RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group114 > 3ZGZ_A_B vs 4CQN_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

3ZGZ_A
3ZGZ_B
4CQN_A
4CQN_B
Conserved?
A:533 [HIS] B:76 [A] A:533 [HIS] B:76 [A] ✔
A:724 [THR] B:14 [A] A:724 [THR] B:14 [A] ✔
A:724 [THR] B:15 [A] A:724 [THR] B:15 [A] ✔
A:648 [PHE] B:12 [G] A:648 [PHE] B:12 [G] ✔
A:648 [PHE] B:23 [C] A:648 [PHE] B:23 [C] ✔
A:648 [PHE] B:24 [A] A:648 [PHE] B:24 [A] ✔
A:570 [LEU] B:69 [G] A:570 [LEU] B:69 [G] ✔
A:570 [LEU] B:70 [G] A:570 [LEU] B:70 [G] ✔
A:619 [LYS] B:69 [G] A:619 [LYS] B:69 [G] ✔
A:619 [LYS] B:70 [G] A:619 [LYS] B:70 [G] ✔
A:619 [LYS] B:71 [G] A:619 [LYS] B:71 [G] ✔
A:619 [LYS] B:75 [C] A:619 [LYS] B:75 [C] ✔
A:619 [LYS] B:76 [A] A:619 [LYS] B:76 [A] ✔
A:714 [ASP] B:16 [U] A:714 [ASP] B:16 [U] ✔
A:536 [MET] B:72 [C] A:536 [MET] B:72 [U] ✔
A:536 [MET] B:73 [A] A:536 [MET] B:73 [A] ✔
A:536 [MET] B:76 [A] A:536 [MET] B:76 [A] ✔
A:424 [ARG] B:74 [C] A:424 [ARG] B:74 [C] ✔
A:169 [GLU] B:74 [C] A:169 [GLU] B:74 [C] ✔
A:169 [GLU] B:75 [C] A:169 [GLU] B:75 [C] ✔
A:618 [SER] B:69 [G] A:618 [SER] B:69 [G] ✔
A:618 [SER] B:70 [G] A:618 [SER] B:70 [G] ✔
A:671 [LYS] B:39 [U] A:671 [LYS] B:39 [U] ✔
A:491 [ASP] B:74 [C] A:491 [ASP] B:74 [C] ✔
A:837 [LYS] B:47F [C] A:837 [LYS] B:47F [C] ✔
A:837 [LYS] B:47G [G] A:837 [LYS] B:47G [G] ✔
A:540 [TYR] B:74 [C] A:540 [TYR] B:74 [C] ✔
A:421 [GLY] B:74 [C] A:421 [GLY] B:74 [C] ✔
A:532 [GLU] B:70 [G] A:532 [GLU] B:70 [G] ✔
A:532 [GLU] B:71 [G] A:532 [GLU] B:71 [G] ✔
A:532 [GLU] B:76 [A] A:532 [GLU] B:76 [A] ✔
A:617 [MET] B:69 [G] A:617 [MET] B:69 [G] ✔
A:617 [MET] B:70 [G] A:617 [MET] B:70 [G] ✔
A:616 [GLY] B:69 [G] A:616 [GLY] B:69 [G] ✔
A:856 [ASN] B:19 [G] A:856 [ASN] B:19 [G] ✔
A:856 [ASN] B:56 [C] A:856 [ASN] B:56 [C] ✔
A:846 [LYS] B:56 [C] A:846 [LYS] B:56 [C] ✔
A:296 [ALA] B:1 [G] A:296 [ALA] B:1 [G] ✔
A:848 [ILE] B:19 [G] A:848 [ILE] B:19 [G] ✔
A:848 [ILE] B:56 [C] A:848 [ILE] B:56 [C] ✔
A:84 [LEU] B:75 [C] A:84 [LEU] B:75 [C] ✔
A:84 [LEU] B:76 [A] A:84 [LEU] B:76 [A] ✔
A:417 [LEU] B:73 [A] A:417 [LEU] B:73 [A] ✔
A:423 [SER] B:74 [C] A:423 [SER] B:74 [C] ✔
A:535 [ILE] B:71 [G] A:535 [ILE] B:71 [G] ✔
A:734 [ASN] B:23 [C] A:734 [ASN] B:23 [C] ✔
