
i:37 [VAL] a:1258 [A] i:36 [TYR] a:1245 [A] ❌ 6S0X_i:37 no longer at interface
i:37 [VAL] a:1259 [C] i:36 [TYR] a:1246 [C] ❌ 6S0X_i:37 no longer at interface
i:8 [TYR] a:1158 [U] i:5 [TYR] a:1145 [U] ❌ 6S0X_i:8 no longer at interface
i:8 [TYR] a:1157 [C] i:5 [TYR] a:1144 [C] ❌ 6S0X_i:8 no longer at interface
i:94 [PRO] a:1188 [G] i:93 [LYS] a:1175 [G] ❌ 6S0X_i:94 no longer at interface
i:94 [PRO] a:1189 [A] i:93 [LYS] a:1176 [A] ❌ 6S0X_i:94 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein S5 domain 2-like Bacterial small subunit ribosomal RNA 0.96 3.4 0.43 0.82 0.96 0.87 0.86 0.44 0.26 0.07 0.39


Other pairs involving 6S0X_i_a or 7RYG_i_a

Total number of entries: 8