RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group29 > 7BL4_9_A vs 7OF7_x_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

7BL4_9
7BL4_A
7OF7_x
7OF7_A
Conserved?
9:76 [ARG] A:2507 [C] x:143 [LYS] A:2994 [U] ✔
9:76 [ARG] A:2508 [G] x:143 [LYS] A:2995 [G] ✔
9:76 [ARG] A:2555 [U] x:143 [LYS] A:3042 [U] ✔
9:76 [ARG] A:2573 [C] x:143 [LYS] A:3060 [C] ✔
9:136 [ARG] A:2601 [C] x:201 [ARG] A:3088 [C] ✔
9:136 [ARG] A:2602 [A] x:201 [ARG] A:3089 [A] ✔
9:136 [ARG] A:2603 [G] x:201 [ARG] A:3090 [G] ✔
9:52 [ASN] A:2661 [G] x:121 [GLN] A:3129 [A] ✔
9:52 [ASN] A:2662 [A] x:121 [GLN] A:3130 [A] ✔
9:27 [LYS] A:2451 [A] x:96 [PRO] A:2938 [A] ✔
9:27 [LYS] A:2452 [C] x:96 [PRO] A:2939 [C] ✔
9:27 [LYS] A:2505 [G] x:96 [PRO] A:2992 [G] ✔
9:27 [LYS] A:2506 [U] x:96 [PRO] A:2993 [U] ✔
9:54 [ASN] A:2660 [A] x:123 [LYS] A:3128 [A] ✔
9:54 [ASN] A:2661 [G] x:123 [LYS] A:3129 [A] ✔
9:75 [SER] A:2492 [U] x:142 [SER] A:2979 [U] ✔
9:75 [SER] A:2493 [U] x:142 [SER] A:2980 [U] ✔
9:79 [THR] A:2556 [C] x:146 [PHE] A:3043 [C] ✔
9:79 [THR] A:2557 [G] x:146 [PHE] A:3044 [A] ✔
9:26 [GLU] A:2451 [A] x:95 [GLU] A:2938 [A] ✔
9:26 [GLU] A:2452 [C] x:95 [GLU] A:2939 [C] ✔
9:26 [GLU] A:2506 [U] x:95 [GLU] A:2993 [U] ✔
9:26 [GLU] A:2583 [G] x:95 [GLU] A:3070 [G] ✔
9:26 [GLU] A:2584 [U] x:95 [GLU] A:3071 [U] ✔
9:80 [GLY] A:2556 [C] x:147 [GLY] A:3043 [C] ✔
9:80 [GLY] A:2557 [G] x:147 [GLY] A:3044 [A] ✔
9:80 [GLY] A:2558 [C] x:147 [GLY] A:3045 [A] ✔
9:22 [SER] A:2493 [U] x:91 [CYS] A:2980 [U] ✔
9:31 [LYS] A:2602 [A] x:100 [PHE] A:3089 [A] ✔
9:81 [LYS] A:2557 [G] x:148 [ARG] A:3044 [A] ✔
9:81 [LYS] A:2558 [C] x:148 [ARG] A:3045 [A] ✔
9:33 [GLY] A:2602 [A] x:102 [GLY] A:3089 [A] ✔
9:77 [ASP] A:2554 [U] x:144 [ASN] A:3041 [U] ✔
9:77 [ASP] A:2555 [U] x:144 [ASN] A:3042 [U] ✔
9:77 [ASP] A:2556 [C] x:144 [ASN] A:3043 [C] ✔
9:34 [PRO] A:2602 [A] x:103 [PRO] A:3089 [A] ✔
9:23 [PHE] A:2493 [U] x:92 [PHE] A:2980 [U] ✔
9:23 [PHE] A:2494 [G] x:92 [PHE] A:2981 [A] ✔
9:23 [PHE] A:2602 [A] x:92 [PHE] A:3089 [A] ✔
9:30 [PRO] A:2450 [A] x:99 [GLU] A:2937 [A] ✔
9:30 [PRO] A:2451 [A] x:99 [GLU] A:2938 [A] ✔
9:32 [GLY] A:2602 [A] x:101 [GLY] A:3089 [A] ✔
9:137 [THR] A:2602 [A] x:202 [ALA] A:3089 [A] ✔
9:131 [LYS] A:2602 [A] x:196 [LEU] A:3089 [A] ✔
9:131 [LYS] A:2603 [G] x:196 [LEU] A:3090 [G] ✔
9:62 [GLU] A:2473 [U] x:129 [LEU] A:2960 [U] ✔
9:82 [ARG] A:2557 [G] x:149 [SER] A:3044 [A] ✔
9:82 [ARG] A:2558 [C] x:149 [SER] A:3045 [A] ✔
9:25 [ARG] A:2451 [A] x:94 [SER] A:2938 [A] ✔