A:734 [ASN] B:24 [A] A:734 [ASN] B:24 [A] ✔
A:731 [GLU] B:22 [A] A:731 [GLU] B:22 [A] ✔
A:731 [GLU] B:23 [C] A:731 [GLU] B:23 [C] ✔
A:719 [ARG] B:15 [A] A:719 [ARG] B:15 [A] ✔
A:719 [ARG] B:16 [U] A:719 [ARG] B:16 [U] ✔
A:157 [ASN] B:74 [C] A:157 [ASN] B:74 [C] ✔
A:654 [MET] B:13 [G] A:654 [MET] B:13 [G] ✔
A:654 [MET] B:14 [A] A:654 [MET] B:14 [A] ✔
A:650 [SER] B:12 [G] A:650 [SER] B:12 [G] ✔
A:650 [SER] B:13 [G] A:650 [SER] B:13 [G] ✔
A:738 [LYS] B:41 [C] A:738 [LYS] B:41 [C] ✔
A:166 [LEU] B:74 [C] A:166 [LEU] B:74 [C] ✔
A:492 [THR] B:76 [A] A:492 [THR] B:76 [A] ✔
A:531 [ILE] B:70 [G] A:531 [ILE] B:70 [G] ✔
A:809 [LYS] B:47H [C] A:809 [LYS] B:47H [C] ✔
A:809 [LYS] B:47I [U] A:809 [LYS] B:47I [U] ✔
A:426 [ARG] B:74 [C] A:426 [ARG] B:74 [C] ✔
A:426 [ARG] B:76 [A] A:426 [ARG] B:76 [A] ✔
A:223 [TRP] B:71 [G] A:223 [TRP] B:71 [G] ✔
A:223 [TRP] B:72 [C] A:223 [TRP] B:72 [U] ✔
A:223 [TRP] B:73 [A] A:223 [TRP] B:73 [A] ✔
A:222 [ASN] B:3 [C] A:222 [ASN] B:3 [C] ✔
A:222 [ASN] B:4 [C] A:222 [ASN] B:4 [C] ✔
A:805 [GLN] B:19 [G] A:805 [GLN] B:19 [G] ✔
A:805 [GLN] B:20 [U] A:805 [GLN] B:20 [U] ✔
A:623 [SER] B:75 [C] A:623 [SER] B:75 [C] ✔
A:219 [MET] B:3 [C] A:219 [MET] B:3 [C] ✔
A:219 [MET] B:4 [C] A:219 [MET] B:4 [C] ✔
A:219 [MET] B:70 [G] A:219 [MET] B:70 [G] ✔
A:416 [ARG] B:72 [C] A:416 [ARG] B:72 [U] ✔
A:416 [ARG] B:73 [A] A:416 [ARG] B:73 [A] ✔
A:803 [VAL] B:20 [U] A:803 [VAL] B:20 [U] ✔
A:85 [PRO] B:75 [C] A:85 [PRO] B:75 [C] ✔
A:85 [PRO] B:76 [A] A:85 [PRO] B:76 [A] ✔
A:718 [ARG] B:16 [U] A:718 [ARG] B:16 [U] ✔
A:727 [ALA] B:22 [A] A:727 [ALA] B:22 [A] ✔
A:727 [ALA] B:23 [C] A:727 [ALA] B:23 [C] ✔
A:838 [TYR] B:47G [G] A:838 [TYR] B:47G [G] ✔
A:838 [TYR] B:47H [C] A:838 [TYR] B:47H [C] ✔
A:715 [ASP] B:16 [U] A:715 [ASP] B:16 [U] ✔
A:80 [ASP] B:76 [A] A:80 [ASP] B:76 [A] ✔
A:834 [LEU] B:47F [C] A:834 [LEU] B:47F [C] ✔
A:834 [LEU] B:47G [G] A:834 [LEU] B:47G [G] ✔
A:810 [VAL] B:20 [U] A:810 [VAL] B:20 [U] ✔
A:810 [VAL] B:20A [A] A:810 [VAL] B:20A [A] ✔
A:167 [ALA] B:74 [C] A:167 [ALA] B:74 [C] ✔
A:167 [ALA] B:75 [C] A:167 [ALA] B:75 [C] ✔
A:672 [ARG] B:24 [A] A:672 [ARG] B:24 [A] ✔
A:672 [ARG] B:40 [C] A:672 [ARG] B:40 [C] ✔
