RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group126 > 7K00_e_a vs 7RYG_E_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

7K00_e
7K00_a
7RYG_E
7RYG_A
Conserved?
e:69 [ARG] a:673 [C] E:68 [ARG] A:671 [C]
e:69 [ARG] a:674 [G] E:68 [ARG] A:672 [G]
e:69 [ARG] a:807 [U] E:68 [ARG] A:805 [U]
e:69 [ARG] a:1255 [U] E:68 [ARG] A:1250 [U]
e:69 [ARG] a:2060 [A] E:68 [ARG] A:2056 [A]
e:69 [ARG] a:2444 [G] E:68 [ARG] A:2440 [G]
e:69 [ARG] a:2445 [2MG] E:68 [ARG] A:2441 [2MG]
e:94 [GLN] a:660 [C] E:93 [GLN] A:658 [C]
e:94 [GLN] a:661 [A] E:93 [GLN] A:659 [U]
e:73 [ILE] a:469 [G] E:72 [ILE] A:468 [G]
e:37 [ALA] a:443 [A] E:36 [ALA] A:442 [A]
e:35 [TYR] a:615 [U] E:34 [TYR] A:613 [U]
e:160 [ALA] a:321 [U] E:159 [ALA] A:323 [U]
e:90 [GLN] a:589 [U] E:89 [GLN] A:587 [U]
e:90 [GLN] a:590 [A] E:89 [GLN] A:588 [A]
e:159 [LEU] a:321 [U] E:158 [LEU] A:323 [U]
e:159 [LEU] a:322 [A] E:158 [LEU] A:324 [A]
e:102 [ARG] a:617 [G] E:101 [ARG] A:615 [G]
e:102 [ARG] a:618 [G] E:101 [ARG] A:616 [G]
e:34 [ALA] a:615 [U] E:33 [ALA] A:613 [U]
e:101 [TYR] a:615 [U] E:100 [TYR] A:613 [U]
e:101 [TYR] a:616 [A] E:100 [TYR] A:614 [A]
e:101 [TYR] a:617 [G] E:100 [TYR] A:615 [G]
e:45 [ALA] a:37 [C] E:44 [ALA] A:44 [C]
e:45 [ALA] a:38 [A] E:44 [ALA] A:45 [A]
e:45 [ALA] a:451 [U] E:44 [ALA] A:450 [U]
e:47 [LYS] a:37 [C] E:46 [LYS] A:44 [C]
e:47 [LYS] a:451 [U] E:46 [LYS] A:450 [U]
e:47 [LYS] a:452 [G] E:46 [LYS] A:451 [G]
e:51 [GLU] a:452 [G] E:50 [ASP] A:451 [G]
e:65 [THR] a:2059 [A] E:64 [THR] A:2055 [A]
e:65 [THR] a:2060 [A] E:64 [THR] A:2056 [A]
e:58 [LYS] a:674 [G] E:57 [LYS] A:672 [G]
e:58 [LYS] a:675 [A] E:57 [LYS] A:673 [A]
e:58 [LYS] a:676 [A] E:57 [LYS] A:674 [A]
e:78 [TRP] a:1257 [C] E:77 [TRP] A:1252 [C]
e:129 [PRO] a:321 [U] E:128 [PRO] A:323 [U]
e:53 [THR] a:452 [G] E:52 [SER] A:451 [G]
e:53 [THR] a:458 [G] E:52 [SER] A:457 [G]
e:53 [THR] a:469 [G] E:52 [SER] A:468 [G]
e:165 [HIS] a:323 [C] E:164 [PRO] A:325 [G]
e:165 [HIS] a:1205 [A] E:164 [PRO] A:1200 [A]
e:44 [ARG] a:37 [C] E:43 [ARG] A:44 [C]
e:44 [ARG] a:38 [A] E:43 [ARG] A:45 [A]
e:44 [ARG] a:442 [G] E:43 [ARG] A:441 [G]
e:44 [ARG] a:444 [C] E:43 [ARG] A:443 [C]
e:44 [ARG] a:1247 [A] E:43 [ARG] A:1242 [A]
e:44 [ARG] a:1248 [G] E:43 [ARG] A:1243 [G]
e:162 [ARG] a:321 [U] E:161 [ARG] A:323 [U]
e:162 [ARG] a:322 [A] E:161 [ARG] A:324 [A]
e:162 [ARG] a:324 [A] E:161 [ARG] A:326 [A]
e:162 [ARG] a:340 [A] E:161 [ARG] A:342 [A]
