RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group95 > 3V6Y_A_B vs 3V74_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

3V6Y_A
3V6Y_B
3V74_A
3V74_B
Conserved?
A:495 [PHE] B:3 [C] A:495 [PHE] B:2 [C] ✔
A:363 [CYS] B:7 [G] A:363 [CYS] B:7 [G] ✔
A:288 [ARG] B:10 [A] A:288 [ARG] B:10 [A] ✔
A:288 [ARG] B:11 [U] A:288 [ARG] B:11 [U] ✔
A:245 [TYR] B:11 [U] A:245 [TYR] B:11 [U] ✔
A:245 [TYR] B:12 [A] A:245 [TYR] B:12 [A] ✔
A:415 [ASN] B:6 [U] A:415 [ASN] B:6 [U] ✔
A:454 [HIS] B:5 [G] A:454 [HIS] B:5 [G] ✔
A:454 [HIS] B:6 [U] A:454 [HIS] B:6 [U] ✔
A:291 [GLN] B:10 [A] A:291 [GLN] B:10 [A] ✔
A:242 [PHE] B:12 [A] A:242 [PHE] B:12 [A] ✔
A:367 [GLN] B:7 [G] A:367 [GLN] B:7 [G] ✔
A:413 [TYR] B:7 [G] A:413 [TYR] B:7 [G] ✔
A:557 [LYS] B:4 [U] A:557 [LYS] B:4 [U] ✔
A:554 [SER] B:3 [C] A:554 [SER] B:2 [C] ✔
A:554 [SER] B:4 [U] A:554 [SER] B:4 [U] ✔
A:323 [ASN] B:10 [A] A:323 [ASN] B:10 [A] ✔
A:248 [GLN] B:11 [U] A:248 [GLN] B:11 [U] ✔
A:419 [GLN] B:6 [U] A:419 [GLN] B:6 [U] ✔
A:364 [ARG] B:7 [G] A:364 [ARG] B:7 [G] ✔
A:364 [ARG] B:8 [C] A:364 [ARG] B:8 [C] ✔
A:285 [PHE] B:11 [U] A:285 [PHE] B:11 [U] ✔
A:201 [LYS] B:12 [A] A:201 [LYS] B:12 [A] ✔
A:360 [LYS] B:7 [G] A:360 [LYS] B:7 [G] ✔
A:360 [LYS] B:8 [C] A:360 [LYS] B:8 [C] ✔
A:326 [HIS] B:9 [C] A:326 [HIS] B:9 [C] ✔
A:326 [HIS] B:10 [A] A:326 [HIS] B:10 [A] ✔
A:555 [GLY] B:3 [C] A:555 [GLY] B:2 [C] ✔
A:504 [GLN] B:4 [U] A:504 [GLN] B:4 [U] ✔
A:287 [CYS] B:10 [A] A:287 [CYS] B:10 [A] ✔
A:453 [SER] B:5 [G] A:453 [SER] B:5 [G] ✔
A:450 [LYS] B:5 [G] A:450 [LYS] B:5 [G] ✔
A:450 [LYS] B:6 [U] A:450 [LYS] B:6 [U] ✔
A:412 [GLU] B:6 [U] A:412 [GLU] B:6 [U] ✔
A:498 [PHE] B:5 [G] A:498 [PHE] B:5 [G] ✔
A:500 [ASN] B:3 [C] A:500 [ASN] B:2 [C] ✔
A:500 [ASN] B:4 [U] A:500 [ASN] B:4 [U] ✔
A:553 [SER] B:3 [C] A:553 [SER] B:2 [C] ✔
A:553 [SER] B:4 [U] A:553 [SER] B:4 [U] ✔
A:497 [GLN] B:4 [U] A:497 [GLN] B:4 [U] ✔
A:497 [GLN] B:5 [G] A:497 [GLN] B:5 [G] ✔
A:361 [TYR] B:8 [C] A:361 [TYR] B:8 [C] ✔
A:361 [TYR] B:9 [C] A:361 [TYR] B:9 [C] ✔
A:552 [PHE] B:3 [C] A:552 [PHE] B:2 [C] ✔
A:241 [ILE] B:11 [U] A:241 [ILE] B:11 [U] ✔
A:241 [ILE] B:12 [A] A:241 [ILE] B:12 [A] ✔
A:496 [HIS] B:3 [C] A:496 [HIS] B:2 [C] ✔
A:451 [PHE] B:6 [U] A:451 [PHE] B:6 [U] ✔
A:322 [GLN] B:10 [A] A:322 [GLN] B:10 [A] ✔
A:284 [LYS] B:10 [A] A:284 [LYS] B:10 [A] ✔
A:284 [LYS] B:11 [U] A:284 [LYS] B:11 [U] ✔
A:501 [TYR] B:4 [U] A:501 [TYR] B:4 [U] ✔
A:501 [TYR] B:5 [G] A:501 [TYR] B:5 [G] ✔
A:416 [TYR] B:6 [U] A:416 [TYR] B:6 [U] ✔
A:416 [TYR] B:7 [G] A:416 [TYR] B:7 [G] ✔
A:244 [ASN] B:11 [U] A:244 [ASN] B:11 [U] ✔
A:204 [CYS] B:12 [A] A:204 [CYS] B:12 [A] ✔
A:208 [GLU] B:12 [A] A:208 [GLU] B:12 [A] ✔
A:551 [ARG] B:3 [C] A:551 [ARG] B:2 [C] ✔
A:494 [MET] B:3 [C] A:494 [MET] B:2 [C] ✔
A:205 [GLN] B:12 [A] A:205 [GLN] B:12 [A] ✔
A:457 [GLU] B:5 [G] A:457 [GLU] B:5 [G] ✔
A:412 [GLU] B:7 [G] A:412 [GLU] B:7 [G] ❌ 3V6Y_A_B
A:497 [GLN] B:3 [C] A:497 [GLN] B:2 [C] ❌ 3V6Y_A_B

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
ARM repeat 0.99 0.31 0.91 1.0 0.57 1.0 0.91 1.00 0.97 0.81 0.00


Other pairs involving 3V6Y_A_B or 3V74_A_B

Total number of entries: 9

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
3BSX_A_C 3V6Y_A_B 0.94 0.85 1.95 0.56 ARM repeat compare
3K49_A_B 3V6Y_A_B 0.80 0.73 3.21 0.5 ARM repeat compare
3V6Y_A_B 3V74_A_B 1.00 0.99 0.31 0.91 ARM repeat compare
3BSX_A_C 3V74_A_B 0.89 0.85 1.99 0.56 ARM repeat compare
3K49_A_B 3V74_A_B 0.90 0.73 3.17 0.6 ARM repeat compare
3V6Y_A_B 5BZ1_A_B 0.68 0.82 2.14 0.33 ARM repeat compare
3V74_A_B 5BZ1_A_B 0.68 0.82 2.09 0.33 ARM repeat compare
3V6Y_A_B 5WZJ_A_B 0.85 0.64 3.34 0.09 ARM repeat compare
3V74_A_B 5WZJ_A_B 0.89 0.64 2.92 0.09 ARM repeat compare