A:813 [LYS] B:20 [U] A:813 [LYS] B:20 [U] ✔
A:293 [ALA] B:1 [G] A:293 [ALA] B:1 [G] ✔
A:293 [ALA] B:72 [C] A:293 [ALA] B:72 [U] ✔
A:293 [ALA] B:73 [A] A:293 [ALA] B:73 [A] ✔
A:651 [PRO] B:13 [G] A:651 [PRO] B:13 [G] ✔
A:651 [PRO] B:14 [A] A:651 [PRO] B:14 [A] ✔
A:661 [SER] B:25 [C] A:661 [SER] B:25 [C] ✔
A:615 [THR] B:69 [G] A:615 [THR] B:69 [G] ✔
A:425 [GLN] B:74 [C] A:425 [GLN] B:74 [C] ✔
A:655 [THR] B:13 [G] A:655 [THR] B:13 [G] ✔
A:655 [THR] B:69 [G] A:655 [THR] B:69 [G] ✔
A:419 [ASP] B:73 [A] A:419 [ASP] B:73 [A] ✔
A:649 [ALA] B:12 [G] A:649 [ALA] B:12 [G] ✔
A:649 [ALA] B:13 [G] A:649 [ALA] B:13 [G] ✔
A:292 [GLU] B:1 [G] A:292 [GLU] B:1 [G] ✔
A:292 [GLU] B:2 [C] A:292 [GLU] B:2 [C] ✔
A:292 [GLU] B:72 [C] A:292 [GLU] B:72 [U] ✔
A:292 [GLU] B:73 [A] A:292 [GLU] B:73 [A] ✔
A:811 [ARG] B:47G [G] A:811 [ARG] B:47G [G] ✔
A:811 [ARG] B:47H [C] A:811 [ARG] B:47H [C] ✔
A:218 [THR] B:3 [C] A:218 [THR] B:3 [C] ✔
A:218 [THR] B:4 [C] A:218 [THR] B:4 [C] ✔
A:297 [THR] B:1 [G] A:297 [THR] B:1 [G] ✔
A:190 [GLN] B:74 [C] A:190 [GLN] B:74 [C] ✔
A:156 [VAL] B:74 [C] A:156 [VAL] B:74 [C] ✔
A:659 [GLN] B:11 [U] A:659 [GLN] B:11 [U] ✔
A:659 [GLN] B:12 [G] A:659 [GLN] B:12 [G] ✔
A:82 [PHE] B:76 [A] A:82 [PHE] B:76 [A] ✔
A:568 [MET] B:70 [G] A:568 [MET] B:70 [G] ✔
A:801 [LEU] B:20 [U] A:801 [LEU] B:20 [U] ✔
A:730 [MET] B:23 [C] A:730 [MET] B:23 [C] ✔
A:730 [MET] B:24 [A] A:730 [MET] B:24 [A] ✔
A:858 [VAL] B:56 [C] A:858 [VAL] B:56 [C] ✔
A:418 [ARG] B:73 [A] A:418 [ARG] B:73 [A] ✔
A:854 [LEU] B:19 [G] A:854 [LEU] B:19 [G] ✔
A:854 [LEU] B:20 [U] A:854 [LEU] B:20 [U] ✔
A:83 [GLY] B:76 [A] A:83 [GLY] B:76 [A] ✔
A:168 [ASN] B:73 [A] A:168 [ASN] B:73 [A] ✔
A:168 [ASN] B:74 [C] A:168 [ASN] B:74 [C] ✔
A:168 [ASN] B:75 [C] A:168 [ASN] B:75 [C] ✔
A:291 [ALA] B:73 [A] A:291 [ALA] B:73 [A] ✔
A:711 [LYS] B:16 [U] A:711 [LYS] B:16 [U] ✔
A:850 [VAL] B:19 [G] A:850 [VAL] B:19 [G] ✔
A:723 [ASN] B:13 [G] A:723 [ASN] B:13 [G] ✔
A:723 [ASN] B:14 [A] A:723 [ASN] B:14 [A] ✔
A:665 [GLY] B:24 [A] A:665 [GLY] B:24 [A] ✔
A:665 [GLY] B:25 [C] A:665 [GLY] B:25 [C] ✔
A:215 [THR] B:4 [C] A:215 [THR] B:4 [C] ✔
A:215 [THR] B:5 [G] A:215 [THR] B:5 [G] ✔
A:668 [ARG] B:25 [C] A:668 [ARG] B:25 [C] ✔