e:131 [THR] a:320 [A] E:130 [THR] A:322 [G]
e:131 [THR] a:321 [U] E:130 [THR] A:323 [U]
e:131 [THR] a:322 [A] E:130 [THR] A:324 [A]
e:75 [SER] a:673 [C] E:74 [SER] A:671 [C]
e:75 [SER] a:674 [G] E:74 [SER] A:672 [G]
e:54 [GLY] a:469 [G] E:53 [GLY] A:468 [G]
e:83 [VAL] a:450 [G] E:82 [LYS] A:449 [G]
e:83 [VAL] a:1248 [G] E:82 [LYS] A:1243 [G]
e:43 [THR] a:38 [A] E:42 [THR] A:45 [A]
e:43 [THR] a:39 [G] E:42 [THR] A:46 [G]
e:43 [THR] a:442 [G] E:42 [THR] A:441 [G]
e:43 [THR] a:444 [C] E:42 [THR] A:443 [C]
e:130 [LYS] a:320 [A] E:129 [LYS] A:322 [G]
e:130 [LYS] a:321 [U] E:129 [LYS] A:323 [U]
e:96 [VAL] a:607 [U] E:95 [VAL] A:605 [U]
e:96 [VAL] a:659 [G] E:95 [VAL] A:657 [G]
e:24 [ASN] a:599 [A] E:23 [ASN] A:597 [A]
e:24 [ASN] a:600 [G] E:23 [ASN] A:598 [G]
e:71 [GLY] a:674 [G] E:70 [GLY] A:672 [G]
e:71 [GLY] a:675 [A] E:70 [GLY] A:673 [A]
e:27 [LEU] a:599 [A] E:26 [LEU] A:597 [A]
e:27 [LEU] a:600 [G] E:26 [LEU] A:598 [G]
e:48 [THR] a:669 [G] E:47 [SER] A:667 [G]
e:48 [THR] a:801 [G] E:47 [SER] A:799 [G]
e:80 [SER] a:448 [U] E:79 [GLY] A:447 [U]
e:80 [SER] a:449 [A] E:79 [GLY] A:448 [A]
e:100 [MET] a:599 [A] E:99 [MET] A:597 [A]
e:100 [MET] a:600 [G] E:99 [MET] A:598 [G]
e:100 [MET] a:659 [G] E:99 [MET] A:657 [G]
e:56 [GLY] a:798 [G] E:55 [GLY] A:796 [G]
e:52 [VAL] a:452 [G] E:51 [VAL] A:451 [G]
e:163 [ASN] a:320 [A] E:162 [ASN] A:322 [G]
e:163 [ASN] a:322 [A] E:162 [ASN] A:324 [A]
e:163 [ASN] a:323 [C] E:162 [ASN] A:325 [G]
e:79 [ARG] a:448 [U] E:78 [VAL] A:447 [U]
e:79 [ARG] a:449 [A] E:78 [VAL] A:448 [A]
e:79 [ARG] a:1257 [C] E:78 [VAL] A:1252 [C]
e:79 [ARG] a:1258 [U] E:78 [VAL] A:1253 [U]
e:95 [LYS] a:606 [U] E:94 [LYS] A:604 [U]
e:95 [LYS] a:607 [U] E:94 [LYS] A:605 [U]
e:95 [LYS] a:658 [U] E:94 [LYS] A:656 [U]
e:95 [LYS] a:659 [G] E:94 [LYS] A:657 [G]
e:95 [LYS] a:660 [C] E:94 [LYS] A:658 [C]
e:29 [HIS] a:1244 [A] E:28 [HIS] A:1239 [A]
e:29 [HIS] a:1245 [G] E:28 [HIS] A:1240 [G]
e:199 [MET] a:617 [G] E:198 [GLU] A:615 [G]
e:76 [PRO] a:585 [G] E:75 [PRO] A:583 [G]
e:76 [PRO] a:672 [C] E:75 [PRO] A:670 [C]
e:76 [PRO] a:673 [C] E:75 [PRO] A:671 [C]
e:97 [ASN] a:606 [U] E:96 [ASN] A:604 [U]
e:97 [ASN] a:607 [U] E:96 [ASN] A:605 [U]
e:97 [ASN] a:658 [U] E:96 [ASN] A:656 [U]
e:97 [ASN] a:659 [G] E:96 [ASN] A:657 [G]
e:42 [GLY] a:443 [A] E:41 [GLY] A:442 [A]
e:42 [GLY] a:444 [C] E:41 [GLY] A:443 [C]
e:55 [SER] a:469 [G] E:54 [GLY] A:468 [G]
e:98 [LYS] a:607 [U] E:97 [ARG] A:605 [U]