9:25 [ARG] A:2452 [C] x:94 [SER] A:2939 [C] ✔
9:28 [TYR] A:2062 [A] x:97 [ARG] A:2725 [A] ✔
9:28 [TYR] A:2063 [C] x:97 [ARG] A:2726 [C] ✔
9:28 [TYR] A:2505 [G] x:97 [ARG] A:2992 [G] ✔
9:78 [CYS] A:2555 [U] x:145 [CYS] A:3042 [U] ✔
9:78 [CYS] A:2556 [C] x:145 [CYS] A:3043 [C] ✔
9:29 [ILE] A:2584 [U] x:98 [LYS] A:3071 [U] ✔
9:21 [VAL] A:2493 [U] x:90 [SER] A:2980 [U] ✔
9:63 [LYS] A:2529 [G] x:130 [SER] A:3016 [G] ❌ 7OF7_x_A
9:22 [SER] A:2492 [U] x:91 [CYS] A:2979 [U] ❌ 7OF7_x_A
9:31 [LYS] A:2601 [C] x:100 [PHE] A:3088 [C] ❌ 7OF7_x_A
9:139 [ARG] A:2493 [U] x:204 [VAL] A:2980 [U] ❌ 7OF7_x_A
9:139 [ARG] A:2494 [G] x:204 [VAL] A:2981 [A] ❌ 7OF7_x_A
9:62 [GLU] A:2472 [G] x:129 [LEU] A:2959 [G] ❌ 7OF7_x_A
9:25 [ARG] A:2493 [U] x:94 [SER] A:2980 [U] ❌ 7OF7_x_A
9:25 [ARG] A:2494 [G] x:94 [SER] A:2981 [A] ❌ 7OF7_x_A
9:28 [TYR] A:2451 [A] x:97 [ARG] A:2938 [A] ❌ 7OF7_x_A
9:29 [ILE] A:2451 [A] x:98 [LYS] A:2938 [A] ❌ 7OF7_x_A
9:21 [VAL] A:2494 [G] x:90 [SER] A:2981 [A] ❌ 7OF7_x_A
9:32 [GLY] A:2603 [G] x:101 [GLY] A:3090 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:62 [GLU] A:2529 [G] x:129 [LEU] A:3016 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:63 [LYS] A:2472 [G] x:130 [SER] A:2959 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:63 [LYS] A:2473 [U] x:130 [SER] A:2960 [U] ❌ 7BL4_9_A
9:76 [ARG] A:2554 [U] x:143 [LYS] A:3041 [U] ❌ 7BL4_9_A
9:81 [LYS] A:2556 [C] x:148 [ARG] A:3043 [C] ❌ 7BL4_9_A
9:128 [THR] A:2603 [G] x:193 [ARG] A:3090 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:132 [SER] A:2603 [G] x:197 [ALA] A:3090 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:133 [SER] A:2603 [G] x:198 [ASN] A:3090 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:22 [SER] A:2494 [G] x:91 [CYS] A:2981 [A] ❌ 7BL4_9_A
9:26 [GLU] A:2505 [G] x:95 [GLU] A:2992 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:27 [LYS] A:2063 [C] x:96 [PRO] A:2726 [C] ❌ 7BL4_9_A
9:27 [LYS] A:2062 [A] x:96 [PRO] A:2725 [A] ❌ 7BL4_9_A
9:27 [LYS] A:2450 [A] x:96 [PRO] A:2937 [A] ❌ 7BL4_9_A
9:29 [ILE] A:2602 [A] x:98 [LYS] A:3089 [A] ❌ 7BL4_9_A
9:29 [ILE] A:2505 [G] x:98 [LYS] A:2992 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:29 [ILE] A:2603 [G] x:98 [LYS] A:3090 [G] ❌ 7BL4_9_A
9:66 [ARG] A:2480 [C] x:133 [GLN] A:2967 [C] ❌ 7OF7_x:133, 7OF7_A:2967 no longer at interface
9:72 [ASN] A:2462 [C] x:139 [ASP] A:2949 [C] ❌ 7OF7_x:139, 7OF7_A:2949 no longer at interface