A:668 [ARG] B:26 [A] A:668 [ARG] B:26 [A] ✔
A:43 [TYR] B:76 [A] A:43 [TYR] B:76 [A] ✔
A:165 [VAL] B:74 [C] A:165 [VAL] B:74 [C] ✔
A:675 [LYS] B:39 [U] A:675 [LYS] B:39 [U] ✔
A:664 [GLU] B:25 [C] A:664 [GLU] B:25 [C] ✔
A:664 [GLU] B:26 [A] A:664 [GLU] B:26 [A] ✔
A:662 [GLY] B:24 [A] A:662 [GLY] B:24 [A] ✔
A:662 [GLY] B:25 [C] A:662 [GLY] B:25 [C] ✔
A:656 [LEU] B:12 [G] A:656 [LEU] B:12 [G] ✔
A:656 [LEU] B:13 [G] A:656 [LEU] B:13 [G] ✔
A:493 [PHE] B:76 [A] A:493 [PHE] B:76 [A] ✔
A:536 [MET] B:74 [C] A:536 [MET] B:74 [C] ❌ 4CQN_A_B
A:808 [GLY] B:20A [A] A:808 [GLY] B:20A [A] ❌ 4CQN_A_B
A:809 [LYS] B:47G [G] A:809 [LYS] B:47G [G] ❌ 4CQN_A_B
A:426 [ARG] B:75 [C] A:426 [ARG] B:75 [C] ❌ 4CQN_A_B
A:805 [GLN] B:20A [A] A:805 [GLN] B:20A [A] ❌ 4CQN_A_B
A:668 [ARG] B:24 [A] A:668 [ARG] B:24 [A] ❌ 4CQN_A_B
A:675 [LYS] B:40 [C] A:675 [LYS] B:40 [C] ❌ 4CQN_A_B
A:424 [ARG] B:73 [A] A:424 [ARG] B:73 [A] ❌ 3ZGZ_A_B
A:540 [TYR] B:73 [A] A:540 [TYR] B:73 [A] ❌ 3ZGZ_A_B
A:568 [MET] B:69 [G] A:568 [MET] B:69 [G] ❌ 3ZGZ_A_B
A:617 [MET] B:68 [C] A:617 [MET] B:68 [C] ❌ 3ZGZ_A_B
A:648 [PHE] B:13 [G] A:648 [PHE] B:13 [G] ❌ 3ZGZ_A_B
A:668 [ARG] B:39 [U] A:668 [ARG] B:39 [U] ❌ 3ZGZ_A_B
A:719 [ARG] B:14 [A] A:719 [ARG] B:14 [A] ❌ 3ZGZ_A_B
A:805 [GLN] B:56 [C] A:805 [GLN] B:56 [C] ❌ 3ZGZ_A_B
A:808 [GLY] B:56 [C] A:808 [GLY] B:56 [C] ❌ 3ZGZ_A_B
A:600 [ARG] B:67 [C] A:600 [ARG] B:67 [C] ❌ 4CQN_A:600, 4CQN_B:67 no longer at interface
A:654 [MET] B:7 [A] A:654 [MET] B:7 [A] ❌ 3ZGZ_B:7 no longer at interface
A:654 [MET] B:6 [G] A:654 [MET] B:6 [G] ❌ 3ZGZ_B:6 no longer at interface
A:805 [GLN] B:57 [A] A:805 [GLN] B:57 [A] ❌ 3ZGZ_B:57 no longer at interface
A:807 [ASN] B:57 [A] A:807 [ASN] B:57 [A] ❌ 3ZGZ_A:807, 3ZGZ_B:57 no longer at interface
A:808 [GLY] B:57 [A] A:808 [GLY] B:57 [A] ❌ 3ZGZ_B:57 no longer at interface
A:856 [ASN] B:57 [A] A:856 [ASN] B:57 [A] ❌ 3ZGZ_B:57 no longer at interface
A:622 [LYS] B:75 [C] A:622 [LYS] B:75 [C] ❌ 4CQN_A:622 no longer at interface
A:622 [LYS] B:76 [A] A:622 [LYS] B:76 [A] ❌ 4CQN_A:622 no longer at interface
A:621 [SER] B:75 [C] A:621 [SER] B:75 [C] ❌ 4CQN_A:621 no longer at interface
A:600 [ARG] B:68 [C] A:600 [ARG] B:68 [C] ❌ 4CQN_A:600 no longer at interface