e:98 [LYS] a:617 [G] E:97 [ARG] A:615 [G]
e:98 [LYS] a:618 [G] E:97 [ARG] A:616 [G]
e:98 [LYS] a:619 [G] E:97 [ARG] A:617 [G]
e:98 [LYS] a:620 [G] E:97 [ARG] A:618 [G]
e:68 [ALA] a:1255 [U] E:67 [ALA] A:1250 [U]
e:68 [ALA] a:1256 [G] E:67 [ALA] A:1251 [G]
e:68 [ALA] a:1257 [C] E:67 [ALA] A:1252 [C]
e:84 [THR] a:585 [G] E:83 [THR] A:583 [G]
e:84 [THR] a:586 [A] E:83 [THR] A:584 [A]
e:84 [THR] a:672 [C] E:83 [THR] A:670 [C]
e:84 [THR] a:801 [G] E:83 [THR] A:799 [G]
e:36 [ALA] a:443 [A] E:35 [LEU] A:442 [A]
e:26 [ALA] a:599 [A] E:25 [ALA] A:597 [A]
e:81 [GLY] a:449 [A] E:80 [GLY] A:448 [A]
e:81 [GLY] a:450 [G] E:80 [GLY] A:449 [G]
e:67 [ARG] a:1255 [U] E:66 [ARG] A:1250 [U]
e:67 [ARG] a:1256 [G] E:66 [ARG] A:1251 [G]
e:67 [ARG] a:1257 [C] E:66 [ARG] A:1252 [C]
e:67 [ARG] a:1258 [U] E:66 [ARG] A:1253 [U]
e:173 [THR] a:616 [A] E:172 [THR] A:614 [A]
e:40 [ARG] a:443 [A] E:39 [ARG] A:442 [A]
e:40 [ARG] a:444 [C] E:39 [ARG] A:443 [C]
e:40 [ARG] a:1246 [A] E:39 [ARG] A:1241 [A]
e:164 [LEU] a:320 [A] E:163 [LEU] A:322 [G]
e:57 [LYS] a:796 [C] E:56 [LYS] A:794 [C]
e:57 [LYS] a:797 [G] E:56 [LYS] A:795 [U]
e:57 [LYS] a:798 [G] E:56 [LYS] A:796 [G]
e:39 [ALA] a:443 [A] E:38 [GLY] A:442 [A]
e:39 [ALA] a:615 [U] E:38 [GLY] A:613 [U]
e:63 [LYS] a:2060 [A] E:62 [LYS] A:2056 [A]
e:63 [LYS] a:2061 [G] E:62 [LYS] A:2057 [G]
e:63 [LYS] a:2443 [C] E:62 [LYS] A:2439 [U]
e:63 [LYS] a:2444 [G] E:62 [LYS] A:2440 [G]
e:166 [LYS] a:1205 [A] E:165 [HIS] A:1200 [A]
e:85 [PHE] a:586 [A] E:84 [PHE] A:584 [A]
e:85 [PHE] a:587 [C] E:84 [PHE] A:585 [C]
e:85 [PHE] a:588 [U] E:84 [PHE] A:586 [U]
e:85 [PHE] a:669 [G] E:84 [PHE] A:667 [G]
e:85 [PHE] a:671 [C] E:84 [PHE] A:669 [C]
e:85 [PHE] a:672 [C] E:84 [PHE] A:670 [C]
e:33 [VAL] a:1244 [A] E:32 [THR] A:1239 [A]
e:33 [VAL] a:1245 [G] E:32 [THR] A:1240 [G]
e:72 [SER] a:674 [G] E:71 [SER] A:672 [G]
e:41 [GLN] a:38 [A] E:40 [GLN] A:45 [A]
e:41 [GLN] a:39 [G] E:40 [GLN] A:46 [G]
e:41 [GLN] a:441 [U] E:40 [GLN] A:440 [U]
e:41 [GLN] a:442 [G] E:40 [GLN] A:441 [G]
e:41 [GLN] a:443 [A] E:40 [GLN] A:442 [A]
e:135 [ALA] a:320 [A] E:134 [LEU] A:322 [G]
e:66 [GLY] a:1255 [U] E:65 [GLY] A:1250 [U]
e:66 [GLY] a:1256 [G] E:65 [GLY] A:1251 [G]
e:66 [GLY] a:2059 [A] E:65 [GLY] A:2055 [A]
e:66 [GLY] a:2060 [A] E:65 [GLY] A:2056 [A]
e:132 [LYS] a:319 [G] E:131 [LYS] A:321 [C]
e:132 [LYS] a:320 [A] E:131 [LYS] A:322 [G]
e:30 [GLN] a:599 [A] E:29 [GLN] A:597 [A]
e:30 [GLN] a:659 [G] E:29 [GLN] A:657 [G]