9:10 [LEU] A:2471 [A] x:79 [LEU] A:2958 [A] ❌ 7OF7_x:79, 7OF7_A:2958 no longer at interface
9:82 [ARG] A:2559 [C] x:149 [SER] A:3046 [C] ❌ 7OF7_A:3046 no longer at interface
9:28 [TYR] A:2503 [A] x:97 [ARG] A:2990 [A] ❌ 7OF7_A:2990 no longer at interface
9:28 [TYR] A:2504 [U] x:97 [ARG] A:2991 [U] ❌ 7OF7_A:2991 no longer at interface
9:31 [LYS] A:2251 [G] x:100 [PHE] A:2815 [OMG] ❌ 7BL4_A:2251 no longer at interface
9:52 [ASN] A:2664 [G] x:121 [GLN] A:3132 [G] ❌ 7BL4_A:2664 no longer at interface
9:52 [ASN] A:2663 [G] x:121 [GLN] A:3131 [G] ❌ 7BL4_A:2663 no longer at interface
9:63 [LYS] A:2478 [A] x:130 [SER] A:2965 [A] ❌ 7BL4_A:2478 no longer at interface
9:81 [LYS] A:2568 [U] x:148 [ARG] A:3055 [U] ❌ 7BL4_A:2568 no longer at interface
9:128 [THR] A:2604 [U] x:193 [ARG] A:3091 [G] ❌ 7BL4_A:2604 no longer at interface
9:133 [SER] A:2593 [U] x:198 [ASN] A:3080 [G] ❌ 7BL4_A:2593 no longer at interface
9:133 [SER] A:2592 [G] x:198 [ASN] A:3079 [G] ❌ 7BL4_A:2592 no longer at interface
9:136 [ARG] A:2592 [G] x:201 [ARG] A:3079 [G] ❌ 7BL4_A:2592 no longer at interface
9:26 [GLU] A:2585 [U] x:95 [GLU] A:3072 [U] ❌ 7BL4_A:2585 no longer at interface
9:28 [TYR] A:2439 [A] x:97 [ARG] A:2926 [A] ❌ 7BL4_A:2439 no longer at interface
9:28 [TYR] A:2585 [U] x:97 [ARG] A:3072 [U] ❌ 7BL4_A:2585 no longer at interface
9:28 [TYR] A:2061 [G] x:97 [ARG] A:2724 [G] ❌ 7BL4_A:2061 no longer at interface
9:29 [ILE] A:2585 [U] x:98 [LYS] A:3072 [U] ❌ 7BL4_A:2585 no longer at interface
9:30 [PRO] A:2064 [C] x:99 [GLU] A:2727 [C] ❌ 7BL4_A:2064 no longer at interface
9:55 [THR] A:2660 [A] x:124 [SER] A:3128 [A] ❌ 7OF7_x:124 no longer at interface
9:51 [GLU] A:2662 [A] x:120 [GLN] A:3130 [A] ❌ 7BL4_9:51 no longer at interface
9:59 [TYR] A:2529 [G] x:128 [VAL] A:3016 [G] ❌ 7BL4_9:59 no longer at interface
9:64 [SER] A:2472 [G] x:131 [ARG] A:2959 [G] ❌ 7BL4_9:64 no longer at interface
9:7 [ALA] A:2473 [U] x:76 [ARG] A:2960 [U] ❌ 7BL4_9:7 no longer at interface
9:24 [ARG] A:2602 [A] x:93 [HIS] A:3089 [A] ❌ 7BL4_9:24 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Obg GTP-binding protein N-terminal domain Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.97 2.76 0.24 0.95 0.97 0.86 0.69 0.71 0.66 0.23 0.49


Other pairs involving 7BL4_9_A or 7OF7_x_A

Total number of entries: 1

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
7BL4_9_A 7OF7_x_A 0.71 0.97 2.76 0.24 Obg GTP-binding protein N-terminal domain Bacterial large subunit ribosomal RNA compare