A:496 [SER] B:76 [A] A:496 [SER] B:76 [A] ❌ 4CQN_A:496 no longer at interface
A:833 [HIS] B:47F [C] A:833 [HIS] B:47F [C] ❌ 4CQN_A:833 no longer at interface
A:290 [VAL] B:73 [A] A:290 [VAL] B:73 [A] ❌ 3ZGZ_A:290 no longer at interface
A:420 [TRP] B:74 [C] A:420 [TRP] B:74 [C] ❌ 3ZGZ_A:420 no longer at interface
A:657 [GLU] B:68 [C] A:657 [GLU] B:68 [C] ❌ 3ZGZ_A:657 no longer at interface
A:666 [ALA] B:24 [A] A:666 [ALA] B:24 [A] ❌ 3ZGZ_A:666 no longer at interface
A:807 [ASN] B:56 [C] A:807 [ASN] B:56 [C] ❌ 3ZGZ_A:807 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & HUP domains & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA 0.99 0.65 0.95 1.0 0.89 0.95 0.97 0.95 0.91 0.74 0.53


Other pairs involving 3ZGZ_A_B or 4CQN_A_B

Total number of entries: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
3ZJT_A_B 4CQN_A_B 0.48 0.9 3.64 0.64 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA compare
4CQN_A_B 5AH5_B_D 0.40 0.87 3.93 0.23 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related tRNA compare
4ARC_A_B 4CQN_A_B 0.59 0.9 3.86 0.53 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA compare
1U0B_B_A 3ZGZ_A_B 0.33 0.69 2.56 0.06 Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases tRNA compare
1U0B_B_A 4CQN_A_B 0.35 0.69 2.61 0.05 Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases tRNA compare
3ZGZ_A_B 3ZJT_A_B 0.47 0.9 3.08 0.61 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA compare
3ZGZ_A_B 3ZJV_A_B 0.58 0.92 2.97 0.66 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA compare
3ZGZ_A_B 4CQN_A_B 0.95 0.99 0.65 0.95 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & HUP domains & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA compare
3ZGZ_A_B 4ARC_A_B 0.59 0.9 3.25 0.5 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA compare
3ZGZ_A_B 5AH5_B_D 0.38 0.87 3.47 0.21 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related tRNA compare
3ZJV_A_B 4CQN_A_B 0.59 0.91 2.89 0.71 acid protease & Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases & beta-grasp fold domain in leucine-tRNA ligase & Rubredoxin-related & Rubredoxin-like domain in leucyl-tRNA synthetase (LS1) tRNA compare