e:30 [GLN] a:660 [C] E:29 [GLN] A:658 [C]
e:70 [SER] a:674 [G] E:69 [ALA] A:672 [G]
e:70 [SER] a:675 [A] E:69 [ALA] A:673 [A]
e:64 [GLY] a:2059 [A] E:63 [GLY] A:2055 [A]
e:64 [GLY] a:2060 [A] E:63 [GLY] A:2056 [A]
e:62 [GLN] a:674 [G] E:61 [GLN] A:672 [G]
e:62 [GLN] a:675 [A] E:61 [GLN] A:673 [A]
e:62 [GLN] a:1255 [U] E:61 [GLN] A:1250 [U]
e:62 [GLN] a:2443 [C] E:61 [GLN] A:2439 [U]
e:62 [GLN] a:2444 [G] E:61 [GLN] A:2440 [G]
e:99 [LYS] a:600 [G] E:98 [LYS] A:598 [G]
e:99 [LYS] a:601 [C] E:98 [LYS] A:599 [C]
e:99 [LYS] a:605 [G] E:98 [LYS] A:603 [G]
e:99 [LYS] a:606 [U] E:98 [LYS] A:604 [U]
e:77 [ILE] a:584 [C] E:76 [ILE] A:582 [C]
e:77 [ILE] a:585 [G] E:76 [ILE] A:583 [G]
e:77 [ILE] a:672 [C] E:76 [ILE] A:670 [C]
e:77 [ILE] a:673 [C] E:76 [ILE] A:671 [C]
e:77 [ILE] a:1254 [A] E:76 [ILE] A:1249 [A]
e:77 [ILE] a:1256 [G] E:76 [ILE] A:1251 [G]
e:77 [ILE] a:1257 [C] E:76 [ILE] A:1252 [C]
e:21 [ARG] a:601 [C] E:20 [ARG] A:599 [C]
e:49 [ARG] a:673 [C] E:48 [ARG] A:671 [C]
e:49 [ARG] a:674 [G] E:48 [ARG] A:672 [G]
e:49 [ARG] a:801 [G] E:48 [ARG] A:799 [G]
e:50 [ALA] a:801 [G] E:49 [ALA] A:799 [G]
e:46 [GLN] a:444 [C] E:45 [HIS] A:443 [C]
e:46 [GLN] a:450 [G] E:45 [HIS] A:449 [G]
e:46 [GLN] a:451 [U] E:45 [HIS] A:450 [U]
e:46 [GLN] a:1248 [G] E:45 [HIS] A:1243 [G]
e:38 [GLY] a:615 [U] E:37 [GLY] A:613 [U]
e:89 [PRO] a:38 [A] E:88 [PRO] A:45 [A]
e:89 [PRO] a:39 [G] E:88 [PRO] A:46 [G]
e:45 [ALA] a:450 [G] E:44 [ALA] A:449 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:78 [TRP] a:1256 [G] E:77 [TRP] A:1251 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:53 [THR] a:451 [U] E:52 [SER] A:450 [U] ❌ 7RYG_E_A
e:54 [GLY] a:798 [G] E:53 [GLY] A:796 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:83 [VAL] a:449 [A] E:82 [LYS] A:448 [A] ❌ 7RYG_E_A
e:43 [THR] a:441 [U] E:42 [THR] A:440 [U] ❌ 7RYG_E_A
e:74 [LYS] a:801 [G] E:73 [ARG] A:799 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:71 [GLY] a:673 [C] E:70 [GLY] A:671 [C] ❌ 7RYG_E_A
e:100 [MET] a:658 [U] E:99 [MET] A:656 [U] ❌ 7RYG_E_A
e:163 [ASN] a:319 [G] E:162 [ASN] A:321 [C] ❌ 7RYG_E_A
e:79 [ARG] a:470 [A] E:78 [VAL] A:469 [A] ❌ 7RYG_E_A
e:199 [MET] a:616 [A] E:198 [GLU] A:614 [A] ❌ 7RYG_E_A
e:97 [ASN] a:600 [G] E:96 [ASN] A:598 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:42 [GLY] a:442 [G] E:41 [GLY] A:441 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:55 [SER] a:468 [G] E:54 [GLY] A:467 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:55 [SER] a:797 [G] E:54 [GLY] A:795 [U] ❌ 7RYG_E_A
e:55 [SER] a:798 [G] E:54 [GLY] A:796 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:84 [THR] a:669 [G] E:83 [THR] A:667 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:36 [ALA] a:615 [U] E:35 [LEU] A:613 [U] ❌ 7RYG_E_A
e:67 [ARG] a:2060 [A] E:66 [ARG] A:2056 [A] ❌ 7RYG_E_A
e:164 [LEU] a:323 [C] E:163 [LEU] A:325 [G] ❌ 7RYG_E_A
e:63 [LYS] a:2059 [A] E:62 [LYS] A:2055 [A] ❌ 7RYG_E_A
e:92 [HIS] a:444 [C] E:91 [TRP] A:443 [C] ❌ 7RYG_E_A
e:132 [LYS] a:321 [U] E:131 [LYS] A:323 [U] ❌ 7RYG_E_A
e:62 [GLN] a:676 [A] E:61 [GLN] A:674 [A] ❌ 7RYG_E_A
e:62 [GLN] a:2060 [A] E:61 [GLN] A:2056 [A] ❌ 7RYG_E_A
e:49 [ARG] a:672 [C] E:48 [ARG] A:670 [C] ❌ 7RYG_E_A
e:46 [GLN] a:37 [C] E:45 [HIS] A:44 [C] ❌ 7RYG_E_A
e:163 [ASN] a:324 [A] E:162 [ASN] A:326 [A] ❌ 7K00_e_a
e:165 [HIS] a:320 [A] E:164 [PRO] A:322 [G] ❌ 7K00_e_a
e:21 [ARG] a:600 [G] E:20 [ARG] A:598 [G] ❌ 7K00_e_a
e:47 [LYS] a:38 [A] E:46 [LYS] A:45 [A] ❌ 7K00_e_a
e:54 [GLY] a:468 [G] E:53 [GLY] A:467 [G] ❌ 7K00_e_a
e:57 [LYS] a:468 [G] E:56 [LYS] A:467 [G] ❌ 7K00_e_a
e:74 [LYS] a:470 [A] E:73 [ARG] A:469 [A] ❌ 7K00_e_a
e:74 [LYS] a:469 [G] E:73 [ARG] A:468 [G] ❌ 7K00_e_a
e:74 [LYS] a:452 [G] E:73 [ARG] A:451 [G] ❌ 7K00_e_a
e:92 [HIS] a:1247 [A] E:91 [TRP] A:1242 [A] ❌ 7K00_e_a
e:92 [HIS] a:1246 [A] E:91 [TRP] A:1241 [A] ❌ 7K00_e_a
e:80 [SER] a:471 [A] E:79 [GLY] A:470 [A] ❌ 7RYG_A:470 no longer at interface
e:171 [ASP] a:613 [A] E:170 [ASP] A:611 [U] ❌ 7RYG_E:170, 7RYG_A:611 no longer at interface
e:79 [ARG] a:471 [A] E:78 [VAL] A:470 [A] ❌ 7RYG_A:470 no longer at interface
e:79 [ARG] a:472 [A] E:78 [VAL] A:471 [A] ❌ 7RYG_A:471 no longer at interface
e:173 [THR] a:613 [A] E:172 [THR] A:611 [U] ❌ 7RYG_A:611 no longer at interface
e:173 [THR] a:614 [A] E:172 [THR] A:612 [A] ❌ 7RYG_A:612 no longer at interface
e:57 [LYS] a:795 [C] E:56 [LYS] A:793 [C] ❌ 7RYG_A:793 no longer at interface
e:63 [LYS] a:2062 [A] E:62 [LYS] A:2058 [A] ❌ 7RYG_A:2058 no longer at interface
e:79 [ARG] a:583 [G] E:78 [VAL] A:581 [G] ❌ 7K00_a:583 no longer at interface
e:60 [TRP] a:1257 [C] E:59 [PHE] A:1252 [C] ❌ 7RYG_E:59 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein L4 Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.99 1.56 0.77 0.96 0.99 1.0 0.99 0.93 0.91 0.68 0.20


Other pairs involving 7K00_e_a or 7RYG_E_A

Total number of entries: 16